RNA的分离纯化技术

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rna提取的原理

rna提取的原理

rna提取的原理
rna提取是一种用于分离和纯化RNA分子的技术。

它是基于RNA在生物体中具有碱性特性以及RNA与DNA之间的化学
差异。

首先,需要将样品(如细胞组织、细胞培养物等)收集并打碎,以释放细胞内的RNA分子。

然后,通过加入裂解缓冲液,可
以使RNA保持在溶液中而不受降解的影响。

接下来,需要加
入含有离子的溶液,如乙酸或盐溶液,以中和RNA分子的碱
性特性。

这样一来,RNA分子会以氢键和离子键的形式与溶
液中的离子结合,形成稳定的RNA-离子复合物。

为了进一步纯化RNA,可以使用酚/氯仿提取法。

该方法利用
酚的亲水特性和氯仿与酚相互不相溶的性质,将RNA-离子复
合物从其他细胞组分中分离出来。

在这个过程中,酚会与
RNA-离子复合物结合,而其他细胞组分则会保留在无机相
(如下层的氯仿相)中。

接下来,离心可将上层的RNA-酚复合物沉淀到底部。

然后,
通过加入冷酒精,可进一步沉淀和纯化RNA分子。

冷酒精中
的离子和RNA结合形成了RNA-离子复合物,这样可以使
RNA从水溶液中沉淀出来。

最后,通过离心将RNA沉淀到管底。

随后,可以使用酚/氯仿
再次提取以去除可能残留的污染物。

最终,用无脂乳状液或其他适当的溶液溶解RNA,在纯化过程完成后就可以得到纯的RNA样品了。

通过RNA提取技术,可以获得高质量的RNA分子,以用于后续的实验和研究,如逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)、Northern印迹、测序等。

提取细胞中的rna的方法

提取细胞中的rna的方法

提取细胞中的rna的方法提取细胞中的RNA是一项重要的实验技术,它能够帮助研究人员深入了解RNA在细胞中的生物学功能及表达调控机制。

下面将介绍几种常见的RNA提取方法。

1. TRIzol法TRIzol法是一种广泛应用于RNA提取的方法。

该方法基于TRIzol试剂对细胞或组织样品中RNA的溶解作用,通过氯仿沉淀和酒精洗涤来纯化RNA。

该方法简单易行,适用于各种类型细胞和组织,同时提取的RNA质量较好,但相对来说RNA纯度不高。

2. 磁珠法磁珠法是一种全自动化的RNA提取方法,通过使用磁性珠子将RNA 特异性结合剂捕获目标RNA,再通过磁力将磁性珠子从混合物中分离出来。

该方法操作简便,具有较高的RNA纯度和产量,且适用于从小样品中提取RNA。

3. 柱式纯化法柱式纯化法即RNA纯化柱法,基于RNA特异性结合柱将RNA捕获,由于RNA与柱子上的化学物质发生特异性亲和作用,其它核酸和蛋白质可以被去除。

该方法RNA纯度高,产量也比较可靠。

4. 整体细胞RNA提取法整体细胞RNA提取法采用混合酚(phenol)和氯仿(chloroform)作为RNA溶解和分离剂,该方法能够直接溶解细胞膜来提取细胞中的RNA。

整体细胞RNA提取法的优点在于它可以同时纯化RNA和DNA,同时提取的RNA产量较高,但RNA质量不够纯粹。

5. 分子降解法分子降解法是使用各种离子、化学物质和酶来切断RNA的方法,从而释放出RNA。

该方法适用于各种细胞和组织类型,它在纯化RNA的同时能够消除能降解和干扰RNA研究的RNA样品,提高RNA纯度。

但该方法RNA产量比较低,不适合处理大量样品。

总之,以上提取RNA的方法各有优缺点,选择哪种方法取决于实验目的、样品类型和实验条件等因素。

RNA的分离纯化技术

RNA的分离纯化技术

RNA的分离纯化技术RNA分离过程中的难点在于多数核糖核酸酶(RNA酶)都非常稳定并且活性很高,不需要任何辅助因子就能进行酶解反应。

因此,在所有RNA分离提取的操作方案中,第一步都是在能使RNA酶失活的化学环境中裂解细胞,然后才是从各种细胞分子中分离提取RNA。

一、RNA制备中的关键因素RNA制备中最关键的因素是尽量减少RNA酶的污染。

(一)去除外源RNase的污染1.避免手、唾液的污染戴口罩、手套,并经常更换(使用一次性手套)。

2.避免空气中的细菌等微生物污染在超净台中操作,工作区域应与进行普通微生物实验的区域分隔开,特别是用于细菌接种、培养基和试剂配制的区域,因为这些区域富含RNA酶。

3.玻璃器皿的处理用水清洗干净后,200℃烘烤4小时。

4.塑料用品的处理尽量使用一次性塑料制品,并用0.05%~0.1%焦碳酸二乙酯(DEPC)浸泡吸头及Eppendorf管过夜或37℃2小时,1.2kPa高压30分钟去除残留的DEPC。

5.溶液的配制先配0.1%DEPC过夜,然后1.2kPa高压30分钟除DEPC,用此水配液,然后用0.22μm的滤膜过滤除菌,最好使用未曾开封的试剂配制。

6.RNA电泳槽的处理先用去污剂洗涤、水清洗、乙醇干燥,再浸泡于冰H2O2溶液中放置10分钟后,用0.1% DEPC处理过的水彻底冲洗。

7.降低Rnase活性尽量在冰浴中操作。

此外,最好将RNA实验用的玻璃器皿、塑料器皿和电泳槽专用专放,标上明显的标记并放在固定位置。

(二)去除内源RNase的污染在细胞破碎的同时,Rnase也被释放出来,原则上应尽可能早地去除细胞内蛋白并加入RNase抑制剂。

1.去蛋白质试剂由于RNase为一种蛋白,故去除蛋白质的试剂可非特异地抑制RNase的活性。

(1)酚-氯仿:其作用为使蛋白质与核酸解离;另外,作为蛋白质变性剂,可以抑制RNase的活性;并且酚-氯仿联合可增强对RNase的抑制。

(2)蛋白酶K:与1%~2%的SDS合用其效果更佳。

rna纯化原理

rna纯化原理

rna纯化原理
RNA纯化是一种重要的实验步骤,目的是从混合样品中分离、纯化并富集RNA。

在进行RNA纯化的过程中,需要考虑到RNA的稳定性以及杂质的去除。

以下是一些常用的RNA纯化
方法和原理:
1. 酚/氯仿法:该方法利用RNA和DNA在酚相和水相中的差
异分配特性,将细胞裂解后的混合样品经酚酸盐处理,使
RNA富集在酚相中,而DNA和蛋白质则富集在水相中。

2. 硅胶柱层析法:该方法基于RNA与硅胶之间的结合性质,
通过将样品溶液滴入硅胶柱中,RNA会与硅胶发生结合,然
后通过洗脱步骤来去除杂质,最终得到纯化的RNA。

3. 离心过滤法(Ultrafiltration):该方法利用超滤膜的孔径大
小来分离RNA和其他分子。

样品置于超滤膜中,通过离心加
速运动,分子会根据其大小通过膜孔,使得RNA被保留在滤
膜上,从而实现纯化。

4. 核酸磁珠法:该方法利用具有亲和性的磁珠来捕获RNA分子,然后通过磁场将磁珠与复合物分离出来,并进行洗脱步骤来去除杂质,使得RNA得到纯化。

这些方法各有优缺点,需要根据实验需求和样品特性选择最合适的方法进行RNA纯化。

在实验过程中,需要注意避免RNA 的降解,避免污染以及误差的引入,以确保最终纯化的RNA
质量和纯度的高度。

rna纯化方法及原理

rna纯化方法及原理

rna纯化方法及原理RNA纯化是分离和提纯RNA分子的过程,常用于RNA的后续研究和应用。

本文将介绍几种常见的RNA纯化方法及其原理。

一、酚-氯仿法酚-氯仿法是一种经典的RNA纯化方法,其原理基于RNA在酚相中溶解度较低,而在氯仿相中溶解度较高的特点。

该方法主要包括细胞破碎、酚相和氯仿相的提取、RNA的沉淀和洗涤等步骤。

将待纯化的细胞破碎,释放出细胞内的RNA分子。

然后,将酚溶液加入细胞裂解液中,混合均匀。

酚与细胞裂解液中的蛋白质结合形成上层的酚相,而RNA则溶解在下层的水相中。

接着,加入等体积的氯仿,形成两层相。

RNA会从水相转移到氯仿相中。

通过离心,将RNA富集在上层的氯仿相中。

然后,将RNA沉淀下来,用乙醇洗涤去除杂质。

最后,将RNA溶解在适当的缓冲液中,即可得到纯化的RNA。

酚-氯仿法是一种简单有效的RNA纯化方法,适用于大量样品的处理,但存在RNA降解的风险。

二、硅胶柱法硅胶柱法是一种基于RNA与硅胶之间的亲和性纯化方法。

硅胶柱具有较大的比表面积和亲和力,可将RNA分子捕获在柱子上,而其他杂质则通过洗涤缓冲液的洗脱。

将待纯化的RNA样品与硅胶柱上的RNA结合缓冲液混合,使RNA与硅胶结合。

然后,将混合物加载到硅胶柱中,RNA会与硅胶发生亲和作用,结合在柱子上。

接着,通过洗脱缓冲液的洗涤,去除非特异性结合的杂质。

最后,使用洗脱缓冲液将纯化的RNA 从硅胶柱上洗脱下来。

硅胶柱法具有选择性好、纯化效果较好的优点,适用于小样本和高质量RNA的纯化,但操作较为繁琐。

三、磁珠法磁珠法是一种基于磁性珠子的RNA纯化方法。

磁性珠子表面修饰有亲和基团,可与RNA发生特异性结合,将RNA富集在磁珠上,然后通过外加磁场将磁珠与RNA分离。

将待纯化的RNA样品与磁珠上的亲和基团发生特异性结合。

然后,通过外加磁场,将磁珠与结合的RNA分离出来,形成磁珠-RNA复合物。

接着,用洗涤缓冲液洗脱非特异性结合的杂质。

最后,去除磁场,将纯化的RNA从磁珠上洗脱下来。

RNA的分离与纯化

RNA的分离与纯化

RNA的分离与纯化包括Northern杂交在内的许多分子生物学实验均是以RNA为材料,mRNA的制备也需要一定质量的总RNA样品,RNA的数量、纯度与完整性将直接影响这些实验的结果。

RNA中rRNA的数量最多,占总量的80%~85%;tRNA及核内小分子RNA占15%~20%;mR NA仅占1%~5%。

由于各种rRNA、tRNA及核内小分子RNA的结构与功能已比较清楚,从基因克隆、表达与诊断的目的出发,目前对RNA的分离与纯化,主要集中在总RNA 与mRNA上。

一、RNA制备的条件与环境为防止RNase对RNA 的水解,一要全力避免细胞外RNase的污染并抑制其活性,二要尽快地抑制细胞内RNase的活性并极力地去除RNase。

对广泛存在的细胞外RNase,应在RNA制备的全过程中保持高度的警惕,并采取严格的措施以避免其污染和抑制其活性。

从RNA提取的初始阶段开始,就选择性地使用针对RNase的蛋白质变性剂(如酚、氯仿等有机溶剂以及强烈的胍类变性剂)、蛋白的水解酶(如蛋白酶K)和能与蛋白质结合的阴离子去污剂(如SDS、sarkosyl或脱氧胆酸钠等)并联合使用RNase的特异性抑制剂(如RNasin与DEPC等)能极大地防止内源性RNase对RNA的水解。

另外,在变性液中加入β-巯基乙醇、二硫苏糖醇(dithiothreitol,DTT)等还原剂可以破坏RNase中的二硫键,有利于RNase的变性、水解与灭活。

二、总RNA的分离与纯化由于RNase的影响,为获得完整的RNA分子,就必须在总RNA分离纯化的最初阶段,尽可能快地灭活胞内RNase的活性。

在β-巯基乙醇的协同作用下,高浓度的(异)硫氰酸胍可以极大极快地抑制RNase的活性,能从胰腺等富含RNase的组织细胞中分离出完整的RNA分子,目前已成为常规使用的试剂。

pH8.0的Tris饱和酚用于DNA的制备,但在RNA纯化时,应使用pH4.5~5.5的水饱和酸性酚,这既有利于DNA的变性又有利于RNA的分离。

RNA的分离纯化技术解析

RNA的分离纯化技术解析
11/1/2018
4、密度梯度离心
• 用胍盐/氯化铯将细胞抽提物进行密度 梯度离心。蛋白质密度<1.33g/cm3在最 上层。DNA密度在1.71g/cm3左右,位 于中间。RNA密度>1.89g/cm3,沉在底部。 用此方法可制备较大量纯度的天然RNA
11/1/2018
结果分析
• 分光光度法测260nm和280nm下OD 值 • Northern-Bolt杂交 • 1)甲醛-琼脂糖凝胶电泳 • 2)聚丙烯酰胺凝胶电泳 • RT-PCR检测
11/1/2018
试验流程图
细胞
氯仿 水相
细胞选择
纯化 RNA 基因组DNA
离心
贴壁细胞 悬浮细胞
加入裂解液 (TRNzol-A+)
有机相
pH5.7
11/1/2018
3、苯酚法
• 细胞内大部分RNA 均与蛋白质结合在一起, 以核蛋白的形式存在。因此,提取RNA时要 把RNA与蛋白质分离并除去。将细胞置于含 有十二烷基磺酸钠(Sodium dodecyl sulfate,SDS)的缓冲液中,加等体积水饱 和酚,通过剧裂振荡,然后离心形成上层 水相和下层酚相。核酸溶于水相,被苯酚 变性的蛋白质或者溶于酚相,或者在两相 界面处形成凝胶层。 • 苯酚法提取酵母RNA
RNA的分离纯化技术
第四组
【实验目的】
1.了解RNA分子的种类、分布及其 结构特点 2.掌握总RNA提取的基本原理和实 验方法 3.掌握总RNA浓度检测的方法 4.掌握总RNA完整性检测的方法
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主要内容
• • • • RNA的概述 分离RNA的意义 总RNA的分离与纯化 结果分析
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植物RNA的分离纯化(LiCl沉淀法)

植物RNA的分离纯化(LiCl沉淀法)

rRNA条带的1.5-2倍。反之,说明部分28S rRNA已经降解成 18S rRNA。若无清晰条带,则说明样品RNA已严重降解;若 加样孔内或孔附近有荧光区带,则说明有DNA污染。
【注意事项】
1.条件允许的实验室应专门辟出RNA操作区,离心机、移液 器、试剂等均应专用,RNA操作区应保持清洁,并定期行除 菌。 2.操作过程中应始终戴一次性手套,并经常更换,以防止手、 臂上的细菌和真菌以及人体自身分泌的RNA酶带到试管或污染 用具。 3.避免在操作过程中说话聊天。 4.配制溶液用的酒精、异丙醇、Tris等应采用未开封的新瓶。 5.所有旧塑料制品都必须用0.5mol/L的NaOH处理10min,用 双蒸水彻底冲洗,DEPC-H20浸泡过夜后灭菌。 6.所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下烘烤6h或更 长时间。 7.配制的溶液应尽可能的用0.1% DEPC在37℃处理12h以上, 然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的试剂,应当 用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经0.22μm滤膜过滤除 菌。
16.弃去上清液,沉淀分别用70%乙醇和无水乙醇1ml洗涤,并 短暂离心。 17.小心吸去残留的乙醇,空气中凉干3min。 18.RNA用20-30l无菌水溶解,贮藏于-70℃备用。 19.RNA的浓度测定和纯度分析 取2-5lRNA溶液稀释至100l,于紫外核酸蛋白检测仪上测 定A260、A280和A320的OD值,并计算RNA浓度和得率。 注:核酸及其衍生物的紫外吸收高峰在260nm,对纯的RNA来 说,OD260/OD280为2.0,1个OD260约为40g/ml RNA。 20.RNA的完整性检测 1.2%琼脂糖凝胶电泳 在紫外检测仪下观察,完整的总RNA样品应呈现三条带: 28S、18S、和5S rRNA。其中28S rRNA条带的亮度应该为18S

rna的提取方法

rna的提取方法

rna的提取方法RNA的提取是从生物样品中获取RNA的过程,这个过程通常包括以下几个步骤:1. 样品收集:根据需求选择生物样品,如细胞、组织、血液等,并采用合适的方法收集。

2. 细胞破碎:通过细胞破碎,将细胞内的RNA释放到溶液中。

破碎方法包括机械破碎、超声波破碎、化学破碎等。

3. RNA分离:分离RNA和其他分子,如DNA、蛋白质等。

4. RNA纯化:将RNA纯化,去除杂质,获得高质量RNA。

纯化方法包括硅胶柱层析、离心管基质层析等。

下面详细介绍三种常用的RNA提取方法:1. 酚-氯仿法这种方法可用于组织和细胞的RNA提取。

首先使用酚将细胞或组织破碎,然后加入等体积的氯仿,混匀,使DNA和蛋白质沉淀于底部,RNA在上层水相中得到富集。

再通过异丙醇沉淀,将RNA分离出来。

最后,通过洗涤和纯化过程,得到高质量RNA。

酚-氯仿法是一种经济、简单和高收率的提取RNA的方法。

2. 硅胶柱纯化法该方法是一种高效、快速且高纯度的RNA提取方法,适用于多样品处理。

该方法使用硅胶柱将RNA分离,并消除DNA和酶的污染。

该方法能够从各种样本中提取高品质RNA,可用于测序、杂交和原位杂交等分子生物学应用。

3. 针头粘贴法这种方法是一种快速简单的RNA提取法,特别适用于某些免疫细胞和细胞样品。

利用针头从样品中取出细胞,将其粘贴在聚丙烯酰胺凝胶上,通过离心将RNA分配到凝胶上。

该方法提取RNA量小,但可以高度升质和纯化的RNA,是一种快速且相对简单的RNA提取方法。

总之,根据不同的实验目的,可选择适用于不同的RNA提取方法。

RNA的提取方法

RNA的提取方法

RNA的提取方法RNA提取是一项关键的实验技术,用于从生物样本中分离和纯化RNA分子。

RNA的提取方法通常包括细胞破碎、RNA的溶解和纯化。

以下是几种常见的RNA提取方法:1.酚/氯仿提取法这是一种常见且经典的RNA提取方法。

首先将样品中的细胞进行破碎,然后将细胞裂解液与等体积的酚混合,并进行振荡离心。

酚可与蛋白质结合形成上清和有机相,而RNA会在有机相中沉淀。

接下来,用氯仿去除DNA等杂质,然后将上清转移到新离心管并加入异丙醇,以沉淀RNA。

最后,通过离心将RNA沉淀物收集并洗涤,最终得到纯化的RNA。

2.硅基膜或硅树脂提取法这是一种使用硅基膜或硅树脂来纯化RNA的高效方法。

在这种方法中,首先通过物理或化学方法破坏细胞膜,然后在硅基膜或硅树脂的表面上固定RNA。

接下来,通过对固定RNA进行洗涤和去除杂质的步骤,最终得到纯化的RNA。

3.列柱纯化法这是一种使用RNA捕获柱或硅膜柱等纯化RNA的方法。

在这种方法中,首先将裂解的细胞滤液加入到柱上,并经过多次洗涤,以去除杂质。

然后,通过改变柱的条件,如pH、盐浓度等,使RNA释放出来并收集。

这种方法具有高纯度、高通量和可自动化的优点。

4.磁珠提取法磁珠提取法是一种快速、高效的RNA提取方法。

在这种方法中,首先将裂解的细胞滤液与具有亲和性RNA结合能力的磁珠混合,并经过洗涤步骤去除杂质。

然后,通过改变磁场的条件,使磁珠内的RNA释放并收集。

这种方法适用于高通量的RNA提取,具有高产率和高纯度。

5.TRIZOL法TRIZOL法是一种常用的综合性RNA提取方法。

在这种方法中,样品中的细胞先与TRIZOL试剂混合,然后加入氯仿使得细胞的核酸沉淀。

接下来,将上清转移至新的离心管中,并加入异丙醇使得RNA沉淀。

最后,通过洗涤和离心将RNA沉淀物收集并纯化。

需要注意的是,不同的RNA提取方法适用于不同类型的样本和实验需求。

选择合适的RNA提取方法对于后续实验的成功与结果的准确性至关重要。

RNA的制备及纯度的鉴定

RNA的制备及纯度的鉴定

rna技术的挑战与展望
技术瓶颈
目前rna提取和纯化仍存在技术瓶颈,需要进一步优化和改进。
数据解读
随着测序数据的爆炸式增长,如何准确解读和分析rna数据成为一 大挑战。
伦理与法律问题
随着rna技术的广泛应用,涉及伦理、隐私和法律等方面的问题也 日益突出,需要引起重视和解决。
THANKS
感谢观看
通过rna测序技术,可以全面检测生物体在不同生理或病理条件下基因的表达水平,揭示基因表达的 差异和规律。
转录组学研究
rna测序可用于转录组学研究,分析特定组织或细胞类型中所有基因的表达情况,有助于深入了解生 命活动的调控机制。
蛋白质合成研究
翻译调控
rna是蛋白质翻译的直接模板,通过研究rna的结构和修饰,可以了解蛋白质合成的调 控机制,进一步探索生命活动的奥秘。
详细描述
在紫外光谱分析中,rna在260nm处有最大 吸收峰,而蛋白质在280nm处有最大吸收峰 。通过比较两个波长下的吸光度值,可以计 算出rna的浓度和纯度泳分析法
总结词
通过电泳分离rna片段,可以观察rna的完整性。
详细描述
纯度评估可以帮助排除其他杂质 对实验的影响,提高实验的准确 性。
02
紫外光谱分析
03
高效液相色谱
通过测量RNA在260nm和 280nm处的吸光度比值,可以评 估RNA的纯度。
高效液相色谱可以分离和检测 RNA中的各种杂质,从而评估 RNA的纯度。
04
CATALOGUE
rna的应用
基因表达分析
基因表达谱
沉淀方法
加入适量的乙醇或异丙醇,使rna从溶液中沉淀下 来。
洗涤目的
用洗涤剂和盐溶液洗涤沉淀,去除残留在rna上的 杂质和盐离子。

rna粗品如何进一步纯化

rna粗品如何进一步纯化

rna粗品如何进一步纯化纯化要求RNA样品中不应存在对酶(如逆转录酶)有抑制作用的有机溶剂和过高浓度的金属离子。

避免其它生物大分子如蛋白质、多糖和脂类分子的污染。

排除DNA分子的污染。

纯化方法及沉淀1、有机溶剂抽提法氯仿抽提:在使用RNA提取试剂进行RNA提取时,常使用氯仿进行抽提,以去除蔗糖、蛋白等杂质,并促进水相与有机相的分离,从而达到纯化RNA的目的。

沉淀:氯仿抽提RNA后,一般采用异丙醇或乙醇来沉淀水相RNA。

加入0.6倍水相体积的异丙醇或与水相等体积的异丙醇,室温沉淀20-30分钟,高速离心,可获得RNA沉淀。

洗涤沉淀:加入无RNase的75%乙醇,将RNA沉淀振荡悬浮,使RNA沉淀中的盐离子被充分溶解。

然后再离心10-30分钟,再次沉淀RNA。

离心后,小心倒掉上清(注意不要倒出RNA 沉淀),随后快速离心1-2秒,将残留在管壁上的乙醇收集到管底后,用小枪头吸净,超净台中风干1-2分钟(注意不要晾得太干,否则RNA沉淀不易溶解)。

溶解沉淀:加入适量的RNase-free ddH2O溶解RNA沉淀。

2、硅基质吸附法随着实验方法的改进,现已发展出一种采用吸附材料纯化核酸的方法。

目前较常见的有:硅基质吸附材料、阴离子交换树脂和磁珠等。

硅基质吸附材料因其具有可特异吸附核酸,使用方便、快捷,不使用有毒溶剂如苯酚、氯仿等优点,成为核酸纯化的首选。

Solarbio公司总RNA提取试剂盒就是采用硅基质吸附达到RNA分离纯化目的。

通过专一结合RNA的离心吸附柱和独特的缓冲液系统,使样品在高盐条件下与硅胶膜特异结合,而蛋白、有机溶剂等杂质不能结合到膜上而被洗脱,盐类则被含有乙醇的漂洗液洗涤,最后用RNase-free ddH2O将RNA从硅胶膜上洗脱下来。

一些特殊组织的RNA提取纤维组织:心脏/骨骼肌等纤维组织提取RNA的关键在于彻底破碎组织。

这些组织细胞密度低,单位重量的组织中RNA 含量较低,建议增加起始量。

northern blot原理

northern blot原理

northern blot原理
Northern blot是一种将RNA进行分离和检测的技术,其原理主要包括以下步骤:
1. RNA的提取:从细胞中提取RNA,通常使用酚/氯仿或商用RNA提取试剂盒等方法。

提取到的RNA应进行纯化和浓缩处理。

2. RNA的电泳分离:将RNA样品加入琼脂糖凝胶中,使用电场让RNA沿电场方向移动。

不同长度的RNA会在凝胶上形成不同的带状,即分子量较大的RNA 会在凝胶上移动较慢,分子量较小的RNA会移动较快。

3. 将RNA传递到薄膜上:使用纸、纤维素、尼龙等材料制成的薄膜来转移RNA 到薄膜上。

这个过程可以通过静电吸附、压力转移等方式完成。

4. 薄膜上的RNA固定:将RNA固定在薄膜上,通常使用紫外线辐射、烘烤或交联等方法。

5. 探针杂交:将标记有荧光物质或放射性同位素的引物探针加入到薄膜上,与特定的RNA序列匹配杂交。

6. 杂交信号检测:通过荧光显微镜、放射性探测器等设备对薄膜进行扫描,检测RNA与引物探针杂交的信号。

通过这些步骤可得到RNA表达与数量的信息,北方印迹技术被广泛应用于基因表达的研究和分析。

chap05 RNA的分离纯化.ppt

chap05 RNA的分离纯化.ppt
a 灭菌的一次性使用的塑料制品基本 上无RNA酶,可以不经预处理直接用 于制备和贮存RNA。
b 实验室用的普通玻璃器皿和塑料制 品经常有RNA酶污染,使用前必须于 180 ℃干烤8小时或更长时间(玻璃器 皿)或用氯仿冲洗(塑料制品)。
另一方法是用0.1 %焦碳酸二乙酯 (DEPC)的水溶液浸泡用于RNA的烧 杯、试管和其他用品。DEPC是RNA酶 的强烈抑制剂。
虽然这三种方法同是利用胍缓冲液以 彻底裂解细胞,但是它们在先前的步 骤中,即如何加工组织或是在如何裂 解的过程中有所不同。
方法一:在匀浆器中加工冷冻的组织。 方法二:通过注射器加工冷冻的组织。 方法三:在液氮中将组织研磨成粉末。
将冷冻的样品放在研钵中进行剧烈研磨 以使其粉碎。当组织被磨成粉状后,向 研钵中加入变性缓冲液,并搅拌均匀。 混合物融化后应转移到合适的容器中进 行进一步的操作。在液氮中研磨组织至 粉末状,细胞的裂解则更完全,因此能 得到比前两种方法多近一倍的产量。
(3)苯酚法
苯酚法用于提纯RNA先于DNA,现仍是分离提 取RNA最好的方法,此法可以单独使用或与其 他方法结合使用,广泛用于各种RNA的提取。 根据其使用条件及与其他方法结合情况可分为
冷酚法、热酚法,皂土-酚法、去垢剂-酚法
等。
热酚法多用于植物组织及病毒RNA的 提取,主要由于这些材料细胞壁及外壳 比较坚硬,脂质较多,必须升高酚的提 取温度,才能使RNA释放出来。
由于Han的方法中要用连续少量的5 M硫 氰酸胍溶解RNA,较为繁琐。而在 Chirgwin的方法中,培养好的组织或细 胞用4M硫氰酸胍溶解,将所得的匀浆铺 在氯化铯浓溶液上。
由于RNA在氯化铯中的浮密度(1.8 g/ml)比其他细胞成分的浮力密度大 得多,在超速离心过程中rRNA和 mRNA将沉到管底。蛋白将保留在胍 基盐裂解液中而DNA悬浮在氯化铯上 层液体中。

rna提取技术的原理及应用

rna提取技术的原理及应用

RNA提取技术的原理及应用1. 简介RNA提取是从生物样本中分离纯化RNA分子的过程。

RNA具有生物信息传递和功能调控等重要功能,因此RNA提取技术在基因表达研究、生物医学研究和临床诊断等领域发挥着关键作用。

2. RNA提取的原理RNA提取技术的核心原理是通过破坏细胞膜结构,使RNA从细胞中释放出来,并利用物理、化学或生物学方法将RNA分离纯化。

2.1 细胞破碎细胞破碎是RNA提取的第一步,常用的方法有机械破碎、化学破碎和酶解。

•机械破碎:通过高速离心、超声波或搅拌破碎等方法破坏细胞膜结构,释放RNA。

•化学破碎:使用离子表面活性剂、蛋白酶K等化学物质破坏细胞膜,使RNA释放。

•酶解:使用RNase酶破坏细胞膜,使RNA释放。

2.2 RNA分离纯化细胞破碎后,需要将RNA分离出来并纯化。

常用的方法有酚/氯仿法、硅胶柱层析法和磁珠法。

•酚/氯仿法:利用酚在碱性条件下与DNA结合并形成两相体系,RNA 在上层水相,DNA在下层有机相,通过酚/氯仿分离纯化RNA。

•硅胶柱层析法:利用硅胶作为固相吸附材料,使RNA与DNA、蛋白质等物质分离,然后通过洗脱和洗涤步骤来纯化RNA。

•磁珠法:利用磁珠的表面修饰物与RNA的亲和性,通过磁场作用将磁珠与RNA结合,然后通过洗涤和洗脱步骤来纯化RNA。

3. RNA提取方法的选择选择合适的RNA提取方法是根据样本类型、研究目的和实验条件等因素综合考虑的。

•样本类型:不同样本类型的细胞或组织含有不同类型和含量的RNA,需要选择适合的RNA提取方法。

•研究目的:不同研究目的对RNA质量和纯度的要求不同,需要选择适合的RNA提取方法满足研究需求。

•实验条件:实验设备、试剂成本和操作难易度等因素也会影响RNA 提取方法的选择。

4. RNA提取技术的应用4.1 基因表达研究RNA提取是基因表达研究的基础步骤之一。

通过提取不同组织或细胞中的RNA,可以对基因表达进行定量分析,研究基因在不同条件下的转录水平变化,寻找差异表达基因,并进一步探究其功能。

纯化rna的原理

纯化rna的原理

纯化rna的原理纯化RNA是一种用于分离和纯化RNA分子的实验技术。

其原理主要基于RNA分子与其他组分(如DNA、蛋白质等)的不同化学或物理特性,通过选择性地去除杂质,从而获得高纯度的RNA样品。

以下是常用的纯化RNA的方法及其原理:1. 次氯酸盐氰胺纤维素柱(CTAB)法:该方法适用于从植物或真菌中纯化RNA。

次氯酸盐(如氯胺T)可以沉淀DNA,而胞外多糖(如CTAB)可以结合蛋白质,从而从混合物中去除这些杂质。

接下来,使用异丙醇或氯仿等有机溶剂使RNA 溶解,然后通过醇沉淀法浓缩纯化RNA。

2. 聚丙烯酰胺凝胶电泳法:该方法利用RNA分子在电场中的迁移速度差异,将RNA分子从其他分子中分离出来。

首先,将RNA样品经过选择性沉淀或纯化步骤,使其成为单一的RNA分子。

然后将RNA样品加载到聚丙烯酰胺凝胶电泳胶槽中,经过电泳过程,RNA分子根据其长度和电荷迁移至不同的位置,从而实现分离和纯化。

3. 超滤法:该方法利用纳滤膜的孔径大小选择性地分离RNA 分子。

在超滤过程中,将混合物通过纳滤膜,小分子及水分子通过膜孔,而大分子如RNA则被滞留在膜上。

通过该方法,可以快速分离和浓缩RNA样品。

4. 碱性酚/氯仿提取法:该方法是分离RNA和DNA的经典方法之一。

在碱性条件下,RNA分子会被水解成碱性核酸盐(如RNA酸盐),而DNA分子则稳定存在。

随后,将膏状混合物经氯仿提取,使RNA分子溶解在水相,而DNA则溶解在有机相中。

进一步利用醇沉淀法可将RNA分子从水相中纯化出来。

5. 商业化RNA纯化试剂盒:目前市场上有多种商业化RNA纯化试剂盒可供选择。

这些试剂盒利用多种技术,如硅胶柱层析、磁珠吸附和离心膜等,以实现RNA的选择性富集和纯化。

综上所述,通过以上不同的方法,可以根据实验需求和样品类型选择适合的纯化RNA方法,以获得高质量和纯度的RNA。

提取rna有哪些方法

提取rna有哪些方法

提取rna有哪些方法
提取RNA的方法有以下几种:
1. 酚/氯仿提取法:加入酚溶液和氯仿,使细胞裂解,并使RNA萃取至有机相中。

然后使用异丙醇和盐沉淀RNA,最后用乙醇洗涤和脱水。

2. 链霉亲和纯化法:利用链霉素结合特定序列(例如poly A序列)的能力,通过链霉素磁珠或石蜡树脂来纯化多聚A尾的mRNA。

3. 柱层析法:使用离子交换柱、凝胶层析柱或亲和层析柱(例如,根据RNA与硅胶柱或根据RNA酶的抗体选择性地结合)来分离和纯化RNA。

4. 总RNA提取法:将细胞或组织裂解,使用一种提取试剂(如TRIzol试剂)来提取总RNA。

总RNA中包含mRNA、rRNA和tRNA等各种类型的RNA。

5. 过滤提取法:通过使用尺寸排除膜或滤波器来去除细胞碎片和DNA,然后使用过滤盘或纤维膜纯化RNA。

需要根据实验需求和样品性质选择适合的RNA提取方法。

酚氯仿纯化rna步骤

酚氯仿纯化rna步骤

酚氯仿纯化rna步骤摘要:1.酚氯仿纯化RNA 的背景和原理2.酚氯仿纯化RNA 的主要步骤3.酚氯仿纯化RNA 的注意事项4.酚氯仿纯化RNA 的优点和局限性5.结论正文:一、酚氯仿纯化RNA 的背景和原理在生物实验中,RNA 提取和纯化是常见的实验步骤,其中酚氯仿纯化RNA 是一种经典的方法。

这种方法主要利用酚和氯仿对RNA 的亲和力,将RNA 从细胞或组织中分离出来。

下面我们将详细介绍酚氯仿纯化RNA 的步骤和原理。

二、酚氯仿纯化RNA 的主要步骤1.将细胞或组织放入离心管中,加入适量的酚氯仿,进行震荡混匀。

2.将离心管放入离心机中,进行离心操作,离心速度和时间根据实验需求进行调整。

3.取出离心管,弃去下层沉淀物,上层液体即为纯化的RNA。

4.为了确保RNA 的纯度,可以对纯化的RNA 进行再次离心,取上层清液即为较纯的RNA。

三、酚氯仿纯化RNA 的注意事项1.在实验过程中,需要避免RNA 降解,因此操作要迅速,避免长时间暴露在酚氯仿中。

2.离心操作时要注意离心速度和时间的选择,以免对RNA 造成不必要的损伤。

3.纯化RNA 时,要避免使用含有RNA 酶的试剂,以免对RNA 造成降解。

四、酚氯仿纯化RNA 的优点和局限性优点:1.酚氯仿纯化RNA 的方法操作简单,容易上手。

2.可以有效地从细胞或组织中分离出RNA,具有较高的纯度。

3.对实验人员和实验环境要求较低,可以在一般的实验室条件下完成。

局限性:1.酚氯仿是一种有毒化学品,实验过程中需要注意安全防护。

2.纯化过程较耗时,特别是需要处理大量样本时。

3.纯化效果受到实验操作和实验条件的影响较大,需要积累一定的实验经验。

五、结论酚氯仿纯化RNA 是一种经典且有效的方法,适用于对RNA 提取和纯化需求较高的实验。

rna提取原理

rna提取原理

rna提取原理
RNA提取原理是一种用于从生物样本中分离出RNA的方法。

RNA
是负责将DNA信息传递到蛋白质合成过程中的重要分子。

因此,对RNA进行提取和分析对于研究基因表达和调控等方面具有重要的意义。

RNA提取的基本原理是利用不同物质的化学性质对RNA进行分离。

一般而言,RNA提取需要经过以下步骤:
1. 细胞破碎:将细胞或组织破碎,使RNA释放到溶液中。

2. 样本处理:对样本进行处理,如添加蛋白酶等,以消化细胞
壁和细胞膜,并去除DNA和蛋白质等杂质。

3. 提取RNA:利用化学物质的特性,如酚/氯仿、异丙醇、醋酸等,将RNA从样本中提取出来。

4. 纯化RNA:样本中还可能存在着RNA的分解产物和其他杂质,需要进行RNA的纯化,以获得高质量的RNA。

5. 检测RNA:利用吸光度、琼脂糖凝胶电泳、荧光标记等方法
检测RNA的含量和质量。

RNA提取的方法和步骤可能会因不同的样本类型和实验目的而略有不同。

例如,对于高脂肪组织,可能需要使用酚/异丙醇/EDTA混
合液进行RNA提取,而对于血液样本,可能需要使用商业化的RNA提取试剂盒。

总之,RNA提取是研究基因表达和调控等方面必不可少的一个步骤,其原理是基于化学物质的特性对RNA进行分离和纯化。

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8/15/2016
4、密度梯度离心
• 用胍盐/氯化铯将细胞抽提物进行密度 梯度离心。蛋白质密度<1.33g/cm3在最 上层。DNA密度在1.71g/cm3左右,位 于中间。RNA密度>1.89g/cm3,沉在底部。 用此方法可制备较大量纯度的天然RNA
8/15/2016
结果分析
• 分光光度法测260nm和280nm下OD 值 • Northern-Bolt杂交 • 1)甲醛-琼脂糖凝胶电泳 • 2)聚丙烯酰胺凝胶电泳 • RT-PCR检测
8/15/2016
异硫氰酸胍—酚法提取植物组织总RNA
1) 取2g左右植物组织放入研钵中,反复加入液氮充分研磨至粉末 状。加4-5mL异硫氰酸胍溶液。转移到小离心管中,每管0.5mL。 2) 置于冰上,顺序加入:50μl 2mol/L NaAc , 混匀,0.5mL水饱和酚, 170μl CI,混匀。置冰上15min。 3) 各管平衡后,4℃,12 000g离心20-30min。转移上清到另一管中, 加入等体积的异丙醇,混匀,-20℃沉淀30min-1hr或-80℃沉 淀10min。4℃,12 000g离心20min回收RNA。 4) 用70%乙醇洗一次,4℃,12 000g离心5min。吸去乙醇,空气中 吹干RNA沉淀。用150μl 异硫氰酸胍溶液,65℃吹打RNA沉淀溶解。
8/15/2016
试验流程图
细胞
氯仿 水相
细胞选择
纯化 RNA 基因组DNA
离心
贴壁细胞 悬浮细胞
加入裂解液 (TRNzol-A+)
有机相
pH5.7
8/15/2016
3、苯酚法
• 细胞内大部分RNA 均与蛋白质结合在一起, 以核蛋白的形式存在。因此,提取RNA时要 把RNA与蛋白质分离并除去。将细胞置于含 有十二烷基磺酸钠(Sodium dodecyl sulfate,SDS)的缓冲液中,加等体积水饱 和酚,通过剧裂振荡,然后离心形成上层 水相和下层酚相。核或者在两相 界面处形成凝胶层。 • 苯酚法提取酵母RNA
8/15/2016
2、TRIzol法
• TRIZOL试剂是直接从细胞或组织中提取总 RNA的试剂。它在破碎和溶解细胞时能保持 RNA的完整性。加入氯仿后离心,样品分成 水样层和有机层。RNA存在于水样层中。收 集上面的的水样层后,RNA可以通过异丙醇 沉淀来还原。在除去水样层后,样品中的 DNA和蛋白也能相继以沉淀的方式还原。乙 醇沉淀能析出中间层的DNA,在有机层中加 入异丙醇能沉淀出蛋白。共纯化DNA对于样 品间标准化RNA的产量十分有用。
8/15/2016
RNA的分类
• 信使RNA(messengerRNA,mRNA)mRNA是合 成蛋白质的模板,按照细胞核中的DNA所转录; • 转移RNA(transferRNA,tRNA)tRNA是mRNA上 碱基序列(即遗传密码子)的识别者和氨基酸 的转运者; • 核糖体RNA(ribosomalRNA,rRNA)rRNA是组 成核糖体的组分,是蛋白质合成的工作场所。 • 微小RNA(microRNA,miRNA)内源性的具有调 控功能的非编码RNA
RNA的分离纯化技术
第四组
【实验目的】
1.了解RNA分子的种类、分布及其 结构特点 2.掌握总RNA提取的基本原理和实 验方法 3.掌握总RNA浓度检测的方法 4.掌握总RNA完整性检测的方法
8/15/2016
主要内容
• • • • RNA的概述 分离RNA的意义 总RNA的分离与纯化 结果分析
8/15/2016
8/15/2016
8/15/2016
5) 加等体积异丙醇-20℃沉淀30min-1hr或-80℃沉 淀10min。4℃,12 000g离心20min回收RNA。 6) 用70%乙醇洗两次后,吹干溶于适量的DEPC-H2O 中。部分分装后进行纯度及完整性的检测。其余加 2.5倍体积乙醇沉淀于-80℃冰箱中存放。 7) 紫外分光光度分析纯度和含量,甲醛变性琼脂糖 凝胶电泳分析完整性。
异硫氰酸胍—酚法提取RNA的原理如下: GIT与β-巯基乙醇共同作用抑制RNase的活 性;GIT与 十二烷基肌氨酸钠 (Sarcosyl) 作用使蛋白质变性,从而释放RNA;酸性条 件下DNA极少发生解离,同蛋白质一起变性 被离心下来,RNA则溶于上清中。该法所提 RNA纯度高完整性好较A(Ribonucleic Acid)的概述
存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。 由至少几十个核糖核苷酸通过磷酸二酯键连接而成的一类 核酸,因含核糖而得名,简称RNA。RNA普遍存在于动物、 植物、微生物及某些病毒和噬菌体内。RNA和蛋白质生物 合成有密切的关系。在RNA病毒和噬菌体内,RNA是遗传 信息的载体。 RNA一般是单链线形分子;也有双链的如呼肠孤病毒RNA; 环状单链的如类病毒RNA
8/15/2016
分离RNA的意义
进行完整的RNA的提取和纯化是进行 RNA方面研究工作的基本前提,如 Northern杂交、mRNA分离、RT-PCR、 基因表达水平检测、cDNA合成及体外 转录和翻译等实验均需要首先得到高 质量的RNA样品。
8/15/2016
总RNA的分离
1、异硫氰酸胍—酚法
8/15/2016
RNA制备的条件与环境
• 为防止RNase对RNA 的水解,一要全 力避免细胞外RNase的污染并抑制其 活性,二要尽快地抑制细胞内RNase 的活性并极力地去除RNase。对广泛 存在的细胞外RNase,应在RNA制备 的全过程中保持高度的警惕,并采 取严格的措施以避免其污染和抑制 其活性。
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