生物学软件大全

生物学软件大全

1. 三维分子类

RASMOL：观看生物分子3D微观立体结构

RasTop：为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件

CHIME：直接在浏览器中观看3D分子

MolMol：将pdb等格式的蛋白文件通过微调，存成普通的图形文件

raswin.exe.gz：rasmol(win)2.7.0.1 rasmol新版本及汉化版本CrystInfo：用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3D结构

PDViewer：PDB格式文件的查看程序

Weblab Viewlite：三维分子浏览工具及大量分子文件例子Weblab ViewerPro：三维分子浏览工具

ICMLite：三维分子浏览工具，有一些其他软件没有的功能VMD：三维分子浏览工具，可以进行动态显示

CN3D：3D分子结构观察软件

WPDB：PDB文件检索显示分析软件

DTMM：三维分子模型显示、编辑与构建程序

Mole：高性能的大分子三维图形显示计算工具gopenmol：显示并分析分子结构及其特性

POV-Rayv：生成三维图像工具软件

MolPOV：将PDB文件转化为POV格式文件的软件

Mol2Mol：分子文件格式转换软件

PovChem：将PDB文件转化为POV格式的文件

Ortep-3 for Windows：生成分子的热椭圆形点图PLATON：通用结晶学软件工具

Mage：读取并演示Kinemage格式文件的专用软件

Prekin ：将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件Swiss-Pdb Viewer：PDB文件显示与分析软件

DINAMO：蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具PCMoleeule2 Lite：查看PDB格式文件的免费软件StrukEd ：化学分子编辑与三维模型生成软件

JMVC：使用JA VA技术编写的三维分子查看器ReView：读取及分析XYZ格式三维分子文件

Oscail：用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包Moilin：分子构建与观察软件

Tinker：与Moilin配套的DOS下的分子设计建模Biodesigner：免费的分子建模与显示软件

MoluCAD：全功能的分子建模与显示工具软件

Viewer Activex Control：三维分子显示控件MarvinView：JA VA语言编写的化学分子二维与三维显示程序

ACD/3D Viewer for ISIS：免费的ISISDraw三维显示插件

Amira：高等三维显示建模系统

AmiraMol：Amira 2.3 相应的显示三维分子的增强工具Visualize：分子建模和研究软件包

ScientificGL：C++OpenGLAPI三维分子开发工具Sojourner：找出小蛋白的最小能量构形并实时演示的软件

2. DNA分析DNAClub：DNA处理软件

JaMBW：分子生物学软件包

DNATool：功能很全面的DNA序列分析工具包pDRAW：DNA分析与绘图软件，可绘制线性或环形DNA 图

ANNHYB：用来帮助进行PCR引物设计与基因探针设计的软件

RESTRICTION ANALYSIS：限制酶消化工具

ABIView：ABI格式文件显示与编辑软件

Chromas：ABI格式文件显示与编辑软件

Sequence viewer：获取与观察从GSDB获取的DNA序列数据及其关联特性的工具

DNAssist：DNA序列分析工具

DNAProbe：核苷酸序列设计工具

DnaSP：DNA序列种群遗传学分析软件

DFW：DNA分析软件

Artemis R4：以Java语言写成的序列查看工具’

ACT R1：以Java语言写成的序列比较查看器

GDA：主要用来进行不连续基因数据的统计分析

RDP：从一组排队比较(Align)的核酸序列中查找潜在的重组体软件

Sequencher：装配DNA小片段为大的连续序列或毗连(序列)群'Contig'软件

MehCalc：自动计算DNA序列热力学数据的Excel电子表格宏软件

基因探索者：中文界面的功能集成、高效、快捷的基因分析软件

ConsInspector：DNA蛋白结合位点预测识别软件

MatInd与Matlnspector：快速匹配DNA序列与已知共有序列的软件工具

GBuilder：JA V A语言编制的用来分析与显示DNA序列的软件

GenomePixelizer：帮助理解基因组中的簇基因

(C1ustermggene)之间的相互关系的软件

LabBook Genomic XML Viewer：图形化显示并处理GenBank 序列数据的免费软件

Gene Construetion Kit 2 ：管理并显示克隆策略中的分子构建过程软件

Genalysis：比较基因组或大量基因序列的工具软件

3. RNA分析RNAdraw：RNA二级结构分析软件RNAstructure：预测RNA 级结构图

RnaViz：RNA二级结构图绘制程序

4. 蛋白质分析ANTHEPROT：蛋白序列分析软件包pSAAM：蛋白序列分析软件包

VHMPT：螺旋状膜蛋白拓扑结构观察与编辑软件aminoXpress：免费的多功能蛋白分析软件包5. 生化教学mmp.zip：将生化代谢中的各种途径用图表的形式表示出来linpath.zip：线性酶反应模拟软件

protlab：蛋白质纯化仿真软件

MOLMED.ZIP：生化基础概念演示教学程序

Biochem：生化教学文件

photo：光合作用教学程序

Adrenalin：肾上腺素在肝糖原代谢中的作用演示

Virtual Cell Lab：多媒体细胞生物学教学程序6. 生化工程brd.zip：生物反应器(发酵罐)设计软件

BioStat：BioStatB发酵罐控制程序

PenSimv：青霉素发酵模拟软件

BioProSim：发酵实时模拟软件