固相亚磷酰胺法——简易讲解模板共18页

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第四步:在氧化剂碘的作用
下,亚磷酰形式转变为更稳定
第的一磷酸个三酯循。 环结束
后期处理
经过以上四个步骤,一
个脱氧核苷酸被连接到 固相载体的核苷酸上。 再以三氯乙酸脱去它的 5'-羟基上的保护基团
2
合成过程中可以观察TCA处理阶段的颜色判定合 成效率。
DMT,重复以上步骤,
直到所有要求合成的碱
基被接上去。
1
通过氨水高温处理,连接在CPG上的引物被切下
来,通过OPC,page等手段纯化引物,成品引物用
C18浓缩,脱盐,沉淀。沉淀后的引物用水悬浮,
测定OD260定量,根据定单要求分装。
3
参考资料
1.亚磷酰胺法 .全国科学技术名词审 定委员会[引用日期2019-01-23]
可以开始了
CP G
第二步:合成DNA的原料,
亚磷酰胺保护核苷酸单体,与 活化剂四氮唑混合,得到核苷 亚磷酸活化中间体,它的3'端 被活化,5'-羟基仍然被DMT保 护,与溶液中游离的5'-羟基 发生缩合反应。
DTMP
A
核苷酸与亚磷酰
胺,和活化剂四 氮唑混合,核苷
亚P
酸3’上的氢被
亚磷酰胺取代形
成核苷亚磷酰胺
2.引物是如何合成的 .生物 帮.2019-04-01[引用日期2019-0123]
3.《环球科学》杂志:组装生命的生 物工厂
Thank you!
谢谢!
17
18
特点:
具有高效、快速的偶联以及 起始反应物比较稳定的特点。
详细步骤:
第一步:将预先连接在固相载体
CPG上的活性基团被保护的核苷酸与三 氯乙酸反应,脱去其5'-羟基的保护基 团DMT,获得游离的5'-羟基。(DMT: 二甲氧基三苯甲基)
DTMHP
将核苷酸 固定在载 体上
A 在团5在脱羟‘某被三去基端反D氯D的MM应T乙T羟取产下酸基代生,作以游磷用保离酸下护的基,
学院院士。
原理:
将核苷3'固定在固相载体(如CPG,可控微 孔玻璃珠)上,并在5'上连接一个保护基团DMT,使 合成的方向由待合成引物的3'端向5'端合成的。
相邻的核苷酸通过3'→5'磷酸二酯键连接。
每个循环过程中都经过高效率且化学 性质活泼的核苷酸3′-亚磷酸酰胺中间体, 其氧化后成为稳定的五价磷酸三酯。
活化中间体
PDM
T
A
P 之后产生的
核苷亚磷酸酰
H亚P
A
胺活化中间体
3’端的亚磷酸
基团与第一步
制好的固相载
体的5’端活化
CPG
的羟基缩合
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第三步,带帽(capping)反应,
缩合反应中可能有极少数5'-羟 基没有参加反应(少于2%),用 乙酸酐和1-甲基咪唑终止其后继 续发生反应,这种短片段可以在 纯化时分离掉。
发明者: Marvin H. Caruthers
背景:
(马文·H·卡拉瑟斯)
美国国家科学院院士,美国
科罗拉多大学化学及生物化
学系教授。
1968年,在西北大学获得博
士学位。现主要从事核酸化
ห้องสมุดไป่ตู้
学和生物化学,利用DNA自身
的化学性质,研发出一种单
链DNA合成法。
1987年,发明“固相亚磷酰
胺法”。
1994年,被授予美国国家科
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