基因工程作业题及答案
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第二章
1. 名词解释:核酸内切酶、核酸内切限制酶、同裂酶、同尾酶、核酸外切酶、末端脱氧核苷酸转移酶
答:
核酸内切酶:是一类从多核苷酸链的内部催化磷酸二酯键断裂的酶。
核酸内切限制酶:是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列(4—8bp),并由此处切割DNA双链的核酸内切酶。
同裂酶:识别位点的序列相同的限制性内切酶。
同尾酶:识别的序列不同,但能切出相同的粘性末端。
核酸外切酶:是一类从多核苷酸链的一头开始催化降解核苷酸的酶。
末端脱氧核苷酸转移酶:可以不需要模板,在单链DNA或突出的双链DNA 3’-OH端随机
添加dNTPs的酶
2. 限制性内切核酸酶的命名原则是什么?
答:限制性内切核酸酶按属名和种名相结合的原则命名的,即:属名+种名+株名+序号;
首字母:取属名的第一个字母,且斜体大写;
第二字母:取种名的第一个字母,斜体小写;
第三字母:(1)取种名的第二个字母,斜体小写;
(2)若种名有词头,且已命名过限制酶,则取词头后的第一字母代替。
第四字母:若有株名,株名则作为第四字母,是否大小写,根据原来的情况而定,但用正体。
顺序号:若在同一菌株中分离了几种限制酶,则按先后顺序冠以I、Ⅱ、Ⅲ、…等,用正体。
3.部分酶切可采取的措施有哪些?
答:1)缩短保温时间
2)降低反应温度
3)减少酶的用量
4. 在序列5'-CGAACATATGGAGT-3'中含有一个6bp
的Ⅱ类限制性内切核酸酶的识别序列,该位点的序列可能是什么?
答:回文序列是:5'-CATA TG-3,
5.什么是限制性内切核酸酶的星号活性? 受哪些因素影响?
答:Ⅱ类限制酶虽然识别和切割的序列都具有特异性,但是这种特异性受特定条件的限制,即在一定环境条件下表现出来的特异性。条件的改变,限制酶的特异性就会松
动,识别的序列和切割都有一些改变,改变后的活性通常称第二活性,而将这种因
条件的改变会出现第二活性的酶的右上角加一个星号表示,因此第二活性又称为星
活性。
概括起来,诱发星活性的因素有如下几种:(1)高甘油含量(>5%, v/v);(2)限制性
内切核酸酶用量过高(>100U/ugDNA);(3)低离子强度(<25 mmol/L);(4)高pH(8.0 以上);(5)含有有机溶剂,如DMSO,乙醇等;(6)有非Mg2+的二价阳离子存在(如
Mn2+,Cu2+,C02+,Zn2+等)。
第三章
1.如何将野生型的λ噬菌体改造成为一个理想的载体?
答:①删除λ噬菌体的非必需区,留出插入空间;并在余下的非必须区内制造限制酶切点
②引进某些突变表型,作为选择标记
③突变某些基因,使它成为安全载体
④删除λDNA必须区段上常用的限制酶切点
2.什么是蓝白斑筛选法?
答:这种方法是根据α互补的原理来筛选重组体。主要是在载体的非必要区插入一个带有大肠杆菌β—半乳糖苷酶的α基因片段(LacZ’),携带有lac基因片段的载体转入LacZ’-的宿主菌后,在IPTG(异丙基硫代-β-D半乳糖)诱导下,载体表达的β—半乳糖苷酶的α肽段和宿主菌表达的β—半乳糖苷酶的β肽段互补,形成有活性的β—半乳糖苷酶,该酶可以分解无色的5—溴—4—氯—3—引哚—β—D—半乳糖苷(X-gal)得到蓝色的5—溴—4—氯—靛蓝,因此在含有X-gal平板上形成浅蓝色的菌斑。外源基因插人LacZ’(或LacZ’基因部分被取代)后,重组的克隆将丧失分解X-gal的能力,在含有X-gal的平板上形成白色的菌斑,非重组的克隆则为蓝色菌斑。
3.M13系列载体具有哪些优缺点?
答:(1)有MCS,便于克隆不同的酶切片段
(2)Xgal显色反应,可供直接选择
(3)可以克隆双链DNA分子中的每一条链
4.辅助噬菌体DNA和相应的噬菌粒是如何协同工作的?
答:虽然噬菌粒载体携带有M13的IG区,能够合成单链DNA,但是它没有M13的功能基因,没有M13基因2的产物存在,所以不能合成单链DNA。而辅助噬菌体具有M13的所有功能基因,但是IG区是缺陷的,辅助噬菌体本身的DNA不能进行单链复制,于是就可以为噬菌粒提供基因2产物和包装蛋白。
5.某一质粒载体具有Tetr和Kanr的表型,在Kan抗性基因内有一Bgl I的切点。现用Bgl I切割该载体进行基因克隆,问:(1)转化后涂皿时应加什么样的抗生素?(2)培养后长出的菌落具有什么样的抗性基因型?(3)如何利用抗性变化筛选到含有插入片段的重组体?
答:(1)加四环素;(2)Tet r Kan s和Tet r Kan r;(3)重新点种在含Tet、Kan和只加Tet的平板上,选择只在Tet平板上生长的菌落,即为所需的重组体。
第四章
1. 目的基因的获取方法有哪些?各有什么优缺点?
答:1)鸟枪法克隆:优点是可以随机克隆供体细胞的全基因组DNA片段;缺点是①工作量较大,需要了解目的基因的背景知识,②不能获得最小长度的目的基因,③不能除去真核生物目的基因的内含子结构
2)cDNA法:优点是①能获得最小长度的目的基因②能除去真核生物目的基因的内含子结构;缺点是①仅限于克隆mRNA分子具有polyA结构的蛋白质编码基因②mRNA分离纯化困难
3)PCR法:优点是高效快速的体外合成目的基因;缺点是已知待扩增目的基因或DNA片段两侧的序列
4)化学合成法:优点是适于合成引物、接头等多种DNA短片段;缺点是必须已知基因的DNA序列,直接合成较大的基因成本较高
2. 什么是基因组文库(genomic library)?构建基因组文库,涉及哪些基本过程?它同遗传学上的基因库有什么不同?
答:
基因组文库是用基因工程的方法,人工构建的含有某一生物基因组DNA的各种片段的克隆群。一般以改造的噬菌体DNA或黏粒作为载体,包括下列过程:(1)高分子量染色体DNA的制备;(2)体外重组连接;(3)包装蛋白的制备;(4)重组体的体外包装;(5)将重组DNA导人寄主细胞;(6)筛选。基因组文库同遗传学上所讲的基因库是完全不同的概念。基因库(gene pool)是指在进行有性生殖的某一群体中,能进行生殖的个体所含总的遗传信息。在基因组文库的构建中,由于使用的载体不同,分为噬菌体载体和黏粒载体构建的基因组文库、YAC文库、BAC文库等。