核酸提取常见试剂地作用原理
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理大家好,今天我们来聊聊DNA提取过程中的各种试剂,它们到底是怎么发挥作用的呢?别着急,我会用最简单易懂的语言,让大家轻松掌握这些知识。
我们要了解DNA是什么。
DNA,就是脱氧核糖核酸,是生物体内遗传信息的载体。
那么,DNA提取又是什么呢?简单来说,就是从生物体中提取出DNA分子的过程。
这个过程包括了很多步骤,而试剂则是其中的关键环节。
接下来,我们就来看看这些试剂都是怎么发挥作用的吧!1. 细胞破碎剂在DNA提取过程中,首先要将生物体破碎成碎片,这样才能方便后续的提取操作。
而细胞破碎剂就是用来实现这个目的的。
它们的作用就是破坏细胞膜和细胞壁,让细胞内的DNA分子释放出来。
常用的细胞破碎剂有胰蛋白酶、胶原蛋白酶等。
大家可能会问,这些酶是怎么把细胞破碎的呢?其实,这些酶能够识别并分解细胞内的特定蛋白质,从而达到破坏细胞的目的。
不同的酶对不同类型的细胞也有不同的作用效果,所以在实验中需要根据实际情况选择合适的酶种。
2. 洗涤剂在细胞破碎后,我们还需要将释放出来的DNA分子进行纯化。
这时候,洗涤剂就派上用场了。
洗涤剂的作用就是去除细胞碎片、蛋白质等杂质,使得DNA分子更加纯净。
常用的洗涤剂有TE缓冲液、PBS等。
这些洗涤剂都有一个共同的特点,那就是能够溶解很多物质,包括DNA分子在内。
因此,通过多次洗涤,我们就可以有效地去除杂质,提高DNA的纯度。
3. 聚乙二醇(PEG)在纯化DNA的过程中,还有一个关键的试剂就是聚乙二醇(PEG)。
PEG是一种非常特殊的溶剂,它可以与水形成氢键,使得DNA分子在水中保持悬浮状态。
这样一来,我们就可以通过离心等方法将不同纯度的DNA分离开来。
而且,PEG还可以调节DNA 的亲和力,使得某些特定的DNA结合得更加紧密。
这对于后续的PCR扩增等实验非常重要。
4. DNA连接酶在纯化出目标DNA后,我们还需要将其与其他DNA片段进行连接。
这时,DNA 连接酶就派上用场了。
核酸检测试剂盒原理
核酸检测试剂盒原理首先是核酸提取试剂。
核酸通常嵌入在细胞或病毒颗粒中,因此需要使用核酸提取试剂将核酸从样本中提取出来。
核酸提取试剂通常包含一个蛋白酶,它能够分解蛋白质,使得核酸从蛋白质的包裹中释放出来。
此外,核酸提取试剂还包含一些溶剂,如盐和酒精,用于使细胞或病毒颗粒破裂和沉淀,从而获得含有核酸的上清液。
接下来是核酸扩增试剂。
核酸检测通常需要扩增核酸的数量,以达到检测的灵敏度。
核酸扩增试剂通常包含一个DNA聚合酶,它能够在一定的温度下,将核酸模板作为引物,合成新的DNA链。
核酸扩增试剂还包含了核酸模板的引物和适当的缓冲液,以调节反应的条件。
在核酸扩增的过程中,还需要考虑PCR(聚合酶链式反应)或RT-PCR (逆转录聚合酶链式反应)的选择。
PCR是一种将DNA扩增到指数级别的技术,它利用DNA聚合酶在高温下对DNA模板进行连续扩增。
而RT-PCR则是先将RNA逆转录成DNA,再进行扩增。
RT-PCR广泛应用于病毒检测和基因表达分析等领域。
最后是核酸标记试剂。
核酸检测通常需要通过标记物来检测核酸的存在和数量。
核酸标记试剂通常包含了一种标记物,如荧光染料或放射性同位素。
对于荧光染料标记,核酸标记试剂中通常含有可与核酸结合的一对引物,其中一对引物上带有荧光染料,另一对引物标记有Quencher。
引物与核酸结合后,荧光染料和Quencher之间的距离很近,因此无荧光信号。
在核酸扩增的过程中,当核酸扩增到引物位点时,荧光染料和Quencher被分离,发出荧光信号。
对于放射性同位素标记,核酸标记试剂中通常含有一种放射性同位素,如32P或35S,它能够与核酸结合。
标记的核酸通过放射性示踪仪来检测。
最后,核酸检测的结果可以通过聚合酶链式反应仪(PCR仪)或放射性示踪仪来记录和测量。
PCR仪可以记录PCR反应的温度变化和荧光信号,从而得到核酸的扩增曲线和定量结果。
放射性示踪仪可以测量核酸标记物的辐射量,从而得到核酸的数量。
核酸提取常见试剂的作用原理
同硫氰酸胍之阳早格格创做强用力的蛋黑量变性剂,能赶快溶解蛋黑量,引导细胞结构破碎,核蛋黑由于其二级结构的益害消得而赶快与核酸分散.胍盐是益害蛋黑量三维结构的离液剂,正在常常使用的蛋黑量变性剂中效用最强的是同硫氰酸胍,它们不妨使普遍蛋黑量变换成一随机的卷直状态.含有强力的阳离子战阳离子基团,它们不妨产死较强的氢键.正在还本剂存留的情况下,同硫氰酸胍不妨断裂氢键,而去垢剂,如SDS存留的情况下,不妨益害疏火效用.盐酸胍、尿素盐酸胍是一个核酸酶的强压制剂,它本去不是一种脚够强的变性剂,不妨允许完备的RNA从富含RNase的构制中提与出去.4-8M可断裂氢键,有二种大概体制:1变性蛋黑战盐酸胍、尿素劣先分散,产死变性蛋黑-变性剂复合物,当复合物被与消,从而引起N-D反应仄稳背左移动,随着变性剂浓度减少,天然状态的蛋黑不竭转化成复合物,最后引导蛋黑量真足变性;2盐酸胍、尿素对付氨基酸的删溶效用,能产死氢键,当浓度下时,能益害火的氢键结构,截止盐酸胍、尿素便称为非极性残基的较好溶剂,使蛋黑量里里的疏火残基伸展战溶解性加强,盐酸胍、尿素引起的变性往往是不可顺的.下浓度尿素使蛋黑量变性并压制Rnase活性十二烷基肌氨酸钠使蛋黑量解体变性巯基试剂1预防蛋黑量大概酶等(如辅酶A)分子中SH基团氧化成二硫键,2正在某些酶反应历程中保护体系的还本环境.DTT,DDTE、巯基乙醇应用最广,谷胱苦肽也常应用,由于他是死物体内的还本剂,共时氧化后能被谷胱苦肽还本酶本位释搁.DNA提与中,常使用巯基乙醇,保护缓冲液的还本环境,预防多酚类氧化,由于具备一定的毒性,浓度不该下于2%.巯基乙醇β-巯基乙醇的主要效用是益害RNase蛋黑量中的二硫键(肽战蛋黑量分子中的半胱氨酸残基中的键).1 还本蛋黑量二硫键,使Rna酶变性2 压制酚类氧化,若氧化,核酸会形成灰乌色,苯酚的氧化产品苯醌等氧化物引起磷酸二酯键的断裂及引导RNA战DNA的接联3 呵护蛋黑量的巯基蛋黑量提与中需要巯基乙醇还本二硫键,使RNA酶得活化教变性剂SDS、尿素、盐酸胍能益害疏火键、盐键、氢键、范德华力使蛋黑量变性然而不效用肽键战二硫键,不克不迭使蛋黑量真足变性加上还本剂巯基乙醇大概DTT,能还本二硫键,使RNA真足变性DTT二硫苏糖醇刺激性气味要小很多,毒性也比巯基乙醇矮很多.而且DTT 比巯基乙醇的浓度矮7倍时,二者效验相近,然而DTT代价略下一些.由于简单被气氛氧化,果此DTT的宁静性较好;然而热冻死存大概正在惰性气体中处理不妨延少它的使用寿命.由于量子化的硫的亲核性较矮,随着pH值的落矮,DTT 的灵验还本性也随之落矮;DTT大概含有DTT的溶液不克不迭举止下压处理.压制Rnase活性TCEP 三(2-甲酰乙基)膦盐酸盐半胱氨酸Trizol苯酚、同硫氰酸胍、8-羟基喹啉、β-巯基乙醇等.TRIzol的主要身分是苯酚.苯酚的主要效用是裂解细胞,使细胞中的蛋黑,核酸物量解散得到释搁.苯酚虽可灵验天变性蛋黑量,然而不克不迭真足压制RNA酶活性,果此TRIzol中还加进了8-羟基喹啉、同硫氰酸胍、β-巯基乙醇等去压制内源战中源RNase(RNA酶).0.1%的8-羟基喹啉不妨压制RNase,与氯仿共同使用可巩固压制效用.同硫氰酸胍属于解奇剂,是一类强力的蛋黑量变性剂,可溶解蛋黑量并使蛋黑量二级结构消得,引导细胞结构落解,核蛋黑赶快与核酸分散.β-巯基乙醇的主要效用是益害RNase蛋黑量中的二硫键.液氮构制破碎,裂解细胞SDS十二烷基硫酸钠阳离子去垢剂,下温(55-65℃)裂解细胞,使染色体离析,蛋黑变性,产死SDS/蛋黑量/多糖复合物,释搁核酸,普及盐(KAc大概NaAc)浓度并落矮温度(冰浴),使SDS/蛋黑量/复合物转化成溶解度更小的钾盐酸形式,使蛋黑量及多糖杂量重淀越收真足、离心后与消重淀,上浑液中的DNA 用酚/氯仿抽提,乙醇重淀火相中的DNA支配简朴,温战,可提与到下分子量的DNA,然而产品多糖类杂量较多阳离子强表面活性剂,常常与蛋黑酶K战抗氧化剂、螯合剂所有使用可益害细胞膜、核膜,并使构制蛋黑与DNA分散溶解膜类蛋黑SDS 能裂解细胞.使细胞中的蛋黑量战核酸之间常借着静电引力大概配位键分散,阳离子去污剂不妨益害那种价键,使染色体离析,蛋黑变性,释搁核酸.(1)SDS是一种阳离子表面活性剂,能使蛋黑量的氢键战疏火键挨启,并分散到蛋黑量的疏火部位;(2)SDS可引起蛋黑量构象改变(3)SDS是一种劣良的解离剂,可使蛋黑量溶解,变性(4)产死SDS-蛋黑量复合物,并使复合物戴背电量粒圆里:正在1%的SDS溶液中缓缓加进5 N的NaCl,您会创制SDS正在下盐浓度下是会爆收重淀的.果此下浓度的盐引导了SDS的重淀.然而如果您加进的不是NaCl而是KCl,您会创制重淀的量要多的多.那本去是十二烷基硫酸钠(sodium dodecylsulfate)逢到钾离子后形成了十二烷基硫酸钾(potassium dodecylsulfate, PDS),而PDS是火不溶的,果此爆收了重淀.如许瞅去,溶液III加进后的重淀本量上是钾离子置换了SDS中的纳离子产死了不溶性的PDS,而下浓度的盐,使得重淀更真足.大家知讲SDS博门喜欢战蛋黑量分散,仄稳二个氨基酸上分散一个SDS分子,钾钠离子置换所爆收的洪量重淀自然便将绝大部分蛋黑量重淀了,让人下兴的是大肠杆菌的基果组DNA也所有被共重淀了.基果组DNA一朝爆收断裂,只消是50-100 kb大小的片断,便不办法再被PDS共重淀了CTAB:十六烷基三甲基溴乙胺,矮温时易重淀阳离子去污剂一种正在下盐下能战核酸分散产死可溶、宁静的复合物,矮盐浓度下可重淀的表面活性剂是一种阳离子去污剂, 矮离子强度(0.1-0.5M NaCl),重淀核酸与酸性多散糖,而蛋黑量战中性多散糖仍留正在溶液中.正在下离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB与蛋黑量战多散糖产死复合物,不过不克不迭重淀核酸.通过有机溶剂抽提,去除蛋黑,多糖,酚类等杂量后加进乙醇重淀即可使核酸分散出去.CTAB可从洪量爆收黏多糖的动物及某些革兰氏阳性菌制备杂化的DNA,那种去污剂加进安排至下离子强度的细菌战细胞裂解液中(>0.7M NaCl),通过连绝的酚/氯仿抽提,去除CTAB/黏多糖/ 蛋黑量复合体,同丙醇/无火乙醇重淀上浑即可将DNA分散出去CTAB另有普及DNA互补链复性速率及宁静已产死的DNA 单螺旋的效用CTAB法的主要特性是用用较广CTAB溶液正在矮于15度会产死重淀析出,果此正在将其加进酷寒的动物资料时,必须预热,且离心温度不矮于15度酶压制剂,螯合二价金属,压制金属依好性的酶螯合Mg2+大概Mn2+离子,压制细胞中DNase的活性,该酶可落解DNAEDTA是去垢剂,分散离子用,而它分散的部分散子是不妨诱收大概者促进RNA酶活性的,比圆Ca2+.EDTA是一种二价离子熬合剂,能熬合Mg2+战Ca2+等二价阳离子,而多种RNA酶的活性是需要依好二价阳离子的,所以EDTA能通过熬合二价阳离子去压制RNA酶的活性碱性条件下才搞够溶解,要战NaOH粉终混同后,再加火,而后用NaOH火溶液安排pH.0.01M,DNase酶基础得活.BSA酶压制剂,使一些落解酶的活性的表面变性粗胺大概其余多胺酶压制剂,落矮核酸酶的效用氰化物酶压制剂,落矮重金属氧化酶的效用PVP缩小酚类、醌类、单宁类物量的效用,抗氧化效用,络合多酚战萜类物量,预防多酚类褐变而氧化,去除多糖战色素,色素是PCR强压制剂,必须去除样品液氮研磨及提与缓冲液中加进PVP大概PVPP等能络合多酚战萜类物量,离心大概氯仿抽提进去,灵验预防多酚氧化成醌类,预防溶液变褐色而具备抗氧化本领提与液中加进适量的PVP大概PVPP能普及DNA的杂度,用量根据杂量而定(1-6%),PVP共时能去除多糖,果此将PVP战巯基乙醇协共使用并安排用量,能灵验预防多酚传染PVP(散乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚产死一种不溶的络合物量,灵验去除多酚,缩小DNA中酚的传染;共时它也能战多糖分散,灵验去除多糖.Triton-x100Triton X100之类的去垢剂有苯环结构,所以正在280nm有很强的吸支.蛋黑酶K蛋黑酶K:切割活性较广的丝氨酸蛋黑酶,切割脂族战芳香族氨基酸的羧基端肽键,将蛋黑量落解成小肽大概氨基酸,使DNA分子完备天分散出去.蛋黑酶K 正在较广的pH范畴内均有活性(pH 4-12.5)温度范畴37-60度盐浓度3M GuHCl 大概4M尿素中均有活性正在一些去污剂:Tween20(5%)、Triton X-100 (1%)战SDS(1%)条件下也有活性.蛋黑酶K消化裂解法适用于所有标本的消化处理,尤以DNA样品为好.如组织细胞(包罗石蜡包埋构制)绒毛、毛收、粗斑、血液(血浑、血浆、齐血)局部分泌物、尿,粪便等.蛋黑酶K的普遍处事浓度是50—100μg/ml蛋黑酶(蛋黑酶K 大概链酶蛋黑酶) 不妨落解蛋黑量,灭活核酸酶(DNase 战RNase) ,DNase 战RNase 也用于去除不需要的核酸,有人使用蛋黑酶代替DEPC处理火的,然而有些人道效验短好.蛋黑酶K,能力巨大的广谱蛋黑酶,95C 加热10 分钟,则真足得活.数年前尾次使用它代替DEPC 处理RNA 抽提用的离心管战枪头,效验不错;厥后又用于处理RNase-Free 的火,效验也是一级棒.今后便再也不必DEPC 了.配制RNA 裂解试剂时,间接用灭菌的单蒸火配制,终尾,加进蛋黑酶K 至终浓度1ug/ml.沉沉混匀,室温搁置15 分钟后即可.枪头及离心管去除RNase:先将枪头及离心管荡涤搞洁后,移进预先混好的含1ug/ml 蛋黑酶K 的单蒸火,真足浸进.室温搁置30 分钟后,连火所有下压灭菌.弃火后,烘搞即可. RNase-Free 火的赢得:间接正在灭菌的单蒸馏火中加进蛋黑酶K 至终浓度1ug/ml.沉沉混匀,室温搁置15 分钟后,灭菌处理即可.该蛋黑量的残留对付后绝真验不可睹的效用.无蛋黑量残留的RNase-Free 火的赢得:那比较贫苦.间接正在灭菌的单蒸馏火中加进蛋黑酶K 至终浓度1ug/ml.沉沉混匀后,倒进博用的蒸馏器中.搁置15 分钟后,加热蒸馏,流出的便是无蛋黑量残留的RNase-Free 火.要指示的是,该博用蒸馏器头频频流出去的火,只可当一般蒸馏火用,果为通讲中易保证RNase-Free 的环境;其余,一定要主要稀关性,可则,流出的火又被传染了.DNA裂解液的效用是益害细胞膜、核膜,并使构制蛋黑与DNA分散,压制细胞中Dnase的活性,而蛋黑酶k的效用是将蛋黑量落解成小肽大概氨基酸,使DNA分子完备天分散出去!溶菌酶溶壁酶DnaseRnase多糖火解酶:火解多糖鼓战酚酚是一种有机溶剂,预先要用STE 缓冲液鼓战,果已鼓战的酚会吸支火相而戴走一部分核酸.酚也易氧化收黄,而氧化的酚可引起核酸链中磷酸二酯键断裂大概使核酸链接联:故正在制备酚鼓战液时要加进82羟基喹咛,以预防酚氧化.苯酚非极性分子火为极性分子使蛋黑量变性,共时压制了DNase的落解效用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋黑与DNA 联结键已断,蛋黑分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶.蛋黑分子溶于酚相,而DNA溶于火相.使用酚的便宜:1. 灵验变性蛋黑量;2. 压制了DNase的落解效用.能灵验使蛋黑量变性而进去,酚产死的有机相益害蛋黑量的胶体宁静性,从而蛋黑量不会分散正在火相中,预防核酸传染缺面:1. 能溶解10-15%的火,从而溶解一部分poly(A)RNA.2. 不克不迭真足压制RNase的活性.酚变性大,然而与火相有一定程度的互溶,约莫10-15%的火溶正在酚相中,使核酸益坏酚(Phenol)对付蛋黑量的变性效用近大于氯仿,按讲理该当用酚去最大程度将蛋黑量抽提掉,然而是火鼓战酚的比重略比火重,逢到下浓度的盐溶液(比圆4M的同硫氰酸胍),离心后酚相会跑到表层,不利于含量粒的火相的回支;然而加进氯仿后不妨减少比重,使得酚/氯仿终究正在下层,便当火相的回支;另有一面,酚与火有很大的互溶性,如果单独用酚抽提后会有洪量的酚溶解到火相中,而酚会压制很多酶反应(比圆节制性酶切反应),应此如果单独用酚抽提后一定要用氯仿抽提一次将火相中的酚去除,而用酚/氯仿的混同液举止抽提,跑到火相中的酚则少得多,微量的酚正在乙醇重淀时便会被除搞洁而不必担心酶切等反应不克不迭仄常举止.至于同戊醇的增加,其效用主假如为了让离心后上下层的界里越收浑晰,也便当了火相的回支.氯仿非极性分子火为极性分子去除脂肪,使更多蛋黑量变性,从而普及提与效用克服酚的缺面;加速有机相与液相分层.终尾用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚.(酚易溶于氯仿中)氯仿变性不如酚好,然而与火不混溶,不会戴走DNA果此混同使用最好,经酚第一次抽提的火相有残留的酚,由于酚战氯仿互溶,可用氯仿第二次戴走酚,也可正在第二次抽提中混同使用,比率为1:1苯酚/氯仿苯酚、氯仿抽提去除蛋黑量非极性分子火为极性分子,当蛋黑火溶液与他们混同时,蛋黑量分子睹的火分子被挤去,使蛋黑得去火合状态而变性,经离心,变性蛋黑稀度比对付大,而与火相分散,苯酚/氯仿比要害,死存留最下层苯酚氯仿使蛋黑量变性量要脚够,果为苯酚去除蛋黑是有一定的鼓战度的,超出鼓战度,裂解体系中蛋黑量不克不迭被一次性去除,必须多次抽提.离心后分三层,下层有机层中有一些脂溶性的杂量,中间层红色絮状重淀是蛋黑,上浑液中即含有核酸;变性后的蛋黑量从火相中析出,位于苯酚中大概苯酚与火相之间.同戊醇抽提DNA,为混同匀称,简单爆收气泡,气泡会遏止相互间的充分效用,加进同戊醇落矮分子表面弛力,普遍采与氯仿:同戊醇=24:1大概酚:氯仿:同戊醇=25:24:1(不必先摆设,临用前加进即可)缩小支配历程中爆收的气泡.缩小蛋黑量变性支配历程中爆收的气泡.同戊醇不妨落矮表面弛力,从而缩小气泡爆收.其余,同戊醇有帮于分相,使离心后的表层含DNA的火相、中间的变性蛋黑相及下层有机溶剂相保护宁静.NaCl提供一个下盐环境,使DNA充分溶解于液相重淀DNA时总会加进下浓度的盐,加盐的手段是益害能使蛋黑量脆持宁静的二个果素,使蛋黑战DNA分散并重淀下去.而此时盐的阳离子会与DNA分散产死DNA-阳离子盐溶于溶液中,再用无火乙醇不妨将DNA-阳离子盐重淀下去提与DNA时先加0.14mol/L氯化钠,果为正在那种浓度的氯化钠溶液中,DNA的溶解度最矮,而蛋黑量的溶解度减少,那样通过过滤能将DNA分散启,以与消蛋黑量.再加进95%的酒粗能使DNA重淀,果为正在那个浓度下DNA溶解度最矮.如果间接加酒粗不先加氯化钠,DNA战蛋黑量皆能被酒粗所重淀,便无法将DNA战蛋黑量分散启.所以必须先加氯化钠后加酒粗,程序不克不迭颠倒.DNA溶液是DNA以火合状态宁静存留,当加进乙醇时,乙醇会夺去DNA周围的火分子,使DNA得火而易于散合.那样不妨是DNA重淀出去正在pH为8安排的溶液中,DNA 分子是戴背电荷的,加一定浓度的NaAc大概NaCl,使Na+中战DNA分子上的背电荷,缩小DNA分子之间的共性电荷相斥力,易于互相散合而产死DNA钠盐重淀,当加进的盐溶液浓度太矮时,惟有部分DNA产死DNA钠盐而散合,那样便制成DNA重淀不真足,当加进的盐溶液浓度太下时,其效验也短好.正在重淀的DNA中,由于过多的盐杂量存留,效用DNA的酶切等反应,必须要举止洗涤大概重重淀.柠檬酸钠它不妨统制反应体系的离子强度,共时另有一定的缓冲效用,包管体系PH的相对付宁静状态,总之柠檬酸钠正在那里的效用类似于食物中的防腐剂.DEPC焦碳酸二乙酯,它通过战RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环分散使蛋黑量变性,从而压制酶的活性.与肝素何用效验巩固.正在Tris中不宁静,很快会领会为二氧化碳战乙醇.热烈然而不真足的RNA酶压制剂0.1%浓度Tris-HCl缓冲体系,使pH变更不会太大同丙醇加进同丙醇之后坐时出现絮状重淀,尔背去以为那是粗确的,瞅了帖子才知讲是蛋黑量传染,同丙醇的重淀效验要比无火乙醇的重淀效验要好,然而是同丙醇重淀有一个毛病便是会重淀下去好多的盐战蛋黑量那样会效用下一步的支配,普遍尔加同丙醇是等体积的效验还不妨.70%乙醇70%乙醇洗涤DNA重淀(果为正在70%乙醇里DNA是不溶的,而盐离子却可溶),用无火乙醇则达不到那个手段!乙醇对付于蛋黑量、核酸的重淀效力随分子量加大而删大,小分子的核酸战蛋黑量碎片是不妨溶于75%乙醇的.漂洗DNA,是为了去除残存的盐类,去除过量SDS战酚等杂物,果为SDS 正在70%的乙醇中脆持溶解状态,不与DNA共重淀,从而通过弃上浑液去除那种去污剂,预防对付以去PCR反应的效用.DEPC(焦碳酸二乙酯):时常使用RNA酶压制剂,与RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环分散使蛋黑量变性,热烈然而不真足的RNA酶压制剂甲酰胺用下浓度甲酰胺代替苯酚从细胞裂解物的蛋黑酶K消化物中分散抽提DNA,甲酰胺是一种离子化溶剂,能分散蛋黑量-DNA复合物并使蛋黑变性战释搁,果其不效用蛋黑酶K的活性,特天适于分散下分子品量的DNA,其分散物籍火棉胶袋的透析,去除变性蛋黑从而杂化DNA.散乙二醇PEG有机散合物,无毒,亲火性强,相对付分子量6-20k,重淀效验主要与其自己的浓度战分子量有关,共时受离子强度、溶液pH值战温度等果素的效用,采与该要领可将病毒浓缩10倍以上.为一种非离子多散物,多离子多散物是六十年代死少起去的一类要害重淀剂.鉴于多散物的重淀效用主要依好于多散物的浓度战被重淀物的分子量大小,Laurent等(1967)提出PEG的重淀机理主假如通过空间位子排斥,使液体中的微粒(包罗死物大分子、病毒战细菌等)志愿集散正在—起而引起重淀的爆收.PEG最早应用于提杂免疫球蛋黑(IgG)战重淀一些细菌病毒,今年去渐渐应用于核酸战酶的分散杂化,特天是用PEG分散量粒DNA,已相称一致.用PEG8000代替乙醇重淀DNA,不妨正在500ul DNA液中加进200ul 20%PEG8000(含1.2 mol/LNaCl),冰浴20min(Li et a1.,1994).该支配的便宜正在于:支配条件温战,阻挡易引起死物大分子的变性.共时具备极下的重淀效能,少量的PEG不妨重淀相称多的死物大分子.乙基黄本酸钾乙基黄本酸钾不妨与多糖分散,产死可溶性复合物,使细胞壁破裂,释搁出核酸.此复合物正在铵离子存留的情况下可转化成火不溶性,并可通过简朴的离心与消,不需要苯酚大概氯仿抽提.其余,乙基黄本酸钾不妨分散金属离子,压制DNase的活性.Tillett等(2000)利用该要领从蓝细菌、微死物、环境样品中提与到下品量的核酸,DNA不妨用于酶切、克隆、PCR,RNA不妨用于RT-PCR,Southern杂接等反应,而且样品中不含核酸酶,温育16 h不爆收落解.。
核酸提取试剂说明书
说明书【产品名称】【预期用途】本产品主要原理如下:1.使用裂解液实现细胞裂解、DNA 的释放。
2.磁珠可以特异地吸附DNA ,通过洗涤,去除DNA 以外的杂质。
3.洗脱液解离吸附在磁珠上的DNA ,得到纯度和浓度均很高的DNA 。
【检验原理】100次/盒; 400次/盒【包装规格】核酸提取或纯化试剂版本号:12/2021用于核酸的提取、富集、纯化等步骤。
其处理后的产物用于临床体外检测使用。
核酸提取或纯化试剂【主要组成成分】100次/盒400次/盒试剂名称规格数量规格数量裂解缓冲液24ml/瓶1瓶96ml/瓶1瓶漂洗缓冲液1(浓缩液)80ml/瓶1瓶80ml/瓶4瓶漂洗缓冲液2(浓缩液)50ml/瓶1瓶50ml/瓶4瓶漂洗缓冲液396 ml/瓶1瓶192ml/瓶2瓶洗脱缓冲液30ml/瓶1瓶96ml/瓶1瓶蛋白酶K25mg/支2支180mg/瓶1瓶蛋白酶K保存液 1.25 ml/支2支5ml/支2支磁珠悬浮液1ml/瓶2瓶8ml/瓶1瓶【自备仪器、试剂】1.手动单管提取:1)恒温混匀仪——货号:CW25932)2/15 ml磁力架——货号:CW25943)异丙醇、无水乙醇2.手动96孔深孔板提取:1)恒温混匀仪——货号:CW25932)废液抽吸系统——推荐品牌台湾洛科3)手动连续分液器——推荐品牌Eppendorf4)电动连续分液器——推荐品牌Eppendorf5)手动连续分液器分液管(25 ml)——推荐品牌Eppendorf6)96孔板磁力架——货号:CW25957)异丙醇、无水乙醇3.磁棒法磁珠自动提取系统:1)磁棒法磁珠自动提取系统——建议品牌Thermo Fisher2)异丙醇、无水乙醇【储存条件及有效期】4-30℃保存,有效期12个月。
可在4-37℃运输,运输时间建议不超过7天。
【样本要求】1.适用样本类型:抗凝全血、唾液、细胞。
2.样本处理与保存:新鲜样本应尽快处理或-70℃冻存,避免反复冻融。
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理
DNA 提取过程中各种试剂的作用及原理 1.溶液 I—溶菌液:溶菌酶:它是糖苷水解酶,能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-1,4 糖苷键,因而具有溶菌的作用。
当溶液中pH小于8 时,溶菌酶作用受到抑制。
葡萄糖:增加溶液的粘度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切力作用而降解。
EDTA:(1)螯合 Mg2+、Ca2+等金属离子,抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用(DNase 作用时需要一定的金属离子作辅基);(2)EDTA 的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。
2.溶液II-NaOH-SDS 液:NaOH:核酸在 pH 大于5,小于9 的溶液中,是稳定的。
但当pH>12或 pH<3时,就会引起双链之间氢键的解离而变性。
在溶液 II中的NaOH浓度为0.2mo1/L,加抽提液时,该系统的 pH就高达12.6,因而促使染色体 DNA 与质粒DNA的变性。
SDS:SDS 是离子型表面活性剂。
它主要功能有:(1)溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。
(2)解聚细胞中的核蛋白。
(3)SDS能与蛋白质结合成为 R-O-SO3-…R+-蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。
但是 SDS 能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去除干净,防止在下一步操作中(用RNase 去除RNA 时)受到干扰。
3. 溶液 III--3mol/L NaAc(pH4.8)溶液:NaAc 的水溶液呈碱性,为了调节pH至 4.8,必须加入大量的冰醋酸。
所以该溶液实际上是NaAc-HAc的缓冲液。
用pH4.8的NaAc溶液是为了把pH12.6 的抽提液,调回 pH至中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。
而高盐的 3mol/L NaAc 有利于变性的大分子染色体 DNA、RNA 以及 SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。
前者是因为中和核酸上的电荷,减少相斥力而互相聚合,后者是因为钠盐与 SDS-蛋白复合物作用后,能形成较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。
核酸提取试剂实验报告
一、实验目的1. 熟悉核酸提取试剂的使用方法。
2. 掌握核酸提取的原理和操作步骤。
3. 了解不同核酸提取试剂的优缺点。
二、实验原理核酸是生物体内重要的生物大分子,包括脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)。
DNA主要存在于细胞核中,负责储存遗传信息;RNA主要存在于细胞质中,参与蛋白质的合成。
核酸提取是将核酸从生物样本中分离出来的过程,常用的提取方法有酚-氯仿法、磁珠法等。
本实验采用酚-氯仿法提取DNA,该方法利用酚和氯仿的变性作用,将蛋白质与DNA 分离,然后通过离心、沉淀等步骤,获得纯化的DNA。
三、实验材料1. 样本:细菌、真菌、植物、动物组织等。
2. 试剂:酚-氯仿、氯仿、无水乙醇、NaCl溶液、TE缓冲液等。
3. 仪器:离心机、电子天平、移液器、离心管等。
四、实验步骤1. 样本处理:将样本剪碎,加入适量TE缓冲液,充分研磨,制成匀浆。
2. 混合:将匀浆液加入等体积的酚-氯仿,充分振荡,静置10分钟。
3. 离心:将混合液以12,000 rpm离心10分钟,取上清液。
4. 沉淀:在上清液中加入等体积的氯仿,充分振荡,静置10分钟。
5. 离心:将混合液以12,000 rpm离心10分钟,取上清液。
6. 沉淀:在上清液中加入1/10体积的3mol/L NaCl溶液和2.5倍体积的无水乙醇,充分混匀,静置2小时。
7. 离心:将混合液以12,000 rpm离心10分钟,弃上清液。
8. 洗涤:用75%乙醇洗涤沉淀,以12,000 rpm离心5分钟,弃上清液。
9. 洗涤:用无水乙醇洗涤沉淀,以12,000 rpm离心5分钟,弃上清液。
10. 溶解:将沉淀溶于适量TE缓冲液,混匀,即为提取的DNA。
五、实验结果与分析1. 实验结果:通过酚-氯仿法提取的DNA呈白色絮状沉淀,溶解于TE缓冲液后,在紫外分光光度计下,A260/A280比值在1.8-2.0之间,表明DNA纯度较高。
2. 结果分析:实验结果表明,酚-氯仿法能够有效提取DNA,且提取的DNA纯度较高。
核酸提取常见试剂地作用原理
核酸提取常见试剂地作用原理核酸提取是分子生物学研究中的基础步骤之一,常用于从细胞或组织中提取和纯化核酸。
核酸提取试剂包括细胞裂解缓冲液、蛋白酶、盐溶液、有机溶剂等。
核酸提取试剂的作用原理主要涉及以下几个方面:1.细胞裂解缓冲液:细胞裂解缓冲液是为了打破细胞膜和核膜,使细胞内的核酸暴露出来。
细胞裂解缓冲液一般含有一些离子和试剂,如EDTA、SDS等。
EDTA可以螯合离子,使核酸不被酶降解。
SDS则可以破坏细胞膜和核膜的完整性,使核酸释放出来。
2. 蛋白酶:蛋白酶的作用是降解核酸分子上的蛋白质,使核酸与蛋白质分离。
在核酸提取的过程中,蛋白酶可以去除核酸表面的蛋白质,从而提高核酸的纯度。
常用的蛋白酶有蛋白酶K和蛋白酶ase。
3.盐溶液:盐溶液的作用是使DNA在溶液中凝集并沉淀。
盐的高浓度可以中和DNA的负电荷,使DNA之间的静电斥力减弱,从而导致DNA分子的凝集和沉淀。
4.有机溶剂:有机溶剂在核酸提取中起到萃取作用,使DNA从细胞裂解液中分离出来。
有机溶剂常用的有酚类、氯仿和异丙醇。
酚类溶剂可以破坏细胞和核膜的完整性,同时与DNA形成无水醇相互作用,促使DNA分离出来。
氯仿可以和DNA结合,并与水进行分配,从而加速DNA的沉淀。
异丙醇则可改变溶液的表面张力,使DNA分子凝胶化和沉淀。
5.离心:离心是核酸提取中的一个重要步骤。
通过离心,可以将细胞碎片、蛋白质、碎屑等杂质与纯净的核酸分离开来。
离心的原理是通过旋转离心机,利用离心力将混合液中的成分分离开来,使沉淀物和上清液分离。
总的来说,核酸提取试剂是通过改变细胞的环境和物理化学性质来实现核酸的分离纯化。
通过使用细胞裂解缓冲液打破细胞膜和核膜,加入蛋白酶降解蛋白质,使用盐溶液凝集和沉淀DNA,加入有机溶剂进行DNA的萃取,最后通过离心分离杂质和DNA。
这些步骤综合起来,能够从复杂的样品中纯化出相对纯净的核酸。
nucleozol 原理
nucleozol 原理
Nucleozol是一种常用的核酸提取试剂,它的原理是利用硅化
二甲基苯基氯硅烷(DMBPS)的化学结构,将核酸与其特异
性地结合,形成特定的络合物。
配合Nucleozol缓冲溶液,可
以在一定条件下使核酸脱离细胞内其他组分,并与DMBPS形
成络合物。
DMBPS是一种疏水性化合物,它具有苯基和硅烷基,能够与
核酸中的酰胺键形成氢键和疏水作用。
通过Nucleozol缓冲溶
液中的高盐浓度和酸性条件,可以改变核酸及其他细胞组分的电荷情况,增加了核酸与DMBPS的亲和性。
此外,高盐浓度
还可以降低有机物和蛋白质的溶解度,从而使它们沉淀或析出,从而有效分离核酸。
经过离心沉淀步骤后,溶液中的核酸-DMBPS络合物可溶解于水,并可通过丙酮沉淀和洗涤的方式从细胞残渣中进一步纯化。
最后,通过加入适当的溶剂,如去离子水或低盐缓冲溶液,可以使核酸从络合物中解离,得到纯净的核酸提取物。
核酸提取常见试剂的作用原理
核酸提取常见试剂的作用原理1. 高盐法高盐法是一种常用的核酸提取方法,其作用原理主要是利用高盐浓度使细胞破裂,并通过沉淀去除蛋白质。
在高盐浓度环境下,细胞膜失去正常结构,细胞破裂释放出胞内的核酸。
此时,核酸与蛋白质结合的盐桥被破坏,蛋白质被沉淀,而核酸则在上清液中。
通过离心去除细胞碎片和沉淀蛋白质后,可以得到相对纯净的核酸。
2. 酚/氯仿法酚/氯仿法是一种经典的核酸提取方法,其作用原理是利用酚和氯仿的不同相溶性分离核酸和蛋白质。
在酚/氯仿混合液中,酚与核酸结合形成酚酸盐,而蛋白质则溶于氯仿相中。
通过离心分离上清液和有机相后,可以得到纯净的核酸。
3. 硅胶柱法硅胶柱法是一种基于硅胶柱的核酸提取方法,其作用原理是利用硅胶柱的吸附作用纯化核酸。
在硅胶柱中,核酸可以与硅胶表面发生静电吸附,而蛋白质和其他杂质则被洗脱。
通过洗脱步骤,可以得到高纯度的核酸。
4. 磁珠法磁珠法是一种利用磁性珠子进行核酸提取的方法,其作用原理是通过磁性珠子的磁性吸附作用纯化核酸。
磁性珠子表面常涂有特定的化学物质,使其具有亲核酸的性质。
在特定条件下,核酸与磁性珠子表面的化学物质结合,而其他杂质则被洗脱。
通过磁力分离,可以得到高纯度的核酸。
以上介绍了几种常见的核酸提取试剂及其作用原理。
这些方法各有优缺点,适用于不同的实验需求。
在选择核酸提取试剂时,需要考虑样品特性、纯度要求、操作简便性等因素。
同时,为了确保提取到高质量的核酸样品,操作过程中需要严格控制各个步骤的条件,避免污染和损失。
通过合理选择和正确操作核酸提取试剂,可以获得高质量的核酸样品,为后续的分子生物学实验提供可靠的基础。
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理
DNA提取过程中各种试剂的作用及原理1. 细胞裂解缓冲液(Cell Lysis Buffer):作用:细胞裂解缓冲液用于破坏细胞膜和细胞核膜,并释放细胞内的DNA分子。
原理:细胞裂解缓冲液主要含有非离子性洗涤剂(如Triton X-100和Tween-20)和盐溶液(如NaCl)。
洗涤剂可以溶解和破坏细胞膜,并释放内部的细胞器和DNA。
高盐浓度可破坏细胞核膜,进一步释放核内的DNA分子。
2. RNase A缓冲液(RNase A Buffer):作用:RNase A缓冲液用于降解细胞内的RNA分子,以避免在DNA提取过程中的RNA污染。
原理:RNase A是一种内切核糖核酸酶,可以特异性地水解单链的RNA。
在DNA提取中,RNase A会降解细胞裂解液中的RNA分子,使其无法干扰后续DNA的纯化步骤。
3. 蛋白酶K缓冲液(Proteinase K Buffer):作用:蛋白酶K缓冲液用于分解和去除DNA周围的蛋白质。
原理:蛋白酶K是一种特异性的蛋白酶,可以水解蛋白质。
在DNA提取中,蛋白酶K会分解细胞裂解液中的蛋白质,包括DNA结合蛋白和酶,以便纯化DNA。
4. 盐溶液(Salt Solution):作用:盐溶液用于沉淀DNA分子,将其从细胞裂解液中分离出来。
原理:DNA可以在高盐浓度下形成沉淀,并从溶液中沉淀出来。
通过加入盐溶液,DNA分子会和盐结合形成可见的凝胶状物质(DNA凝胶)。
5. 酒精沉淀缓冲液(Ethanol Precipitation Buffer):作用:酒精沉淀缓冲液用于使DNA形成可见的物质,并沉淀下来。
原理:通过将酒精加入DNA溶液中,可以改变溶液的物理性质,使DNA凝析成不可溶的颗粒,从而方便后续的离心沉淀。
6. 纯化缓冲液(Purification Buffer):作用:纯化缓冲液用于洗涤和纯化沉淀下来的DNA样品。
原理:纯化缓冲液中含有适当的离子浓度和pH值,可以提供适当的条件,以去除影响DNA纯化的杂质。
核酸提取常见试剂地作用原理
核酸提取常见试剂地作用原理核酸提取是分离纯化DNA或RNA的过程,以获得高质量的核酸样品用于进一步的分子生物学实验。
核酸提取的常见试剂主要有细胞裂解缓冲液、蛋白酶、溶剂和混合物。
下面将详细介绍这些常见试剂的地作用原理。
1.细胞裂解缓冲液:细胞裂解缓冲液主要包含盐、缓冲剂、洗涤剂和螯合剂等成分。
其主要作用是破坏细胞膜和核膜,使细胞释放出核酸。
细胞裂解缓冲液中的盐通过渗透压作用使细胞膜破裂,使细胞内部的核酸暴露在外。
缓冲剂可以调节溶液的酸碱度,使其维持在适合核酸稳定的范围内。
洗涤剂的作用是将细胞中的脂质和蛋白质溶解,进一步破坏细胞膜。
螯合剂能够与金属离子形成配合物,阻止金属离子催化核酸降解反应。
2.蛋白酶:蛋白酶一般用于去除核酸提取过程中的蛋白质污染物。
蛋白酶能够水解蛋白质,将其分解成氨基酸和小肽,从而达到去除蛋白质的目的。
在核酸提取过程中,蛋白酶通常添加在核酸的溶解和洗涤步骤中,以去除细胞中的蛋白质。
3.溶剂:在核酸提取过程中,常用的溶剂有酚、异丙醇和乙醇等。
这些溶剂的作用是通过改变核酸和其他杂质的溶解特性,从而实现纯化目的。
酚能够溶解DNA,并与蛋白质形成复合物,其中DNA会在酚的上层,而蛋白质则在下层。
异丙醇和乙醇主要用于沉淀和纯化核酸。
添加这些溶剂后,核酸会从溶液中析出形成沉淀,然后可以通过离心沉淀核酸,将杂质剔除。
4.混合物:核酸提取中常用的混合物有实验用试剂盒等。
实验用试剂盒通常包含多种试剂和材料,提供了从细胞裂解到纯化核酸的全部步骤。
这些试剂盒经过精心配置,能够实现快速、高效和可靠的核酸提取。
其中的各种试剂按照特定的顺序和比例添加,以实现细胞裂解、去除蛋白质、去除杂质、沉淀核酸等步骤。
总的来说,核酸提取的常见试剂通过不同的地作用原理实现细胞裂解、去除蛋白质和杂质、纯化核酸等功能。
这些试剂能够有效地提取出高质量的DNA或RNA,为后续的分子生物学实验提供可靠的基础。
核酸提取方法三种
核酸提取方法三种核酸(DNA或RNA)的提取是生物学和分子生物学研究中的一项重要技术。
这些提取方法可分为化学法、机械法和磁珠法三种。
1. 化学法:化学法是最常用的核酸提取方法之一,其基本原理是通过化学试剂破坏细胞膜和核膜,使得核酸被释放出来。
常用的化学试剂包括胰蛋白酶、SDS、EDTA、蛋白酶K等。
首先,组织样品需经过细胞破碎,方法可以是机械破碎或液氮冲击。
接下来,将样品中的蛋白质通过蛋白酶处理,以去除干扰。
然后,加入一定的试剂将DNA 或RNA稳定起来,并用氯仿醇萃取法或硅胶柱纯化法来分离核酸。
最后,用适当的缓冲液溶解核酸,使其适合后续实验使用。
2. 机械法:机械法适用于提取植物细胞原生质体中的DNA或RNA。
它的基本原理是通过物理力量破碎细胞壁和细胞膜,释放细胞质中的核酸。
机械法提取核酸的方法有刀切法、研磨法和玻璃珠破碎法等。
在刀切法中,样品被切成细小片段,然后用块状试剂研磨,最后用缓冲液洗净,使核酸溶解。
研磨法和玻璃珠破碎法则通过高速旋转或震荡的方法,利用玻璃珠等硬质物体对样品进行破碎。
3. 磁珠法:磁珠法是一种快速高效的核酸提取方法。
它利用表面修饰的磁性珠,通过磁场的作用来实现核酸的捕获、纯化和洗脱。
这种方法常用于自动化的核酸提取设备中,并通过磁力分离技术简化了传统柱层析法的操作步骤。
在磁珠法中,首先制备表面修饰的磁性珠,以使其能够选择性结合DNA或RNA。
然后,将样品与磁珠混合,使核酸与磁珠结合。
通过磁场的引导和离心沉降,磁珠与被结合的核酸被分离出来。
最后,通过洗脱步骤,将核酸从磁珠上解离,使其溶解在适当的缓冲液中。
总结:核酸提取是分子生物学研究中至关重要的一步,能够从组织样品中提取出纯度较高的DNA或RNA。
化学法、机械法和磁珠法是常用的核酸提取方法。
化学法利用试剂破坏细胞和核膜,使核酸被释放出来;机械法通过物理力量破碎细胞壁和细胞膜,释放细胞质中的核酸;磁珠法则利用表面修饰的磁性珠来捕获、纯化和洗脱核酸。
核酸提取常见试剂的作用原理
核酸提取常见试剂的作用原理核酸提取是从细胞、组织中分离、纯化出核酸的过程。
核酸提取的常见试剂包括细胞裂解液、蛋白酶K、乙酸钠、异丙醇以及盐溶液等。
这些试剂根据其作用原理可分为裂解细胞膜、消化蛋白质、沉淀杂质、精炼核酸等几个步骤。
首先,细胞裂解液是核酸提取中最关键的试剂之一,其作用是破坏细胞膜和核酸与蛋白质间的非共价键,使其释放到裂解液中。
细胞裂解液主要由含有蛋白酶的缓冲盐溶液组成,蛋白酶的作用是分解蛋白质,使核酸得以顺利释放。
其次,蛋白酶K是一种特异性水解蛋白质的酶,主要作用是将裂解产物中的核酸外源性污染物进行消化降解,从而提高核酸的纯度。
蛋白酶K在酸性、碱性和高温条件下都具有较好的活性,因此可以在一定程度上去除核酸提取过程中可能存在的污染。
乙酸钠在核酸提取中主要用作沉淀钙离子,这是因为钙离子可以结合核酸形成不溶于水的盐类沉淀,从而使核酸纤维变得更加容易提取。
乙酸钠在碱性条件下结合钙离子,并形成不溶于水的钙酸盐沉淀,从而使得核酸能够更好地沉淀,减少杂质的存在。
异丙醇是核酸提取中的一种有机试剂,主要作用是通过改变核酸和水的亲合性来实现核酸的提纯。
异丙醇可以显著降低核酸与水之间的溶解度,使核酸从水中沉淀出来。
除了降低溶解度,异丙醇还能减少核酸与蛋白质之间的相互作用,从而防止核酸与蛋白质的复合物形成。
最后,盐溶液在核酸提取过程中主要用作洗涤核酸的试剂,其作用是去除核酸中的杂质以及一些可能残留的试剂。
盐溶液中的高离子浓度能够帮助核酸与水中的杂质分离,使核酸在洗涤过程中保持稳定。
综上所述,核酸提取常见试剂在提取过程中有着不同的作用原理,包括裂解细胞膜、消化蛋白质、沉淀杂质以及精炼核酸等几个步骤。
它们通过不同的机制来实现核酸的纯化、提纯以及去除污染物,为后续的核酸分析提供高质量的样品。
核酸提取常见试剂的作用原理复习课程
核酸提取常见试剂的作用原理异硫氰酸胍强用力的蛋白质变性剂,能迅速溶解蛋白质,导致细胞结构破碎,核蛋白由于其二级结构的破坏消失而迅速与核酸分离。
胍盐是破坏蛋白质三维结构的离液剂,在通常使用的蛋白质变性剂中作用最强的是异硫氰酸胍,它们可以使多数蛋白质转换成一随机的卷曲状态。
含有强力的阴离子和阳离子基团,它们可以形成较强的氢键。
在还原剂存在的情况下,异硫氰酸胍可以断裂氢键,而去垢剂,如SDS存在的情况下,可以破坏疏水作用。
盐酸胍、尿素盐酸胍是一个核酸酶的强抑制剂,它并不是一种足够强的变性剂,可以允许完整的RNA从富含RNase的组织中提取出来。
4-8M可断裂氢键,有两种可能机制:1变性蛋白和盐酸胍、尿素优先结合,形成变性蛋白-变性剂复合物,当复合物被除去,从而引起N-D反应平衡向右移动,随着变性剂浓度增加,天然状态的蛋白不断转变为复合物,最终导致蛋白质完全变性;2盐酸胍、尿素对氨基酸的增溶作用,能形成氢键,当浓度高时,能破坏水的氢键结构,结果盐酸胍、尿素就称为非极性残基的较好溶剂,使蛋白质内部的疏水残基伸展和溶解性加强,盐酸胍、尿素引起的变性往往是不可逆的。
高浓度尿素使蛋白质变性并抑制Rnase活性十二烷基肌氨酸钠使蛋白质解体变性巯基试剂1防止蛋白质或酶等(如辅酶A)分子中SH基团氧化成二硫键,2在某些酶反应过程中维持体系的还原环境。
DTT,DDTE、巯基乙醇应用最广,谷胱甘肽也常应用,由于他是生物体内的还原剂,同时氧化后能被谷胱甘肽还原酶原位释放。
DNA提取中,常使用巯基乙醇,维持缓冲液的还原环境,防止多酚类氧化,由于具有一定的毒性,浓度不应高于2%。
巯基乙醇β-巯基乙醇的主要作用是破坏RNase蛋白质中的二硫键(肽和蛋白质分子中的半胱氨酸残基中的键)。
1 还原蛋白质二硫键,使Rna酶变性2 抑制酚类氧化,若氧化,核酸会变成灰黑色,苯酚的氧化产物苯醌等氧化物引起磷酸二酯键的断裂及导致RNA和DNA的交联3 保护蛋白质的巯基蛋白质提取中需要巯基乙醇还原二硫键,使RNA酶失活化学变性剂SDS、尿素、盐酸胍能破坏疏水键、盐键、氢键、范德华力使蛋白质变性但不影响肽键和二硫键,不能使蛋白质彻底变性加上还原剂巯基乙醇或DTT,能还原二硫键,使RNA彻底变性DTT二硫苏糖醇刺激性气味要小很多,毒性也比巯基乙醇低很多。
核酸提取常见试剂地作用原理
异硫氰酸胍强用力的蛋白质变性剂,能迅速溶解蛋白质,导致细胞结构破碎,核蛋白由于其二级结构的破坏消失而迅速与核酸分离。
胍盐是破坏蛋白质三维结构的离液剂,在通常使用的蛋白质变性剂中作用最强的是异硫氰酸胍,它们可以使多数蛋白质转换成一随机的卷曲状态。
含有强力的阴离子和阳离子基团,它们可以形成较强的氢键。
在还原剂存在的情况下,异硫氰酸胍可以断裂氢键,而去垢剂,如SDS存在的情况下,可以破坏疏水作用。
盐酸胍、尿素盐酸胍是一个核酸酶的强抑制剂,它并不是一种足够强的变性剂,可以允许完整的RNA 从富含RNase的组织中提取出来。
4-8M可断裂氢键,有两种可能机制:1变性蛋白和盐酸胍、尿素优先结合,形成变性蛋白-变性剂复合物,当复合物被除去,从而引起N-D反应平衡向右移动,随着变性剂浓度增加,天然状态的蛋白不断转变为复合物,最终导致蛋白质完全变性;2盐酸胍、尿素对氨基酸的增溶作用,能形成氢键,当浓度高时,能破坏水的氢键结构,结果盐酸胍、尿素就称为非极性残基的较好溶剂,使蛋白质内部的疏水残基伸展和溶解性加强,盐酸胍、尿素引起的变性往往是不可逆的。
高浓度尿素使蛋白质变性并抑制Rnase活性十二烷基肌氨酸钠使蛋白质解体变性巯基试剂1防止蛋白质或酶等(如辅酶A)分子中SH基团氧化成二硫键,2在某些酶反应过程中维持体系的还原环境。
DTT,DDTE、巯基乙醇应用最广,谷胱甘肽也常应用,由于他是生物体内的还原剂,同时氧化后能被谷胱甘肽还原酶原位释放。
DNA提取中,常使用巯基乙醇,维持缓冲液的还原环境,防止多酚类氧化,由于具有一定的毒性,浓度不应高于2%。
巯基乙醇β-巯基乙醇的主要作用是破坏RNase蛋白质中的二硫键(肽和蛋白质分子中的半胱氨酸残基中的键)。
1 还原蛋白质二硫键,使Rna酶变性2 抑制酚类氧化,若氧化,核酸会变成灰黑色,苯酚的氧化产物苯醌等氧化物引起磷酸二酯键的断裂及导致RNA和DNA的交联3 保护蛋白质的巯基蛋白质提取中需要巯基乙醇还原二硫键,使RNA酶失活化学变性剂SDS、尿素、盐酸胍能破坏疏水键、盐键、氢键、范德华力使蛋白质变性但不影响肽键和二硫键,不能使蛋白质彻底变性加上还原剂巯基乙醇或DTT,能还原二硫键,使RNA彻底变性DTT二硫苏糖醇刺激性气味要小很多,毒性也比巯基乙醇低很多。
核酸提取常见试剂的作用原理
核酸提取常见试剂的作用原理核酸提取是分子生物学和遗传学研究中的重要步骤,其目的是从生物样本中分离和纯化核酸。
常见的核酸提取试剂有离体腺苷酸(ATP)、蛋白酶K、脲和异碘酸等。
这些试剂在核酸提取中起到不同的作用,下面详细介绍它们的作用原理。
离体腺苷酸(ATP)是核酸提取试剂中的一种常用溶液。
它的主要作用是通过竞争性抑制蛋白酶活性,防止蛋白酶降解核酸。
蛋白酶是存在于细胞中的一类酶,它能降解蛋白质。
在核酸提取过程中,为了保护核酸不被蛋白酶降解,需要加入ATP来与蛋白酶竞争结合位点,从而保护核酸的完整性。
蛋白酶K是一种广泛应用于核酸提取的酶。
它主要通过切断蛋白质和核酸间的化学键来释放核酸分子。
蛋白酶K能够识别蛋白质表面的多肽链,然后切断其肽键,从而解离蛋白质和核酸的相互作用,使核酸释放出来。
在核酸提取过程中,加入蛋白酶K可以帮助溶解蛋白质,使核酸可以从蛋白质中分离出来。
脲是核酸提取试剂中一种常用的溶液,它的作用是通过改变溶液中的离子浓度和盐浓度来调节核酸的溶解性。
脲能够与核酸分子形成氢键,从而增加核酸的稳定性。
在核酸提取过程中,将生物样本加入含有脲的溶液中,可以使细胞破裂并释放出核酸,同时保护核酸不被降解,并增加核酸在溶液中的溶解度。
异碘酸是一种氧化剂,它在核酸提取中的作用是氧化生物样本中的蛋白质和多肽链,从而分解它们。
异碘酸的氧化性能够破坏蛋白质和多肽链的化学键,将其分解成小分子,使得核酸可以从中解离出来。
异碘酸还可以去除细胞中的多聚腺苷酸,从而降低核酸提取过程中的阻碍。
综上所述,离体腺苷酸、蛋白酶K、脲和异碘酸是核酸提取过程中常见的试剂,它们分别通过竞争性抑制蛋白酶活性、切断蛋白质和核酸的化学键、调节核酸的溶解性和氧化蛋白质和多肽链,完成核酸的提取和纯化。
在核酸提取实验中,合理使用这些试剂,可以保护核酸的完整性和纯度,为后续的分子生物学和遗传学研究提供可靠的基础数据。
DNA提取中实验试剂作用原理
DNA提取中实验试剂作用原理实验中常用的DNA提取试剂包括裂解试剂、蛋白酶、盐酸试液、乙醇和双酚鳞溶液等。
这些试剂在DNA提取过程中各有作用,如下所述:1.裂解试剂:裂解试剂用于破坏细胞膜和核膜,使得DNA从细胞内释放出来。
裂解试剂通常包括CTAB(阳离子型表面活性剂)、SDS(阴离子型表面活性剂)等。
CTAB形成的复合物非常稳定,能够将DNA包裹在内,从而避免DNA的降解。
SDS则是通过与脂质结合,破坏细胞和核膜的结构。
2.蛋白酶:蛋白酶用于降解细胞内蛋白质和核酸酶,从而防止蛋白质和核酸酶对DNA的降解。
常用的蛋白酶有蛋白酶K和胰蛋白酶等,它们能够将核酸链断裂的酶活性降低至最小。
3.盐酸试液:盐酸试液用于将DNA溶解在水溶液中。
DNA分子含有大量的负电荷,通过加入盐酸试液可以中和DNA的负电荷,从而使得DNA变得溶解于水中。
4.乙醇:乙醇的作用是用来沉淀DNA。
加入乙醇后,DNA分子会聚集在一起,形成可见的白色沉淀。
乙醇使得DNA分子水化度降低,从而迫使DNA分子之间发生相互作用,进一步形成沉淀。
5.双酚鳞溶液:双酚鳞溶液能够与DNA结合形成复合物,在DNA提取的过程中起到分离DNA和其他细胞成分的作用。
双酚鳞可以与DNA的A-T碱基对之间发生氢键作用,从而形成稳定的DNA-双酚鳞复合物。
此后可以通过离心将复合物沉淀下来,从而实现DNA的纯化。
在DNA提取过程中,实验试剂的作用主要包括细胞破裂、DNA溶解、DNA纯化和去除杂质等。
上述试剂通过不同的作用机制协同起作用,最终使得DNA从细胞中提取出来并得到纯化。
这些试剂的选用和使用方法要根据具体的DNA提取方案进行调整,以保证提取到高质量和高纯度的DNA样品。
核酸提取液作用原理
核酸提取液作用原理
核酸提取液是一种用于从生物样本中提取核酸(DNA或RNA)的化学试剂。
它的作用原理是通过破坏细胞膜和核酸蛋白质的相互作用,使核酸从细胞中释放出来,并且保护核酸免受酶的降解。
核酸提取液通常包含离子表面活性剂(如SDS或CTAB)、蛋白酶K、EDTA、盐和缓冲液等成分。
这些成分共同发挥作用,实现核酸的高效提取。
核酸提取液中的离子表面活性剂会破坏细胞膜的完整性。
离子表面活性剂具有亲水和疏水两个部分,可以相互作用并与细胞膜脂质结合,破坏脂质屏障,使细胞膜破裂。
同时,离子表面活性剂还可以与细胞膜蛋白质结合,破坏蛋白质的三维结构,进一步破坏细胞膜。
核酸提取液中的蛋白酶K可以降解蛋白质。
蛋白酶K是一种嗜热性蛋白酶,在高温条件下能够高效降解细胞中的蛋白质。
通过加入蛋白酶K,可以迅速降解细胞中的蛋白质,将核酸从蛋白质中释放出来。
核酸提取液中的EDTA可以螯合金属离子,抑制核酸酶的活性。
核酸酶是一类能够降解核酸的酶,在细胞内广泛存在。
通过加入EDTA,可以使其与金属离子结合,降低核酸酶的活性,从而保护核酸不被降解。
核酸提取液中的盐和缓冲液可以调节提取液的pH值和离子强度,为
核酸的提取提供合适的环境。
适当的pH值和离子强度可以使核酸分子更容易溶解在提取液中,并且有助于去除细胞中的蛋白质和其他杂质。
核酸提取液通过破坏细胞膜和核酸蛋白质的相互作用,释放核酸,并且通过蛋白酶的降解和核酸酶的抑制,保护核酸不被降解。
核酸提取液的使用可以方便、高效地从生物样本中提取出纯度较高的核酸,为后续的分子生物学研究和应用提供了重要的基础。
硫酸铵在核酸提取中的作用
硫酸铵在核酸提取中的作用一、引言核酸提取是现代生物学研究中的重要环节,它能够从生物样本中分离和纯化核酸,为后续的分子生物学实验和研究提供基础。
在核酸提取的过程中,硫酸铵作为一种重要的试剂,发挥着关键的作用。
本文将详细介绍硫酸铵在核酸提取中的作用机制与优势。
二、硫酸铵的作用机制在核酸提取中,硫酸铵主要通过结合DNA或RNA中的负电荷,使核酸以沉淀的形式从溶液中析出。
它能够与核酸中的磷酸根结合,形成难溶性的沉淀物,使核酸分离出来。
硫酸铵的作用机制可以简单地概括为两个步骤:首先,硫酸铵中的硫酸根与DNA或RNA中的磷酸根结合,形成硫酸铵盐的沉淀;其次,硫酸铵沉淀物的形成使核酸从溶液中析出。
三、硫酸铵的优势1. 高效:硫酸铵具有很高的结合效率,能够迅速与DNA或RNA中的磷酸根结合,形成沉淀物。
其高效的结合能力使得核酸能够得到有效的分离和纯化。
2. 选择性:硫酸铵在核酸提取中具有较强的选择性,能够选择性地与核酸结合,而不与其他的杂质物质结合。
这样可以有效地去除杂质,提高核酸的纯度。
3. 方便操作:硫酸铵作为一种常见的试剂,易于获取和操作。
它的使用方法简单明了,不需要复杂的设备和步骤,因此广泛应用于核酸提取的实验中。
4. 经济实惠:与其他核酸提取试剂相比,硫酸铵的成本较低。
这使得硫酸铵成为实验室中首选的核酸提取试剂之一。
四、总结硫酸铵在核酸提取中的作用是不可或缺的。
它通过与DNA或RNA 中的磷酸根结合,使核酸以沉淀的形式从溶液中析出,实现了核酸的分离和纯化。
硫酸铵具有高效、选择性、方便操作和经济实惠的特点,使其在核酸提取中得到了广泛的应用。
通过合理使用硫酸铵,可以获得高质量的核酸样本,为后续的分子生物学研究提供可靠的基础。
(以上内容仅供参考,仅供学习交流使用)。
核酸提取常见试剂的作用原理
异硫氰酸胍强用力得蛋白质变性剂,能迅速溶解蛋白质,导致细胞结构破碎,核蛋白由于其二级结构得破坏消失而迅速与核酸分离。
胍盐就是破坏蛋白质三维结构得离液剂,在通常使用得蛋白质变性剂中作用最强得就是异硫氰酸胍,它们可以使多数蛋白质转换成一随机得卷曲状态。
含有强力得阴离子与阳离子基团,它们可以形成较强得氢键。
在还原剂存在得情况下,异硫氰酸胍可以断裂氢键,而去垢剂,如SDS存在得情况下,可以破坏疏水作用。
盐酸胍、尿素盐酸胍就是一个核酸酶得强抑制剂,它并不就是一种足够强得变性剂,可以允许完整得RNA从富含RNase得组织中提取出来。
4-8M可断裂氢键,有两种可能机制:1变性蛋白与盐酸胍、尿素优先结合,形成变性蛋白-变性剂复合物,当复合物被除去,从而引起N-D反应平衡向右移动,随着变性剂浓度增加,天然状态得蛋白不断转变为复合物,最终导致蛋白质完全变性;2盐酸胍、尿素对氨基酸得增溶作用,能形成氢键,当浓度高时,能破坏水得氢键结构,结果盐酸胍、尿素就称为非极性残基得较好溶剂,使蛋白质内部得疏水残基伸展与溶解性加强,盐酸胍、尿素引起得变性往往就是不可逆得。
高浓度尿素使蛋白质变性并抑制Rnase活性十二烷基肌氨酸钠使蛋白质解体变性巯基试剂1防止蛋白质或酶等(如辅酶A)分子中SH基团氧化成二硫键,2在某些酶反应过程中维持体系得还原环境。
DTT,DDTE、巯基乙醇应用最广,谷胱甘肽也常应用,由于她就是生物体内得还原剂,同时氧化后能被谷胱甘肽还原酶原位释放。
DNA提取中,常使用巯基乙醇,维持缓冲液得还原环境,防止多酚类氧化,由于具有一定得毒性,浓度不应高于2%。
巯基乙醇β-巯基乙醇得主要作用就是破坏RNase蛋白质中得二硫键(肽与蛋白质分子中得半胱氨酸残基中得键)。
1 还原蛋白质二硫键,使Rna酶变性2 抑制酚类氧化,若氧化,核酸会变成灰黑色,苯酚得氧化产物苯醌等氧化物引起磷酸二酯键得断裂及导致RNA与DNA得交联3 保护蛋白质得巯基蛋白质提取中需要巯基乙醇还原二硫键,使RNA酶失活化学变性剂SDS、尿素、盐酸胍能破坏疏水键、盐键、氢键、范德华力使蛋白质变性但不影响肽键与二硫键,不能使蛋白质彻底变性加上还原剂巯基乙醇或DTT,能还原二硫键,使RNA彻底变性DTT二硫苏糖醇刺激性气味要小很多,毒性也比巯基乙醇低很多。
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异硫氰酸胍强用力的蛋白质变性剂,能迅速溶解蛋白质,导致细胞结构破碎,核蛋白由于其二级结构的破坏消失而迅速与核酸分离。
胍盐是破坏蛋白质三维结构的离液剂,在通常使用的蛋白质变性剂中作用最强的是异硫氰酸胍,它们可以使多数蛋白质转换成一随机的卷曲状态。
含有强力的阴离子和阳离子基团,它们可以形成较强的氢键。
在还原剂存在的情况下,异硫氰酸胍可以断裂氢键,而去垢剂,如SDS存在的情况下,可以破坏疏水作用。
盐酸胍、尿素盐酸胍是一个核酸酶的强抑制剂,它并不是一种足够强的变性剂,可以允许完整的RNA 从富含RNase的组织中提取出来。
4-8M可断裂氢键,有两种可能机制:1变性蛋白和盐酸胍、尿素优先结合,形成变性蛋白-变性剂复合物,当复合物被除去,从而引起N-D反应平衡向右移动,随着变性剂浓度增加,天然状态的蛋白不断转变为复合物,最终导致蛋白质完全变性;2盐酸胍、尿素对氨基酸的增溶作用,能形成氢键,当浓度高时,能破坏水的氢键结构,结果盐酸胍、尿素就称为非极性残基的较好溶剂,使蛋白质内部的疏水残基伸展和溶解性加强,盐酸胍、尿素引起的变性往往是不可逆的。
高浓度尿素使蛋白质变性并抑制Rnase活性十二烷基肌氨酸钠使蛋白质解体变性巯基试剂1防止蛋白质或酶等(如辅酶A)分子中SH基团氧化成二硫键,2在某些酶反应过程中维持体系的还原环境。
DTT,DDTE、巯基乙醇应用最广,谷胱甘肽也常应用,由于他是生物体内的还原剂,同时氧化后能被谷胱甘肽还原酶原位释放。
DNA提取中,常使用巯基乙醇,维持缓冲液的还原环境,防止多酚类氧化,由于具有一定的毒性,浓度不应高于2%。
巯基乙醇β-巯基乙醇的主要作用是破坏RNase蛋白质中的二硫键(肽和蛋白质分子中的半胱氨酸残基中的键)。
1 还原蛋白质二硫键,使Rna酶变性2 抑制酚类氧化,若氧化,核酸会变成灰黑色,苯酚的氧化产物苯醌等氧化物引起磷酸二酯键的断裂及导致RNA和DNA的交联3 保护蛋白质的巯基蛋白质提取中需要巯基乙醇还原二硫键,使RNA酶失活化学变性剂SDS、尿素、盐酸胍能破坏疏水键、盐键、氢键、范德华力使蛋白质变性但不影响肽键和二硫键,不能使蛋白质彻底变性加上还原剂巯基乙醇或DTT,能还原二硫键,使RNA彻底变性DTT二硫苏糖醇刺激性气味要小很多,毒性也比巯基乙醇低很多。
而且DTT比巯基乙醇的浓度低7倍时,两者效果相近,但DTT价格略高一些。
由于容易被空气氧化,因此DTT的稳定性较差;但冷冻保存或在惰性气体中处理能够延长它的使用寿命。
由于质子化的硫的亲核性较低,随着pH值的降低,DTT的有效还原性也随之降低;DTT或含有DTT的溶液不能进行高压处理。
抑制Rnase活性TCEP 三(2-甲酰乙基)膦盐酸盐半胱氨酸Trizol苯酚、异硫氰酸胍、8-羟基喹啉、β-巯基乙醇等。
TRIzol的主要成分是苯酚。
苯酚的主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质解聚得到释放。
苯酚虽可有效地变性蛋白质,但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中还加入了8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase(RNA酶)。
0.1%的8-羟基喹啉可以抑制RNase,与氯仿联合使用可增强抑制作用。
异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质并使蛋白质二级结构消失,导致细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离。
β-巯基乙醇的主要作用是破坏RNase蛋白质中的二硫键。
液氮组织破碎,裂解细胞SDS十二烷基硫酸钠阴离子去垢剂,高温(55-65℃)裂解细胞,使染色体离析,蛋白变性,形成SDS/蛋白质/多糖复合物,释放核酸,提高盐(KAc或NaAc)浓度并降低温度(冰浴),使SDS/蛋白质/复合物转变为溶解度更小的钾盐酸形式,使蛋白质及多糖杂质沉淀更加完全、离心后除去沉淀,上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,乙醇沉淀水相中的DNA操作简单,温和,可提取到高分子量的DNA,但产物多糖类杂质较多阳离子强表面活性剂,通常与蛋白酶K和抗氧化剂、螯合剂一起使用可破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离溶解膜类蛋白SDS 能裂解细胞。
使细胞中的蛋白质和核酸之间常借着静电引力或配位键结合,阴离子去污剂能够破坏这种价键,使染色体离析,蛋白变性,释放核酸。
(1)SDS是一种阴离子表面活性剂,能使蛋白质的氢键和疏水键打开,并结合到蛋白质的疏水部位;(2)SDS可引起蛋白质构象改变(3)SDS是一种良好的解离剂,可使蛋白质溶解,变性(4)形成SDS-蛋白质复合物,并使复合物带负电质粒方面:在1%的SDS溶液中慢慢加入5 N的NaCl,你会发现SDS在高盐浓度下是会产生沉淀的。
因此高浓度的盐导致了SDS的沉淀。
但如果你加入的不是NaCl而是KCl,你会发现沉淀的量要多的多。
这其实是十二烷基硫酸钠(sodium dodecylsulfate)遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾(potassium dodecylsulfate, PDS),而PDS是水不溶的,因此发生了沉淀。
如此看来,溶液III加入后的沉淀实际上是钾离子置换了SDS中的纳离子形成了不溶性的PDS,而高浓度的盐,使得沉淀更完全。
大家知道SDS专门喜欢和蛋白质结合,平均两个氨基酸上结合一个SDS分子,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质沉淀了,让人高兴的是大肠杆菌的基因组DNA也一起被共沉淀了。
基因组DNA一旦发生断裂,只要是50-100 kb大小的片断,就没有办法再被PDS共沉淀了CTABCTAB:十六烷基三甲基溴乙胺,低温时易沉淀阳离子去污剂一种在高盐下能和核酸结合形成可溶、稳定的复合物,低盐浓度下可沉淀的表面活性剂是一种阳离子去污剂, 低离子强度(0.1-0.5M NaCl),沉淀核酸与酸性多聚糖,而蛋白质和中性多聚糖仍留在溶液中。
在高离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸。
通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。
CTAB可从大量产生黏多糖的植物及某些革兰氏阴性菌制备纯化的DNA,这种去污剂加入调节至高离子强度的细菌和细胞裂解液中(>0.7M NaCl),经过连续的酚/氯仿抽提,去除CTAB/黏多糖/ 蛋白质复合体,异丙醇/无水乙醇沉淀上清即可将DNA分离出来CTAB还有提高DNA互补链复性速率及稳定已形成的DNA双螺旋的作用CTAB法的主要特点是用用较广CTAB溶液在低于15度会形成沉淀析出,因此在将其加入冰冷的植物材料时,必须预热,且离心温度不低于15度EDTA酶抑制剂,螯合二价金属,抑制金属依赖性的酶螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制细胞中DNase的活性,该酶可降解DNAEDTA是去垢剂,结合离子用,而它结合的部分离子是能够诱发或者促进RNA酶活性的,比如Ca2+。
EDTA是一种二价离子熬合剂,能熬合Mg2+和Ca2+等二价阳离子,而多种RNA 酶的活性是需要依赖二价阳离子的,所以EDTA能通过熬合二价阳离子来抑制RNA酶的活性碱性条件下才能够溶解,要和NaOH粉末混合后,再加水,然后用NaOH水溶液调节pH。
0.01M,DNase酶基本失活。
BSA酶抑制剂,使一些降解酶的活性的表面变性精胺或其他多胺酶抑制剂,降低核酸酶的影响氰化物酶抑制剂,降低重金属氧化酶的影响PVP减少酚类、醌类、单宁类物质的影响,抗氧化作用,络合多酚和萜类物质,防止多酚类褐变而氧化,去除多糖和色素,色素是PCR强抑制剂,必须去除样品液氮研磨及提取缓冲液中加入PVP或PVPP等能络合多酚和萜类物质,离心或氯仿抽提出去,有效防止多酚氧化成醌类,避免溶液变褐色而具有抗氧化能力提取液中加入适量的PVP或PVPP能提高DNA的纯度,用量根据杂质而定(1-6%),PVP 同时能去除多糖,因此将PVP和巯基乙醇配合使用并调整用量,能有效防止多酚污染PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。
Triton-x100Triton X100之类的去垢剂有苯环结构,所以在280nm有很强的吸收。
蛋白酶K蛋白酶K:切割活性较广的丝氨酸蛋白酶,切割脂族和芳香族氨基酸的羧基端肽键,将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分离出来。
蛋白酶K 在较广的pH范围内均有活性(pH 4-12.5)温度范围37-60度盐浓度3M GuHCl 或4M尿素中均有活性在一些去污剂:Tween20(5%)、Triton X-100 (1%)和SDS(1%)条件下也有活性。
蛋白酶K消化裂解法适用于所有标本的消化处理,尤以DNA样品为佳.如组织细胞(包括石蜡包埋组织)绒毛、毛发、精斑、血液(血清、血浆、全血)局部分泌物、尿,粪便等.蛋白酶K的一般工作浓度是50—100μg/ml蛋白酶(蛋白酶K 或链酶蛋白酶) 可以降解蛋白质,灭活核酸酶(DNase 和RNase) ,DNase 和RNase 也用于去除不需要的核酸,有人使用蛋白酶替代DEPC处理水的,但有些人说效果不好。
蛋白酶K,威力巨大的广谱蛋白酶,95C 加热10 分钟,则完全失活。
数年前首次使用它替代DEPC 处理RNA 抽提用的离心管和枪头,效果不错;后来又用于处理RNase-Free的水,效果也是一级棒。
从此就再也不用DEPC 了。
配制RNA 裂解试剂时,直接用灭菌的双蒸水配制,最后,加入蛋白酶K 至终浓度1ug/ml。
轻轻混匀,室温放置15 分钟后即可。
枪头及离心管去除RNase:先将枪头及离心管清洗干净后,移入预先混好的含1ug/ml 蛋白酶K 的双蒸水,彻底浸入。
室温放置30 分钟后,连水一起高压灭菌。
弃水后,烘干即可。
RNase-Free 水的获得:直接在灭菌的双蒸馏水中加入蛋白酶K 至终浓度1ug/ml。
轻轻混匀,室温放置15 分钟后,灭菌处理即可。
该蛋白质的残留对后续实验没有可见的影响。
无蛋白质残留的RNase-Free 水的获得:这比较麻烦。
直接在灭菌的双蒸馏水中加入蛋白酶K 至终浓度1ug/ml。
轻轻混匀后,倒入专用的蒸馏器中。
放置15 分钟后,加热蒸馏,流出的就是无蛋白质残留的RNase-Free 水。
要提醒的是,该专用蒸馏器头几次流出来的水,只能当普通蒸馏水用,因为通道中难确保RNase-Free 的环境;另外,一定要主要密闭性,否则,流出的水又被污染了。
DNA裂解液的作用是破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离,抑制细胞中Dnase 的活性,而蛋白酶k的作用是将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分离出来!溶菌酶溶壁酶DnaseRnase多糖水解酶:水解多糖饱和酚酚是一种有机溶剂,预先要用STE 缓冲液饱和,因未饱和的酚会吸收水相而带走一部分核酸。