肿瘤相关基因突变的临床意义及其检测方法
肿瘤基因突变检测
肿瘤基因突变检测癌症是一类难以预防的疾病,中晚期癌症治愈的可能性又很小,而早期癌症的治愈率可达65%以上,有些肿瘤可达90%以上,因此,战胜癌症的关键是早期发现癌症。
由于癌症早期常无特殊症状,甚至毫无症状,故癌症的早期发现、早期诊断主要是通过定期健康体检和人群筛查完成。
目前筛查癌症的方法主要是通过化验血肿瘤指标及B超、CT、MRI、PET-CT 等检查,但这些方法的敏感性和特异性均不高,发现有异常时往往已是中晚期。
17种常见高发肿瘤,包括乳腺癌(breast cancer)、结肠癌(colorectalcancer)、子宫癌(endometrial cancer)、脑胶质瘤(glioma)、白血病(leukemia)、肺癌(lungcancer)、淋巴癌(lymphoma)、成神经管细胞瘤(medulloblastoma)、黑色素癌(melanoma)、间皮瘤(mesothelioma) 、多性骨髓瘤(multiple myeloma) 、卵巢癌(ovarian cancer)、胰腺癌(pancreatic cancer) 、真性红细胞增多(polycythemia vera) 、前列腺癌(prostatecancer) 、肾细胞癌(renal cell cancer)和恶性内瘤(sarcoma),其发病机制涉及与多种肿瘤发生共同相关的肿瘤易感基因群介导的分子改变,参与了肿瘤发生的早期分子事件。
系统寻找和探讨它们在肿瘤发生发展过程中的遗传学变异,对阐明肿瘤早期发生机制及寻找肿瘤早期预警、早期诊断和早期治疗的分子靶标都具有重要的现实意义。
利用高通量分子测序技术平台,可同时开展多个肿瘤基因突变检测项目,如EGFR、K-RAS 、N-RAS、B-RAF、PI3K 、p53、p16、BRCA1、BRCA2等。
K-RAS 基因(K-ras,p21)突变检测KRAS基因(K-ras,p21)检测是目前医生了解大肠癌患者癌基因状况最直接、最有效的方法,通过检测不仅可以深入了解癌基因的情况,更重要的是筛选出针对抗表皮生长因子受体靶向药物治疗有效的大肠癌患者,帮助医生选择对肿瘤病人最有效的治疗方法。
肿瘤的基因突变和靶向治疗
肿瘤的基因突变和靶向治疗随着科技的进步,肿瘤治疗的方法也在不断的发展和完善。
其中,基因突变和靶向治疗成为了新的研究方向和治疗手段。
这一方面意义深远,可以为肿瘤患者提供更加个体化的治疗方法,同时也具有更好的治疗效果和预后。
一、基因突变的概念和类型基因是生物体遗传信息的载体,它是由DNA构成的。
而基因突变则是指DNA序列发生改变的现象。
基因突变是肿瘤发生和发展的核心原因之一,它可以导致基因功能的改变,从而影响生长、分化、凋亡等生命活动的平衡,最终导致肿瘤发生。
目前,总体来看,基因突变主要分为两大类:致癌基因突变和抑癌基因突变。
其中,致癌基因突变常常引起基因失控、异常活化等问题,从而导致细胞的异常增殖和恶性转化;而抑癌基因突变则会使细胞内的抑制性信号受到抑制,从而失去控制生长的限制,也可以促进肿瘤的发生和发展。
二、基因突变的影响和检测方法基因突变的影响很大,它不仅可以影响细胞的增殖、分化和凋亡等生命过程,还可以影响药物的治疗效果和预后,从而引起肿瘤的恶化或治疗失败。
因此,对基因突变进行检测是非常重要的。
目前,常见的检测方法包括:基因测序、基因芯片、PCR等方法。
其中,基因测序是检测基因突变的最常用方法之一,它可以对细胞中的DNA进行全面的测序,获得更加详细和全面的基因信息。
三、基因突变与靶向治疗的关系基因突变和靶向治疗是密切相关的。
基因突变不仅是肿瘤发生和发展的核心原因之一,它还为靶向治疗提供了更加个体化的治疗手段和方向。
靶向治疗是指利用特定药物针对肿瘤特异性靶标进行治疗的方法。
与传统的化疗药物不同,靶向治疗的药物更加精准和个体化,可以减少其他细胞的不良影响,并且针对特定的肿瘤特征进行治疗,具有更好的治疗效果和预后。
最终,基因突变与靶向治疗的结合可以为肿瘤患者提供更加个体化和精准的治疗手段,从而提高治疗效果和预后。
未来,这一理论还有很大的发展空间和应用前景,值得我们密切关注和研究。
肿瘤相关基因的临床意义
肿瘤相关基因的临床意义摘要:目的:探究肿瘤基因治疗方法的临床意义。
方式:举例利用JAK2基因突变方法诊断髓系恶性肿瘤。
结果:不同髓系恶性肿瘤中可见不同种基因突变。
结论:通过全文介绍可以知道,在我国目前治疗肿瘤的方法中,基因治疗方式有很高的利用价值。
关键词:肿瘤;基因;临床意义;引言随着医学水平的提升,我国对于肿瘤的治疗方式也有了突破。
本研究主要针对肿瘤的相关基因进行治疗,也就是说,利用基因治疗的方式来治愈肿瘤。
随着基因技术水平的不断发展,基因治疗肿瘤的方式有很广阔的应用前景。
研究对象以及相关资料2.1浅析肿瘤概念肿瘤是指机体在各种致瘤因子作用下,局部组织细胞增生所形成的新生物,因为这种新生物多呈占位性块状突起,也称赘生物。
根据新生物的细胞特性及对机体的危害性程度,又将肿瘤分为良性肿瘤和恶性肿瘤两大类,而癌症即为恶性肿瘤的总称。
要提请注意的是,癌症与癌是两个不同的概念,癌指的是上皮性的恶性肿瘤,如由大肠黏膜上皮形成的恶性肿瘤称为大肠黏膜上皮癌,简称大肠癌。
近年来,由于环境污染和人们生活方式的变化,以及工作和生活上的压力加剧,生活长期无律,越来越多的人群呈现出一种亚健康状态,各种疾病趁虚而入,世界癌症的发病率也显示逐年升高的趋势。
癌症的遗传异质性、病灶转移性、个体差异性,给癌症的治疗带来了极大的困扰。
自肿瘤基因检测技术应用以来,治疗效果十分显著,得到了越来越多的癌症患者的认可,是极为有前途的个体化治疗方法。
肿瘤分子靶标在癌症的个性化治疗中起到了极为重要的作用,目前科学家正在陆续发现这些分子靶标,已经发现并应用于临床的分子靶标药物逐渐增多,为众多癌症患者的治疗带来了希望。
肿瘤治疗逐渐告别了局部治疗时代和化疗时代,正走向系统化治疗时代。
长期以来,对癌症确诊患者,尤其是晚期癌症患者,多采用放疗和化疗的治疗方案。
但由于放疗和化疗不能主动识别癌细胞,针对性较差,在抑癌杀癌的过程中,对正常细胞也同样具有杀伤作用,使人体机能严重受损,在整个治疗过程中给病人带来极大痛苦。
癌症肿瘤抑制基因突变
癌症肿瘤抑制基因突变癌症是一组恶性肿瘤的总称,是由于细胞基因突变导致的异常细胞增殖和分化失控所引起的一种疾病。
在癌症的发展过程中,肿瘤抑制基因的突变是一个重要的影响因素。
本文将重点探讨癌症肿瘤抑制基因突变的相关知识。
I. 癌症肿瘤抑制基因突变的定义癌症肿瘤抑制基因突变是指抑制肿瘤生长和发展的基因发生了异常的变异。
这些基因在正常情况下可以抑制肿瘤的发生,但是当其发生突变时,就会失去原有的功能,无法有效地抑制肿瘤的生长,从而导致癌症的发展。
II. 癌症肿瘤抑制基因突变的类型癌症肿瘤抑制基因突变可以分为两大类:基因缺失突变和突变失活。
1. 基因缺失突变基因缺失突变是指癌细胞中某个或某些抑制肿瘤的基因发生了缺失。
这种突变会导致抑制肿瘤的遗传物质丧失,使肿瘤细胞失去正常细胞生长和分化控制的制约,从而促使肿瘤的形成与发展。
2. 突变失活突变失活是指癌细胞中的肿瘤抑制基因发生了点突变,使其产生了非功能性或功能受损的蛋白质。
这种突变会导致肿瘤抑制基因无法正常发挥其抑制肿瘤的作用,失去了对癌细胞生长和分化的正常调控。
III. 癌症肿瘤抑制基因突变的影响癌症肿瘤抑制基因突变会对肿瘤的生长和发展产生深远的影响。
1. 促进肿瘤发生正常情况下,癌症肿瘤抑制基因可以有效地抑制肿瘤的生长和分化,但当其发生突变时,失去抑制功能,使得肿瘤细胞无法受到约束,从而促进肿瘤的发生和扩散。
2. 影响肿瘤的预后癌症肿瘤抑制基因突变还会对肿瘤的预后产生重大影响。
许多研究表明,某些癌症患者的肿瘤中存在肿瘤抑制基因的突变,这些突变与患者的预后密切相关。
一些研究人员甚至认为,肿瘤抑制基因的突变类型和频率可以作为判断癌症患者疾病预后的重要依据。
IV. 癌症肿瘤抑制基因突变的检测方法癌症肿瘤抑制基因突变的检测是遗传学和分子生物学领域的研究热点之一。
目前常用的检测方法主要包括:1. 基因测序利用高通量测序技术,对肿瘤样本中的基因进行测序分析,以寻找肿瘤抑制基因的突变。
基因突变在肿瘤发生发展过程中的作用与临床判断
基因突变在肿瘤发生发展过程中的作用与临床判断简介:肿瘤是一种由异常细胞在机体内不受控制地增殖形成的疾病。
基因突变作为肿瘤发生发展的重要机制之一,对肿瘤的病理分型、临床判断和个体化治疗等具有重要意义。
本文将探讨基因突变在肿瘤发生发展过程中的作用,并解释其在临床判断中的应用。
一、基因突变与肿瘤发生发展的关系1.1 基因突变的定义和机制基因突变是指DNA序列发生变异导致基因功能的改变。
在肿瘤中,这些突变通常是细胞遗传物质的复制、修复和再组合等机制的累积结果。
它们可以发生在癌症相关基因中,如肿瘤抑制基因(TSG)和肿瘤促进基因(Oncogene),导致这些基因在肿瘤发生发展中的异常表达或功能改变。
1.2 基因突变的作用基因突变在肿瘤发生发展过程中起到至关重要的作用。
它们可以造成细胞周期的紊乱、细胞凋亡的抑制、血管生成的促进,以及细胞的浸润和转移等。
此外,基因突变还与肿瘤的预后、治疗效果和耐药性等密切相关。
二、基因突变与临床判断2.1 基因突变与肿瘤病理分型基因突变可以帮助确定肿瘤的病理分型。
通过检测肿瘤细胞中特定基因的突变情况,可以将肿瘤分为不同的亚型,如肺癌中的EGFR突变和ALK融合基因等。
这种亚型分型有助于确定治疗方案并预测肿瘤患者的预后。
2.2 基因突变与肿瘤预后评估基因突变对肿瘤的预后评估具有重要意义。
某些基因突变可以被用来预测患者的治疗反应、复发和生存率等重要临床指标。
例如,在乳腺癌中,HER2突变被认为是预测患者抗HER2治疗效果和预后的重要标志物。
2.3 基因突变与个体化治疗基因突变的检测可以为肿瘤患者提供个体化治疗策略。
根据某些基因突变的存在与否,医生可以选择合适的靶向治疗药物,以提高治疗的效果和减少不必要的不良反应。
例如,在结直肠癌中,KRAS突变可导致抗EGFR治疗的耐药性,因此只有KRAS突变阴性的患者才能受益于这种治疗策略。
2.4 基因突变与耐药性研究基因突变还与肿瘤耐药性的研究息息相关。
肿瘤科基因检测与个体化治疗
肿瘤科基因检测与个体化治疗近年来,随着科技的不断进步和医学的飞速发展,肿瘤治疗领域也迎来了一次革命性的变革。
基因检测与个体化治疗作为肿瘤科研究的重要领域,为患者提供了更加精确、个性化的治疗方案。
本文将探讨肿瘤科基因检测与个体化治疗的意义、方法和前景。
一、基因检测的意义1. 基因检测可以帮助发现遗传突变肿瘤的发生与基因突变密切相关。
基因检测可以帮助医生发现与肿瘤相关的遗传突变,从而对患者的病情进行更准确的评估。
通过对肿瘤基因的检测,可以了解肿瘤的发生机制,针对性地选择合适的治疗方法。
2. 基因检测可以预测治疗效果不同个体对同一治疗方法的反应可能存在差异。
基因检测可以帮助医生预测患者对某种治疗方案的敏感性和耐药性,避免因试错而造成的不良影响。
基因检测结果可以为医生制定个性化治疗方案提供有力的依据。
二、基因检测的方法1. 常见的基因检测技术常见的基因检测技术包括PCR、测序技术和芯片技术。
PCR技术是最常用的基因检测方法之一,它可以通过扩增目标基因片段,检测该基因的突变情况。
测序技术可以对DNA或RNA的序列进行测定,帮助全面了解基因的变异情况。
芯片技术则可以同时分析多个基因的表达水平,快速筛查出与肿瘤相关的基因。
2. 基因检测的操作流程基因检测的操作流程主要包括样本采集、DNA或RNA提取、PCR扩增、测序分析和结果解读等步骤。
在样本采集过程中,通常采用活检组织、血液或体液等方式获取患者的生物样本。
提取样本中的DNA或RNA后,可以通过PCR扩增目标基因,在测序仪或芯片上进行测序或芯片检测,最终解读结果得出。
三、个体化治疗的意义1. 个体化治疗可以提高治疗效果个体化治疗是根据患者的基因检测结果,为其量身定制治疗方案。
通过了解患者的基因信息,医生可以选择更加有效的治疗手段,提高治疗的成功率。
个体化治疗在一定程度上解决了传统治疗方法的不足,为患者提供更好的治疗效果。
2. 个体化治疗可以减少副作用传统的治疗方法往往对患者的整体产生一定的影响,包括不可避免的副作用。
肿瘤细胞基因突变的快速检测技术
肿瘤细胞基因突变的快速检测技术肿瘤是一种常见的疾病,它的形成涉及到基因突变,而快速准确地检测肿瘤细胞的基因突变对于肿瘤的治疗和预后具有重要意义。
在近些年,肿瘤细胞基因突变的快速检测技术不断发展,可以通过多种方法进行检测,如下文所述。
首先介绍的是PCR(聚合酶链反应)技术。
PCR技术是一种将DNA扩增的方法,它能对肿瘤细胞中的基因进行快速检测。
PCR 技术是通过特殊的酶,将DNA链的两端不断进一步复制,从而形成大量的DNA分子。
在PCR技术中,我们可以将特定的一段DNA序列扩增,从而检测基因突变。
这种方法可快速准确地检测出肿瘤细胞基因的突变情况。
其次是基于Nanopore技术的检测方法。
Nanopore技术是新兴出现的一种基于纳米孔的单分子检测技术。
Nanopore技术可以将试样分成很小的单元,然后通过纳米孔通道测量样品中不同的成分。
在肿瘤细胞的基因检测上,Nanopore技术可以实现对具有高度变异的基因区域进行快速检测,从而提高肿瘤检测的准确率。
另一种方法是利用NGS(下一代测序)技术。
NGS技术是一种高通量DNA测序方法,可以将该样品DNA中的所有序列片段同时测序并得到数据。
在肿瘤细胞检测中,该技术可将基因突变的信息与参考基因库进行比对,从而快速准确地发现肿瘤细胞中的基因突变。
通过NGS技术分析,医生可以精准地针对患者的病情,进行个性化的治疗方案设计。
最后,基于电泳的检测技术也是一种常见方法。
在肿瘤细胞基因突变的快速检测方面,电泳技术可以识别DNA序列中的单核苷酸变异(简称SNV)或结构变异(简称SV)。
电泳技术基于电极原理,可以将DNA序列按碱基组成的大小不同进行分离,从而实现来自临床样本和细胞系的SNV和SV基因检测。
总之,随着技术的不断进步和发展,对肿瘤细胞基因突变的快速检测成为了一种非常重要的手段。
无论是PCR技术,还是Nanopore技术、NGS技术或电泳技术,都提供了精准、灵敏、可靠的检测手段,在临床肿瘤治疗中起到了重要作用。
肿瘤基因检测的解读流程
肿瘤基因检测的解读流程一、引言肿瘤基因检测是一种新型的检测方法,它可以通过对肿瘤组织或血液样本中的基因进行分析,帮助医生制定个性化治疗方案。
但是,对于普通人来说,肿瘤基因检测的结果往往难以理解。
本文将从样本采集、检测流程、结果解读等方面进行详细介绍,希望能够帮助大家更好地了解肿瘤基因检测。
二、样本采集1. 肿瘤组织样本采集肿瘤组织是最常见的样本类型之一。
一般情况下,医生会通过手术或穿刺等方式获取肿瘤组织样本,并将其送往实验室进行检测。
2. 血液样本采集血液样本采集相对简单,只需要在静脉注射针头插入后抽取2-5ml血液即可。
但是需要注意的是,在采集血液前需要遵守一些特定的规定和注意事项。
三、检测流程1. DNA提取首先需要将肿瘤组织或血液中的DNA提取出来。
DNA提取是肿瘤基因检测的第一步,也是最为关键的一步。
目前市面上常用的DNA提取方法有化学法、机械法、磁珠法等。
2. 文库构建文库构建是将DNA片段连接到载体上,形成文库的过程。
该过程需要进行PCR扩增、末端修复、连接等步骤。
3. 高通量测序高通量测序是肿瘤基因检测中最重要的一步。
它可以对文库中的DNA 进行大规模并行测序,并生成海量数据。
目前市面上常见的高通量测序技术有Illumina、Ion Torrent等。
4. 数据分析数据分析是肿瘤基因检测中最为复杂和困难的一步。
它需要对海量数据进行处理和分析,并从中找出与肿瘤相关的基因变异信息。
四、结果解读1. 基因突变类型根据检测结果,可以确定样本中存在哪些基因突变类型,如点突变、插入缺失突变等。
2. 基因突变频率基因突变频率反映了该突变在样本中所占比例大小,这对于制定个性化治疗方案非常重要。
3. 基因突变的临床意义基因突变的临床意义是指该突变与肿瘤发生、发展的关系。
有些基因突变可能会导致肿瘤的恶化和转移,而有些基因突变则可能与肿瘤治疗反应相关。
五、结论通过本文的介绍,我们可以了解到肿瘤基因检测的流程和结果解读。
如何正确看待肿瘤基因检测报告?教你如何解读!
如何正确看待肿瘤基因检测报告?教你如何解读!引言随着科学技术的不断进步,肿瘤基因检测已经成为了肿瘤诊断和治疗中的重要工具之一。
通过基因检测,可以发现肿瘤细胞的基因组变异情况,帮助医生确定患者的治疗方案,从而提高治疗的精准度和效果。
对于普通人来说,如何正确地看待和理解肿瘤基因检测报告却是一个挑战。
本文将教你如何正确解读肿瘤基因检测报告,帮助你更好地理解肿瘤基因检测结果。
一、了解基因检测的原理和意义在解读肿瘤基因检测报告之前,首先需要了解基因检测的原理和意义。
基因检测是通过对肿瘤细胞中的基因组进行测序,以发现其中的基因突变、基因重排、基因失活等情况,从而为肿瘤的诊断、预后评估和治疗提供依据。
基因检测可以帮助医生确定患者的治疗方案,包括化疗药物的选择、靶向药物的应用以及免疫治疗的指导,提高治疗的个体化和精准度。
二、了解检测报告的内容和格式通常情况下,肿瘤基因检测报告会包括肿瘤样本的信息、检测方法、基因变异情况以及相关的临床意义等内容。
在阅读报告时,需要了解每个部分的含义和格式,以便更好地理解报告的内容和结论。
一般来说,报告会包括基因突变的类型、变异的频率、临床意义和相关的治疗选项等信息,需要仔细阅读和理解每个部分。
三、正确理解基因突变的临床意义在肿瘤基因检测报告中,通常会包括肿瘤细胞中的基因突变情况。
基因突变的临床意义取决于突变的类型、频率以及相关的研究和临床资料。
在阅读报告时,需要注意理解每个基因突变的临床意义,并结合临床指南和最新研究成果进行综合分析。
有些基因突变可能会对治疗方案和预后评估产生重要影响,需要重点关注和理解。
四、与医生进行深入交流和讨论在解读肿瘤基因检测报告时,最重要的是与医生进行深入的交流和讨论。
医生会根据患者的个体情况和检测报告的结果,制定个性化的治疗方案,并解答患者可能有的疑问和担忧。
与医生进行良好的沟通和合作,可以帮助患者更加准确地理解检测报告的结果,以及可能的治疗选择和预后评估。
基因突变分析技术及其临床意义
基因突变分析技术及其临床意义基因突变是指DNA序列中发生的错误或变异,可以分为两种类型:基因突变和染色体突变。
随着科技的进步,各种基因突变分析技术不断涌现,并在临床中发挥着重要的作用。
本文将介绍几种常见的基因突变分析技术,并探讨其在临床中的意义。
首先,聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)是一种常用的基因突变分析技术。
PCR可以扩增特定的DNA区域,使其在实验室中产生大量复制的DNA片段。
PCR可以用于特定基因突变的检测和定量PCR可以用于检测某个基因的拷贝数变化。
这些突变检测结果可以帮助科研人员和医生了解基因突变与遗传疾病的关系,并为治疗和预防提供依据。
其次,新一代测序(next generation sequencing, NGS)技术是近年来发展迅猛的基因突变分析技术。
与传统测序技术相比,NGS技术具有高通量、高灵敏度和高准确性的特点。
NGS技术的应用使突变的检测更加高效和可靠,同时也降低了检测成本。
NGS可以用于对整个基因组的突变进行分析,探索基因突变与疾病之间的关系。
此外,NGS技术还可以对肿瘤样本进行测序,帮助医生确定个体的肿瘤突变谱,从而为个性化治疗提供参考。
另外,比较基因组学是一种比较不同个体基因组序列的方法,可以揭示不同物种或个体之间的基因差异。
比较基因组学的突变分析可以帮助科研人员研究种属间的进化关系,也可以帮助医生识别有风险的基因突变。
例如,通过比较基因组学分析,科学家们发现一些特定的基因突变与乳腺癌、卵巢癌等遗传性疾病有关。
这些研究对于早期发现患者的遗传病风险,进行家族病史风险评估以及成人遗传咨询等方面具有重要的临床意义。
此外,单细胞测序是一种新兴的基因突变分析技术,可以对单个细胞的基因组进行测序研究。
传统的测序技术受限于细胞样品的数量和杂质,无法获得单细胞的具体信息。
而单细胞测序技术可以提供细胞间的异质性资料,从而帮助研究人员探索细胞类型的多样性和发展动态,对早期疾病的发现和诊断起到重要的作用。
遗传性肿瘤的基因研究及其临床意义
遗传性肿瘤的基因研究及其临床意义肿瘤是一种具有多因素、多步骤致癌机制的疾病,其中包括良性肿瘤和恶性肿瘤。
其中恶性肿瘤是一种会对人体带来极大威胁的疾病,它往往会对人们的生命进行威胁。
而在所有的恶性肿瘤中,遗传性肿瘤是一种经常会遗传给后代的肿瘤类型,其研究对于肿瘤的预防和治疗有着至关重要的作用。
因此本文将深入探讨遗传性肿瘤的基因研究及其临床意义,以期为相关专业研究人员和患者提供一定的帮助。
一、什么是遗传性肿瘤遗传性肿瘤是由一些遗传基因突变引起的肿瘤类型,其肿瘤往往具有两个众多的特征,一是早期发病,二是自身的家族病史。
而在家族病史种,如果存在一个或多个需要随访的重大肿瘤时,那么其余家族成员也就面临着一定的风险。
因此,遗传性肿瘤的研究不仅对于患者、家属非常重要,同时也对于肿瘤研究专业人员具有一定的意义。
二、遗传性肿瘤的基因研究遗传性肿瘤的研究肯定绕不开基因的角度,而目前的研究表明,从单基因突变到多基因互作多个层次对于肿瘤的影响有所不同,同时肿瘤的复杂性及多样性也让人们疲于奔命。
因此,在遗传性肿瘤研究中,大量的基因探索和解析是不可或缺的。
以BRCA1和BRCA2基因突变在Familial Breast Ovarian Cancer Syndrome中的作用为例,解析BRCA1和BRCA2基因突变及其互作机制,为家族性女性乳腺癌及卵巢癌的风险预测和预防提供了科学依据,为预测和治疗肿瘤开辟了新天地。
三、遗传性肿瘤的与临床意义1.预测肿瘤风险在遗传性肿瘤研究中,基因的角色不仅仅局限于疾病的起因,更是很多肿瘤危险因子的提供者。
通过一系列的基因检测,往往能够准确的预测患者患上肿瘤的风险。
例如,在宫颈癌的研究中,HPV病毒感染是一种关键的因素,而亚洲HPV感染的基因与肿瘤风险的关系不容小觑。
因此,遗传性肿瘤预测能够让人们对未来更加预防、警觉,避免不必要的流行病发生。
2.基因治疗目前随着遗传学和基因治疗技术的快速发展,越来越多遗传性肿瘤的治疗方法出现了。
恶性髓系血液肿瘤基因突变检查临床意义-陆道培血液肿瘤中心血液科主任童春容
恶性髓系肿瘤基因突变检查的临床意义陆道培血液•肿瘤中心童春容对恶性血液病的诊断与分型,目前专家的共识是应采用MICM的整合诊断方法,也就是联合形态学、免疫学、染色体、基因分析来诊断与分型,以达到更全面准确的诊断、指导精确治疗的目的。
我中心既往已经可以筛查100多种急性白血病的融合基因,并能检测一些恶性血液病的突变基因,基因突变包括基因丢失、新基因插入或被替代等。
既往的研究显示,40%多的急性白血病有白血病特异的融合基因。
恶性血液病是多种基因异常或突变的结果,我中心最近成功采用基因测序方法筛查数十种基因突变,与既往的方法比较,可以检测以上基因的全部突变位点,提高了基因突变的检出率。
如NPM1有40多种突变位点,既往的方法只能检测其中最常见的10种突变位点,而目前的方法可检测几乎NPM1的全部突变位点。
基因突变的筛查有以下临床意义。
一帮助诊断恶性血液病一些恶性血液病,尤其是骨髓增殖性肿瘤(MPN)、骨髓增生异常综合征(MDS)、MDS/MPN综合征等,没有特异性的免疫学、染色体或融合基因异常,在早期时主要表现为血液细胞轻度升高或降低,难以与再生障碍性贫血、类白血病反应等良性疾病鉴别。
既往诊断主要靠排除多种疾病,并需要较长时间的观察才能诊断。
几乎所有恶性血液肿瘤都能检查到某种或多种基因突变,因此当具有髓系恶性肿瘤的临床表现及一些实验室特征时,相关基因突变阳性对这些疾病的诊断有重要意义,基因突变检查可明显提高恶性血液肿瘤的准确率及速度。
还有一些髓外恶性血液病,由于组织标本少,其它方法难以有足够标本诊断;或治疗获得完全缓解后来到我院,怀疑既往的诊断。
因此我们发展了用骨髓/血涂片、组织切片等少量标本做几十种基因突变检查的方法,对于这些患者可以用治疗前做其它检查留存的标本(骨髓涂片、血液涂片、组织切片等)来检测恶性血液病的基因突变,从而帮助进一步确定恶性血液病的诊断及预后,并帮助治疗选择。
1JAK2(包括V617F和Exon12)基因突变在髓系恶性肿瘤诊断中的价值JAK2基因突变可见于多种MPN及其它恶性血液病。
基因突变的检测与病理诊断
基因突变的检测与病理诊断基因突变是一种常见的基因变异形式,是在DNA分子中的一种不正常的、意外的、或者出现了永久变化的序列单元。
由于基因突变会导致DNA信息的发生改变,从而影响基因的表达和功能,其可能是导致许多遗传病发生和发展的重要原因。
因此,基因突变的检测和诊断对于疾病预防和治疗具有重要意义。
1. 基因突变的检测方法基因突变的检测方法主要包括三种:单一基因疾病检测、基因组测序、基因组重排检测。
单一基因疾病检测是指检测一个基因中某种变异导致疾病的存在,可以通过PCR、Sangers测序、节段扩增等方式进行检测。
例如,致病基因突变导致的囊性纤维化是遗传性疾病之一,即CFTR 基因的编码突变导致纤维化囊性病的发生。
因此,在一个家族中,如果存在不止一个成员有囊性纤维化,可以考虑对该基因进行突变检测。
基因组测序是指通过对DNA序列的完整测定来搜寻某个基因或某些基因区域的突变情况。
它可以检测单核苷酸多样性(SNP)、插入或删除(Indel)等类型的基因突变。
现代的测序技术已经可以通过NGS(下一代测序技术)分析人类整个基因组的信息,这允许检测全遗传基因组中的变异。
例如,基因组测序可以检测致病基因突变与传染性疾病的产生机制和治疗方式的关联性。
另外,基因组测序也可以检测罕见的基因疾病,如先天性心脏病等。
基因组重排检测是指检测有些一段DNA序列在某些疾病情况下被缺失或者重复。
这种变异类型通常在一些多基因疾病或癌症基因分析过程中经常出现。
重复元件是基因组结构中的一部分,因此,一些人群内的�某个基因组区域可能遗传了重复元件,导致某种疾病突变。
例如,在黄色瘤遗传形式中,大部分都是由于C-kit基因的 Chromosome 4上的重复元件所导致,此时可通过基因重排检测来进行检测。
2. 基因突变与疾病的关联基因突变是各种疾病发生的重要原因。
从单基因遗传病的角度来看,多个常见疾病与基因缺陷或突变有直接关联。
例如,血友病是由于F8/F9基因突变而导致的疾病,遗传性乳糜泻疾病是由于消化系统中的酶表达出现问题,因此身体对膳食中的麦类蛋白质产生了过敏反应。
KRAS基因突变的检测及其临床意义
KRAS基因突变的检测及其临床意义KRAS基因突变是一种与肿瘤发生和发展密切相关的基因突变。
KRAS 基因是一种编码KRAS蛋白的基因,该蛋白在细胞信号传导通路中扮演着关键的角色,参与了细胞生长、分化和凋亡等重要生理过程。
KRAS基因突变导致KRAS蛋白的激活失控,进而引发多种恶性肿瘤的形成。
首先,KRAS基因突变检测对于肿瘤的诊断十分重要。
不同种类的肿瘤常常具有不同的突变基因谱,KRAS基因突变在一些特定类型的肿瘤中较为常见,例如肺癌和结直肠癌。
检测KRAS基因突变可以帮助医生对肿瘤的发生进行定性和定位,为肿瘤的进一步治疗提供重要依据。
其次,KRAS基因突变检测对于预测肿瘤转移倾向和预后也具有重要意义。
研究表明,KRAS基因突变与恶性肿瘤的发生和转移密切相关。
一些肿瘤患者在治疗过程中采用了靶向药物进行治疗,通过检测其KRAS基因突变状态,可以预测肿瘤对该药物的敏感性,从而指导临床用药方案的选择。
此外,KRAS基因突变还与肿瘤的预后密切相关。
一些研究发现,KRAS基因突变的患者通常具有较差的预后,而这一结论对于临床医生来说具有重要的指导意义。
最后,KRAS基因突变检测为个体化治疗提供了重要的决策依据。
随着精准医疗的发展,越来越多的药物已经或即将进入临床应用,这些药物常常是通过特定的分子靶点发挥治疗作用。
例如,EGFR靶向治疗药物对于KRAS基因突变阴性的肺癌患者来说疗效显著,而对于KRAS基因突变阳性的患者则几乎没有疗效。
因此,准确检测KRAS基因突变状态可以帮助医生制定个体化治疗方案,提高治疗的有效性和安全性。
总的来说,KRAS基因突变的检测对于肿瘤的诊断、预测转移倾向和预后以及个体化治疗具有重要临床意义。
随着基因检测技术的不断进步和应用价值的不断被发现,相信KRAS基因突变检测在临床中的应用将会越来越广泛,为肿瘤的诊断和治疗提供更准确、精确的指导。
肿瘤基因组测序数据的解析和临床意义
肿瘤基因组测序数据的解析和临床意义肿瘤基因组测序是一种通过测定肿瘤细胞中的基因组序列,以了解肿瘤发生和发展的机制的方法。
随着高通量测序技术的快速发展,越来越多的肿瘤基因组数据被产生出来。
这些数据的解析和理解对于临床医学的发展具有重要意义。
基因组测序数据的解析可以揭示肿瘤的遗传特征和致病机制。
通过分析肿瘤细胞中的突变、拷贝数变异和表达水平等信息,我们可以了解到肿瘤的突变模式和突变频率。
这有助于我们识别驱动肿瘤发生和发展的关键基因,并进一步探索肿瘤的致病机制。
此外,基因组测序还可以帮助鉴定肿瘤中的肿瘤抗原,从而为个体化免疫治疗提供信息。
肿瘤基因组测序数据的解析对于肿瘤的分类和诊断也具有重要意义。
基于基因组测序数据的分析,可以将肿瘤分为不同亚型或亚群。
这种分子分型方法能够更好地指导治疗和预后评估,提高临床医学的精确性和个体化治疗的效果。
此外,基于测序数据的诊断方法可以更准确地检测肿瘤的遗传突变,如基因重排、拷贝数变异等,并与临床表型进行关联,为肿瘤的早期诊断和治疗提供依据。
基因组测序数据的解析还可以为肿瘤的预后评估提供重要依据。
通过对肿瘤基因组数据的分析,可以预测患者的生存期、治疗反应和复发风险等。
例如,某些基因突变或表达模式与肿瘤预后密切相关,可以被作为预后评估的标志物。
这些标志物的发现可以帮助医生更好地制定治疗方案,提高患者的生存质量和治疗效果。
此外,肿瘤基因组测序数据的解析还可以为新药研发和药物治疗提供支持。
通过对肿瘤基因组的深入研究,我们可以发现肿瘤特有的靶标和致病基因,为新药的研发提供有力的靶点。
在药物治疗过程中,通过基因组测序数据可以实现个体化用药,根据患者的基因型和基因表达水平,选择最适合的药物和剂量,提高治疗效果和减少不良反应。
综上所述,肿瘤基因组测序数据的解析和临床意义密切相关。
通过对肿瘤基因组数据的深入分析,我们可以获取关于肿瘤的遗传特征、分类、诊断、预后以及药物治疗信息。
这些信息将为精确医学的发展和个体化治疗的实施提供重要依据,促进肿瘤的早期识别、及时干预和有效治疗,最终提高患者的生存质量和生活福祉。
乳腺癌的基因突变及其临床意义
乳腺癌的基因突变及其临床意义乳腺癌作为女性最常见的恶性肿瘤之一,其发生和发展与多种因素密切相关。
近年来,通过对乳腺癌患者的基因组学研究,科学家们发现了许多与乳腺癌发生相关的基因突变。
这些基因突变的发现不仅有助于深入了解乳腺癌的病因和发展机制,还对乳腺癌的早期诊断、个体化治疗以及预后评估等方面具有重要的临床意义。
1. ERBB2基因突变ERBB2基因编码表皮生长因子受体2(HER2),是一种与乳腺癌发生密切相关的基因。
ERBB2基因的突变可以导致其过度表达,促进肿瘤细胞增殖和侵袭,从而加速乳腺癌的发展。
临床研究表明,ERBB2基因突变与乳腺癌的侵袭性和预后呈正相关。
由于ERBB2基因突变能够作为一种分子标志物,可以通过检测ERBB2基因的突变状态,为乳腺癌患者的治疗方案选择提供重要的参考。
2. TP53基因突变TP53基因编码肿瘤蛋白p53,是人体最重要的抑癌基因之一。
TP53基因突变是乳腺癌中最常见的基因突变之一,与乳腺癌的发生和预后密切相关。
研究发现,TP53基因突变可以导致p53蛋白功能丧失,从而失去对肿瘤细胞的抑制作用,促进乳腺癌的发展。
此外,TP53基因突变还与乳腺癌对化疗的敏感性密切相关。
因此,检测乳腺癌患者的TP53基因突变状态,有助于评估其对治疗的反应程度,指导个体化的治疗方案制定。
3. BRCA1和BRCA2基因突变BRCA1和BRCA2基因分别是乳腺癌中最常见的两个致病基因,也是与遗传性乳腺癌发病率最高的基因。
研究发现,BRCA1和BRCA2基因突变可导致DNA修复机制发生障碍,增加乳腺癌的发生风险。
此外,乳腺癌患者中BRCA1和BRCA2基因突变的患者通常具有较早的发病年龄、家族史以及双侧乳腺癌的发生率较高等特点。
因此,对于乳腺癌患者的基因突变状态进行筛查,可帮助患者及其家族成员了解患病风险,采取相应的预防措施和监测方案。
4. PIK3CA基因突变PIK3CA基因编码磷脂酰肌醇3激酶(PI3K),参与调控肿瘤细胞的增殖和存活。
恶性髓系血液肿瘤基因突变检查临床意义-陆道培血液肿瘤中心血液科主任童春容
恶性髓系肿瘤基因突变检查的临床意义陆道培血液•肿瘤中心童春容对恶性血液病的诊断与分型,目前专家的共识是应采用MICM的整合诊断方法,也就是联合形态学、免疫学、染色体、基因分析来诊断与分型,以达到更全面准确的诊断、指导精确治疗的目的。
我中心既往已经可以筛查100多种急性白血病的融合基因,并能检测一些恶性血液病的突变基因,基因突变包括基因丢失、新基因插入或被替代等。
既往的研究显示,40%多的急性白血病有白血病特异的融合基因。
恶性血液病是多种基因异常或突变的结果,我中心最近成功采用基因测序方法筛查数十种基因突变,与既往的方法比较,可以检测以上基因的全部突变位点,提高了基因突变的检出率。
如NPM1有40多种突变位点,既往的方法只能检测其中最常见的10种突变位点,而目前的方法可检测几乎NPM1的全部突变位点。
基因突变的筛查有以下临床意义。
一帮助诊断恶性血液病一些恶性血液病,尤其是骨髓增殖性肿瘤(MPN)、骨髓增生异常综合征(MDS)、MDS/MPN综合征等,没有特异性的免疫学、染色体或融合基因异常,在早期时主要表现为血液细胞轻度升高或降低,难以与再生障碍性贫血、类白血病反应等良性疾病鉴别。
既往诊断主要靠排除多种疾病,并需要较长时间的观察才能诊断。
几乎所有恶性血液肿瘤都能检查到某种或多种基因突变,因此当具有髓系恶性肿瘤的临床表现及一些实验室特征时,相关基因突变阳性对这些疾病的诊断有重要意义,基因突变检查可明显提高恶性血液肿瘤的准确率及速度。
还有一些髓外恶性血液病,由于组织标本少,其它方法难以有足够标本诊断;或治疗获得完全缓解后来到我院,怀疑既往的诊断。
因此我们发展了用骨髓/血涂片、组织切片等少量标本做几十种基因突变检查的方法,对于这些患者可以用治疗前做其它检查留存的标本(骨髓涂片、血液涂片、组织切片等)来检测恶性血液病的基因突变,从而帮助进一步确定恶性血液病的诊断及预后,并帮助治疗选择。
1JAK2(包括V617F和Exon12)基因突变在髓系恶性肿瘤诊断中的价值JAK2基因突变可见于多种MPN及其它恶性血液病。
肿瘤医学中的基因检测技术研究
肿瘤医学中的基因检测技术研究正文:引言肿瘤是威胁人们健康和生命的一种常见病症,随着基因技术的不断发展,基因检测技术已经成为肿瘤治疗的重要手段。
基因检测技术可以帮助医生了解肿瘤患者的遗传特征和基因突变情况,从而为患者提供更加精准的治疗方案。
本文将从基因检测技术的原理、检测方法、应用及挑战这四个方面进行探讨。
一、基因检测技术的原理基因检测技术是通过对人体遗传信息进行检测和分析,挖掘其中对健康状况影响较大的基因突变信息的技术。
基因检测技术主要针对DNA单体多态性(SNP)、基因甲基化、DNA序列变异等遗传信号进行检测,通过对这些基因变异信息的挖掘,可以在较早的时期发现肿瘤等疾病的存在及其性质,从而为精准治疗提供依据和前置条件。
二、基因检测技术的检测方法目前,基因检测技术主要采用PCR(聚合酶链式反应)技术和NGS(下一代测序)技术,而在检测完成之后,医生们会对结果进行详细的分析和解读,以提供更为精确和有效的治疗方案。
(一)PCR技术PCR技术是通过特定引物将DNA的一个特定片段扩增出来,从而检查DNA是否存在某一个特定基因突变。
PCR技术具有快速、准确、成本低等优点,在很多肿瘤患者的日常监测中非常常见。
(二)NGS技术NGS技术是一种高通量测序技术,其可同时对多个基因的突变状态进行检测,具有效率高、样本用量小等优点。
由于NGS可同时扫描K,影响治疗效果的SNP、CNV、SV以及突变增加、甲基化等众多因素,因此NGS技术具有更多的优势和潜力。
三、基因检测技术在肿瘤医学中的应用(一)遗传性肿瘤遗传性肿瘤是指由于肿瘤相关基因的突变,导致患者具有家族遗传倾向及更高的肿瘤风险的一类肿瘤。
随着基因检测技术的快速发展及其应用的不断推广,基因检测技术正在成为遗传性肿瘤精准诊断和预测的重要手段。
在遗传性多发性乳腺癌、多发性内分泌腺瘤、遗传性结直肠癌等疾病的预测方面,基因检测技术都显示出了很广泛的应用。
(二)制定个体化治疗方案在肿瘤医学中,个体化治疗是目前治疗肿瘤的重要方法之一。
dmmr和pmmr的判读
dmmr和pmmr的判读DMMR和PMMR是两个与基因突变有关的检测方法,用于判断肿瘤细胞中的基因突变情况。
下面我将从多个角度来回答你的问题。
1. 定义和原理:DMMR(Mismatch Repair Deficiency)指的是肿瘤细胞中DNA错配修复系统的缺陷,导致DNA错配修复功能失效,进而导致基因组中的错配修复错误增加。
PMMR(Proficient Mismatch Repair)表示肿瘤细胞中DNA 错配修复系统正常,没有错配修复缺陷。
2. 检测方法:DMMR的检测方法主要包括免疫组织化学染色(IHC)和微卫星不稳定性(MSI)分析。
IHC检测主要通过检测错配修复蛋白(如MLH1、MSH2、MSH6、PMS2等)的表达情况来判断是否存在错配修复缺陷。
MSI分析则是通过检测肿瘤细胞中微卫星位点的稳定性来判断错配修复功能是否正常。
PMMR通常是通过排除DMMR的存在来判断的,即如果IHC和MSI结果均正常,则可以认为肿瘤细胞中的错配修复功能正常。
3. 临床意义:DMMR是一些肿瘤类型(如结直肠癌、子宫内膜癌等)的重要分子标志物,与肿瘤的发生、发展和预后密切相关。
DMMR肿瘤对某些免疫治疗药物(如PD-1抑制剂)具有较好的治疗响应,因此DMMR检测对于指导免疫治疗的应用具有重要意义。
PMMR则意味着肿瘤细胞中的错配修复功能正常,可能对某些化疗药物具有更好的敏感性。
4. 结果解读:DMMR的判断标准通常是根据IHC和MSI结果的一致性来确定。
如果IHC显示错配修复蛋白表达异常,同时MSI分析结果也显示微卫星不稳定性,则可以判断为DMMR。
而如果IHC和MSI结果均正常,则可以判断为PMMR。
需要注意的是,DMMR和PMMR的判断结果可能会因不同实验室的检测方法和标准而有所差异,因此在解读结果时应结合具体的实验室报告和临床情况进行综合判断。
总结起来,DMMR和PMMR是用于判断肿瘤细胞中基因突变情况的两种检测方法。
基因突变与肿瘤发生的关联研究
基因突变与肿瘤发生的关联研究基因突变在肿瘤的发生和发展中起着至关重要的作用。
随着对基因与肿瘤关系的深入研究,人们对于肿瘤的预防、诊断和治疗也有了更深刻的认识。
本文将从基因突变的概念、突变类型、与肿瘤发生的关联以及研究方法等方面进行探讨。
一、基因突变的概念和突变类型基因突变是指DNA序列发生异常改变的现象。
这种改变可能会导致蛋白质结构、功能的改变,进而影响细胞的正常生理过程。
基因突变可以分为以下几类:1. 点突变:指DNA序列中的一个碱基被替代、插入或缺失的突变形式。
点突变是最常见的基因突变类型之一。
2. 基因重排:指DNA序列在基因组中的重新排列,常见的基因重排包括基因扩增、基因融合等。
3. 缺失和插入突变:指DNA序列中的一段碱基被删除或新增,导致序列长度发生改变。
二、基因突变与肿瘤的关联基因突变是肿瘤发生和发展的关键因素之一。
通过对肿瘤组织中基因突变的检测和分析,可以更好地理解肿瘤的病理生理过程,并为肿瘤的预防、诊断和治疗提供依据。
1. 肿瘤抑制基因的突变与肿瘤发生相关:肿瘤抑制基因是维持细胞正常生命周期以及抑制肿瘤发生的关键基因。
当这些基因发生突变时,细胞的生长和增殖受到抑制的功能失去,从而导致细胞无限制地增殖,形成肿瘤。
2. 癌基因的突变与肿瘤发生相关:癌基因是一类具有促进细胞生长和增殖作用的基因。
当癌基因发生突变,细胞的正常生长调控机制被破坏,细胞开始不受限制地增殖,从而形成肿瘤。
3. 祖细胞的突变与肿瘤发生相关:祖细胞是体内能够自我更新并分化为多种细胞类型的干细胞。
当祖细胞发生突变时,其分化和增殖能力失控,可能导致肿瘤的发生。
三、基因突变与肿瘤发生的研究方法研究基因突变与肿瘤发生的关联需要运用到多种实验技术和研究方法。
以下是常用的几种方法:1. 基因测序:通过对肿瘤组织或细胞中基因组的测序,可以检测基因是否发生突变,并确定突变的类型和位置。
2. PCR扩增:通过PCR扩增特定基因区域,可以检测基因突变的存在与否,并定量突变的频率。
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显微切割 + 直接测序 直接测序法 荧光定量PCR法 Mutation-riched PCR PCR-SSCP ……
激光捕获显微切割
(laster capture microdissection, LCM)
工作原理:
利用紫外激光对生物样本进行 切割和分离,通过弹射装置将目 的细胞收集于EP管内。
Nature Review 2007, 7:169
EGFR主要突变
外显子 18exon
突变类型 置换
突变位点 G719A (2156G>A碱基置换突变)
对TKI敏感性 敏感
19exon 20exon
缺失 置换
△E746-A750del 2235-2249位点,15bp缺失突变
△E747-A753del 2240-2257位点,18bp缺失突变
RNA提取方法
硅胶膜吸附法:利用硅胶膜特异吸附核酸 TRIZON:一步法
样本种类
血液学样本:抗凝血液、血浆、血清、全血、骨髓 组织学样本:新鲜组织、冰冻组织、石蜡包埋组织 脱落细胞:胸腹水、痰液、宫颈诊刮LCT、TCT
石蜡组织基因组DNA提取流程
硅胶膜吸附法(吸附柱法)
样本裂解
加入吸附柱
缓冲液漂洗
EGFR
EGFR (epidermal growth factor receptor),又称HER – 1 位于人 类Chr7的短臂 含EGFR激活性突变的NSCLC对 TKI敏感 突变多发生于EGFR激酶区
配体 EGFR
EGFR-TK
EEGGFFRR--TTKKII
增生 侵袭血 管 生 成
转移 细胞凋亡
汇总
例数 924 520 1444
成功检出
阳性检出
917 (99.2%)257(28.0%)
493 (94.8%)144(29.2%)
1410(97.6%)401(28.4%)
荧光定量PCR法检测突变的基因
EGFR:19、21号外显子 KRAS:12、13号密码子 BRAF:15号外显子
第三部分
Chiu et al, 2003
INFORM研究成果
1。 治疗组无进展生存期明显 延长(4.8个月:2.6个月) 疾病进展风险下降了58%
中国ASCO会议第一人
2。EGFR突变的亚组: 中位无进展生存期延长(16.6月: 2.7月) 疾病进展风险下降了84%
非小细胞肺癌中EGFR酪氨酸激酶区突变
野生型
EGFR-exon19 测序峰图
开始出现套峰
△E746-A751del 2240-2254位点,15bp缺失
PCR反应耗时约90分钟
con 12 12 12 12 12 12 13 ala asp arg cys ser val asp
荧光定量PCR特点
针对固定的已知突变 操作简便、耗时短(2h) 结果分析直观 敏感性:
10%以上突变体 条件优化困难
标本类型
手术标本
活检或穿 刺标本
肿瘤相关基因突变的临床 意义及其检测方法
中山大学肿瘤防治中心 分子诊断科 王芳
一、核酸DNA提取 二、基因突变常规检测手段 三、肿瘤相关基因突变简介 四、核酸扩增技术其他用途 五五、、新新基基因因介介绍绍
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
第一部分
基因组DNA提取方法
硅胶膜吸附法:利用硅胶膜特异吸附核酸 磁珠法:独特包埋的磁珠 传统酚氯仿法:传统方法,抽提时间长,成本低
T790M (2369位点C>T碱基置换突变)
敏感 敏感 耐药
21exon
置换
L858R (2573位点T>G碱基置换突变) L861Q (2582位点T>G碱基互换突变)
敏感 敏感
EGFR基因突变检测方法
直接测序 定量PCR ADx-ARMS
测序图 EGFR-exon18测序峰图
18号外显子G719C突变
• 选择稀释倍数,确保OD260 值在0.1~1.0之间:
• OD260 /OD280 < 1.7 OD260 /OD280=1.7~1.9 OD260 /OD280 > 1.9
有蛋白的污染 纯度很好 部分降解或有RNA污染
DNA检测方法-内参检测法
石蜡包埋组织GAPDH扩增产物电泳图
第二部分
基因突变检测方法
测序法流程
提取肿瘤 组织DNA
病理学评估
PCR反应扩增
琼脂糖凝胶 电泳纯化
高质量的 PCR 反应原液
DNA测序仪上机
2000
测序结果影响因素分析 500 200
石蜡包埋组织提取DNA的片段化 100
直接测序法:肿瘤组织中混杂不同程度非肿瘤细胞, 影响测序敏感性
显微切割+测序:不适于普通实验室开展 传统PCR易于产生污染 产物纯化及DNA测序不可控
DNA洗脱收集
核酸保存
• 浓度:100-300ng/ul • 纯度:避免杂质导致DNA在储存过程中的降解 • 温度:分装-20℃保存 • 溶解DNA Buffer:TB Buffer 或者Tris缓冲液
DNA检测方法-紫外分光光度法
纯度( OD260-320 /OD280-320 )
紫外分光光度计测量
功 能:
通过从诊断明确的组织中切取 获得的细胞或细胞成份,提取核 酸,可用于PCR、DHPLC等
切割之前的目的癌巢
切割之后,可见目的癌 巢已取走
直接测序法
原理:双脱氧终止法 仪器:PCR仪、电泳仪、测序仪
CEQ8000: 工作原理:标记终止物法
直接测序法的特点
直接测出碱基序列,明确突变类型 检测条件要求高:仪器、组织质量、操作、结果分析 耗时长:2~3天 敏感性有限制:10~30% 突变体
测序法检测突变的基因
EGFR:18、19、20、21号外显子 c-kit:9、11、13、17号外显子 PDGFRA:12、18号外显子
荧光定量PCR
原理:Taqman探针 仪器:荧光定量PCR仪
基于定量PCR检测工作流程
提取肿瘤 组织DNA
对突变与对照的反应 进行比较以完成分析
每个DNA样本均加到几 个独立的试管中并放入 实时PCR仪器
肿瘤相关基因
与肿瘤的发生发展密切相关的基因
ras、 braf、PIK3CA、p53 、EGFR、HER-2、 kit 、PDGFRA、cMET、PTEN …
从分子水平认识肿瘤
指导肿瘤的诊断、治疗及预后预测
肿瘤相关基因致瘤过程改变
致瘤过程:癌基因激活、抑癌基因失活、 相关基因扩增、过表达
基因突变:点突变、缺失、插入 基因过表达 基因扩增