病原微生物应急检测
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流行性病原微生物应急检测制度
一、病原微生物引起的传染病
我国传染病法规定的法定报告传染病分类:甲、乙、丙3类,从数量上共有39种,主要由病毒、细菌和寄生虫引起。
(一)甲类传染病主要鼠疫和霍乱。
(二)乙类传染病
(1)病毒引起的:传染性非典型肺炎、人感染高致病性禽流感、新型甲型H1N1流感、麻疹、病毒性肝炎、艾滋病、脊髓灰质炎、流行性出血热、狂犬病、流行性乙型脑炎。
(2)细菌引起的:伤寒和副伤寒、淋病、梅毒、百日咳、白喉、流行性脑脊髓膜炎、猩红热、钩端螺旋体病、布鲁氏菌病、炭疽、肺结核、新生儿破伤风。
(3)寄生虫和细菌:疟疾、血吸虫病、细菌性和阿米巴性痢疾。
(三)丙类传染病
(1)病毒引起的主要有:流行性感冒、流行性腮腺炎、急性出血性结膜炎、手足口病、风疹及除霍乱、痢疾、伤寒和副伤寒以外的感染性腹泻病。
(2)细菌和寄生虫引起的:麻风病、流行性和地方性斑疹伤寒、黑热病、丝虫病、包虫病。
(四)病原微生物引起的综合征
1、急性腹泻综合征
(1)细菌性腹泻:霍乱弧菌、志贺氏菌、大肠杆菌(肠毒素性和肠出血性)、沙门菌、空肠弯曲菌、小肠结肠耶尔森菌、艰难梭菌等。
(2)病毒性腹泻:轮状病毒、诺如病毒、腺病毒、埃博拉和其他出血热病毒等。
(3)寄生虫性腹泻:痢疾阿米巴、隐孢子虫、贾迪鞭毛虫等。
2、急性出血热综合征
登革热病毒、汉坦病毒、克里米亚-刚果热病毒、埃博拉病毒、拉萨热病毒、马尔堡出血热病毒、裂谷热病毒、南美沙粒病毒、蜱传播的黄病毒、黄热病病毒等。
3、急性黄疸综合征
A,B,E型肝炎病毒、钩端螺旋体、黄热病病毒等、
4、急性神经性综合征
(1)细菌性脑膜炎:脑膜炎奈瑟氏菌、钩体、肺炎链球菌、嗜血流感杆菌、大肠杆菌、李斯特菌等。
(2)病毒性脑炎:乙型脑炎病毒、脊髓灰质炎、狂犬病毒、肠道病毒、蜱传播的脑炎病毒等
(3)寄生虫性脑炎:锥形虫、疟原虫等。
5、急性呼吸综合征
(1)细菌性:炭疽杆菌、鼠疫杆菌、百日咳杆菌、白喉杆菌、A群链球菌、TB、军团菌、支原体、衣原体等。
(2)病毒性:冠状病毒、流感和禽流感病毒、肺综合征汉坦病毒和腺病毒等。
6、急性皮肤综合征
水痘病毒、麻疹病毒、风疹病毒、肠道病毒71、柯萨奇病毒A组16型、斑疹伤寒立克次氏体、炭疽杆菌、猴豆病毒、细小病毒B19、基孔肯雅热病毒等。
7、急性眼综合征
腺病毒、肠道病毒、沙眼衣原体
8、急性全身性综合征
炭疽杆菌、鼠疫杆菌、布氏菌、伤寒沙门菌、钩体、HIV、登革病毒、汉坦病毒、疟原虫莱姆病螺旋体。
二、应急检测的目的和意义
应急检测的目的和意义是
1、识别暴发、确定病因
2、确定传染来源
3、确定传播链和流行范围
4、发现新的病原微生物
5、提供仲裁依据
三、病原微生物的特点及其应急检测
病毒不是完整的生物体,结构简单,需要再电子显微镜下才能看清楚。
电镜是研究病毒和细胞相互作用的重要工具,但是在诊断实验室的使用却非常有限。要想直接用电镜观察检测病毒,样品必须含有高滴度的病毒颗粒(106到107个/ ml)但也可通过样品浓缩和使用标记抗体提高敏感性。电镜主要用于不可培养的病毒检测,特别是病毒性胃肠炎病原体检测。
细菌的诊断相对容易,培养也较方便。
(一)病原微生物及其抗原和核酸的检测方法和初步结果报告时限
1、分离培养(细菌:48~72小时,病毒14~28天)
2、免疫荧光法(4~8小时)
3、固相免疫分析胶体金法(30~60分钟)
4、酶联免疫分析(ELISA) (4~8小时)
5、核酸扩增聚合酶链式反应(PCR)(4~8小时)
6、实时荧光PCR (3~4小时)
7、核酸序列分析(16~24小时)
8、形态学诊断(24~72小时)
二)血清学抗体检测方法和初步结果报告时限
1、ELISA检测感染早期IgM抗体(4~8小时)
2、ELISA检测感染急性期和恢复期IgG抗体(4~8小时)
3、病毒抗体中和试验测定急性期和恢复期中和抗体(7天)
4、血球凝集抑制检测病毒抗体(4~8小时)
5、试管凝集试验检测细菌抗体(4~8小时)
6、间接血球凝集抑制试验检测病毒抗体(4~8小时)
7、补体结合试验(24~48小时)
(三)选择检验方法需考虑的因素
1、疑似病原微生物感染的病理学知识
2、病人感染的病程和采样时间
3、各种方法对疑似病原微生物感染的适用性
4、可用于检测标本类别
(四)实验室结果的意义和解释
1、病原微生物感染的实验室诊断需要多方面的信息,包括:对可疑病原体的致病机理的理解,对感染阶段的认识,被感染者的年龄和免疫状况等。
2、病原微生物分离培养的成功与多个因素有关,包括:选择适当的标本,仔细收集标本以最大限度收集到致病因子,标本的运输必须尽量保持病原体活性,减少污染菌的增殖等。
3、如果从疑似病人的标本中分离到目标细菌和病毒,可以确诊。
4、如果在疑似病人的标本中检测到目标细菌和病毒核酸,可以确诊。
5、如果目标病原微生物感染的中和抗体或IgG抗体或其他方法测定的抗体滴度稳定维持在高水平,或者出现阳转血清抗体滴度,或是恢复期血清的抗体滴度比急性期有4倍或4倍以上的增长,则表明病人确有感染相应病原体。
6、如病人血清或脑脊液标本中检测到目标病原微生物感染的IgM抗体阳性,表示有近期感染、
7、如果脑脊髓液标本或血清IgM抗体检测阴性,可能是因为患者体内的抗体还没达到可被检测的浓度,需结合发病和采样日期,进一步对患者的血清标本进行检测。
三、应急检测标本的采集和运输
(一)标本的选择
1、为了说明病原体与某种特殊疾病的关系,标本应尽可能取自靶器官
2、许多病原微生物感染的临床症状可以用来确定靶器官,以取得适当的标本
3、分离立克次氏体的标本种类有限,主要是血液和内脏组织
(二)采样器材
1、无菌、耐低温、密闭带螺口盖的容器。包括尿杯和一次性离心管(15~50ml),适于盛装2~4mlVTM的标本收集管,2~5ml血清收集管
2、无菌棉签和专用采样拭子
3、无菌玻珠(直径5mm)每管加3~4个玻璃珠,以便于将结合在拭子上的细胞释放出来
4、注射器配26和27号针头,用于吸取囊泡液
5、含抗凝剂的血液收集管
(三)病毒运输液(VTM)
1、运输液可以防止标本干燥,在标本收集和接种的间隔期内有助于保持病毒活性,同时延缓污染菌的增殖。
2、使用的VTM有多种配方,VTM既可在实验室自行配制,也可以购买商品化的,尽管综合性的研究不多,但使用不同的VTM对选择的病毒的回收检测结果没有显著影响。
(四)细菌运送培养基
1、维持活力,不增菌的非营养性半固体培养基
2、四种主要运送培养基:Stuarts、Cary-Blair、Amies、STGG
(五)标本收集
1、出现临床症状后尽可能早地采集标本,最好在没有进行抗病毒和抗生素治疗之前采集。
2、最易分离到病毒的时间是发病后3天内,5天以后分离到病毒的机会将大大降低。病例死亡后应尽快采集尸解标本。
3、收集立克次氏体培养标本应尽量无菌。
4、详细询问病史,包括发病日期、临床表现、近期暴露史、动物和节肢动物接触史和叮咬史、近期到流行区的旅行史和疫苗接种史。
5、用于细菌血培养的标本应尽早采集,并注意无菌操作。
(六)标本的运送、接收与保存
1、专人负责标本运输
2、新鲜的临床采集标本应在4℃条件下24小时内运送至实验室;未能24小时内送至实验室的,应置-70℃或