分子实验室、细胞实验室常用配方
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(一)WB相关试剂及常用缓冲液
●
●10%过硫酸铵溶液AP(分装保存于-20度)
AP粉末 1g
ddH20 10ml
●10%SDS(十二烷基硫酸钠):
SDS粉末 10g
ddH20定容到 100ml
注意:用磁力搅拌器搅拌不会容易起泡泡
●6X蛋白质sample buffer
Tris-HCl(1M,pH6.8) 30mL
SDS 10g
甘油 30mL
DTT(154.25) 9.3g
溴酚蓝 0.06g
dd H20 定容至100mL
●10XPBS缓冲液的配制:
NaCl 80g
KCl 2g
Na2HPO4 14.4g(十二水合36g)
KH2PO40 2.4g
加800 mLddH2O,根据开始的pH用NaOH或HCL调pH到7.4,调好pH再定容到1升。
配好后用高压蒸气灭菌后常温保存最好是在4度
●PBST(1X)
PBS(1X) 500ml
Tween 20 500μl
●50×Tris-乙酸(TAE)缓冲液配制1L溶液各成分的用量
Tris粉末 242g
冰醋酸 57.1ml
Na2EDTA·2H2O 37.2g
ddH20定容到 1L
●封闭液
脱脂奶粉 5g
叠氮钠 0.02g(现配现用时可不加)
PBS 定容到100mL
●脱色液:(室温)
甲醇 165mL
乙酸 50 mL
H20 785 mL
ddH20 定容至1L
●TBST(1X)
TBS(1X) 500ml
Tween 20 500μl
●Stripping buffer(可反复利用)温老师组配方
10%SDS 10ml
Β-巯基乙醇 350 l
Tris-HCI(pH6.8) 6.25ml(6.06加到50mL水)
加入ddH2O 至50mL
●Stripping buffer(可反复利用)郭老师给配方
甘氨酸 15g
SDS 1g
Tween20 1ml
dd ddH2O 1L
作这个buffer洗20min,然后用PBST洗3次,再重新封闭孵抗体。
(二)细胞和细菌培养基、抗生素
●SOB培养基
将下列组分溶解在0.9L水中:
蛋白胨 20g
酵母提取物 5g
氯化钠 0.5g
1mol/L氯化钾 2.5ml
用水补足体积到1L。
分成100ml的小份,高压灭菌。
培养基冷却到室温后,再在每100ml 的小份中加1ml灭过菌的1mol/L氯化镁
●1M IPTG(异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(分子量为238.3))溶液
IPTG粉末 2.383g
ddH20 定容到10ml
用0.22μm滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。
●Amp+(50mg/ml)
Amp+粉末 50mg
ddH20 1ml
注意:分装保存于-20度,使用时按1000:1的比例用
●Kana+(50mg/ml)
Kana +粉末 50mg
ddH20 1ml
注意:分装保存于-20度,使用时按1000:1的比例用
●胰酶:抽滤,长期保存可放负20度
粉末 0.25g
EDTA 0.02-0.03g
1XPBS 100ml
●高糖DMEM培养基:抽滤保存在4度
粉末全部
碳酸氢钠 3.7g
ddH20 定容到1L(用盐酸调pH值到:7.2-7.4)
●G418母液(100mg/ml)用0.22μM滤菌,分装存于-20度
粉末 1g
PBS 10ml
●zeocin母液(100mg/ml)用0.22μM滤菌,分装存于-20度
粉末 1g
ddH2O 10ml
●Blasticidin(100mg/ml)用0.22μM滤菌,分装存于-20度
粉末 0.3g
PBS 10ml
●
Na3PO4(164) 8.2g(50mM)
NaCl (58.5) 17.55g(300mM)
加800 mL ddH2O溶解,用2M NaOH或者2M HCL 调pH到8.0,再定容到1升。
配好后用高压蒸气灭菌后常温保存。
●洗涤液(wash buffer):2011年做蛋白纯化时用
Na3PO4 8.2g(50mM)
NaCl 17.55g(300mM)
咪唑 0.681g(10mM)
加800 mLddH2O溶解,根据开始的pH用2M NaOH或者2M HCL调pH到8.0,调好pH再定容到1升
●洗脱液(elution buffer):2011年做蛋白纯化时用
Na3PO4 8.2g(50mM)
NaCl 17.55g(300mM)
咪唑 17.025g(250mM)
加800 mLddH2O溶解,根据开始的pH用2MNaOH或者2M HCL调pH到8.0,调好pH 再定容到1升)
PrepEase®Histidine-Tagged Protein Purification Kits - High Specificity
●8X LEW Buffer (Lysis-Equilibrium-Wash Buffer):(室温保存)pH:8.0
NaH2PO4.2H2O 6.2404g(400mM)
NaCl 14.0256g(2.4M)
dH20 定容到100 mL (调节pH:8.0)
●4X Elution Buffer:(室温保存)pH:8.0
NaH2PO4.2H2O 3.1202 g(200mM)
NaC l7.0128g(1.2M)
咪唑 6.81 g(1M)
dH20 定容到100 mL(调节pH:8.0)
●EDTA:(100mM)
EDTA 2.923 g
dH20 定容到100 mL
●NiSO4:
NiSO4 .6H2O 2.6285g(100mM) dH20 定容到100 mL
●溶菌酶:(使用时1ml溶液加入20ul)
粉末 50mg
ddH20 1mL
(四)利用His-tag从细胞中富集蛋白配方
●磷酸钠缓冲液
按图示比例混合0.2 M Na2HPO4溶液和0.2 MNaH2PO4溶液,得到两种缓冲液,pH分别调节成为8.0和6.3.
(注意二价阳离子螯合剂,还原剂,会导致镍从树脂上的洗脱)
本实验的所有试剂中EDTA浓度不得超过1 mM,DTT浓度不超过5 mM,巯基乙醇浓度不超过20 mM。
注意使用pH为6.3的磷酸缓冲液,而且pH不得低于6,pH要精确配制,非常重要!Histidine 的质子化,会导致镍树脂上的解离,所以要精确测定pH,并且以pH试纸校对,而不是仅仅依靠pH仪器。
洗脱溶液
200mMImidazole咪唑,
5% (wt/vol)SDS,
150mM Tris-HCl(pH 6.7)
30% (vol/vol)丙三醇
720mM巯基乙醇
0.0025%(wt/vol)溴酚蓝
注意wt/vol是质量/体积之比例,而vol/vol是体积:体积的比例。
(五)双向电泳溶液配制
●水化上样缓冲液(I):
尿素(8M) 4.805g
CHAPS(4%) 0.4g
DTT(65mM) 0.098g(现加)
Bio-Lyte0.2%(w/v)50μI(40%现加)
溴酚蓝0.001% 10μI(1%溴酚蓝)
MilliQ水定容到10mI,分装成10小管,-20度冰箱保存●上样缓冲液(II):
尿素(7M) 4.2g
硫脲(2M) 1.52g
CHAPS(4%) 0.4g
DTT(65mM) 0.098g(现加)
Bio-Lyte0.2%(w/v)50μI(40%现加)
溴酚蓝0.001% 10μI(1%溴酚蓝)
MilliQ水定容到10mI,分装成10小管,-20度冰箱保存
●上样缓冲液(III)
尿素(5M) 3g
硫脲(2M) 1.52g
CHAPS(2%) 0.2g
SB 3-10(2%) 0.2g
DTT(65mM) 0.098g(现加)
Bio-Lyte0.2%(w/v)50μI(40%现加)
溴酚蓝0.001% 10μI(1%溴酚蓝)
MilliQ水定容到10mI,分装成10小管,-20度冰箱保存
●平衡缓冲液母液
尿素(6M) 36g
SDS(2%) 2g
Tris-HCI(pH8.8)0.375M 25mI(1.5M)
甘油(20%) 20mI
MilliQ水定容到100mI,分装10管,-20度保存
●胶条平衡缓冲液I(充分混匀,用时现配)
胶条平衡缓冲液母液10mI
DTT 0.2g
●胶条平衡缓冲液II(充分混匀,用时现配)
胶条平衡缓冲母液10mI
碘乙酰胺0.25g
●低熔点琼脂糖封闭液
低熔点琼脂糖0.5% 0.5g
Tris(25mM)0.303g
甘氨酸(192mM) 1.44g
SDS(0.1%)1mI(10%SDS)
溴酚蓝(0.001%)100μI(1%溴酚蓝)
MilliQ水定容到100mI,加热溶解至澄清,室温保存
(六)同位素实验相关试剂
●
●
● 2 X Annealing buffer
Tris-HCI(pH7.5-8.0) 20mM
NaCI 100mM
EDTA 2mM
●
●
Tris 0.89M 26.945g
硼酸(pH8.3) 0.89M 13.757g
Na2EDTA 20mM 1.86115g
●15% Denatured DNA PAGE gel(100ml)
10 X TBE 15ml
40%,19:1 gel stock 37.5ml
ddH2O 16ml
Urea 48g
存放在4度,使用前加200μl 10%AP和20μl TEMED
●20% Denatured DNA PAGE gel
10 X TBE 15ml
40%,19:1 gel stock 50ml
ddH2O 3.5ml
Urea(尿素) 48g
存放于4度,使用前取35ml混合液加140μl 10%AP和140μl TEMED ●硼氢化钠(1M) 37.83
粉末 0.7566g
ddH2O 10ml
● 2 X dRP buffer(分装保存于负20度)
DNA binding buffer
(七)酶切打质谱相关配方
NH4HCO3(79.06) 100mM
粉末 0.7906g
ddH2O定容到100ml,pH7.8-8.0
DTT(154.25g) 100mM
粉末 0.01542g
ddH2O 1ml
IAA(碘乙酰胺,184.96) 200mM
粉末 0.036992g
ddH2O 1ml
(八)其他配方
●2XHEPES-缓冲液(潘老师给的配方做细胞转染,需要调pH为7.05,用0.22μM滤菌,
分装存于-20度)。
●CaCI2·2H2O(2M) 147.02 潘老师给的配方做细胞转染
粉末 5.88g
ddH2O 20ml
0.22μm滤菌,分装存于-20度
●5XTBS(1L体系)(在利用flag tag带磁珠的抗体富集蛋白时用)
Tris-HCI(250mM) 30.275g
NaCI(750mM) 43.875g
dd H20 定容至1L(调节pH为7.4)
●MMS甲磺酸甲酯(Sigma 密度为1.3g/mI,M=110.13)
1M 体系:液体85μI ddH2O 915μI
●Hochest
母液:1mg/ml,避光存于-20度
工作液:母液按1:1000稀释
●TritonX-100(0.2%)
TritonX-100 2 l
ddH2O 1ml
● 2 X HDM buffe(II)曾用于LSD1去甲基化
100mmol/L PMSF(苯甲基磺酰氟):分成贮存于-20℃。
PMSF粉末 1.742g
异丙醇/甲醇定容到10ml
【注意】PMSF严重损害呼吸道粘膜、眼睛及皮肤,吸入、吞进或通过皮肤吸收后有致命危险。
一旦眼睛或皮肤接触了PMSF,应立即用大量水冲洗之。
凡被PMSF污染的衣物应予丢弃。
●5mol/L氯化钠(NaCl):
氯化钠 29.2g
ddH20 定容到100ml
● 2.5% X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-半乳糖苷):
X-gal 25mg
二甲基甲酰胺(DMF) 1ml
注意:用铝箔包裹装液管,贮存-20℃。
●DEPC(焦碳酸二乙酯)处理水
加100ul DEPC 于 100ml 水中,使DEPC的体积分数为0.1%。
在37℃温浴至少12h,然后在15 psi 条件下高压灭菌20min,以使残余的DEPC失活。
DEPC会与胺起反应,不可用DEPC 处理Tris缓冲液。
●1mol/L CaCl2溶液
在200ml蒸馏水中溶解54g CaCl2•6H2O,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成10ml小份贮存于-20℃
● 2.5mol/L CaCl2溶液
在20ml蒸馏水中溶解13.5g CaCl2•6H2O,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。
●pH校准液
通常称为标液,现在你买仪器一般厂家都会标配三小瓶粉末:邻苯二甲酸氢钾(pH=4.003),混合磷酸盐(pH=6.864),硼砂(pH=9.182)这需要你把它稀释,一瓶只能兑250毫升(250C)的纯净水,兑好后摇一摇直到充分溶解(三瓶要分三个瓶子装哦)
NaOH(2M) 8g NaOH粉末定容到100mL
HCL(2M) 10mL 11M HCL溶液定容到110 mL
(一)WB相关试剂及常用缓冲液(1-3页)
(二)细胞和细菌培养基、抗生素(4-5页)
(三)利用His-tag从细菌中纯化蛋白配方(6-7页)
(四)利用His-tag从细胞中富集蛋白配方(8-9页)
(五)双向电泳溶液配制(10页)
(六)同位素实验相关试剂(11-13页)
(七)酶切打质谱相关配方(14页)
(八)其他配方(14-16页)。