基因型鉴定 中科院版

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1.鼠尾DNA提取

第一天:

1.剪取小鼠尾尖(同样适用于脚趾,胚胎组织,卵黄膜等,若不立即提取,可以

放置4℃数日)放入1.5ml EP 管。

2.每管加入鼠尾裂解液 350ul +10ul 蛋白酶K(简称PK,10mg/ml,现用现加)。

3.55℃水浴消化过夜

第二天:

4.用劲将消化好的组织摇匀(可用振荡器摇匀)。

5.每管加入350ul 酚/氯仿(苯酚:氯仿:异戊醇25:24:1,事先配好,4℃保

存)。

6.上下充分混匀,室温静置3分钟后,离心,12000转,30分钟。

7.取出离心后的EP管,可见液体分为三层,取上层无色水相液体约200μl于新

1.5ml EP管中,注意勿吸取中层液体。(不能将中间的蛋白层吸起来,否则会

对后续的实验造成影响。为防止压力过大,可使用切去尖端的枪头)。

8.向新EP管中加入400μl无水乙醇(为2倍于上清的体积),上下颠倒混匀,此

时应可看到白色丝状样的DNA。

9.离心12000转,10分钟。

10.可看到有白色沉淀,弃去上清,加入1ml的75%乙醇,将沉淀弹起,以便去除

DNA上过多的离子。

11.离心,12000转,10分钟。

12.弃去上清,倒置EP管于吸水纸上,室温干燥约15分钟(注意不能过分干燥,以免

基因组DNA难溶解)。

13.加入150-200μl (根据DNA沉淀的量)无菌蒸馏水或者是TE Buffer,可放置37℃助溶。

14.短期4℃,长期-20℃保存。

相关配方:

1.鼠尾裂解液配方

1000ml溶解液中含:

100mM Tris-HCl pH8.5

5mM EDTA

0.2%SDS

200mM NaCl

室温保存。

2.蛋白酶K溶液:

取100mg 蛋白酶K,加去离子水10ml使成10mg/ml,分装后冻存于 -20℃,用时溶解。

3.酚/氯仿:

取Tris平衡酚50ml,氯仿48ml,异戊醇2ml加入100ml棕色试剂瓶中混匀,4℃避光保存。

2.基因鉴定PCR反应

标准的PCR反应体系:

10×扩增缓冲液 10ul

4种dNTP混合物各200umol/L

引物各10~100pmol

模板DNA 0.1~2ug

Taq DNA聚合酶 2.5U

Mg2+ 1.5mmol/L

加双或三蒸水至 100ul

以我们实验室常用的PCR25ul体系为例:

10xbuffer: 2.5ul

dNTP 2ul

MgCl2: 1.5ul

Primer F: 1ul

Primer R: 1ul

Taq酶: 0.5ul

DNA模板: 1~3ul

去离子水加至: 25ul

退火温度根据引物合成说明书决定

PCR操作注意事项:

1)PCR的复合管配制需在冰上进行,尤其taq酶需始终放于冰上,或者在最后加入时

从-20°冰箱拿出,加完后立即放回。

2)PCR反应极为灵敏,操作过程应当注意避免样本之间的相互污染,吸取不同样本时应

当换枪头。

3.琼脂糖凝胶电泳

1.根据欲分离DNA片断大小用凝胶缓冲液(TAE 缓冲液)配制适宜浓度的琼脂糖凝胶,

以1%胶为例:称取琼脂糖1克,倒入通风橱内的锥形瓶中,尽量不要让粉末沾在内壁上。用量筒量取1×TAE100ml ,倒入锥形瓶,戴入一次性手套混匀。

2.戴一次性手套把锥形瓶放入微波炉,加热3min左右,使琼脂糖彻底溶解,看不到颗粒

为止。在此期间插好制胶的板槽和梳子。

3.迅速将锥形瓶置于通风橱内,冷却片刻,用通风橱内20μl枪,吸6~10ul(0.05%)的

EB,插入液面,轻轻旋转以充分混匀凝胶溶液,倒入电泳槽中,注意避免产生气泡,如有气泡,应设法除去。(枪头应丢入指定垃圾箱)

4.等待30min冷却。

5.凝固后,戴一次性手套,先两端起开一点梳子,再将梳子完全拔出,将胶安放在电泳

槽内。

6.向电泳槽中倒入电泳缓冲液,其量以没过胶面1mm为宜,如样品孔内有气泡,应设法

除去。退掉一次性手套加样。

7.每个25ul样本加入6×buffer 5ul,混匀后,将样品缓冲液缓慢加入被浸没的凝胶加样

孔内。

8.加样后。带上一次性手套接通电源,插上+/ -极,切记DNA样品由负极往正极泳动。

设置电压,一般为60-100V,按下RUN开始电泳,电泳15-30分钟即可。

9.根据指示剂泳动的位置,判断是否终止电泳;一般前端染料到2/3处即可。

10.电泳完毕后,戴一次性手套关掉电泳仪。拿出胶版,推出胶。在凝胶成像仪上观察电

泳带及其位置,并与核酸分子量标准Marker比较被扩增产物的大小。

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