大片段DNA的克隆

通常超过3Kb以上的片段不太容易构建到载体上，成功率也是非常的低，根据笔者多年的经验成功克隆过5kb左右的基因片段，先将一些心得与大家分享：

第一、PCR产物确保正确，扩增长片段往往会出现点突变，缺失插入突变，甚至是并非自己想要的片段，此时就要要求所用的TAQ酶是高质量高保真高前进能力的酶——推荐primerstar，并且保证所设计的引物的特异性，如果有错配的可以尝试不加MCS的巢式引物，拿第一次PCR产物再用加MCS的引物去扩，可保证起特异性和效率性。

第二、连接要求有效，通常大片段与载体相连接由于空间位阻的原因不太容易得到阳性克隆，所以一定要保证以下几点-目的基因绝对的大量保证在载体的10-15倍摩尔比值；载体最好不要太小，可以直接尝试表达载体；最好使用过夜16度连接（24h以上），快速连接的效果对于大片段来讲并不占优势；连接酶可适当多加。

第三、转化要高效，由于大片段克隆到载体上通常加上载体会比较大，有时甚至超过10-20kb，这时会严重影响转化效率和细菌的生长速度，可以考虑电转或者，300-400ul的感受态细胞，严格按要求转化，使用DH5a时，可能消耗能量的原因，细菌长得很慢，可以考虑用TOP10,或DH5a多培养一段时间

第四、不轻易放弃，长出来的菌因为质粒很大，去做菌落PCR不一定能检测出来阳性菌，可以考虑照样接种，次日提质粒酶切鉴定。也可以多对比几个不同的载体，相信一定能做出来的。

第五、实在是做不出来，将其肢解成多个小片段，每个片段构建到T载上，最后拼接到一起。

第六、克隆大片段真核基因，要保证高质量的RNA，以确保完整的片段，并且需要高质量的逆转录酶，可以将RNA的量加到说明书的上限，保证足够浓度的完整的cDNA片段。如果大片段的外显子不是很多，还可以考虑用基因组或BAC/Y AC来调取目的基因。

原文地址:/biotech/exp/molbio/DNA/2010/a818444974.html