第二章蛋白质的结构和生理功能
蛋白质的结构与功能
三、氨基酸的理化性质:
1.两性解离及等电点: (1) 氨基酸在晶体和水溶液中主要以兼性离子形式存在 ①晶体溶点高 → 离子晶格,不是分子晶格。 ②不溶于非极性溶剂 →极性分子 ③介电常数高→ 水溶液中的氨基酸是极性分子。 (2) 氨基酸的两性解离和酸碱滴定曲线 HA → A- + H+ pH=pKa/ +Log[A-]/[HA] pKa/ 就是HA50%解离([碱] = [酸])时溶液的pH值, Ka/就是此时溶液的[H+] 当HA50%解离时,溶液的pH值等于pKa/ pH = pKa/ 时,[碱] = [酸](50%解离) pH > pKa/ 时,[碱] > [酸](>50%解离) pH < pKa/ 时, [酸] > [碱](<50%解离)
蛋白质的二级结构是指蛋白质多肽链主链
原子局部的空间结构,但不包括与其他肽
段的相互关系及侧链构象的内容。维系蛋
白质二级结构的主要化学键是氢键。
酰胺平面(肽平面) 1. 由于C=O双键中的π 电子云与N原子上 的未共用电子对发生“电子共振”,使肽 键具有部分双键的性质,不能自由旋转。 2. 与肽键相连的六个原子构成刚性平面 结构,称为肽单元或肽键平面。但由于 α - 碳原子与其他原子之间均形成单键, 因此两相邻的肽键平面可以作相对旋转。
氨基酸的光吸收性 Tyr、Phe、Trp的 R基含有共轭双键, 在220-300nm近紫外 区有吸收。 λ(nm) ε Tyr 275 1.4×103 Phe 257 2.0×102 Trp 280 5.6×103
3.氨基酸的化学反应
(1)氨基参与的反应
与亚硝酸反应(Van Slyke 法测定氨基酸) Sanger 反应 :2.4一二硝基氟苯(DNFB) Edman反应:苯异硫氰酸酯,PITC 生成西佛碱的反应(Schiff):西佛碱是某 些酶促反应的中间产物(如转氨基反应的中 间产物)。 甲醛反应
第二章 蛋白质的结构与功能(中职护理 《生物化学》)
氨基酸的结构
亚氨基酸
脯氨酸 Proline
H N C OH O
2,根据R侧链的极性分类
非极性疏水性氨基酸 极性中性氨基酸 酸性氨基酸 碱性氨基酸
1,非极性疏水性氨基酸
特点:含有非极性的侧链,具有疏水性(在中性水 溶液中的溶解度较小),共7种。
甘氨酸 丙氨酸 缬氨酸 亮氨酸 异亮氨酸 苯丙氨酸 脯氨酸
3, β-转角
定义: 在肽链进行180° 回折时的转角上,通 常由四个氨基酸残基 构成,其中第二个残 基常为脯氨酸。
作用力:氢键
4,无规卷曲
定义: 是指多肽链中没有确定规 律性的那部分肽链构像。
(二)三级结构
定义:
蛋白质的多肽链在各种二级结构的基础上再 进一步盘曲或折叠形成具有一定规律的三维空间 结构,称为蛋白质的三级结构。
含硫氨基酸
O H2N CH C CH2 SH OH
氨基酸的结构
天冬氨酸 Aspartate
酸性氨基酸
O H2 N CH C CH2 C OH O OH
氨基酸的结构
天冬氨酸 Aspartate
谷氨酸 Glutamate
酸性氨基酸
O H2N CH C CH2 CH2 C OH O OH
氨基酸的结构
证明:氨基酸是蛋白质的基本组成单位
۶ 组成人体蛋白质的20种氨基酸均 属于L--氨基酸
• 存在自然界中的氨基酸有300余种, 但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种, 且均属 L-氨基酸(甘氨酸除外)。
۶ 组成蛋白质的氨基酸
(一)氨基酸的结构
1、结构通式
侧链基团
氨基 羧基
2、结构特点:
① 每种氨基酸分子中至少都含有一个氨基和一个羧 基,并且连接在同一个碳原子上,故称α -氨基酸 (脯氨酸除外:亚氨基——NH2+)。 ②除甘氨酸的R为H外,其他氨基酸的Cα 是不对称 碳原子,因此具有L型与D型两种不同的构型,组成 人体的都是L型。 ③不同氨基酸的R侧链各异,它 们的分子量、解离程度和化学反 应性质也不相同。
第二章--蛋白质的结构和功能
COOH
COO-
H2N C H 或 H3N+ C H
R
R
R代表氨基酸侧链
1.组成蛋白质的氨基酸都是α-氨基酸 (脯氨酸为α-亚氨基酸)。
α -碳原子,即与-COOH相邻碳原子。 氨基均连在α -碳原子上,故为α-氨基 酸。
2.组成人体蛋白质的氨基酸都是 L 型,即 L-α-氨基酸。
不同的氨基酸其侧链不同,除甘氨酸外,其余 氨基酸的α-碳原子分别连接 4 个不同原子或基团, 是手性碳原子,有两种不同的构型,即L型和D型。
(一)氨基酸的命名
1.系统命名法 以 羧基为母体,碳原子的 位次以阿拉伯数字或希 腊字母标示。
2.俗称
H3C CH COOH NH2
α -氨基丙酸(丙氨酸)
(二)氨基酸的结构特点
自然界存在的氨基酸有300多种,但组成人体 蛋白质氨基酸仅有20种,且都有特异的遗传密码, 为编码氨基酸。
氨基酸的结构通式可用下式表示:
COOH
H2N C H R
L-α -氨基酸
COOH
H C NH2 R
D-α -氨基酸
(三)氨基酸的分类
(三)氨基酸的分类
基本氨基酸的分类方法一: 按侧链结构分类
脂肪族氨基酸(15种) 芳香族氨基酸(3种) 杂环氨基酸(2种)
(三)氨基酸的分类
基本氨基酸的分类方法二: 按侧链R基团极性分类 非极性(疏水)氨基酸(9种) 极性不带电荷氨基酸(6种) 极性带正电荷氨基酸(碱性氨基酸)(3种) 极性带负电荷氨基酸(酸性氨基酸)(2种)
蛋白质是由许多氨基酸单位通过肽键连接形成 的具有特定分子结构的高分子化合物。
蛋白质的分子结构可分为一级、二级、三级和 四级。一级结构是蛋白质的基本结构,二级、 三级、四级结构称为高级或空间构象。
第二章 蛋白质的结构与功能
无规则卷曲( random coil )
定义:没有明确规律性的那部分肽段的结构。
但这些“无规则卷曲”也象其他二级结构那样是 明确而稳定的结构。即蛋白质在其多肽链的不同 区段可形成不同的二级结构。
作用:赋予蛋白质较大的构象柔性,常构成蛋
白质的特定功能部位。
(三)超二级结构(supersecondary structure)和 结构域(domain)
H3N
C C R1
+
O C
H
H
+
H
C C R2
O O-
N
O-
H -H2O
H
+
H N C C
O O-
H3N
C
H R2 R1 peptide bone
Features of peptide bond
键长为0.132nm ,介于单键(键长为
0.147nm)与双键(键长为0.128nm) 之间。 具双键的性质,即不能旋转。
β-折叠的要点:
多肽链较伸展, 遇Cα发生折叠, R侧链交错 位于锯齿状(hackle)结构上下方; 两条或多条肽链片段平行排列,靠链间氢 键稳定构象(-CO和-NH) ; 两条肽链的走向可以是顺向平行或反向平 行(残基间距离前者为0.65nm,后者为 0.70nm)或混合排列。
-转角 ( -turn)
α-螺旋的要点:
一般为右手螺旋; 每个螺旋圈含3.6个氨基酸残基,螺距为 0.54nm; 螺旋圈之间通过氢键(aa1的C=O和aa4 的-NH之间)维持结构稳定; R侧链位于螺旋外侧,其大小、形状及 电荷等是影响此结构形成的主要因素。
例1
Hair α-keratin is an elongated aα-helix with somewhat thicker domains near the amino and carboxy termini. Pairs of these helices are interwound, probably in a lefthanded sense, to form two-chain coiled coils.
第二章蛋白质的组成及物理化学性质可编辑全文
(4)磷蛋白(phosphoprotein):含磷酸,如酪蛋白。 (5) 金属蛋白(metalloprotein):含金属,如铁蛋白含Fe。 (6) 血红素蛋白(hemoprotein):辅基为血红素,如血红蛋白 (7) 黄素蛋白(flavoprotein):辅基为黄素(FAD或FMN), 如琥珀酸脱氢酶(含FAD)。
在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和 阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电 中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。
R CH COOH NH2
R
+OH-
CH COOH
R
CH COO- +OH- R CH COO-
NH3+
+H+
NH3+
+H+
NH2
pH<pI
阳离子
pH=pI
氨基酸的兼性离子
4)谷醇溶蛋白(prolamine):不溶于水,但溶于 70%~80%乙醇, 如玉米醇溶蛋白。
5) 组蛋白(histone):溶于水及稀酸溶液,分子中含 Arg、Lys 较多,呈(弱)碱性,如小牛胸腺组蛋白。
6) 鱼精蛋白(protamine):溶于水及稀酸溶液,分子中 含碱性 氨基酸特别多,呈(强)碱性,如鲑精蛋白。
丙氨酸 alanine
H3C
CH CHCOOCH3 NH3+
缬氨酸
valine
CH3
HC CH2 CH3
CNHHC3+OO亮- 氨酸
leucine
H2C
CH CHCOO-
CH3 CH3 NH3+
异亮氨酸 isoleucine
第二章 蛋白质的结构与功能
第二节
蛋白质的分子结构
蛋白质是由许多氨基酸单位通过肽键连接起 来的,具有特定分子结构的高分子化合物。
蛋白质的分子结构可人为划分为一、二、三、 四级结构。除一级结构外,蛋白质的二、三、 四级结构均属于空间结构,即构象。
构象是由于有机分子中单键的旋转所形成的。 蛋白质的构象通常由非共价键(次级键)来维 系。
人胰岛素的一级结构
测定蛋白质的一级结构的主要意义: 一级结构是研究高级结构的基础。
可以从分子水平阐明蛋白质的结构与功 能的关系。 可以为人工合成蛋白质提供参考顺序。
二、蛋白质的空间结构
空间结构:指Pr分子内各原子围绕某些 共价键的旋转而形成的各种空间排布及 相互关系,称为Pr的构象。 主链构象 侧链构象
手性C原子:与α-C原子相连的四个 原子或基团各不相同。
L-α -氨基酸的结构通式
(三)氨基酸的分类 自然界存在的aa有300种,但作为 蛋白质基本单位的aa有20种,且 都有特异的遗传密码,为编码aa。
根据R侧链基团解离性质的不同,可将 氨基酸进行分类: 1.酸性侧链氨基酸——Glu,Asp;侧 链基团在中性溶液中解离后带负电荷 的氨基酸。
一、蛋白质的一级结构
1、概念: 蛋白质的一级结构是指蛋白质多肽链中通过肽 键连接起来的氨基酸的排列顺序,即多肽链的 线状结构。 2、 维系蛋白质一级结构的主要化学键为肽键 3、胰岛素(Insulin)由51个氨基酸残基组成, 分为A、B两条链。A链21个氨基酸残基,B链30 个氨基酸残基。A、B两条链之间通过两个二硫 键联结在一起,A链另有一个链内二硫键。
2、两性解离与等电点
A、aa是两性电解质:有碱性的-NH2 和酸性的-COOH B、等电点(PI): aa处于两性离子时溶液的PH值
第02章:蛋白质结构与功能(science ediion)
定义:多肽链中,从N端至C端的氨基酸 排列顺序。
主要化学健:肽键,二硫健
primary structure of bovine insulin
一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。
二、蛋白质的二级结构
Secondary structure refers to regularities in local conformations, maintained by hydrogen bonds between amide hydrogens and carbonyl oxygens of the peptide backbone. 定义:蛋白质分子中某一段肽链的局部空间 结构,也就是该段肽链主链骨架原子的相对空间 位臵,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。 主要化学键:氢键
8、参与凝血作用:凝血因子
三、氧化供能
蛋白质分解产生氨基酸,脱氨基作用产生 酮酸,可进入三羧酸循环,提供能量。
第一节 蛋白质的分子组成
The Molecular Component of Protein
The element composition of protein
1. main elements:C、H、O、N and S.
1、非极性疏水性氨基酸
甘氨酸
丙氨酸
缬氨酸
亮氨酸
异亮氨酸
脯氨酸
苯丙氨酸
甲硫(蛋)氨酸
色氨酸
2、极性中性氨基酸
丝氨酸
酪氨酸
谷氨酰胺
天冬酰胺
半胱氨酸
苏氨酸
3、酸性氨基酸
天冬氨酸
谷氨酸
4、碱性氨基酸
组氨酸
赖氨酸
精氨酸
含苯环的氨基酸
侧链含有硫元素的氨基酸
第二章讲义蛋白质的结构与功能
蛋氨酸 methionine Met M 5.74
天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41
谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65
苏氨酸 threonine
Thr T 5.60
目 录目录
3. 酸性氨基酸 4. 碱性氨基酸
天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97 谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22
高级 结构
目录
一、蛋白质的一级结构
定义: 蛋白质的一级结构指在蛋白质分子从N-端至
C-端的氨基酸排列顺序。 主要的化学键:
肽键,有些蛋白质还包括二硫键。
目录
一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能 的基础,但不是决定蛋白质空间构象的唯一因素。
目录
二、蛋白质二级结构
定义: 蛋白质分子中某一段肽链的局部空间
精品
第二章蛋白质的结构与功能
什么是蛋白质? 蛋 白 质 (protein) 是 由 许 多 氨 基 酸
(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连 形成的高分子含氮化合物。
目录
第1节 蛋白质的分子组成
The Molecular Component of Protein
目录
结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空 间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象 。
主要的化学键:氢键
目录
参与肽键形成的6个原子在同一平面上
参与肽键的6个原子C1、C、O、N、H、C2位于同一平 面,C1和C2在平面上所处的位置为反式(trans)构型,此同 一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元 (peptide unit) 。
(二)天然存在的活性肽
第二章蛋白质的结构与功能共10页
第二章蛋白质的结构与功能蛋白质(protein)是生命的物质基础。
种类繁多,人体含蛋白质种类在10万种以上。
是生物体含量最丰富的生物大分子,约占人体固体成分的45%,细胞干重的70%。
几乎所有的器官都含有蛋白质,并各自具有其特殊的结构,因而决定了蛋白质功能的多样性。
第一节蛋白质的分子组成(protein composition and construction )一、蛋白质的元素组成蛋白质的元素主要有碳(50%~55%)、氢(6%~7%)、氧(19%~24%)、氮(13%~19%)。
大部分蛋白质还含有硫,有的还含有少量的磷或铁、锰、锌、铜、钴、钼,个别还含有碘。
蛋白质元素组成特点:含氮量很接近,平均为16%。
1g氮相当于6.25g蛋白质。
测定出生物样品的含氮量可按下式计算出其蛋白质大致含量:100g样品中蛋白质含量(g%)=每克样品中含氮克数×6.25×100二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸(the basic unit of protein composition——amino acid)氨基酸(amino acid)是组成蛋白质的基本单位。
(一)氨基酸的命名(略)(二)氨基酸的结构特点自然界中的氨基酸有300余种,组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种。
都有相应的遗传密码,故又称为编码氨基酸。
氨基酸的结构通式可用下式表示(R为氨基酸侧链):虽然各种氨基酸结构各不相同,但都具有如下特点:1.组成蛋白质的氨基酸都是α-氨基酸。
即氨基均连在α-碳原子上。
脯氨酸为α-亚氨基酸。
2.除甘氨酸外,其余氨基酸的α-碳原子是不对称碳原子,有两种不同的构型,即L型和D型。
组成人体蛋白质的氨基酸都是L型,即L-α-氨基酸。
L-α-氨基酸 D-α-氨基酸(三)氨基酸的分类氨基酸的按侧链的结构和理化性质可分为4类:非极性侧链氨基酸:甘氨酸(Gly),丙氨酸(Ala),缬氨酸,亮氨酸,异亮氨酸,丙氨酸,脯氨酸(Pro);侧链为烃基、吲哚环或甲硫基等非极性疏水集团。
第二章蛋白质的结构与功能
第二章蛋白质的结构与功能一.教学基本要求在熟记蛋白质生理功能的基础上,论述蛋白质是生命活动的物质基础。
熟记蛋白质元素组成特点;多肽链的基本组成单位一—L—α氨基酸;20种氨基酸缩写符号、结构式及主要特点。
准确描述肽键、多肽链、蛋白质一级结构、高级结构概念。
结合实例论述蛋白质结构与功能的关系。
熟记蛋白质重要的理化性质及有关的基本概念,并列举蛋白质性质与医学的关系;结合蛋白质的性质,列举蛋白质分离纯化及测定方法。
知道多肽链氨基酸序列分析方法及关键试剂名称。
二.教材内容精要(一)蛋白质的生物学功能蛋白质是一切生命活动重要的物质基础,是构成生物体各种组织的主要有机成分。
人体中蛋白质含量丰富,约占固体成分的45%。
蛋白质具有多种多样的生物学功能:催化生物体内代谢反应的酶大多是蛋白质;调节代谢反应的某些激素是蛋白质;免疫球蛋白对机体具有防御保护功能;转运蛋白可在不同组织间载运代谢物;结构蛋白对生物体起支持和保护作用,还有运动蛋白、储存蛋白、甜味蛋白、抗冻蛋白等。
(二)蛋白质的分子组成1.蛋白质的元素组成组成蛋白质的元素主要有碳、氢、氧、氮和硫,有些蛋白质还含有少量磷和金属元素。
各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。
这与样品中蛋白质含量的测定有关。
2.蛋白质的基本组成单位——氨基酸L-α氨基酸是蛋白质的基本组成单位,常见者有20种。
按其侧链(R)的结构和理化性质可分为4类:①非极性、疏水氨基酸(非极性R基氨基酸);②极性、中性氨基酸(不带电荷的极性R氨基酸);③酸性氨基酸;④碱性氨基酸。
所有氨基酸都含有氨基(-NH2)能与质子(H+)结合而呈阳离子(-NH3+);又含有羧基(-COOH)能与羟基(-OH)结合失去质子而变成阴离子(-COO-),所以它是一种两性电解质,具有两性游离的特性。
在某一pH环境中,氨基酸游离成阳性离子及阴性离子的趋势相等,成为氨基酸的兼性离子。
兼性离子所带净电荷为零,在电场中不泳动。
第二章蛋白质的结构与功能
50
毛细血管的p(O2)约 为30 torr,肌红蛋白
Mb很快被饱和,代
谢活跃的细胞线粒体
80
p(O2)约1 torr(此 氧压下Mb约为25%
饱和),当肌肉收缩
引起线粒体氧压下降
23
24
蛋白质空间结构稳定的因素
主要是一些弱的相互作用或称非共价键, 包括静电相互作用(主要是盐键和范德 华力)、氢键、疏水作用。 共价二硫键在稳定某些蛋白质的构象方 面也起着重要作用。
25
26
蛋白质的变性与复性
天然蛋白质分子受到某些物理因素(如热、紫 外线照射、高压和表面张力等)或化学因素 (如有机溶剂、脲素、盐酸胍、酸、碱等)的 影响时,生物活性丧失,一些侧链基团暴露溶 解度降低,粘度增加,旋光和紫外吸收变化以 及其它的物理化学常数发生改变,这种过程称 为蛋白质变性。其实质为蛋白质分子中的次级 键被破坏,天然构象解体。变性不涉及共价键 的破裂,一级结构保持完好。
16
纤维状蛋白质可分为不溶性(硬蛋白)和可 溶性二类,前者有角蛋白、胶原蛋白和弹 性蛋白等; 后者有肌球蛋白和纤维蛋白原等,但不包 括微管(microtubule)、肌动蛋白细丝 (actin filament)或鞭毛( flagella),它 们是球状蛋白质的长向聚集体。
17
3、球状蛋白质与三级结构
氧通过血红蛋白从肺部转运到组织毛细 血管,然后从毛细血管扩散到组织中并 被肌红蛋白结合,肌红蛋白刺激O2迅速 扩散,氧化过程产生的CO2通过该转运 系统从肺部排出。
34
肌红蛋白和血红蛋白的结构
肌红蛋白的分子十分致密结实,含亲水 侧链的氨基酸残基几乎全分布于分子外 表面,而含疏水侧链的氨基酸残基几乎 都被埋在分子内部。 肌红蛋白由一条含153个氨基酸残基的多 肽链和一个辅基血红素构成。肌红蛋白 分子中多肽主链由长短不等的8段α螺旋 组成。分子中80%的残基处于α螺旋区 内。8段螺旋分别命名为A、B、C、D、 E、F、G、H。
蛋白质的功能及其结构基础
(三)解毒 解毒是细胞中不可缺少的一种自我保护机制。 过多的疏水性分子的积累也对细胞是有毒害 的。 针对蛋白质类型的毒素,解毒的方法是利用 蛋白酶将毒素降解;而对疏水的分子,则是 全然不同的解毒方法。最简单的方法是将疏 水性的分子转变为水溶性分子,便于细胞和 机体的清除和排出。将疏水分子转化为水溶 性分子,可以有多种途径。
2.低等动物的防卫系统 抗菌肽是低等生物的防卫系统之一。这类 抗菌肽可以使一些细胞膜溶解。 在很多低等生物的血淋巴液中没有细胞免 疫的机制,但是含有简单的凝集素,这些 凝集素起到类似于高等动物先天免疫的作 用。其中有些凝集素的结构与高等动物的C 类凝集素有同源性。
3.植物免疫 植物没有动物的免疫系统,但是植物也能自 我防卫和保护。在受到外界的各种刺激时, 不论是生物的还是非生物的,植物都可以通 过细胞质中的信号转导过程,诱导多种类型 的基因表达,从而产生多种酶系和多种蛋白 质。这些酶系被用于合成各种类型的小分子, 对外界刺激作出应答;多种蛋白质中有所谓 的病程相关蛋白,以及针对并干扰动物病原 体的几丁质酶和蛋白酶抑制剂等。
(四)其他 在北冰洋生活的一些鱼类,它们的血液中存 在着抗冻蛋白质。这些蛋白质的分子质量并 不小,但是,这些蛋白质能引起的冰点下降 的能力远远超过了物理化学中的依数性。一 些结构不同的蛋白质却具有相同的抗冻能力。 微生物和一些昆虫多药物和农药的抗性,也 是一种自我防卫和保护。主要通过其体内经 诱导产生的能降解和改变药物和农药特性的 酶。
(二)免疫 免疫是几乎所有生物体都具备的功能,不仅 动物有免疫系统,而且植物也有免疫系统。 免疫的含义被拓展了,机体对外界感染和刺 激的应答,对环境变化的防范均可归属于免 疫的范畴。 1.高等动物免疫系统 高等动物的免疫系统大致可分为体液免疫和 细胞免疫两个部分。 体液免疫以补体为中心。 细胞免疫以淋巴细胞为中心。这种免疫系统 更高级,具有“记忆”特性。
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二、氨基酸的性质和生理特点 (一)性质 1.物理性质 无味、无色晶体物质; 熔点200-300oC之间,会分解成胺和CO2; 具有较高的介电常数; 一般可溶于水,其水溶液为无色透明液体, 溶解度各不相同; 一般不溶于有机溶剂; 均溶于稀酸或稀碱。
2.氨基酸的晶体存在形式
氨基酸晶体是以离子晶格组成的,维系晶 格中质点的作用力是较强的静电吸引力,因而 熔点高,而一般的有机化合物晶体是由分子晶 格组成,其维系力为较弱的范德华力,此类物 质熔点较低。
蛋白质功能的多样性
• 具有储藏氨基酸的功能。用作有机体及其胚胎 或幼体生长发育的原料。如蛋类中的卵清蛋白、 乳中的酪蛋白、小麦种子中的麦醇蛋白。 • 运输功能。脊椎动物红细胞里的血红蛋白、无 脊椎动物中的血蓝蛋白在呼吸过程中起着输送 氧气的作用;血液中的脂蛋白随血流输送脂质; 生物氧化过程中的某些色素蛋白如细胞色素C 等起电子传递体的作用。
• • • • 氨基酸排列随机性 周期性的重复未发现 二硫键的数目和位置也没有明显的规律 每种蛋白质化学结构的独特性 在同源蛋白质氨基酸顺序中有许多位置的氨基 酸对所有种属来说是相同的(不变残基),但 其他位置的氨基酸却不同(可变残基)。这种 相似性被称为顺序同源现象。
蛋白质一级结构的重要性
氨基酸组成及顺序不同会导致蛋 白质生物功能的改变(病态现象)。如 镰刀形细胞贫血病就是血红蛋白(4个 亚基,582个氨基酸组成)中的一个谷 氨酸变为缬氨酸导致的。 一级结构是立体结构的基础。
在研究蛋白质氨基酸组成时一般先用完全 水解的方法,将蛋白质水解成各种氨基酸的 混合物,然后采用高效液相色谱等方法进行 定量测定。通常采用的水解方法有酸水解、 碱水解和酶水解。
酸水解
用硫酸(6 mol/L)或盐酸(4 mol/L)煮沸回流20小时。
• 优点:不引起消旋作用,得到L型氨基酸。 • 缺点:色氨酸完全被破坏;羟基氨基酸 (丝氨酸和苏氨酸)有一小部分被分解; 天冬酰胺和谷胺酰胺的酰胺基被水解生 成天冬氨酸和谷胺酸。
由于肽键是共振杂化体,肽键的四个 原子和两个相连的α碳原子处于同一平面 (肽平面)。肽平面内C=O与N-H呈反 式排列,各原子间的键长和建角固定,而 C α-N1和C α-N2单键可自由旋转。 绕C α-N1旋转的角度为Φ,绕C α-N2 旋转的角度为ψ,所有构象均能用此二面角 来描述
由于空间位阻的作用,以及使暴露溶 剂中的疏水基团降低最小程度的作用,使 得二面角不能任意取值,通常存在着一种 天然构象,在热力学上,此时相当于一个 具有最低自有能△G的稳定的体系。这一 构象和侧链R的极性、疏水性及空间位阻 紧密相关。
1. 按化学结构分类:脂肪族氨基酸(3)
• 含酰胺基氨基酸 天冬酰胺;谷胺酰胺 • 含一氨基二羧基的酸性氨基酸 天冬氨酸( α-氨基丁二酸) 谷氨酸( α-氨基戊二酸) • 含二氨基一羧基的碱性氨基酸 赖氨酸( α,ε-二氨基己酸) 精氨酸( α-氨基-δ-胍基戊酸)
1. 按化学结构分类:芳香族氨基酸 • 苯丙氨酸( α-氨基-β-苯基丙酸)
2. 按R基极性分类:不带电荷的极性R基 • 甘氨酸;丝氨酸;苏氨酸;半胱氨酸; 酪氨酸;天冬酰胺;谷胺酰胺
2. 按R基极性分类:带正电荷的R基 • 赖氨酸;精氨酸;组氨酸
2. 按R基极性分类:带负电荷的R基 • 天冬氨酸;谷氨酸
几个概念
• 必须氨基酸(8种)? 缬氨酸;亮氨酸;异亮氨酸;苏氨酸; 色氨酸;苯丙氨酸;赖氨酸和蛋氨酸。 • 半必须氨基酸(2种)? 组氨酸和精氨酸。 • 完全蛋白质和不完全蛋白质?
• 作为接受和传递信息作用的受体,如视网膜上 的视色素、味蕾上的味觉蛋白。 • 调节或控制细胞的生长、分化和遗传信息的表 达,如组蛋白等。
生物界蛋白质的种类是很多的,估计在 1010-1012数量级。造成蛋白质生物功能多样性 和种属特异性的原因在于其结构特点
目前各种生物体中发现的氨基酸有180多 种,但构成蛋白质的氨基酸常见的有20种。
第二章 蛋白质的结构及生理功能
蛋白质是一类重要的生物大分子,英文为 Protein,字源出希腊文,为“最初的”;“第一重 要的”意思。 蛋白质之所以显得如此重要主要是因为 它在生物体内所占的特殊地位决定的:蛋白质 和核酸是构成细胞内原生质(protoplasm)的 主要成分,而原生质是生命现象的物质基础。
由于解离能力的不同,使得溶液中正 离子和负离子的量是不等的。所以中性氨 基酸的pH值不等于7,一般略小于7,其等 电点小于7;酸性氨基酸的等电点小于7; 碱性氨基酸的等电点大于7。
当pH值大于等电点时,氨基酸带净负 电荷,在电场中将向正极移动。 当pH值低于等电点时,氨基酸带净正 电荷,在电场中将向负极移动。 在等电点条件下,净电荷为0,此时在 电场中不向任何一极移动。由于不带电荷, 分子间容易聚集成大分子而沉淀出来,此 时溶解度最小。
蛋白质功能的多样性 • 某些蛋白质如肌纤维中的肌球蛋白和肌 动蛋白是肌肉收缩系统的必要成分。 • 具有激素的功能。对新陈代谢起调节作 用,如胰脏兰氏小岛细胞分泌的胰岛素 参与血糖的代谢调节,降低血液中葡萄 糖的含量。 • 高等动物的免疫反应也是通过蛋白质来 实现的,如抗体或免疫球蛋白。
蛋白质功能的多样性
• 酪氨酸( α-氨基-β-对羟苯基丙酸)
1. 按化学结构分类:杂环族氨基酸 • 色氨酸( α-氨基-β-吲哚基丙酸)
• 组氨酸( α-氨基-β-咪唑基丙酸)
• 脯氨酸( 吡咯啶- α-羧酸)
2. 按R基极性分类:非极性R基 • 丙氨酸;缬氨酸;亮氨酸;异亮氨酸; 脯氨酸;苯丙氨酸;色氨酸;蛋氨酸
蛋白质功能的多样性
• 最重要的生物学功能是作为机体新陈代谢的催 化剂--酶。生物体各种化学反应几乎都是在 酶参与下进行的。 • 作为机体的结构成分。高等动物里,胶原纤维 是主要的细胞外结构蛋白,参与结缔组织和骨 骼作为身体的支架。细胞内的片层结构如细胞 膜、线粒体、叶绿体和内质网等都是由不溶性 蛋白质与脂质组成的。
这些氨基酸构成蛋白质时,数量的不同、 排列顺序的不同及二、三、四级结构的不同 决定了蛋白质的种属特异性和功能多样性。
第一节 蛋白质的基本单位-氨基酸
对于蛋白质的化学研究早在100多年 前就开始了。氨基酸是蛋白质的基本组 成单位,也是蛋白质水解的最终产物。
蛋白质组成:指某种蛋白质含有全部氨基酸 的种类及各种类氨基酸的相对含量。
肽键中的四个原子和两个α碳处于同一个 平面中,仅α碳的简单共价键能自由转动。
肽键的平面性在肽链折叠成三维构想 的过程中起着重要的作用。 在肽平面内,两个α碳可以顺式也可 以反式。顺式构型中,由于R基之间的空 间位阻,不稳定,两者相差8 kJ/mol,因 而均为反式(脯氨酸除外)。
蛋白质一级结构的特点
1. 按化学结构分类:脂肪族氨基酸(1) • 含一氨基一羧基的中性氨基酸 甘氨酸(氨基乙酸) 丙氨酸(α-氨基丙酸) 缬氨酸( α-氨基异戊酸) 亮氨酸( α-氨基异己酸) 异亮氨酸( α-氨基-β-甲基戊酸)
1. 按化学结构分类:脂肪族氨基酸(2) • 含羟基氨基酸 丝氨酸( α-氨基-β-羟基丙酸) 苏氨酸( α-氨基-β-羟基丁酸) • 含硫氨基酸 半胱氨酸( α-氨基-β-巯基丙酸) 甲硫氨酸或蛋氨酸( α-氨基-γ-甲硫 基丁酸)
此外,介电常数与电解质分子的极性结构 有关。极性分子的介电常数高,非极性分子的 介电常数低,而偶极离子形式的氨基酸是强极 性分子,因而可增大水的介电常数。如20oC时, 水的ε为80,而1M浓度的α-氨基酸的ε为102- 108。
3.氨基酸的两性(水溶液中的存在形式)
依照Bronsted-Lowry的酸碱质子理论: 酸是质子的供体,碱是质子的受体。因此, 氨基酸属于两性电解质。
碱水解
• 用5 mol/L的NaOH共煮10-20小时。
• 优点:色氨酸稳定。 • 缺点:多数的氨基酸受到不同程度的破 坏,并产生消旋现象,产物为D型和L型 氨基酸的混合物。
酶水解
• 利用酶的作用切断肽键。 • 优点:不产生消旋作用;不破坏氨基酸;反应 条件温和。 • 缺点:一种酶的作用不够彻底,需要几种酶协 同作用才能达到完全水解的目的;反应时间较 长。 酶法水解多用于部分水解。
(二)二级结构
蛋白质的二级结构是指多肽链中有规则 重复的构象。
氢键是维系二级结构的主要作用力。
构型和构象的区别
• 构型(configuration):立体异构体中取代 原子或基团在空间的取向。 • 构象(conformation):指这些取代基团当 单键旋转时可能形成的不同的立体结构。
多肽链的共价主链形式上都是单键,可 以设想形成许多构象,并且由于热运动, 任何一种特定的构象还将发生不断的变化, 然而在生物体正常的温度和pH条件下,蛋白 质多肽链只有一种或很少几种构象。这种天 然构象保证了它的生物活性,并且相当稳定。 说明单键不是自由旋转,多肽链折叠存在空 间限制。
第二节蛋白质的结构和性质
一、蛋白质的结构 (一)蛋白质的一级结构 1969年,国际纯化学和应用化学协会 规定蛋白质的一级结构只指肽链中的氨 基酸顺序。
氨基酸的基本连接方式为肽键
目前已知最短的蛋白质链含有20-100个 氨基酸,而大多数为100-500个,有的达 数千个。
在一级结构中,主要是共价键,故一级 结构也叫共价结构。除肽键外,两个半光氨 酸残基的侧链间能形成二硫键(二硫桥), 它可以使两条单独的肽链共价交联起来或使 一条链的某一部分形成环(链内二硫键)。
氨基酸的光吸收性
• 色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸分别在278、 274.5和260nm处具有最高吸光度。 • 其他氨基酸在远紫外区210nm处有吸光度。 因此可利用分光光度法来测定氨基酸 和蛋白质的含量。
(二)生理特点 1.氨基酸不能储留 大部分氨基酸在人体内不能储存, 随着消化会很快降解(赖氨酸除外),如 不及时合成蛋白质,则会转化为看作是一种酰胺键,它通过两个 中介形式的共振而得到稳定。