常见的通用引物序列
载体通用引物序列
5'-GGC AAC TAG AAG GCA CAG TC-3'
PCDNA3.1F
5'-CTA GAG AAC CCA CTG CTT AC-3’
PCDNA3.1R
5'-TAG AAG GCA CAG TCG AGG-3’
pCEP Frorward
5'-AGC AGA GCT CGT TTA GTG AAC CG-3'
P31430
5'-CGT TTT AAAACCTAAGAGTCAC-3'
P12584
5'-TTT TCA GTA TCT ACG AT-3’
P17110
5'-TAC CAC TAC AAT GGA TG-3’
PAS2-1F
5'-TCA TCG GAA GCG AGT AG-3'
PAS2-1R
5'-CGT TTT AAA ACC TAA GAG TCA C-3'
PQE30R
5'-GTT CTG AGG TCA TTA CTG G-3'
pTARGET-SEQ
5'-TTA CGC CAA GTT ATT TAG GTG ACA-3’
PTRC99C-F
5'-TTG CGC CGA CAT CAT AAC-3’
PTRC99C-R
5'-CTG CGT TCT GAT TTA ATC TG-3’
PEGFP-C-3’
5'-TAT GGC TGA TTA TGA TCA GT-3'
PEGFP-C-5’
5'-CAT GGT CCT GCT GGA GTT CGT G-3'
犬瘟热鉴定pcr引物标准
犬瘟热鉴定pcr引物标准一、概述犬瘟热是一种常见的犬类传染病，严重影响犬类的健康和生命。
为了更好地进行犬瘟热的诊断和治疗，我们制定了这个PCR引物标准。
本标准规定了PCR检测所需的引物，以保证犬瘟热检测的准确性和可靠性。
二、引物选择犬瘟热PCR检测需要选择合适的引物，以保证检测的准确性和特异性。
本标准引物选择的原则是：根据犬瘟热病毒的基因组序列，选择特异性高、灵敏度好的引物。
引物长度、GC含量、Tm值等参数也需要符合要求。
三、引物序列本标准引物序列如下：正向引物：5’-GCG AGT GAT CCT TTC ACG TTC-3’反向引物：5’-TGG CTT CCC TGA GAT CCG GTA-3’四、PCR反应体系本标准推荐的PCR反应体系为25μL，包括以下成分：1. 正向引物（μM）：0.52. 反向引物（μM）：0.53. dNTPs（各mol/L）：0.24. MgCl2（mmol/L）：25. PCR缓冲液（10×）：2.56. 模板DNA（ng/μL）：50-1007. 无菌水：18.75μL五、PCR反应条件本标准推荐的PCR反应条件为：95℃预变性5分钟；95℃变性30秒，60℃复性30秒，72℃延伸30秒，共进行40个循环；最后在72℃延伸5分钟。
具体条件可以根据实际情况进行调整。
六、结果判定PCR产物可以通过琼脂糖凝胶电泳进行检测。
当出现清晰的目标条带，且与预期大小一致，可判定为阳性。
若未出现目标条带，可判定为阴性。
若需进一步确认，可进行克隆和测序。
七、质量控制为了保证PCR检测的准确性和可靠性，需要进行严格的质量控制。
包括但不限于以下措施：选择合适的试剂和耗材、进行室内和室间质量评价、定期对仪器设备进行校准和检测等。
八、注意事项1. 引物浓度和退火温度需要根据具体情况进行调整，以保证最佳检测效果。
2. 样品需要经过适当的前处理，以保证最佳的PCR反应效果。
3. 避免非特异性扩增，可以通过增加退火温度、延长循环时间等方法来减少非特异性产物。
基因测序(一代测序和二代测序)-用于临床疑难病原体鉴定精选全文
（一）难鉴定细菌真菌一代测序方法
细菌核糖体基因结构特征
➢ 16S rRNA编码基因约1500 bp，包含约50个功能域。 ➢ 为细菌分类的金标准，由可变区和保守区组成。 ➢ 保守区为细菌共有，可变区有属或种特异性。
真菌核糖体基因结构特征
➢ 18S RNA基因、5.8S rDNA、28S RNA基因较保守， 不适合区分不同属种。
➢诊断不清、治疗 无效、束手无策
二代测序案例分析
➢48小时 ➢完成脑脊液标本二代测序
➢ 提示钩端螺旋体感染 ➢475条序列，占比0.016% ➢改用青霉素治疗
➢32天 ➢男孩痊愈出院
二代测序案例分析
共得到序列数 3,063,784
二代测序过程 PCR扩增选择 性，可丢失大 量病原体片段
二代测序案例分析
➢ 1个样品3000元以上。
二代测序流程
样本收集 保存转运
RNA病毒 也可建库
二代测序 百万序列
7000种病 原体分析
区分致病 菌污染菌
华大基因二代测序可检测病原体近 7000种
可检测病原种类 细菌 真菌 病毒
寄生虫 分枝杆菌（结核和非结核）
支原体/衣原体
种类数量/种 2328 199 4189 135 83 41
病毒有DNA病毒和RNA病毒之分，如怀疑流感病毒、呼吸道合 胞病毒、冠状病毒等RNA病毒，需要注意送检RNA检测流程。
迅敏康IngeniGen公司二代测序可检 测病原体14000多种
可检测病原种类 细菌 真菌 病毒
寄生虫 分枝杆菌（结核和非结核）
衣原体 支原体 立克次氏体
种类数量/种 5682 812 7098 138 94 85 96 90
➢ 间隔区ITSl、5.8S rDNA和间隔区ITS2 在不同真 菌属及种间表现出较高的差异，目前已用于真菌 分类鉴定和分子检测，以ITS2应用最广泛。
常见的通用引物序列
5’TGCTAGTTATTGCTCAGCGG3'
S.TAG
5’CGAACGCCAGCACATGGACA3’
T3
5'ATTAACCCTCACTAAAGGGA3’
M13F（47）
5'CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC3’
M13R（48)
5'AGCGGATAACAATTTCACACAGGA3'
TGC GTA CTG CGG TGA TCA AC
P3'
CTG CAA GGC GAT TAA GTT GG
DuetDOWN1
5’-GATTATGCGGCCGTGTACAA-3'
PET Upstream
ATG CGT CCG GCG TAG AGG AT
DuetUP2
5'-TTGTACACGGCCGCATAATC-3’
PTRCHISAF
5’CAT GGT ATG GCT AGC ATG AC3’
PTRCHISAR
5'CAG GCT GAA AAT CTT CTC TC3'
pDC316 F
5’ —TAA CTT GTT TAT TGC AGC —3'
pDC316 A
5' -TAT GCT TAC CGT AAC TTG -3'
PEFF
5' TCA AGC CTC AGA CAG TGG TTC3’
PCEPF
5’ AGA GCT CGT TTA GTG AAC CG3’
EBVR
5’ GTG GTT TGT CCA AAC TCA TC3’
CMVF
5'CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG3'
pet28a通用引物序列
pet28a通用引物序列
Pet28a 是一种常用的原核高效表达载体，通常用于大肠杆菌中表达融合蛋白。
为了在大肠杆菌中克隆 Pet28a 载体上的特定基因，需要使用 Pet28a 的通用引物。
Pet28a 的通用引物是 T7 正向和反向引物。
T7 正向引物通常位于基因的上游区域，用于向载体的 DNA 序列中引入 T7 启动子，以便在宿主细胞中的表达。
T7 反向引物通常位于基因的下游区域，用于向 DNA 序列中引入终止子，以便在表达过程中产生合适的肽链。
Pet28a 通用引物的序列如下:
- T7 正向引物:5"-CTAAGTAACATAAGGAGAAGGAGAA-3"
- T7 反向引物:5"-CTAAGGAAAAAAGAAAAACTGA-3"
请注意，这些引物只能在特定的细菌中使用，并且应该在进行克隆之前进行优化。
通用引物的名词解释
通用引物的名词解释导语：在现代生物学研究中，通用引物是一种常用的实验方法，用于特定基因或DNA区域的扩增和分析。
本文将对通用引物进行详细的名词解释，探讨其在研究中的应用，并讨论其发展和未来的潜力。
一、引物的概念和作用引物是指在DNA复制和扩增过程中的一对短片段，通常为20-30个碱基，用于在特定DNA序列的两端进行扩增。
引物可以与目标DNA互补配对，从而引导DNA聚合酶生成新的DNA链。
在分子生物学研究中，引物是重要的试剂，其作用主要有两方面：1. 扩增特定DNA区域：引物通过与目标DNA互补配对，在聚合酶的作用下，使目标DNA区域的复制倍增。
这为后续的测序、基因突变检测、DNA指纹分析等提供了基础。
2. 分析目标DNA序列：通用引物可与多个物种中保守的DNA区域结合，从而用来鉴定、分析不同物种间的亲缘关系、分类等问题。
二、通用引物的定义通用引物是能够与多个物种中保守的基因或DNA区域结合的引物。
它们在分子生物学领域被广泛使用，以解决不同物种、不同遗传变异情况下的DNA扩增和分析难题。
通用引物一般是设计基于已知基因序列的，以确保高特异性和敏感性。
三、通用引物的设计方法通用引物的设计主要基于以下几个原则：1. 保守性：引物要选择在多个物种中高度保守的基因区域或DNA序列。
这样可以确保引物在不同物种中的特异性扩增。
2. 特异性：引物在目标DNA中的互补序列应尽可能唯一，以避免与非目标DNA区域结合。
这样可以消除杂交反应，提高扩增的特异性。
3. 长度和碱基组成：一般来说，通用引物的长度应在20-30个碱基之间，而碱基组成应平衡，避免G-C含量过高或过低。
四、通用引物的应用通用引物在科研和实验室研究中有广泛的应用，涵盖了生命科学的各个领域，如遗传学、进化生物学以及种群生态学等。
1. 物种鉴定和分类：通用引物广泛应用于物种鉴定和分类，通过特定引物扩增保守的DNA区域，可以鉴定物种间的亲缘关系和进化关系。
2. 突变检测和基因分型：通用引物在疾病和遗传变异研究中起着重要作用。
常用引物序列
常用引物序列引言引物序列是指在分子生物学实验中用来特异性引导DNA或RNA复制和扩增的短链核酸序列。
常用的引物序列在科研和实验室工作中起着重要作用。
本文将介绍几种常用引物序列及其在实验中的应用。
1. 通用引物序列通用引物序列是指适用于多种物种的引物序列。
常见的通用引物序列包括16S rRNA引物序列用于细菌和古细菌的分析，18S rRNA引物序列用于真核生物的分析，以及ITS引物序列用于真菌的分析。
这些通用引物序列具有高度保守性，可以用于不同物种的物种鉴定和进化分析。
2. 物种特异引物序列物种特异引物序列是指只在特定物种中存在的引物序列。
这些引物序列通常用于物种鉴定和种群遗传分析。
例如，人类特异引物序列可以用于人类DNA的特异扩增，从而进行人类个体的鉴定。
物种特异引物序列的选择和设计需要根据目标物种的基因组序列进行。
3. 定量引物序列定量引物序列是指用于定量PCR实验的引物序列。
这些引物序列通常与目标基因的外显子区域相结合，可以通过PCR扩增目标基因的特定片段，并通过实时荧光定量PCR技术进行定量分析。
定量引物序列的设计需要考虑引物的特异性和扩增效率，以确保准确的定量结果。
4. 荧光标记引物序列荧光标记引物序列是指在引物序列上加入荧光标记分子，用于检测和定量特定基因的表达水平。
常用的荧光标记引物序列包括荧光探针和荧光引物。
荧光标记引物序列可以通过荧光定量PCR或原位杂交等技术进行检测。
5. 反向引物序列反向引物序列是指用于反转录PCR实验的引物序列。
反转录PCR是一种将RNA转录成cDNA的技术，常用于研究基因的表达调控和mRNA的定量分析。
反向引物序列通常与反向转录酶结合，将RNA逆转录成cDNA，并通过PCR扩增特定基因的cDNA片段。
6. 基因特异引物序列基因特异引物序列是指用于特定基因扩增的引物序列。
这些引物序列通常与目标基因的外显子区域相结合，可以选择性地扩增目标基因，从而进行基因型鉴定和基因表达分析。
RT-PCR常用引物序列
RT-PCR常用引物序列RT-PCR引物序列基因来源引物序列产物大小（kb）β-actin 人有意义链CCTCG CCTTT GCCGA TCC 反义链GGATC TTCAT GAGGT AGTCA GTC 0.62 kbβ-actin* 大鼠有意义链TACAA CCTCC TTGCA GCTCC 反义链GGATC TTCAT GAGGT AGTCA GTC 0.62kbβ-actin 小鼠有意义链GTCGT ACCAC AGGCA TTGTG ATGG反义链GCAAT GCCTG GGTAC ATGGT GG 0.49 kbGAPDH 人有意义链 GGTGA AGGTC GGAGT CAACG反义链CAAAG TTGTC ATGGA TGHACC 0.50kbGAPDH 大鼠有意义链GATGC TGGTG CTGAG TATGR CG反义链GTGGT GCAGG ATGCA TTGCT CTGA 0.20 kbDynein 小鼠有意义链 GCGGG CGCTG GAGGA GAA反义链GGATC TTCAT GAGGT AGTCA GTC 12.3 kbPolymerase ε人有意义链CGCCA AATTT CTCCC CTGAAA反义链CCGTA GTGCT GGGCA ATGTT C 6.8 kbPolymerase ε人有意义链 AAGGC TGGCG GATTA CTGCC反义链GATGC TGCTG GTGAT GTACT C 3.5 kbTuberous Sclerosis 人有意义链GGAGT TTATC ATCAC CGCGG AAATA CTGAG AG反义链TATTT CACTG ACAGG CAATA CCGTC CAAGG 5.3 kb18S rRNA 大豆有意义链CTTTC GATGG TAGGA TAGTG GCCT反义链CAATG ATCCT TCCGC AGGTT CACCT AC 1.5 kb*引物不会扩增假基因PCR引物序列基因来源引物序列产物大小（kb）HIV gag region 病毒 SK 38ATTAAT CACTA TCCAG TAGGA GAAATSK 39TTTGG TCCTG TCTTA TGTCC AGAAT GC 0.11kbβ-globin 人 (29923)GGTGT TCCCT TGATG TAGCA CA(34016)CCAGG ATTTT TGATG GGACA CG 4.1kbβ-globin 人 (31194)GCTGC TCTGT GCATC CGAGT GG(34016)CCAGG ATTTT TGATG GGACA CG 2.8kb序列来源：nvitrogen 公司大家用什么稀释引物?引物应该用TE稀释。
Invitrogen中国测序通用引物序列
ATT AAC CCT CAC TAA AGG GA
pGEX-4T-5'
GGG CTG GCA AGC CAC GTT TGG TG
pGEX-4T-3'
CCG GGA GCT GCA TGT GTC AGA GG
GLp1
TGT ATC TTA TGG TAC TGT AAC TG
GLp2
CTT TAT GTT TTT GGC GTC TTC CA
PBV220R:
CTG CGT TCT GAT TTA ATC TG
U6
ATG GAC TAT CAT ATG CTT ACC GTA
2.0rev primer:
AGG CGA TTA AGT TGG GTA
3.0rev:
GAG TTA GCT CAC TCA TTA GGC
S.tag
GAA CGC CAG CAC ATG GAC
pIRES2-EGFP.P5’:
GTA GGC GTG TAC GGT GGG AG
pIRES2-EGFP.P3’:
AAC GCA CAC CGG CCT TAT TC
3'AD:
AGA TGG TGC ACG ATG CAC AG
CMV -F
CGC AAA TGG GCG GTA GGC GTG
S1
pCMV-R
TCCAAACTCATCAATGTATC
pTRC99C-F:
TTG CGC CGA CAT CAT AAC
pTRC99C-R:
CTGCGTTCTGATTTAATCTG
pCEP-F:
AGA GCT CGT TTA GTG AAC CG
EBV-R :
1-miRNA克隆+miRNA RT-PCR+miRNA qPCR引物设计
MicroRNAs (miRNAs) 是一类重要的非编码单链小RNA，主要调节蛋白质的翻译。
通常长度为21-23个核苷酸, 具有高度保守性，已成为疾病、组织重构和细胞分化等研究的热点。
因含量较低，miRNAs较难分离；一旦分离，这些18-24nt的RNAs经过纯化，加上5'和3'端接头，RT-PCR后才可克隆至载体并测序。
1、miRNA克隆步骤：获取miRNA序列-设计引物-miRNA RT-PCR-构载体测序（miRNA RT-PCR是miRNA克隆的中间一步）1.1获取miRNA序列：miR-Base数据库（/）第一步：打开数据库，输入miRNA名称，注意输入格式正确，点击Go第二步:根据来源物种选择所需要的序列has：人类mmu：小鼠rno：大鼠第三步：获得序列，可点击“Get sequence”1.2 设计引物以mmu-miR-30d-5p为例：1、获取miRNA成熟序列：UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG将U全部改成T：TGTAAACATCCCCGACTGGAAG2、设计茎环引物，茎环引物由两部分构成，一部分是通用的序列（通用序列有很多种，这里只列举一种），如：CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGC另外一部分是针对某个miRNA特定序列，这一部分的序列是6个碱基，我们设计的是miR-30d-5p，从它的3‘端，开始数取6-8个序列，即GAAGGTCA，取它的互补序列，即为CTTCCAGT，将这段序列与茎环引物的通用序列，结合，就成了miR-30d-5p的反转录引物，如下所示：CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGCCTTCCAGT这个引物是在反转录的时候使用，它在反转录过程中的示意图如下所示：1.3构载体以自行设计的带有茎环结构的特异性反转录引物代替反转录试剂盒中的通用引物，按照试剂盒说明书，去除基因组DNA 污染后，合成cDNA 的第一条链。
表4 主要使用的引物及序列
表4 主要使用的引物及序列序列技术在现代生物学研究中发挥着越来越重要的作用。
在进行序列分析之前，需要先选择合适的引物，以确保检测到所需的目标序列，并避免检测到不必要的杂交或引物间的相互杂交。
本文将介绍主要使用的引物及其序列。
1. 基因测序引物基因测序引物是用于测序DNA或RNA的引物。
这些引物通常包括一个DNA或RNA序列和一个与之匹配的引物序列。
常用的基因测序引物包括以下几种：- M13引物M13引物是一种通用的测序引物，用于测序单链DNA。
其序列为：5'-GTAAAACGACGGCCAGT-3'。
- T7和SP6引物T7和SP6引物用于测序DNA文库中的克隆DNA。
其中T7引物的序列为：5'-TAATACGACTCACTATAGGG-3'，SP6引物的序列为：5'-ATTTAGGTGACACTATAG-3'。
- M13F和M13R引物M13F和M13R引物也用于测序单链DNA。
M13F引物的序列为：5'-GTAAAACGACGGCCAGT-3'，M13R引物的序列为：5'-CAGGAAACAGCTATGAC-3'。
- T3和T7引物T3和T7引物与RNA兼容，并用于测序RNA和RNA-DNA杂交分子。
T3引物的序列为：5'-AATTAACCCTCACTAAAGGGA-3'，T7引物的序列为：5'-TAATACGACTCACTATAG-3'。
2. PCR引物PCR引物是用于荧光定量PCR、数字PCR、标准PCR等技术的引物。
以下是几种常用的PCR引物：- GAPDH引物GAPDH引物用于检测人体组织中的GAPDH基因表达水平。
其序列为：5'-GAAGGTGAAGGTCGGAGT-3'（前引物）、5'-GAAGATGGTGATGGGATTTC-3'（后引物）。
细菌通用引物程序
细菌通用引物程序细菌通用引物程序是一种常用的实验方法，用于检测和鉴定细菌的存在和种类。
通过选择合适的引物序列，可以放大目标细菌的DNA 片段，从而进行进一步的分析和鉴定。
本文将介绍细菌通用引物程序的原理、步骤和应用。
一、原理细菌通用引物程序利用PCR技术（聚合酶链式反应）放大细菌的16S rRNA基因片段。
16S rRNA基因在细菌中高度保守，但又存在足够的变异性，可以用来区分不同种类的细菌。
通过设计特定的引物序列，可以选择性地放大目标细菌的16S rRNA基因片段，从而实现对其进行检测和鉴定。
二、步骤1. 提取细菌DNA：首先需要从样品中提取细菌的总DNA，可以使用商业DNA提取试剂盒进行提取，也可以采用传统的蛋白酶消化和酚/氯仿提取方法。
2. PCR反应：制备PCR反应体系，包括DNA模板、引物、核酸酶、缓冲液等。
根据所选择的引物序列，在PCR仪中进行放大反应，一般包括变性、退火和延伸三个步骤。
3. 扩增产物检测：将PCR反应产物进行电泳分析，通过比对分子量标准和参考文献，确定目标细菌的存在和种类。
4. 序列分析：对PCR产物进行测序，获取16S rRNA基因序列，通过比对已知数据库，确定目标细菌的物种和亲缘关系。
三、应用细菌通用引物程序在微生物学研究中有着广泛的应用。
它可以用于环境样品中细菌的检测和鉴定，如土壤、水体、空气等。
同时，也可以应用于食品安全检测、医学临床诊断和药物研发等领域。
总的来说，细菌通用引物程序是一种简单、快速、灵敏的细菌检测方法。
通过选择适当的引物序列，可以实现对目标细菌的特异性检测，为微生物学研究和应用提供了重要的技术支持。
希望本文的介绍能够帮助读者更好地了解和应用细菌通用引物程序。
古菌通用引物测序
古菌通用引物测序
古菌是生活在极端环境中的微生物，与细菌和真核生物不同。
为了对古菌进行基因测序，通常需要使用古菌特有的引物进行PCR扩增。
以下是古菌通用引物的测序步骤：
1.准备样品：从极端环境中采集古菌样品，并使用适当的培养基进行培养。
或者，可以使用已分离的古菌DNA样品。
2.DNA提取：将古菌细胞从培养基中分离出来，并使用DNA提取试剂盒或
传统的酚-氯仿提取法提取DNA。
3.引物设计：根据古菌的基因组序列设计通用引物。
常用的古菌通用引物包
括16S rRNA基因的通用引物和古菌特异性引物。
4.PCR扩增：使用设计的引物和适当的PCR反应体系，在PCR仪中进行扩
增反应。
反应条件需要根据具体的引物和样品进行调整。
5.产物测序：将扩增产物送至测序公司进行测序。
测序方法可以采用传统的
Sanger测序或新一代测序技术。
6.数据分析：对测序结果进行质量控制和数据分析，包括序列拼接、物种鉴
定、基因注释等。
7.结果解释：根据数据分析结果，对古菌的种类、基因组结构和功能进行解
释和讨论。
需要注意的是，由于古菌的基因组结构和组成与细菌和真核生物存在较大差异，因此在测序和分析过程中可能需要进行一些特殊的处理和调整。
同时，由于古菌生活在极端环境中，其基因组中可能存在大量的稀有碱基和修饰碱基，这也需要在测序和分析过程中加以考虑和处理。
HPV病毒的常用通用引物检测
HPV病毒的常用通用引物检测摘要研究表明，HPV病毒感染与人体多种肿瘤的发生相关。
对感染个体的病毒检测具有重要的疾病诊断、治疗、预防意义。
但目前缺乏可以兼顾敏感性、特异性、操作简单，可以大规模推广使用的可靠检测方法。
对待测样本进行PCR 检测仍是目前实验室最多采用的检测方法。
PCR具有高敏感、易操作的优点，但其反应的灵活性和极高的敏感性，也带来了假阳性和假阴性的问题。
针对HPV 病毒L1序列保守区域设计的通用引物检测，最常被应用于大样本检测。
通用引物可以在一次PCR反应中同时检测多种型别的HPV病毒感染，与序列特异PCR 检测相比，可以大大减少检测的工作量。
但其缺点在于，通用引物仅与某个或少数HPV型序列匹配，而对于多数型别HPV，引物结合区都存在或多或少的碱基错配。
这使得通用引物对不同型别的HPV扩增效率不同。
因此，使用通用引物检测HPV感染时，对于某些与引物匹配较差的HPV型别，其感染情况往往可能被低估。
目前常用的通用引物根据设计原则不同分为三类：1）单一引物如：GP5+/6+。
2）简并引物如：、MY09/11。
3）混合引物如：SPF1/2。
个型通用引物都有其各自的优缺点，需要根据特定试验的目的、条件选用合适的通用引物进行检测。
【关键词】HPV病毒；通用引物；单一引物；简并引物；混合引物HPV病毒是一种亲上皮细胞的双链DNA病毒，其基因组长约7900bp。
目前约共发现约200多型HPV病毒。
该病毒主要感染皮肤和粘膜的上皮细胞，造成上皮增生甚至恶性转化[1] [2] [3]。
人们已经在生殖道检测到超过40型的HPV，其中许多与宫颈内皮增生及宫颈癌密切相关，如：16、18、31、33、35等，这部分HPV病毒被称为高危型[4][5]。
而HPV6、11等型别主要存在于良性病变中，多造成生殖道疣等疾病，被称为低危型[6][7]。
但人为区分的高危型和低危型并不是绝对的，因为在一些癌变中确实也存在所谓的低危型HPV[8]。
通用引物_??????
通用引物
通用引物是一种在分子生物学中广泛应用的引物，用于扩增特定目标序列。
通用引物可以被设计成能够结合到多个不同物种的目标序列上，因此被称为“通用”。
以下是一些常见的通用引物：
1. 通用PCR引物：
- Forward引物：5' - GTGCCAGCMGCCGCGGTAA - 3'
- Reverse引物：5' - GGACTACHVGGGTWTCTAAT - 3'
2. 通用寡核苷酸引物（oligo-dT）：
- 5' - AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTAC(T)18 - 3'
3. 通用测序引物：
- Forward引物：5' - GTGCCAGCMGCCGCGGTAA - 3'
- Reverse引物：5' - GGACTACHVGGGTWTCTAAT - 3'
这些通用引物设计得具有较高的特异性和亲和力，可以在各种不同的生物种类中扩增目标序列，例如基因组DNA、cDNA或特定的基因片段。
但是，由于不同物种的基因序列差异和变异，通用引物在不同物种中的扩增效率和特异性可能会有所差异，因此在实验设计和优化过程中需要注意选择合适的引物。
测序通用引物序列
测序通用引物序列常见载体的测序引物：Primer of Vector:Vector：Primer(F)；Primer(R)pACT T7 T3pACT2 GAL4 AD pACT2-RpAS2-1 GAL4 BD pAS2-1.RpB42AD pB42ADF pB42ADRpBACPAK8 BAC1 BAC2pBK-CMV T7 T3PBS(SK/KS)/M13- M13F/T7 T3/M13RpBV220 PBV220F PBV220RpCAMBIA 1301(1300) P1 P2pCAMBIA 2300 M13R(-48) M13F(-47)PCANTB5E S1/M13R S6pCAT3-enhancer RVP3 此载体无反向引物pcDNA3.0 CMV-F/T7 SP6/BGHpcDNA3.1 T7 BGHpcDNA4 T7/CMV-F BGHpcDNA6 T7/CMV-F(J21025在T7前面）BGHpcDNAII T7 SP6pCE2.1 M13F M13RpCEP4 pCEP-F EBV-RpCF-T M13F M13RpCI T7（17Base）此载体无反向引物pCI-neo T7（17Base）T3pCMS-EGFP T7 T3pCMV-3Tag-4A T3 /PFLAG-CMV-F T7pCMV5 pCMV5F pCMV5RpCMV5-Flag pCMV5F pCMV5RpCMV-MYC/HA pCMV-F pCMV-RpCMV-Sport M13F/T7 SP6/M13RpCMV-Tag(KAN+) T3 T7pCR2.1-TOPO M13F/T7 M13RpCR3.1 T7 BGHpCS2 SP6 T7pDonar M13F M13RpDONR221 M13F M13RpDrive T7 SP6pDRIveR(KAN+) T7 SP6pDsRED1-C1 pDsRED-ex-C1-F pEGFP-N-3’(距离很近,一般不用) pDsRED2-C1(KAN+) pDsRED-ex-C1-F pEGFP-N-3’pDSRED-N1(KAN+) pEGFP-N-5’ PDSRED-N-RpECFP-C pEGFP-C-5’ pECFP-C-3′pECFP-N1 pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pEF/myc/ER pEF-F pCDNA3.1RpEGFP-C(KAN+) pEGFP-C-5’ pEGFP-C-3′pEGFP-N(KAN+) pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pENTR/D-TOPO(KAN+) M13F M13RpET-*(His)(KAN+) T7 T7 TerpET22(a,b,c)(AMP+) T7 T7 TerpET28,30,24,49(KAN+) T7 T7 TerpET32(a,b,c)(AMP+) T7/S.tag T7 TerpET50(amp+) T7/s.tag T7TERpET44(AMP+) T7/s.tag T7 TerpEYFP-N1 pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pEYFP-C1 pEGFP-C-5’ pEGFP-C-3′pFLAG-CMV pFLAG-CMV -F pFLAG-CMV -R pGAD424 GAL4 AD 3′ADpGADGH GAL4 AD 3′ADpGADT7-Rec GAL4 AD/T7 3′ADpGAPZa-A a-FACTOR 3′AOXpGBKT7(Kana+) T7 3′BDpGEM-T(-Easy) M13F/T7 SP6/M13RpGEX-(*)T pGEX-4T-5’ pGEX-4T-3’pGL2 GLP1 GLP2pGL3 RVP3 GLP2(RVP4)(没有特别说明用GLP2) PinpointTM Vector Pinpoint Primer SP6pIRES PIRES-F/T7 T3/PIRES-R (J40720)pIRES2-EGFP pIRES2-EGFP.P5’ pIRES2-EGFP.P3’pLXSN pLXSN-F pLXSN-RpMAL-c2E MalE primer M13F(-47)pMAL-C2x P5’ P3’pMAL-p2X MalE primer M13F(-47)PMD18-T M13R(-48) M13F(-47)PMD19-T M13F(-47) M13R(-48)pPIC9K(AMP+、ZEO+）5’AOX/a-factor 3’AOX pPICZa 5′AOX/PPICZa-F 3′AOXpPROEXHTA M13R(-48) 无反向引物pQE30or40 pQE30-F pQE-R:pRSET T7 T7TERpSilencer3.1-H1 hygro M13F(-47) 3.0REV pSILENCEV2.0-U6 T7 2.0REVpSK01-T M13F M13RpSK-CMV(KAN+) T7 T3pSP72 T7 SP6pSport1 SP6/M13F(-47) T7/M13RpSUPER T7 T3pTA2 M13F/T7(优先使用M13F）T3/M13RpT-Adv M13F /T7 M13RpTARGET TM pTarget.F(在T7前面）/T7 pTarget.R pTO-T7 T7 T7TERpTRC99a-c pTRC99C-F pTRC99C-RpTriPLEx2 5′pTriPLEx2 T7pTWIN-1 T7 T7TER(客户确认再用）pUC18(19)/118(119) M13F(-47) M13R(-48)pUCm-T M13F/T7 M13RpVAX1 T7 BGHpWSK29 T7/M13F/M13F(-47) T3/M13R/M13R(-48)pXT7 T7 SP6pYES2 T7 pYes2.RpLEXA pLEXA-F pLEXA-RpLNCX pLNCX-F pLNCX-RpRECEIVER CMV-F 此载体无反向引物pSHUTTLE-CMV PSHUTTLE-CMV-F PSHUTTLE-CMV-R pSP64/65 SP6 此载体无反向引物pSTBlue-1 T7 SP6pT7Blue(R) T7 M13F(-47)引物名称序列(5′-3′)：M13R：CAG GAA ACA GCT ATG ACCM13F：TGT AAA ACG ACG GCC AGTM13F(-47)：CGC CAG GGT TTT CCC AGT CAC GACM13R(-48)：AGC GGA TAA CAA TTT CAC ACA GGA M13(-96)：CCC TCA TAG TTA GCG TAA CGSP6：ATT TAG GTG ACA CTA TAGT7：TAA TAC GAC TCA CTA TAG GGT7 terminator：TGC TAG TTA TTG CTC AGC GGT3：ATT AAC CCT CAC TAA AGG GApGEX-4T-5′：GGG CTG GCA AGC CAC GTT TGG TG pGEX-4T-3′：CCG GGA GCT GCA TGT GTC AGA GG GLp1：TGT ATC TTA TGG TAC TGT AAC TGGLp2：CTT TAT GTT TTT GGC GTC TTC CARVp3：CTA GCA AAA TAG GCT GTC CCRVp4：GAC GAT AGT CAT GCC CCG CGpcDNA3.1R：TAG AAG GCA CAG TCG AGGPinPoint primer：CGT GAC GCG GTG CAG GGC G pCMV-F：TCT AAA AGC TGC GGA ATT GTpCMV-R：TCCAAACTCATCAATGTATCpTRC99C-F: TTG CGC CGA CAT CAT AACpTRC99C-R: CTGCGTTCTGATTTAATCTGpCEP-F: AGA GCT CGT TTA GTG AAC CGEBV-R : GTG GTT TGT CCA AAC TCA TCpIRES2-EGFP.P5’: GTA GGC GTG TAC GGT GGG AG pIRES2-EGFP.P3’: AAC GCA CAC CGG CCT TAT TC3′AD: AGA TGG TGC ACG ATG CAC AGCMV -F：CGC AAA TGG GCG GTA GGC GTGS1：CAA CGT GAA AAA ATT ATT ATT CGCS6：GTA AAT GAA TTT TCT GTA GTA GG5`AOX1：GAC TGG TTC CAA TTG ACA AGC3`AOX1：GCA AAT GGC ATT CTG ACA TCCα-Factor：TAC TAT TGC CAG CAT TGC TGCGAL4 AD：TAC CAC TAC AAT GGA TGpACT2-R：GTGCACGATGCACAGTTGAApB42ADF：CCA GCC TCT TGC TGA GTG GAG ATGpB42ADR：AAG CCG ACA ACC TTG ATT GGA GpEGFP-N-5’：TGG GAG GTC TAT ATA AGC AGA G pEGFP-N-3’：CGT CGC CGT CCA GCT CGA CCA G pEGFP-C-5’：CAT GGT CCT GCT GGA GTT CGT G pEGFP-C-3′ ：TAT GGC TGA TTA TGA TCA GTPBV220F：AAG AAG GGC AGC ATT CAA AGPBV220R：CTG CGT TCT GAT TTA ATC TGU6：ATG GAC TAT CAT ATG CTT ACC GTA2.0rev primer：AGG CGA TTA AGT TGG GTA3.0rev：GAG TTA GCT CAC TCA TTA GGCS.tag：GAA CGC CAG CAC ATG GAC5′TriplEx2：CTC CGA GAT CTG GAC GAG CRVP4：GAC GAT AGT CAT GCC CCG CGRVP3：CTA GCA AAA TAG GCT GTC CCpQE30-R：GTT CTG AGG TCA TTA CTG GpQE30-F：TGA GCG GAT AAC AAT TTC ACpEF-F：TCA AGC CTC AGA CAG TGG TTCpDSRED-N1-R：TGA AGC GCA TGA ACT CCT TG pDsRED-express-C1-F：TCC CAC AAC GAG GAC TAC AC pCMV5R：ATT ATA GAG GAC ACC TAG TCpCMV5F：TTC CAA AAT GTC GTA ATA ACP5′：TGC GTA CTG CGG TGA TCA ACP3′：CTG CAA GGC GAT TAA GTT GGBAC2：ACG CAC AGA ATC TAG CGC TTBAC1：AAC CAT CTC GCA AAT AAA TA3′BD：TAA GAG TCA CTT TAA AAT TTG TAT AC pTarget.F：CCA GGA TTT TCC CAG TCA CpTarget.R：GGC TTT ACA CTT TAT GCT TCT7(17base)：ACA TCC ACT TTG CCT TTC TCpYes2.R：TCG GTT AGA GCG GAT GTGGAL4 BD：TCA TCG GAA GAG AGT AGpAS2-1.R：AAG AGT TAC TCA AGA ACA AGA ApFlag-CMV-F: GGT AGG CGT GTA CGG TGGpFlag-CMV-R: GCA CTG GAG TGG CAA CTTpIRES-F: CTT ACT GAC ATC CAC TTT GCpIRES.R: CAC TGC ATT CTA GTT GTG GTP1：CCA GGC TTT ACA CTT TAT GCP2：GCG ATT AAG TTG GGT AAC GCpLEXA-F：CGT CAG CAG AGC TTC ACC ATpLEXA-R：TAA AAC CTA AGA GTC ACT TTpLNCX-F：AGC TCG TTT AGT GAA CCG TCA GAT CG pLNCX-R：ACC TAC AGG TGG GGT CTT TCA TTC CC pLXSN-F：CTT GAA CCT CCT CGT TCG ACpLXSN-R：GTT GCT GAC TAA TTG AGA TGpSHUTTLE-CMV-F：GGT CTA TAT AAG CAG AGG TG pSHUTTLE-CMV-R：GTG GTA TGG CTG ATT ATG ATC AG MalE Primer：GGT CGT CAG ACT GTC GAT GAA GCC。
常用引物序列
常用引物序列引言：引言是文章的开端，用来引起读者的兴趣和注意力，概括文章的主题和内容。
在这篇文章中，我们将探讨一些常用的引物序列，以及它们在不同领域的应用。
一、"据说"引物序列"据说"是一种常见的引言方式，用来引述别人的话或传闻。
在新闻报道中，我们经常可以看到这样的句子，比如"据说明天会下雨"或"据说他们要离婚了"。
这种引言方式可以用来引出一些未经证实的消息或观点。
二、"有人说"引物序列"有人说"是另一种常见的引言方式，用来引用别人的意见或看法。
这种引言方式常用于讨论社会热点或争议性话题，比如"有人说女性更擅长情感表达"或"有人说男性更适合从事科学研究"。
这种引言方式可以用来引出不同人群的不同观点，展示多样性和包容性。
三、"据统计"引物序列"据统计"是一种用来引用数据或统计结果的引言方式。
在科学研究或市场调查中，我们经常使用这种引言方式来支持自己的观点或结论。
比如"据统计，80%的人认为健康饮食对身体有益"或"据统计，今年公司的销售额增长了20%"。
这种引言方式可以增加文章的权威性和可信度。
四、"有研究表明"引物序列"有研究表明"是一种常见的引言方式，用来引用科学研究的结果。
在科技领域的文章中，我们经常可以看到这种引言方式，比如"有研究表明，人类的记忆力可以通过锻炼来提升"或"有研究表明，某种药物可以治疗癌症"。
这种引言方式可以用来表达科学研究的进展和发现。
五、"根据调查显示"引物序列"根据调查显示"是一种用来引用调查结果的引言方式。
在社会科学研究或市场调查中，我们经常使用这种引言方式来描述人们的行为或态度。
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5'TAC TAT TGC CAG CAT TGC TGC3'
M13(96)
5'CCCTCATAGTTAGCGTAACG3'
PCMVF-BD
5'TCTAAAAGCTGCGGAATTGT3'
PCMVR
5'TCCAAACTCATCAATGTATC3'
P17110
5’TACCACTACAATGGATG3’
P12584
5’TTTTCAGTATCTACGAT3’
PAS21F
5' TCATCGGAAGCGAGTAG3'
PAS21R
5' CGTTTTAAAACCTAAGAGTCAC3'
3'AD
5' AGA TGG TGC ACG ATG CAC AG3'
3'BD
5'TAA GAG TCA CTT TAA AAT TTG TAT C3'
T7TER
5'TGCTAGTTATTGCTCAGCGG3'
S.TAG
5'CGAACGCCAGCACATGGACA3'
T3
5'ATTAACCCTCACTAAAGGGA3'
M13F（47）
5'CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC3'
M13R（48）
5'AGCGGATAACAATTTCACACAGGA3'
5’TGC GTA CTG CGG TGA TCA AC3’
pMALC2XR
5’CTG CAA GGC GAT TAA GTT GG3’
pbdgal4f
5'GCCTCTAACATTGAGACAGC3'
pbdgal4r
5'AAGAGTTACTCAAGAACAAGAA3'
pbi121(35s)
5'GACGCACAATCCCACTATCC3'
奥科公司测序部通用引物合成
引物名称
引物序列
T7
TAATACGACTCACTATAGGG
SP6
5'ATTTAGGTGACACTATAG3'
M13F
5'TGTAAAACGACGGCCAGT3'
M13R
5'CAGGAAACAGCTATGACC3'
T7（17BASE）
5'ACATCCACTTTGCCTTTCTC3'
AAT ACC ACT ACA ATG GAT GAT G
N-CMV-30
ATA ACC CCG CCC CGT TG
C-CMV-24
TTA GGA CAA GGC TGG TGG
pBABE_5'
ctt tat cca gcc ctc ac
pBABE_3'
accctaactgacacacattcc
P5'
5'-gTg gTA Tgg CTg ATT ATg ATC Ag-3'
GAL4BD
5'TCA TCG GAA GAG AGT AG 3'
TADH
5'GTA AAT TTC TGG CAA GGT AGA C 3'
pDsRed-n5'
GACTTTCCAAAATGTCGTAA
T7-EEV
5'AAG GCT AGA GTA CTT AAT ACG A 3'
PGEX5’
5'GGGCTGGCAAGCCACGTTTGGTG3'
PGEX3’
5'CCGGGAGCTGCATGTGTCAGAGG3'
PEGFPC5’
5'CATGGTCCTGCTGGAGTTCGTG3'
PEGFPC3’
5'TATGGCTGATTATGATCAGT3'
PEGFPN5’
5'TGGGAGGTCTATATAAGCAGAG3'
PTRCHISAF
5’CAT GGT ATG GCT AGC ATG AC3’
PTRCHISAR
5’CAG GCT GAA AAT CTT CTC TC3’
pDC316 F
5' -TAA CTT GTT TAT TGC AGC -3'
pDC316 A
5' -TAT GCT TAC CGT AAC TTG -3'
pSR 5' Primer
ggaagccttggcttttg
SV40 PolyA
5' TAAGATACATTGATGAGTTTGGAC 3'
pCMV5R
ATTATAgAggACACCTAgTC
pCMV5F
TTCCAAAATgTCgTAATAAC
BGH
5'TAG AAG GCA CAG TCG AGG3'
pDC316F
5' acg tgg gta taa gag gcg 3'
pDC316R
5' cga tgc tag acg atc cag 3'
pshuttle-cmv F
5'-ggT CTA TAT AAg CAg AgC Tg-3'
pshuttle-cmv R
PB42ADR
5'AAGCCGACAACCTTGATTGGAG3'
TRXF
5'CATATGAGCGATAAAATTATTCAC3'
TRXR
5'GGATCCCTTGTCATCGTCATCACCA3'
pTARGETSEQ
5’ TTA CGC CAA GTT ATT TAG GTG ACA3’
pMALC2XF
5' TGT ATC TTA TGG TAC TGT AAC TG3'
GLP2
5' CTT TAT GTT TTT GGC GTC TTC CA3'
RVP3
5' CTA GCA AAA TAG GCT GTC CC3'
RVP4
5'GAC GAT AGT CAT GCC CCG CG3'
PTRC99CF
PQE30F
5' TGA GCG GAT AAC AAT TTC AC3'
PQE30R
5' GTT CTG AGG TCA TTA CTG G3'
S1
5’CAA CGT GAA AAA ATT ATT ATT CGC3’
S6
5’GTA AAT GAA TTT TCT GTA TGA GG3’
GLP1
PEFF
5' TCA AGC CTC AGA CAG TGG TTC3'
PCEPF
5' AGA GCT CGT TTA GTG AAC CG3'
EBVR
5' GTG GTT TGT CCA AAC TCA TC3'
CMVF
5'CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG3'
CMVR
5'GTTCACGGTGCCCTCC3'
TGC GTA CTG CGG TGA TCA AC
P3'
CTG CAA GGC GAT TAA GTT GG
DuetDOWN1
5'-GATTATGCGGCCGTGTห้องสมุดไป่ตู้CAA-3'
PET Upstream
ATG CGT CCG GCG TAG AGG AT
DuetUP2
5'-TTGTACACGGCCGCATAATC-3'
PEGFPN3’
5'CGTCGCCGTCCAGCTCGACCAG3'
PBV220F
5'AAGAAGGGCAGCATTCAAAG3'
PBV220R
5'CTG CGT TCT GAT TTA ATC TG3'
5’AOX
5'GACTGGTTCCAATTGACAAGC3'
3’AOX
5'GGCAAATGGCATTCTGACAT3'
pfastBac-5'
GTC CGA AAC CAT GTC GTA C
pfastBac-3'
CTG ATT ATG ATC CTC TAG TAC TTC
PBAD5'
TAT CGC AAC TCT CTA CTG TT
PBAD3'
5' AGC CAA GCT GGA GAC CGT TT 3'
5'AD
5’TTG CGC CGA CAT CAT AAC3’
PTRC99CR
5’CTG CGT TCT GAT TTA ATC TG3’
PIRES2EGFPF
5'GTA GGC GTG TAC GGT GGG AG3'
PIRES3EGFPR
5'AAC GCA CAC CGG CCT TAT TC3'
PCDNA3.0F2
5'CTC TGG CTA ACT AGA GAA CC3'
PCDNA3.0R2
5'GGC AAC TAG AAG GCA CAG TC3'
BAC1
5'AAC CAT CTC GCA AAT AAA TA 3'