寡核苷酸芯片技术

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磁珠和寡核苷酸探针标记技术服务

磁珠和寡核苷酸探针标记技术服务

磁珠和寡核苷酸探针标记技术服务
简介
寡核苷酸芯片(oligochip)技术能够快速检测SNP位点,可用于绘制基因图谱、检测突变位点以及单核苷酸多态性的检测方面。

纳米磁珠技术是一种分离富集技术,磁珠由磁性内核与高分子外壳组成,因受到外界磁场影响而定向运动,其外面的高分子可与多种活性物质相结合。

磁珠和寡核苷酸探针标记技术用磁珠替代了原来的尼龙膜,提高了检测效率和便捷性。

内容
百欧泰生物技术团队可以为客户定制各种抗体标记技术,客户可以自主选择需要的服务项目,我们一定会尽力满足您的需求。

基本原理
磁珠-寡核苷酸探针标记技术是利用磁性分离结合寡核苷酸技术的多重可扩增探针杂交的方法,将扩增探针与固定在磁珠上的DNA杂交,并利用磁珠回收特异性杂交的探针,回收的探针经扩增及荧光标记后,与设计的寡核苷酸芯片杂交,从而达到检测目的。

技术优点
●∙固定效率高
●∙特异亲和性强
●∙敏感度高
●∙简单便捷
●∙回收探针效率高
实验服务流程
双方沟通一致后确定实验方案,确定服务要求-签订合同—预付款-开始实验-成果交付。

染色质寡核苷酸沉淀

染色质寡核苷酸沉淀

染色质寡核苷酸沉淀
染色质寡核苷酸沉淀(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)是一种在细胞核内研究某种蛋白质与DNA结合情况的方法。

该方法通过利用特异性抗体结合目标蛋白质,将其与DNA结合的区域分离出来,并通过PCR、测序等方法分析特定基因或大片染色质区域的结合情况。

该方法包括以下步骤:
1. 交联:将细胞进行交联,使某种蛋白与DNA结合形成的复合物保持稳定状态。

2. 溶解:将细胞溶解,并将细胞核分离出来。

3. 剪切:利用酶切等方法将染色质DNA剪切成一定长度的片段。

4. 免疫沉淀:用特异性抗体结合目标蛋白质,将其与DNA结合的区域分离出来。

5. 逆交联:去除交联剂,使染色质DNA和蛋白质分离。

6. PCR或测序:对分离出来的DNA片段进行PCR扩增或测序,从而分析蛋白质与染色质DNA结合的区域。

该方法被广泛应用于研究基因调控、表观遗传学、疾病发生机制等方面,是分子生物学和遗传学领域的重要实验技术。

大规模并行微阵列寡核苷酸合成

大规模并行微阵列寡核苷酸合成

大规模并行微阵列寡核苷酸合成大规模并行微阵列寡核苷酸合成技术是一种革命性的生物合成技术,它通过同时合成多个寡核苷酸序列,大大提高了合成效率和产量。

这项技术的应用领域广泛,涵盖了基因工程、新药开发、生物传感器等诸多领域,具有广阔的应用前景。

大规模并行微阵列寡核苷酸合成技术的核心是微阵列芯片。

这种芯片上覆盖有数以千计的微小反应器,每个反应器都可以进行一次寡核苷酸合成反应。

通过精确控制每个反应器中的反应条件,可以在短时间内合成大量的寡核苷酸序列。

与传统的单个反应器合成方法相比,这种技术可以大大提高合成效率,节省时间和成本。

在大规模并行微阵列寡核苷酸合成技术中,合成寡核苷酸的核心步骤是酶催化和碱基化。

首先,将需要合成的寡核苷酸序列分解成单个碱基,并与酶催化剂一起加入到微阵列芯片中的每个反应器中。

当反应器中的温度和酶催化剂浓度达到一定条件时,酶催化剂与碱基发生反应,合成单个碱基。

在此过程中,每个反应器都可以同时进行不同的合成反应,实现大规模的并行合成。

其次,酶催化后的碱基需要进行碱基化处理,将其转化为寡核苷酸单元。

为了实现高效的碱基化反应,微阵列芯片上覆盖了大量的反应剂,用于催化碱基化反应。

每个反应器中的反应剂可以同时催化多个碱基化反应,从而进一步提高合成效率。

大规模并行微阵列寡核苷酸合成技术的优势在于它能够同时合成大量的寡核苷酸序列,不受传统合成方法中的时间和工艺限制。

这为基因工程和生物医学研究提供了很大的便利。

例如,在基因组学研究中,科学家可以使用这项技术快速合成大规模的基因片段,从而加快对基因功能的研究和理解。

在新药开发中,可以使用这项技术合成多种变体的寡核苷酸药物,从而寻找到更有效的治疗方法。

此外,大规模并行微阵列寡核苷酸合成技术还具备可扩展性和灵活性。

通过增加微阵列芯片上的反应器数量,可以进一步提高合成产量。

同时,可以根据需求合成不同长度和序列的寡核苷酸,满足不同研究和应用的需求。

总而言之,大规模并行微阵列寡核苷酸合成技术的出现极大地推动了生物合成领域的发展。

猪三种重要病毒寡核苷酸芯片诊断方法的建立的开题报告

猪三种重要病毒寡核苷酸芯片诊断方法的建立的开题报告

猪三种重要病毒寡核苷酸芯片诊断方法的建立的开题报告题目:猪三种重要病毒寡核苷酸芯片诊断方法的建立背景和意义:家畜疾病是影响养殖业经济效益和社会生产生活的重大问题之一。

在养猪业中,猪病的发病率和死亡率较高,病例多发。

三种重要的猪病毒,分别是猪流感病毒、猪繁殖与呼吸综合症病毒和猪 circovirus 病毒。

这些病毒致使猪的免疫力下降,从而引发猪舍腹泻、支气管肺炎等猪病。

为提高猪病的诊断效率和精度,建立快速检测的方法,对于繁殖养殖、疫情监测与防疫工作的开展具有重大意义。

研发具有高灵敏度和特异性的猪三种重要病毒寡核苷酸芯片,可以大大提高疾病的检测效率,诊断水平和工作效率。

研究内容:本研究旨在建立猪三种重要病毒寡核苷酸芯片诊断方法,提高猪病的检测效率与病原菌诊断水平。

具体内容包括以下几点:1. 设计猪病重要病毒的寡核苷酸序列2. 选取适当的探针序列3. 制备猪三种重要病毒寡核苷酸芯片4. 对寡核苷酸芯片进行验证实验,优选工作参数5. 进行病原体的检测和验证6. 与其他诊断方法进行对比试验,并分析其准确性、灵敏度、特异性等指标研究方法:本研究将采用生物芯片技术和分子生物学方法,实现猪三种病毒的检测和诊断。

具体方法包括:1. 病毒寡核苷酸探针的设计与合成:根据猪流感病毒、猪 circovirus 和猪繁殖与呼吸综合症病毒的寡核苷酸序列,利用生物信息学软件设计病毒特异性探针,并进行化学合成。

2. 芯片制备:利用印刷技术,在硅片表面上制备猪三种重要病毒寡核苷酸芯片,并印制病毒寡核苷酸探针。

3. 芯片实验操作:样品取自猪体内组织、分泌物、粪便等样本,提取寡核苷酸后进行杂交实验,利用扫描仪扫描芯片结果。

4. 芯片结果分析:结合样品浓度,利用生物信息学工具软件进行信号强度分析和数据解读。

预期成果:1. 成功建立猪三种重要病毒寡核苷酸芯片检测方法2. 获得猪流感病毒、猪 circovirus 和猪繁殖与呼吸综合症病毒的特异性探针序列和芯片结构3. 对芯片技术和分子生物学技术的应用进行了深入的研究,积累了大量的实验数据4. 对猪病的诊断、预防和控制工作提供重要的科学依据结论:本研究将建立猪三种重要病毒寡核苷酸芯片检测方法,其具有高度的效率、灵敏度和特异性,可为病原菌的检测提供有效方法,并为猪舍腹泻、支气管肺炎等猪病的预防和控制提供科学依据。

用于诊断四种猪疫病病毒寡核苷酸芯片的研制的开题报告

用于诊断四种猪疫病病毒寡核苷酸芯片的研制的开题报告

用于诊断四种猪疫病病毒寡核苷酸芯片的研制的开题报告一、研究背景及意义猪是我们国家的重要经济动物之一,也是重要的食品来源之一。

然而近年来,猪疫病的爆发给猪养殖业带来了巨大的经济损失和社会影响。

主要的猪疫病包括猪瘟、猪链球菌病、猪流感和猪繁殖与呼吸综合症。

这些疾病的症状相似,往往需要经过长时间的观察才能确定病因,导致病情无法及时被控制和治疗。

为了更好地防治猪疫病,快速而准确地诊断病毒是至关重要的。

传统的病毒诊断方法往往需要对病原体进行分离培养,再进行鉴定,耗费时间、成本高,并且容易受到污染和交叉反应的影响。

寡核苷酸芯片是一种新兴的高通量筛选工具,能够锁定多种病原体序列,包括病毒、细菌、真菌等,具有高敏感度和高特异性,是一种较为理想的病毒诊断方法。

因此,开发研制适用于猪疫病诊断的病毒寡核苷酸芯片,将为猪疫病的早期诊断和有效治疗提供一种快速、准确的技术手段,对于优化猪疫病的防治工作,有着重要的现实意义和应用价值。

二、研究内容本研究将针对猪疫病的四个主要类型(猪瘟、猪链球菌病、猪流感和猪繁殖与呼吸综合症),设计合适的核酸探针,构建病毒寡核苷酸芯片。

具体研究内容包括:1. 选择合适的病毒基因序列:根据目前对四种猪疫病类型病原体的已知基因序列,筛选出具有代表性的核酸序列,包括病毒的保护性抗原、表面抗原、毒素基因等。

2. 设计合适的核酸探针:根据已知的病原体基因序列,设计合适的核酸探针。

通过一系列生物信息学分析和实验验证,筛选出最具代表性和特异性的核酸探针,未知样本和已知病原体DNA样本都能准确识别。

3. 构建病毒寡核苷酸芯片:选用适合的芯片材料和芯片制造工艺,将病毒核酸探针在芯片上固定。

通过探针交叉验证和芯片稳定性测试,确保芯片的可靠性和重复性。

4. 测试病毒寡核苷酸芯片的准确性:利用不同类型的病毒样本(包括纯化病毒、病毒携带者的体液样本等)与未知样本进行测试,验证病毒寡核苷酸芯片的敏感性、特异性和准确性。

三、研究方法1. 生物信息学分析:利用BLAST、Clustal等多种生物信息学工具,针对已知基因序列进行序列比对、同源性分析,筛选出具有代表性的核酸序列。

寡核苷酸芯片

寡核苷酸芯片

寡核苷酸芯片寡核苷酸芯片的主要原理与cDNA芯片类似,主要通过碱基互补配对原则进行杂交,来检测对应片段是否存在、存在量的多少。

它与cDNA芯片的本质差别在于寡聚核苷酸芯片固定的探针为特定的DNA寡聚核苷酸片段(探针),而后者为cDNA。

基因表达芯片的两个重要参数是检测的灵敏度和特异性。

cDNA芯片由于基因长短不同以至Tm值各异,众多的基因在同一张芯片上杂交,使得杂交条件很难同一,使得传统的cDNA芯片的分辨能力受到限制。

寡聚核苷酸芯片序列选择经过优化,利用合成的一定长度(如20,30,70-mer 等)的寡核苷酸单链探针代替全长cDNA点样,制成芯片。

其优点:无需扩增,防止扩增失败影响实验;减少非特异杂交,能有效区分有同源序列的基因;杂交温度均一,提高杂交效率;减少二级结构。

此外,寡核苷酸芯片还可以通过原位合成法制备,而cDNA芯片只能通过后者制备。

上述特点使得寡核苷酸芯片的应用日益广泛。

但是当寡核苷酸序列较短时,单一的序列不足以代表整个基因,需要用多段序列。

高密度的寡核苷酸芯片作为一个有力的工具广泛用于分析基因组数据,与传统的凝胶分析方法比较起来,具有成本低、高通量、高度自动化的优点,这些寡核苷酸芯片,已广泛用于用遗传变异扫描、分子条编码、基因表达检测及测序。

寡核苷酸芯片主要用途包括:1)临床诊断方面。

用于研究人类多基因相关性疾病(如癌症、心血管疾病等),发现相关的基因及其相互作用机理,寻找早期发现,早期诊断的方法;同时还可制成外源性病原体相关基因芯片,如病毒性肝炎芯片等;2)基因功能研究。

应用基因芯片可以开展DNA测序、基因表达检测、基因突变性、基因功能研究、寻找新基因、单核苷酸多态性(SNP)测定等研究;3)药物筛选和新药开发。

采用了基因芯片技术来寻找药物靶标,查检药物的毒性或副作用,用芯片作大规模的筛选研究可以省略大量的动物试验,缩短药物筛选所用时间,在基因组药学(pharmacogenomics)领域带动新药的研究和开发;并可指导实现合理用药。

芯片寡核苷酸化学合成-定义说明解析

芯片寡核苷酸化学合成-定义说明解析

芯片寡核苷酸化学合成-概述说明以及解释1.引言1.1 概述概述芯片寡核苷酸化学合成是指利用芯片技术进行寡核苷酸的合成,是一种高效、精准的化学合成方法。

随着基因组学和生物技术的发展,寡核苷酸合成在基础研究和临床应用中的重要性日益凸显。

芯片寡核苷酸化学合成技术的出现,为寡核苷酸的合成提供了一种全新的思路和方法,极大地促进了生命科学领域的研究和应用。

本文将从芯片寡核苷酸化学合成的原理、方法与步骤以及在生物医药领域的应用等方面进行详细的介绍和讨论,旨在为读者提供全面、系统的了解和认识。

通过本文的阐述,读者将对芯片寡核苷酸化学合成有一个更深入的认识,并对其在生命科学领域的意义和未来发展有所启发和思考。

1.2 文章结构:本文分为引言、正文和结论三个部分。

在引言部分,将介绍对芯片寡核苷酸化学合成的概述,文章的结构和目的。

正文部分将详细阐述芯片寡核苷酸化学合成的原理、方法和步骤,以及它在生物医药领域的应用。

最后,结论部分将总结全文的内容,展望未来研究的方向,并探讨芯片寡核苷酸化学合成的意义和价值。

通过这样的结构,读者可以系统地了解芯片寡核苷酸化学合成的相关知识,并对其应用和发展有一个清晰的认识。

1.3 目的本文旨在介绍芯片寡核苷酸化学合成的原理、方法与步骤,以及在生物医药领域的应用。

通过深入探讨芯片寡核苷酸化学合成功能及应用,旨在为相关研究人员提供参考和借鉴,推动该领域的发展和应用。

同时,本文也旨在强调该技术在生物医药领域的重要意义,展望其在未来的发展前景,促进科学研究和生物医药产业的进步和发展。

2.正文2.1 芯片寡核苷酸化学合成原理芯片寡核苷酸化学合成是一种利用固相合成技术在微型芯片表面同时合成多个寡核苷酸序列的方法。

其原理是在芯片表面通过一系列化学反应,利用酶的特异性识别和核酸序列的互补配对原理,逐步合成目标寡核苷酸序列。

在芯片上进行寡核苷酸化学合成的关键在于合成步骤的控制和核酸序列的定向生长。

首先,在芯片表面固定一种特定的核酸单元(如脱氧核苷酸),然后通过化学方法依次添加不同的核苷酸单元,再经过去保护基团、活化、耦合等步骤,使得核酸序列通过互补配对逐渐生长,最终得到目标寡核苷酸序列。

寡核苷酸微阵列

寡核苷酸微阵列

寡核苷酸微阵列寡核苷酸微阵列是一种用于检测和分析核酸序列的技术。

它是基于DNA或RNA的互补配对原理,通过将多个寡核苷酸分子固定在芯片上并与待测样品中的核酸片段进行杂交反应,从而实现对目标序列的检测和分析。

下面将从原理、制备、应用等几个方面来介绍寡核苷酸微阵列。

首先是寡核苷酸微阵列的原理。

DNA或RNA寡核苷酸是由4种核苷酸(腺嘌呤、鸟嘌呤、胸腺嘧啶和鳞状嘧啶)组成的短链,它们能与目标核酸序列中的互补碱基序列发生特异性的互补配对反应。

寡核苷酸微阵列就是将这些寡核苷酸固定在芯片上的特定区域,形成一个网格状的阵列。

待测样品中的核酸片段与芯片上寡核苷酸的互补序列结合,通过检测这些结合事件可以获得目标序列的信息。

其次是寡核苷酸微阵列的制备过程。

寡核苷酸微阵列的制备需要经过一系列的步骤。

首先是设计合适的寡核苷酸序列,这一步需要考虑到目标序列的长度、互补序列的选择等因素。

然后,寡核苷酸需要被固定在芯片上,通常采用的方法是利用化学反应或生物反应在芯片表面形成共价键或非共价键。

最后,经过检验和分析,确定寡核苷酸微阵列的质量和性能。

寡核苷酸微阵列具有广泛的应用。

首先是基因表达谱分析。

通过将寡核苷酸微阵列与从生物样品中提取的mRNA反应,可以得到样品中基因的表达情况。

这对于研究不同组织或细胞类型的基因表达差异、发现新的基因等具有重要意义。

其次是SNP分析。

SNP(Single Nucleotide Polymorphism)是指遗传序列中单个核苷酸的变异。

通过寡核苷酸微阵列可以高通量地对大量SNP进行检测,有助于研究与疾病发生有关的基因突变。

此外,寡核苷酸微阵列还可以用于药物筛选、病毒检测等领域。

总结一下,寡核苷酸微阵列是一种用于检测和分析核酸序列的技术。

它通过固定在芯片上的寡核苷酸与待测样品中的核酸片段发生互补配对反应,实现对目标序列的检测和分析。

寡核苷酸微阵列的制备需要经过设计、固定和检验等步骤。

这一技术具有广泛的应用,如基因表达谱分析、SNP分析、药物筛选等。

寡核苷酸芯片技术

寡核苷酸芯片技术
经过放大后的信号通过荧光检测仪、化学发光检 测仪等仪器进行检测,获取定量或定性结果。
检测方法与仪器
杂交反应
将待测样本与寡核苷酸 芯片进行杂交反应,通 常在恒温条件下进行一
定时间。
洗涤与干燥
杂交后需要进行洗涤去 除未结合的游离核酸, 然后进行干燥处理以便
后续检测。
检测方法
荧光检测法、化学发光 检测法、酶联免疫法等。
基因组测序辅助分析
总结词
基因组测序辅助分析是利用寡核苷酸芯片技术对基因组测序数据进行验证和补充的一种 方法。
详细描述
随着高通量测序技术的发展,基因组序列数据的获取变得相对容易,但数据的质量控制 和准确性验证仍然重要。寡核苷酸芯片可以用于检测基因组序列中的结构变异、拷贝数 变异和单倍型等复杂变异模式,提高测序数据的准确性和可靠性。这一技术在临床诊断、
技术趋势
结合纳米技术、生物信息学和微流控 技术,开发新型寡核苷酸芯片平台, 实现高通量、高灵敏度和高特异性的 检测。
对生物科学研究的影响与价值
影响
寡核苷酸芯片技术为生物科学研究提供了强有力的工具,有助于深入揭示生命活动的分子机制和疾病 发生发展的机制。
价值
寡核苷酸芯片技术在药物研发、疾病诊断和治疗、个性化医疗等领域具有巨大的应用价值和潜力。
信号转导
杂交后的信号通过荧光标记、化学发光等标记技术进行转导,以便 后续的检测和成像。
信号放大技术
1 2 3
酶促扩增
利用DNA聚合酶等酶促反应,将杂交后的产物进 行扩增,提高信号的强度和特异性。
信号放大
通过串联反应或信号放大技术,将初始杂交信号 进行多级放大,进一步提高检测的灵敏度和准确 性。
信号检测
个体化医疗

寡核苷酸管芯片技术检测和鉴别我国不同组植原体

寡核苷酸管芯片技术检测和鉴别我国不同组植原体
C h i n e s e A c a d e my o f F o r e s t r y ,B e i j i n g 1 0 0 0 9 1 ,C h i n a )
A b s t r a c t : [ O b j e c t i v e ] T o i f n d t h e o p t i m a l s p e c i i f c p r o b e a n d d e v e l o p t h e d e t e c t i o n t e c h n i q u e u s i n g o l i g o n u c l e o t i d e
扩增结合 管芯片杂交技术 , 对 收集到的 1 5种植 原体 侵染的植 物样 品及其健 康对 照进 行检测 和鉴别 。[ 结果 ] 建立 了管 芯片检测和鉴别植原体技术体 系。l 5种病 害样 品中 , 1 3种 获得显著 的阳性杂 交信号 , 并且所 有的健康 对照 都
呈现 为阴性 。l 3种植原体病害依 1 6 S r D N A直接测 序可分为 1 6 S r I、 Ⅱ、 V、 X I X四组植原体。在所有探 针中 , 植原 体 的通用 探针 ( P p  ̄ 0 2 ) 可 以检测 到所有 确定 的植原体样品。1 6 S r I 组特异性探针 ( P p I - 4 6 5 ) 可以确定 1 6 S r I 组 的 泡桐丛枝 、 苦楝丛枝 、 桑树萎缩和莴苣黄化 4种植原体样 品。1 6 S r l I 组特异性探针 ( P p Ⅱ- 6 2 9 ) 仅可以确定 1 6 S r I I 组 的花生丛 枝 、 甘薯丛枝 和臭矢菜丛 枝 3种植 原体 样品 。但 1 6 S r V组 的枣 疯病 、 樱 桃致死 黄化 和重 阳木 丛枝 及 1 6 S r
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寡核苷酸探针的合成 及纯化
与载体基片通过化学反应连接
处理标本 (外周血或口腔粘膜) 提取基因组DNA PCR扩增并用引物标记
杂交 检测及数据分析
核酸分子杂交
杂交前
杂交后
七、杂交结果的检测方法
激光共聚焦扫描
激光共聚焦扫描原理
Laser beam
Detector lens
Detector
Filter Confocal pinhole
探针
23 mer
50 mer
50mer 基因特异性探针 每个微珠连接有近百万探针 每种类型微珠~30倍重复 探针设计:生物信息学分析挑选几个候选探针,动力学反应扫描确定(专利)
Scanned Image and Data output analyzed with
BeadStudio
2、寡核苷酸检测芯片技术方法流程
姜振玲
一、基因芯片概念
基因芯片(gene chip)又称DNA芯片, 是指将许多特定的寡核苷酸片段或基因片 段有序地、高密度地排列固定于支持物上, 待测样品核算分子经过标记,与固定在载 体上的DNA阵列中的点按碱基配对原理 同时进行杂交。杂交形式属于固液杂交。 通过激光共聚焦荧光检测系统进行扫描以 获取样品数量和序列信息。
Objective lens Substrate
检测芯片扫描图示
谢谢! The End
二、基因芯片的主要特征
高通量--提高信息量 平行化--提高信息的可比性 微量化--降低待测样本的用量 自动化--提高工作效率 低成本--可迅速普及推广
三、基因芯片分类
cDNA芯片 寡核苷酸芯片
寡核苷酸芯片和cDNA芯片的比较
比较内容 DNA类型 DNA长度 DNA链 DNA制备 连接方式 应用
寡核苷酸芯片 寡核苷酸 小于80碱基 单链 预合成或原位合成 共价键 基因表达谱、突变等
cDNA芯片 cDNA 500-3000碱基 双链 PCR产物 共价键或离子键 基因表达谱
四、寡核苷酸芯片的特点
序列经过优化,减少非特异杂交,能有效 区分有同源序列的基因;
减少二级结构; 杂交温度均一,提高杂交效率; 合成产物浓度均一,避免因样品浓度差异
而造成的点样量差异; 无需扩增,防止扩增失败影响实验
五、寡核苷酸芯片分类
根据寡核苷酸应用方向的不同,可将其分为 两类:
表达谱芯片:用于检测基因的表达状况 (我公司目前使用的illumina表达谱芯片 即为此类)
检测芯片: 用于检测特定基因是否存在 (我公司使用的DRB检测芯片为此类)
六、寡核苷酸芯片的技术原理
1.寡核苷酸表达谱芯片的技术方法流程:
寡核苷酸探针的合成 及纯化
实验组样本
对照组样本
RNA分离
与载体基片通过化学反应连接
RNA反转录扩增标记
杂交 激光共聚焦扫描检测及数据统计
筛选不同处理后表达的差异基因

完整RNA检测:直接杂交
** *
** *Biotin 标记 cRNA * ***
微珠
地址序列
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