PCR技术在乳酸菌分类鉴定中的应用
PCR技术在食品微生物检测中的应用
PCR技术在食品微生物检测中的应用摘要:食品污染关系到人们的身体健康,同时也是食品健康保障工作开展中要关注的重点问题。
由于食品污染中微生物污染具有动态变化的性质。
因此,需要针对微生物物质应用专业的技术进行检测,并且进一步对检测工作的开展进行指标观察和结果观察。
以便更进一步掌握食物中的微生物成分和含量,为控制微生物、保证健康饮食的需求以及食物质量保障工作的顺利开展。
关键词: PCR技术;食物微生物检测;应用分析引言:食物中的微生物若能保持一定的含量水平,对于食物的保鲜以及食物的口感都会产生积极的作用,但微生物检测工作的开展也需要同步匹配进行。
这不仅是检验食物成分的科学方法,也是及时发现食物腐败变质问题的重要手段。
PCR检测技术在现阶段的食物微生物检测中,属于应用广泛性较强的一种典型技术。
本文立足于此技术在食物微生物检测中的应用进行分析,以期为相关的检测工作提供参考。
一、 PCR技术在食物微生物检测工作中的应用优势分析PCR技术是我国食品行业现阶段逐步发展和完善后兴起的一种针对性的检验技术,是针对食物的成分以及食物可能出现的污染和安全问题,运用检测手段进行控制和把握的专业技术。
其在实际应用中主要体现出了以下几方面优势。
(一)技术应用的便捷性较高PCR技术在实践应用的过程中能够体现出更加显著的应用便捷性优势。
在实际应用中,此种技术克服了传统的微生物检测对环境影响的依赖以及对检测时间的要求。
在检测中,只需要借助专门的一体机设备,就能对检测程序进行统一的控制和管理。
检测过程中只要将检测样本放入一体机,就能够联动性地完成各个环节的基础检测步骤,并且节省检测工作的时间成本[1]。
在保证工作效率的基础上,同步保障检测结果的准确性。
对于现阶段大量的食品生产以及微生物检测需求来说,此种设备的应用具有更高的适宜性,检测工作能够在便捷操作的支持下顺利完成。
(二)技术应用的时间成本相对较低时间成本相对较低主要是指,在检测工作的落实开展过程中,可通过便捷的系统输入过程实现对微生物整个经络的检测。
食品中乳酸细菌的筛选和鉴定
食品中乳酸细菌的筛选和鉴定食品是人类生活中不可或缺的一部分,而乳酸细菌则是食品产业中的重要组成部分。
乳酸细菌在食品加工过程中起着关键的作用,例如发酵乳制品、面包、啤酒等。
因此,筛选和鉴定食品中的乳酸细菌对于食品安全和质量的保障具有重要意义。
首先,筛选食品中的乳酸细菌应该从源头开始。
当我们选择原料时,应注意选择新鲜且有机的食材。
乳酸细菌通常存在于新鲜的奶制品、蔬菜和水果中。
因此,在生产过程中应该选择高质量的原料,以确保食品中含有丰富的乳酸细菌。
其次,对食品中的乳酸细菌进行鉴定也是非常重要的。
目前常用的方法有传统培养方法和分子生物学方法。
传统培养方法是通过将食品样品接种到乳酸菌富集培养基中,然后根据菌落形态和生理特性进行鉴定。
虽然该方法简单易行,但对于少数难以培养的乳酸细菌则无法准确鉴定。
分子生物学方法是近年来迅速发展的一种鉴定乳酸细菌的新方法。
这种方法基于对乳酸细菌基因组的分析,通过PCR、蛋白质电泳等技术手段来确定乳酸菌的种类和数量。
分子生物学方法具有快速、准确和高通量的特点,可以帮助我们更好地了解食品中乳酸细菌的情况。
此外,筛选合适的乳酸菌应具备以下特点。
首先,应具备较强的耐受性,能够在食品加工过程中存活和繁殖。
其次,应具备较好的产酸能力,确保食品发酵的质量和风味。
最后,应能够对食品中的有害细菌起到一定的抑制作用,从而保证食品的安全性。
乳酸细菌在食品发酵过程中起到的作用不仅仅是改善风味,还具有多种益处。
首先,乳酸细菌能够制造出多种有益物质,例如乳酸、对乳酸菌独有的多种抗菌物质等。
这些物质具有抗菌、抗氧化和免疫调节等作用,对人体健康有益。
其次,乳酸细菌可以帮助消化,改善肠道菌群的平衡,增加人体对营养的吸收。
此外,乳酸细菌还可以帮助降低肠道内有害菌的数量,提高人体的免疫力。
然而,在乳酸细菌的选择过程中也存在一些问题和挑战。
首先,不同种类的食品需要不同的菌株,因此我们需要根据具体产品的特点来选择适合的乳酸菌。
乳酸菌检验报告
乳酸菌检验报告1. 引言本报告旨在对乳酸菌样本的检验结果进行详细分析和解释。
乳酸菌是一类益生菌,具有多种益处,包括改善肠道菌群平衡、促进消化系统健康等。
通过对乳酸菌样本的检验,了解其数量和种类,能够为人们提供有关肠道健康的重要指标。
本报告将详细介绍检验方法、结果分析以及相关建议。
2. 检验方法乳酸菌样本的检验通常采用以下方法之一:2.1 培养基法乳酸菌样本首先被接种在含有适宜营养物质的培养基上。
经过一段时间的培养,菌种将生长并形成可见的菌落数量。
通过观察培养基上形成的菌落数量和形态特征,可以初步了解乳酸菌的情况。
2.2 PCR法PCR法是一种通过扩增目标DNA片段的技术。
在乳酸菌检验中,可以通过PCR方法扩增乳酸菌特异性基因片段。
通过测量扩增产物的数量,可以推测乳酸菌样本中乳酸菌的数量。
2.3 16S rRNA测序法16S rRNA测序法是一种通过测序乳酸菌样本中16S rRNA基因的方法。
16S rRNA是一种在细菌中普遍存在的基因,其序列具有一定的保守性和变异性。
通过测序并比对乳酸菌样本中的16S rRNA序列,可以确定乳酸菌的种类。
3. 检验结果与分析3.1 培养基法检验结果经过培养基法检验,乳酸菌样本形成了X个可见的菌落,其形态特征为Y。
根据经验数据,通过数量与形态的分析,可以判断肠道菌群平衡的情况。
3.2 PCR检验结果PCR法检验得到的扩增产物数量为Z,据推测,乳酸菌样本中可能存在的乳酸菌数量约为W。
3.3 16S rRNA测序结果通过16S rRNA测序,确定了乳酸菌样本中存在的乳酸菌种类为A、B、C。
根据已知的乳酸菌种类特点,可以初步评估肠道健康状况。
4. 结果解释与建议根据乳酸菌检验结果,结合个人的生活习惯和饮食情况,可以给出以下解释和建议:•根据培养基法检验结果,乳酸菌样本形成的菌落数量适中,形态特征正常,表明肠道菌群平衡较好。
•根据PCR检验结果,乳酸菌样本中可能存在适量的乳酸菌,有益于维持肠道健康。
乳酸利用菌的筛选及应用
乳酸利用菌的筛选及应用宋克伟;周森;魏金旺;王勇;张如金;胡建华;胡佳音;赵卫鹏【摘要】At present, there exists technical problems in the production of Qingxiang base liquor such as excessive high content of ethyl lactate and unbalanced ratio of acetic acid and lactic acid. In this study, we isolated a bacterial strain from Qingxiang Daqu in Niulanshan Distillery for the degradation of lactic acid, such strain was numbered B001 and it was identified as Bacillus subtilis by PCR. The use of B001 in Qingxiang base liquor production could effectively reduce the content of ethyl lactate and increase slightly the content of ethyl acetate. The technical prob-lems had also been settled successfully.%当前,我国清香型白酒基酒生产过程中,普遍存在着乳酸乙酯含量过高,乙乳比例失调的技术难题。
牛栏山酒厂运用微生物技术,从本厂清香型大曲中分离筛选出1株可降解乳酸的细菌,编号为B001,通过PCR 鉴定确定为枯草芽孢杆菌。
同时,将B001进行中试试验,有效降低了白酒中乳酸乙酯的含量,同时少量提升了乙酸乙酯的含量,解决了乙乳比例失调的技术难题,有效改善了清香型白酒因乙乳比例失调导致的酒体不协调的问题。
分子生物学方法在食品微生物检测中的应用
一、概述食品安全一直是人们关注的重点问题,而微生物污染是导致食品安全问题的重要原因之一。
食品微生物检测技术的发展对于保障食品安全具有重要意义。
分子生物学方法由于其高度特异性和灵敏度,在食品微生物检测中得到了广泛的应用。
本文将就分子生物学方法在食品微生物检测中的应用进行探讨,旨在为食品安全领域的研究和实践提供参考。
二、分子生物学方法在食品微生物检测中的应用1. PCR技术2. 实时荧光PCR技术3. 微阵列芯片技术4. 基因测序技术5. 其他新兴分子生物学方法三、分子生物学方法在食品微生物检测中的优势与挑战1. 优势1.1 高度特异性1.2 高度灵敏度1.3 快速性1.4 可定量性2. 挑战2.1 样品前处理的标准化2.2 数据分析的标准化2.3 成本控制四、分子生物学方法在特定食品微生物检测中的应用案例1. 肉制品中致病菌的检测2. 奶制品中乳酸菌的检测3. 水产品中霉菌的检测4. 蔬果制品中寄生虫的检测5. 其他食品中常见微生物污染的检测五、分子生物学方法在食品微生物检测中的未来发展1. 新技术的不断涌现2. 多重技术的融合应用3. 检测标准的国际统一4. 自动化、智能化的检测设备的发展六、结论分子生物学方法在食品微生物检测中的应用已经取得了显著的成果,为食品安全领域的进步作出了重要贡献。
随着技术的不断进步和发展,相信分子生物学方法在食品微生物检测中将会发挥越来越重要的作用,为保障人们的饮食安全提供更为可靠的技术支持。
希望该领域的科研人员和实践者能够不断探索创新,共同致力于食品安全事业的发展。
七、分子生物学方法在食品微生物检测中的优势与挑战分子生物学方法在食品微生物检测中具有诸多优势,首先是高度的特异性。
传统的微生物检测方法可能对多种微生物都具有一定的反应,而分子生物学方法可以设计特异性的引物或探针,只对目标微生物进行检测,避免了其他微生物的干扰,提高了检测的准确性。
其次是高度的灵敏度,分子生物学方法可以检测到微生物的极低浓度,可以在微生物含量较低的食品样品中提高检测的准确性和可靠性。
发酵食品中乳酸菌的分离与鉴定
发酵食品中乳酸菌的分离与鉴定乳酸菌是一类重要的微生物,在食品发酵过程中扮演着不可替代的角色。
乳酸菌不仅能够提高食品的营养价值,还具有促进肠道健康、增强免疫力等益生作用。
因此,分离和鉴定发酵食品中的乳酸菌是食品科学领域中的一项重要研究内容。
要进行乳酸菌的分离与鉴定,首先需要从发酵食品样品中分离乳酸菌。
一般而言,我们可以选择将样品通过稀释后接种于选择性培养基上,以便只有乳酸菌能够生长。
接种后,将培养基放置于适宜的温度下,培养一段时间。
乳酸菌具有较强的酸性产生能力,因此在培养过程中会形成明显的酸性环境。
可通过测量培养基的pH值来初步判断是否有乳酸菌生长。
在分离乳酸菌的培养基上,我们可能会观察到许多不同形态的菌落。
这些菌落在形状、颜色、质地等方面可能存在差异。
我们可以选择几个具有代表性的菌落进行后续的鉴定。
对于乳酸菌的鉴定,有许多方法可供选择。
一种常用的鉴定方法是形态学观察。
乳酸菌具有一些特征性的形态特征,如菌落的形状、边缘的特点、质地的柔软程度等。
此外,乳酸菌的细胞形态也具有一定的特征,如形状、大小、胞内结构等。
通过在显微镜下观察乳酸菌的形态特征,可以初步判断其种属。
除了形态学观察外,乳酸菌的生理生化特性也是鉴定的重要依据。
例如,乳酸菌通常能够在不产生气体的条件下发酵葡萄糖。
此外,乳酸菌对于一些特定的碳源、氮源等具有较强的利用能力。
通过对乳酸菌进行代谢特性的测试,可以进一步确认其种属。
分子生物学方法也为乳酸菌的鉴定提供了新的手段。
通过对乳酸菌的DNA进行提取和PCR扩增,可以得到乳酸菌的16S rRNA序列。
将这些序列与已知种属的乳酸菌进行比对,可以准确鉴定乳酸菌的种属。
在发酵食品中,常常存在多种乳酸菌同时存在的情况。
因此,对于从发酵食品中分离到的乳酸菌,进行种属鉴定是至关重要的。
只有确定了乳酸菌的种属,才能更好地利用其在食品工业中的潜力。
发酵食品中乳酸菌的分离与鉴定是一项科学而有趣的工作。
通过对乳酸菌的研究,我们可以更好地了解乳酸菌在食品发酵过程中的功能和作用,为食品工业的发展提供更多的可能性。
乳酸细菌分类鉴定及实验方法
乳酸细菌分类鉴定及实验方法乳酸细菌是一类可以发酵果糖或蔗糖产生乳酸的革兰氏阳性细菌。
它们广泛存在于自然界中的土壤、水体、动物肠道、植物表面等环境中,并且在食品加工、乳制品、膳食补充剂等领域具有重要的应用价值。
分类鉴定乳酸细菌的方法主要包括传统分离鉴定和分子生物学方法,而实验方法主要包括培养、生理生化鉴定和分子鉴定等。
1.传统分离鉴定传统分离鉴定是通过培养、生理生化特性的观察和细菌形态学特征的分析来进行分类鉴定的方法。
一般的步骤包括:1.2分离:采用适当的培养基,如MRS培养基等,在适当条件下进行分离培养。
可以采用不同的稀释度和培养温度来增加分离率和适应性。
1.3纯化:从培养出的菌落中选择纯净的菌落进行纯化。
1.4形态学观察:观察细菌的形态学特征,如菌落形态、细胞形态、孢子形态等。
1.5生理生化特性鉴定:通过生理生化实验,如氧需氧性、产气、产酸、碱性产蛋白酶等特性的鉴定来进一步确定细菌的分类。
1.6比较分析:将鉴定结果与已知的乳酸菌进行比较分析,以确定菌株的分类。
2.分子生物学方法分子生物学方法是一种快速、准确的分类鉴定方法,可以通过检测细菌的DNA序列来进行鉴定。
常用的分子生物学方法包括PCR、16SrRNA测序和随机扩增多态性DNA(RAPD)等。
2.1PCR:PCR是通过扩增细菌DNA的特定区域来进行鉴定的方法。
首先,从培养的细菌中提取DNA。
然后,使用特定引物扩增目标区域的DNA,并通过凝胶电泳分析PCR产物的大小。
比较PCR产物的片段大小和带型模式,可以确定乳酸菌的分类。
2.216SrRNA测序:细菌的16SrRNA序列是一个高度保守的基因序列,可以用来进行细菌分类鉴定。
通过提取DNA,扩增16SrRNA基因片段,并进行测序,然后将测序结果与已知的乳酸菌序列比对,可以确定细菌的分类。
2.3RAPD:RAPD是一种无须事先了解目标序列的技术,它利用随机引物扩增细菌DNA的多态位点,通过凝胶电泳分析不同样品间的DNA带型模式,来进行菌株分类。
食品检验中乳酸菌的鉴定方法新思考
食品检验中乳酸菌的鉴定方法新思考摘要:食品是人们生存不可或缺的重要物品,对人们的身体健康等方面具有重要的影响。
因此需要对食品进行相应的检验,明确其中的成分和含量,从而保障食品的卫生和安全。
其中对乳酸菌进行检定具有重要意义,关于鉴定方法应引起相关工作人员的重视。
关键词:食品检验;乳酸菌;鉴定方法一、研究背景乳酸菌具有较多的种类,并且具有较多的用途。
当前阶段主要广泛应用到婴幼儿的食品以及保健食品中,为保障使用者的身体健康和生命安全,对食品中含有的乳酸菌种类、含量等进行鉴定具有一定的必要性。
通过添加乳酸菌有利于视屏的营养价值提高,并且对食品味道和储藏等具有较好的改善作用,因此其在食品生产行业得到了广泛的应用,并具有较高的应用价值。
乳酸菌具有调节肠道的功能,并且有利于人体血清胆固醇的降低,因此可以起到较好的预防疾病、保障人体健康的作用。
通过对食品中含有的乳酸菌进行鉴定,可以明确乳酸菌的种类及含量,受乳酸菌自身形态的影响,可通过理化特征、生物特征等均分乳酸菌并进行相应的鉴定,从而使乳酸菌的应用符合相关的规定,应用范围具有合理性进而保障其使用功能的充分发挥。
有利于促进食品检验行业的进一步发展,切实保障使用者的身体健康、生命安全。
二、乳酸菌及鉴定相关概述乳酸菌可通过将碳水化合物发酵形成乳酸,本质上是一种细菌,具有较多的种类,并且分布范围相对广泛。
当前已经有上百种的乳酸菌种类被人们所知,其中大部分的种类对人体的肠道运行具有较好的促进作用,并有利于对人体的机能进行调整。
可将乳酸菌分成以下几个类型,即动物源乳酸菌、植物源乳酸菌。
其中植物源乳酸菌更易被人体认可和接受,植物源乳酸菌具有较高的活性,因此应用到人体中发挥的生物功效更具稳定性。
对乳酸菌进行鉴定,主要是依据不同种类的乳酸菌其形态、生物特征和理化特征等方面也不相同,因此通过现代化的方法对其进行检测,便可明确食品中所含的乳酸菌的类型、含量。
当前阶段主要通过以下两种方法对食品中的乳酸菌进行鉴定,其一便是通过生理生化的方法进行鉴定。
PCR技术在食品微生物检测中的运用
食品科技微生物的含量在食品安全分析中有十分重要的作用,近年来,部分地方环境的污染导致食物中含有一定量的污染成分,直接导致食品安全受到影响。
在这些食品当中,存在的有害菌群远远超出允许值,甚至有些食物中存在微量的致病微生物。
因此,食品安全也成为群众最为关心的问题,强化对食品的微生物检测工作,才能为国民饮食安全提供保障。
本文结合微生物检测工作的发展情况,深入探讨PCR 技术的应用作用与价值,对我国食品检测行业的稳定发展具有重要意义。
1 PCR技术在食品微生物检测中的应用优势方便性。
与传统检测方式相比,PCR技术具备一定的自动化程度,不需要大量劳动力进行支撑,由于不同微生物的生长环境、温度与pH值等存在差异,在对细胞特征、菌落特征等生理生化情况进行判定时,PCR技术可以快速对微生物含量进行检测,使整个流程愈加规范[1]。
快捷性。
应用PCR技术对菌落进行检测时,可以避免传统检测方式的复杂流程,而且传统检测方式通常需要2~5天,这也导致微生物检测结果存在滞后性,采用PCR技术可以在一天内确定微生物含量,进而有效满足工业生产需求。
准确性。
在应用传统检测技术时,针对各类食品都是采用单一的检测方式,检测中容易受到诸多因素的影响,而PCR技术可以根据不同种类的食品选择多种检测方式,例如对弱势菌群检测时,应用多重检测方式可以准确判定微生物含量,以此来保证检测结果的准确程度。
2 PCR技术在食品微生物检测中的常用方式2.1 常规PCR检测常规PCR技术方式原理比较简单,主要是在DNA模板与相应引物的混合物中加入聚合酶,同时对混合物进行催化反应,对其DNA片段变化情况进行检测,为保证微生物检测结果的准确性,还要对不同反应周期的变化情况进行分析。
这种检测方式最早应用于沙门氏菌的检测工作中,随着近年来检测技术与体系的不断完善,该方式可以对多种菌类进行检测,而且检出率在90%以上[2]。
2.2 多重PCR检测多重PCR检测技术针对食品微生物之间的互补关系进行检测,例如在聚合酶反应的基础上,针对不同DNA片段进行检测,该方式不仅可以提升常规PCR技术的测定速率,而且可以减少实验步骤。
《乳酸细菌分类鉴定及实验方法》
《乳酸细菌分类鉴定及实验方法》一、引言乳酸细菌(Lactobacillus)是一类常见的益生菌,它们能帮助消化系统聪明,同时也可以通过促进有益的肠道微生物的生长来改善肠道健康。
因此,乳酸细菌的分类和鉴定对于研究乳酸细菌的功能和应用具有重要意义。
本文将首先介绍乳酸细菌的分类和鉴定,然后介绍乳酸细菌的实验方法。
二、乳酸细菌的分类和鉴定1. 乳酸细菌的分类乳酸细菌是属于细菌科(Bacteroidetes)的一类细菌。
它们可以分为三大类:乳酸菌(Lactobacillus)、乳酸乳球菌(Streptococcus)和乳酸变形杆菌(Bifidobacterium)。
每一类乳酸菌都有不同的特征,如形态、生长习性和生理功能。
2. 乳酸细菌的鉴定乳酸细菌的鉴定可以分成宏观鉴定和微观鉴定两种。
宏观鉴定可以从外观上分辨不同种类的乳酸细菌,其中包括形态、大小、色泽和膜结构等。
微观鉴定则是从细节上来识别乳酸细菌的特征,包括菌体的形态、菌落的形状、菌落的大小和染色等。
三、乳酸细菌的实验方法1. 样品采集乳酸细菌的实验方法首先要从样品的采集开始。
乳酸细菌的样品可以从食品、生物体表面、自然环境或肠道等环境中获取。
采集的样品应当及时保存,以防乳酸细菌的生长和繁殖。
2. 培养基制备乳酸细菌的培养基是乳酸细菌实验的基础,它可以保证乳酸细菌的生长和繁殖。
常用的乳酸细菌培养基有MRS培养基、MRS-glucose培养基和MRS-sucrose培养基等。
这些培养基中的成分可以满足乳酸细菌的需求,从而促进乳酸细菌的繁殖和活力。
3. 培养和筛选采集到的样品和制备好的培养基可以混合在一起,然后置于培养室中,根据规定的条件进行培养。
一旦乳酸细菌在培养基中获得了生长和繁殖的机会,就可以开始筛选。
筛选的过程可以通过诸如生长观察、生理鉴定和生化鉴定等方法来进行。
4. 分子鉴定最后,分子鉴定是乳酸细菌分类鉴定的最关键步骤。
分子鉴定可以通过PCR技术、限制性片段长度多态性分析(RFLP)和16S rRNA基因测序等方法准确地识别乳酸细菌的种类。
乳酸菌分离鉴定及试验方法
乳酸菌分离鉴定及试验方法一、引言乳酸菌是一类广泛存在于自然界中的微生物,具有重要的生物学功能和应用价值。
乳酸菌可以通过发酵作用,将葡萄糖、果糖等碳源转化为乳酸和其他有机酸,同时还会产生一些对人体有益的物质,如维生素、酶、抗生素等。
乳酸菌在食品工业、医药工业、农业等领域具有重要的应用前景。
乳酸菌的分离鉴定及试验方法对于深入研究乳酸菌菌种的特性、功能以及在不同领域中的应用具有重要意义。
本文将介绍乳酸菌的分离鉴定及试验方法,旨在为相关研究人员提供参考和指导。
二、乳酸菌分离方法1. 采样乳酸菌的分离首先需要进行采样工作。
可以从发酵食品、乳制品、蔬菜、水果、土壤、肠道等多种来源进行采样。
在采样过程中应注意样品的新鲜性和卫生性,避免外部污染对实验结果造成影响。
2. 培养基的选择乳酸菌可以利用多种培养基进行分离和培养,常用的培养基有MRS培养基、乳清培养基等。
根据具体的分离目的和需求选择适合的培养基。
3. 分离将采样得到的样品进行系列稀释,取适量的稀释液均匀涂布在含有适当培养基的琼脂平板上,培养温度一般在30-37摄氏度之间,培养时间约48-72小时。
4. 纯化观察培养基上的菌落形态,选择典型的菌落进行分离单菌培养,通过多次传代稀释可以纯化获得纯种的乳酸菌。
5. 形态观察利用显微镜对分离得到的菌株进行形态学观察,包括细胞形状、大小、排列方式等。
三、乳酸菌鉴定方法1. 生理生化鉴定通过对分离得到的菌株进行生理生化特性的研究,包括乳酸发酵能力、氧耐受性、温度、pH值的适应能力等,可以初步判断乳酸菌的种属。
2. 生化试剂法利用生化试剂对乳酸菌进行鉴定,如气体发生试验、氧化还原酶试验、酶活性试验等。
3. 分子生物学鉴定通过PCR扩增乳酸菌的16S rRNA基因序列,测序后与数据库比对,确定乳酸菌的种属分类。
四、乳酸菌试验方法1. 发酵活性测定通过测定菌株在不同条件下的发酵活性,如发酵速率、产酸速率、产酶能力等。
2. 抗菌活性测定测定乳酸菌对一些有害菌的抑菌作用,判断其在抗菌方面的潜力。
食品中乳酸菌的分离鉴定与应用研究
食品中乳酸菌的分离鉴定与应用研究随着人们对健康的关注程度不断提升,食品安全成为人们日常生活中不可忽视的问题之一。
乳酸菌作为一类有益微生物,被广泛应用于食品工业中。
然而,食品中乳酸菌的准确鉴定与合理应用仍然是当前科学研究关注的热点。
本文探讨了食品中乳酸菌的分离鉴定方法以及其在食品工业中的应用前景,旨在为食品科学领域的研究提供参考。
在食品加工过程中,乳酸菌是一类常见的菌群,可以发酵产生乳酸,给食品赋予了特殊的风味和营养价值。
为了准确鉴定食品中的乳酸菌,科学家们普遍采用了分离纯化的方法。
首先,从食品样品中分离出潜在的乳酸菌,然后通过多重培养基和生理生化特性进行初步筛选。
接下来,通过形态学观察和生理生化试验进一步确定乳酸菌的种属分类。
最后,通过分子生物学技术如PCR和DNA测序来确定乳酸菌的亲缘关系。
这些方法的综合应用可以有效地分离鉴定食品中的乳酸菌种类。
乳酸菌的应用广泛,尤其在食品工业中展现出了巨大的潜力。
首先,乳酸菌可以用于酸奶、酸乳等乳制品的生产。
其产生的乳酸不仅可以增加产品的保存期限,还能提高食品的口感,增加食品的营养价值。
其次,乳酸菌还可以应用于面包、豆腐等发酵类食品的生产。
乳酸菌发酵能够使得食品在产生特殊风味的同时,还能使食品中的抗营养因子降低,增加人体对营养物质的吸收。
此外,乳酸菌还可以应用于腌制食品的生产,通过发酵降低盐分含量,并使食品更具咸鲜味。
乳酸菌的种类繁多,其应用潜力远未被完全挖掘。
尽管食品中乳酸菌的应用前景广阔,但是乳酸菌菌株的选择和培养条件仍然是当前研究中的难题。
一方面,不同种类的乳酸菌育种有其特殊性,如何从大量的微生物中筛选出理想的乳酸菌成为了困扰科学家的问题。
另一方面,乳酸菌的培养条件也是研究的难点之一。
乳酸菌对酸碱度、温度、营养物质等环境因素都有一定要求,因此科学家们需要不断努力来寻找适宜的培养条件。
综上所述,食品中乳酸菌的分离鉴定与应用研究是当前食品科学研究的重要方向之一。
乳酸菌检测思考题与讨论
乳酸菌检测思考题与讨论乳酸菌检测思考题与讨论引言:乳酸菌是一类广泛存在于自然界中的微生物,具有重要的生物学功能和应用价值。
乳酸菌不仅可以产生乳酸,还能够抑制有害菌的生长,增强人体免疫力,并对人体健康具有多种益处。
乳酸菌的检测对于食品、医药、农业等领域具有重要意义。
一、乳酸菌检测方法1. 培养基法:这是最常用的乳酸菌检测方法之一。
通过将样品接种到含有特定培养基的琼脂平板上,利用乳酸菌对特定营养物质的需求进行筛选和培养。
通过观察琼脂平板上是否出现特定形态和颜色的细菌落,可以初步判断样品中是否存在乳酸菌。
2. PCR法:PCR(聚合酶链式反应)是一种分子生物学技术,可以在短时间内扩增目标DNA片段。
通过设计特异性引物,可以选择性地扩增与乳酸菌相关的基因序列。
通过检测PCR反应产物的存在与否,可以判断样品中是否存在乳酸菌。
3. 酶法:乳酸菌在代谢过程中会产生一些特定的酶,如乳酸脱氢酶、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶等。
利用这些特定的酶可以进行乳酸菌的检测。
常用的方法有色谱法、比色法等。
二、乳酸菌检测的应用领域1. 食品行业:乳制品是乳酸菌最常见的应用领域之一。
通过对食品中乳酸菌含量的检测,可以评估产品质量和卫生安全,并指导生产工艺和储存条件的控制。
还可以通过检测食品中潜在致病菌和有害物质的含量来保障消费者健康。
2. 医药领域:乳酸菌具有调节肠道微生态平衡、增强免疫力等作用,在医药领域有广泛应用。
通过对患者粪便或血液样本中乳酸菌含量的检测,可以评估肠道健康状况,并指导医生制定个体化的治疗方案。
3. 农业领域:乳酸菌在农业领域中也有一定的应用价值。
通过检测土壤或植物体内乳酸菌的含量,可以评估土壤质量和植物健康状况,并指导农民合理施肥和防治病虫害。
三、乳酸菌检测中存在的问题与挑战1. 检测方法选择:不同的乳酸菌检测方法具有不同的灵敏度、特异性和操作难度。
在实际应用中,需要根据具体需求选择合适的检测方法。
同时,还需要考虑成本、时间等因素。
PCR技术在食品微生物检测中的运用
S口匿口□艏测P C R技朮在食品微生物检测中的运用■文I张宁黑龙江省绿色食品科学研究院+于受到环境影响,部分原生食物中污染成分含量较 Et[高,致使其出现了食品安全隐患。
部分食物中的有 害菌群远高出限定值,或存在致病微生物,为此需要利用 微生物检测方法对食品进行检测:本文首先阐述了 P C R技 术的应用原理,然后分析了P C R技术对致病菌、乳酸菌、啤酒腐败菌的检测。
一、P C R技术的应用原理P C R技术是基因工程中关键性的技术之一,也是食 品微生物检测中较为高效的新型检测方法。
其工作原理 是基于P C R体系对食物进行增温处理,高温状态下食物中 微生物的核酸序列会出现变性。
通常,P C R体系的初始温 度应为94°C左右,此时微生物的DNA会裂解成为单链,之后先将温度下降至55°C后再升至72°C,这一过程中,会使微生物上生长的引物与模板DNA产生融合,从而在 聚合酶的作用下产生新的DNA链,而后需要反复上述步 骤。
最后通过检查所获得的产物中是否有特异性DNA片 段,即可了解食品是否含有微生物此种微生物检测方法相对精准,且可通过DNA片段的测序了解所含有的微 生物种类。
二、 在食品微生物检测中的具体运用分析在致病菌检测方面的运用。
致病菌是危害人体的主要病菌,如支原体、病毒以及真菌等均属于致病菌。
利用 P C R技术检测食品中致病菌含量的步骤如下:首要对致病 菌样本进行提取,利用高速离心法进行致病菌的分离,而 后通过高温使之裂解而获取到核酸接着需要对致病菌的 DNA序列进行分析,将其中典型的DNA片段筛选出来,以靶DNA的序列为依据研究出可与其结合的特异性引物,若 引物DNA中含有靶DNA片段,则说明检测物属于致病菌细 胞。
P C R技术可应用在大肠杆菌、沙门氏菌等致病菌的检 测过程中,相较于传统检测方法,此技术具有精准性高、检测更快捷的优势。
2.在乳酸菌检测方面的运用。
PCR技术在食品微生物检测中的应用
PCR技术在食品微生物检测中的应用摘要:在现代生活当中,食品安全是一个相当重要的课题,得到了社会各界的广泛重视,保证食品安全成为了关系国计民生的大事,因此在政府和民众当中需要保持高度的重视。
对于微生物的检测技术来说,属于一项重要的检测技术,其中所涉及到的快速性、精准性以及经济型等多方面的因素需要作出最大限度的考虑。
在本文当中,首先对PCR 技术进行了概述;其次对PCR 在食品微生物检测中的具体应用做出了具体的分析和研究。
关键词:PCR技术;微生物检测;在人类赖以生存的环境和发展过程当中,食品属于一项重要的物质基础,可以保证人们安全稳定的发展,因此食品的营养和安全问题,可以说关系到了人体健康和国计民生的重大问题, 在近些年当中,出现了一些食源性疾病和食品安全问题, 已经引起了人们的高度重视。
因此在此种情况下,需要最大限度的加快食品中微生物快速检测技术是食品微生物检测技术,开展主动检测和危险性评估。
在微生物检测的过程当中,需要根据实际情况来进行不同方式的应用,从而对食品中微生物从分子进行全面的检测。
一、PCR 技术PCR技术,又称之为多聚酶链式反应( polymerase chain reaction,PCR) ,主要是在食品中微生物的检测中发挥着重要作用。
为生物基因工程提供了相当重要的技术手段。
在现阶段当中,各国对于其技术的理论研究也开展了相关广泛的研究。
在利用PCR技术进行微生物检测的原理当中,主要是对微生物当中的核酸序列进行检测,在PCR的体系下,微生物在经过高温变性、低温退火以及适温延伸这三个步骤之后,可以对其中的单个核酸分子序列以2的指数进行大量复制扩增的。
在进行检测的过程当中,需要实现对双链DNA 序列在94℃变性解链成双链的检测,其中还需要注意55℃特异性引物与单链DNA结合, 72℃在引物的引导延伸复制检测微生物DNA 序列。
经过循环序列扩增之后得到的大量的微生物DNA序列, 一般会在凝胶电泳的基础上进行目的DNA的检测。
PCR技术在食品微生物检测中的应用
PCR技术在食品微生物检测中的应用摘要:食品安全一直是社会关注的焦点,而微生物污染是导致食品安全问题的主要因素之一。
食品中的微生物污染可能引发食品中毒、食源性疾病等健康风险。
为了保障公众的健康和食品产业的可持续发展,快速、准确地检测食品中的微生物污染变得尤为重要。
本文以“PCR技术在食品微生物检测中的应用”为题进行深入探究,旨在促进该领域的进一步研究开发和推广应用。
关键词:PCR技术;食品微生物检测;应用引言:聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)技术作为一种高度灵敏且特异的分子生物学工具,已在食品微生物检测领域得到广泛应用。
PCR技术通过扩增目标微生物的核酸片段,使微生物的检测不仅更加敏感,还能够区分不同菌株,从而为食品质量控制和食品安全监测提供有力的手段。
因此,对PCR技术在食品微生物检测中的应用进行探究具有极大的现实意义。
1.PCR技术聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,简称PCR)技术是一种用于扩增DNA片段的强大工具,它在分子生物学、医学、生物研究和疾病诊断等领域得到广泛应用。
PCR技术的原理基于DNA的复制过程,通过一系列的循环反应,使特定DNA片段的数量迅速增加,从而可以从微小的起始DNA样本中获得足够的DNA量用于分析和检测。
2.食品微生物检测食品微生物检测是一种关键的食品安全控制措施,旨在检测食品样品中是否存在微生物污染,以确保食品的卫生和安全。
食品微生物检测的目标微生物范围广泛,包括细菌、真菌、病毒等。
常见的检测目标包括致病性细菌(如沙门氏菌、大肠杆菌等)、食品腐败微生物、食品过敏原等。
3.PCR技术在食品微生物检测中的应用3.1 选择合适的目标基因或序列特异性是PCR检测的核心,关系到所获得的检测结果是否能够准确地区分目标微生物与其他相关物种。
在选择目标基因时,需要优先考虑那些在不同菌株中高度保守的基因或序列。
食品中乳酸杆菌的实时荧光PCR的快速检测
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Ab ta t I i a t l wee t bih d a rp d me d o ee t n o L co a i u n f 0 s g r a— me P R c n q e Ge e a s r c : n t s r ce, sa l e a i  ̄o f rd tci f a t b cl s i 0 d u i e lt h i s o l n i C t h iu . n r l e
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a d se i cpo e r ein dt ee tte 1S r n p cf rb swee d s e o d tc h 6 DNA eu n eo a tb cl s b a M a a e li R sa su ig i g sq e c fL co a iu y T q n- a-meP l  ̄r t C asy s n
利 亚乳杆菌 ,常用于饮料等发酵工业 。也有些常用 于
本研 究所用 植物乳酸杆菌 、干酪乳 酸杆 菌 、保加
生物检定 ,如乳酪乳杆 菌被广 泛应用 于各种维生素 B
利亚乳酸杆菌,嗜热链球菌标准菌株购 自 北京兰伯瑞 生物技术 有限公司; 其他菌株均为本实验室分 离得 到。 1 仪器和试剂 . 2
L c o a i u nfo . a t b c l si o d l
Ke ywo d : o d L co a i u ; e l i r s fo ; a tb cl s r a・ meP l t CR; ee t n d t ci o
PCR技术在食品 微生物检测中的应用
PCR技术在食品微生物检测中的应用作者:李亚男来源:《中国食品》2021年第17期随着生活水平的不断提升,人们越来越关注食品安全问题,因为食品安全问题与人们的健康息息相关,一旦食品存在质量问题就可能导致疾病传播,并造成社会恐慌。
为了全力保障食品安全,诸多食品检测技术得到利用,其中的PCR技术就是先进的食品微生物检测技术之一,操作便捷,准确性高,可以有效检测食品中的微生物。
本文从PCR技术在食品微生物检测中的应用类型入手,介绍了PCR技术的特点与优势,并分析了如何在食品微生物检测中利用PCR技术,希望对相关研究有所帮助。
一、PCR技术在食品微生物检测中的应用类型PCR也被称为聚合酶链式反应,结合了生物体DNA复制技术,20世纪80年代,美国利用并迅速发展该技术,能够促进特定生物体外的特定DNA序列扩增。
PCR技术包括变性阶段、退火阶段和延伸阶段,在变性阶段打开DNA双链;在退火阶段将DNA单链和特性异物结合;在延伸阶段将DNA单链作为模板,并在DNA聚合酶的影响下合成DNA。
利用PCR技术可以获取大量的DNA分子,然后对DNA进行分析,通过检测DNA序列及其丰度可以确定微生物的种类和数量,其中少量微生物可以利用PCR技术进行检测。
目前,PCR技术广泛用于核酸检测领域,相较于传统的克隆技术来说是巨大的突破。
1.基础PCR技术。
改革开放以来我国食品行业迅速发展,食品生产企业的数量逐年增加,但是部分企业受经济、设备等条件的限制,在生产和加工食品的过程中未能做好微生物检测工作,导致部分问题产品流入市场。
如今,越来越多的食品生产企业利用PCR技术对食品中的多数微生物进行检测,有相关人员利用PCR技术进行沙门氏菌基因检测,检出率高达99%,从而有效预防微生物污染,保障食品质量安全。
2.多重PCR技术。
借助PCR多重检测技术能够简化操作流程,对多种基因进行检测,有相关人员对大肠杆菌、沙门氏菌进行检测,证实可行性较高。
酸奶发酵过程中乳酸菌菌株的筛选与鉴定
酸奶发酵过程中乳酸菌菌株的筛选与鉴定酸奶是一种由牛奶或者其他乳制品通过乳酸菌的发酵而制成的食品。
乳酸菌是酸奶发酵的关键因素,具有良好的保健效果和口感。
在酸奶制作过程中,乳酸菌菌株的筛选与鉴定是非常重要的步骤。
本文将介绍酸奶发酵过程中乳酸菌菌株的筛选与鉴定的方法和意义。
首先,乳酸菌菌株的筛选是为了选择出适合酸奶发酵的优质菌株。
在酸奶制作中,菌株的特性包括产酸能力、耐受性、生长速度和抗菌特性等多方面。
通过筛选过程,可以找到产酸量高、生长快速、对不良菌有抑制作用的优质菌株。
这些菌株可以在酸奶制作中快速发酵,产生出优质的酸奶。
乳酸菌菌株的筛选方法有很多种,常见的包括传统筛选法、分子筛选法和生理筛选法等。
传统筛选法是指利用一系列的生理、生化和形态特性对菌株进行初步筛选。
通过这种方法,可以初步判断菌株是否具有发酵酸奶的潜力。
分子筛选法则是通过利用分子生物学技术对乳酸菌菌株进行检测,例如PCR扩增、16S rRNA测序等。
这些方法可以对菌株的遗传信息进行分析,从而确定其种属和亲缘关系。
生理筛选法则是根据菌株在不同环境条件下的生长情况,筛选出适应性强、产酸能力高的菌株。
乳酸菌菌株的鉴定是为了确保酸奶发酵过程中使用的菌株的纯度和品质。
鉴定的目的是确定菌株的种属和亚种,以及其在酸奶制作中的适用性。
鉴定的方法多样化,常用的有生化鉴定法、微生物学鉴定法和分子生物学鉴定法等。
生化鉴定法是利用菌株在特定培养基和条件下的代谢特征进行分析,通过菌株对不同物质的反应情况来确定其种属。
微生物学鉴定法则是通过观察菌株的细胞形态、培养特性等进行判断。
分子生物学鉴定法则是通过测序菌株的特定基因序列,例如16S rRNA,来确定菌株的种属和亲缘关系。
乳酸菌菌株的筛选与鉴定在酸奶发酵过程中具有重要的意义。
通过合适的筛选和鉴定方法,可以保证酸奶发酵的质量和稳定性。
优质的菌株不仅可以提高酸奶的口感和品质,还具有益生菌的功能,对消化系统和免疫系统有益。
乳酸菌菌落特征与鉴定
乳酸菌菌落特征与鉴定乳酸菌是一类广泛存在于自然界中的微生物,可以在发酵食品、发酵饲料等的制作过程中产生乳酸,具有重要的应用价值。
乳酸菌菌落的特征与鉴定有助于确定其种类、品质以及发酵能力等方面的信息。
以下将从乳酸菌的菌落形态特征、生理生化特征以及分子生物学特征等方面进行介绍。
乳酸菌的菌落形态特征对于鉴定其种类至关重要。
乳酸菌的菌落通常呈白色或乳白色,与一些其他菌落形态相比较容易区分。
乳酸菌的菌落一般较小,直径在1-2毫米左右,起初呈球形,逐渐变平展,并具有典型的菌落边缘光滑或呈不规则的边缘。
此外,乳酸菌的菌落表面光滑或凹凸不平,质地柔软,并且菌落会发生一定的变色现象,例如有的乳酸菌会在菌落周围形成红色环带。
乳酸菌的生理生化特征也是鉴定其种类的重要依据之一、乳酸菌具有好气性和厌氧性两种类型,好气性乳酸菌需要氧气才能生长,而厌氧性乳酸菌则可以在无氧条件下生长。
乳酸菌在形成乳酸的过程中不产生气体,与产气菌相比较容易区分。
此外,乳酸菌一般为革兰氏阳性菌,不产生芽孢。
乳酸菌的生理生化特征还包括是否产生过氧化氢酶、蛋白酶、氧化酶等酶类,以及对不同的碳源和氮源的利用情况等。
分子生物学技术的应用使得乳酸菌的鉴定更为准确和方便。
通过PCR技术可以扩增乳酸菌的16SrRNA基因序列,然后通过测序和序列分析来鉴定乳酸菌的种类。
16SrRNA序列是乳酸菌的系统分类研究中最常用的序列标记,其具有高度保守性和足够的区分度,有助于确定乳酸菌的种属和进一步的亚种分类。
此外,对于一些重要的产酸乳酸菌种类,还可以通过多重引物聚合酶链式反应技术来进行鉴定。
例如,通过对乳酸菌的ldh基因进行扩增和分析,可以鉴定产酸乳酸菌中嗜酸性的乳酸菌种类。
通过分子生物学的方法,乳酸菌的鉴定可以更加迅速和准确。
总之,乳酸菌的菌落特征、生理生化特征和分子生物学特征是鉴定乳酸菌的重要依据。
综合运用这些方法可以确定乳酸菌的种类、品质以及发酵能力等信息,对于乳酸菌的研究和应用具有重要意义。
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PCR技术在乳酸菌分类鉴定中的应用王庭柱,高学军,杨振宇东北农业大学教育部乳品科学重点实验室(150030)E-mail:wangtingzhu1980@摘要:近年来,随着分子生物学和生物信息学的迅速发展,特别是作为生物技术里程碑的PCR技术以及核酸测序和电泳技术的不断改进与完善,产生了许多新的分类学方法,如RAPD、PCR-RFLP、T-RFLP、ARDRA、PCR-SSCP、PCR-DGGE、PCR-TGGE、AFLP、REP-PCR、S-PCR、LCR、LH-PCR、SBCS以及小卫星序列多态性和序列同源性分析等。
本文即论述了这些技术在乳酸菌分类鉴定中的应用及其优势和局限性。
关键词:乳酸菌,PCR,分类,鉴定,分子生物学1. 引言乳酸菌(lactic acid bacteria, LAB)是一大类缺乏细胞色素、糖代谢主要以乳酸为终产物的革兰氏阳性非芽孢细菌,其过氧化氢酶反应为阴性、耐氧耐酸、营养要求复杂并且严格发酵。
LAB这个名称就细菌分类学而言实属一个非正式、非规范的名称。
目前从自然界中已发现的这类细菌在分类学上至少可划分为23个属,涉及到的有关菌种则更多,其代表性的菌属有乳杆菌属、乳球菌属、链球菌属、双歧杆菌属、肠球菌属、明串珠菌属、气球菌属、肉杆菌属、酒球菌属、足球菌属、四体球菌属和漫游球菌属等[1,2]。
传统的LAB鉴定方法主要依赖于表型分析,包括形态学观察、生长需要及特性、发酵图谱、细胞壁蛋白分析、血清学以及脂肪酸甲基酯分析等,其中有些技术已被证明适用于某些LAB的鉴定,但是也普遍意识到表型分析的一些缺点,如重现率及辨识能力低、相似的表型特性并不等同于相似的或者关系密切的基因型[3]。
表型试验可能的固有问题是,不是每一给定种内的所有菌株都有一个共同的性状,而且即使是同一菌株也可能呈现出一定的生化变异性。
此外,实验操作的一点改变也可能产生错误的结果。
因此基于表型试验的常规技术并不能对菌株做出明确的鉴定[4]。
一般来讲,准确地鉴定一株乳酸菌至菌种的水平,至少需要17种表型实验[5],但是微生态系统的分离株需要更为简单快速的鉴定方法。
因此,需要进行表型特性的分子水平研究和遗传特性的研究。
只有分子生物学技术才能解决LAB鉴定的复杂性。
近年来发展起来的核酸技术如DNA 杂交和特定靶序列的扩增技术,对LAB的鉴定是一种改进和补充。
在LAB分类学方面,代表性的遗传学方法是限制酶分析(restriction enzyme analysis, REA)的多态性(如PFGE、RFLP 和核糖分型)和PCR技术[3]。
REA是进行基因组DNA的限制性内切酶消化。
脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis, PFGE)是经酶切后,分离出大量的基因组片段;限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism, RFLP)指的是酶切后含同源序列的酶切片段在长度大小或数目上的差异;而核糖分型(Ribotyping)是以rDNA和/或其间隔区域作为探针,与基因组限制片段进行杂交。
PFGE是菌株分类中最有识别力的方法,但是基因组DNA的所有限制片段的完全分离是个困难;迄今,最佳辨识力的遗传探针是种特异性的[6];而PCR技术以及以PCR为基础的遗传指纹技术和群落分析技术甚至可以进行高度菌株特异性的LAB鉴定。
PCR技术的创立打开了LAB快速鉴定的大门,其不仅操作简便、快速可靠并且灵敏高效,而且还克服了对培养的依赖性(自然界中有85~99.9%的微生物至今还不能进行纯培养)。
PCR技术用于LAB的鉴定和鉴别,一些是依赖于扩增子的多少有无,如特异性PCR、多重PCR、PCR-RFLP、ARDRA、T-RFLP、RAPD、AFLP、REP-PCR、LCR、LH-PCR以及小卫星序列多态性等,而另一些则是依赖于等长同源扩增子的序列比较分析或者是其在特殊电泳介质中迁移距离的差异,如序列同源性分析法、PCR-SSCP、PCR-DGGE和PCR-TGGE。
以PCR为基础的方法学为LAB鉴定以及混合菌群的多样性研究提供了简单快速的方法。
本文即对各种PCR技术在LAB分类鉴定研究应用中的原理及其应用的优势和局限性做一综述。
2. 特异性PCR特异性PCR(Specific PCR),是依据某一(某些)乳酸菌株的已知(同源)基因序列设计菌株(菌种/菌属/菌群)特异性的PCR引物,扩增后产生排他性的唯一条带,据此做出鉴定。
PCR的特异性取决于引物与模板核苷酸序列的特异性结合,即模板核苷酸顺序的特异性,因此靶序列的选择起着决定性的作用。
目前,多是以蛋白/酶编码基因作为靶序列进行鉴定引物的设计,如聚糖酶(dex)、氨基肽酶C(pepC)、氨基肽酶N(pepN)、胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶(htrA)、重组酶(recA)、N-乙酰溶菌酶(acmA)、脯氨酸亚氨基肽酶(pepI)、addAB、β-半乳糖苷酶(lacz)和谷氨酸脱羧酶(gad)、谷氨酸脱氢酶(gdh)等,且多为菌种(含亚种)水平的,涉及到的菌种有远缘链球菌、变形链球菌[7]、汉毛链球菌[8]、猪链球菌 [9]、嗜热链球菌[10]、瑞士乳杆菌[11]、植物乳杆菌、戊糖乳杆菌、类植物乳杆菌[12]、德氏乳杆菌[13]、乳酸乳球菌[14,15]以及亚种有德氏乳杆菌保加利亚亚种和乳酸亚种[16]、乳酸乳球菌乳酸亚种和乳脂亚种[14,15];也有依据组氨酸生物合成操纵子序列设计了乳酸乳球菌亚种特异性的PCR引物,可将其乳酸亚种和乳脂亚种鉴别开[17]。
此外也有群、属特异性PCR引物,如JC Le等比较各种LAB的组氨酸脱羧酶基因(hdcA)设计了群特异性引物,可鉴定出所有可使组氨酸脱羧的LAB[18];FJ Picard 等基于链球菌延伸因子编码基因(tuf)设计了属特异性的PCR引物[19];甚至也有婴儿双岐杆菌Y1和短双歧杆菌Y8的菌株特异性PCR引物[20]。
随着16s rRNA基因及其结构的发现,认为其可作为遗传标记的“细菌化石”,所以其在分类学上的应用也越来越广泛,且多是依据16S rDNA可变区设计特异性引物,与其保守区域引物协同使用,进行菌种水平的鉴定,包括鼠李糖乳杆菌、干酪乳杆菌、副酪乳杆菌[21]、短乳杆菌[22]、植物乳杆菌、发酵乳杆菌、罗伊乳杆菌、唾液乳杆菌[23]、婴儿双岐杆菌、动物双歧杆菌、长双歧杆菌[24]、青春双歧杆菌、齿双歧杆菌[25]、无乳链球菌[26]和乳酸乳球菌[27];也有上下游引物都是依据保守区域设计,这样可进行更为广阔范围的LAB鉴定,如S Goto 等设计明串珠菌属特异性的PCR引物[28],而S Nakano等甚至依据16s rDNA设计群特异性引物检测乳杆菌属和足球菌属的耐醋酸性LAB[29]。
特异性PCR用于LAB的种属鉴定是很方便直观的,但是用于种属之内的菌株鉴定却很麻烦,因为随着进化距离的降低,同源基因(包括rDNA)的多样性也不是很有效的,关系接近菌株的遗传关系也不容易做出准确的界定。
研究表明,16S~23S rRNA基因间序列(intergenic sequences, ITS)能够克服这个问题 [6,30,31],因为ITS区域的进化压力较小,所以可以提供更大的遗传变异。
但是需要针对每一菌株都进行特异性引物设计,这无疑降低了实验的可操作性。
3. 多重PCR多重PCR(Multiple PCR),是指在1次PCR反应中使用多套/个引物,针对多个乳酸菌DNA模板或同一LAB模板的不同区域进行扩增的过程,依据扩增片段的有无和长短差异做出鉴定。
针对于多个DNA模板的多重PCR可同时检测出几个乳酸菌属[32]/菌种[8,12,33~36]甚至是几个菌株[26],这取决于特异性PCR引物靶基因的序列特异性;而针对于同一LAB模板的不同区域进行扩增,可以增加鉴定的特异性和检测的准确性,且多为菌种水平[9,31,37,38],也可达到菌株水平[39]。
另外也可通过PCR的嵌套来扩大检测的范围[40]。
Multiple PCR在一个反应管中能够同时检测多种目的DNA,可同时满足分析不同DNA 序列的需要,这不仅能节省珍贵的实验样品,而且能使以往繁琐的操作变得省时省力。
一般来说,扩增的靶序列越多,准确性和可靠性越大。
多重PCR的主要局限性与PCR反应条件的优化(即退火温度、退火时间以及引物浓度的相对比例)有关,这使得必须选择有相似反应条件的引物,尤其是退火温度。
如果有适当可用的序列信息,那么建立和确定潜在的多重PCR方案是可行的。
4. 群落分析技术群落分析技术应用于LAB的鉴定方面是基于高分辨率的电泳系统,如单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism, SSCP)、变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE)和温度梯度凝胶电泳(temperature gradient gel electrophoresis, TGGE),甚至可检测出1个碱基的序列差异。
其基本原理是依据单一rRNA基因的构象差异以及双链rRNA基因的化学稳定性和解链温度的差异对其进行分离, SSCP是基于单链构象的多态性进行中性聚丙酰胺凝胶分离;DGGE的聚丙酰胺凝胶是由一个线性的变性梯度组成的,这个线性的变性梯度是由尿素和甲酰胺形成;而TGGE 中是一个线性的温度梯度。
群落分析技术进行LAB的鉴定,多是进行等长16S rRNA特异性PCR扩增子的总体描绘,不仅能够进行多样性的快速判断,同时也可进行多样品的分析[41~44]。
SSCP只适合长度小于200bp的序列检测,而DGGE/TGGE能够进行500bp以下的序列测定,它们的另一个限度是,异种序列也可能有相似的迁移,因此凝胶中相同位置的条带并不能必然地说明它们在系统发生学上是密切相关的。
通过缩小梯度可增强分辨率,但是图谱的随后鉴定工作(如杂交分析或者切离条带的克隆测序)也增加了鉴定的复杂性,尽管可以通过选用低拷贝的同源基因作为靶序列以减少所检测的序列数目来降低鉴定的复杂性[45];也可通过PCR的嵌套来降低对扩增子进行克隆测序的必要性[46]。
此外,这些突变检测系统的价格昂贵(约13000美元),也使其广泛应用受到了限制。
5. 遗传指纹技术改进的遗传指纹技术依赖于特异性PCR扩增子的REA的多态性,PCR-RFLP是先用特定引物特异性扩增基因组DNA,然后用适当的限制性内切酶切割扩增产物,电泳检测多态性[15,47],而扩增rDNA限制性分析(amplified ribosomal DNA restriction analysis, ARDRA)是基于16s rDNA的RFLP[48~50]。