生物化学思考题
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生物化学思考题
蛋白质
1、蛋白质含量的测定方法有哪些?
答:蛋白质含量的测定方法主要有:
(1)凯氏定氮法:
蛋白质含量=蛋白质含N量×6.25
(2)紫外比色法
(3)双缩脲法
(4)Folin—酚法
(5)考马斯亮兰G—250比色法
2、蛋白质的基本组成单位是什么?蛋白质经过怎样处理才可产生这些基本组成单位?
答:蛋白质的基本组成单位是氨基酸。蛋白质经过如下三种处理均可产生氨基酸基本单位:
(1)酸水解:常用 6 mol/L的盐酸或4mol/L的硫酸在105-110℃ 20小时左右。
(2)碱水解:一般用5 mol/L氢氧化钠煮沸10-20小时。
(3)酶水解:已有十多种蛋白水解酶,如胰蛋白酶、糜蛋白酶、热激蛋白酶等。反应条件温和,酶水解时间长,反应不完全。
3、已知末端α-COOH,pK3.6,末端α-NH3+pK8.0 ε-NH+3pK10.6。
计算Ala-Ala-Lys-Ala的等电点。
4、简述蛋白质一级结构的测定顺序。
答:测定蛋白质一级结构的先后顺序为:
(1)测定蛋白质分子中多肽链的数目。
(2)拆分蛋白质分子的多肽链。
(3)断开链内二硫键。
(4)分析每条多肽链的氨基酸组成比及数目。
(5)鉴定多肽链的N、C瑞残基。
(6)裂解多肽成小的肽段。
(7)测各肽段的氨基酸序列。
(8)重建完整多肽链的一级结构。
(9)确定二硫键的位置。
5、从热力学上考虑,一个多肽的片段在什么情况下容易形成α-螺旋,是完全暴露在水的环境中还是完全埋藏在蛋白质的非极性内部?为什么?
答:当多肽片断完全埋藏在蛋白质的非极性内部时,容易形成氢键。因为在水的环境中,肽键的C=O和N-H基团能和水形成氢键,亦能彼此之间形成氢键,这两种情况在自由能上没有差别。因此相对的说,形成α-螺旋的可能性较小。而当多肽片段在蛋白质的非极性内部时,这些极性基团除了彼此之间形成氢键外,不再和其它基团形成氢键,因此有利于α-螺旋的形成。
6、某氨基酸溶于pH7的水中,所得氨基酸溶液的pH为6,问此氨基酸的pI是大于6、等于6还是小于6?
氨基酸在固体状态时以两性离子形式存在。某氨基酸溶于pH7的水中,pH从7下降到6,说明该氨基酸溶解于水的过程中放出了质子,为了使该氨基酸达到等电点,只有加些酸,因此氨基酸的等电点小于6。
7、一系列球状的单体蛋白质,相对分子质量从10000到100000,随着相对分子质量的增加,亲水残基与疏水残基的比率将会发生什么变化?
随着蛋白质相对分子质量的增加,表面积与体积的比率也就是亲水残基与疏水残基的比率必定减少。假设这些蛋白质是半径为r的球状蛋白质,由于蛋白质相对分子质量的增加,表面积随r2的增加而增加,体积随r3的增加而增加,体积的增加比表面积的增加更快,所以表面积与体积的比率减少,因此亲水残基与疏水残基的比率也就减少。
8、维持蛋白质一、二、三、四级结构的键或力是什么?
答:维持蛋白质一级结构的键或力主要为肽键,还有二硫键。
维持蛋白质二级结构的键或力主要为氢键,其次为二硫键。
维持蛋白质三、四级结构的键或力主要为疏水键,其次为氢键、盐键和范德华力。
9、沉淀蛋白质的方法主要有哪些?
答:沉淀蛋白质的方法主要有:
(1) PI法。
(2)盐析法。
(3)有机溶剂沉淀法。
(4)重金属盐沉淀蛋白质。
(5)生物碱、有机酸试剂沉淀蛋白质。
(6)加热变性沉淀法。
(7)抗体对蛋白质的沉淀。
10、蛋白质二级结构以什么为基础,有哪些主要形式?
答:蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。其主要形式有:
(1)α-螺旋(α- Helix)
(2)β-折叠(β- pleated sheets)
(3)β-转角 (β-turn) (4) 无规卷曲 (5)Ω环
11、有一个七肽,经分析其氨基酸组成分别为Lys 、Pro 、Arg 、Phe 、Ala 、Tyr 和Ser 。此肽与DNFB 不反应。用胰凝乳蛋白酶降解,得到两个肽段 ,其氨基酸组成分别为Ala 、Tyr 、Ser 和Pro 、Phe 、Lys 、Arg 。这两个肽段与DNFB 反应,分别生成DNP-Ser 和DNP-Lys 。此肽与胰蛋白酶作用,同样生成两个肽段,它们的氨基酸组成分别为Arg 、Pro 和Phe 、Tyr 、Lys 、Ser 、Ala 。试推测此多肽的结构和氨基酸组成。
答:由此肽与DNFB 不反应可知,该七肽必为一环状多肽。
因为胰凝乳蛋白酶的酶切位点Tyr 、Phe 、Trp 等疏水氨基酸的羧基端,因此用胰凝乳蛋白酶降解得到的Ala 、Tyr 、Ser 和Pro 、Phe 、Lys 、Arg 两个肽段,其酶切位点分别为Tyr 和Phe 。加之,这两个肽段与DNFB 反应,分别生成DNP-Ser 和DNP-Lys ,表明在Ala 、Tyr 、Ser 肽段中,与Tyr 相临的氨基酸残基是Lys ,因此其氨基酸顺序为Ser - Ala-Tyr ;而在Pro 、Phe 、Lys 、Arg 肽段中,与Phe 相临的氨基酸残基为Ser 。
由于胰蛋白酶的酶切位点主要为Lys 、Arg 的羧基端,因此,用胰蛋白酶作用得到的Arg 、Pro 和Phe 、Tyr 、Lys 、Ser 、Ala 两个肽段,表明Arg 与Pro 相临,且Pro 与Lys 相临。 综上所述,此肽段的氨基酸顺序和结构为:
酶
1、简述酶作为生物催化剂与一般化学催化剂的共性及其个性。
答:酶作为生物催化剂与一般化学催化剂的共性为:在反应前后没有质和量的变化;用量少而催化效率高;只能催化热力学允许的化学反应;只能加速可逆反应的进程,而不改变反应的平衡点;可降低化学反应的活化能。
与一般化学催化剂相较,酶作为生物催化剂的特点为:酶催化效率更高,具有高度的专一性;容易失活,活力受条件的调节控制;活力与辅助因子有关。 2、何谓竞争性抑制?磺胺药物作用的生化机理是什么?
答:竞争性抑制:某些抑制剂的化学结构与底物相似,因而能与底物竟争与酶活性中心结合;竟争性抑制通常可以通过增大底物浓度,即提高底物的竞争能力来消除;Vmax 不变;Km 值增加,酶与底物的亲和力降低。
Ala Ser
Phe
Pro Lys
Tyr