4.肿瘤的遗传变异和表观遗传调控异常 Genetic and Epigenetic Variations in Cancer_sj_181211
肿瘤遗传知识点总结
肿瘤遗传知识点总结一、肿瘤的遗传基础肿瘤的遗传基础主要包括三个层面的遗传变异：基因型、表观基因型和全基因组。
1. 基因型：即细胞核内基因组的遗传信息。
基因型的遗传变异包括基因突变、基因重排、基因扩增和基因缺失等。
这些遗传变异可能导致染色体异常、蛋白质功能失调、细胞增殖异常等，最终导致肿瘤的发生。
2. 表观基因型：即影响基因表达的遗传修饰。
表观基因型的遗传变异包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA调控等。
这些遗传变异可能导致基因的表达异常，改变细胞的生物学功能，从而促进肿瘤的发生。
3. 全基因组：即细胞内全部基因组的遗传信息。
全基因组的遗传变异包括染色体数目异常、染色体结构异常和整个基因组的遗传异常等。
这些遗传变异可能导致基因组稳定性的失调，促进肿瘤的发生。
以上三个层面的遗传变异共同构成了肿瘤的遗传基础。
理解和揭示这些遗传变异的发生和发展机制，对于预防和治疗肿瘤具有重要意义。
二、遗传突变的发生和发展机制遗传突变是指在细胞分裂和增殖过程中，细胞的遗传信息发生变异，导致基因型、表观基因型和全基因组的遗传异常。
遗传突变的发生和发展机制主要包括以下几个方面。
1. DNA复制错误：DNA的复制是细胞增殖的必要过程，但在复制过程中会产生错误。
这些错误可能导致基因组的遗传变异，促进肿瘤的发生。
2. DNA修复失调：细胞内有多种DNA修复机制，可以帮助细胞修复DNA损伤。
但当这些修复机制出现失调时，会导致DNA的遗传变异，从而促进肿瘤的发生。
3. 病毒、化学物质和辐射的影响：病毒的侵染、化学物质的暴露和辐射的作用，都可能导致细胞的遗传信息发生变异，从而促进肿瘤的发生。
4. 遗传易感性：个体的遗传易感性是影响遗传突变发生和发展的重要因素。
一些基因型和表观基因型的遗传变异，会增加个体对于遗传突变的易感性，从而促进肿瘤的发生。
以上几个方面共同影响了遗传突变的发生和发展。
对于这些机制的深入了解，有助于找到抑制肿瘤遗传突变的方法，从而预防和治疗肿瘤。
肿瘤生物标志物在肿瘤个性化治疗中的意义
肿瘤生物标志物在肿瘤个性化治疗中的意义肿瘤严重危害人类健康，肿瘤生物标志物在个性化治疗过程中可用于肿瘤早期筛查，临床分期与肿瘤诊断，判断预后、治疗监测和疗效判断，也可作为治疗预测及肿瘤治疗的靶点，提高治疗针对性从而提高肿瘤治愈率，减少患者不必要的痛苦。
本研究主要对肿瘤生物标志物的分类、主要检测方法及其在肿瘤个性化治疗和肿瘤靶向性治疗中的作用进行综述。
[Abstract] Targeted cancer therapy has been popular in tumor personalized treatment recent years. Tumor BioMarker can provide direct drug targets and be the target of RNA interference therapy，and we can screen the tumor-specific promoter from them. So they can be used to improve the accuracy and the efficiency of cancer therapy, reduce patients’ unnecessary pain. This review focuses on the significance of tumor biomarker in targeted cancer therapy.[Key words] Tumor Biomarker;Personalizing therapy;RNA interference;Targeted therapy肿瘤是严重危害人类健康的一种常见病，恶性肿瘤的死亡率也一直呈上升趋势。
由于肿瘤的异质性及患者个体差异，如果简单采取同一方法就容易产生治疗不当或治疗过度的问题，因此针对每一个患者的不同情况，采用“个性化”治疗就显得十分必要。
表观遗传学在肿瘤发生和进展中的作用
表观遗传学在肿瘤发生和进展中的作用表观遗传学（epigenetics）是一门研究基因表达和细胞命运调控的学科，它通过研究遗传物质之外细胞内部和外部环境对基因表达的调控机制，揭示了基因的表达是如何受到环境因素的影响。
近年来，随着先进技术的发展，我们对于表观遗传学在肿瘤发生和进展中的作用有了更深入的理解。
肿瘤是一类恶性疾病，其发生和进展的机制非常复杂，涉及许多遗传和表观遗传因素。
传统上，研究人员主要关注肿瘤发生和发展的遗传突变，如基因突变、染色体异常等。
然而，近年来的研究表明，表观遗传调控也在肿瘤的发生和进展中发挥着重要作用。
表观遗传调控主要涉及DNA甲基化和组蛋白修饰两种机制。
DNA甲基化是指在DNA分子中加入甲基基团，通过甲基化酶对基因组DNA进行甲基化修饰。
DNA甲基化在细胞命运决定、基因沉默、基因转录调控等方面发挥着重要作用。
在肿瘤中，DNA甲基化异常是常见现象。
许多肿瘤相关的基因和DNA修复机制的基因在肿瘤中发生异常的DNA甲基化，从而导致基因的异常表达，甚至基因沉默，进而促进肿瘤的发生和进展。
组蛋白修饰是另一种重要的表观遗传调控机制。
组蛋白是细胞核中最主要的蛋白质组分，可以通过翻译调节基因的转录活性。
组蛋白修饰包括甲基化、乙酰化、泛素化等，其中乙酰化修饰是最为常见的一种形式。
组蛋白乙酰化修饰能够促进染色质结构的松弛，改变 DNA的可及性，从而影响基因的转录活性。
在肿瘤中，许多组蛋白修饰酶的异常表达或功能缺陷与肿瘤的发生和进展密切相关。
例如，组蛋白乙酰转移酶P300的缺失会导致肿瘤抑制基因的沉默，从而促进肿瘤的发生。
此外，表观遗传修饰与肿瘤干细胞的特性也密切相关。
肿瘤干细胞是肿瘤中的一小部分细胞群体，具有自我更新和多向分化的能力。
它们在肿瘤的发生、重复和治疗抵抗中起着关键作用。
表观遗传调控能够改变肿瘤干细胞的命运调控途径和细胞命运标记物的表达，从而影响肿瘤干细胞的自我更新和分化能力。
研究发现，许多组蛋白修饰因子和 DNA 甲基化酶在调控肿瘤干细胞命运中发挥着重要作用。
肿瘤表观遗传学
组蛋白修饰在肿瘤中的研究主要包括：探究 组蛋白修饰在肿瘤中的特征和规律，探究组 蛋白修饰与肿瘤发生、发展、转移和耐药等 过程的关系，以及寻找可作为肿瘤诊断和疗
效评估的组蛋白修饰标志物。
03
肿瘤表观遗传学与肿瘤发 生发展的关系
表观遗传学变化与肿瘤细胞增殖
表观遗传学变化是指基因表达的改变，而非基因序列 的改变。这些变化可以通过甲基化、乙酰化、磷酸化 等修饰方式影响基因的表达，进而影响细胞的功能。 在肿瘤发生发展过程中，表观遗传学变化可以调控肿 瘤细胞的增殖过程。例如，某些基因的甲基化状态改 变可以影响其表达水平，进而影响细胞增殖的速度和 程度。
VS
基因组印记在肿瘤中的研究主要包括： 探究基因组印记与肿瘤发生、发展、 转移和耐药等过程的关系，以及寻找 可作为肿瘤诊断和疗效评估的印记标 志物。
非编码RNA
非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA分子，包括miRNA、lncRNA等。非编码RNA在表观遗传学中扮演重要角色，参与基因 表达的调控，并与肿瘤的发生和发展密切相关。
04
肿瘤表观遗传学的治疗策 略与药物研发
表观遗传学治疗策略
靶向DNA甲基化
通过抑制DNA甲基转移酶或激活 去甲基化酶，调节基因表达，抑 制肿瘤生长。
靶向组蛋白修饰
通过抑制组蛋白乙酰化酶或组蛋 白甲基化酶，改变染色质构象， 抑制肿瘤细胞增殖。
靶向非编码RNA
通过调控miRNA、lncRNA等非 编码RNA的表达，调节基因表达， 抑制肿瘤进展。
非编码RNA在肿瘤中的研究主要包括：探究非编码RNA在肿瘤中的表达特征和规律，探究非编码RNA与肿瘤发生、发展、转 移和耐药等过程的关系，以及寻找可作为肿瘤诊断、预后和疗效评估的非编码RNA标志物。
病理与免疫组化复习重点
A：闭卷内容：1、CSC（肿瘤干细胞）与正常干细胞的共性是什么？答：①、相对静止—休眠。
②、抗药性。
③、抗凋亡。
④、具有更高的促血管生产能力。
⑤、表达某些趋化因子受体（XCR4），有利于细胞归巢。
2、肿瘤标志的概念、分类？答：肿瘤标志物是指由肿瘤细胞由肿瘤组织和细胞产生的与肿瘤的形成、发生相关的物质，这些物质存在于肿瘤细胞的胞核、胞质、胞膜上或体液中，进入到血液或其他体液或组织中，或是宿主对体内新生物反应而产生并进入到血液或体液或组织中而含量明显高于正常参考值的一类生物活性物质。
不存在于正常成人组织而见于胚胎组织,或在肿瘤组织中含量超过正常含量。
肿瘤标志物分类：（1）肿瘤抗原（2）糖类抗原（3）酶和同工酶（4）激素和异位激素（5）蛋白类角蛋白(Keratin上皮来源肿瘤)（6）肿瘤相关病毒（7）癌基因、抑癌基因及其产物3、几种重要的肿瘤标志物有哪些？答：（1）甲胎蛋白（AFP）（2）癌胚抗原（CEA）（3）血清β2微球蛋白（β2 -MG）（4）血清铁蛋白（SF）（5）前列腺酸性磷酸酶（PAP）和前列腺特异抗原（PSA）（6）人绒毛膜促性腺激素（HCG）（7）神经特异性烯醇化酶（NSE）（8）细胞角蛋白相关TM （9）鳞状上皮癌相关抗原（SCCA）（10）胃蛋白酶原Ⅰ、Ⅱ（PGI、II）（11）糖类抗原(CA)（12）生长激素（HGH）（13）其他组织多肽抗原（TPA）、组织多肽特异性抗原（TPS）、膀胱癌抗原（UBC）4、肿瘤标志物检测方法有哪些？答：（1）、血清学水平。
（除传统的放射免疫分析（RIA）和酶联免疫分析（ELISA）外，目前在国内主要有三类全自动免疫化学分析系统（化学发光免疫分析系统；荧光免疫分析系统和电化学发光免疫分析系统）广泛的应用于临床，对血清肿瘤标记物检测具有快速、准确、半定量。
可检测AFP、CEA、CA19-9、CA72-4、CA125、CA15-3、NSE、Cyfra21-1、PSA、f- PSA等。
肿瘤的发生与发展机制
肿瘤的发生与发展机制一、肿瘤的发生机制肿瘤是一种由于体内细胞发生异常而失去正常生长调控机制的疾病。
它可以通过多种方式发生，包括遗传突变、表观遗传改变、DNA修复能力损害等。
在肿瘤的发展过程中，细胞逃脱了正常细胞凋亡和增殖机制的调控，从而导致不受约束的细胞分裂和扩散。
1. 遗传突变与癌症遗传突变是指基因组DNA序列的永久性改变，它可能导致基因功能的丧失或增强。
遗传突变在肿瘤发生和发展中起着重要作用。
例如，某些人群携带特定的突变体，在遭受特定环境因素刺激后更容易罹患某种类型的癌症。
这些突变可能会累积并导致正常细胞转化为恶性肿瘤细胞。
2. 表观遗传改变与癌症除了DNA序列上的突变外，表观遗传改变也是肿瘤发生的重要机制。
表观遗传改变是指影响基因表达而不涉及DNA序列改变的细胞遗传学变化，如DNA甲基化和组蛋白修饰。
这些修饰可以通过改变染色质结构和功能来调节基因表达，并对肿瘤形成起着关键作用。
3. DNA修复能力损害与癌症DNA修复系统是保持基因组完整性的重要机制，它能够纠正DNA中的错误或损伤。
当DNA修复系统发生损伤或缺陷时，细胞将面临累积的突变风险，从而增加癌症发生的可能性。
例如，BRCA1、BRCA2等基因在DNA双链断裂修复中发挥重要作用，其突变会显著增加乳腺和卵巢癌发生的风险。
二、肿瘤的发展机制肿瘤的发展是一个多步骤、多基因参与的过程。
正常细胞逐渐积累了一系列突变，从而失去了对分裂、凋亡、血管生成和免疫反应等过程的调控。
1. 细胞周期调控失衡肿瘤细胞往往存在细胞周期调控失衡的问题。
例如，癌细胞可能会进入无限增殖状态或逃脱正常细胞周期停滞检查点，从而形成快速生长的肿瘤。
2. 不受约束的增殖和分化正常细胞在一定条件下进行有序的增殖和分化。
但是，在肿瘤发展过程中，这种有序调控被破坏，细胞逃脱了对增殖和分化的约束。
结果导致肿瘤细胞无限制地增殖并失去其特定功能。
3. 血管生成促进肿瘤需要大量营养物质和氧气来支持不断增长的细胞群体。
表观遗传学&基因与基因组学
第十三章 表观遗传学第一节 概 述基因的表达相同的基因型不同的表型：一．表观遗传学(epigenetic)DNA的序列不发生变化、基因表达改变、并且这种改变可稳定遗传。
二．表观遗传学研究的内容：1.基因选择性转录、表达的调控。
2.基因转录后调控。
(表观遗传通常被定义为DNA的序列不发生变化但是基因表达却发生了可遗传的改变，也就是说基因型未变化而表型却发生了改变，这种变化是细胞内除了遗传信息以外的其他可遗传物质的改变，并且这种改变在发育和细胞增殖的过程中能稳定的传递下去。
表观遗传学研究内容具体来说主要包括DNA甲基化表观遗传、染色质表观遗传、表观遗传基因表达调控、表观遗传基因沉默、细菌的限制性基因修饰等。
从更加广泛的意义上来说，DNA甲基化、组蛋白甲基化和乙酰化、基因沉默、基因组印记、染色质重塑、RNA剪接、RNA编辑、RNA干扰、x染色体失活等等都可以归入表观遗传学的范畴，而其中任何一个过程的异常都将影响基因结构以及基因表达，导致某些复杂综合症、多因素疾病或癌症。
) 三．表观遗传修饰从多个水平上调控基因表达：1.RNA水平：非编码RNA可通过某些机制实现对基因转录以及转录后的调控，例如microRNA、RNA干扰等2.蛋白质水平：通过对蛋白质的修饰或改变其构象实现对基因表达的调控，例如组蛋白修饰3.染色质水平：通过染色质位置、结构的变化实现对基因表达的调控，例如染色质重塑以上几个水平之间相互关联，任何一方面的异常都将影响染色质结构和基因表达。
四．表观遗传学的研究意义：1.表观遗传学补充了“中心法则”所忽略的两个问题，即哪些因素决定了基因的正常转录和翻译以及核酸并不是存储遗传信息的唯一载体。
2.表观遗传信息可以通过控制基因的表达时间、空间和方式来调控各种生理反应。
所以许多用DNA序列不能解释的现象都能够找到答案。
3.与DNA序列的改变不同，许多表观遗传的改变是可逆的，这使表观遗传疾病的治愈成为可能。
病理学练习题——肿瘤
肿瘤一、名词解释1. 副肿瘤综合征（paraneoplastic syndrome）:由于肿瘤的产物（包括异位激素产生）或异常免疫反应（包括交叉免疫、自身免疫和免疫复合物沉着等）或其他不明原因，可引起内分泌、神经、消化、造血、骨关节、肾脏及皮肤等系统发生病变，出现相应的临床表现。
这些表现不是由原发肿瘤或转移灶直接引起的，而是通过产生某些物质间接引起的。
2. 交界性肿瘤（borderline tumor）：组织学形态和生物学行为介于良性、恶性之间的某些肿瘤，称为交界性肿瘤。
3. 肿瘤演进（progression）：转化细胞变成为肿瘤需要一个发展过程。
在转化过程中瘤细胞不断分裂，倍增时间缩短，恶性程度增加和发生扩散。
这个生物学现象称为肿瘤演进。
4. 肿瘤的异质性(heterogeneity)：指单克隆来源的肿瘤细胞在生长过程中形成在侵袭力、生长速度、对激素的反应、对抗癌药的敏感性方面有所不同的亚克隆的过程，称为异质化；这具有不同生物学特性的瘤细胞群体称为肿瘤异质性。
5．异型性：肿瘤与正常组织在形态和功能上有相似之处，也有不相似之处即差异，这种差异称为异型性。
6．肿瘤实质和间质：肿瘤实质是肿瘤细胞的总称，是肿瘤的主要成分。
肿瘤间质一般由结缔组织和血管组成，有时还可在淋巴管。
7．原位癌：局限于上皮内的癌，尚未突破基膜而向下浸润生长者。
二、选择题【A型题】1．癌与肉瘤的最主要区别是A．瘤细胞的分布方式不同B．发生的年龄不同C．肿瘤内血管多少不同D．转移的途径不同E．组织来源不同2.下列说法正确的是：A．肿瘤通常为多发B．肿瘤通常大小较一致C．肿瘤只有在显微镜下才可诊断D．肿瘤的大小与肿瘤的性质和发生部位等有关E．黑色素瘤通常不发生转移3.下列肿瘤组成相同的是：A. 绒毛膜癌与乳腺浸润性导管癌B. 绒毛膜癌与基底细胞癌C. 绒毛膜癌与白血病D. 淋巴瘤与Ewing氏瘤E. 粒细胞性白血病与脂肪肉瘤4．下列哪项不是决定肿瘤生长快慢的因素：A.肿瘤生长分数B.肿瘤倍增时间C.肿瘤生成与丢失D.肿瘤血管形成E.肿瘤组织来源5. 关于转移的说法正确的是：A. 肺癌易转移到骨B. 甲状腺癌易转移到肺C. 乳腺癌易转移到脾D. 肾癌易转移到肝E. 前列腺癌易转移至骨6. 我国常见的10大恶性肿瘤按死亡率排列位于第三位的是：A. 肺癌B. 胃癌C. 肝癌D. 乳腺癌E. 鼻咽癌7. 肿瘤性增生与非肿瘤性增生的根本区别是：A. 有核分裂象B. 有纤维母细胞，炎症细胞浸润C. 有肿块形成D. 细胞不同程度失去了分化能力E. 生长迅速8. 良性肿瘤的异型性主要是：A. 细胞形态与组织结构均没有异型性B. 细胞形态异型性为主C. 组织结构异型性为主D. 细胞形态与组织结构均有异形性E. 以上都不是9. 下列说法正确的是：A. 张力原纤维提示平滑肌来源肿瘤B. 肌微丝提示鳞状细胞来源肿瘤C. 波形蛋白为间叶组织标志D. 细胞角蛋白为间叶组织来源肿瘤标志E. 以上都不是10. 血道转移的确切根据是A. 血液中发现了瘤细胞B. 在远隔器官形成了与原发瘤同样类型的肿瘤C. 瘤细胞栓塞于远隔器官D. 瘤细胞进入了静脉E. 瘤细胞进入了动脉11. 关于良恶性肿瘤说法正确的是：A. 良性肿瘤患者可出现恶病质B. 恶性肿瘤主要浸润破坏组织，一般没有压迫和阻塞症状C. 良性肿瘤因浸润而产生压迫和阻塞症状D. 恶性肿瘤也可有压迫和阻塞等良性肿瘤的症状E. 以上都不是12. 交界性肿瘤是A. 混合性肿瘤B. 介乎于肿瘤与非肿瘤之间的肿块组织C. 癌前病变D. 性质介于良、恶性之间的肿瘤E. 分化好的恶性瘤13. 肿瘤的异质化是指：A. 一种肿瘤转变为另一种性质的肿瘤B. 肿瘤细胞生长过程中形成新的亚克隆过程C. 肿瘤变得越来越恶性过程D. 恶性肿瘤变的良性化过程E. 以上都不对14. 哪一种酶与肿瘤转移无关A. 尿激酶型纤溶酶原激活物B. MMPC. 组织蛋白酶D. 粘蛋白酶E. 以上都不是15. 分泌MMP的细胞除了A. 纤维母细胞B. 中性粒细胞C. 淋巴细胞D. 巨噬细胞E. 滋养层细胞16．恶性肿瘤易坏死的原因不包括：A. 肿瘤细胞生长速度快B. 肿瘤血流异常C. 与某些细胞因子有关D. 肿瘤本身容易凋亡E. 肿瘤组织间流体静压较高17. 关于肿瘤血管生成因子的特点：A. 来源于肿瘤细胞，不同肿瘤血管生成因子不同B. 存在于细胞间C. 由于结构复杂，还不能用人工方法合成血管生成因子D. 机理是促进血管外皮细胞的分裂和刺激毛细血管的生长E. 一般作用于体内毛细血管和小静脉。
表观遗传与表观遗传学
1、表观遗传与表观遗传学表观遗传学（epigenetics）研究不涉及DNA序列改变的基因表达和调控的可遗传变化，研究从基因演绎为表型的过程和机制，是一门新兴的遗传学分支。
研究不涉及DNA序列改变的基因表达和调控的可遗传修饰，即探索从基因演绎为表型的过程和机制。
（刘署东等，遗传学）2.表观遗传现象1：遗传物质+环境共同影响表型表观遗传现象2：单等位基因表达异常影响表型表观遗传现象3：环境影响表型表观遗传现象4：特定基因时空表达影响细胞重编程表观遗传现象5：高度终末分化细胞的逆向重编程表观遗传现象6：表观遗传与肿瘤密切相关4、表观遗传学的特点、研究内容和机制真核基因的表达调控非常复杂，受细胞和内、外多层次的调节，呈现多级调控。
概括地说，主要包括遗传调控（genetic regulation）和表观遗传调控（epigeneitcregulation）。
其中，表观遗传调控，又被称为染色质为基础的基因表达调控。
（1）表观遗传学的特点：可遗传的，即这类改变通过有丝分裂或减数分裂，能在细胞或个体世代间遗传；可逆性的基因表达调节，也有较少的学者描述为基因活性或功能的改变；没有DNA序列的改变或不能用DNA序列变化来解释。
1、DNA甲基化定义：DNA甲基化是指在DNA复制后在甲基化转移酶（DNMTs)的催化下，以S-腺苷甲硫氨酸（SAM）为甲基供体，将甲基集团连接到DNA分子的腺嘌呤或胞嘧啶碱基上，进行DNA修饰的过程。
在哺乳动物中，大于60%的基因启动子区存在CpG岛；大多数的CpG岛中的CpG二核酸甲基化状态一致且多数是非甲基化的，即多数的CpG岛处于非甲基化状态；CpG岛的DNA甲基化是调控基因表达的开关，一般情况下，甲基化的CpG岛与基因沉默相关，非甲基化的CpG岛与基因活化相关；由正反交实验可以看出：印迹基因的正反交结果不一致、不符合孟德尔定律。
小鼠Igf-2 基因总是母本来源的等位基因被印迹，父本来源的等位基因表达，因此是母本印迹。
肿瘤的表观遗传学研究
肿瘤的表观遗传学研究肿瘤的表观遗传学研究是近年来在肿瘤学领域中崭露头角的研究方向。
它覆盖了一系列与基因表达和染色质状态相关的修饰，包括DNA 甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等。
这些修饰可以影响基因表达，从而促进肿瘤的发生和发展。
下面将对肿瘤的表观遗传学研究进行详细介绍。
首先，我们来了解一下肿瘤的表观遗传学在肿瘤发生发展中的重要性。
肿瘤是由一系列致癌基因的异常激活和抑癌基因的失活所致。
除了基因突变之外，肿瘤细胞还出现了染色体异常、DNA甲基化和组蛋白修饰的改变，这些都属于表观遗传学的范畴。
肿瘤细胞的表观遗传学改变可以导致DNA序列的变化，从而改变基因的正常功能，促进肿瘤的发生和发展。
其次，我们来具体了解肿瘤的表观遗传学修饰。
DNA甲基化是最为常见的表观遗传学修饰之一。
在正常细胞中，DNA甲基化主要发生在CpG位点上，通过DNA甲基转移酶将甲基基团添加到CpG位点上的胞嘧啶上。
然而，在肿瘤细胞中，DNA甲基化状态发生了改变，表现为全基因组或某些特定基因区域的甲基化程度的增加或减少。
这些甲基化的变化可以影响到基因的转录以及染色质的结构和稳定性。
除了DNA甲基化外，组蛋白的修饰也是肿瘤中常见的表观遗传学修饰。
组蛋白是一种包裹DNA的蛋白质，在细胞中具有调控基因表达的重要作用。
组蛋白修饰通常包括乙酰化、甲基化、磷酸化和泛素化等。
在肿瘤细胞中，组蛋白修饰的模式发生了改变，导致某些基因的表达受到抑制或激活。
例如，H3K27me3修饰的增加可以抑制肿瘤抑制基因的表达，从而促进肿瘤的发展。
此外，非编码RNA（non-coding RNA）在肿瘤的表观遗传学中也扮演着重要的角色。
非编码RNA是指不能编码蛋白质的RNA分子，其中包括长链非编码RNA（lncRNA）和微小RNA（miRNA）。
近年来的研究发现，非编码RNA可以通过与DNA、RNA或蛋白质相互作用，调控基因的表达和功能。
在肿瘤中，非编码RNA的表达也发生了改变，从而影响肿瘤细胞的增殖、转移和耐药性等特性。
恶性肿瘤的遗传异质性研究揭示疾病发展的多样性
恶性肿瘤的遗传异质性研究揭示疾病发展的多样性恶性肿瘤是一种严重威胁人类健康的疾病，其发展过程极为复杂且具有多样性。
近年来，随着遗传学研究的不断深入，科学家们逐渐认识到恶性肿瘤存在着遗传异质性，即细胞内遗传变异的程度和类型各异。
本文将从遗传异质性的概念、产生原因、对疾病发展的影响以及临床意义等方面进行探讨。
一、遗传异质性概述遗传异质性指的是同一种恶性肿瘤在遗传水平上存在着差异，这种差异主要体现在DNA序列变异、染色体异常和基因表达水平的差异等方面。
从某种意义上来说，遗传异质性是恶性肿瘤发展的内在基础，它使得肿瘤细胞之间具有差异性，并导致了疾病的多样性。
二、遗传异质性产生的原因1. 突变积累：突变是遗传异质性产生的主要原因之一。
突变可以是自发发生的，也可以由外界环境因素或遗传缺陷等引起。
细胞内的DNA修复系统可以帮助修复DNA上的突变，但暴露在长期致突变物质作用下，修复系统容易发生故障，导致突变积累。
2. 染色体不稳定性：染色体异常是遗传异质性产生的另一个重要原因。
染色体畸变、重排、缺失和增加等染色体异常会导致基因的缺失或改变，从而引发肿瘤的发生。
3. 突变选择：在肿瘤发展的过程中，不同基因突变在不同的环境中可能会产生不同的效应。
环境中的选择压力会选择那些具有生存优势的突变细胞，这样就形成了遗传异质性。
三、遗传异质性对疾病发展的影响1. 药物抵抗性：由于恶性肿瘤细胞中存在着遗传异质性，不同细胞之间可能对同一药物产生不同的反应。
其中一些细胞可能会具有耐药性，导致药物治疗效果不佳。
2. 肿瘤进展速度：遗传异质性不仅影响了肿瘤细胞对药物的敏感性，还使得肿瘤的扩散和进展速度更快。
一些细胞可能具有更高的增殖能力和迁移能力，从而加速了肿瘤的发展。
3. 预后差异：由于遗传异质性的存在，肿瘤患者的预后也存在差异。
一些具有突变的细胞可能更容易导致肿瘤的复发和转移，导致患者的预后更差。
四、遗传异质性的临床意义1. 个体化治疗：了解肿瘤遗传异质性的特点可以为肿瘤的个体化治疗提供指导。
恶性肿瘤的表观遗传学研究解码癌细胞的表达规律
恶性肿瘤的表观遗传学研究解码癌细胞的表达规律恶性肿瘤是一类具有高度恶性和侵袭性的疾病，目前仍然是全球范围内最主要的健康威胁之一。
虽然我们已经取得了一定的进展，但对于癌症的发生机制和治疗方法仍然存在很多未解之谜。
近年来，表观遗传学的研究逐渐成为解码癌细胞表达规律的重要工具。
本文将重点介绍恶性肿瘤的表观遗传学研究，以期揭示癌细胞的表达规律。
一、表观遗传学研究概述表观遗传学是研究基因组中除DNA序列以外的一切可遗传因素的学科，它包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等一系列的变化。
这些变化能够直接或间接地影响染色质的结构和功能，从而调控基因的表达和功能。
表观遗传学在肿瘤研究中的应用日益受到重视，成为研究癌症发生和发展的关键领域。
二、癌细胞的表观遗传学变化恶性肿瘤的发生和发展与基因组的异常变化密切相关，而表观遗传学的变化在这一过程中起到了重要的调节作用。
通过对癌细胞的表观遗传学变化的研究，可以发现许多与癌症发生和发展密切相关的关键因子。
1. DNA甲基化修饰的变化DNA甲基化是表观遗传学中最重要的一种变化形式，它主要发生在DNA分子起始的胞嘧啶环上。
癌细胞中常常存在一种称为DNA甲基化酶的酶类，它能够使DNA分子上的甲基化位点增加，从而抑制肿瘤抑制因子的表达。
此外，在一些癌症中还发现了DNA甲基化缺失的现象，这可能导致一些关键的基因错乱表达，从而促进肿瘤的发生。
2. 组蛋白修饰的变化组蛋白是构成染色质的重要组成部分，而组蛋白修饰则能够直接影响染色质的结构和功能。
在癌细胞中，一些特定的组蛋白修饰变化与肿瘤发生发展密切相关。
例如，乙酰化组蛋白修饰增加可能导致染色质结构松散，从而导致癌基因的异常表达。
3. 非编码RNA的表达变化非编码RNA在基因表达调控中发挥着重要作用，而在癌症中常常存在非编码RNA的异常表达。
一些非编码RNA可以充当肿瘤抑制因子，对于保持细胞的正常状态起到重要作用。
而在癌细胞中，这些非编码RNA的表达通常下调或缺失，从而导致癌基因的异常表达和癌细胞的快速增殖。
遗传表观遗传学研究及其在肿瘤治疗中的应用
遗传表观遗传学研究及其在肿瘤治疗中的应用近年来，随着科技的不断发展和生物学研究的深入，遗传表观遗传学成为了一个备受关注的领域。
遗传表观遗传学研究了基因活性与环境因素之间的相互关系，通过改变某些表观遗传标记，可以对基因表达产生影响。
这一领域的研究与肿瘤治疗有着密切的关系，已经成为了治疗肿瘤的一种重要方式。
一、遗传表观遗传学的研究内容遗传表观遗传学主要研究基因表达的可塑性和稳定性，以及表观遗传标记如何影响基因表达。
表观遗传标记包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA等。
这些表观遗传变化可以在细胞分化、细胞增殖和身体发育等方面发挥重要作用。
不仅如此，它们也可以在诸如癌症、自身免疫疾病、神经退行性疾病等方面的疾病发生和进展中发挥作用。
二、DNA甲基化在肿瘤治疗中的应用DNA甲基化是目前遗传表观遗传学研究的一个热点领域。
肿瘤细胞与正常细胞相比，存在许多与DNA甲基化相关的变化。
甲基化位点的改变会影响癌症细胞的信号通路和基因表达，并增加癌细胞的侵袭和转移能力。
针对这些变化，科学家们开始尝试通过改变DNA甲基化状态来治疗癌症。
一项为期12个月的临床试验发现，在对42名慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者进行5-氮苯酮（5-AZA）治疗后，40%的患者获得了临床和治疗上的回应。
此外，最近的研究表明，5-AZA能够减少乳腺癌干细胞的数量，从而减少癌症再发的可能性。
三、组蛋白修饰在肿瘤治疗中的应用与DNA甲基化类似，组蛋白修饰也是研究肿瘤治疗的重要领域。
组蛋白修饰指的是一组特定的化学修饰，例如酰化、甲基化等，这些修饰能影响基因的表达。
针对这些修饰，许多药物已经被开发出来，并用于肿瘤治疗。
例如，抑制乙酰转移酶（HAT）的药物已经用于治疗B细胞淋巴瘤，并表现出良好的疗效。
此外，在对非小细胞肺癌细胞进行研究时，科学家发现经由抑制组蛋白去乙酰化酶（HDAC）来增加渗出紫杉烷的治疗效果。
四、非编码RNA在肿瘤治疗中的应用非编码RNA是进一步研究表观遗传变化的热点。
肿瘤遗传学知识点
肿瘤遗传学知识点肿瘤遗传学是研究癌症发生机制与遗传变异相关的学科。
它通过对肿瘤细胞遗传学特点和突变基因的研究，揭示了肿瘤发生发展的分子机制，为癌症的早期诊断、预后判断和个体化治疗提供了理论基础。
下面，我们将介绍一些肿瘤遗传学的重要知识点。
1. 肿瘤发生的基因突变在肿瘤发生过程中，基因突变是一个非常重要的环节。
基因突变可以分为两类：感染性突变和获得性突变。
感染性突变是指通过病毒或其他病原体引起的突变，例如人类乳头瘤病毒（HPV）引发的宫颈癌。
获得性突变是指后天获得的基因突变，这类突变可以是单个基因的突变，也可以是多个基因的共同突变。
2. 肿瘤基因的突变类型肿瘤基因的突变类型多种多样，包括点突变、插入/缺失突变、染色体易位等。
其中，点突变是最常见的一种突变类型，它会导致基因的结构或功能的改变，从而促进肿瘤的发生发展。
插入/缺失突变是指DNA分子中插入或缺失一个或多个碱基对，这种突变会影响基因的读码能力，进而改变蛋白质的合成。
染色体易位是指两个染色体间的染色体片段交换，这种突变可以导致关键基因的改变，从而影响细胞的正常功能。
3. 肿瘤抑制基因和促癌基因在肿瘤遗传学中，有两类基因对肿瘤的发生发展起到重要作用，分别是肿瘤抑制基因和促癌基因。
肿瘤抑制基因是指能够抑制细胞癌变的基因，例如TP53基因，它被称为癌症的“守门人”，能够监控细胞的DNA损伤，并触发细胞凋亡。
促癌基因是指能够促使正常细胞癌变的基因，例如RAS基因，它能够促进细胞增殖和存活。
4. 肿瘤标志物肿瘤标志物是一些在癌症患者体内可以检测到的特定蛋白质或其他分子物质。
通过检测肿瘤标志物的水平变化，可以帮助医生进行癌症的诊断、预后判断和治疗效果评估。
例如，前列腺特异抗原（PSA）是前列腺癌的常见标志物，乳腺癌患者体内的HER2蛋白也是一个重要的肿瘤标志物。
5. 基因检测和个体化治疗肿瘤遗传学的研究为基因检测和个体化治疗提供了理论基础。
通过对肿瘤细胞中突变基因的检测，可以了解患者的基因变异情况，从而为患者提供更具针对性的治疗方案。
表观遗传调控机制在癌症发生发展中的作用概述
表观遗传调控机制在癌症发生发展中的作用概述引言：表观遗传调控是指通过细胞内外环境信号对基因表达的调控，而不涉及DNA序列的改变。
在癌症发生发展中，表观遗传调控机制起着至关重要的作用。
本文将概述表观遗传调控在癌症发生发展中的作用，并重点讨论DNA甲基化、组蛋白修饰以及非编码RNA调控等几个重要的表观遗传调控机制。
第一部分：DNA甲基化在癌症中的调控作用DNA甲基化是指DNA链上的甲基化修饰，其中甲基化在癌症发生发展中具有重要的调控作用。
研究发现，在癌症细胞中，DNA甲基化的模式发生了明显的改变。
一方面，癌细胞的全局DNA甲基化水平下降，导致原本甲基化的基因变为非甲基化状态，进而激活了一些癌症相关基因的表达。
另一方面，癌细胞中一些关键的抑癌基因则出现了异常的高度甲基化，从而导致这些基因的沉默。
这种异常的DNA甲基化模式使得癌细胞在增殖、转移和抵抗药物方面具有明显的优势。
第二部分：组蛋白修饰在癌症中的调控作用组蛋白修饰是指通过对组蛋白进行化学修饰，来调控染色质状态和基因表达的一种机制。
研究发现，癌症中染色质状态存在明显的异常修饰模式。
举例来说，癌细胞中常常出现组蛋白甲基转移酶的过度表达，导致染色质的过度甲基化，从而影响基因的表达。
此外，癌细胞中还存在组蛋白乙酰化、甲酰化等修饰模式的异常，这些错误的修饰模式导致了细胞增殖、转移等恶性特征的获得。
第三部分：非编码RNA在癌症中的调控作用非编码RNA是指在转录过程中产生的不参与蛋白质翻译的RNA分子。
越来越多的研究表明，非编码RNA在癌症发生发展中发挥重要的调控作用。
例如，某些长链非编码RNA可以与DNA、RNA或蛋白质相互作用，调控基因的表达；而某些短链非编码RNA则具有剪切、诱导RNA降解等功能，参与细胞增殖、转移等关键过程。
非编码RNA的异常表达与癌症的发生密切相关，对于癌症的早期诊断和治疗具有重要意义。
结论：在癌症发生发展中，表观遗传调控机制起着至关重要的作用。
表观遗传修饰与肿瘤
表观遗传修饰与肿瘤表观遗传修饰与肿瘤之间存在着密切的。
在本文中，我们将探讨表观遗传修饰的定义、类型及其在肿瘤发生中的作用，肿瘤细胞中表观遗传修饰物的变化对肿瘤治疗的影响，以及表观遗传修饰与肿瘤的未来研究方向及其应用前景。
一、表观遗传修饰的定义、类型及其在肿瘤发生中的作用表观遗传修饰是指DNA序列不发生变化，但基因表达却发生可遗传变化的现象。
这些变化包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等。
在肿瘤发生中，表观遗传修饰的作用不容忽视。
例如，基因组印记异常、抑癌基因的甲基化失活和癌基因的激活等现象，都与表观遗传修饰密切相关。
二、肿瘤细胞中表观遗传修饰物的变化对肿瘤治疗的影响肿瘤细胞中表观遗传修饰物的变化会对肿瘤治疗产生影响。
一方面，这些变化可以作为肿瘤的诊断和分类依据。
例如，通过检测基因组印记异常，可以帮助医生判断肿瘤的类型和预后。
另一方面，表观遗传修饰也为肿瘤治疗提供了新的思路。
例如，针对抑癌基因的甲基化失活，研发相应的去甲基化药物，可能恢复抑癌基因的正常功能，抑制肿瘤的生长。
三、表观遗传修饰与肿瘤的未来研究方向及其应用前景未来，表观遗传修饰与肿瘤的研究将会有更多的研究方向和应用前景。
首先，随着检测技术的发展，我们有望发现更多的表观遗传修饰与肿瘤发生、发展的关系，为肿瘤诊断和治疗提供更多新的靶点。
其次，表观遗传修饰与肿瘤的研究也将有助于我们更好地理解肿瘤的病因和发病机制，从而制定更为有效的预防和治疗策略。
结论总的来说，表观遗传修饰与肿瘤之间存在着密切的。
表观遗传修饰在肿瘤发生中的作用，以及肿瘤细胞中表观遗传修饰物的变化对肿瘤治疗的影响，都为我们提供了新的视角和思路。
未来，随着研究的深入，我们有望通过调控表观遗传修饰，为肿瘤的诊断和治疗提供更为有效的方法。
随着生物科技的不断发展，我们对肿瘤的理解逐渐深入。
表观遗传学作为一门新兴学科，研究的是基因表达的潜在调控机制，与肿瘤的发生、发展密切相关。
本文将围绕肿瘤的表观遗传学研究展开讨论，揭示这一领域的重要性和未来可能的研究方向。
肿瘤学各院校研究生复试真题汇总最新版
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细胞生物学题库-04年11月17日期末
细胞⽣物学题库-04年11⽉17⽇期末中⼭⼤学⽣科院细胞⽣物学期末试卷任课教师∶王⾦发2004年11⽉17⽇姓名∶专业∶⼀、简要回答下列名词或短语对的⽣物学意义(每⼩题3分, 共15分):1.原癌基因与肿瘤抑制基因(Proto-oncogenes / tumor suppressor genes);2.细胞分化与细胞全能性(Cell differentiation / cell totipotency);3.G蛋⽩偶连受体与酶偶连受体(G protein-linked receptors / Enzyme-linked receptors);4.微管组织者中⼼与核仁组织者区域(MTOC / NOR);5.有丝分裂与减数分裂(Mitosis / Meiosis).⼆、填空题(每空1分，共20分):1.真核细胞三⼤结构体系是_____________________、______________________和___________________。
2.动物细胞⼀般靠钠钾泵⼯作产⽣的跨膜Na+电化学梯度摄取营养物，⽽植物细胞、真菌和细菌等细胞主要靠______________电化学梯度摄取营养物。
3.胶原(collagen)是⼀种分泌蛋⽩，其合成通路和其它分泌蛋⽩类似，先在__________切除信号肽，然后在__________装配形成三股螺旋的前胶原分⼦(procollagen)，同时在__________被糖基化等加⼯修饰，最后在细胞外形成成熟的胶原分⼦(collagen molecule)，之后装配成胶原。
胶原能够赋予组织______能⼒。
4.上⽪细胞能被表⽪⽣长因⼦(EGF)刺激⽽分裂。
细胞可通过内吞⽅式将其连同受体⼀道内化，最后在___________降解，从⽽终⽌信号作⽤。
5.细胞质基质中，⼀些变性或错误折叠的蛋⽩质在⽆法修复时，将与_______分⼦共价结合，⽽被________复合物降解。
表观遗传学与肿瘤(共29张)
患者1年总生存率仅15%左右。 动态的染色质重塑是大多数以DNA为模板的生物学过程的基础, 如基因转录、DNA的复制与修复、染色体浓缩与分离、细胞调亡等, 因而异常的染
色质重塑与肿瘤的发生与发复合7体5, %参；与对基mRN因A的非切割甲或翻基译抑化制。且该位点染色体发生缺失的患者1年
过去的观点认为, 成熟的干细胞发生异常的克隆性增生, 导致细胞的异质性的不断增强, 因此很多肿瘤呈现出一系列的演进过程；
siRNA天然的总作用生是封存闭转率座子达, 它们40能%在左染色右质水,平、而转录基水平因、转甲录后基水平化、基、因水且平对该基因位表点达进染行调色控。体发生缺失的
组蛋白去乙酰化酶异常结合到启动子区，从而抑制正常功能基因的转录也可能是恶性肿瘤发生的机制之一
基化状态, 而大多数散在分布的CpG二核苷酸常多发生甲基 Issa等研究证实存在CpG岛甲基化表型，即同时存在多个基因具有肿瘤特异性CpG岛甲基化。
赖氨酸甲基化有单甲基化，双甲基化以及三甲基化3种不同的形式，他们显著扩大了组蛋白复合体的密码信息。 长链非编码RNA在基因簇甚至整个染色体水平发挥顺式调节作用；
• 染色质重塑:
• 指染色质位置、结构的变化，包括紧缩的染色质丝在与核小体连 接处发生松动，造成染色质的解压缩，从而暴露基因转录启动子 区中的顺式作用元件，为反式作用因子与之结合提供可能。
• 两类结构介导: ATP依赖的核小体重塑复合体，通过水解作用改变 核小体构型；组蛋白共价修饰复合体，催化对核心组蛋白N-末端 尾部进行共价修饰，改变核小体构型，为其它蛋白提供与DNA作用 的结合位点；
表观遗传调控与癌症发展间的联系
表观遗传调控与癌症发展间的联系近年来，随着生物学和医学研究的进展，科学家们对于癌症发展的机制有了更深入的了解。
在癌症发展的过程中，表观遗传调控起着重要的作用。
表观遗传指的是影响基因表达和细胞功能的遗传变化，而并不改变DNA序列本身。
这种遗传变化包括DNA甲基化、组蛋白修饰以及非编码RNA等。
本文将探讨表观遗传调控与癌症发展之间的联系，并介绍一些相关研究的最新进展。
表观遗传调控与癌症发展之间的联系已经得到了广泛的研究和验证。
首先，表观遗传调控在癌症的起始和发展过程中起着至关重要的作用。
研究表明，DNA甲基化是一种常见的表观遗传调控方式。
在正常细胞中，DNA甲基化水平较高，可以抑制癌细胞的形成。
然而，在癌症细胞中，DNA甲基化水平通常下降，导致一些关键基因的表达异常。
这些异常表达的基因可以促进癌细胞的增殖、侵袭和转移，从而加速癌症的发展。
其次，组蛋白修饰也是表观遗传调控的关键因素之一。
组蛋白修饰是通过改变染色质结构来影响基因的表达。
研究发现，癌症细胞中存在大量的组蛋白修饰异常。
其中一种常见的异常是组蛋白去乙酰化修饰的丢失。
组蛋白去乙酰化修饰在正常细胞中起到抑制癌细胞生长的作用，但在癌症细胞中丧失了这种抑制作用，导致癌细胞的异常增殖。
此外，非编码RNA（ncRNA）也是表观遗传调控的重要组成部分。
ncRNA是一类不编码蛋白质的RNA分子，在细胞内起着多种功能。
研究发现，ncRNA在癌症细胞中的表达水平与癌症的发展密切相关。
一些ncRNA参与调控基因表达和细胞功能，进而影响癌细胞的生长和转移。
通过调控ncRNA的表达水平，可以抑制癌细胞的增殖和转移能力，进而达到抑制癌症发展的目的。
近年来，针对表观遗传调控与癌症发展之间的联系开展了大量的研究，并取得了一些重要的进展。
例如，研究人员发现了一些与DNA甲基化异常相关的酶。
这些酶可以通过干预DNA甲基化过程来抑制癌细胞的增殖和转移能力。
此外，科学家们还发现了一些能够改变组蛋白修饰的药物。
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SMARCA4 CCDS12253.1 PALB2 CCDS32406.1
IVS10+2C>T Splice Site
6
Gene
Transcript Accession ID
Nucleotide (genomic)-hg17
Nucleotide (cDNA)
Amino acid Mutation Type (protein)
Genetic info: template; coding info.
Epigenetic info: when、where、how to use genetic info.
3
Pediatric Research, 2007, : 38R-42R
Cell 2013 153, 38-55DOI: (10.1016/j.cell.2013.03.008)
o
12
Age (61 year-old male) Cigarette smoking Family history (family history of pancreatic cancer) Chronic pancreatitis (heavy drinking) Diabetes mellitus
4
Case:
61 year-old male, with family history of pancreatic cancer Abdominal pain, unexplained weight loss CT scan pT3N1M0 infiltrating ductal adenocarcinoma of the pancreas Management:
SMARCA4 CCDS12253.1 PALB2 CCDS32406.1
IVS10+2C>T Splice Site
Driver Gene
A gene whose mutation or aberrant expression is subject to selection during tumorigenesis.
根据突变最初发生的细胞分类
1.生殖细胞突变 2.体细胞突变 根据突变对氨基酸序列的影响分类 1. 同义突变 2. 错义突变 3. 无义突变 4. 移码突变
14
根据突变导致的生物学效应分类 1.基因突变具有致死性 2.部分功能丧失 3.隐性突变 4.有益突变 根据突变发生的分子机制分类 1.点突变：碱基替换；缺失或插入 2.动态突变 3. 移动基因、外源DNA序列插入 引起的突变
c.3469C>T
p.R1157W
Missense
Splice Site
IVS10+2C>T Splice Site
Driver Gene
10
Genetic variations
Gene Mutation（基因突变） Chromosomal Aberration
（染色体畸变）
Genomic Instability
KRAS CDKN2A SMAD4 TGFBR2 MLL3
CCDS8702.1 CCDS6510.1 CCDS11950.1 CCDS2648.1 CCDS5931.1
g.chr12:25289551G>A g.chr9:21961120C>T (homozygous) g.chr18:46829124dupA (homozygous) g.chr3:30688926dupG (homozygous) g.chr7:151279445G>A g.chr19:11002492C>T g. Chr16: 23603471C>T
2
Genetics & Epigenetics
Genetics: genes, genetic variation, and heredity in living organisms. Epigenetics: stably heritable phenotype resulting from changes in a chromosome without alterations in the DNA sequence. (Reversible)
15
16
A point mutation is a change in a single nucleotide. There are three types of point mutations:
Transition 转换 ATCATTCACT Substitution 置换 ATTATTCACT Transversion 颠换 ATCTTTCACT ATCATTCACT
In multicellular organism, two broad categories of mutations: somatic mutations & germ line mutations. Somatic mutations 体细胞突变 occur in somatic cells and only affect the individual in which the mutation arises. Germ line mutations 生殖细胞突变 alter gametes and passed to the next generation.
c.35G>A c.238C>T c.320dupA c.1247dupG
p.G12D p.R80X fs fs
Missense Nonsense INDEL INDEL Splice Site Missense Splice Site
IVS55+1G>A Splice Site c.3469C>T p.R1157W
Transcript Accession ID
Nucleotide (genomic)-hg17
Nucleotide (cDNA)
Amino acid Mutation Type (protein)
KRAS
CCDS8702.1
CDKN2A CCDS6510.1 SMAD4 CCDS11950.1 TGFBR2 MLL3 CCDS2648.1 CCDS5931.1
KRAS
CCDS8702.1
CDKN2A CCDS6510.1 SMAD4 CCDS11950.1 TGFBR2 MLL3 CCDS2648.1 CCDS5931.1
g.chr12:25289551G>A g.chr9:21961120C>T (homozygous) g.chr18:46829124dupA (homozygous) g.chr3:30688926dupG (homozygous) g.chr7:151279445G>A g.chr19:11002492C>T g. Chr16: 23603471C>T
“Passenger Mutations” (>99%)
The mutations that have no effect on the neoplastic process.
8
Science 29 Mar 2013:Vol. 339, Issue 6127, pp. 1546-1558 9
Gene
7
Driver Gene
A gene whose mutation or aberrant expression is subject to selection during tumorigenesis.
“Driver Mutations”
The mutations that confer a selective growth advantage to the tumor cell.
o o
They may be harmful, beneficial or neutral. Mutations are raw material of evolution. No variation means no evolution and mutations are the ultimate source of variation. Spontaneous mutation 自发突变, induced mutation 诱发突变 (mutagen 诱变剂)
p.G12D p.R80X fs fs
Missense Nonsense INDEL INDEL Splice Site
IVS55+1G>A Splice Site
SMARCA4 CCDS12253.1
PALB2 CCDS32406.1
g.chr19:11002492C>T
g. Chr16: 23603471C>T
Nucleotide (cDNA)
Amino acid Mutation Type (protein)
KRAS
CCDS8702.1
CDKN2A CCDS6510.1 SMAD4 CCDS11950.1 TGFBR2 MLL3 CCDS2648.1 CCDS5931.1
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g.chr12:25289551G>A g.chr9:21961120C>T (homozygous) g.chr18:46829124dupA (homozygous) g.chr3:30688926dupG (homozygous) g.chr7:151279445G>A