上海交大生化ppt刘建华说课讲解
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第9章 催化策略(刘建华)解析
Ser 195的侧链与His 57的咪唑环形成氢键，咪唑环的 NH又与Asp 102形成氢键，活性位点氨基酸残基这样 的排布称为 催化三联体。
这种排布使Ser 195特别活泼。组氨酸残基定位Ser残基侧链，极 化Ser侧链的羟基（去质子）。底物存在时，His 57侧链接受Ser 195侧链羟基的质子，因此His 57是碱催化剂。Ser 195丢失氢离 子，产生烷基氧离子，其亲核性比羟基大得多。Asp 102协助 His57定位，通过氢键和静电相互作用使His 57更能接受Ser 195 的质子。
第7步： His 57作为酸催化剂，提供质子导致四面体 碳原子崩溃，断裂形成羧基。
第8步：释放羧酸产物和游离酶。
图9.8 胰凝乳蛋白酶水解肽键的催化反应 可以解释共价催化和酸碱催化机制。反应过 程包括8步：（1）底物结合；（2）丝氨酸亲核攻击肽键的羰基碳原子；（3）四面体 崩溃；（4）氨基组分释放；（5）分释放。虚线表示氢键。
图9.2 胰凝乳蛋白酶具有一个高度活泼的丝氨酸。用 DIPF 处 理，胰凝乳蛋白酶分子28个丝氨酸残基中 195位丝氨酸 与DIPF 反应，导致胰凝乳蛋白酶失活。
图9.3 颜色底物。胰凝乳蛋白酶水解 N-乙酰-L-苯丙氨酸-p-硝基 苯酚酯 产生 黄色产物对硝基苯酚。在pH7.0，对硝基苯酚解离。
Berg • Tymoczko • Stryer
Biochemistry
Sixth Edition
Chapter 9: Catalytic Strategies
( 催化策略 ）
Copyright © 2007 by W. H. Freeman and Company
国际象棋和酶都使用策略，国际象棋通过比赛发展策略，而酶则通 过进化建立酶促反应机制。右边是能够酶切肽键的活性位点，由三 个氨基酸残基（化学键是白色）构成。用黑色化学键表示的底物分 子如同左边比赛中已经落入圈套的国王，面临被裂解的命运。
上海交大生化第2章生化(刘建华)
Berg • Tymoczko • Stryer
Biochemistry
Sixth Edition
Chapter 2 Protein Composition and Structure
2020/11/17
Copyright © 2007 by W. H. Freeman and Company
2020/11/17
人胰岛素晶体。胰岛素是蛋白质激素 ，是人体维持适当血糖浓度的关键。 多肽链的氨基酸序列（一级结构）决 定了蛋白质的性质。胰岛素两条多肽 链折叠形成单一胰岛素分子的三级结 构。六个胰岛素分子之间相互作用形 成复合物。这种复合物结构，即胰岛 素分子之间的相互作用叫蛋白质四级 结构。在适当条件诱导下，胰岛素复 合物能形成晶体。蛋白质晶体可以用 来进行蛋白质结构测定。
蛋白质的几个关键性质：
（1）蛋白质是肽键连接氨基酸的线性聚合物 。蛋白质能自动折叠成三维结构，而且蛋白 质的三维结构取决于蛋白质的氨基酸序列。 蛋白质的功能直接依赖于蛋白质的三维结构 。因此，蛋白质是一维的分子序列向三维的 分子功能转化的具体体现。
2020/11/17
（2）蛋白质有很多功能基团。这些功能基团包 括醇羟基、巯基、巯醚基、羧酸基、酰胺基、 和碱性基团。大多数基团有化学反应性。不同 的氨基酸序列其功能基团的组合也不同，这解 释了不同蛋白质执行不同功能的原因。功能基 团的化学反应性是酶催化活性必需的。
（4）有些蛋白质很坚硬，但有些蛋白 质很柔软。坚硬的蛋白质可以作为细胞 骨架或粘联组织的结构元件。而有一定 柔软度的蛋白质可以充当绞合部（ hinges)，弹簧（springs)，或杠杆（ levers)。这些绞合部（hinges)、弹簧（ springs)、或杠杆（levers)对有些蛋白质 的功能、蛋白质之间的相互作用或蛋白 质与其它成分相互作用形成复合物、或 在细胞内或细胞间传递信息是必需的。
Biochemistry
Sixth Edition
Chapter 2 Protein Composition and Structure
2020/11/17
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2020/11/17
人胰岛素晶体。胰岛素是蛋白质激素 ，是人体维持适当血糖浓度的关键。 多肽链的氨基酸序列（一级结构）决 定了蛋白质的性质。胰岛素两条多肽 链折叠形成单一胰岛素分子的三级结 构。六个胰岛素分子之间相互作用形 成复合物。这种复合物结构，即胰岛 素分子之间的相互作用叫蛋白质四级 结构。在适当条件诱导下，胰岛素复 合物能形成晶体。蛋白质晶体可以用 来进行蛋白质结构测定。
蛋白质的几个关键性质：
（1）蛋白质是肽键连接氨基酸的线性聚合物 。蛋白质能自动折叠成三维结构，而且蛋白 质的三维结构取决于蛋白质的氨基酸序列。 蛋白质的功能直接依赖于蛋白质的三维结构 。因此，蛋白质是一维的分子序列向三维的 分子功能转化的具体体现。
2020/11/17
（2）蛋白质有很多功能基团。这些功能基团包 括醇羟基、巯基、巯醚基、羧酸基、酰胺基、 和碱性基团。大多数基团有化学反应性。不同 的氨基酸序列其功能基团的组合也不同，这解 释了不同蛋白质执行不同功能的原因。功能基 团的化学反应性是酶催化活性必需的。
（4）有些蛋白质很坚硬，但有些蛋白 质很柔软。坚硬的蛋白质可以作为细胞 骨架或粘联组织的结构元件。而有一定 柔软度的蛋白质可以充当绞合部（ hinges)，弹簧（springs)，或杠杆（ levers)。这些绞合部（hinges)、弹簧（ springs)、或杠杆（levers)对有些蛋白质 的功能、蛋白质之间的相互作用或蛋白 质与其它成分相互作用形成复合物、或 在细胞内或细胞间传递信息是必需的。
上海交大第3章生化(刘建华)
其沉降速度快。 4. 沉降速度也依赖于溶液密度（r）。溶液r 大， 颗粒沉降慢。。实际上，nr > 1颗粒上浮；当nr = 1颗粒不移动； nr ＜ 1颗粒上浮。
图3.14 细胞组分的密度和沉降系数。
制备密度梯度 介质用于密度 梯度离心。
上样
水平降平衡技术能直接用来测定蛋 白质的分子量。此时离心速度较慢使蛋白 质沉降和蛋白质扩散达到平衡。用离心沉 降平衡技术测定的蛋白质质量非常准确， 条件温和、保留多亚基蛋白质天然的四级 结构。而SDS-PAGE只能提供解离多肽链 的质量。注意，如果我们既知道一个多聚 体蛋白质在变性条件下各个多肽的估算值 ，也知道沉降平衡离心的完整多亚基蛋白 的质量，我们就能够确定该多亚基蛋白各 个多肽链的拷贝数。
Berg • Tymoczko • Stryer
Biochemistry
Sixth Edition
Chapter 3: Exploring Proteins and Proteomes
Copyright © 2007 by W. H. Freeman and Company
奶汁是所有哺乳动物的营养源。奶汁含有不同蛋白质。用 MALDI-TOF质谱技术研究奶汁的蛋白质组成，依靠蛋白分子质 量/电荷比将奶汁蛋白质各组分分开。
依据蛋白质的净 电荷差异
离子交换层析的介质
阳离子交换
阴离子交换
亲和层析：依靠配基与蛋白质之间特异的亲和性。
HPLC (凝胶过滤柱) 支持物颗粒细， 分离效果好，但需要 施加高压才有合理的 流速。
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳
电泳速度 球状分子
u = Ez/f f=6phr
(1) (2)
+ β-mercaptoethanol
图3.14 细胞组分的密度和沉降系数。
制备密度梯度 介质用于密度 梯度离心。
上样
水平降平衡技术能直接用来测定蛋 白质的分子量。此时离心速度较慢使蛋白 质沉降和蛋白质扩散达到平衡。用离心沉 降平衡技术测定的蛋白质质量非常准确， 条件温和、保留多亚基蛋白质天然的四级 结构。而SDS-PAGE只能提供解离多肽链 的质量。注意，如果我们既知道一个多聚 体蛋白质在变性条件下各个多肽的估算值 ，也知道沉降平衡离心的完整多亚基蛋白 的质量，我们就能够确定该多亚基蛋白各 个多肽链的拷贝数。
Berg • Tymoczko • Stryer
Biochemistry
Sixth Edition
Chapter 3: Exploring Proteins and Proteomes
Copyright © 2007 by W. H. Freeman and Company
奶汁是所有哺乳动物的营养源。奶汁含有不同蛋白质。用 MALDI-TOF质谱技术研究奶汁的蛋白质组成，依靠蛋白分子质 量/电荷比将奶汁蛋白质各组分分开。
依据蛋白质的净 电荷差异
离子交换层析的介质
阳离子交换
阴离子交换
亲和层析：依靠配基与蛋白质之间特异的亲和性。
HPLC (凝胶过滤柱) 支持物颗粒细， 分离效果好，但需要 施加高压才有合理的 流速。
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳
电泳速度 球状分子
u = Ez/f f=6phr
(1) (2)
+ β-mercaptoethanol
上海交通大学医学院教案教案
教案课程名称：实验诊断授课题目肝胆疾病的生物化学与实验诊断授课日期2011年授课班级法八专业授课时数2学时授课方式理论授课重点、难点重点：1、肝排泄功能测定2、肝血清酶学测定3、肝脏检查功能的选择和应用难点：1、黄疸的分类和鉴别授课内容、教具与时间分配第一节概述（20min）（教具：PowerPoint）一、肝脏的基本功能(Functions of the liver)二、肝细胞损伤时的物质代谢改变1、糖代谢2、蛋白质和氨基酸代谢3、脂代谢4、激素代谢5、维生素代谢三、肝细胞损伤时常用的生化试验（60min）（教具：PowerPoint）(Laboratory Examinations for Hepatic Diseases)1．肝功能检查的重要性肝脏疾病是我国人民的常见病、多发病，仅乙型肝炎，全国约有一亿二千万以上人口呈病毒感染或发病状态，全国每年约有9～10万人死于原发性肝癌。
2．肝功能检查的目的。
(1)了解肝脏各项功能有无损害及损害程度；(2)通过动态观察判断预后；(3)临床药物的筛选及疗效观察；(4)健康检查及对某些术前病人耐受能力的评价等。
3．肝功能检查的分类蛋白质代谢、糖类代谢的试验、脂类代谢的试验、酶学代谢的试验、胆红素和胆汁酸代谢的试验、色素的排泄试验、激素的代谢试验、维生素的代谢试验、药物转化功能的试验、免疫功能试验。
第__1__页授课内容、教具与时间分配二、蛋白质代谢功能的试验由肝脏合成的蛋白质约占人体每天合成蛋白质总量的40%以上。
当肝脏发生病变时，肝细胞合成蛋白质功能减退，血浆中蛋白质即会发生质和量的改变，血浆白蛋白等由肝脏合成的蛋白质减少，此外由于损伤的肝细胞以及其他致病因子，如肠道细菌经门体短路入体循环可以作为抗原，刺激免疫系统而致γ球蛋白升高。
1．A/G：(1)急性肝脏损害的早期或病变范围较小时，A/G比值仍可正常。
(2)如白蛋白低于30g, 球蛋白高于40g，A/G比值即可小于1，提示有慢性肝实质性损害。
上海交大第7章生化 (刘建华)
红细胞的2,3-二磷酸甘油酸是影响血红蛋白氧 亲和性的关键
为了让血红蛋白有效地发 挥作用，需要血红蛋白在 T-型稳定，直到体内有足 量氧气与血红蛋白结合才 转化成R-型。但是T-型血 红蛋白很不稳定，生理条 件下少量氧气就能将T-型 转化成R-型。比较纯化血红
蛋白和红细胞血红蛋白的氧结合性质，发现红细胞稳定血红蛋白 T-态结构的机制。纯化血红蛋白结合氧的亲和性比红细胞高。这 种差异的基础是细胞含有2,3-二磷酸甘油酸（2,3-BPG）。红细胞 的2,3-BPG含量与血红蛋白含量几乎相当（约2 mM）。这个化合 物含有很多阴离子。没有2,3-BPG，血红蛋白运输氧的能力很差， 在组织只能释放8%的氧气。
图7.17 胎儿红细胞的氧亲和性。由于胎儿红细胞的血红蛋白 不结合2,3-BPG，胎儿红细胞对氧的亲和性比母体红细胞高。
有氧代谢能获得更多的能量，因此从厌氧代 谢转变成有氧代谢是一个巨大的进步。脊椎动 物获取氧气的方式有两种：即用循环系统将氧 气输送到全身和采用血红蛋白运氧和肌红蛋白 储氧。红细胞的血红蛋白能够将肺部氧气运送 到各个组织，并将各组织的CO2和H+运回肺部。 位于肌肉的肌红蛋白是氧气储存蛋白，能及时 提供肌肉需要的氧气。 肌红蛋白和血红蛋白进化相关，结合氧的结 构几乎一致。但是血红蛋白携带氧的能力大， 能够达到90%的潜在氧容量。在相似的条件下， 肌红蛋白质能实现其潜在氧容量的7%。这种巨 大差异的原因何在？
图7.15 纯化的血红蛋白和红细胞的血红蛋白结合氧的情况。纯 化血红蛋白结合氧的亲和性与红细胞血红蛋白结合氧的亲和性 大。这种差异的基础在于红细胞含有2,3-二磷酸甘油酸（2,3BPG）。
2,3-BPG显著降低血红蛋白的氧亲和性的机理： T-态血红蛋白中 心有一个口袋能够结合2,3-BPG，结合后T态更稳定。 T-态转化 成R-态，这个口袋就崩溃， R-态没有这个口袋，释放2,3-BPG。 在2,3-BPG存在时，血红蛋白四聚体需要更多位点与氧结合才能 破坏2,3-BPG与蛋白的相互作用，将T-态转化成R-态。
生化全套ppt胺和生物碱专选课件
盐酸苯胺或苯胺盐酸盐 (aniline hydrochloride)
注意： “氨”用于表示取代基，如氨基酸。 “胺”表示氨的烃基衍生物，如三甲胺 “铵”用于季铵类化合物和胺的离子型化合物。
• 三、胺的结构
氮原子的电子结构为：
↑ ↑↑
E ↑↓ 2P
2S
跃迁
↑
↑ ↑ ↓↑ 杂化
2Px 2Py 2PZ
2S
N
113.9 0
H
N
H H
• 四、胺的物理性质
常温下的状态
甲胺、二甲胺、三甲胺和乙胺为气体，其它胺为液体或固体。
许多胺类有难闻的气味，如三甲胺有鱼腥味、1,4-丁二胺俗 称腐肉胺、1,5-戊二胺俗称尸胺。
沸点(b.p)
与醇相似，伯胺、仲胺可以形成分子间氢键，其沸点高于相 对分子质量相近的非极性化合物(如烷烃)，而低于相应的醇或羧 酸(为什么?)。
3-戊胺
H 2 N C H 2 C H 2 C H 2 C H 2 N H 2 １,４－丁二胺
2．N-取代芳香胺（氨基直接连在苯环上）
当氮上同时连有芳基和脂肪烃基时，以芳胺作母体，在脂 肪烃基前加“N”字表示脂肪烃基连在氮原子上。
NH CH3
CH3 N
C2H5
N-甲基苯胺
N-甲基-N-乙基苯胺
3．复杂的胺
电子效应： 3°胺＞2°胺＞1°胺 空间效应： 1°胺＞2°胺＞3°胺 溶剂化效应： 1°胺＞2°胺＞3°胺
RNH HO O 2 2H H ＞RNHO2H ＞R RNHO2H HO2H R HO2H R 共 轭 酸 稳 定 性 好 ， 酸 性 弱 ， 碱 性 强 。
:
:
:
:
:
2. 芳胺
上海交大第10章生化 (刘建华)解读
图10.6 ATCase结构。（A）从顶部观察天冬氨酸-氨基甲酰转移酶 的四级结构。中间图仅仅代表亚基之间的关系。只能看到一个催 化三体（黄色）的c链，另一个催化亚基（三体）被遮住。一个r链 经过Zn 2+离子与一个c链相互作用。（B）ATCase侧视图。
为了确定活性位点，在N-膦酰乙酰基L-天冬氨酸（PALA）存在的情况下进行 ATCase结晶。PALA是双底物类似物，类似 于催化途、苏氨酸、酪氨酸
磷酸化反应的受体处于细胞内。胞内含有大量的ATP（即磷 酸供体）。完全处于细胞外的蛋白质不受可逆磷酸化调节。 蛋白磷酸酯酶的作用与蛋白激酶相反。这个酶能够将蛋白连 接的磷酸基团水解，再生出侧链含有羟基的氨基酸残基，并 释放磷酸。这些酶在细胞内的功能也很重要，因为它们能够 关闭激酶活化的信号途径。一类高度保守的磷酸酯酶是 PP2A，能够阻遏受癌促进的一些激酶活性。
亚基之间究竟是什么作用能够解释ATCase 的特性？大量的思路来自ATCase的三维结构测 定。William Lipscomb实验室首先用x-晶体衍 射测定ATCase结构。两个催化三体叠加在一起 ，三体之间用调解多肽链联系起来（图10.6） 。催化亚基和调节亚基之间有大量接触：调节 亚基（二聚体）的每条r链与催化三体的一条c 链相互作用。一个Zn 2+与四个半胱氨酸残基结 合稳定c链与r链的一个结构域接触。汞化合物 p-羟基汞苯甲酸与半胱氨酸结合力强，替代Zn 2+导致r-链结构域不稳定，结果催化亚基和调 节亚基发生解离。
乙酰化赖氨酸
磷酸化是调节目标蛋白或性的有效方式 真核细胞各种代谢途径的调节方式几乎都用到磷 酸化机制。实际上，细胞内有30%的蛋白质被磷酸化。 催化磷酸化反应的酶叫蛋白激酶。这些酶构成了目前 所知的最大的蛋白家族。酵母有100多种同源蛋白激酶 ，人类有500多种同源蛋白激酶。品种众多的蛋白激酶 使之能够精细调节各种活性以满足特定组织、特定时 间、和特定底物的需求。 ATP是最常用的磷酸供体分子。ATP的g-磷酸能够 转移给蛋白质特定的氨基酸。在真核生物，磷酸受体 是三个侧链带有羟基的氨基酸。一类蛋白激酶能够将 磷酸转移给丝氨酸或苏氨酸，另一类蛋白激酶能够将 磷酸转移给酪氨酸。多细胞生物独有的酪氨酸蛋白激 酶在生物生长控制方面起非常重要的作用。通常癌细 胞含有这些蛋白激酶的变异。
生化工程 第一章 绪论 PPT课件
• 所以可以把生化工程看成是化学工程的 一个分支，也可以认为是生物工程的一 个重要组成部分。 • 生化工程的任务就是要处理与生物学有 关的工艺过程中的特殊性工程技术问题。 • 在工业规模生产中，如何以较少的原料
和能量，高效率地获得产物，以及如何 将实验室中新发现的物质和过程迅速而 经济地推向工业生产。
３、生化反应器及反应条件的选择和监控
生化反应器是进行生化反应的核心 设备。 它应为细胞或酶提供适宜的反应环 境，以达到细胞生长和进行反应的目的。 反应器的结构、操作方式和操作条 件对反应、原料的转化率、产品的质量 和生产成本有密切的关系。同时反应参 数的检测与控制对生化反应过程的顺利 进行也至关重要。
• 1908年，埃利希和俄裔法国细菌学家梅 契尼科夫（1845-1916）分享诺贝尔生理 医学奖。 • 尽管洒尔佛散有这样那样的问题，但埃 利希已经开启了一种创新的医疗的方法， 是第一位有意识地设计和制造新药的科 学家。这种药是一种化合物，它对人的 身体和细菌产生不同的作用。他发明了 “化学疗法”，
• 他将一些标本堆放在水 槽中，没加盖。过几天后他 才回来清洗盘子。这时他注 意到琼脂凝胶上长出了绿色 的霉菌斑点，其四周有一圈 无菌区：这里的细菌都已被 消灭。 • 弗莱明断定这种霉菌肯 定是分泌出一种对细菌来说 是致命的物质，他把它叫做 Penicillin“青霉素”
• 40年代前期，正好是第二次世界大战 期间，战场上有成千上万的伤员需要 救治，急需药物防止伤口感染。 • 早在1928年英国的学者Fleming发现 了青霉素，1940年分离出纯品， 1941～1942年在临床上应用，证明有 非常好的疗效，这时急待将青霉素投 入工业化生产。这就给传统的发酵工 业提出了一个巨大的难题。为什么说 是巨大的难题呢？
刘建华老师讲义827-PPT精选
1.11 1.33 3.17 2.89 1.35 0.55
NA 0.58 2.36 0.34 0.70 1.59
美国科技股市盈率(P/E)
工业 通讯设备 计算机硬件 计算机网络 计算机外围设备 计算机服务 计算机存储 电子仪器 办公设备 科技仪器 半导体 软件
公司市值 310.0B 296.7B 24.5B 53.6B 239.9B 30.7B 97.9B 33.2B 49.5B 430.5B 527.5B
OTCBB电子柜台板历史资料
3,000,000,000 2,500,000,000 2,000,000,000 1,500,000,000 1,000,000,000
500,000,000 0
2019 2019 2019 2019 2019 2000 2019 2019 2019 2019 2019 2019 2019 2019 2009
日成交股 日成交金额
中国农业“第一股”——永业国际
内蒙古
一种让农作物增产的生物产品——“生命 素”
一组堪称王牌的营销核心团队
美国上市
2019年 2019年4月 2019年4月 2019年9月 2009年5月
公司成立 美国OTCBB上市 1000万美元私募 940万美元私募 900万美元私募
Issue Name
Jingwei International Limited Common Stock
Wowjoint Holdings Limited Common Shares (Cayman Islands)
Wowjoint Holdings Limited Unit (Cayman Islands)
34.28 19.95 22.16 22.65 24.81 24.75 22.30 27.57 25.68 37.40 25.90 15.22
NA 0.58 2.36 0.34 0.70 1.59
美国科技股市盈率(P/E)
工业 通讯设备 计算机硬件 计算机网络 计算机外围设备 计算机服务 计算机存储 电子仪器 办公设备 科技仪器 半导体 软件
公司市值 310.0B 296.7B 24.5B 53.6B 239.9B 30.7B 97.9B 33.2B 49.5B 430.5B 527.5B
OTCBB电子柜台板历史资料
3,000,000,000 2,500,000,000 2,000,000,000 1,500,000,000 1,000,000,000
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2019 2019 2019 2019 2019 2000 2019 2019 2019 2019 2019 2019 2019 2019 2009
日成交股 日成交金额
中国农业“第一股”——永业国际
内蒙古
一种让农作物增产的生物产品——“生命 素”
一组堪称王牌的营销核心团队
美国上市
2019年 2019年4月 2019年4月 2019年9月 2009年5月
公司成立 美国OTCBB上市 1000万美元私募 940万美元私募 900万美元私募
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上海交通大学第6章生化 (刘建华)
考察有进化关系的蛋白质分子中已经 存在的氨基酸替代，基于序列适当比对的数据 ，人们提出了替代矩阵。 1. 发生频率高的替代，得分高；发生频率非 常少的替代，失分就多 2. 一个氨基酸残基缺口扣12分，在此基础上 缺口每增加一个残基加扣2分。 采用这种打分方式，图6.6比对获得115 分。大多数替代是保守替代(得分是正值），极 少数替代是稀有替代（得分是负值）（图6.10 ）。
图6.14 三维结构保守性。人血红蛋白a-链，肌红蛋白，和豆 血红蛋白三维结构保守。每个血红素辅基有一个铁原子。氧 分子就是结合于该铁原子上
蛋白质三维结构更保守。
当你知道血红蛋白、肌红蛋白和豆血红蛋 白的功能相似，你就会预测它们有相似的结构 。但是有些已经鉴定的功能并不相关的蛋白质 却有明显类似的三维结构。例如，肌动蛋白是 细胞骨架的一个主要组分，热休克蛋白70（ Hsp-70）协助胞内蛋白折叠。这两种蛋白质序 列一致性只有15.6%（图6.15）。但是三维结构 比对显示它们是侧向同源物。尽管它们在体内 功能不同，但结构类似显示它们来自同一祖先 。随着空间结构明了的蛋白越来越多，发现这 种意料之外的亲缘关系的概率越来越大。确定 蛋白三维结构后，计算机搜寻三维结构类似蛋 白有助于鉴定这种亲缘关系。
Berg • Tymoczko • Stryer
Biochemistry
Sixth Edition
Chapter 6: Exploring Evolution and Bioinformatics
Copyright © 2007 by W. H. Freeman and Company
蛋白质序列清楚地反映出生物的进化关系。Jane Goodall和一只 黑猩猩互动提示人类与黑猩猩亲缘关系近。血红蛋白的氨基酸 序列也证明人类与黑猩猩的亲缘关系。在血红蛋白153个氨基酸 残基中，人血红蛋白（红色）与黑猩猩血红蛋白（蓝色）只有 一个氨基酸的最 有力工具之一。最新鉴定的新序列与数据库比 较，确定与该序列相关的分子。利用这些信息 ，能够研究具有这种新近测序分子功能和机制 。如果三维结构也清楚，我们能比较三维结构 、证实序列比较的结论，还能揭示那些序列比 较没有发现的成员。
生化演讲 PPT课件
1 • 血液，血量循环速率
2 • 红细胞更新 3 • 腺体活性 4 • 癌组织的部位 5 • 骨组织或血细胞的形成速率
利用砷-74放射正电子湮灭产生γ射线被肿瘤细胞吸收
利用铬酸钠附着在红细胞上的特点标志红细胞
用钴-60标志维生素B12来测定B12在血液中的运转路 径
与甲状腺相结合的碘测定新陈代谢和组织形状机能
由于血红蛋白中含有铁元素，故用Fe-59标志之
用含有P-32的磷酸根来显示血液流动路径
I-131
理论依据：
1：由于处于颈部的甲状腺能有效的从血液中摄取 无机碘，和富集、储存含有碘的物质，并且将这些 碘以蛋白质结合碘的形式（PBI）逐渐释放到血液
里。
2：碘-131与碘-127一样。在化学性质上并没有什 么差别。但是前者具有一定的放射性，而且半衰期 较短，故用来标志化合物
放射性在医学治疗方面的应用
是用各种不同能 量的射线照射肿 瘤，以抑制和杀 灭癌细胞的一种 治疗方法。放疗 可单独使用，也 可与手术、化疗 等配合，作为综 合治疗的一部分， 以提高癌症的治 愈率。
防化
化学武器
化学武器主要指以毒剂杀伤有 生力量，牵制或扰乱军事行动， 毒害植物的毒剂弹药及施放器 材。
说说放射性和防化的那些事
放射性同位素在医学上的应用
一提到原子能，就要和不可捉摸的放射性联系在一 起，一些人往往望而生畏，这说明原子科学领域对 于许多人来说还是陌生的。其实原子能既不可怕， 也不神秘，它在我们的日常生活中正起着越来越大 的作用。
同位素在医学诊断上的应用
在一些具有代表性的医院里，有多达十七种放射 性同位素的测定方法来帮助医生来确诊病情。所 以方法都涉及到示踪量放射性同位素
失能性毒剂——毕兹（BZ）
2 • 红细胞更新 3 • 腺体活性 4 • 癌组织的部位 5 • 骨组织或血细胞的形成速率
利用砷-74放射正电子湮灭产生γ射线被肿瘤细胞吸收
利用铬酸钠附着在红细胞上的特点标志红细胞
用钴-60标志维生素B12来测定B12在血液中的运转路 径
与甲状腺相结合的碘测定新陈代谢和组织形状机能
由于血红蛋白中含有铁元素，故用Fe-59标志之
用含有P-32的磷酸根来显示血液流动路径
I-131
理论依据：
1：由于处于颈部的甲状腺能有效的从血液中摄取 无机碘，和富集、储存含有碘的物质，并且将这些 碘以蛋白质结合碘的形式（PBI）逐渐释放到血液
里。
2：碘-131与碘-127一样。在化学性质上并没有什 么差别。但是前者具有一定的放射性，而且半衰期 较短，故用来标志化合物
放射性在医学治疗方面的应用
是用各种不同能 量的射线照射肿 瘤，以抑制和杀 灭癌细胞的一种 治疗方法。放疗 可单独使用，也 可与手术、化疗 等配合，作为综 合治疗的一部分， 以提高癌症的治 愈率。
防化
化学武器
化学武器主要指以毒剂杀伤有 生力量，牵制或扰乱军事行动， 毒害植物的毒剂弹药及施放器 材。
说说放射性和防化的那些事
放射性同位素在医学上的应用
一提到原子能，就要和不可捉摸的放射性联系在一 起，一些人往往望而生畏，这说明原子科学领域对 于许多人来说还是陌生的。其实原子能既不可怕， 也不神秘，它在我们的日常生活中正起着越来越大 的作用。
同位素在医学诊断上的应用
在一些具有代表性的医院里，有多达十七种放射 性同位素的测定方法来帮助医生来确诊病情。所 以方法都涉及到示踪量放射性同位素
失能性毒剂——毕兹（BZ）
第15章 代谢(刘建华)
ATP具有很高的磷酸化能力的基础在于其分子结构 ATP + H2O 甘油3-磷酸 + H2O ADP + Pi △Go' = - 30.5 kJ mol-1 甘油 + Pi △Go' = - 9.2 kJ mol-1
ATP分子的这种特性与分子自身结构密切相 关。“共振稳定”、“静电斥力”、和“水合稳 定”对这种特性有重大贡献。
图15.6 磷酸基团转移 能力很高的化合物。 这些化合物转移磷酸 基团的能力比ATP还 高，因此能被用来将 ADP转化成ATP。
肌肉的ATP量可维持1秒的肌肉收缩。脊椎动 物肌肉的肌酸磷酸酐是高能磷酸库，能够将磷酸及 时供给ADP。在剧烈运动时，肌酸磷酸酐将ADP转 化ATP。该反应的催化剂是肌酸激酶。 creatine phosphate +ADP
一个代谢途径至少要满足两个标准：(1) 各个 反应必须特异，和(2)构成一个代谢途径的整套反 应在热力学上有利(即自由能变化量小于零)。
在A和B反应生成C和D的反应中，自由能的改 变(△G)可以用下列方程式计算： △G = △Go' + RT ln {[C][D]/[A][B]} 因此，自由能改变△G取决于反应物合生成物的本 质（即△Go'，是标准自由能的变化）以及它们的 浓度。
图15.2 代谢途径。
代谢途径分为两大类：
（1）分解代谢(catabolism, catabolic reactions) ： 将燃料分子的能量转化成生物体可以利用的能 量形式； 燃料 分解代谢 CO2 + H2O + 可用能量 （2）合成代谢(anabolism, anabolic reactions) ： 需要输入能量才能进行的代谢途径。 可用能量+简单前体 合成代谢 复杂分子
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构成人类基因组的DNA分子。染色体显色图谱用于鉴定染色体特定区域。右边是人类7号染色体图谱， 用箭头标出了q31.2条带。该区域编码的蛋白质功能异常将导致囊性纤维化疾病有关[左图来自 Alfred Pasieka/Peter Arnold]。
生物化学的多样性和共同性。经过千百年的进化，不同物种之间的基因表达调节蛋 白质（TATA-box结合蛋白）外形是相似的。
发信人: ccchef(ccchef), (2010年03月29日21:12:35 星期一)
•Just insist on, no need to consider too much.
发信人: JustFight(Gwong yat cham...Tin Hau), (2010年03月29日 20:49:33 星期一)
生物进化的可能时间节点。图中标出了一些关键事件。注意 地球生命在35亿年前就已经产生，而人类在最近才出现。
生命树。从35亿年前的共 同祖先（树的底部）进化 成现代生物（树的顶部） 的可能途径。
DNA的四种碱基。
DNA是核苷酸的线性聚合物。
DNA的双螺旋结构。
DNA复制。如果DNA分子分成两条链，每条 链可以作为模板指导互补链的合成。
•餐具杯具洗具，皆需自己体会。佛曰：“不可说,不可说,一说即 是错。”
发信人: FFCC(小霸王), •上过他生化的飘过... 其实他人还是不错的，考试前题目都会暗 示给你的...不过讲课就...
发信人: seedlin(seedlin), 信区: •你还是尽快背吧……事实证明他很恐怖……
发信人: superddt(superddt), 信区: • 淡定，使劲背就行了。 发信人: fefeyu(成长进行时), 信区: •这几天我也一直想说：珍爱生命，远离生物！
Biochemistry
Siቤተ መጻሕፍቲ ባይዱth Edition
Chapter 1: Biochemistry: An Evolving Science
Copyright © 2007 by W. H. Freeman and Company
疾病和基因组。人类基因组研究能揭示病因和其它的生物化学奥秘。左边是人类染色体，含有
有些分子的共价键有一种以上的画法。例如腺嘌呤可以画成两
种共轭结构。腺嘌呤的真实结构是这两种共振结构的综合，这 可以从键长看出。C4-C5的键长是1.40 A，比单键C-C键长度（ 1.54A）短，比C=C双键长度（1.34A)长。能够写出几种能量 几乎相等的共轭结构的化合物稳定性比没有共轭结构的化合物 更为稳定。
发信人: wangtienan(Tina), 信区: •那老师普通话很差，但是他考试基本都是他说过的，所以上课 一定要听，二书一定要看， ，，一定要背，，，如果这样，一 学期下来能学到很多，，，
发信人: rangeryan(梦想在别处), 信区: 其实学生物就是人间惨剧。
Berg • Tymoczko • Stryer
上海交大生化ppt刘建华
教学语言：
1. Ppt图谱和文字，以英文为主，中文 为辅。
2. 口语教学：以中文为主，适当章节 用英文介绍。
3. 答疑：以中文为主。
交大BBS评论刘建华生化
发信人: Biono(蠹仔), LS 标 题: 刘建华的生化真是人间餐具吗？ •生化选课杯具的被童爷爷踢了，现在极度没底，因为听说刘建华 的课必须买书，考试闭卷 而且很多小测。 这学期学分爆表，如 果真的那么恐怖的话提前就要开始看单词了= =、、、
讲到此处，第一 次课。
此课件下载可自行编辑修改，仅供参考！ 感谢您的支持，我们努力做得更好！谢谢
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生命树。从35亿年前的共 同祖先（树的底部）进化 成现代生物（树的顶部） 的可能途径。
DNA的四种碱基。
DNA是核苷酸的线性聚合物。
DNA的双螺旋结构。
DNA复制。如果DNA分子分成两条链，每条 链可以作为模板指导互补链的合成。
•餐具杯具洗具，皆需自己体会。佛曰：“不可说,不可说,一说即 是错。”
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疾病和基因组。人类基因组研究能揭示病因和其它的生物化学奥秘。左边是人类染色体，含有
有些分子的共价键有一种以上的画法。例如腺嘌呤可以画成两
种共轭结构。腺嘌呤的真实结构是这两种共振结构的综合，这 可以从键长看出。C4-C5的键长是1.40 A，比单键C-C键长度（ 1.54A）短，比C=C双键长度（1.34A)长。能够写出几种能量 几乎相等的共轭结构的化合物稳定性比没有共轭结构的化合物 更为稳定。
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