最新基因表达检测RTPCR
标准终点RTPCR
标准终点RTPCR实时荧光定量PCR（real-time PCR）是一种高灵敏度、高特异性的核酸检测技术，广泛应用于基因表达分析、病原微生物检测、遗传疾病诊断等领域。
在实时荧光定量PCR技术中，终点PCR是一种常用的PCR方法，它可以通过检测PCR反应终点的荧光信号来定量目标DNA或RNA的含量。
本文将介绍标准终点RTPCR的原理、方法和应用。
1. 原理。
标准终点RTPCR是一种半定量PCR技术，其原理是利用DNA或RNA模板，在PCR反应体系中进行多轮扩增，通过检测PCR反应终点的荧光信号来定量目标DNA或RNA的含量。
在PCR反应中，每一轮循环都会产生指数级增加的DNA或RNA产物，同时伴随着荧光信号的累积。
当PCR反应达到饱和时，荧光信号会呈指数级增加，最终趋于平稳。
通过检测PCR反应终点的荧光信号强度，可以确定起始模板的含量，从而实现对目标DNA或RNA的定量分析。
2. 方法。
标准终点RTPCR的方法包括PCR反应体系的准备、PCR程序的设置、荧光信号的检测和数据分析等步骤。
首先，需要准备PCR反应体系，包括模板DNA或RNA、引物、荧光探针、聚合酶等。
然后，设置PCR程序，包括预变性、PCR扩增和荧光信号采集等步骤。
在PCR扩增过程中，荧光信号会随着PCR产物的累积而增加，直至达到饱和。
最后，通过荧光检测仪器采集PCR反应终点的荧光信号，并进行数据分析，得出目标DNA或RNA的定量结果。
3. 应用。
标准终点RTPCR技术在科学研究和临床诊断中具有广泛的应用价值。
在基因表达分析中，可以利用标准终点RTPCR技术对特定基因的表达水平进行定量分析，从而揭示基因调控网络和信号转导通路。
在病原微生物检测中，可以利用标准终点RTPCR技术对病原微生物的核酸进行定量检测，实现对病原微生物的快速、准确的诊断。
在遗传疾病诊断中，可以利用标准终点RTPCR技术对患者的遗传物质进行定量分析，为临床诊断和治疗提供依据。
rt-pcr检测基因表达水平的原理
rt-pcr检测基因表达水平的原理RT-PCR（Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction）是一种常用的分子生物学技术，用于检测基因表达水平。
其原理是通过逆转录将RNA转化为cDNA，并利用聚合酶链式反应（PCR）扩增目标基因的序列，最终定量检测目标基因的表达水平。
下面将详细介绍RT-PCR的原理。
1.逆转录（Reverse Transcription）逆转录是RT-PCR的第一步，主要是将目标基因的RNA转化为互补的DNA，即cDNA。
逆转录反应需要逆转录酶（Reverse Transcriptase）和引物（Primers）的参与。
首先，待检测的RNA通过加热来解旋成为单链。
然后，在逆转录反应中，引物（Primers）结合在RNA的末端，提供一个起始点。
逆转录酶（Reverse Transcriptase）将引物作为模板，合成互补的DNA链。
引物一般选择Oligo-dT引物，它可以与RNA的多聚腺苷酸尾端结合，从而引导逆转录酶合成cDNA链。
此外，逆转录反应还需要dNTP（脱氧核苷酸三磷酸盐）和逆转录缓冲液等辅助物资。
2. PCR扩增（Polymerase Chain Reaction）逆转录后得到的cDNA是目标基因的复制物。
为了增加检测敏感性，需进一步扩增cDNA序列。
在PCR扩增过程中，引物（Primers）的作用是选择目标基因的特异序列，通过引物与目标序列的互补配对，使DNA聚合酶（DNA Polymerase）能够在相应的温度下在该位置合成新的DNA链。
PCR扩增需要参与的物质有DNA聚合酶、引物、dNTP、缓冲液和模板DNA。
引物是PCR反应中的关键，其中一对引物的设计应使其能够选择性地与目标基因序列的两个位点互补，从而能够在接下来的扩增反应中产生目标DNA片段。
PCR反应一般包括三个步骤：变性、退火和扩增。
首先，通过高温（通常为94℃至96℃）变性步骤将目标DNA链分离为两个单链。
rtpcr原理
rtpcr原理RT-PCR原理。
RT-PCR全称为逆转录聚合酶链式反应，是一种用于检测RNA的技术。
它结合了逆转录和聚合酶链式反应的步骤，可以将RNA转录成cDNA，然后进行扩增和检测。
这种技术在分子生物学和医学诊断中得到了广泛的应用，尤其在病毒检测和基因表达分析方面有着重要的作用。
RT-PCR的原理主要分为三个步骤，逆转录、PCR扩增和检测。
首先是逆转录，即将RNA转录成cDNA。
这一步骤需要逆转录酶和引物，逆转录酶能够将RNA模板转录成cDNA，引物则是用来引导逆转录酶的合成。
在逆转录的过程中，引物将与RNA模板结合，逆转录酶将在引物的引导下合成cDNA链。
这样就得到了cDNA模板，为后续的PCR扩增提供了基础。
接下来是PCR扩增，即利用聚合酶链式反应对cDNA进行扩增。
在PCR反应中，需要两种引物，分别是前向引物和反向引物。
这两种引物将在PCR反应中与cDNA模板配对，聚合酶将在引物的引导下合成新的DNA链。
通过多轮的PCR反应，可以将目标DNA序列扩增到可检测的水平。
PCR扩增是RT-PCR技术的关键步骤，它能够快速、高效地扩增目标DNA序列，为后续的检测提供了充分的材料。
最后是检测，即对扩增后的DNA进行检测分析。
常用的检测方法包括凝胶电泳、实时荧光定量PCR和测序等。
凝胶电泳是一种常规的检测方法，通过电泳将扩增后的DNA分离并观察。
实时荧光定量PCR则是一种高灵敏度和高特异性的检测方法，可以实时监测PCR反应过程中的荧光信号，从而定量分析目标DNA的含量。
而测序则是一种直接测定DNA序列的方法，可以准确地确定目标DNA的碱基序列。
这些检测方法可以根据实际需求进行选择，以满足不同的研究和临床应用。
总的来说，RT-PCR技术通过逆转录、PCR扩增和检测三个步骤，实现了对RNA的检测和分析。
它具有高灵敏度、高特异性和高效性的特点，可以广泛应用于基因表达分析、病毒检测、肿瘤诊断等领域。
随着生物技术的不断发展，RT-PCR技术也在不断完善和改进，为科研和临床诊断提供了强大的工具和支持。
RT-PCR百度百科
概念RT-PCR 为反转录RCR（reverse transcription PCR）和实时PCR（real time PCR）共同的缩写。
逆转录PCR，或者称反转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR)，是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。
在RT-PCR中，一条RNA链被逆转录成为互补DNA，再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。
由一条RNA单链转录为互补DNA(cDNA)称作“逆转录”，由依赖RNA的DNA聚合酶（逆转录酶）来完成。
随后，DNA的另一条链通过脱氧核苷酸引物和依赖RNA 的DNA聚合酶完成，随每个循环倍增，即通常的PCR。
原先的RNA模板被RNA酶H降解，留下互补DNA。
RT-PCR的指数扩增是一种很灵敏的技术，可以检测很低拷贝数的RNA。
RT-P CR广泛应用于遗传病的诊断，并且可以用于定量监测某种RNA的含量。
（检测基因表达的方法，参见Northern Blot法。
）RT-PCR有时候也会指代实时PCR(real-time PCR)。
为了与逆转录PCR相区别，通常被写作“定量PCR”(quantitative PCR)或者RTQ-PCR(real-time quantitative P CR)。
实时PCR(real-time PCR)，属于定量PCR（Q-PCR）的一种，以一定时间内D NA的增幅量为基础进行DNA的定量分析。
real time PCR 的定量使用萤光色素，目前有二种方法。
一种是在ds DNA中插入特异的萤光色素；另一种使用一种能与增幅DNA序列中特定寡核酸序列相结合的一种萤光探针（probe）。
real time PCR 与reverse transcription PCR 相结合，能用微量的RNA来找出特定时间、细胞、组织内的特别表达的遗传基因。
这两种RT PCR的组合又被称之为“定量RT-PCR（quantitative RT-PCR）”[编辑本段]PCR技术相关试剂A液：变性液B液：醋酸钠溶液C液：酚／氯仿／异戊醇混合液（50：49：1）D液：异丙醇E液：75％乙醇F液：DEPC处理的灭菌去离子水G液：RNA酶抑制剂H液：反转录反应液I液：反转录酶J液：PCR反应液K液：Taq DNA聚合酶(0.5u／µl)L液：矿物油M液：50倍TAE电泳缓冲液N液：溴化乙锭溶液0液：上样缓冲液[编辑本段]PCR各步骤的目的（一）预变性：破坏DNA中可能存在的较难破坏的二级结构。
RTPCR原理和实验步骤
RT—PCR原理与实验步骤一、知识背景：1、基因表达：DNA RNA Protein单拷贝基因表达存在逐步放大机制，如一个蚕丝心蛋白基因 104个丝心蛋白mRNA（每个mRNA存活4d,可以合成105个丝心蛋白) 共合成109个丝心蛋白。
因此单拷贝基因的mRNA表达水平对于其功能水平的调控是非常重要的。
2、PCR技术(Polymerase chain reaction）：即聚合酶链式反应。
在模板、引物和四种脱氧核苷酸存在的条件下依赖于DNA聚合酶的酶促反应，其特异性由两个人工合成的引物序列决定。
反应分三步：A。
变性：通过加热使DNA双螺旋的氢键断裂，形成单链DNA；B.退火：将反应混合液冷却至某一温度，使引物与模板结合.C。
延伸：在DNA聚合酶和dNTPs及Mg2＋存在下，退火引物沿5’3’方向延伸。
以上三步为一个循环,如此反复。
3、逆转录酶和RT-PCR逆转录酶（reverse transcriptase）是存在于RNA病毒体内的依赖RNA的DNA聚合酶,至少具有以下三种活性：1、依赖RNA的DNA聚合酶活性：以RNA为模板合成cDNA第一条链;2、Rnase水解活性：水解RNA：DNA杂合体中的RNA；3、依赖DNA的DNA聚合酶活性:以第一条DNA链为模板合成互补的双链cDNA。
二、RT—PCR的准备:1。
引物的设计及其原则：1）引物的特异性决定PCR反应特异性.因此引物设计是否合理对于整个实验有着至关重要的影响。
在引物设计时要充分考虑到可能存在的同源序列，同种蛋白的不同亚型,不同的mRNA剪切方式以及可能存在的hnRNA对引物的特异性的影响。
尽量选择覆盖相连两个内含子的引物,或者在目的蛋白表达过程中特异存在而在其他亚型中不存在的内含子。
2) 引物设计原则的把握引物设计原则包括：a、引物长度：一般为15～30bp ，引物太短会影响PCR的特异性，引物太长PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最适温度,也影响反应的特异性。
rtpcr的作用
rtpcr的作用什么是rtpcrrtpcr（全称为逆转录聚合酶链反应，Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction），是一种基因检测技术，可以用于检测RNA分子在样本中的存在并量化。
rtpcr的原理rtpcr技术基于聚合酶链反应（PCR）的原理，通过逆转录将RNA转化为反义DNA （cDNA），然后使用一对特定的引物（primers）扩增目标基因的DNA片段。
逆转录过程中，逆转录酶将RNA模板反向转录合成cDNA，在PCR反应中，DNA聚合酶通过引物将cDNA扩增成大量的DNA。
这个过程可以使我们检测到RNA分子的存在，并量化RNA的数量。
rtpcr的应用rtpcr技术在生物医学研究和临床诊断中有着广泛的应用，特别是在疾病的诊断和治疗中起着重要作用。
1.病原体检测：rtpcr可以检测感染性疾病的病原体，如病毒和细菌。
通过扩增病原体酸核酸的特定片段，可以快速准确地诊断出病原体感染。
2.基因表达分析：rtpcr可以评估基因在不同组织或细胞中的表达水平。
通过对比不同样本中目标基因的表达差异，可以研究基因在生理和病理过程中的调控机制。
3.肿瘤检测：rtpcr可以检测肿瘤标志物，通过扩增患者体液或组织中的肿瘤相关基因，可以及早诊断出肿瘤，进行早期治疗。
4.遗传疾病诊断：rtpcr可以检测遗传疾病的突变基因，帮助医生确定患者是否携带致病基因，并进行遗传咨询和干预。
5.药物研发：rtpcr可以评估药物对特定基因的调控作用，在新药研发中有着重要的应用价值。
rtpcr的优势和局限性rtpcr技术相比传统的基因检测方法具有以下优势：•高灵敏度：可以检测到非常低浓度的目标RNA，并能够量化RNA的表达水平。
•高特异性：通过引物的设计，可以选择性地扩增目标基因，减少误报率。
•高准确性：可以重复多次扩增同一样本，并获得可重复的结果。
然而，rtpcr技术也存在一些局限性：•需要引物设计：需要针对目标基因设计特异引物，这对于一些未知基因或变异较多的基因可能存在困难。
rtpcr实验报告
rtpcr实验报告标题：rtpcr实验报告摘要：本实验使用了rtpcr技术对特定基因进行检测，通过分析实验结果，得出了基因表达水平的定量数据。
实验结果表明，该基因在不同条件下的表达水平存在显著差异，为进一步研究该基因在生物学过程中的作用提供了重要参考。
引言：rtpcr（reverse transcription polymerase chain reaction）是一种常用的分子生物学技术，可以用于检测特定基因的表达水平。
通过rtpcr实验，我们可以定量分析基因在不同组织、不同条件下的表达情况，从而深入研究基因在生物学过程中的作用。
材料与方法：1. 样本准备：收集不同组织或细胞系的样本，提取总RNA。
2. 反转录：使用反转录酶将RNA转录成cDNA。
3. pcr扩增：设计引物，进行实时荧光定量pcr扩增。
4. 数据分析：利用实时pcr仪器收集数据，进行定量分析。
结果：通过rtpcr实验，我们得到了不同组织或细胞系中特定基因的表达水平数据。
实验结果显示，在不同条件下，该基因的表达水平存在显著差异。
例如，在刺激条件下，基因的表达水平明显上调；而在抑制条件下，基因的表达水平则显著下调。
这些数据为我们进一步探究该基因在生物学过程中的作用提供了重要参考。
讨论：rtpcr实验结果表明，特定基因在不同条件下的表达水平存在显著差异。
这表明该基因可能在特定生物学过程中发挥重要作用，或者受到外部环境的调控。
进一步的研究可以探究该基因在细胞信号传导、代谢调控等方面的作用机制，为相关疾病的治疗提供理论依据。
结论：通过rtpcr实验，我们成功地分析了特定基因在不同条件下的表达水平。
实验结果表明，该基因在生物学过程中可能发挥重要作用，为进一步研究该基因的功能和调控机制提供了重要参考。
这项研究为深入探究基因在生物学过程中的作用提供了重要的实验基础。
RTPCR的基本原理
RTPCR的基本原理一、什么是RTPCRRTPCR（Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction）是一种基因检测技术，常用于检测RNA的数量和序列特征。
通过该技术，可以对RNA进行逆转录合成DNA，然后利用聚合酶链反应（PCR）放大DNA的特定片段。
RTPCR技术在医学、生物学和疾病诊断领域具有广泛的应用。
二、RTPCR的基本步骤RTPCR技术主要包括逆转录、PCR放大和检测三个步骤。
1. 逆转录逆转录是将RNA转录为DNA的过程。
在逆转录过程中，需要使用逆转录酶、RNA 模板和引物（primers）进行反应。
逆转录酶能够将RNA模板中的核苷酸序列反转录成互补的DNA链。
引物是一小段DNA或RNA序列，在逆转录过程中与RNA模板发生互补配对，作为起始合成新DNA链的起点。
2. PCR放大PCR放大是将逆转录得到的DNA片段进行指数级扩增的过程。
在PCR反应体系中，需要加入逆转录产物、DNA聚合酶、引物和dNTPs（脱氧核苷酸三磷酸盐）。
PCR 反应通过循环加热和冷却的步骤，在不同温度下引发DNA的分离、复性和扩增。
反复的PCR循环能够使目标DNA片段的数量成倍增加。
3. 检测PCR放大后的DNA片段可以进行进一步的检测和分析。
常用的检测方法包括凝胶电泳、荧光探针或荧光染料结合等技术。
通过这些方法，可以检测到目标DNA片段的数量和特异性。
三、RTPCR的应用RTPCR技术在医学和生物学领域有广泛的应用。
1. 疾病诊断RTPCR可以检测病原体的基因序列，用于疾病的早期诊断和追踪。
例如，在新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情中，RTPCR被广泛应用于检测病毒的核酸，以帮助诊断和追踪病例。
2. 基因表达分析RTPCR可以检测和分析基因的表达水平。
通过检测特定基因的转录水平，可以了解基因在不同组织、不同发育阶段或不同环境条件下的表达差异。
这对于研究基因功能和调控机制非常重要。
RT-PCR在基因表达检测中的应用
RT-PCR在基因表达检测中的应用基因表达的检测有几种方法。
经典的方法（仍然重要）是根据在细胞或生物体中所观察到的生物化学或表型的变化来决定某一特定基因是否表达。
随着大分子分离技术的进步使得特异的基因产物或蛋白分子的识别和分离成为可能。
随着重组DNA技术的运用，现在有可能检测．分析任何基因的转录产物。
目前有好几种方法广泛应用于于研究特定RNA 分子。
这些方法包括原位杂交．NORTHERN凝胶分析．打点或印迹打点．S－1核酸酶分析和RNA酶保护研究。
这里描述RT-PCR从RNA水平上检查基因表达的应用。
RT-PCR检测基因表达的问题讨论关于RT-PCR技术方法的描述参见PCR技术应用进展，在此主要讨论它在应用中的问题。
理论上1μL细胞质总RNA对稀有mRNA扩增是足够了（每个细胞有1个或几个拷贝）。
1μL差不多相当于50－100，000个典型哺乳动物细胞的细胞质中所含RNA的数量，靶分子的数量通常大于50，000，因此扩增是很容易的。
该方法所能检测的最低靶分子的数量可能与通常的DNAPCR相同；例如它能检测出单个RNA分子。
当已知量的转录RNA（用T7RNA聚合酶体外合成）经一系列稀释，实验结果表明通过PCR的方法可检测出10个分子或低于10个分子，这是反映其灵敏度的一个实例。
用此技术现已从不到1个philadelphia染色体阳性细胞株K562中检测到了白血病特异的MRNA的转录子。
因此没必要分离polyA+RNA，RNA/PCR法有足够的灵敏度来满足绝大多数实验条件的需要。
将PCR缓冲液同时用于反转录酶反应和PCR反应，可简化实验步骤。
我们发现整个反应过程皆用PCR缓冲液的结果相当于或优于先用反转录缓冲液合成CDNA，然后PCR缓冲液进行PCR扩增循环。
当然，值得注意的是PCR缓冲液并不最适合第一条DNA链的合成。
我们对不同的缓冲液用于大片段DNA合成是否成功还没有进行过严格的研究。
反转录酶的选择似乎对实验方法成功与否并不十分重要。
rtpcr的原理及应用
RTPCR的原理及应用1. 引言实时逆转录聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction, RTPCR)是一种用于检测RNA在体系中的数量和质量的方法。
RTPCR结合了逆转录反应和聚合酶链式反应，能够在短时间内快速、准确地检测样本中的RNA分子。
RTPCR具有灵敏度高、特异性好、快速、简洁的特点，广泛应用于基因表达分析、病原体检测和人类疾病研究等领域。
2. 原理RTPCR的原理基于逆转录反应和聚合酶链式反应。
逆转录反应将RNA转录为cDNA，聚合酶链式反应则在PCR扩增过程中指数倍增加RNA的复制。
RTPCR主要分为两个阶段：逆转录阶段和扩增阶段。
2.1 逆转录阶段逆转录阶段是将RNA转录为cDNA的过程。
首先，将RNA样本与引物（专门识别RNA序列的寡核苷酸）和酶（逆转录酶）混合，通过加热和降温的过程，逆转录酶会将RNA作为模板合成cDNA链。
逆转录阶段的关键步骤是反应体系的温度控制和逆转录酶的选择。
2.2 扩增阶段扩增阶段是将cDNA扩增为大量的DNA片段。
在此阶段，引物将cDNA作为模板，并与聚合酶和核苷酸混合。
扩增过程是通过多个循环的温度变化来实现的。
每个循环都包括分离（95°C）、退火（低温，引物与DNA结合）和扩增（高温，聚合酶合成新的DNA链）的步骤。
这个过程会重复多次，从而指数倍增加扩增产物的数量。
3. 应用RTPCR在基因表达分析、病原体检测和人类疾病研究等领域有着广泛的应用。
3.1 基因表达分析RTPCR可以用于定量研究基因的表达水平。
通过测量PCR产物的数量，可以推断RNA在细胞中的丰度。
这对于研究基因调控、生物过程和疾病机制等具有重要意义。
3.2 病原体检测RTPCR可以用于快速检测病原体，如病毒和细菌。
通过特定引物的选择，可以在样本中检测病原体的存在与数量，从而进行疾病的诊断和监测。
3.3 人类疾病研究RTPCR在人类疾病研究方面发挥着重要作用。
rt-pcr检测基因表达水平的原理
rt-pcr检测基因表达水平的原理一、 rt-pcr检测基因表达水平的基本原理1. rt-pcr技术是一种用来检测基因表达水平的常用方法，其中rt代表逆转录（reverse transcription），pcr代表聚合酶链式反应（polymerase ch本人n reaction）。
2. rt-pcr技术通过将RNA转录成cDNA，然后进行聚合酶链式反应来扩增特定基因的片段，从而检测基因的表达水平。
3. rt-pcr检测基因表达水平的原理可以分为逆转录和聚合酶链式反应两个步骤。
4. 逆转录是将RNA转录成cDNA的过程，通过逆转录酶（reverse transcriptase）的作用，RNA可以被转录成cDNA。
5. 聚合酶链式反应是将cDNA扩增的过程，通过聚合酶和引物（primer）的作用，cDNA可以被扩增成大量的目标片段。
二、 rt-pcr检测基因表达水平的具体步骤1. 提取RNA：首先需要从待检测的组织或细胞中提取总RNA，保证RNA的完整性和纯度对后续实验非常重要。
2. 逆转录：将提取的RNA进行逆转录反应，将RNA转录成cDNA。
逆转录反应需要逆转录酶和随机引物或特异性引物。
3. pcr扩增：将逆转录后得到的cDNA进行聚合酶链式反应，使用特异性引物对目标基因进行扩增。
聚合酶链式反应的过程需要聚合酶、引物和dNTP。
4. 分析结果：最后通过凝胶电泳或实时荧光定量PCR等方法对扩增产物进行定量和分析，得到基因表达水平的信息。
三、 rt-pcr检测基因表达水平的优缺点1. 优点：rt-pcr检测基因表达水平的灵敏度高，可以检测低表达基因；检测结果定量化准确，能够得到基因的具体表达量；方法简单、快速、高效，适用于大规模的基因表达分析。
2. 缺点：需要严格控制反应条件和引物设计，以避免假阳性结果；受到RNA的完整性和纯度的影响，需谨慎处理RNA样本；无法区分剪接异构体，对于复杂基因的表达分析存在局限性。
RTPCR核酸检测流程第九版
RTPCR核酸检测流程第九版
RT-PCR（Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction）核酸检测是一种基因诊断的非常有效的技术。
它的广泛应用于病毒的检测，如新冠病毒检测。
首先，给被检测的样本制备RNA核酸，用反转录缓冲液将其反转录成cDNA（复制DNA）。
然后，将这种复制DNA分解到一些短片段。
最后，通过聚合酶链反应（PCR）对短片段进行扩增，然后可以对其有效加以检测。
需要注意的是，该流程需要使用专门的实验室仪器和实验材料来完成，才能确保质量和准确性。
此外，操作过程中应遵循相应的安全措施，以防止传染病的传播。
RT-PCR核酸检测的第九版已经上市，该版本显著优于第八版，由于实验操作及样品前处理许多技术已得以改进。
如果正确使用，它可以在几小时内从样品中以准确高效的方式检测到病毒，使实验加快速度和提高准确性。
因此，这项技术在诊断的实际应用中起着非常重要的作用，帮助病毒检测工作者更好地分析和把握病毒的发展趋势，为病毒防控提供有力的依据。
rt-qulc方法
rt-qulc方法
RT-qPCR（实时定量聚合酶链反应）是一种用于检测和定量DNA
或RNA的方法。
它结合了PCR技术和荧光探针技术，可以实时监测DNA或RNA的扩增过程，并且可以定量测定初始模板的数量。
这种
方法广泛应用于基因表达分析、病原体检测、基因突变分析等领域。
RT-qPCR的步骤包括，提取RNA（如果是RNA检测）、逆转录成cDNA、设置PCR反应体系、进行PCR扩增、实时监测PCR扩增过程
并记录荧光信号、分析数据并定量目标DNA或RNA的数量。
RT-qPCR方法有许多优点，例如高灵敏度、高特异性、宽线性
范围和快速速度。
它也可以用于分析少量样本，因此在临床诊断和
科研领域得到了广泛的应用。
在使用RT-qPCR方法时，需要注意一些影响结果准确性的因素，比如RNA提取的质量、逆转录反应的效率、PCR反应的特异性等。
此外，还需要在实验设计和数据分析过程中进行严谨的控制，以确
保结果的可靠性和准确性。
总的来说，RT-qPCR方法是一种非常重要且常用的分子生物学技。
实验七利用RT-PCR分析基因表达
目录
• 引言 • 实验原理 • 实验步骤 • 结果分析 • 实验注意事项与技巧 • 实验总结与展望
01 引言
目的和背景
研究基因表达
通过RT-PCR技术，可以检测特定基因在细胞或组织中的表达情况， 从而研究基因的功能和调控机制。
疾病诊断
RT-PCR技术可用于检测病原体基因的表达，如病毒、细菌等，为 疾病的诊断和治疗提供依据。
选择合适的PCR缓冲液和镁离子浓度，优化PCR反应体 系。
控制PCR循环次数，避免过度扩增导致非特异性产物的 生成。
调整退火温度和延伸时间，根据引物和模板的特性进行 优化。
使用高质量的DNA聚合酶和dNTPs，确保PCR反应的 准确性和效率。
06 实验总结与展望
本次实验成果回顾
实验目的实现
成功利用RT-PCR技术对目标基因在不同样本中的表达水平进行了 分析。
提高反转录效率和特异性方法
选择合适的引物，设计特异性强 的引物序列，避免非特异性扩增 。
使用高质量的RNA模板，避 免使用降解或污染的RNA。
优化反转录反应条件，如反应温 度和时间等，提高cDNA合成效 率。
在反转录反应体系中加入适量的 RNase抑制剂，防止RNase对 cDNA的降解。
优化PCR反应体系和条件建议
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荧光定量PCR原理
荧光基团标记
在PCR扩增过程中，引入荧光基 团标记的特异性探针或引物。随 着PCR反应的进行，荧光信号不
断累积。
实时监测
通过荧光检测系统实时监测PCR反 应过程中的荧光信号变化。荧光信 号与PCR产物的数量成正比，因此 可以通过荧光信号的强度来推算 PCR产物的数量。
rtpcr原理及应用
rtpcr原理及应用RT-PCR原理及应用。
RT-PCR（Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction）是一种基因分子生物学技术，它结合了逆转录和聚合酶链式反应两种方法，可以在研究中对RNA进行扩增，从而检测和分析特定基因的表达水平。
本文将介绍RT-PCR的原理和应用，以便更好地理解和运用这一技术。
RT-PCR的原理。
RT-PCR的原理主要包括逆转录和聚合酶链式反应两个步骤。
首先是逆转录，即将RNA转录为cDNA（complementary DNA），这是因为在常规的PCR反应中需要DNA作为模板，而RNA不能直接作为PCR的模板。
逆转录过程中，需要逆转录酶和RNA模板，通过逆转录酶的作用，RNA被逆转录为cDNA。
接着是聚合酶链式反应，即利用DNA聚合酶对cDNA进行扩增，通过PCR反应使特定基因的DNA序列得以扩增，从而进行后续的分析和检测。
RT-PCR的应用。
1. 基因表达分析。
RT-PCR可以用于研究特定基因在不同组织、细胞类型或生理状态下的表达水平。
通过逆转录和PCR扩增，可以定量检测特定基因的mRNA水平，从而了解其在生物体内的表达情况。
2. 病原体检测。
RT-PCR可以用于检测病原体，如病毒、细菌等的RNA或DNA，从而进行疾病的诊断和监测。
例如，在流感疫情监测中，RT-PCR可以快速、准确地检测流感病毒的存在，为疫情防控提供重要依据。
3. 肿瘤标志物检测。
RT-PCR可以用于检测肿瘤标志物的表达水平，帮助肿瘤的早期诊断和疗效监测。
通过检测肿瘤相关基因的表达水平，可以及早发现潜在的肿瘤病变，为临床治疗提供参考。
4. 药物研发。
RT-PCR可以用于药物研发中的基因表达分析和药效评价。
通过比较药物处理前后特定基因的表达水平变化，可以评估药物对基因表达的影响，为药物研发提供重要参考。
5. 遗传病检测。
RT-PCR可以用于遗传病的检测和分析，例如常见的遗传性疾病、基因突变等。
半定量RTPCR法在检测基因表达水平中的应用
半定量RT PCR法在检测基因表达水平中的应用半定量逆转录多聚酶链式反应是近年来常用的一种简捷、快速、特异的定量RNA 测定方法, 通过mRNA 反转录成cDNA , 再进行PCR 扩增, 扩增产物以指数形式增长, 通过测定PCR 产物的数量, 就可以推测各样品中特异mRNA 的相对含量, 即使模板浓度较低也能检测到. 这就为用非常少量的RNA分析提供了可能. 虽然此法只能测定mRNA 的相对含量, 但在比较模型组和对照组样品之间特异mRNA 的表达差异时足以说明问题.利用PCR 技术对生命过程中某种基因表达量变化的分析经历了一个从相对定量到绝对定量的过程, 荧光实时定量PCR 仪的问世, 使定量技术达到了一个新的高度, 实现了PCR 从定性到定量的飞跃, 但是, 由于荧光实时定量PCR仪价格昂贵, 限制了该仪器在研究中的推广使用。
事实上, 在许多研究过程中只需评估样品之间某种基因表达水平的相对差异, 半定量RT－PCR技术完全可以满足上述目的的要求。
与经典的检测基因的表达方法如Northern 印迹、RNA 酶保护分析等相比, 半定量RT －PCR法以其灵敏度高(比杂交法高1 000～ 10 000 倍)、专一性好、快速简便、且对初始总RNA 量要求不很严格, 不需已知浓度的标准品等优点而得到广泛的应用.1 半定量RT－PCR 方法的检测步骤1. 1 提取组织或细胞中的总RNA总RNA 的纯度和完整性关系到后面的cDNA合成及PCR 扩增, 因此所提的总RNA 要求纯度高,完整性好并达到一定的浓度. 要达到这一要求, 必须从取标本开始就进行无RNA 酶操作, 以防RNA 酶对所提总RNA 的降解, 具体做法为:所用的器械及器皿必须经200 ℃以上的高温烘烤最少5 h; 所用的耗材及试剂必须用0. 1% 的DEPC 水处理12～ 16 h,这样方可保证所提总RNA 的完整; 在选用试剂时最好选用知名品牌公司的试剂, 以保证总RNA 纯度及提取的产量;另外所用的组织量最少应在100mg、细胞数最少应在107.1. 2 总RNA 的纯度和完整性鉴定总RNA 提取之后, 必须用紫外分光光度计测定其纯度和浓度,A 260?A 280 在1. 8～ 2. 0 之间方可采用; 然后再用1. 5% 左右的琼脂糖凝胶对总RNA 进行电泳, 以鉴定其完整性, 浓度不高, 完整性不好的标本最好不用, 以免影响后面的实验结果.1. 3 cDNA 第一链的合成由总RNA 逆转录成cDNA 时, 所取的各组标本的总RNA 的量必须要一样多, 最好在1ug 以上, 这样才能保证各组标本总RNA 中所需检测的mRNA量的差异.为了使逆转录效益最大, 最好采用含有多个碱基的随机序列引物.1. 4 PCR 扩增以逆转录的cDNA 第一链为模板, 以特异性引物扩增所要检测的mRNA. 在PCR 扩增时一定要注意以下两点: ①为了克服不同管间扩增引起的“管效益”, 必须以组成型表达的内参基因如β-actin (或其它的看家基因, 如GA PDH、β-M G 等) 为内标, 在同一管中加入扩增内参基因的引物, 共同扩增所要检测的基因和内参基因, 内参扩增产物的大小最好与目的基因mRNA 扩增产物的大小相差200 bp 以上,这样便于观测结果; ②由于PCR 扩增存在着扩增效率及平台期的问题, 因此必须进行预试验以确定待检测基因与内参基因达到平台期前扩增效率最大的循环数. 对于PCR 反应存在着这样的关系式: N =N 0 (1+ E) n. 其中N 0为起始浓度, E 为扩增效率, n代表扩增周期,N 为产物最终浓度. 那么log N = nlog (1+ E) + log N 0. 通过预试验, 在不同的周期取样进行密度扫描, 以待检测基因与内标比值的对数分别与扩增周期作图, 如在20～ 30 周期内, 它们的线性关系良好, 说明在30 周期内二者的扩增未到达平台期, 最后确定扩增效率最大的循环数, 这样可有效地避免因引物结合效率不同而引起的误差.1. 5 结果的分析根据扩增产物片段的大小配制最适宜浓度的凝胶, 将PCR 扩增产物进行电泳. 待检基因与内参基因的扩增条带应相隔一定的距离(最少200 bp 以上) , 以便于观测结果及密度扫描, 且所选用的Marker 应尽量含有与扩增产物相对应的条带. 电泳条带经密度扫描仪扫描, 得到待测基因与内参基因条带各自的峰面积积分值, 计算各组样品两者的比值. 为了使扩增条带密度扫描的峰面积积分值尽量的准确可靠, 电泳条带一定要清晰, 不能有杂带出现. 有杂带出现的标本最好不用, 若有杂带应重新调整PCR 过程中的退火温度, 直至杂带消失, 这样才能保证扫描结果的专一性及可靠性.2 半定量RT -PCR技术的关键因素2. 1 总RNA 和cDNA 的质量只有在总RNA 未被降解的情况下, 才能保证其中mRNA 的完整性和随后反转录的cDNA 的质量,从而真实反映基因的表达.2. 2 总RNA 的定量在反转录之前, 作为起始模板各个样品中的总RNA 量要一样, cDNA 量和电泳PCR 产物量也要一样, 这样才能保证PCR 扩增产物能真实反映基因表达的实际情况.2. 3 引物的选择PCR反应的特异性是由一对上下游引物所决定的, 因此引物的好坏往往是PCR 反应成败的关键. 引物包括扩增目的基因的引物及扩增内参基因的引物, 引物的设计, 要根据基因的非保守序列设计, 以保证扩增的特异性.2. 4 PCR 循环数的确定选择合适的循环数不仅能使扩增产物在琼脂糖凝胶上清晰可见和定量, 也可使扩增反应在到达平台期前的线性范围内进行.在RT-PCR 方法中, 反应的循环数是一个必须分析的参数. PCR 扩增产物的量与循环数之间有一线性关系. 前期的扩增产物量随循环数的递增而成比例增加. 随着DNA 聚合酶活性的下降和溶液中反应底物的消耗, 扩增产物将达到一个平台. 半定量分析的循环数应确定在成比例的线性关系范围内. 表达丰度不同的基因半定量分析的PCR 循环数不同.PCR 扩增反应是酶促反应, 遵循酶促反应定律, 开始的循环内扩增产物呈指数累积, 产物与模板呈线性关系, 半定量RT-PCR 技术正是利用产物与模板的这一线性关系, 通过扩增产物来对比总RNA 中目的基因的表达, 但经过一定的循环后, PCR 产物不再呈指数累积而进入平台期, 在平台期低水平表达的目的RNA 可能会增加到与高水平表达的目的RNA 相同的浓度, 因此, 为避免平台效应的影响, 合适的循环数是PCR 半定量方法的关键因素之2. 5 最佳Mg2+ 浓度的确定M g2+ 浓度对PCR 扩增的特异性和产量有显著的影响, 因为它是影响Taq 酶扩增效率的重要因素,除此之外,M g2+ 还可影响引物的退火和解链温度,影响产物的特异性以及引物二聚体的形成等. 浓度范围多在0. 5～ 5 mmo lPL , 但扩增的效率则主要视序列而定. 在一般的PCR 反应中, 各种dNTP 浓度为200 umo lPL 时,M g2+ 浓度为1. 5～ 2. 0 mmolPL 为宜. M g2+ 浓度过高, 反应特异性降低, 出现非特异性扩增, 浓度过低会降低Taq DNA 聚合酶的活性, 使反应产物减少. 实验过程中可分别取1. 0、1. 5、2. 0mmo lPLMg2+ 进行预实验, PCR 产物经琼脂糖凝胶电泳后, 通过鉴定其亮度和特异性, 来确定最适的M g2+ 浓度.2. 6 合适内参的选择设立内参照可以减少因RNA 定量时产生的误差, 也可消除细胞个数的差别所带来的误差. 为避免RNA 抽提、加样、测量、cDNA 合成及PCR 反应过程中的某些系统误差和人为误差, 实验要选用在生物体内稳定表达且在其它生理条件下不受影响或影响很小的持家基因片段作为内参.传统的半定量RT-PCR 技术多以β-act in 作内参, 另外常用的内参照还有GAPDH, 它是一种细胞内代谢酶,其基因属于保守性强的“管家基因”, 该基因在生物体内普遍存在且稳定表达. β-M G 也是常用的内参, 研究表明18 S rRNA 具有更强的保守性和更普遍而恒定表达的特性, 因此在很多情况下也常常被用作内参. 不同的生物体其生命过程和生理过程各不相同, 选用何种内参要根据目的基因和实验的具体情况而定.3 半定量RT-PCR 法的应用半定量RT-PCR 是目前研究基因转录水平的有效手段, 可用来检测基因表达及其变化状况, 并可进行定量分析, 万平等以微管蛋白基因(Tubulin) 为对照,利用半定量RT 2PCR 法研究发现小麦锌指蛋白基因(TazF) 属于组成型表达基因. 王维平等以水稻肌动蛋白基因(Actin) 为对照, 利用半定量RT-PCR 研究, 发现水稻RCOI1基因的表达受茉莉酸甲酯(MeJA) 的诱导. 同时半定量RT 2PCR 方法在病原体检测、转基因的安全检测及肿瘤的研究方面也有非常广泛的应用.4 总结与展望半定量RT-PCR 法除了要求反转录和PCR条件完全一致外, 相比较样品之间最好同批进行RT -PCR , 对于用凝胶扫描检测PCR 扩增产物来说, 更适宜在同一块凝胶上进行电泳分离. 如果样品数量多, 由于泳道限制, 就不能同时在一块胶上电泳. 这时可采用Life Technologies 公司的定量Marker, 通过计算分析, 得到PCR 扩增产物的含量, 这样就可对同批扩增的样品进行多次重复电泳检测, 以提高定量的准确性和可靠性. 另外采用反转录与PCR分开进行的两步法RT-PCR , 在实验摸索阶段较一步法RT-PCR更为经济和方便, 因为每次提取到的总RNA 立即反转录成cDNA 存放, 可以尽量避免RNA操作中的降解, 而且一次反转录的cDNA 模板可供多次PCR 使用, 不但节约成本还可缩短实验周期,提高实验成功率.若靶基因的模板量大大低于内参基因, 若按常规方法同时加入两种基因的引物进行PCR 扩增, 在同一PCR 体系中, 太高浓度的模板会竞争性地形成优势扩增, 从而使另一模板失去指数扩增. 同时, 由于PCR 扩增中“平台期”的影响, 当靶基因可用EB检测出时, 内参基因已快进入“平台期”. 因此可采用PCR 扩增时内参照引物滞后加入的方法, 使内参照与靶基因同时处于指数增长期, 这样就可避免内参的优势扩增. 另外半定量RT - PCR 检测体系必须防止混在RNA 中的基因组DNA 带来的假阳性. 为排除可能的污染, 在实验中可同时设置两个阴性对照,一是以mRNA 为模板直接进行PCR 反应, 另一组不加任何模板. 若含有基因组DNA , 则会有条带出现.总之, RT-PCR 法是讨论基因转录水平的有效手段, 利用RT 2PCR 法对mRNA 进行半定量分析,最关键的是优化实验条件, 寻求PCR线性扩增范围, 确定最适M g2+ 浓度和PCR 循环数. 但是要使该法能够较准确地定量, 还有许多要注意的问题, 如在进行目的基因的定量分析过程中尚需考虑目的基因和内对照基因的丰度、大小以及它们的引物长短对扩增反应的影响, 另外就定量分析而言, 要使PCR产物量能够较好地反映起始模板量, 必须对处于指数扩增阶段的产物进行检测, 而它是不能通过EB 染色检测到的, 这是在利用常规PCR 方法分析目的基因表达变化过程中常遇到的难题, 大多数实验室常将定量分析过程中的PCR 扩增循环数提高到30 甚至35 个循环, 但是, 往往导致实验失败, 因此, 寻求一种高灵敏度的检测核酸数量变化的方法是今后需要努力去做的工作.。
rtpcr操作流程
rtpcr操作流程RT-PCR（Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction）是一种用于检测RNA的技术，常用于检测病毒、细菌等微生物的存在。
下面将介绍RT-PCR的操作流程。
首先，准备实验所需的试剂和设备，包括RNA提取试剂盒、逆转录试剂盒、PCR试剂盒、热循环仪等。
确保所有试剂和设备都处于干净、无菌状态。
第二步是提取RNA样本。
将待检测的样本（如血液、组织等）加入RNA提取试剂盒中，按照试剂盒说明书的指导进行RNA提取。
提取后的RNA样本应该是纯净的，没有受到污染。
第三步是逆转录反应。
将提取得到的RNA样本加入逆转录试剂盒中，进行逆转录反应，将RNA转录成cDNA。
逆转录反应的条件和时间根据试剂盒的说明进行设置。
第四步是PCR扩增。
将逆转录反应得到的cDNA加入PCR试剂盒中，进行PCR扩增反应。
PCR扩增的条件包括温度、时间和引物浓度等，需要根据试剂盒的说明进行设置。
第五步是检测PCR产物。
将PCR扩增反应得到的产物进行凝胶电泳或实时荧光定量PCR检测，确定目标基因是否存在。
通过比对标准曲线或者与阳性对照样本进行比较，可以确定目标基因的表达水平。
最后，分析结果并进行数据处理。
根据PCR检测结果，可以判断样本中是否存在目标基因，以及其表达水平。
对数据进行统计分析，得出结论并撰写实验报告。
总的来说，RT-PCR操作流程包括RNA提取、逆转录、PCR扩增、检测PCR产物和数据处理等步骤。
正确操作每一步，严格控制实验条件，可以确保实验结果的准确性和可靠性。
RT-PCR技术在医学、生物学等领域有着广泛的应用，对于疾病的诊断和研究具有重要意义。
RTPCR具体步骤
RTPCR具体步骤RT-PCR（逆转录聚合酶链反应）是一种用于检测和测量特定RNA分子在样本或样本中的表达水平的实验技术。
下面是RT-PCR的具体步骤：1.提取RNA：首先从样本（可以是细胞或组织）中提取RNA。
这可以通过商业RNA提取试剂盒或经典的酚-氯仿提取法来完成。
提取的RNA可能含有DNA杂质，因此可以使用DNA酶I来去除DNA。
2.逆转录反应：将提取的RNA转录成互补的DNA（cDNA）的过程称为逆转录。
逆转录反应的目的是将RNA转录成cDNA，并将其中的信息保存下来，以便后续PCR反应中进行扩增。
逆转录反应通常在逆转录酶（例如M-MLV反转录酶）和随后使用的引物的存在下进行。
需要引物来诱导逆转录酶在RNA模板上合成第一链cDNA。
3.PCR反应：PCR是一种将特定DNA片段扩增到大量可检测水平的技术。
在RT-PCR中，PCR反应用于扩增从RNA转录的cDNA片段。
PCR反应需要一对引物，这对引物应是特异性的，可以选择性地放大感兴趣的RNA分子。
PCR反应通常包含DNA模板，引物，dNTPs（脱氧核苷酸三磷酸盐）和DNA聚合酶。
PCR反应包括一系列循环，每个循环都包括一定的时间和温度在一定的时间内。
4.聚合酶链反应：在PCR反应中，DNA聚合酶在每一个循环中以DNA末端为模板合成互补的DNA链。
每个循环包括退火，延伸和变性步骤。
在退火步骤中，引物结合到DNA模板上。
在延伸步骤中，DNA聚合酶合成新的DNA链，并以它们作为模板进一步合成更多的DNA链。
在变性步骤中，PCR反应的温度被升高以分离DNA链。
5.检测与分析：PCR反应产生的扩增产物可以通过凝胶电泳或其他检测方法进行分析。
凝胶电泳可以分离不同大小的DNA片段，并且扩增产物的相对量可以通过定量PCR（qPCR）进行测量。
qPCR使用荧光信号来检测PCR产物的积累，并通过与标准曲线相比较来确定特定的RNA分子在样本中的表达水平。
6.数据分析：通过分析PCR产物的相对量，可以根据比较样品之间的扩增产物浓度来确定特定RNA分子在样本中的表达水平。
实时定量RTPCR的原理及方法
实时定量RTPCR的原理及方法一、本文概述实时定量反转录聚合酶链式反应（Real-Time Quantitative Reverse Transcription Polymerase Chn Reaction，简称实时定量RT-PCR）是一种在分子生物学领域中广泛应用的实验技术，用于检测和分析RNA样本中特定基因的表达水平。
该技术结合了反转录和聚合酶链式反应（PCR）的基本原理，通过实时监测PCR过程中产生的荧光信号，实现对基因表达量的高精度定量。
本文将对实时定量RT-PCR 的原理、实验方法以及应用进行详细的阐述，旨在为读者提供全面且深入的了解，从而能够在实际研究中灵活应用该技术，提高实验效率和准确性。
二、实时定量RT-PCR的基本原理实时定量反转录聚合酶链式反应（Real-Time Quantitative Reverse Transcription Polymerase Chn Reaction，简称实时定量RT-PCR）是一种在DNA扩增过程中，通过荧光信号实时监测反应产物量的变化，从而得到起始模板量的分析方法。
这种技术结合了反转录（RT）和聚合酶链式反应（PCR）两个过程，使得RNA模板也能进行定量分析。
实时定量RT-PCR的基本原理可以分为三个步骤：反转录，PCR 扩增，以及实时荧光信号检测。
反转录步骤中，RNA模板在反转录酶的作用下，被转换成互补的DNA（cDNA）。
这个过程中，RNA的特异性序列被保留下来，为后续的PCR扩增提供了模板。
然后，PCR扩增步骤中，特定的DNA片段在DNA聚合酶的作用下，通过引物的引导，进行指数级的扩增。
在这个过程中，DNA的数量以2的n次方（n为循环次数）增长，从而大大提高了检测的灵敏度。
实时荧光信号检测步骤中，通过在PCR反应体系中加入荧光染料或荧光标记的特异性探针，使得在DNA扩增的每一个循环中，都能实时监测到荧光信号的变化。
这种荧光信号的变化与DNA产物的量成正比，因此可以通过实时监测荧光信号，来推算出起始模板的量。
RTPCR和QPCR区别哪个更准确
RTPCR和QPCR区别哪个更准确引言在分子生物学和生物医学领域中，常用的分析方法包括RT-PCR（Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction）和qPCR（quantitative Polymerase Chain Reaction）。
这两个技术在检测核酸的表达和定量方面都非常重要。
本文将比较它们的区别和准确性，帮助读者更好地理解两者的特点。
RT-PCR和qPCR的基本原理RT-PCR是一种通过逆转录将RNA转录成cDNA（complementary DNA），然后利用聚合酶链反应（PCR）在DNA模板上扩增目标序列的方法。
这种技术可以将RNA转录成DNA，从而可以方便地对RNA进行定性和定量分析。
qPCR是在RT-PCR的基础上进一步发展而来的技术。
它在PCR过程中使用了荧光探针（如SYBR Green或TaqMan探针）来实时监测PCR反应的过程。
荧光信号的强度与模板DNA的数量成正比，可以通过荧光信号的变化来定量分析目标序列的表达水平。
RT-PCR和qPCR的区别1.应用范围： RT-PCR主要用于定性分析，即检测目标基因的存在与否。
而qPCR不仅可以定性分析，还可以进行定量分析，即准确测定目标基因的表达水平。
2.实验原理： RT-PCR将RNA逆转录成cDNA，然后通过PCR进行扩增。
而qPCR在RT-PCR的基础上引入了荧光信号监测系统，可以实时监测PCR反应的进行。
3.准确性： qPCR相比于RT-PCR更加准确。
通过实时监测PCR反应的信号变化，可以高精度地获取PCR产物的数量，从而准确测定目标基因的表达水平。
4.灵敏度：在目标基因表达水平较低的情况下，qPCR比RT-PCR更具灵敏度。
qPCR可以通过荧光信号变化的动态范围更好地区分不同表达水平的目标基因。
5.实验复杂度： RT-PCR相对来说比qPCR更简单，只需要进行逆转录和PCR扩增两个步骤。
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利用Trizol 试剂 抽提植物总RNA
Trizol 试剂是由苯酚和硫氰酸胍配制而成的单相 的快速抽提总RNA的试剂，在匀浆和裂解过程中， 能在破碎细胞、降解细胞其它成分的同时保持RNA 的完整性。在氯仿抽提、离心分离后，RNA处于水 相中，将水相转管后用异丙醇沉淀RNA。
用这种方法得到的总RNA中蛋白质和DNA污染很少， 可以用来做Northern,RT-PCR,分离mRNA，体外翻译 和分子克隆等。
RNA抽提前应准备的其它试剂及物品：
1. 75％乙醇（in DEPC-treated water) 2. 氯仿 3. 异丙醇（RNA专用） 4. RNase-free water：Draw water to RNase-free glass
bottles. Add diethylpyrocarbonate （DEPC）to 0.1% . Let stand overnight and autoclave. 5. 防止外源RNase的污染： 应戴口罩和手套，环境洁净；玻璃器皿180ºC烘烤3hrs 以上；塑料制品DEPC水清洗，蛋白质变性剂处理；一 次性用品如tube, tip等使用新的，无RNA酶的产品。
实验目的：学习RNA的简易制备过程，通过RNA电泳
带评价RNA质量
实验材料：水稻幼嫩叶片
提取方法：
➢ 苯酚/氯仿反复抽提 ，价廉但质不优， 尤其是对多酚等含量高的材料不适
➢ 蛋白酶/SDS配合酚、氯仿抽提的方法 ➢ 强变性剂法。硫氰酸胍，盐酸胍等，可
配合氯化铯离心或有机溶剂提取。
Trizol Reagent
防止内源RNA酶降解RNA
材料要新鲜; 裂解过程要同RNase活性抑制同步
RNA酶抑制剂
RNA酶是一种很顽固的酶，在RNA 分离和鉴定的各个阶段严重威胁RNA的 完整性。用来使RNA酶不发挥作用的 RNA酶抑制剂主要有：
1. DEPC 2. 氧钒核糖核苷复合物 3. RNA酶的蛋白质抑制剂
操作步骤（二）
4. 2-8 ℃ ，12000×g 离心10-15分钟；
将水相（上清）转入一新离心管，加0.5ml 异丙醇室 温下沉淀10分钟；
5. 2-8 ℃ ，12000×g 离心15分钟；
6. 弃上清，加1ml 75％乙醇清洗RNA，振荡片刻后（务 必使沉淀悬浮起来，以确保洗涤干净），7500×g 离 心5分钟，小心弃上清；
DEPC:
是高度活性的烷基化试剂，通过组胺基团乙氧 基甲酸化形式破坏RNase的活性
氧钒核糖核苷复合物:
O
C-CH2-CH3 O
C-CH2-CH3 O
能与多种RNAห้องสมุดไป่ตู้活性位点结合并几乎百分之百 地抑制RNA酶的活性
RNA酶蛋白质抑制剂 Ribonuclease Inhibitor
可与RNase形成非共价的复合物，从而使RNA酶失活。 不能在变性剂如SDS、胍等存在的情况下使用。
长 的 时 间 隧 道，袅
基因表达检测RTPCR
基因表达分析
Northern Blotting
Reverse Transcription PCR
RNA抽提
反转录
基因特异性引导 Oligo(dT)引导 随机六核苷酸引物引导
cDNA
Northern Blotting
PCR
基因表达水平
•Awarded Nobel Prize for Chemistry in 1993.
7. 室温静置5－15分，使RNA沉淀恰好干燥，加入20 µl DEPC水溶解，保存于-70 ℃ 。
8. 取2 µl 琼脂糖电泳检测RNA质量。
RNA的琼脂糖凝胶电泳
1. 用乙二醛/甲酰胺对RNA进行预变性，然后进 行琼脂糖凝胶电泳
2. 用甲醛和二甲基亚砜对RNA进行预处理，在 含6％或2.2mol/L甲醛的凝胶中电泳
进 入 夏 天 ，少 不了一 个热字 当头， 电扇空 调陆续 登场， 每逢此 时，总 会想起 那 一 把 蒲 扇 。蒲扇 ，是记 忆中的 农村， 夏季经 常用的 一件物 品。 记 忆 中 的故 乡 ， 每 逢 进 入夏天 ，集市 上最常 见的便 是蒲扇 、凉席 ，不论 男女老 少，个 个手持 一 把 ， 忽 闪 忽闪个 不停， 嘴里叨 叨着“ 怎么这 么热” ，于是 三五成 群，聚 在大树 下 ， 或 站 着 ，或随 即坐在 石头上 ，手持 那把扇 子，边 唠嗑边 乘凉。 孩子们 却在周 围 跑 跑 跳 跳 ，热得 满头大 汗，不 时听到 “强子 ，别跑 了，快 来我给 你扇扇 ”。孩 子 们 才 不 听 这一套 ，跑个 没完， 直到累 气喘吁 吁，这 才一跑 一踮地 围过了 ，这时 母 亲总是 ，好似 生气的 样子， 边扇边 训，“ 你看热 的，跑 什么？ ”此时 这把蒲 扇， 是 那 么 凉 快 ，那么 的温馨 幸福， 有母亲 的味道 ！ 蒲 扇 是 中 国传 统工艺 品，在 我 国 已 有 三 千年多 年的历 史。取 材于棕 榈树， 制作简 单，方 便携带 ，且蒲 扇的表 面 光 滑 ， 因 而，古 人常会 在上面 作画。 古有棕 扇、葵 扇、蒲 扇、蕉 扇诸名 ，实即 今 日 的 蒲 扇 ，江浙 称之为 芭蕉扇 。六七 十年代 ，人们 最常用 的就是 这种， 似圆非 圆 ， 轻 巧 又 便宜的 蒲扇。 蒲 扇 流 传 至今， 我的记 忆中， 它跨越 了半个 世纪， 也 走 过 了 我 们的半 个人生 的轨迹 ，携带 着特有 的念想 ，一年 年，一 天天， 流向长
RNA EXTRACTION (mini prep)
RNA的制备与分析对于了解基因在转录水平上的 调节和cDNA的合成都是必须的，RNA的纯度和完整性 对于NortheA分离的方法很多，最关 键的因素是尽量减少RNA酶的污染。
操作步骤（一）
• 液氮磨样，每管分装0.1克样品； • 每管加1毫升Trizol 试剂（样品体积不超过Trizol 试剂体
积的10％），迅速混匀（若样品较多可先将混好的样品置 于冰上）；室温下净置5－10分钟以利于核酸蛋白质复合 体的解离； 1. 加200 µl的氯仿，用手剧烈摇荡15秒，室温下静置5分钟 左右；