人源葡萄糖转运蛋白GLUT1的晶体结构(中文翻译)

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人源葡萄糖转运蛋白GLUT1的晶体结构

摘要:

葡萄糖转运蛋白GLUT1主要促进葡萄糖扩散进入红细胞,并负责葡萄糖供应到大脑和其他器官。不正常的基因突变可能导致GLUT1缺陷综合症,其中GLUT1的过度表达是癌症的预示指标。尽管经过几十年的调查, GLUT1的结构尚不清楚。在这里,我们报告的人GLUT1的晶体结构在3.2 ˚分辨率的状态。一种被捕获的具有典型的向内折叠构象的全长蛋白。这种结构可以实现对精确映射和疾病相关的基因突变中GLUT1的潜在机理的解释。这些突变基因结构提供了一个洞察GLUT1和糖搬运工亚家族的其他成员的交流访问机制的途径。在单向转运GLUT1与质子耦合木糖转运体XylE的结构比较中,可以检验被动推动者和积极转运的转运机制。

GLUT1 由SLC2A1编码,介导的细胞将基底水平葡萄糖的摄取到许多组织中。特别是,它负责通过促进葡萄糖的扩散,使成红细胞常数摄取保持在约5毫米的血液浓度。GLUT1在血液组织屏障的内皮细胞内具有使葡萄糖供应到大脑和其他器官中的核心作用。

GLUT1的失活突变,将导致血糖运输活动受损,而这是与疾病相关联的缺乏能源供应到大脑不足相关联的。 GLUT1缺陷综合征(又称德活体综合征)的特点是症状包括早发性癫痫,小头畸形和发育迟缓的频谱。癌细胞需要增强葡萄糖的供应,部分是通过无氧糖酵解( Warburg效应)的效率较低的能源产生。确定GLUT1的水平将作为肿瘤预后的重要指标。因为它的基本生理和病理意义,GLUT1一直是功能研究及结构测定的重点。

GLUT1属于MFS ,其中规模最大最普遍存在的二次转运蛋白超家族之一的糖搬运工亚科。 MFS转运共享一个保守的核心,其包括由两个离散地折叠的结构,即在氨基和羧基末端结构域12个跨膜片段。在每个领域,连续六次跨膜段折叠成一对“3+3 ”反向重复的片段。已知的的实验证据表明,三螺旋束可以表示其基本结构和功能单位。所有MFS转运蛋白被认为是利用交流访问机制,其中由底物结合位点是从两侧通过转运蛋白的构象变化交替访问OFTHE膜运输衬底。

细菌GLUT1同系物,在D -木糖的结构:从大肠杆菌和葡萄糖H+转运体XylE (参28 ,29 )或从表皮葡萄球菌获得的H+转运体GLCP(参见30 )已有报道。值得注意的是, XylE的结构约束着GLUT1 (参见28 )以托德 - 木糖ORD -葡萄糖启用同源性为基础的建模。然而,无论XylE和GLCP都是作为GLUT1一个催化葡萄糖向下穿过膜的浓度梯度单向转运质子驱动转运体。人类GLUT1的原子结构对理解它的运输和疾病机制至关重要。

GLUT1的结构测定

表达GLUT1和纯化的细节可以在方法上找到。把全长的人GLUT1 (残基

1-492 )与C-末端10 ×组氨酸标记过表达在感染了杆状病毒击掌昆虫细胞上。为了消除由于糖基化的异质性,他们引入了一个单点突变( N45T)。他们尝试,但无法结晶到GLUT1( N45T)。他们的理由是GLUT1,具有高活性的转运,可能会出现多个可互换的构象,阻碍结晶。为了解决这个潜在的问题,我们进行文献检索的GLUT1的变种,可以锁定单向转运体在特定的构象。一个单一的错义突变--E329Q ,曾表明逮捕到GLUT1向内的构象。他们最终成功地遏制了突变N45T 和E329Q并使全长GLUT1的结晶。该晶体出现了C2空间群并且他们在同步辐射光源得几个X射线衍射均超越3.2˚。使用带有XylE的N和C结构域的坐标作为单独的搜索模型分子置换测定GLUT1的结构。最后的原子模型被提炼到3.2˚分辨率。

在GLUT1的结构中,残基9–455构成典型的MFS折叠,在C-末端部分是看不见可能是由于其固有的构象的灵活性。N和C结构域围成一个腔,打开细胞内侧的结构,从而代表一个向内的开放构象,与预测状态GLUT1一致(e329q)。值得注意的是,N和C结构域是由一个细胞内螺旋束连接(ICH)包括四个不足的螺旋结构。有趣的是,在ICH领域中也观察到糖搬运工成员XylE和GLCP的结构,而不是在其他MFS转运中,这提示脑出血可能是糖搬运工亚科中的一员造成的。

对配体结合的影响

在对原子模型细化期间,具有不连续尾巴的盘形电子出现在向内打开的腔中(扩展数据图 2a)。因为GLUT1在0.4%(重量/体积)的正壬基-β-D-吡喃葡糖苷(β- NG)中纯化和结晶,所以观测到的电子密度可能来自一个绑定β- NG 分子的糖部分,其中发生成为GLUT1的底物。的确,一个β-NG分子完美配合到电子密度,用D -吡喃葡糖苷结合到GLUT1的C结构大致中央处的膜中,其中的

脂肪族尾部指向沿着所述腔(扩展数据图胞内侧面2b所示, C)。

GLUT1及XylE的C结构域可以与1.244 A˚超过138对准Ca原子的根均方偏差相互叠加。在域上叠加的时候,D -吡喃葡糖苷结合的β- NG与D-葡萄糖(扩展数据图2d )重叠。让人想起由XylE 协调的(参见28)的D-葡萄糖,对D-吡喃葡糖苷β- NG是连接周围的极性残基C结构的氢键。(扩展数据图2e )。类似的,协调对D-吡喃葡糖苷β- NG的向内开的GLUT1及D-葡萄糖通过朝外XylE的支持单糖结合位点可以被交替地从膜的任一侧上存取。在朝外遮挡的部分XylE,D-葡萄糖是由主要是从C结构域的残基进行协调。在向内开的GLUT1 ,来自N结构域的残基不参与配体结合。这些观察结果表明, C结构域可以提供一级基体结合位点并导致N域交替运动。

疾病相关基因突变的映射

GLUT1的详细结构信息提供了疾病衍生的机理且解释了分子激活突变的基础(扩展数据表2)。这些突变患者如早发性失神性癫痫,发作性运动诱发性运动障碍,以及特发性家族性全身性癫痫被鉴定为GLUT1缺陷综合。大多数突变具有极性的或带电荷的氨基酸可能是有用的。这是些突变可能破坏GLUT1的结构完整性,导致机体功能完全丧失因而致死。

本病衍生的突变很大程度上映射到三个GLUT1集群中(图2)。第一组残基负责底物结合(图2和扩展数据图);第二组位于所述跨膜结构域和ICH的域之间的界面(图2和图3);第三组包括残基的传送路径,它们大多致力于对细胞外侧的N和C结构域之间的相互作用(图2和图4和扩展的数据图3a )。底物结合残基的突变可导致识别D-葡萄糖受损并显著地降低其运输活动。下面,我们专注于集群II和III的分析可能有助于GLUT1的传输机制和其他糖搬运工成员的理解。

在ICH领域的关键作用

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