聚类分析—K-means and K-medoids聚类

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k-medoids 聚类公式字母公式

k-medoids 聚类公式字母公式

k-medoids 聚类算法是一种常用的基于距离的聚类方法,它主要用于将数据集中的数据点划分为若干个类别,使得同一类别内的数据点之间的相似度较高,不同类别之间的相似度较低。

与k-means 算法不同的是,k-medoids 算法使用代表性的数据点(medoids)来代表每个类别,从而使得对噪声和异常值更加稳健。

在k-medoids 聚类算法中,我们首先需要确定聚类的数量k,然后从数据集中随机选择k个数据点作为初始的medoids。

接下来的步骤是不断地迭代,直至收敛为止。

具体的迭代过程如下:1. 初始化:随机选择k个数据点作为初始的medoids。

2. 分配数据点:对于每个数据点,计算它与各个medoids 的距离,并将其分配到距离最近的medoids 所代表的类别中。

3. 更新medoids:对于每个类别,选择一个新的medoids 来代表该类别,使得该类别内所有数据点到新medoids 的距离之和最小。

4. 判断收敛:检查新的medoids 是否与旧的medoids 相同,若相同则停止迭代,否则继续进行迭代。

在k-medoids 聚类算法中,距离的计算可以使用各种不同的距离度量方式,例如欧氏距离、曼哈顿距离等。

对于大规模的数据集,k-medoids 算法可能会比k-means 算法更具有优势,因为它在每次迭代时只需要计算medoids 之间的距离,而不需要计算所有数据点之间的距离,从而可以减少计算量。

k-medoids 聚类算法是一种有效且稳健的聚类方法,它在处理一些特定情况下可以取得比k-means 更好的聚类效果。

通过对数据进行有效的分组和分类,k-medoids 聚类算法在数据挖掘和模式识别领域具有广泛的应用前景。

K-medoids clustering algorithm is a widely used distance-based clustering method for partitioning the data points in a dataset into several categories, in which the similarity of data points within the same category is relatively high, while the similarity between different categories is relatively low. Unlike the k-means algorithm, the k-medoids algorithm uses representative data points (medoids) to represent each category, making it more robust to noise and outliers.In the k-medoids clustering algorithm, the first step is to determine the number of clusters, denoted as k, and then randomly select k data points from the dataset as the initial medoids. The following steps involve iterative processes until the algorithm converges.The specific iterative process is as follows:1. Initialization: randomly select k data points as the initial medoids.2. Data point assignment: for each data point, calculate its distance to each medoid and assign it to the category represented by the nearest medoid.3. Update medoids: for each category, select a new medoid to represent the category, so that the sum of the distances from all data points in the category to the new medoid is minimized.4. Convergence check: check whether the new medoids are the same as the old medoids. If they are the same, stop the iteration; otherwise, continue the iteration.In the k-medoids clustering algorithm, various distance metrics can be used for distance calculation, such as Euclidean distance, Manhattan distance, etc. For large-scale datasets, the k-medoids algorithm may have advantages over the k-means algorithm because it only needs to calculate the distance betweenmedoids at each iteration, rather than calculating the distance between all data points, which can reduce theputational workload.In conclusion, the k-medoids clustering algorithm is an effective and robust clustering method that can achieve better clustering results than the k-means algorithm in certain situations. By effectively grouping and classifying data, the k-medoids clustering algorithm has wide application prospects in the fields of data mining and pattern recognition.Moreover, the k-medoids algorithm can be further extended and applied in various domains, such as customer segmentation in marketing, anomaly detection in cybersecurity, and image segmentation inputer vision. In marketing, k-medoids clustering can be used to identify customer segments based on their purchasing behavior, allowingpanies to tailor their marketing strategies to different customer groups. In cybersecurity, k-medoids can help detect anomalies by identifying patterns that deviate from the norm in network traffic or user behavior. Inputer vision, k-medoids can be used for image segmentation to partition an image into different regions based on similarity, which is useful for object recognition and scene understanding.Furthermore, the k-medoids algorithm can also bebined with other machine learning techniques, such as dimensionality reduction, feature selection, and ensemble learning, to improve its performance and scalability. For example, using dimensionality reduction techniques like principalponent analysis (PCA) can help reduce theputational burden of calculating distances in high-dimensional data, while ensemble learning methods like boosting or bagging can enhance the robustness and accuracy of k-medoids clustering.In addition, research and development efforts can focus on optimizing the k-medoids algorithm for specific applications and datasets, such as developing parallel and distributed versions of the algorithm to handle big data, exploring adaptive and dynamic approaches to adjust the number of clusters based on the data characteristics, and integrating domain-specific knowledge or constraints into the clustering process to improve the interpretability and usefulness of the results.Overall, the k-medoids clustering algorithm is a powerful tool for data analysis and pattern recognition, with a wide range of applications and potential for further advancements andinnovations. Its ability to handle noise and outliers, its flexibility in distance metrics, and its scalability to large-scale datasets make it a valuable technique for addressing real-world challenges in various domains. As the field of data science and machine learning continues to evolve, the k-medoids algorithm will likely remain an important method for uncovering meaningful insights fromplex data.。

聚类分析及k-means算法

聚类分析及k-means算法

样品到类中心的距离; 归类;
计算所有球队分别对三个中心点的欧氏 距离。下面是用程序求取的结果:
第一次聚类结果: A:日本,韩国,伊朗,沙特; B:乌兹别克斯坦,巴林,朝鲜; C:中国,伊拉克,卡塔尔,阿联酋,泰
国,越南,阿曼,印尼。
重新计算类中心;
下面根据第一次聚类结果,采用k-均值法调整各个类 的中心点。
K-means算法流程
1. 从 n个数据对象任意选择 k 个对象作为初 始聚类中心;
2. 根据每个聚类对象的均值(中心对象), 计算每个对象与这些中心对象的距离; 并根据最小距离重新对相应对象进行划 分;
3. 重新计算每个(有变化)聚类的均值 (中心对象);
4. 循环(3)到(4)直到每个聚类不再发生变化 为止 ;
相似性度量指标
空间距离 相似系数(similarity coefficient)
空间距离
假使每个样品有p个变量,则每个样品都 可以看成p维空间中的一个点,n个样品 就是p维空间中的n个点,则第i样品与第
j 样品之间的距离记为 dij
样品距离必须满足的条件
➢ 对称性 dij d ji 0 ➢ 三角不等式 dij dik d jk ➢ dij 0 则样品i与样品j不相等
斜交空间距离
相似系数
相似系数表示作为对 象的两个分类单位 (所进行的分类单位) 间相似程度的指标。
相似系数通常介于0 cij 和1 之间,相似系数等 于1 ,说明两个样品完 全相同;相似系数等 于0,说明样品完全不 同。
n
t 1
xti
xi
xtj
xj
n
2
t1 xti xi
2
n
t1 xtj x j

聚类算法和分类算法总结

聚类算法和分类算法总结

聚类算法和分类算法总结聚类算法总结原⽂:聚类算法的种类:基于划分聚类算法(partition clustering)k-means:是⼀种典型的划分聚类算法,它⽤⼀个聚类的中⼼来代表⼀个簇,即在迭代过程中选择的聚点不⼀定是聚类中的⼀个点,该算法只能处理数值型数据k-modes:K-Means算法的扩展,采⽤简单匹配⽅法来度量分类型数据的相似度k-prototypes:结合了K-Means和K-Modes两种算法,能够处理混合型数据k-medoids:在迭代过程中选择簇中的某点作为聚点,PAM是典型的k-medoids算法CLARA:CLARA算法在PAM的基础上采⽤了抽样技术,能够处理⼤规模数据CLARANS:CLARANS算法融合了PAM和CLARA两者的优点,是第⼀个⽤于空间数据库的聚类算法FocusedCLARAN:采⽤了空间索引技术提⾼了CLARANS算法的效率PCM:模糊集合理论引⼊聚类分析中并提出了PCM模糊聚类算法基于层次聚类算法:CURE:采⽤抽样技术先对数据集D随机抽取样本,再采⽤分区技术对样本进⾏分区,然后对每个分区局部聚类,最后对局部聚类进⾏全局聚类ROCK:也采⽤了随机抽样技术,该算法在计算两个对象的相似度时,同时考虑了周围对象的影响CHEMALOEN(变⾊龙算法):⾸先由数据集构造成⼀个K-最近邻图Gk ,再通过⼀个图的划分算法将图Gk 划分成⼤量的⼦图,每个⼦图代表⼀个初始⼦簇,最后⽤⼀个凝聚的层次聚类算法反复合并⼦簇,找到真正的结果簇SBAC:SBAC算法则在计算对象间相似度时,考虑了属性特征对于体现对象本质的重要程度,对于更能体现对象本质的属性赋予较⾼的权值BIRCH:BIRCH算法利⽤树结构对数据集进⾏处理,叶结点存储⼀个聚类,⽤中⼼和半径表⽰,顺序处理每⼀个对象,并把它划分到距离最近的结点,该算法也可以作为其他聚类算法的预处理过程BUBBLE:BUBBLE算法则把BIRCH算法的中⼼和半径概念推⼴到普通的距离空间BUBBLE-FM:BUBBLE-FM算法通过减少距离的计算次数,提⾼了BUBBLE算法的效率基于密度聚类算法:DBSCAN:DBSCAN算法是⼀种典型的基于密度的聚类算法,该算法采⽤空间索引技术来搜索对象的邻域,引⼊了“核⼼对象”和“密度可达”等概念,从核⼼对象出发,把所有密度可达的对象组成⼀个簇GDBSCAN:算法通过泛化DBSCAN算法中邻域的概念,以适应空间对象的特点DBLASD:OPTICS:OPTICS算法结合了聚类的⾃动性和交互性,先⽣成聚类的次序,可以对不同的聚类设置不同的参数,来得到⽤户满意的结果FDC:FDC算法通过构造k-d tree把整个数据空间划分成若⼲个矩形空间,当空间维数较少时可以⼤⼤提⾼DBSCAN的效率基于⽹格的聚类算法:STING:利⽤⽹格单元保存数据统计信息,从⽽实现多分辨率的聚类WaveCluster:在聚类分析中引⼊了⼩波变换的原理,主要应⽤于信号处理领域。

聚类算法介绍(K-means+DBSCAN+典型案例)

聚类算法介绍(K-means+DBSCAN+典型案例)
的影响;缺点是计算中位数时需要对数据集中的数据进行
排序,速度相对于K-Means较慢,一般只适合小数据量。
二,DBSCAN
在DBSCAN算法中将数据点分为一下三类:
01
核心点:在半径r内含有超过minPoints数目的点
边界点:在半径r内点的数量小于minPoints,但是落在核心点的邻域内
噪音点:既不是核心点也不是边界点的点
算密度单元的计算复杂度大,
每一簇内较大的点代表核心对象,较
小的点代表边界点(与簇内其他点密
度相连,但是自身不是核心对象)。
黑色的点代表离群点或者叫噪声点。
三,凝聚层级聚类(HAC)
HAC是自下而上的一种聚类算法。
1
HAC首先将每个数据点视为一个单一的簇,然后计算所有簇之间的距离来合并
簇,直到所有的簇聚合成为一个簇为止。
之间具有更多的相似性。
是一种探索性的分析。聚类分析所
使用方法的不同,常常会得到不同
的结论。不同研究者对于同一组数
据进行聚类分析,所得到的聚类数
未必一致。
从机器学习的角度讲,簇相当
于隐藏模式。聚类是搜索簇的
无监督学习过程。
01
02
04
03
05
06
从统计学的观点看,聚类分析
是通过数据建模简化数据的一
种方法。
典型的应用案例
例3:基于DBSCAN算法的交通事故读法点段排查方法
核心思想:对于构成交通事故多发点段的每个交通事敌,其发生的地点半径e(邻域)公里范围以内的其它交通
事故的个数,必须不小于一个给定的阈值(MinPts),也就是说其邻域的密度必须不小于某个阈值。
下面是DBSCAN算法的交通事故多发点段排查方法在交通事故黑点排查中的一些定义:

(完整版)聚类算法总结

(完整版)聚类算法总结

1.聚类定义“聚类是把相似的对象通过静态分类的方法分成不同的组别或者更多的子集(subset),这样让在同一个子集中的成员对象都有一些相似的属性”——wikipedia“聚类分析指将物理或抽象对象的集合分组成为由类似的对象组成的多个类的分析过程。

它是一种重要的人类行为。

聚类是将数据分类到不同的类或者簇这样的一个过程,所以同一个簇中的对象有很大的相似性,而不同簇间的对象有很大的相异性。

”——百度百科说白了,聚类(clustering)是完全可以按字面意思来理解的——将相同、相似、相近、相关的对象实例聚成一类的过程。

简单理解,如果一个数据集合包含N个实例,根据某种准则可以将这N 个实例划分为m个类别,每个类别中的实例都是相关的,而不同类别之间是区别的也就是不相关的,这个过程就叫聚类了。

2.聚类过程:1) 数据准备:包括特征标准化和降维.2) 特征选择:从最初的特征中选择最有效的特征,并将其存储于向量中.3) 特征提取:通过对所选择的特征进行转换形成新的突出特征.4) 聚类(或分组):首先选择合适特征类型的某种距离函数(或构造新的距离函数)进行接近程度的度量;而后执行聚类或分组.5) 聚类结果评估:是指对聚类结果进行评估.评估主要有3 种:外部有效性评估、内部有效性评估和相关性测试评估.3聚类算法的类别没有任何一种聚类技术(聚类算法)可以普遍适用于揭示各种多维数据集所呈现出来的多种多样的结构,根据数据在聚类中的积聚规则以及应用这些规则的方法,有多种聚类算法.聚类算法有多种分类方法将聚类算法大致分成层次化聚类算法、划分式聚类算法、基于密度和网格的聚类算法和其他聚类算法,如图1 所示的4 个类别.3.聚类算法基于层次聚类算法:基于划分聚类算法(partition clustering)基于密度聚类算法:基于网格的聚类算法:STING :利用网格单元保存数据统计信息,从而实现多分辨率的聚类WaveCluster:在聚类分析中引入了小波变换的原理,主要应用于信号处理领域。

K-means聚类算法ppt课件

K-means聚类算法ppt课件
K-means聚类算法
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1
K-means算法是很典型的基于距离的 聚类算法,采用距离作为相似性的评价指 标,即认为两个对象的距离越近,其相似 度就越大。
该算法认为类是由距离靠近的对象组 成的,因此把得到紧凑且独立的类作为最 终目标。
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2
假设数据集合为(x1, x2, …, xn),并 且每个xi为d维的向量,K-means聚类的目 的是,在给定分类组数k(k ≤ n)值的条 件下,将原始数据分成k类:
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4
数学表达式:
n:样本数。 k:样本分为k类。 rnk:第n个样本点是否属于第k类,属于则
rnk=1, 不属于则rnk=0。 μK:第k个中心点。
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5
k-means 要做的就是最小化
这个函数。
迭代的方法: 1、固定μK,得到rnk。 2、固定rnk,求出最优的μK。
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12
K- medoids算法流程如下: 1、任意选取K个对象作为初始中心点 (O1,O2,…Oi…Ok)。 2、将余下的对象分到各个类中去(根据与 中心点最相近的原则); 3、对于每个类(Oi)中,顺序选取一个Or, 计算用Or代替Oi后的消耗—E(Or)。选择 E最小的那个Or来代替Oi。这样K个中心点 就改变了。
。不过,加上归一化规定,一个数据点的 隶属度的和总等于1:
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21
把n个元素xi(i=1,2,…,n)分为c个模糊组, 目标函数:
其中,m是大于1的实数,加权实数。uij 是xi属于类别j隶属度,cj是 类j的聚类中心。
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22
算法步骤: 1、用值在0,1间的随机数初始化隶属矩阵U,

聚类分析(二)——K中心点算法(k-mediods)

聚类分析(二)——K中心点算法(k-mediods)

聚类分析(⼆)——K中⼼点算法(k-mediods)K中⼼点算法(K-medoids)前⾯介绍了k-means算法,并列举了该算法的缺点。

⽽K中⼼点算法(K-medoids)正好能解决k-means算法中的 “噪声”敏感这个问题。

如何解决的呢?⾸先,我们得介绍下k-means算法为什么会对“噪声”敏感。

还记得K-means寻找质点的过程吗?对某类簇中所有的样本点维度求平均值,即获得该类簇质点的维度。

当聚类的样本点中有“噪声”(离群点)时,在计算类簇质点的过程中会受到噪声异常维度的⼲扰,造成所得质点和实际质点位置偏差过⼤,从⽽使类簇发⽣“畸变”。

Eg: 类簇C1中已经包含点A(1,1)、B(2,2)、 C(1,2)、 D(2,1),假设N(100,100)为异常点,当它纳⼊类簇C1时,计算质点Centroid((1+2+1+2+100)/5,(1+2+2+1+100)/5)=centroid(21,21),此时可能造成了类簇C1质点的偏移,在下⼀轮迭代重新划分样本点的时候,将⼤量不属于类簇C1的样本点纳⼊,因此得到不准确的聚类结果。

为了解决该问题,K中⼼点算法(K-medoids)提出了新的质点选取⽅式,⽽不是简单像k-means算法采⽤均值计算法。

在K中⼼点算法中,每次迭代后的质点都是从聚类的样本点中选取,⽽选取的标准就是当该样本点成为新的质点后能提⾼类簇的聚类质量,使得类簇更紧凑。

该算法使⽤绝对误差标准来定义⼀个类簇的紧凑程度。

如果某样本点成为质点后,绝对误差能⼩于原质点所造成的绝对误差,那么K中⼼点算法认为该样本点是可以取代原质点的,在⼀次迭代重计算类簇质点的时候,我们选择绝对误差最⼩的那个样本点成为新的质点。

Eg:样本点A –>E1=10样本点B –>E2=11样本点C –>E3=12原质点O–>E4=13,那我们选举A作为类簇的新质点。

与K-means算法⼀样,K-medoids也是采⽤欧⼏⾥得距离来衡量某个样本点到底是属于哪个类簇。

聚类分析—K-means and K-medoids聚类34页PPT

聚类分析—K-means and K-medoids聚类34页PPT
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5、虽然权力是一头固执的熊,可是金 子可以 拉着它 的鼻子 走。— —莎士 比
ห้องสมุดไป่ตู้
6、最大的骄傲于最大的自卑都表示心灵的最软弱无力。——斯宾诺莎 7、自知之明是最难得的知识。——西班牙 8、勇气通往天堂,怯懦通往地狱。——塞内加 9、有时候读书是一种巧妙地避开思考的方法。——赫尔普斯 10、阅读一切好书如同和过去最杰出的人谈话。——笛卡儿
聚类分析—K-means and K-medoids聚 类
1、合法而稳定的权力在使用得当时很 少遇到 抵抗。 ——塞 ·约翰 逊 2、权力会使人渐渐失去温厚善良的美 德。— —伯克
3、最大限度地行使权力总是令人反感 ;权力 不易确 定之处 始终存 在着危 险。— —塞·约翰逊 4、权力会奴化一切。——塔西佗

K-means聚类分析

K-means聚类分析
k 2
i
E 是一个数据集中所有对象的误差平方和,P 是一个对象,mi 是聚类 Ci 的质心, 即 mi
qC i
q
Ci
k‐means 聚类算法的具体步骤如下: ①从数据集中选择 k 个质心 C1,C2,…,Ck 作为初始的聚类中心; ②把每个对象分配到与之最相似的聚合。每个聚合用其中所有对象的均值来 代表, “最相似”就是指距离最小。对于每个点 Vi,找出一个质心 Cj,使它与其 间 的距离 d(Vi,Cj)最小,并把 Vi 分配到第 j 组; ③把所有的点都分配到相应的组之后重新计算每个组的质心 Cj; ④循环执行第②步和第③步,直到数据的划分不再发生变化。 该算法具有很好的可伸缩性,其计算复杂度为 O(nkt),其中,t 是循环的次数。 K‐means 聚类算法的不足之处在于它要多次扫描数据库,此外,它只能找出球形 的 类, 而不能发现任意形状的类。 还有, 初始质心的选择对聚类结果有较大的影响, 该算法对噪声很敏感。
K‐means 聚类分析
主要的聚类算法可以分为以下几种:划分聚类、层次聚类、密度型聚类、网 格型聚类和基于模型的聚类。 划分聚类算法把数据点集分为 k 个划分,每个划分作为一个聚类。它一般从 一个初始划分开始,然后通过重复的控制策略,使某个准则函数最优化,而每个 聚类由其质心来代表(k‐means 算法),或者由该聚类中最靠近中心的一个对象来 代 表(k‐medoids 算法)。 划分聚类算法收敛速度快, 缺点在于它倾向于识别凸形分布 大小相近、密度相近的聚类,不能发现分布形状比较复杂的聚类,它要求类别数 目 k 可以合理地估计,并且初始中心的选择和噪声会对聚类结果产生很大影响。 主要的划分聚类算法有 k‐means,EM,k‐medoids,CLARA,CLARANS 等。 下面主要介绍 K‐means 聚类方法。 k‐means 算法首先随机选择 k 个对象,每个对象代表一个聚类的质心。对于其 余的每一个对象,根据该对象与各聚类质心之间的距离,把它分配到与之最相似 的聚类中。然后,计算每个聚类的新质心。重复上述过程,直到准则函数会聚。 通常采用的准则函数是平方误差准则函数(squared‐error criterion),即 E i 1 pC p m

聚类分析原理及步骤

聚类分析原理及步骤

聚类分析原理及步骤聚类分析原理及步骤——将未知数据按相似程度分类到不同的类或簇的过程1》传统的统计聚类分析方法包括系统聚类法、分解法、加入法、动态聚类法、有序样品聚类、有重叠聚类和模糊聚类等。

采用k- 均值、k- 中心点等算法的聚类分析工具已被加入到许多著名的统计分析软件包中,如SPSS、SAS 等。

典型应用1》动植物分类和对基因进行分类2》在网上进行文档归类来修复信息3》帮助电子商务的用户了解自己的客户,向客户提供更合适的服务主要步骤1》数据预处理——选择数量,类型和特征的标度((依据特征选择和抽取)特征选择选择重要的特征,特征抽取把输入的特征转化为一个新的显著特征,它们经常被用来获取一个合适的特征集来为避免“维数灾”进行聚类)和将孤立点移出数据(孤立点是不依附于一般数据行为或模型的数据)2》为衡量数据点间的相似度定义一个距离函数——既然相类似性是定义一个类的基础,那么不同数据之间在同一个特征空间相似度的衡量对于聚类步骤是很重要的,由于特征类型和特征标度的多样性,距离度量必须谨慎,它经常依赖于应用,例如,通常通过定义在特征空间的距离度量来评估不同对象的相异性,很多距离度都应用在一些不同的领域一个简单的距离度量,如Euclidean 距离,经常被用作反映不同数据间的相异性,一些有关相似性的度量,例如PMC和SMC,能够被用来特征化不同数据的概念相似性,在图像聚类上,子图图像的误差更正能够被用来衡量两个图形的相似性3》聚类或分组——将数据对象分到不同的类中【划分方法(划分方法一般从初始划分和最优化一个聚类标准开始,CrispClustering 和Fuzzy Clusterin 是划分方法的两个主要技术,Crisp Clustering ,它的每一个数据都属于单独的类;Fuzzy Clustering ,它的每个数据可能在任何一个类中)和层次方法(基于某个标准产生一个嵌套的划分系列,它可以度量不同类之间的相似性或一个类的可分离性用来合并和分裂类)是聚类分析的两个主要方法,另外还有基于密度的聚类,基于模型的聚类,基于网格的聚类】4》评估输出——评估聚类结果的质量(它是通过一个类有效索引来评价,,一般来说,几何性质,包括类间的分离和类内部的耦合,一般都用来评价聚类结果的质量,类有效索引在决定类的数目时经常扮演了一个重要角色,类有效索引的最佳值被期望从真实的类数目中获取,一个通常的决定类数目的方法是选择一个特定的类有效索引的最佳值,这个索引能否真实的得出类的数目是判断该索引是否有效的标准,很多已经存在的标准对于相互分离的类数据集合都能得出很好的结果,但是对于复杂的数据集,却通常行不通,例如,对于交叠类的集合。

聚类分析—K-means and K-medoids聚类

聚类分析—K-means and K-medoids聚类
j
3. 按下式重新计算k个聚类中心; xs s:label ( s ) j cj , j 1, 2,..., k Nj
4. 重复步骤2和步骤3,直到达到最大迭代次数为止。
2014-5-12
Matlab程序实现
function [M, j, e] = kmeans(X, K, Max_Its) [N,D]=size(X); I=randperm(N); M=X(I(1:K),:); Mo = M; for n=1:Max_Its for k=1:K Dist(:,k) = sum((X - repmat(M(k,:),N,1)).^2,2)'; end [i, j]=min(Dist, [], 2); for k=1:K if size(find(j==k))>0 M(k, :) = mean(X(find(j==k), :)); end end

10
9

10
10 9 8 7 6 5
9
8
8
7
7
6
6
5
5
4
4 3 2 1 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
将每个 对象赋 给最类 似的中 心
10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0
3 2 1 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
更新簇 的平均 值 重新赋值
4 3 2 1 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10


聚类结果的质量用一个代价函数来估算, 该函数评估了 对象与其参照对象之间的平均相异度
E || p oi ||
k j 1 pC j
2014-5-12
2

K-means聚类分析

K-means聚类分析

大连理工大学硕士学位论文K-means聚类算法的研究姓名:冯超申请学位级别:硕士专业:软件工程指导教师:吴国伟20071215大连理工大学硕士学位论文摘要聚类是数据挖掘领域中重要的技术之一,用于发现数据中未知的分类。

聚类分析已经有了很长的研究历史,其重要性已经越来越受到人们的肯定。

聚类算法是机器学习、数据挖掘和模式识别等研究方向的重要研究内容之一,在识别数据对象的内在关系方面,具有极其重要的作用。

聚类主要应用于模式识别中的语音识别、字符识别等,机器学习中的聚类算法应用于图像分割,图像处理中,主要用于数据压缩、信息检索。

聚类的另一个主要应用是数据挖掘、时空数据库应用、序列和异常数据分析等。

此外,聚类还应用于统计科学,同时,在生物学、地质学、地理学以及市场营销等方面也有着重要的作用。

本文是对聚类算法K-means的研究。

首先介绍了聚类技术的相关概念。

其次重点对K-means算法进行了分析研究,K-means算法是一种基于划分的方法,该算法的优点是简单易行,时间复杂度为00),并且适用予处理大规模数据。

但是该算法存在以下缺点:需要给定初始的聚类个数K以及K个聚类中心,算法对初始聚类中心点的选择很敏感,容易陷入局部最优,并且一般只能发现球状簇。

本文针对聚类个数足的确定、初始K个聚类中心的选定作了改进,给出了改进的算法MMDBK(Max.Min and Davies.BouldinIndex based K-means,简称MMDBK)。

算法的出发点是确保发现聚类中心的同时使同一类内的相似度大,而不同类之间的相似度小。

算法采用Davies.Bouldin Index 聚类指标确定最佳聚类个数,改进的最大最小距离法选取新的聚类中心,以及聚类中心的近邻查找法来保证各个类之间的较小的相似度。

文中最后使用KDD99数据集作为实验数据,对K-means算法以及MMDBK算法进行了仿真实验。

结果显示改进后的MMDBK算法在入侵检测中是有效的。

k-means聚类算法的研究全解

k-means聚类算法的研究全解

k-means聚类算法的研究1.k-means算法简介1.1 k-means算法描述给定n个对象的数据集D和要生成的簇数目k,划分算法将对象组织划分为k个簇(k<=n),这些簇的形成旨在优化一个目标准则。

例如,基于距离的差异性函数,使得根据数据集的属性,在同一个簇中的对象是“相似的”,而不同簇中的对象是“相异的”。

划分聚类算法需要预先指定簇数目或簇中心,通过反复迭代运算,逐步降低目标函数的误差值,当目标函数收敛时,得到最终聚类结果。

这类方法分为基于质心的(Centroid-based)划分方法和基于中心的(Medoid-based)划分方法,而基于质心的划分方法是研究最多的算法,其中k-means算法是最具代表和知名的。

k-means算法是1967年由MacQueen首次提出的一种经典算法,经常用于数据挖掘和模式识别中,是一种无监督式的学习算法,其使用目的是对几何进行等价类的划分,即对一组具有相同数据结构的记录按某种分类准则进行分类,以获取若干个同类记录集。

k-means聚类是近年来数据挖掘学科的一个研究热点和重点,这主要是因为它广泛应用于地球科学、信息技术、决策科学、医学、行为学和商业智能等领域。

迄今为止,很多聚类任务都选择该算法。

k-means算法是应用最为广泛的聚类算法。

该算法以类中各样本的加权均值(成为质心)代表该类,只用于数字属性数据的聚类,算法有很清晰的几何和统计意义,但抗干扰性较差。

通常以各种样本与其质心欧几里德距离总和作为目标函数,也可将目标函数修改为各类中任意两点间欧几里德距离总和,这样既考虑了类的分散度也考虑了类的紧致度。

k-means算法是聚类分析中基于原型的划分聚类的应用算法。

如果将目标函数看成分布归一化混合模型的似然率对数,k-means算法就可以看成概率模型算法的推广。

k-means算法基本思想:(1)随机的选K个点作为聚类中心;(2)划分剩余的点;(3)迭代过程需要一个收敛准则,此次采用平均误差准则。

K-median算法(2020)

K-median算法(2020)

K-median算法(2020)聚类算法之k-medoids算法上一次我们了解了一个最基本的 clustering 办法 k-means ,这次要说的k-medoids 算法,其实从名字上就可以看出来,和k-means 肯定是非常相似的。

事实也确实如此,k-medoids 可以算是 k-means 的一个变种。

k-medoids 和k-means 不一样的地方在于中心点的选取,在k-means 中,我们将中心点取为当前cluster 中所有数据点的平均值:并且我们已经证明在固定了各个数据点的assignment 的情况下,这样选取的中心点能够把目标函数最小化。

然而在 k-medoids 中,我们将中心点的选取限制在当前 cluster 所包含的数据点的集合中。

换句话说,在 k-medoids 算法中,我们将从当前cluster 中选取这样一个点——它到其他所有(当前cluster 中的)点的距离之和最小——作为中心点。

k-means 和k-medoids 之间的差异就类似于一个数据样本的均值 (mean) 和中位数 (median) 之间的差异:前者的取值范围可以是连续空间中的任意值,而后者只能在给样本给定的那些点里面选。

那么,这样做的好处是什么呢?一个最直接的理由就是 k-means 对数据的要求太高了,它使用欧氏距离描述数据点之间的差异(dissimilarity) ,从而可以直接通过求均值来计算中心点。

这要求数据点处在一个欧氏空间之中。

然而并不是所有的数据都能满足这样的要求,对于数值类型的特征,比如身高,可以很自然地用这样的方式来处理,但是类别(categorical)类型的特征就不行了。

举一个简单的例子,如果我现在要对犬进行聚类,并且希望直接在所有犬组成的空间中进行,k-means 就无能为力了,因为欧氏距离在这里不能用了:一只Samoyed 减去一只Rough Collie 然后在平方一下?天知道那是什么!再加上一只German Shepherd Dog 然后求一下平均值?根本没法算,k-means 在这里寸步难行!在 k-medoids 中,我们把原来的目标函数中的欧氏距离改为一个任意的 dissimilarity measure 函数最常见的方式是构造一个 dissimilarity matrix 来代表,其中的元素只狗和第只狗之间的差异程度,例如,两只Samoyed 之间的差异可以设为 0 ,一只German Shepherd Dog 和一只Rough Collie 之间的差异是 0.7,和一只Miniature Schnauzer 之间的差异是 1 ,等等。

聚类分析方法

聚类分析方法
选方法之一 06
优缺点
缺点
对初始点的选择敏感:K-means算法的初始点选择对结果有很大影响,可能会导致不同 的初始点导致不同的聚类结果 需要预设k值:使用K-means算法需要预先设定k值,而最佳的k值可能并不容易确定
不适合大规模数据集:对于大规模数据集,K-means算法可能需要很长时间才能收敛
means||等
第1部分 算法步骤
算法步骤
以下是K-means算法的 基本步骤
算法步骤
初始化:选择k个点作为初始的聚类中心。这些点可以 是数据集中的实际数据点,也可以是随机生成的数据点
分配数据点到最近的聚类中心:对于数据集中的每个点,计 算它与k个聚类中心的距离,并将其分配到最近的聚类中心。 这一步通常使用欧氏距离来计算两点之间的距离
聚类分析—— Kmeans方法
-
目录
CONTENTS
1
算法步骤
2
优缺点
3
应用场景
2
聚类分析——Kmeans方法
聚类分析是一种无监督学习方法,用于将对象分组,使得同一组(或簇)内的对象相互之间 相似(按照某些度量方式),而不同组之间的对象相互之间不相似。其中,K-means算法是 一种常用的聚类算法,以其发明者Arthur James和Donald Fisher的名字来命名
特征选择和降维:在聚类之前,可以 进行特征选择和降维,以减少数据的 维度和噪声,提高聚类的效果
可视化:可以将聚类结果进行可视化, 以更直观地展示聚类的效果和结果
优缺点
通过以上改进方向,可以 进一步提高K-means算法的 性能和适用性,使其在更 多的实际应用中得到广泛
应用
第3部分 应用场景
应用场景
应用场景

聚类算法在医疗影像分析中的前沿探索

聚类算法在医疗影像分析中的前沿探索

聚类算法在医疗影像分析中的前沿探索一、聚类算法概述聚类算法是一种无监督学习技术,其核心目标是将数据集中的样本划分为若干个由相似对象组成的子集或“簇”。

在医疗影像分析中,聚类算法的应用尤为重要,它可以帮助医生和研究人员从大量的影像数据中发现潜在的模式和规律,从而提高疾病的诊断和治疗效率。

聚类算法的基本原理是通过计算样本之间的相似度或距离,将相似的样本聚集在一起,形成不同的簇。

1.1 聚类算法的类型聚类算法主要可以分为几类,包括基于中心的算法、基于连接的算法、基于密度的算法和基于模型的算法。

基于中心的算法,如K-means和K-medoids,通过计算样本与簇中心的距离来进行聚类;基于连接的算法,如层次聚类,通过构建一个连接样本的树状结构来进行聚类;基于密度的算法,如DBSCAN,通过计算样本周围的密度来进行聚类;基于模型的算法,如高斯混合模型,通过假设数据是由多个概率分布生成的来进行聚类。

1.2 聚类算法的应用场景聚类算法在医疗影像分析中的应用场景非常广泛,包括但不限于以下几个方面:- 疾病诊断:通过聚类算法对影像数据进行分析,可以帮助医生发现不同疾病的特征,从而提高诊断的准确性。

- 疾病分类:聚类算法可以将具有相似特征的疾病影像数据聚集在一起,有助于疾病的分类和研究。

- 影像分割:聚类算法可以用于影像的自动分割,将不同的组织和器官从影像中分离出来,便于进一步的分析和处理。

- 特征提取:聚类算法可以用于提取影像中的关键特征,为后续的图像处理和分析提供支持。

二、聚类算法在医疗影像分析中的应用聚类算法在医疗影像分析中的应用是一个复杂而富有挑战的过程,涉及到多个方面的技术和方法。

2.1 影像数据的预处理在进行聚类分析之前,首先需要对影像数据进行预处理。

这包括图像的去噪、增强、标准化等操作,以提高影像数据的质量,减少噪声对聚类结果的影响。

预处理的目的是使影像数据更适合聚类算法的处理,提高聚类的效果。

2.2 特征选择与提取特征选择和提取是聚类分析的关键步骤。

聚类分析—K-means and K-medoids聚类要点

聚类分析—K-means and K-medoids聚类要点

2018/10/5
在图像分割上的简单应用(续)
分割后的效果
注:最大迭代次数为20次,需运行多次才有可能得到较好的效果。
2018/10/5
在图像分割上的简单应用(续)
例 2:
注:聚类中心个数为5,最大迭代次数为10。
2018/1Байду номын сангаас/5
k-平均聚类算法(续)

优点: 相对有效性: O(tkn),
其中 n 是对象数目, k 是簇数目, t 是迭代次数; 通常, k, t << n.
2018/10/5
PAM

PAM (Partitioning Around Medoids) (Kaufman and Rousseeuw, 1987)

是最早提出的k-中心点聚类算法 基本思想:

随机选择k个代表对象

反复地试图找出更好的代表对象: 分析所有可能的对象对,每个对 中的一个对象被看作是代表对象, 而另一个不是. 对可能的各种组合, 估算聚类结果的质量
2018/10/5
k-中心点聚类方法(续)

找聚类中的代表对象(中心点)
PAM (Partitioning Around Medoids, 1987)

首先为每个簇随意选择选择一个代表对象, 剩余的对象根 据其与代表对象的距离分配给最近的一个簇; 然后反复地 用非代表对象来替代代表对象,以改进聚类的质量 PAM 对于较小的数据集非常有效, 但不能很好地扩展到大 型数据集

k-平均值(MacQueen’67): 每个簇用该簇中对象的平均值来表示

k-中心点或 PAM (Partition around medoids) (Kaufman & Rousseeuw’87): 每个簇用接近聚类中心的一个对象来表示

聚类分析

聚类分析

聚类分析算法作为一种有效的数据分析方法被广泛应用于数据挖掘、机器学习、图像分割、语音识别、生物信息处理等,聚类算法还可以应用于商业分析,它可以帮助市场决策人员从消费者数据库中区分出不同的消费群体,并且概括出每一类消费者的消费模式或习惯。

从本质来说聚类算法是将总体中的个体分类以发现数据中的结构,希望一个类中的个体彼此接近或相似,而与其它类中的个体相异,这样就可以对划分出来的每一类进行深入的分析从而概括出每一类的特点。

1 . 聚类分析算法的基本定义给定一个对象集合X = {x 1 , x2 , , xn},假设每个对象 xi , i = 1...n 含有 m 个特征,在此用向量的方式来表示对象的特征,)....,(2,1m i l l l x =,聚类分析的过程就是根据对象的特征来分析对象之间的相似程度,并根据某种聚类决策准则来获得聚类结果。

通常聚类分析算法一般包含四个部分:(1)特征获取与选择;(2)计算相似度;(3)分组;(4)聚类结果展示。

特征获取与选择就是为了获得能够恰当表示对象属性的数据,并且减少数据的冗余度。

计算相似度就是根据对象的特征来计算对象之间的相似程度,在聚类过程中可能一次性的计算所有对象之间的相似度信息,也可能在聚类分析的过程中按需要来计算对象之间的相似度信息。

分组就是根据对象之间的相似程度来判断对象之间的类别信息,将类似的对象分组到同一个类中,不相似的对象分组到不同的类中。

聚类结果展示可以只是简单的输出对象分组信息,也可以用图形化的方式来展示聚类结果,但是目前的研究趋势要求算法能够自动的归纳出每个不同的分组所代表的类信息并抽象出类中对象的共同特性。

2. 聚类分析方法聚类算法主要分为层次化聚类方法,划分式聚类方法,基于密度的聚类方法,基于网格的聚类方法,基于核的聚类算法,基于谱的聚类方法,基于模型的聚类方法,基于遗传算法的聚类方法,基于 SVM 的聚类方法,基于神经网络的聚类方法等等.1)划分式聚类方法对于一个给定的 n 个数据对象的数据集,采用目标函数最小化的策略,初始时选择一定量的聚类中心或数据点,通过某种原则把数据划分到各个组中,每个组为一个簇。

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数据挖掘
Topic3--聚类分析 K-means &K-medoids 聚类
主要内容
K-means算法 Matlab程序实现 在图像分割上的简单应用 K-medoids算法
k-中心点聚类算法--PAM
K-medoids改进算法
2014-5-12
基于划分的聚类方法

构造n个对象数据库D的划分, 将其划分成k个聚类 启发式方法: k-平均值(k- means)和 k-中心点(k- medoids) 算 法
10 9
Swapping O and Oramdom If quality is improved.
8 7 6 5 4 3 2 1 0
Compute total cost of swapping
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PAM(续)
2014-5-12
k-中心点聚类方法(续) Βιβλιοθήκη 找聚类中的代表对象(中心点)
PAM (Partitioning Around Medoids, 1987)

首先为每个簇随意选择选择一个代表对象, 剩余的对象根 据其与代表对象的距离分配给最近的一个簇; 然后反复地 用非代表对象来替代代表对象,以改进聚类的质量 PAM 对于较小的数据集非常有效, 但不能很好地扩展到大 型数据集
k-中心点聚类方法(续)

算法: k-中心点
(1) 随机选择k个对象作为初始的代表对象;
(2) repeat
(3) 指派每个剩余的对象给离它最近的代表对象所代表的簇; (4) 随意地选择一个非代表对象Orandom; (5) 计算用Orandom代替Oj的总代价S; (6) 如果S<0,则用Orandom替换Oj,形成新的k个代表对象的集 合; (7) until 不发生变化


CLARA (Kaufmann & Rousseeuw, 1990)抽样 CLARANS (Ng & Han, 1994): 随机选样
2014-5-12
k-中心点聚类方法(续)

基本思想:

首先为每个簇随意选择选择一个代表对象; 剩余的对象 根据其与代表对象的距离分配给最近的一个簇
然后反复地用非代表对象来替代代表对象, 以改进聚类 的质量
2014-5-12
Matlab程序实现(续)
Z = zeros(N,K); for m=1:N Z(m,j(m)) = 1; end e = sum(sum(Z.*Dist)./N); fprintf('%d Error = %f\n', n, e); Mo = M; end
2014-5-12
k-平均聚类算法(续)
2014-5-12
PAM

PAM (Partitioning Around Medoids) (Kaufman and Rousseeuw, 1987)

是最早提出的k-中心点聚类算法 基本思想:

随机选择k个代表对象

反复地试图找出更好的代表对象: 分析所有可能的对象对,每个对 中的一个对象被看作是代表对象, 而另一个不是. 对可能的各种组合, 估算聚类结果的质量
best
24
sampled
2014-5-12
CLARA 改良
解決:CLARANS (Clustering Large Application based upon RANdomized Search) 应用 graph 考虑紧邻节点 不局限于区域性 负杂度:O(n^2) → 缺点

j
3. 按下式重新计算k个聚类中心; xs s:label ( s ) j cj , j 1, 2,..., k Nj
4. 重复步骤2和步骤3,直到达到最大迭代次数为止。
2014-5-12
Matlab程序实现
function [M, j, e] = kmeans(X, K, Max_Its) [N,D]=size(X); I=randperm(N); M=X(I(1:K),:); Mo = M; for n=1:Max_Its for k=1:K Dist(:,k) = sum((X - repmat(M(k,:),N,1)).^2,2)'; end [i, j]=min(Dist, [], 2); for k=1:K if size(find(j==k))>0 M(k, :) = mean(X(find(j==k), :)); end end
2014-5-12
在图像分割上的简单应用(续)
分割后的效果
注:最大迭代次数为20次,需运行多次才有可能得到较好的效果。
2014-5-12
在图像分割上的简单应用(续)
例 2:
注:聚类中心个数为5,最大迭代次数为10。
2014-5-12
k-平均聚类算法(续)

优点: 相对有效性: O(tkn),
其中 n 是对象数目, k 是簇数目, t 是迭代次数; 通常, k, t << n.
Assign each remainin g object to nearest medoids
7 6 5 4 3 2 1 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
K=2
Total Cost = 26
Randomly select a nonmedoid object,Oramdom
10
Do loop Until no change
2014-5-12
K-means聚类算法(续)

算法的具体过程 c2, …, ck;
N { x } 1. 从数据集 n n1 中任意选取k个赋给初始的聚类中心c1,
2. 对数据集中的每个样本点xi,计算其与各个聚类中心 cj的欧氏距离并获取其类别标号:
label (i) arg min || xi c j ||2 , i 1,..., N, j 1,..., k


有效性依赖于样本集的大小 基于样本的好的聚类并不一定是 整个数据集的好的聚类, 样本可能发生倾斜

例如, Oi是最佳的k个中心点之一, 但它不包含在样本中, CLARA将找不到 最佳聚类
2014-5-12
CLARA -- 效率

由取样大小决定 PAM → 利用完整资料集 CLARA → 利用取样资料集 盲点:取样范围不包含最佳解

当结果簇是密集的,而簇与簇之间区别明显时,它的效果 较好
Comment: 常常终止于局部最优.


全局最优 可以使用诸如确定性的退火(deterministic
annealing)和遗传算法(genetic algorithms)等技术得到
2014-5-12
k-平均聚类算法(续)

弱点

只有在簇的平均值(mean)被定义的情况下才能使用.可能不适用于 某些应用, 例如涉及有分类属性的数据



第四种情况:p当前隶属于Oi,i≠j。如果Oj被Orandom代替,且p离Orandom最近,
那么p被重新分配给Orandom
2014-5-12
k-中心点聚类方法(续)

1.重新分配给Oi
2. 重新分配给Orandom
3. 不发生变化
2014-5-12
4.重新分配给Orandom
k-中心点聚类代价函数的四种情况
需要预先指顶簇的数目k, 不能处理噪音数据和孤立点(outliers) 不适合用来发现具有非凸形状(non-convex shapes)的簇

2014-5-12
k-中心点聚类方法

k-平均值算法对孤立点很敏感!

因为具有特别大的值的对象可能显著地影响数据的分布.

k-中心点(k-Medoids): 不采用簇中对象的平均值作为参照

10
9

10
10 9 8 7 6 5
9
8
8
7
7
6
6
5
5
4
4 3 2 1 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
将每个 对象赋 给最类 似的中 心
10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0
3 2 1 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
更新簇 的平均 值 重新赋值
4 3 2 1 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
2014-5-12
PAM(续)
Total Cost = 20
10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
10 9 8
10 9 8
Arbitrary choose k object as initial medoids
7 6 5 4 3 2 1 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
2014-5-12
K-means聚类算法

算法描述
1. 为中心向量c1, c2, …, ck初始化k个种子 2. 分组: 将样本分配给距离其最近的中心向量 由这些样本构造不相交( non-overlapping ) 的聚类 3. 确定中心: 用各个聚类的中心向量作为新的中心 4. 重复分组和确定中心的步骤,直至算法收敛
重新赋值
10 9 8 7 6
K=2
任意选择 K个对 象作为初始聚类 中心
更新簇 的平均 值
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