蛋白质分子基础习题
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蛋白质分子基础习题
第一章
1 根据蛋白质的化学组成和溶解性可把蛋白质分成哪几类?
按组成成分分类
1.单纯蛋白质蛋白质组分中只含有α-氨基酸。天然蛋白质大多属于此类。
2.缀合蛋白质如前所述,此类蛋白由单纯蛋白质与称做辅基的非蛋白物质结合而成。根据辅基不同,又可分为核蛋白、色蛋白、糖蛋白、脂蛋白、磷蛋白和金属蛋白等。
3.在缀合蛋白质中都是以蛋白质为其主体成分,各种辅基为其次要组成。
按溶解度分类
1.可溶性蛋白质可溶性蛋白质是指可溶于水、稀中性盐和稀酸溶液。
2.醇溶性蛋白质一类不溶于水而溶于70%~80%乙醇的蛋白质。
3.不溶性蛋白质此类蛋白质既不溶于水、稀盐溶液,也不溶于一般有机溶剂
2 按疏水性质可把20种普通氨基酸分为几类?
可分为疏水性氨基酸和亲水性氨基酸两类
但Gly由于R基为-H,划分时既可以算作疏水性氨基酸又可以划到亲水性氨基酸里
3 写出20种氨基酸的一个字母代表符号?
甘氨酸:G;丙氨酸:A;缬氨酸:V;亮氨酸:L;异亮氨酸:I;苯丙氨酸:F;
脯氨酸:P;色氨酸:W;丝氨酸:S;酪氨酸:Y;半胱氨酸:C;蛋氨酸:M;
天冬氨酸:N;谷氨酰胺:Q;苏氨酸:T;天冬氨酸:D;谷氨酸:E;赖氨酸:K;
精氨酸:R;组氨酸:H
第二章
1 蛋白质的哪些性质可以用于蛋白质的分离纯化?
答:根据蛋白质分子大小不同;溶解度不同;电荷不同和蛋白质的选择吸附等性质分离纯化蛋白质
2 蛋白质纯化方法有几种类型?依据是什么?
答:常用的纯化方法有:1.凝胶过滤层析:利用一定大小孔隙的具有网状结构的凝胶作层析介质,根据被分离物质的分子大小、形状不同扩散到凝胶孔隙内的速度不同,因而通过层析柱的快慢不同而分离的一种层析法;2.离子交换纤维素层析:根据离子所带电荷的不同进行分离;3.亲和层析:利用分子与其配体间特殊的、可逆性的亲和结合作用而进行分离的一种层析技术。
3 蛋白质分离、纯化的一般步骤是什么?提纯过程中要注意哪些问题?
答:一般步骤:(一)材料的预处理及细胞破碎(破碎方法:1. 机械破碎法,2. 渗透破碎法3. 反复冻融法4. 超声波法5. 酶法);(二) 蛋白质的抽提;(三)蛋白质粗制品的获得(1. 等电点沉淀法2. 盐析法3. 有机溶剂沉淀法);(四)样品的进一步分离纯化
注意问题:蛋白质维持在一定浓度范围;有合适的pH以及温度;使用蛋白酶抑制剂,防
止蛋白酶对目标蛋白的降解;避免样品反复冻融和剧烈搅动,以防蛋白质的变性;防止蛋白质的氧化;使用灭菌溶液,防止微生物生长。
4 破碎细胞的常用方法有哪些?制备细胞抽提液时要注意什么问题?
答:有物理法(超声法、高压分散法和反复冻融法,适用于实验室规模制备),机械法(高速组织分散器和匀浆器,适用于组织中提取)和化学法(酶解法分解细胞壁和表面活性剂处理法破坏细胞壁,适用于(基因工程)实验室规模和大规模生产);
注意问题:1.提取液的选择(1.蛋白质类可用水抽提2.球蛋白类蛋白质用稀盐溶液3.脂蛋白用稀的去垢剂或有机溶剂);2.增加蛋白质提取量的措施(1.采用合适的缓冲体系2.抑制蛋白水解酶3.低温,0—4℃)3.抽提的原则:少量多次
5 层析方法有哪几种?各种层析方法的基本原理是什么?操作的一般步骤是什么?影响层析分辨率和回收率的因素有哪些?各种层析法的优缺点是什么?
答:层析方法:离子交换层析,凝胶过滤层析和亲和层析
6 电泳有几种类型?有何应用?电泳法的使用范围是什么?等电聚焦和聚焦层析有何异同?什么是Western blotting,有何应用?
答:按电泳的原理来分,可分为二类:自由界面电泳和区带电泳;区带电泳又分为
1.纸电泳;用滤纸作为支持介质,多用于核苷酸的定性定量分析
②醋酸纤维素薄膜电泳;医学上,常用于分析血清蛋白、胎盘球蛋白,其优点是简便迅速,便于保存照相,比纸电泳分辨率高。
③淀粉凝胶电泳;多用于同工酶分析
④琼脂糖凝胶电泳:用于核酸的分离分析
⑤聚丙烯酰胺凝胶电泳:可用于核酸和蛋白质的分离、纯化及检测。
7 什么是高效毛细管电泳?它的操作形式有哪些?为什么火箭免疫电泳可以定量测定蛋白质?
8 蛋白质结晶的基本原理是什么?结晶方法有哪些?如何选择最佳结晶条件?
9 有哪些方法可用于蛋白质纯化的鉴定?其局限性是什么?蛋白质的纯度标准是什么?
答:方法:层析法,电泳法,蛋白质末端分析法,总氨基酸分析法,分光光度法,利用蛋白质的特殊功能分析
10 大规模纯化蛋白质时常采用什么方法?与常规实验室操作有什么不同?适用于大规模
操作的层析技术有哪些?为什么说膜固定pH梯度等电聚焦法适于大规模提纯蛋白质?
11 A、B、C3种蛋白质的等电点分别是9.0、8.0、4.0,将这3种蛋白质混合在一起,上到
CE-Sepharose Fast Flow阳离子交换柱上,采用0.05mol/L,柠檬酸缓冲液(pH0.5)平衡吸附,请问,在此条件下,哪些蛋白质不被吸附,被吸附的蛋白质中哪种先被盐溶液(1mol/L NaCl梯度)洗下来,为什么?
12 测定蛋白质浓度的方法有几种,它们的优缺点是什么?操作中应当注意哪些问题?
答:定氮法,双缩尿法(Biuret法)、Folin-酚试剂法(Lowry法)和紫外吸收法。考马斯亮蓝法(Bradford法)。
凯氏定氮灵敏度低,适用于0.2~ 1.0mg氮,误差为±2%费时 8~10小时将蛋白氮转化为氨,用酸吸收后滴定非蛋白氮(可用三氯乙酸沉淀蛋白质而分离)用于标准蛋白质含量的准确测定;干扰少;费时太长
双缩脲法(Biuret法)灵敏度低 1~20mg 中速 20~30分钟多肽键+碱性Cu2+®紫色络合物硫酸铵;Tris缓冲液;某些氨基酸用于快速测定,但不太灵敏;不同蛋白质显色相似
紫外吸收法较为灵敏 50~100mg 快速 5~10分钟蛋白质中的酪氨酸和色氨酸残基在280nm处的光吸收各种嘌吟和嘧啶;
Folin-酚试剂法(Lowry法)灵敏度高~5mg 慢速 40~60分钟双缩脲反应;磷钼酸-磷钨酸试剂被Tyr和Phe还原硫酸铵;Tris缓冲液;甘氨酸;
各种硫醇耗费时间长;操作要严格计时;颜色深浅随不同蛋白质变化
考马斯亮蓝法(Bradford法) 灵敏度最高 1~5mg 快速5~15分钟考马斯亮蓝染料与蛋白质结合时,其lmax由465nm变为595nm 强碱性缓冲液;
SDS 最好的方法;干扰物质少;颜色稳定;颜色深浅随不同蛋白质变化
第三章
1 蛋白质序列分析的基本战略和一般方法步骤是什么?
答案:基本战略两种或两种以上的特异性裂解法逐级进行特异性裂。步骤:测定多肽链的数目,拆分多肽链,断开多肽链内的二硫键,测定每一肽链的氨基酸组成,鉴定多肽链的N-末端和C-末端,裂解多肽链为较小的肽段,测定各肽段的氨基酸序列,利用重叠肽重建完整多肽链的一级结构,确定二硫键的位置。
2 氨基酸定量分析中,为什么不用紫外分光光度计直接测量,而要用茚三酮显色?色氨酸的含量测定为什么要用特殊方法?
答案: 因为氨基酸分析时,一般是将它溶解在水中,而水在230nm附近有很多干扰吸收收,所以在用紫外可见分光光度计对氨基酸分析检测时有干扰。此外,还需注意:只有少数氨基酸