超详细的Western实验步骤及结果分析
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Western实验步骤
1. 电泳(Electrophoresis)
(1)SDS-PAGE凝胶配制
SDS-PAGE凝胶进行配制,配方试剂去离子水,Arc-HCL(29:1),10%APS,SDS,TEMED。
一般按分子大小配胶,现实验分离胶配12%-15%的胶,浓缩胶10%的胶。
配胶步骤:
1.清洗玻璃板,装好(注意不要漏即玻璃板要对齐)。
2.按比例配分离胶(8ml-10ml)
3.加水压胶,待分离胶凝固后(可见有分离胶与水有分隔线,一般凝固时间30分钟-1小时左右),吸走上层水面
4.按比例配浓缩胶(3ml-4ml),加入分离胶上层,插入梳子,(注意别有气泡),待凝。(如果今日不上样可以放入4°C冰箱)
注意:玻璃板要洗得干净;玻璃板要装好,不要漏;制胶过程中,一定要充分混匀,而且避免有气泡;(2)样品处理
1.准备无菌EP管,向EP管内加入样品蛋白质体积的1/4体积的SDS缓冲液(5X的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液,现样品加 3.5ul),之后加入相应蛋白样品(要制冰,蛋白质样品要放置在冰上),充分吹打混匀
2.100℃水浴加热5分钟,以充分变性蛋白。
3.12000r离心5分钟。
(3)上样与电泳
1.将玻璃板装入电泳槽中,加电泳缓冲液至泳槽的的2/3左右
2.蛋白质样品冷却到室温后,直接上样到SDS-PAGE胶加样孔内即可,样品两边加蛋白质Maker(6ul)(注意上样蛋白质顺序,一定不要弄错)。
3.通常把电压设置在100V,然后设定定时时间为100分钟(一般为90-120分钟)。设置定时可以避免经常发生的电泳过头。
通常电泳时溴酚蓝到达胶的底端处附近即可停止电泳,或者可以根据预染蛋白质分子量标准的电泳情况,预计目的蛋白已经被适当分离后即可停止电泳。(为了避免电泳过头,最好是在电泳设定时间的提前30分钟观察电泳)
注意:上样时尽量避免样本被上漏出孔外;注意电泳时间的把握;最重要的是一定要记录上样顺序,必要时记录在本子上。
电泳常出现的现象:
a.︶条带呈笑脸状,原因:凝胶不均匀冷却,中间冷却不好。
b.︵条带呈皱眉状,可能是由于装置不合适,特别可能是凝胶和玻璃挡板底部有气泡,或者两边聚合不完全。
c.拖尾:样品溶解不好。
d.纹理(纵向条纹):样品中含有不溶性颗粒。
E.条带偏斜:电极不平衡或者加样位置偏斜。
f.条带两边扩散:加样量过多。
3.转膜(Transfer)
1.物品准备,甲醇,转膜缓冲液,滤纸,转膜槽,玻璃皿3个,制冰。
2.取下胶板,用专门的板将玻璃板分离(务必不要将胶弄破,动作轻些,从下面和上面分离玻璃板),切适合大小的胶(不要切掉MAKER)。
3.用专门的板将胶转入事先放有转膜缓冲液的皿中,记录胶的顺序,剪与胶同等大小的滤纸和转膜纸PVDF膜,PVDF膜要放入甲醇中浸15秒(一般1-2分钟),胶要切角做标记(不要切到maker),一般一个切三个角,一个切一个角,记录顺序
4.铺膜,PVDF膜铺在胶上,在PVDF膜上铺三层滤纸,然后胶的对侧面铺三层滤纸即可(滤纸要大于等PVDF膜,PVDF膜要大于等胶),赶尽气饱。
5.再将铺好的膜胶滤纸,转入转膜夹中,有PVDF膜这面放在正极侧(即无色透明夹这面),再将夹子放入转膜槽里(电极不要放错,蛋白质带负电的)
6.转膜,槽放入冰中,槽内放冰槽,设定转膜电流为300-400mA,电压120伏,转膜时间为40分钟(30-60分钟)。
注意:实验选用PVDF膜但硝酸纤维素膜比较脆,在操作过程中特别是用镊子夹取,膜不要碰到其他地方特别是手不要碰到膜;动作要轻;赶尽气饱;正负极不要弄错;记录胶的顺序;
通常如果使用Bio-Rad的标准湿式转膜装置,可以设定转膜电流为300-400mA,电压120伏,转膜时间为30-60分钟。也可以在15-20mA转膜过夜。具体的转膜时间要根据目的蛋白的大小而定,目的蛋白的分子量越大,需要的转膜时间越长,目的蛋白的分子量越小,需要的转膜时间越短。
在转膜过程中,特别是高电流快速转膜时,通常会有非常严重的发热现象,最好把转膜槽放置在冰浴中进行转膜。
转膜的效果可以观察所使用的预染蛋白质分子量标准,通常分子量最大的1-2条带较难全部转到膜上。转膜的效果也可以用丽春红染色液对膜进行染色,以观察实际的转膜效果。也可以用考马斯亮蓝快速染色液对完成转膜的SDS-PAGE胶进行染色,以观察蛋白的残留情况。
4.封闭
1.转膜完毕后,将蛋白膜放入,TBS漂洗1-2分钟
2.再用TBST封闭,在摇床上摇1小时,装入薄膜内
配制TBS:1MtriHCL (PH8.0) 10ML,1M NaCL 150ml,dd水 840ml;
TBST(MILLK):5%millk(脱脂奶粉),0.1%tween20,TBS
注意:从转膜完毕后所有的步骤,一定要注意膜的保湿,避免膜的干燥,否则极易产生较高的背景;对于一些背景较高的抗体,可以4℃封闭过夜。
5. 一抗孵育(Primary antibody incubation)
1.切所需蛋白条带后,参考一抗的说明书,按照适当比例用TBST(有奶粉的)稀释一抗。放置在冰上
2.有薄膜将所需条带封住,立即加入稀释好的一抗后,封口,4℃孵育过夜。
注意:其实室温或4℃在侧摆摇床上缓慢摇动孵育一小时。如果一抗孵育一小时效果不佳,可以4℃缓慢摇动孵育过夜。或更据抗体的说明选择适当的孵育温度和时间。
6.二抗孵育(antibody incubation)
1.回收一抗。
2.取出膜,放入TBST(没MILLK)中摆摇床上缓慢摇动洗涤5分钟(5-10分钟),共洗涤3次
注意:如果结果背景较高可以适当延长洗涤时间并增加洗涤次数,一般洗膜后以MAKER条带背景变淡一些为好。
3.参考二抗的说明书,按照适当比例用TBST(MILLK)稀释辣根过氧化物酶(HRP)标记的二抗。二抗需根据一抗进行选择,例如,一抗是小鼠来源的IgG,则二抗需选择抗小鼠IgG的二抗
4.立即加入稀释好的二抗,室温或4℃在侧摆摇床上缓慢摇动孵育一小时。回收二抗。
5取出膜,放入TBST(没MILLK)中摆摇床上缓慢摇动洗涤5分钟(5-10分钟),共洗涤3次,如果结果背景较高可以适当延长洗涤时间并增加洗涤次数
7.显色和曝光
1.物品准备:显色试剂A、B(A;B=1ml:25ul),显影液,定影液,保鲜膜,胶片