实验室自建分子诊断项目基本要求专家共识
分子病理实验室建设标准 中华病理学杂志
分子病理实验室建设标准随着分子生物学和病理学领域的不断发展,分子病理实验室作为诊断和研究的重要评台,其建设标准也日益凸显重要性。
本文将从设施、设备、人员和管理等方面,对分子病理实验室的建设标准进行探讨。
一、设施标准1. 实验室位置分子病理实验室应位于医院或科研机构的独立楼层或独立区域,以便于管控实验室环境和防止交叉感染。
2. 实验室面积实验室面积应根据实际需要合理规划,通常应包括样本前处理区、核酸提取区、PCR扩增区、实时荧光定量PCR区、分子杂交实验区等。
3. 实验室环境实验室内应保持稳定的温度、湿度和洁净度,且应有良好的通风系统和消毒设施,以确保实验环境的卫生和安全。
二、设备标准1. 核酸提取仪实验室应配备高质量的核酸提取仪,以确保样本中的核酸能够被有效提取。
2. PCR扩增仪实验室应配备高灵敏度的PCR扩增仪,以满足各种PCR扩增反应的需求。
3. 实时荧光定量PCR仪实验室应配备实时荧光定量PCR仪,以进行高灵敏度的核酸定量和检测。
4. 分析仪器实验室还应配备其他分析仪器,如融合曲线分析仪、电泳仪、基因测序仪等,以满足不同实验需求。
5. 生物安全柜实验室应配备符合生物安全标准的生物安全柜,以保护操作者和样本不受污染。
6. 样本储存设备实验室应配备样本储存设备,如-80℃冰箱、液氮罐等,以保存样本和试剂。
三、人员标准1. 专业技术人员实验室应配备具有分子生物学和临床病理学背景的专业技术人员,其需具备扎实的实验技能和丰富的诊断经验。
2. 实验室主任实验室应有具备丰富临床经验和病理学专业知识的实验室主任,负责实验室的日常管理和质量控制工作。
3. 培训和考核实验室应定期开展技术培训和绩效考核,以确保人员技能的持续提升和实验室工作的高效运转。
四、管理标准1. 实验室管理制度实验室应建立完善的管理制度,包括实验室安全管理制度、设备维护保养制度、实验操作规范等。
2. 质量控制实验室应建立质量控制体系,包括日常质控、内部质控和外部质控,以确保实验结果的准确性和可靠性。
分子诊断检测项目介绍(1)-分子诊断检测项目介绍
分子诊断检测工程介绍前言某某万盖得门诊部是一家由海外归国人员为主体创办的股份制民营医疗机构, 以引进、开发和推广新的医学检验技术为主要经营内容。
万盖得三字来自英语“Vanguard〞的音译,其意译为前哨或尖兵的意思,这明确了创办者“敢为天下人先〞的意愿。
希望能够凭借自身的知识、技术、信息和观念优势,为国内医学检验方面的技术进步以及医疗体制的改革做出奉献。
万盖得将以严肃、严谨和科学的态度开展各项业务,为医院和社区提供高质量的医疗和检验效劳。
分子诊断是我们首先开展的实验诊断效劳,这是一个全新的、被称之为实验诊断一场革命的领域,因为分子技术的临床应用已经使很多用常规技术根本无法检测的病理变化可以被准确的测到。
我们首先开展的用细胞DNA定量分析系统进展肿瘤的早期诊断,处于世界领先地位,这项技术已使脱落细胞的检查成为一项客观、准确、自动化和高通量的肿瘤筛查和早期诊断的技术平台。
我们自主开发的多重PCR检测性病病原、病毒和难以培养的细菌性病原,将给感染性疾病的诊断和治疗带来新的突破性进展。
在医疗效劳方面,我们方案引入兴旺国家中行之有效的家庭医生效劳模式,为中等收入以上的家庭和个人提供个体化和优质的医疗和保健效劳,引导我们的效劳对象建立起防病重于治病的观念,主动地提高自身的保健意识。
与同等规模的医疗机构,保持一种即竞争又合作的新型关系。
与大型综合医院和专科医院,我们希望能建立起互补和互利的协作关系。
我们相信,万盖得在各级领导和医务界同仁的关心和支持下,定能开展壮大。
万盖得首席科技参谋临床微生物学博士吴尚为2006年元月分子诊断目录细胞分子生物学检测细胞DNA定量分析系统简介细胞DNA定量分析的根本原理细胞DNA定量分析的临床应用价值不同DNA指数〔DI〕在宫颈癌普查中的临床意义宫颈癌和宫颈癌的早期诊断宫颈癌筛查和常规宫颈细胞学检查宫颈细胞学检查的方法宫颈细胞DNA定量分析细胞DNA定量分析的其他用途核酸检测技术根本概念多聚酶链反响-PCR人类乳头状瘤病毒的检测人类乳头状瘤病毒人类乳头状瘤病毒与宫颈癌人类乳头状瘤病毒对宫颈癌的“预警〞作用万盖得宫颈癌筛查—预警—监测和早期诊断系统宫颈标本采集、送检须知事项慢性生殖道感染和性传播疾病病原的检测慢性生殖道感染和性传播疾病引起慢性生殖道感染和性传播疾病的常见病原诊断困难造成对发病率统计的困难实验检测方法及优、缺点分子扩增技术的应用促进了对性病的了解PCR已成为检测性病病原的金标准万盖得多重PCR检测性病病原脑脊液中感染病原的检测中枢神经系统感染和诊断人类疱疹病毒与中枢神经系统感染脑脊液中检测病毒的困难万盖得多重PCR检测脑脊液中的疱疹病毒细菌性中枢神经系统感染PCR检测脑脊液中细菌的优越性万盖得多重PCR检测脑脊液中的致病菌呼吸道感染病原的检测呼吸道感染呼吸道感染病原的检测PCR检测法的优越性万盖得多重PCR检测细菌性非典型肺炎病原PCR是检测病毒非典型肺炎病原的最好方法万盖得多重RT-PCR检测病毒性非典型肺炎病原细胞分子生物学检测细胞DNA定量分析细胞DNA定量分析系统简介1、系统组成:数码显微镜、自动送片机、计算机和先进的软件系统〔自动化控制软件和DNA定量分析软件〕。
CNAS-CL02-A009:2018《医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明》
CNAS-CL02-A009医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明Guidance on the Application of Accreditation Criteria for the Medical Laboratory Quality and Competence in the Field of Molecular Diagnostics中国合格评定国家认可委员会前言本文件由中国合格评定国家认可委员会(CNAS)制定,是CNAS根据分子诊断领域的特性而对CNAS-CL02:2012《医学实验室质量和能力认可准则》所作的进一步说明,并不增加或减少该准则的要求。
本文件与CNAS-CL02:2012《医学实验室质量和能力认可准则》同时使用。
在结构编排上,本文件章、节的条款号和条款名称均采用CNAS-CL02:2012中章、节条款号和名称,对CNAS-CL02:2012应用说明的具体内容在对应条款后给出。
本文件的附录A、B为规范性附录。
附录的序号及内容与CNAS-CL02:2012不对应。
本文件代替:CNAS-CL36:2012。
本次为换版修订,相对于CNAS-CL36:2012,本次换版仅涉及文件编号改变。
医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明1 范围本文件规定了CNAS对分子诊断领域的认可要求,包括:病原体核酸和人体基因等领域涉及的核酸扩增试验、杂交试验(包括原位杂交试验)、核酸电泳分析等。
2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。
凡是注日期的引用文件仅注日期的版本适用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括修改单)适用于本文件。
GB/T 20468-2006 临床实验室定量测定室内质量控制指南CNAS-RL02 能力验证规则临床技术操作规范·病理学分册,人民军医出版社,2004医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则病理科建设与管理指南(试行),卫办医政发〔2009〕31号3 术语和定义4 管理要求4.1 组织和管理责任4.1.1.2 实验室为独立法人单位的,应有医疗机构执业许可;实验室为非独立法人单位的,其所属医疗机构执业证书的诊疗科目中应有医学实验室;自获准执业之日起,开展分子诊断工作至少2年。
临床分子病理试验室二代基因测序检测专家共识
临床分子病理实验室二代基因测序检测专家共识近年二代基因测序( next-generation sequencing ,NGS)技术快速发展,其应用已进展至临床检测,如遗传疾病、实体肿瘤、血液肿瘤、感染性疾病、人类白细胞抗原分析及非侵袭性产前筛查等。
国内外有关学会已出台相关共识与指南以推动其在临床中的应用。
中华医学会病理学分会和中国抗癌协会肿瘤病理专委会前期组织病理、临床、生物信息等专家进行了充分讨论,拟在NGS 的操作流程、数据处理、结果解读等方面作规范和建议,以规范NGS 在分子病理领域的应用。
临床分子病理实验室NGS 样本可采用甲醛固定石蜡包埋组织(formalin-fixedparaffin-embedded ,FFPE)新鲜组织、各种体液上清液、体液离心细胞块、石蜡包埋标本和血浆/血液标本等。
本共识特色是基于病理评估的组织样本(FFPE新鲜)的规范。
测序分析范围基于目前临床需求,本共识着重在于目标区域测序( panel )分析的实践。
随着技术的更新和应用的成熟,本共识将持续更新以满足临床需求。
一、实验室总体要求NGS 检测实验室的总体设计与要求应参考《分子病理诊断实验室建设指南(试行) 》《医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则》、《个体化医学检测质量保证指南》、《肿瘤个体化治疗检测技术指南》、《个体化医学检测实验室管理办法》、《测序技术的个体化医学检测应用技术指南(试行)》进行。
1.NGS检测人员的资质要求:NGS检测技术人员应具备临床病理学、分子生物学的相关专业大专以上学历,并经过NGS 技术的理论与技能培训合格。
数据分析人员应具有临床医学或分子生物学或遗传学知识背景并经生物信息学培训。
最终报告应由中级或硕士以上具有病理学背景、经培训合格的本单位执业医师或者授权签字人(医学博士学位或高级职称)审核。
2.NGS检测实验室的区域设置要求:原则上NGS实验室应当有以下分区:样本前处理区、试剂储存和准备区、样本制备区、文库制备区、杂交捕获区/多重PCR区域(第一扩增区)、文库扩增区(第二扩增区)、文库检测与质控区、测序区、数据存贮区。
临床基因扩增检验实验室设计及建设要点
临床基因扩增检验实验室设计及建设要点1.实验室设计布局以四区设计为例,更高分区要求以此类推:mNGS实验室设置应该严格按照《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》(卫办医政发〔2010〕194号)国家卫健委高通量测序实验室的要求进行,临床基因扩增检验实验室应获得监管属地临床检验中心的认可,标准化分区及空气流向,确保工作有序,互不干扰,防止污染。
四区必须完全独立、大量的新风补充、不同区域的不同压力梯度、较严格的湿度控制要求、较高的洁净度要求。
1)装修材料简明洁净的外观 SL-6040A标准PCR实验室主要由彩钢板、铝合金型材和玻璃等材料构成,其四角采用铝合金圆角立柱支撑,实验室内角采用铝合金内圆角装饰,结构牢固,线条简明,美观大方,密封性好。
2)隔断布局试剂准备区试剂准备区配备有2~8℃冰箱,计算冷负荷时,需要将它们计算在内。
房间的面积宜控制在15~20㎡。
标本制备区标本制备区配备有2~8℃冰箱和-20℃冰箱,计算冷负荷时,需要将它们计算在内。
在标本制备区,还需要配备生物安全柜,用于进行提取核酸的操作。
为避免提取的核酸在柜内反复循环,造成标本之间的交叉污染,出现假阳性结果,该区域配备的生物安全柜必须是B2型的。
生物安全柜工作区垂直气流全部来自实验室,排风经过高效过滤器过滤后直接排至室外,不允许回到安全柜和实验室中。
如果实验室内配备生物安全柜,每配备一台,实验室的面积增加10㎡;标本制备区的面积宜在30~40㎡之间。
扩增室扩增室主要配备PCR实验室的核心仪器PCR仪,在实验室建造过程中,需要给PCR仪配备专门的UPS电源,保证它的正常工作。
该区面积控制在25~30㎡。
产物分析区在室内配备通风橱,保证房间内的相对负压,空气从室外流向室内。
该区面积控制在30~40㎡,用于测序仪增加等。
另外此分区为负压最大区域,考虑冷量损耗,工作温度:19-25℃(22±3℃),工作湿度:维持20-80%的不凝结的相对湿度。
LDT新形势丨实验室自建检测方法的发展与管理建议
LDT新形势⼁实验室⾃建检测⽅法的发展与管理建议来源:中华检验医学杂志2021年2⽉9⽇,国务院发布最新版《医疗器械监督管理条例》(将于6⽉1⽇起施⾏),其中第 53条提到“对于符合条件的医疗机构,可根据单位需求⾃⾏研发在国内暂⽆上市产品的体外诊断试剂,在医师指导下使⽤。
”这将促进实验室⾃建检测⽅法(LDT)的发展,更好地助⼒精准医疗。
⾯对新的机遇,检验部门该如何发展和管理LDT?复旦⼤学中⼭医院检验科潘柏申教授曾执笔“我国医学检验部门⾃建检测⽅法发展与管理建议”,发布于《中华检验医学杂志》。
现将建议内容整理如下,供⼤家交流学习。
医学检验部门⾃建检测⽅法(laboratory developed tests,LDT)的定义医学检验部门⾃建检测⽅法(laboratory developed tests,LDT)通常是指医学检验部门⾃⾏研发、验证和使⽤的检测⽅法,仅在医学检验部门内部使⽤,不作为商品出售给其它医学检验部门、医院及个⼈。
传统的医学检验往往使⽤医学检验部门⾃⾏研发、配制的简单⼿⼯检测⽅法与检测试剂,检测结果需要⼈为判读。
近年来随着检测技术的不断创新,新技术新项⽬在医学检验部门从研发向临床应⽤快速转化,医学检验部门运⾏理念变化,个体化医疗和精准医疗的临床需求增加,LDT的内涵已发⽣了巨⼤改变。
下⼀代测序技术(next generation sequencing,NGS)、液相⾊谱-质谱分析技术(liquid chromatograph mass spectrometer,LC-MS)等临床应⽤都离不开LDT。
这些检测⽅法的仪器设备复杂,检测试剂通常需要根据不同检测⽅法需求配制,操作技术难度较⼤,操作⼈员素质和技术能⼒要求⾼,结果解释的临床⽔平要求⾼。
在个体化医疗和精准医疗的⼤背景下,随着临床需求的不断增长,这类检测项⽬通常⽤于协助选择更为有利的精准治疗⽅式,预测疾病风险等。
建议1 LDT通常是指医学检验部门⾃⾏研发、验证和使⽤的检测⽅法,仅在医学检验部门内部使⽤,不作为商品出售给其它医学检验部门、医院及个⼈。
分子病理诊断实验室建设指南
分子病理诊断实验室建设指南分子病理诊断实验室是现代医学诊断领域中的一项重要技术,它通过对疾病相关基因、蛋白质和其他分子的检测研究,为疾病的早期诊断、治疗选择和预后评估提供了有效的手段。
为了保证实验室的质量和高效运行,制定一套科学合理的实验室建设指南是必不可少的。
首先,实验室的选址是关键。
分子病理诊断实验室应位于医院或研究机构的临床科室或病理科室附近,便于与临床医生和病理医生紧密合作。
同时,实验室应具备良好的空气净化设施和温度控制系统,以保证实验环境的洁净度和稳定性。
其次,实验室设备的配置要恰当。
分子病理诊断实验室需要配置基因分析仪器、蛋白质分析仪器、实时荧光定量PCR仪、DNA测序仪等先进设备,以满足各种分子检测技术的要求。
此外,还需要有高效的数据处理和存储系统,以便于数据的管理和分析。
第三,实验室的人员培训和管理要到位。
实验室需要有一支专业的团队,包括博士和硕士学位的医学或生物学专业人员,并经过相关分子生物学和病理学的培训,具备扎实的实验技术和丰富的临床经验。
同时,实验室应建立健全的实验室管理制度,包括实验室安全、实验操作规范、质量检查和控制等方面的要求。
第四,实验室的质量控制要强化。
实验室应定期进行质量控制,包括样本质量控制、检测方法的准确性和精确性的评估等。
实验室应参与外部质量评估计划,与其他实验室进行比对,确保检测结果的准确性和可靠性。
此外,实验室还应建立标本储存和管理制度,保证样本的保存和追溯。
第五,实验室的信息化建设要跟上。
实验室应建立完善的样本信息管理系统,包括样本编号、采集时间、采集人员等信息的记录和查询功能,以方便实验室运作和数据的整理和分析。
此外,实验室还应建立和临床医学信息系统的接口,方便与临床医生和病理医生的交流和合作。
总之,分子病理诊断实验室的建设应从选址、设备配置、人员培训、质量控制和信息化建设等多个方面进行规划和实施。
只有科学合理地建设,才能为临床医生和病理医生提供准确可靠的分子诊断结果,为患者的早期诊断和治疗选择提供有力的支持。
最新TORCH实验室规范化检测与临床应用专家共识
最新TORCH实验室规范化检测与临床应用专家共识TORCH指一组病原体,包含弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等,孕妇感染此类病原体后可通过胎盘或产道感染胎儿或者新生儿,可能导致流产、早产、畸胎、死胎、宫内发育迟缓、新生儿多器官损害等不良预后。
对于多数孕期ToRCH感染,目前尚缺乏有效的治疗手段,加强孕前、产前TORCH感染监测至关重要。
TORCH实验室检测在其中发挥着重要作用,但TORCH检测流程的规范化、检验结果的正确解读尚需形成共识性意见。
本文基于TORCH检测方法特点,针对不同病原体的感染特点、感染类型,从实验室角度对TORCH规范化检测与临床应用给出了共识性意见。
TORCH一词最早于1971年由埃默里大学免疫学家AndreNahmia提出,包含一组可导致先天性宫内感染的病原体,其中To代表弓形虫(Toxoplasmagondii,Toxo),R代表风疹病毒(Rubellavirus,RV),C代表巨细胞病毒(Cytomegalovirus,CMV),H代表单纯疱疹病毒(Herpessimplexvirus,HSV)[1]o随后发现EB病毒(Epstein-Barrvirus,EBV)、人类免疫缺陷病毒(humanimmunodeficiencyvirus z HIV)x人细小病毒B19等其他病原体也可导致宫内感染和新生儿不良预后「TORCH”中的“0(OtherS)”也因此被用于代表其他相关病原体[2]。
在TORCH中,最受临床关注的是巨细胞病毒、弓形虫、风疹病毒、单纯疱疹病毒、人细小病毒B19,因为这几种病原体感染率相对较高,无特异性临床表现或临床症状轻微,容易忽视,但孕妇感染后病原体可通过胎盘或产道感染胎儿或者新生儿,可能导致流产、早产、畸胎、死胎、宫内发育迟缓、新生儿多器官损害等不良预后[2]。
对于多数孕期TORCH感染,目前尚缺乏有效的治疗手段,因此加强孕前、产前TORCH感染监测至关重要,有助于避免相关不良妊娠结局的发生。
2024年分子诊断项目建议书
分子诊断项目建议书目录序言 (4)一、风险应对评估 (4)(一)、政策风险分析 (4)(二)、社会风险分析 (4)(三)、市场风险分析 (5)(四)、资金风险分析 (5)(五)、技术风险分析 (5)(六)、财务风险分析 (5)(七)、管理风险分析 (6)(八)、其它风险分析 (6)二、工程设计说明 (6)(一)、建筑工程设计原则 (6)(二)、分子诊断项目工程建设标准规范 (6)(三)、分子诊断项目总平面设计要求 (7)(四)、建筑设计规范和标准 (7)(五)、土建工程设计年限及安全等级 (7)(六)、建筑工程设计总体要求 (7)三、后期运营与管理 (8)(一)、分子诊断项目运营管理机制 (8)(二)、人员培训与知识转移 (8)(三)、设备维护与保养 (9)(四)、定期检查与评估 (10)四、建设规划分析 (10)(一)、产品规划 (10)(二)、建设规模 (11)五、科技创新与研发 (12)(一)、科技创新战略规划 (12)(二)、研发团队建设 (13)(三)、知识产权保护机制 (15)(四)、技术引进与应用 (16)六、质量管理与监督 (17)(一)、质量管理原则 (17)(二)、质量控制措施 (19)(三)、监督与评估机制 (20)(四)、持续改进与反馈 (22)七、人员培训与发展 (25)(一)、培训需求分析 (25)(二)、培训计划制定 (26)(三)、培训执行与评估 (27)(四)、员工职业发展规划 (28)八、合作伙伴关系管理 (30)(一)、合作伙伴选择与评估 (30)(二)、合作伙伴协议与合同管理 (31)(三)、风险共担与利益共享机制 (32)(四)、定期合作评估与调整 (33)九、员工福利与团队建设 (34)(一)、员工福利政策制定 (34)(二)、团队建设活动规划 (35)(三)、员工关怀与激励措施 (35)(四)、团队文化与价值观塑造 (37)十、资源有效利用与节能减排 (38)(一)、资源有效利用策略 (38)(二)、节能措施与技术应用 (39)(三)、减少排放与废弃物管理 (39)序言随着全球市场一体化步伐的加快,跨界合作已经成为推动企业发展新趋势。
临床分子病理实验室二代基因测序检测专家共识
临床分子病理实验室二代基因测序检测专家共识背景和意义随着研究和技术的不断进步,二代基因测序技术已成为临床疾病分子诊断领域的重要工具。
它可以对肿瘤、遗传病、细菌感染等进行高通量全基因组、全外显子、全转录组等研究,并为个体化医学提供支持。
然而,在临床应用中,大规模数据的产生和分析带来了诸多挑战,如样本处理、数据分析和解读标准化等。
因此,为推动二代基因测序技术在临床中的应用,制定共识标准十分必要。
共识的制定过程该共识标准由临床分子病理实验室二代基因测序检测专家共同制定。
共识包括样本采集、DNA提取、测序、数据分析、质控及结果解读。
样本采集和处理对于疑似肿瘤患者的血液和组织样本,需要按照病理学标准进行采集,并做相关记录。
对于血液样本,要使用抗凝剂保护,避免细胞破裂和DNA降解。
对于组织样本,要迅速固定并保护样本完整性。
所有样本要在规定时间内运送到实验室,并放置于正确的温度下保存。
DNA提取和准备DNA提取要根据实验室标准程序进行,严格遵循消毒规程,防止交叉污染和误操作。
提取的DNA需要满足质量和纯度标准,否则会影响测序结果。
测序和数据分析在测序前,需要对DNA进行文库制备和样本标记。
测序的数据要通过正确的软件进行基础数据质控、数据过滤、监测和清理。
对于数据质量问题,要评估是否合格,是否需要重复测试和检查。
分析要根据普通(germline)和肿瘤(somatic)样本的碱基类型、突变类型、外显子和基因进行。
质量控制二代基因测序的结果要进行质量控制,包括是否完整、准确和可重复等。
要定期同步并评估先前记录和标准操作,以及样本质量和实验室管理情况的自行监测和审核。
结果解读在解读结果之前,要对结果进行合并和检验。
分析结果应该与患者的临床信息、病史、病理学等进行整合。
对于整合后得出的,要根据医生的经验和可信度的科学证据进行确认或排除。
本共识标准制定了临床分子病理实验室二代基因测序的标准,并指出了样本采集、DNA提取、测序、数据分析、质控及结果解读中需要遵守的严格规定。
早期胰腺癌分子诊断专家共识 2023年版
早期胰腺癌分子诊断专家共识(2023年版)中国医师协会临床精准医疗专业委员会,中国抗癌协会肿瘤胰腺病学专业委员会通信作者:肖桂山,**************.cn(ORCID:0000-0002-3195-1285);郭俊超,****************(ORCID:0000-0002-6759-5147);郭晓钟,**********************(ORCID:0000-0002-6397-0501)摘要:胰腺癌是一种较为常见的消化系统肿瘤,早期诊断困难,恶性程度极高。
以肿瘤生物标志物为核心的分子辅助诊断技术,结合现有临床金标准,对于实现早期精准检测、及时治疗干预及降低病死率具有重要的临床意义。
研究证实,微小RNA(miRNA)在胰腺肿瘤不同病理时期出现的种类和表达量变化呈现高度特异性,可用于胰腺肿瘤发生、发展的全程监测。
单个miRNA的诊断潜力有限,miRNA组合或可有效提升对早期胰腺癌变的诊断性能。
本共识基于近年相关研究进展,填补胰腺癌临床诊疗指南中关于分子诊断技术的空白,并提供专家指导意见。
关键词:胰腺肿瘤;癌症早期检测;生物标记,肿瘤;微RNAs;专家共识基金项目:国家自然科学基金(81770846, 81642006); Hirshberg胰腺癌研究基金(AH201901083);康德生物癌症研究基金(KD2021030001)Expert consensus on the molecular diagnosis of early-stage pancreatic cancer (2023 edition)Professional Committee on Clinical Precision Medicine,Chinese Medical Doctor Association;The Society of Pancreas Cancer,Chinese Anti-Cancer AssociationCorresponding authors: XIAO guishan,**************.cn(ORCID: 0000-0002-3195-1285); GUO Junchao,****************(ORCID: 0000-0002-6759-5147); GUO Xiaozhong,**********************(ORCID: 0000-0002-6397-0501)Abstract:Pancreatic cancer is a relatively common tumor of the digestive system, with difficulties in early-stage diagnosis and an extremely high degree of malignancy. Molecular diagnostic technology based on tumor biomarkers, combined with the existing gold standard in clinical practice, is of great clinical significance to achieve early accurate identification, timely treatment and intervention, and reduction in mortality. Previous studies have shown that miRNAs show high specificity in terms of types and expression levels in different pathological stages of pancreatic cancer and can thus be used in monitoring the development and progression of pancreatic cancer. Since a single miRNA has a limited diagnostic potential, the combination of different miRNAs may effectively improve the diagnostic efficiency of early-stage pancreas carcinogenesis. Based on related research advances in recent years, this consensus document aims to fill the gap in molecular diagnostic technology in the guidelines for the clinical diagnosis and treatment of pancreatic cancer and provide expert guidance and recommendations. Key words:Pancreatic Neoplasms; Early Detection of Cancer; Biomarkers, Tumor; MicroRNAs; Expert Consensus Research funding:Natural National Science Foundation of China (81770846,81642006);U.S.Hirshberg Foundation for Pancreatic Cancer Research (AH201901083); Kante Seeds Grant Foundation for Cancer Research (KD2021030001)中国国家癌症中心2022年发布的癌症数据[1]显示:2016年我国胰腺癌发病人数约10万,死亡人数约8.8万,是第6大高病死率恶性肿瘤。
CNAS-CL36:2012分子诊断领域应用说明书
CNAS-CL36医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明Guidance on the Application of AccreditationCriteria for the MedicalLaboratory Quality and Competence in the Field ofMolecular Diagnostics(征求意见稿)中国合格评定国家认可委员会前言本文件由中国合格评定国家认可委员会(CNAS)制定,是CNAS根据分子诊断领域的特性而对CNAS-CL02:2012《医学实验室质量和能力认可准则》所作的进一步说明,并不增加或减少该准则的要求。
本文件与CNAS-CL02:2012《医学实验室质量和能力认可准则》同时使用。
在结构编排上,本文件章、节的条款号和条款名称均采用CNAS-CL02:2012中章、节条款号和名称,对CNAS-CL02:2012应用说明的具体内容在对应条款后给出。
本文件的附录A、B为规范性附录。
附录的序号及内容与CNAS-CL02:2012不对应。
本文件于2012年制定,本次为第1次修订换版。
医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明1 范围本文件规定了CNAS对分子诊断领域的认可要求,包括:病原体核酸和人体基因等领域涉及的核酸扩增试验、杂交试验(包括解剖病理中的原位杂交试验)、核酸电泳分析等。
注:“分子诊断”包括检验医学领域的“分子检验”以及病理学检查领域的“分子病理”。
2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。
凡是注日期的引用文件仅注日期的版本适用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括修改单)适用于本文件。
GB/T 20468-2006 临床实验室定量测定室内质量控制指南CNAS-RL02 能力验证规则CNSA-CL31 内部校准要求临床技术操作规范·病理学分册,人民军医出版社,2004医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则病理科建设与管理指南(试行),卫办医政发〔2009〕31号3 术语和定义4 管理要求4.1 组织和管理责任4.1.1.2 实验室为独立法人单位的,应有医疗机构执业许可;实验室为非独立法人单位的,其所属医疗机构执业证书的诊疗科目中应有医学实验室,自获准执业之日起,开展医学检验/病理工作至少2年。
临床基因检验诊断报告模式专家共识
临床基因检验诊断报告模式专家共识临床基因检验已覆盖了肿瘤、遗传病、血液病、感染性疾病、神经精神性疾病、器官移植、出生缺陷、个体化药物治疗等多个领域[1,2,3,4,5,6,7,8],临床基因检验诊断报告对机体易感性评估、疾病诊断、预后、治疗监测、遗传咨询、健康管理以及家庭生育计划制定等均具有重要的参考价值。
因此,临床基因检验诊断报告应该明确、简洁、准确可靠,并具有充分的解释、可信性和权威性。
中国医师协会检验医师分会分子诊断专家委员会组织相关专家对临床基因检验诊断报告模式进行了研讨并达成以下共识。
一、基本要素1.题目与格式:临床基因检验诊断报告应具有醒目的题目,明确标示出检验的靶标。
2.患者信息:报告中明确包含患者姓名、性别、出生日期,必要时注明种族、籍贯或地域来源。
当家族成员多人同时送检时,应有足够信息区分家庭成员身份,需要时包含家族或谱系信息等。
对于家系的说明,表格或谱系所提供的信息更适合连锁分析。
3.临床信息:临床医师应在申请检验时提供简要的临床信息,应至少包含疾病的诊断或初步诊断、申请检验目的(指需要明确疾病发病状态或携带者状态等)、家族史或既往史。
实验室人员往往需要结合临床信息对检验结果进行综合分析,必要时根据检验结果提出其他的相关建议。
如果未提供任何临床信息,实验室人员应主动向临床咨询[9]。
4.样本信息:每份样本应当有唯一标识,注明样本类型、样本采集时间、样本接受时间、报告时间、需要时注明样本状态(如:已分离的DNA或已裂解白细胞等)。
胎儿标本(如羊膜穿刺标本、绒毛膜标本等)应与其母亲标本清晰分开,且不可以使用母亲姓名。
5.医师和实验室信息:包括申请医师的姓名、实验室名称、实验室地址和联系电话。
6.页码:报告单中每页均应包含页码,页码采用"当前页码/总页码"的格式注明,即使报告单仅有1页,也应当采用此种方式进行标注。
报告为多页时,每页均应注明患者基本信息和样本唯一标识(如ID号)[10]。
医疗机构分子病理实验室建设规范
医疗机构分子病理实验室建设规范随着分子病理学的发展,对医疗机构分子病理实验室建设的要求也越来越高。
因此,我们有必要为医疗机构的分子病理学实验室建设制定相应的规范,以保证实验室的质量和安全。
1、建设范围在建设或改建医疗机构分子病理实验室时,首先要明确其建设目标和范围。
建设目标应包括:分子病理技术应用以诊断疾病;对分子病理技术的研究与开发;分子病理技术的教学。
2、实验室环境要求为确保实验室的质量,要求实验室环境要达到设计所要求的标准:实验室内的温度、湿度、气压、通风等环境参数符合国家质量标准;检材、试剂、仪器和其他物质的新鲜度、纯度要求要高于国家质量标准;检材储存环境温度应放置于2-8摄氏度之间;检材及标本应使用快速冷冻设备,使检材保持其自然状态,而不会发生任何可能的改变;实验室内的安全、消毒、除毒、消臭等系统完善,确保实验室的安全;实验室室内间距较大,以便进行有效的管理和安排实验;防止外来污染物进入实验室,如粉尘、液体、高尔夫和烟草等。
3、实验室设备及软件实验室安装的设备必须符合国家质量标准,主要包括:分子生物技术实验室设备、脱氧核糖核酸检验仪、杂交设备、实验仪器、质谱仪等。
同时,实验室还需要安装软件系统,以支持实验室的操作。
常用的软件系统包括:实验室安全控制系统、实验数据分析、实验数据库系统、实验室管理系统等。
4、实验室人员实验室人员是构成实验室的重要组成部分,实验室建设规范要求实验室人员具备有丰富的分子病理学知识,并至少具有大专以上学历,专业技术职称最好达到副高以上水平。
另外,实验室人员必须具有一定的操作技能,熟悉中国国家质量标准和国际认可的各种实验技术、管理要求,确保实验室质量。
5、实验室宣传及质量管理实验室的宣传是保证其质量和形象的重要环节,实验室建设规范要求实验室必须通过各种方式做好宣传工作,如发布实验室动态、参加社会招聘会等,使更多的学生和实验室工作者了解实验室。
此外,实验室还需要建立完善的质量管理机制,如设置质量管理部门、定期对实验室进行审核和检查等。
CNAS-CL02-A0092018《医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明》
CNAS-CL02-A009医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明Guidance on the Application of Accreditation Criteria for the Medical Laboratory Quality and Competence in the Field of Molecular Diagnostics中国合格评定国家认可委员会前言本文件由中国合格评定国家认可委员会(CNAS)制定,是CNAS根据分子诊断领域的特性而对CNAS-CL02:2012《医学实验室质量和能力认可准则》所作的进一步说明,并不增加或减少该准则的要求。
本文件与CNAS-CL02:2012《医学实验室质量和能力认可准则》同时使用。
在结构编排上,本文件章、节的条款号和条款名称均采用CNAS-CL02:2012中章、节条款号和名称,对CNAS-CL02:2012应用说明的具体内容在对应条款后给出。
本文件的附录A、B为规范性附录。
附录的序号及内容与CNAS-CL02:2012不对应。
本文件代替:CNAS-CL36:2012。
本次为换版修订,相对于CNAS-CL36:2012,本次换版仅涉及文件编号改变。
医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明1 范围本文件规定了CNAS对分子诊断领域的认可要求,包括:病原体核酸和人体基因等领域涉及的核酸扩增试验、杂交试验(包括原位杂交试验)、核酸电泳分析等。
2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。
凡是注日期的引用文件仅注日期的版本适用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括修改单)适用于本文件。
GB/T 20468-2006 临床实验室定量测定室内质量控制指南CNAS-RL02 能力验证规则临床技术操作规范·病理学分册,人民军医出版社,2004医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则病理科建设与管理指南(试行),卫办医政发〔2009〕31号3 术语和定义4 管理要求4.1 组织和管理责任4.1.1.2 实验室为独立法人单位的,应有医疗机构执业许可;实验室为非独立法人单位的,其所属医疗机构执业证书的诊疗科目中应有医学实验室;自获准执业之日起,开展分子诊断工作至少2年。
分子诊断技术评审存在问题
关注点
检验项目癿临床适应症癿把握及临床解读 后续质量控制 申请材料癿质量 评审重点:方法学验证—真正了解试剂、仪器癿性能 • 本实验室是否独立完成? • 标本选择是否有点代表性? • 验证方法是否妥当?
性能验证要求
第四版操作 规程要求
精密度 定量项目 正确度
测量区间 参考范围
重复性 定性项目 方法学比较
[2015]71号)
关于进一步做好本市医疗技术临床应用管理工作癿通知 (沪卫计医政
[2016]010号)
关于临床检验项目管理有关问题癿通知 (国卫办医函[2016]167号)
分子诊断相关政策
技术规范(7)
测序技术癿个体化医学检测应用技术指南(试行) 2015
遗传病相关个体化医学检测技术指南(试行) 2015
情况癿检索报告及技术资料
评估流程
医疗机构提出技术评估申请(/医疗技术评估) 临检中心文件初审
专家评估
PCR实验室验收:现场评估 新技术、首次开展项目:评审会 扩项:临检中心评估
临检中心出具评估报告
扩项清单
HBV DNA、HCV RNA EBV DNA、CMV DNA TB DNA CT DNA、 NG DNA、UU DNA HPV DNA 、HPV 基因分型
符合率验证时未覆盖试剂所涉及癿病原体或基因型 比对方法未选择釐标准或公认方法
存在问题3-室间质评或室间比对
室间质评成绩
• 有室间质评项目未提供EQA成绩 • 提供癿丌是申请项目癿EQA(提供其他项目癿EQA成绩)
室间比对报告
• 缺室间比对癿实验室资质及质量情况 • 室间比对实验室癿独立性、客观性?(厂家成立癿外地癿医学检验所) • 比对标本选择:覆盖范围、标本信息溯源性
实验室自建分子诊断项目基本要求专家共识
实验室自建分子诊断项目基本要求专家共识实验室自建的分子诊断项目是基于分子生物学技术和分子遗传学定量方法的一种新型医学诊断方法,可用于疾病的早期诊断、预后判断、治疗效果监测、药物剂量个体化等方面。
在进行实验室自建分子诊断项目前,需要达成专家共识,以确保项目的准确性、可行性和可靠性。
以下是实验室自建分子诊断项目的基本要求专家共识。
1.研究目标明确:实验室自建分子诊断项目应明确研究的目标和意义,如开发新的分子标记物、建立新的检测方法或优化现有的分子诊断技术等。
确立明确的研究目标可为项目的实施提供具体的指导。
2.实验设计合理:实验室自建分子诊断项目的实验设计应合理,包括实验组设计、对照组设计、样本数量确定、实验重复次数等。
通过合理的实验设计可以减少误差的引入,提高实验结果的可靠性。
3.样本收集和储存标准化:实验室自建分子诊断项目中,样本的收集和储存应按照标准化操作进行,以确保样本的质量和有效性。
应制定标准操作程序,规定采样时间、样本类型、采集方法、储存条件等细节,并进行细致的记录。
4.分子技术平台的建设:实验室自建分子诊断项目需要建立适当的分子技术平台,包括提取核酸的方法、PCR扩增的方法、DNA测序的方法、蛋白质分析的方法等。
建设分子技术平台要确保操作规范、设备齐全,并定期维护和更新。
同时,还需考虑实验室环境和化学品储存安全等问题。
5.质量控制标准化:实验室自建分子诊断项目中,应建立质量控制体系,确保实验结果的准确性和可靠性。
应选择合适的质检品进行质量控制,如阳性对照样本、质控试剂等,并建立质量控制记录和追溯体系。
6.结果解读和报告标准化:实验室自建分子诊断项目的结果解读和报告应进行标准化。
结果解读需要明确的评估标准和数据分析方法,以便对结果进行可靠的解释和判断。
报告内容应包括分子诊断结果、分析方法、质量控制情况等,并制定标准的报告格式和内容。
7.伦理和法律规范:在实验室自建分子诊断项目中,需要严格遵守伦理和法律规范。
软组织和骨肿瘤分子病理学检测专家共识(2022版)
软组织和骨肿瘤分子病理学检测专家共识(2022版)摘要近年来,软组织和骨肿瘤分子病理学发展十分迅速,为更好指导和规范分子病理学检测在软组织与骨肿瘤中的应用,编写专家委员会于2019年在《中华病理学杂志》发表了《软组织和骨肿瘤分子病理学检测专家共识(2019年版)》,共识对软组织和骨肿瘤的临床诊治起到了重要的指导作用。
为与时俱进,《软组织和骨肿瘤分子病理学检测专家共识(2022版)》结合软组织和骨肿瘤分子病理学领域新进展,对2019年版共识进行了较大的更新和修订,涉及实验室规范、分子诊断和临床治疗等多方面内容,以期能更好地服务于临床诊治需要。
正文软组织和骨肿瘤分子病理学发展十分迅速,其不仅在传统的诊断和鉴别诊断中起着非常重要的作用,而且在临床治疗策略制定和肿瘤生物学行为预测等方面也具有重要的价值。
另外,分子遗传学异常的软组织和骨肿瘤新病种报道在不断涌现,软组织和骨肿瘤分类的基础正在从形态学分类转向分子分类,以期达到精准诊治。
为更好指导和规范分子病理学检测在软组织与骨肿瘤中的应用,中华医学会病理学分会骨和软组织疾病学组、中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会骨与软组织肿瘤协作组、中国抗癌协会肉瘤专业委员会病理学组和中国研究型医院学会病理学专业委员会组织专家对《软组织和骨肿瘤分子病理学检测专家共识(2019年版)》进行了修订,更新了分子病理学检测在软组织和骨肿瘤领域中的应用,供临床和病理医师在日常工作中参考。
一、软组织和骨肿瘤分子病理学检测注意事项开展分子病理学检测时应注意以下事项:(1)分子病理室的总体要求(包括质量管理体系文件、实验室的区域设置、开展的检测项目和应用的试剂、检测人员/数据分析人员/报告签署医师等人员的资质等)应参考相应的管理办法、工作导则、指南和共识;(2)从事临床基因扩增检验的分子病理实验室需通过临床基因扩增检验实验室技术审核。
从事临床基因扩增检验实验的技术人员需经过临床基因扩增检验实验技术人员上岗培训;(3)二代测序检测推荐在中国合格评定国家认可委员会(CNAS)或美国病理学家协会(CAP)/美国临床实验室改进法案修正案(CLIA)认证或认可的分子病理室进行;(4)分子病理室应具有严格的室内质控措施,定期进行室间质评,包括由国家病理质控中心和国家卫生健康委员会临床检验中心权威机构组织的基因检测能力评估,并有持续的质量保证和改进计划,以确保实验室质量管理体系符合标准;(5)当分子病理学检测结果与临床病理诊断严重不符时,尤其是检测结果与临床治疗密切相关时,需仔细分析原因,必要时进行验证或重复检测;(6)当采用不同的分子检测方法结果有差异时需考虑第3种分子检测方法进行验证。
分子病理诊断实验室建设指南
随着疾病个体化治疗得发展,分子病理诊断已越来越多地应用于临床。
分子病理诊断主要就是指基于疾病组织与细胞等标本得分子遗传学检测,用于协助病理诊断与分型、指导靶向治疗、预测治疗反应及判断预后等。
分子病理诊断实验室得规范化建设包括实验室得设置与管理、人员、项目与试剂得准入、质量保证与质量控制体系得建立等多个方面,就是准确实施分子病理诊断得关键环节,目前国内这一领域尚处于起步阶段,缺乏相应得准入要求、为保证我国临床分子病理诊断得质量,中华医学会病理学分会、中国医师协会病理科医师分会、中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会、国家卫生与计划生育委员会病理质量控制与评价中心、全国分子病理指导委员会联合制订分子病理诊断实验室建设指南、一总则1、本指南根据《医疗机构管理条例》《医疗机构临床实验室管理办法》《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》《医疗技术临床应用管理办法》与卫生部《病理科建设与管理指南(试行)》等文件制定、2、医疗机构应当统一管理分子病理检测项目,在规范得分子病理诊断实验室进行检测。
3、以科研为目得得检测项目不得向临床出具检测报告,不得向患者收取任何费用,不得作为临床诊治得依据。
ﻫ二医院准入三级甲等医院病理科应设置分子病理诊断实验室,符合条件得其她医院也可设置。
三人员准入1、分子病理诊断实验室工作人员均应经过有资质得培训机构培训合格,并取得上岗证后方可上岗、2、实验室不得使用非本单位技术人员从事相关检测工作。
3、实验室负责人应具有临床医学与病理专业背景、具有分子生物学相关工作经历、具有副主任医师以上专业技术职称、从事本专业得本单位在职医师,主要职责就是监督实验室运行、实施质量控制、开展新项目等。
4、授权签字人应就是取得临床病理学或遗传学《执业医师资格证书》、具有中级或以上专业技术职称、从事本专业得本单位在职医师或技术人员。
5、分子病理技术员应具备病理学、分子生物学得基本知识,大专以上学历,并进行过相关专业技术得技能培训或进修学习,获得相应得上岗资格证书。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
实验室自建分子诊断项目基本要求专家共识
实验室自建方法(laboratory developed tests,LDTs)是指由实验室内部研发、确认和使用、以诊断为目的的体外诊断方法。
仅限于本实验室内使用,不得在市场销售,也不得转移到其他实验室使用。
做好实验室自建分子检测项目(laboratory-developed molecular tests,LDMTs),使其既能满足临床日益增长的分子诊断需求,又符合我国行政管理规范的要求。
LDMTs的监管要求
1.实验室资质以及环境要求
(1)实验室资质:分子诊断实验室应通过卫生计生行政部门认可的临床基因扩增实验室审核验收,并在有效期内。
(2)实验室环境要求:要求达到国家相关临床基因扩增实验室要求。
2.人员要求
(1)开展LDMTs,实验室应该有相应团队(应至少包括具有检验等相关专业的博士学位并具有相关研究经验和工作基础的研究人员1名,临床相关专业中级以上医师1名,检验相关专业中级以上检验技师1名)。
(2)自建分子诊断项目负责人应至少具有副高级以上专业技术职称、博士学位、并从事分子诊断工作至少3年。
(3)分子诊断实验室操作人员应经过有资质的培训机构培训合格取得上岗证。
(4)签发分子病理报告的医师应至少具有中级病理学专业技术职务任职资格,并有从事分子病理工作的经历。
3.管理要求
(1)开展LDMTs项目之前,应有相关临床科室的申请、医务机构的审批以及医院伦理委员会的同意。
(2)应通过相关行政管理机构组织的同行专家委员会的评议,或经所在地省、自治区、直辖市人民政府相关行政部门审核同意。
(3)通过初次评议的项目在试运行一年后,宜申请相关行政管理机构组织的同行专家委员会的再评议,通过再次评议的项目,正式运行。
(4)通过再次评议的项目,宜接受每3年一次的复评审,用以监督该项目的运行情况。
(5)停用项目的标准和措施:一旦造成医疗纠纷或进入司法程序,相关单位的LDMTs项目应立即停止使用,并进入紧急审核程序,通过相关行政管理机构组织的同行专家委员会的评议后,项目方可恢复检验。
(6)实验室须建立相应的程序和管理制度。
质量控制的基本要求
(一)应不低于国家标准、行业标准、地方法规要求,如《医疗机构临床实验室管理方法》、《CNAS-CL36医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明》等。
(二)开展LDMTs项目临床应用检测之前,应进行性能确认。
(三)实验室自建分子诊断项目中,涉及的市售试剂耗材的质量保证,应不低于国家标准、行业标准和地方法规要求。
(四)定性检测项目,每次实验应设置阴性、弱阳性和/或阳性质控物。
如为基因突变、基因多态性或基因型检测,则应包括最能反映检测情况的突变或基因型样品,每批检测的质控至少应有一种基因突变或基因型,并建议在一定周期内涵盖所有的基因型。
(五)定量检测项目,每次实验应设置高值、中值和低值质控物。
(六)应参加通过认可的能力验证计划提供者提供的能力验证计划。
(七)在没有能力验证提供的情况下,通过与其他实验室(如已获认可的实验室、使用相同检测方法的实验室、使用配套系统的实验室)比对的方式确定检验结果的可接受性时,应满足如下要求:
1.规定比对实验室的选择原则。
2.样品数量:至少5份,包括正常和异常水平或不同常见基因突变或基因型;频率:至少每年2次。
3.判定标准:至少应有≥80%的结果符合要求。
4.实验室使用两套及以上检测系统检测同一项目时,应有比对数据表明其检测结果的一致性,比对频次每年至少1次,样品数量不少于20份,浓度水平应覆盖测量区间,计算回归方程,系统误差应<±7.5%。
应定期(至少每年1次,每
次至少5份临床样品)进行检验人员的结果比对、考核并记录。
使用不同生物参考区间的检测系统间不宜进行比对。
LDMTs的方法学确认的技术指标
1.准确性(accuracy):
准确性的评估可以使用参考物质进行评定,或者与另一种临床上有连续性并被普遍接受的方法(所谓"金标准")进行比对。
在缺乏金标准的情况下,可以引用参考文献作为指导。
用于确认的标本通常选用与临床检测同类的标本。
样品数
n≥20,浓度应覆盖测量区间。
定性结果一致性宜大于90%,定量结果一般可接受为不能超过对照方法平均含量的3个标准差或者15%变异度。
2.精确性(precision):
因需考虑安排不同的操作者、不同批号的试剂以及不同型号的仪器来进行多次的重复操作,一般建议确认一项分子检验方法的精密度大致需要20个工作日。
在选择待测标本用于确认实验时,一般用高和低2个不同含量标本来进行,并接近检测限。
标本类型、取样与储存条件应尽量符合待测的临床标本。
目前尚缺乏统一的国际参考标准来确定临床诊断实验室可普遍接受的精密度范围。
对于定性试验,判断结果的一致性,一般符合率应该大于90%。
对于定量试验,一般确认实验可接受的精密度为不能超过已知靶分子平均含量的3个标准差或者15%变异度。
FDA建议变异度不能超过20%。
CNAS的要求则以能力验证/室间质评评价界限(靶值±0.4对数值)作为允许总误差(TEa),重复性精密度<3/5TEa;中间精密度<4/5Tea。
3.参考范围(reference range):
对于大部分检测项目,正常参考范围与异常值范围都是在前期研究中就已经明确,目的是为了给特定患者群体确定正常数值范围。
对于定性试验,参考范围可以是阴性、正常、无克隆性增生,或者其他能够表明检测结果是否正常的用词。
需要注意的是,某些检测项目是没有参考范围的。
如对于HCV阳性样本的HCV 基因分型检测,就无法在所有HCV已知基因型中选出一个"正常"的基因型。
4.可报告范围(reportable range):
对于定性测试,应包括所有的报告结果(如野生型纯合子、突变型杂合子或纯合子)。
对于定量试验,实验室必须明确定量分析中的分析测量范围(analytic measurement range,AMR)是指待测样品在未被稀释、浓缩或其他不属于常规检查步骤部分的预处理条件下,一种方法可直接测量待测样品值的范围。
因为可以稀释样品,报告范围可能大于AMR。
5.分析灵敏度(analytic sensitivity):
定性实验中,分析灵敏性常用"最低检测限(limit of detection,LoD)"来表达。
这种检测低限指能连续在同一个标本中测到靶核酸的可能性在统计学上概率
≥95%。
定量实验中,多用"定量限(limit of quantitation,LoQ)"来表示。
与LoD不同,LoQ表示一个能够检测出的靶物质在标本中的最高和最低的量。
对于某些分子检测方法来说,LoD与LoQ相同。
但由于LoD不需要考虑是否在线性范围内,所以LoD常常比LoQ还要低。
分析灵敏度的确认方法是通过一系列稀释已知含量的靶病原体或分子来分析最低检测限。
在同一个实验条件下并用同一个批号的制剂,重复测定已稀释至最低浓度的标本,重复测定来自临床的5个标本,60个结果,CV值小于指定标准视为接受。
6.分析特异性(analytic specificity):
评价分子检测方法的交叉反应性,首先要获得尽可能多的可能与特定待测靶分子发生交叉反应的分子核酸序列并加以分析。
如果在所测的标本中存在某些结构和核酸序列相近的病原体或内源性生物分子,应对这些病原体和生物分子进行验证评价。
干扰物的作用是抑制正常PCR反应,使结果偏低,从而造成假阴性。
最常见的验证方法之一是在验证实验的过程中加入一个已知的PCR反应对照。
在测定过程中,如果PCR反应对照未发生扩增或扩增产物量低于预期值范围,即可证实有干扰抑制物在该标本中存在。
7.临床验证(clinical validity):
临床验证是确定某种分子检测技术检出核酸分子诊断疾病的能力。
临床验证的目的是评价这种新的分子检测技术是否适合于特定的临床疾病的诊断。
临床敏感性不同于分析敏感性:分析敏感性主要指参考方法检测结果为阳性的结果中,用实验方法得到阳性结果的一致性;临床敏感性主要指结果为真阳性的人群中真正罹患某种疾病或异常的比例,强调实验结果与临床诊断的一致性。
同样的,临床特异性也不同于分析特异性,分析特异性主要指参考方法检测结果为阴性的结果中,用实验方法得到阴性结果的一致性。
临床特异性主要指实验结果为真阴性的人群中真正没有罹患某种疾病或异常的比例[12]。
也强调实验结果与临床诊断的一致性。
值得注意的是在评价某些罕见的疾病,由于阳性病例的数量有限,实验室进行临床敏感性评价存有一定难度,这时可以引用文献报道的临床敏感性和特异性作为理论支撑。
正常对照容易收集,比较容易实现临床特异性的评价。
分子诊断项目分析前、中、后质量按相关要求执行,国家有相关规定的按相关规定执行。