黄瓜抗霜霉病相关EST—SSR的信息分析

（Ｃ ８３ ） １ ０ Ｃ ４ ；东北农 大学 自然科学基 金 ， 作者简介 ：乇丽娟（９ ７ ） １ ６ 一 ，女 ，副研究 员 ， 硕士生 导师 ，研究方向为植物胚胎发育与分子生物。Ｅ ｍ ｉ ｌ ｗ ｎ ＠ ６ ．ｏ － ａ ｊ ａ ｇ １ ３ｃ ｒ ｈ＿ ｎ 通讯作者：秦智伟 ，教授 ， 博士生导师 ， 研究方 向为蔬菜遗传育种 。 － ａ ：ｚ ３ ３ ２ ． ｏ Ｅ ｍ ｉ ｑｗ ０ ＠１６ ｃｎ ｌ
ｃ ＤＮＡ ｉｒ ｒ ｉｈ ｗｅｒ ｏｎ ｔ ｃｅｄ ｗ ｉ ｕ ｕ ｂ ｒｌａ ｅ ｎ ｃ ｄ ｂ ｅ ｄ ｐ ｒ ｎ ｓ ｏ ａ ｃ ｂ ｎ ￣．Ａ ｌ ａｙ ｗｈｃ ｂ ｅ ｃ ｓ ｒ ｔ ｔ ｃ ｃ ｍ ｅ ｅ ｖ ｓ ｉｄｕ ｅ ｙ Ｐｓ ｕ ｏ ｅ ｏ ｏ ｐ ｒ ｕ ｅ ｓ ｕ ｈ ｔｔ ｌ ｆ２ ５ ７ ｕ ｉｅ ｅ ｅ ｕ ｎ ｅ ｏ ａ ０ ｎｇ ｎ ｓ ｓ ｑ ｅ ｃ ｓｗｅｒ ｂ ａｎ ｄ ａ ｅ ｒ ｃ ｓ ｉｇ ａ ｄ ｓ ｉｉｇ Ｔｈ ｉｔｉｕｉ ｒ ｑ ｅｎ ｙ ｏ ｅ ｏ ｔ ｉｅ ｆ ｒｐ ｏ ｅ ｓｎ ｎ ｐｌ ｎ ． ｅ ｄｓｒ ｔ ｔ ｃ ｂ ｏｎｆｅ ｕ ｃ
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收 稿 日期 ：２ １一 ３ １ ０ １Ｏ — Ｏ
基金项目：国家 “６ ” ８ ３ 计划 项 目（０ ７ ２ ０ ＡＡ１Ｚ ７ ） ０ １７ ；黑 龙江 省博士后 专项科 研基 金 资助项 目（ Ｂ Ｚ ７ １ ） Ｌ Ｈ— ０ ２ ３ ；黑 龙江省 归国 留学基金
Ａｂｓ ｒ ｃ ： ｏａ ３０ １ｅ ｐｅ ｓ ｄ ｓ ｑ ｅ ｃ ａ ｓｗｅｅ ｉｖ ｓｉａｅ ｈ ｎ ｅ ｅ ｓ ｑ ｅ ｃ ｓｆ ｍ ｔａ ｔ Ｔ ｔｌ ９ ｘ ｒｓ ｅ ｅ ｕ ｎ ｅｔｇ ｒ ｅ ｔ ｔｄ ｉ ｔｅ ｕ ｉ ｎ ｅ ｕ ｎ ｅ ｒ ｎ ｇ ｎ ｇ ｏ
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２５ ７ Ｕ ｉｅｅ。应用生物信 息学方法 ，对黄瓜 抗霜霉病相关 Ｅ Ｔ Ｓ Ｒ 的分布频率和碱基重复特点进行 了归纳 ０ 条 ｎ ｎ ｓ ｇ Ｓ —Ｓ ｓ 及 分析 ．结果表 明，２５ ７ Ｕ ｉ ｎｓ ． ０ 条 ｎｇ ｅ 中共检 索到 ２ １ Ｅ Ｔ Ｓ Ｒ， 出现 频率为 ７ ７ ｅ ３ 个 Ｓ —Ｓ ． ％，平均 分布距 离为４５ ｈ ４ ．８ｋ 。 Ｅ Ｔ Ｓ Ｒ 包括 ５ 种 重复单元 ，以二核 苷酸和三核 苷酸重 复基 元为主 ，二者分别 占总Ｓ Ｒ 的５ ． ％和 ３ ． ％， Ｓ —Ｓ ｓ １ Ｓ ｓ ９７ ４ ４３ ６
Ｓ ｉｎ ｅ ，Ｎｏ ｔ ｅ ｓ ｇ ｉ ｕｔ ｒ ｌＵｎｖ ｒ ｉ ，Ｈ ｒ ｉ ０ ３ ，Ｃｈ ｎ ；２ ｃｅ ｃ ｓ ｒ ａ ｔＡ ｒ ｌ ａ ｈ ｃ ｕ ｉｅ ｓｔ ｙ ａ ｂｎ １ ０ ０ ５ ｉ ａ ．Ｈ ｒ ｉ ｉｅ ｓｔ ，Ｈａ ｂ ｎ ａ ｂｎ Ｕｎｖ ｒ ｉ ｙ ｒ ｉ
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第 ｌ 期 ０
王丽娟等 ：黄瓜抗霜霉病相关 Ｅ Ｔ Ｓ Ｒ的信息分析 Ｓ—Ｓ
黄 瓜 （ ｕｕ ｓ ａｉ ｓ ．霜霉 病 是 一 种 流 行 性 Ｃ ｃｍｉｓｔｕ ） ｖ Ｌ
库 ，共 有 ３ ９ 条 Ｅ Ｔ 序 列 。 １ Ｓｓ ０ １ 黄 瓜霜 霉病 相关 Ｅ Ｔ的前 期 处理 ． ２ Ｓ
很强 的黄瓜 叶部病 害 ，也是保护地栽培黄瓜 的主
要病害” ，给 黄 瓜 生 产 带 来 很 大 威 胁 口 黄 瓜 霜 霉 。 病 是 由古 巴假 霜霉 菌 （ ｓｕｏｅｏｏ ｏａｃｂｎｉ） Ｐｅｄｐｒｎｓ ｒ ｅｓ 引 ｐ ｕ ｓ 起 的 ，是 全 球 范 围 内 黄 瓜 产 区 主 要 叶 部 病 害 之
ｅ ｇ Ｎ Ｈ．Ａｔ ＧＲＸ４ ａ ａ ｉｏ ｓ ｃ ｌｒｐａ ｔ ｎ ｔｉｌｇｕ－ ， ｎＡｒｂｄ ｐ ￣ ｈｏｏ ｌｓｉ ｍｏ ｏｈｏ ｌｔ ｃ 【８ Ｃｈ ｎ １ Ｊ
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第 ４ 卷 第 １ 期 ２ ０
２ １ 年 ｌ 月 ０１ ０东 Nhomakorabea北
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４ （０： ２ ５ ２１ １５ － ６
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黄瓜抗霜霉病相关 Ｅ Ｔ Ｓ Ｒ的信 息分析 Ｓ —Ｓ
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王 丽娟 ，孙 彩玉 ，毕永贤 ，秦智伟 。
（． １ 东北农业大学生命科 学学院 ，哈尔滨 １０ ３ ；２ 哈尔滨学院 ，哈尔滨 ５０ ０ ． １０ ８ ；３ 东北农业大学园艺学院 ，哈尔滨 ５０６ ． １０ ３ ５ ０ ０）
摘
要 ： ，经过 除前 处理和拼接后得到 ９ 条 Ｓ ｓ
ａｅ ｏｉ，ｉ ａｌ ｏｓｐ ｒｓ ｅｓ ｇｘ ｕａ ｔｐ ｅｏｙｅ ｎ ｒｄｘｎ ｓ ｂｅｔ ｕ ｐｅｓｙａｔ ｒ５ ｍ ｔｎ ｈ ｎ ｔ ｓａ ｄ ｐ ｒｓｏｄｔ ｏｉａｉｅ ｔ ｓ［． Ｅ ＳＬ ｔ ２ ０ ， ８ ： ４ —８４ ｅｐｎ ｘｄ ｔ ｒ ｓ ］Ｆ Ｂ ｅ， ０ ８５ ２ ８ ８ ５ ． ｏ ｖ ｓｅ Ｊ ｔ
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在 Ｅ Ｔ中的 总 出现 频 率 分 别 为 ４４ ％和 ２５ ％，二 核 苷 酸 的 重 复 基 元 以 Ｔ ／ Ｇ为 主 ，三 核 苷 酸 重 复 基 元 以 Ｔ Ｔ所 Ｓ ．６ ． ９ ＣＡ Ｃ
占比例 最高。研究结果为黄瓜 Ｅ Ｔ 源开发和黄瓜抗 霜霉病基 因遗传标记奠定 了基础。 Ｓ资 关键词 ：黄瓜 ；霜霉病 ；Ｅ Ｔ Ｓ Ｒ；重复基元 Ｓ —Ｓ 中图分类号 ：￥４ ． ６２ ２ 文献标 志码 ：Ａ 文章编号 ：１０ — ３ ９ ２ １ ）０ ０ ５ — ５ ０ ５ ９ ６ （０ １ — ０ ２ ０ １
Ａｎ ｌｓｓ ｏ ａｙ ｉ ｆＥＳＴ－ ｎｏ ｍａ ｉｎ ｒ ｌｔ ｄ ｔ ｏ ｙ ｍ ｉ ｅ ｒｓｓａ ｃ ＳＳＲ ｉｆ ｒ ｔ ｅａｅ ｏ ｄ ｗｎ ｌ ｗ ｅ ｉｔ ｎ ｅ ｏ ｄ ｉ Ｃ ｃ ｍ ｂ ｒ Ｎ ｉａ ’ Ｕ ａ ｕ ＩＹ ｎ ｘ ｎ，ＱＮ Ｚ ｉｅ（． ｏｅ ｅ ｏ ｉ ｎ ｕｕ ｅ／ ＷＡ Ｇ Ｌｕ ｎ ｊ ，Ｓ Ｎ Ｃ ｉ ’ ｏ ｇｉ Ｉ ｈ ｉ１ Ｃ ｌｇ ｆＬｅ ｙ ，Ｂ ａ ｗ 。 ｌ ｆ
一
使用 Ｓｑ ｌ ｎ ｅＣｅ 软件 对获得 的 Ｅ Ｔ ａ Ｓ 进行前 期处
理 ，包 括 去 载体 序 列 、重 复序 列 和排 除长 度 小 于 １０ｂ ０ ｐ的序列 等 后 ，得 到 高 质量 的 Ｅ Ｔ 序 列 ２９３ Ｓｓ ０
１
，
世界范围内大约有 ７ 多个国家受其危害 ，严 ０
ａ ｄ ２．９ ｉ Ｊｔ ｅ ＥＳＴｓ ｒ ｓ ｅ ｔ ｅｙ 丁Ｃ／ ｎ ５ ％ ｎ ａＪｈ ， ｅ ｐ ｃｉ ｌ． ｖ ＡＧ ｒ ｈ ｓ ｏ ｗｅ ｅ ｔｅ ｍｏ ｔ ｍｍｏ ｔ ｉｕ ｌｏｔ ｅ． ｎ ｃ ｎ ｍｏ ｉｉ ｄｎ ｃｅ ｉ ａ ｄ ＴＣＴ ｓ ｆｆ ｌ ｄ ｗａ ｔ ｅ ｍｏ ｔｃ ｈ ｓ ｏｍｍｏ ｔ ｒ ｕ ｌｏ ｉｅ． ｌｈｅ ｅ ｅ ｔ ｂｉｈ ｄ ｔ ｅ ｔ ｅ ｒ ｔ ｎ ａｉｎ ｆ ｒｄ ｖ ｌｐ ｎ ｍｏ ｉ ｉ ｔｉ ｃｅ ｔ ｆｎ ｎ ｄ Ａｌｔ ｓ ｓ ａ ｌ ｅ ｈ ｈ ｏ ｅｉ ｆ ｄ ｔ ｅ ｅｏ ｍｅｎ ｓ ｃ ｏｕ ｏ ｏ ｔＥＳＴ ｒ ｓ ｕ ｃ ｆ ｕ ｕ ｅ ｄ ｒ ｓｓａｎ ｅ ｇ ｎ ｓｇ ｎ ｔ ｌｃ ｌｒ ｒｅｒ ． ｅ ｏ ｒｅ ｏ ｃ ｍｂ ｒ ｃ ａｎ ｅ ｉｔ ｃ ｅ ｅ ｅ ｅ ｉ ｍｏｅ ｕａ ｋ ｓ ｃ ｍａ