基因克隆载体的特点、分类和表达
克隆载体与表达载体

克隆载体:大多是高拷贝的载体,一般是原核细菌,将需要克隆的基因与克隆载体的质粒相连接,再导入原核细菌内,质粒会在原核细菌内大量复制,形成大量的基因克隆,被克隆的基因不一定会表达,但一定被大量复制。
克隆载体只是为了保存基因片段,这样细胞内不会有很多表达的蛋白质而影响别的工作。
克隆载体(Cloning vector ):携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。
(这是为携带”感兴趣的外源DNA实现外源DNA勺无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。
)其中,为使插入的外源 DNA序列可转录、进而翻译成多肽链而设计的克隆载体又称表达载体。
是否含有表达系统元件,即启动子 -- 核糖体结合位点 -- 克隆位点 -- 转录终止信号,这是用来区别克隆载体和表达载体的标志。
表达载体:有的是高拷贝的,有的是低拷贝的,各有各的用处,是一些用于工程生产的细菌,被导入的目标基因会在此类细菌中得到表达,生产出我们需要的产物,导入的基因是由克隆载体产出的。
表达载体具有较高的蛋白质表达效率,一般因为具有强的启动子。
表达载体( Expression vectors )就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等),是目的基因能够表达的载体。
如表达载体 pKK223-3 是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。
其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨苄青霉素抗性基因。
在表达元件中,有一个杂合tac强启动子和终止子,在启动子下游有RBS位点(如果利用这个位点,要求与ATG之间间隔5-13bp),其后的多克隆位点可装载要表达的目标基因。
(RBS位点:1974年Shine和Dalgarno首先发现,原核生物,在 mRNAk有核糖体的结合位点,它们是起始密码子AUG和一段位于AUG上游3〜10 bp处的由3 —9bp组成的序列。
这段序列富含嘌吟核苷酸,刚好与16S rRNA 3,末端的富含嘧啶的序列互补,是核糖体 RNA的识另U与结合位点。
克隆载体与表达载体

染色体具有复制功能,利用染色体的复制元件来驱动外源DNA片段复制的载体称为人工染色体载体
其装载外源DNA的容量比质粒、噬菌体和噬菌体-质粒杂合载体等有很大的拓展,甚至可以跟染色体的大小相媲美。
人工染色体载体拷贝数少,制备困难,通常采取“穿梭载体”的策略来解决
含有质粒载体所必备的第一受体(大肠杆菌)质粒复制起始位点,这样的载体在大肠杆菌内可以按质粒复制形式进行高拷贝复制,含有第二受体(如酵母)端粒(TEL)、DNA复制起始位点(ARS)和着丝粒(CEN)以及合适的选择标记。载体在体外与目的DNA重组后转化到第二受体细胞,按照染色体复制的形式进行复制和传递。筛选第一受体的克隆子一般采用抗生素抗性选择标记;筛选第二受体的克隆子常用与受体互补的营养缺陷型。
克隆载体
基本性质
基本特征(或载体的构建)
原理机制
常用的载体
克隆载体
质粒载体
质粒能利用寄主细胞的DNA复制系统进行自主复制;不相容性;可转移性(基因工程中采用非接合性质粒)
(1)具有合适的复制起始位点(ORI)(2)具有合适的选择性标记基因(3)若干限制性内切酶的单一位点(4)具有较小的分子量和较高的拷贝数。
M13噬菌体产生单双链DNA的机制)
LacZ’ 5’端的第13个核苷酸G突变成A,产生了一个EcoR I切点
一类人工构建的含有λ-DNA cos序列和质粒复制子的的特殊类型载体。能像l-DNA那样进行体外包装,并高效转染受体细胞;能像质粒那样在受体细胞中自主复制具有较高容量的克隆能力:45kb;具有与同源性序列的质粒进行重组的能力
当带有抗菌素抗性基因的载体进入受体菌后,受体菌才能生长。不带有抗菌素抗性基因的受体菌不能在含有抗菌素的培养基(选择培养基)中生长。(抗菌素选择原理)
第三章 克隆载体的特征及类型

质粒
质粒DNA的分离纯化
氯化铯密度梯度离心法: 用含有EDTA的缓冲液悬浮菌体 加溶菌酶裂解细菌细胞壁 加CsCl和溴乙锭 超速离心过夜 在紫外灯下吸取cccDNA 稀释沉淀cccDNA RNAs ocDNA L-DNA proteins
质粒
重要的大肠杆菌质粒载体
pGEM-3Z: 多拷贝 装有多克隆位点(MCS) 正选择颜色标记 lacZ’ 装有两个噬菌体的强启动子 用于外源基因的高效表达
ori Apr
pGEM-3E 2743 bp lacZ’
PT7
MCS
PSP6
注意:T7和SP6启动子特异性地由噬菌体DNA编码的RNA聚合 酶所识别,因此相应的受体菌必须表达噬菌体RNA聚合酶,如: E.coli BL21(DE3)等
质粒
质粒的基本特征
质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制 – 质粒DNA复制启动控制 控制复制引物与模板的结合
RNA II
3’ 5’
复制方向
5’ 3’
ori
RNA I
rop
(+) Rop
E.coli ColE1 plasmid
RNAII是复制的正向调节分子,RNAI是复制的负调节物
质粒
质粒的基本特征
在重组的 pGEM3Z载体中 加入相应的RNA 聚合酶,可以 发生外源基因 转录。
质粒
质粒DNA的分离纯化
实验室一般使用下列三种方法制备质粒DNA: 氯化铯密度梯度离心法
质粒DNA纯度高、周期长、设备要求高、溴乙锭污染
沸水浴法
质粒DNA纯度底、快速、操作简便
碱溶法 质粒DNA纯度、操作周期介于氯化铯法和碱溶法之间
拷贝数控制系统的干扰,致使两种质粒的最终拷贝数不同,
(整理)克隆载体与表达载体

一部分:概念解析二部分:问题解答克隆载体:大多是高拷贝的载体,一般是原核细菌,将需要克隆的基因与克隆载体的质粒相连接,再导入原核细菌内,质粒会在原核细菌内大量复制,形成大量的基因克隆,被克隆的基因不一定会表达,但一定被大量复制。
克隆载体只是为了保存基因片段,这样细胞内不会有很多表达的蛋白质而影响别的工作。
克隆载体(Cloning vector ):携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。
(这是为“携带”感兴趣的外源DNA、实现外源DNA的无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。
) 其中,为使插入的外源DNA序列可转录、进而翻译成多肽链而设计的克隆载体又称表达载体。
是否含有表达系统元件,即启动子--核糖体结合位点--克隆位点--转录终止信号,这是用来区别克隆载体和表达载体的标志。
表达载体:有的是高拷贝的,有的是低拷贝的,各有各的用处,是一些用于工程生产的细菌,被导入的目标基因会在此类细菌中得到表达,生产出我们需要的产物,导入的基因是由克隆载体产出的。
表达载体具有较高的蛋白质表达效率,一般因为具有强的启动子。
表达载体(Expression vectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等),是目的基因能够表达的载体。
如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。
其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨苄青霉素抗性基因。
在表达元件中,有一个杂合tac强启动子和终止子,在启动子下游有RBS位点(如果利用这个位点,要求与ATG之间间隔5-13bp),其后的多克隆位点可装载要表达的目标基因。
(RBS位点:1974年Shine和Dalgarno首先发现,原核生物,在mRNA上有核糖体的结合位点,它们是起始密码子AUG和一段位于AUG上游3~10 bp处的由3—9bp组成的序列。
这段序列富含嘌呤核苷酸,刚好与16S rRNA 3,末端的富含嘧啶的序列互补,是核糖体RNA的识别与结合位点。
克隆载体与表达载体

克隆载体与表达载体
1. T载体是克隆载体,你的基因通过TA克隆法插入载体,这一步的目的是扩增基因,得到大量你要的目的基因片段,以便进行下一步表达载体的构建;DH5α是克隆菌株,不能用来做表达;
2. 欲在大肠杆菌中表达外源基因,需要首先构建原核表达载体,如可将构建至T 载体的目的通过双酶切切下来然后连接到表达载体上,如PET系列的载体等,构建成原核表达载体后,可将此载体转化表达菌株,如BL21(DE3,)等,如果你的目的基因含有稀有密码子,也可以转化Rosetta系列的表达菌株。
最后将构建成功的基因工程菌进行诱导表达。
1、T载体常用于克隆,一般来讲都会再把目的基因亚克隆到表达载体上。
但是并非T载体不能用来表达。
常见的pMD18-T,含有lacZ操纵子,可以IPTG诱导表达。
pGEM-T则含有T7和SP6启动子。
2、为了能够顺利地使用T7系统来表达蛋白,在如BL21(DE3)一类的大肠杆菌菌株中,编码T7RNA聚合酶的基因被整合到其染色体上,并位于lacUV5启动子的下游,受乳糖操纵子调控。
而目标蛋白的编码序列则被构建到含T7启动子序列的质粒上,并受T7RNA聚合酶调控转录。
3、构建质粒、基因表达看似比较成熟,也比较简单。
其实这里面大有学问。
学会看菌株和质粒的相关文档,答案就在其中。
克隆载体与表达载体

克隆载体:大多是高拷贝的载体,一般是原核细菌,将需要克隆的基因与克隆载体的质粒相连接,再导入原核细菌内,质粒会在原核细菌内大量复制,形成大量的基因克隆,被克隆的基因不一定会表达,但一定被大量复制。
克隆载体只是为了保存基因片段,这样细胞内不会有很多表达的蛋白质而影响别的工作。
克隆载体(Cloning vector ):携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。
(这是为“携带”感兴趣的外源DNA、实现外源DNA的无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA 分子。
)其中,为使插入的外源DNA序列可转录、进而翻译成多肽链而设计的克隆载体又称表达载体。
是否含有表达系统元件,即启动子--核糖体结合位点--克隆位点--转录终止信号,这是用来区别克隆载体和表达载体的标志。
表达载体:有的是高拷贝的,有的是低拷贝的,各有各的用处,是一些用于工程生产的细菌,被导入的目标基因会在此类细菌中得到表达,生产出我们需要的产物,导入的基因是由克隆载体产出的。
表达载体具有较高的蛋白质表达效率,一般因为具有强的启动子。
表达载体(Expression vectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等),是目的基因能够表达的载体。
如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。
其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨苄青霉素抗性基因。
在表达元件中,有一个杂合tac强启动子和终止子,在启动子下游有RBS位点(如果利用这个位点,要求与ATG之间间隔5-13bp),其后的多克隆位点可装载要表达的目标基因。
(RBS位点:1974年Shine和Dalgarno首先发现,原核生物,在mRNA上有核糖体的结合位点,它们是起始密码子AUG和一段位于AUG上游3~10 bp处的由3—9bp组成的序列。
这段序列富含嘌呤核苷酸,刚好与16S rRNA 3,末端的富含嘧啶的序列互补,是核糖体RNA的识别与结合位点。
克隆载体与表达载体教程文件

克隆载体:大多是高拷贝的载体,一般是原核细菌,将需要克隆的基因与克隆载体的质粒相连接,再导入原核细菌内,质粒会在原核细菌内大量复制,形成大量的基因克隆,被克隆的基因不一定会表达,但一定被大量复制。
克隆载体只是为了保存基因片段,这样细胞内不会有很多表达的蛋白质而影响别的工作。
克隆载体(Cloning vector ):携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。
(这是为“携带”感兴趣的外源DNA、实现外源DNA的无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA 分子。
)其中,为使插入的外源DNA序列可转录、进而翻译成多肽链而设计的克隆载体又称表达载体。
是否含有表达系统元件,即启动子--核糖体结合位点--克隆位点--转录终止信号,这是用来区别克隆载体和表达载体的标志。
表达载体:有的是高拷贝的,有的是低拷贝的,各有各的用处,是一些用于工程生产的细菌,被导入的目标基因会在此类细菌中得到表达,生产出我们需要的产物,导入的基因是由克隆载体产出的。
表达载体具有较高的蛋白质表达效率,一般因为具有强的启动子。
表达载体(Expression vectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等),是目的基因能够表达的载体。
如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。
其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨苄青霉素抗性基因。
在表达元件中,有一个杂合tac强启动子和终止子,在启动子下游有RBS位点(如果利用这个位点,要求与ATG之间间隔5-13bp),其后的多克隆位点可装载要表达的目标基因。
(RBS位点:1974年Shine和Dalgarno首先发现,原核生物,在mRNA上有核糖体的结合位点,它们是起始密码子AUG和一段位于AUG上游3~10 bp处的由3—9bp组成的序列。
这段序列富含嘌呤核苷酸,刚好与16S rRNA 3,末端的富含嘧啶的序列互补,是核糖体RNA的识别与结合位点。
简述基因克隆载体的主要类型

简述基因克隆载体的主要类型
基因克隆载体是指一类可以携带外源DNA片段并能够被复制的DNA分子。
常用于基因工程中,将特定基因序列克隆到载体DNA上,进而进行转化和表达。
根据不同的功能和应用,基因克隆载体可以分为多种类型,以下是主要的几种:
1. 质粒(Plasmid):质粒是最常用的基因克隆载体之一,通常起源于细菌,具有自主复制的能力,易于操作和扩增。
质粒通常被用于基因表达、基因敲除和基因突变等领域。
2. 病毒载体(Viral Vector):病毒载体是一类通过改造病毒而成的基因克隆载体,具有高度的转染效率和生物安全性。
病毒载体通常被用于基因治疗、免疫治疗和癌症治疗等领域。
3. 人工染色体(Artificial Chromosome):人工染色体是一种可以模拟天然染色体结构和功能的基因克隆载体,通常具有高度的稳定性和扩增性能。
人工染色体通常被用于基因组学研究和治疗复杂遗传病等领域。
4. 原核表达载体(Prokaryotic Expression Vector):原核表达载体是一类专门用于大肠杆菌等原核生物中进行基因表达的基因克隆载体。
原核表达载体通常具有高度的表达效率和易于操作的特点,被广泛应用于蛋白质制备和生物技术研究等领域。
第三章 基因克隆载体

基因克隆载体(gene cloning vector): 能承 载外源基因,将其带 入受体细胞得以稳定 维持的DNA 分子。
克隆载体的功能
运送外源基因高效转入受体细胞。 为外源基因提供复制能力或整合能力。 为外源基因的扩增或表达提供必要的条件。
克隆载体具备的条件:
载体越小越好。 >10kb的DNA在纯化过程中容易断裂。
② 双抗菌素抗性选择标记
插入失活,分两次先后选择:
没有获得载体的寄主细胞 在Amp或Tet中都死亡。
获得载体的寄主细胞 在Amp或Tet其中之一中死亡。
插入失活筛选法
pBR322质粒载体的筛选
③ 高拷贝数
氯霉素扩增之后,每个细胞可达 1000~3000copy
OC
SC
L
1.1.2 质粒的分类
1)根据质粒自身传递的性质分为: 接合型质粒 能自我转移
非接合型质粒 不能自我转移
接合型质粒
又叫自我转移型质粒。
除了带有自我复制所必需的遗传信息外还带有
一套控制细菌配对和质粒接合转移的基因。 如:F质粒(性质粒、或F因子): 能使寄主染色体上的基因随其一道转移到原先 不存在该质粒的受体菌中。
简称phage 。
蛋白质外壳内包裹着 DNA(双链、单链、 线性、环状等)。
2 噬菌体载体
2.1 噬菌体的一般特性 2.2 λ噬菌体载体的构建 2.3 λ噬菌体载体的类型
2.1 噬菌体的一般特性
类型:
大多数呈带尾部的20面型,相当一部分为线
状体型。
核酸:
核酸多数为DNA,少量为RNA,如烟草花
基因克隆的载体

插入失活型质粒载体
将外源DNA片断插入在质粒上会导致选择记号基因 失活的位点,就有可能通过抗菌素抗性的筛选,大幅度 的提高获得阳性克隆的机会。
Example:
在pBR329质粒载体的EcoR1位点插入外源片断,会 使氯霉素抗性基因失活,在筛选的氯霉素敏感的转化子 细胞群体中,含有插入片断的重组体质粒的几率会显著 上升。
4、有适合的标记,易于选择。
5、有时还要求载体要能启动外源基因进行转录及表达, 并且尽可能是高效的表达。 6、从安全角度考虑,要求载体不能随便转移,仅限于在 某些实验室内特殊菌种内才可复制等等。
载体
功能 克隆载体: 克隆一个基因或DNA片断 表达载体: 用于一个基因的蛋白表达 整合载体: 把一个基因插入到染色体组中
正选择的质粒载体
正向选择:应用只有突变体或重组体才能正常生 长的培养条件进行选择。 这种质粒载体具有直接选择记号并可 赋予寄主细 胞相应的表型。
正向选择质粒载体的条件限制: 1、需要特殊的寄主菌株或选择培养基 2、可使用的克隆位点少 3、 假阳性水平高 4、 不能够调节插入序列表达活性
表达型的质粒载体
微量碱变性法分离程序:
1、取1.5毫升含质粒的大肠杆菌过夜培养物,加在微量离心管 中,离心收集细胞沉淀; 2、加入100微升冰冷的溶液I(50mM葡萄糖, 25mM TrisHCl PH=8.0, 10mM EDTA,4~5mg溶菌酶)静置5分钟; 3、加入200微升微冷的溶液II(0.2NaOH,1.0%SDS)缓缓 混匀置室温5分钟。 65度水浴一段时间会加强染色体DNA的变性作用。 4、加入150毫升冰冷的PH=4.8的3M醋酸钠(溶液III),振荡后, 冰浴5分钟。 5、离心的上清液用苯酚抽提数次,用乙醇沉淀收集质粒DNA。
基因载体名词解释

基因载体名词解释基因载体是指一种能够携带外源基因并在细胞内进行复制和表达的分子。
在基因工程和生物技术领域,基因载体扮演着重要的角色,它们被广泛用于转基因、基因克隆、基因治疗、基因表达等领域。
本文将对基因载体的相关概念、分类、特点以及应用进行详细解释。
一、基因载体的概念基因载体是指一种能够携带外源基因并在细胞内进行复制和表达的分子。
它可以被用于将外源基因导入宿主细胞中,从而实现基因的表达和功能研究。
基因载体的种类繁多,包括质粒、病毒、人工染色体等,它们具有不同的特点和应用。
二、基因载体的分类基因载体可以根据不同的分类标准进行分类,常见的分类方式包括以下几种:1. 根据来源分类基因载体可以根据来源分为自然基因载体和人工基因载体。
自然基因载体是指在自然界中存在的基因载体,如细菌质粒、病毒等;人工基因载体是人工合成的基因载体,如人工合成的质粒、合成的病毒等。
2. 根据结构分类基因载体可以根据结构分类为环状质粒、线性质粒、病毒、人工染色体等。
其中,环状质粒是最常见的基因载体,它具有环状的DNA 结构,能够在宿主细胞中进行复制和表达。
3. 根据大小分类基因载体可以根据大小分类为小型基因载体和大型基因载体。
小型基因载体通常指大小在1-10 kb之间的基因载体,如质粒、噬菌体等;大型基因载体通常指大小在10 kb以上的基因载体,如人工染色体等。
三、基因载体的特点基因载体具有以下几个特点:1. 能够携带外源基因:基因载体可以携带外源基因,将其导入宿主细胞中,从而实现基因的表达和功能研究。
2. 能够在宿主细胞内进行复制和表达:基因载体能够在宿主细胞内进行复制和表达,从而实现基因的稳定遗传和表达。
3. 具有选择性标记:基因载体通常具有选择性标记,如抗生素抗性基因等,能够区分转化和未转化的细胞,从而筛选出携带外源基因的细胞。
4. 具有多个限制酶切位点:基因载体通常具有多个限制酶切位点,能够方便地进行基因克隆和基因操作。
克隆载体与表达载体

克隆载体
基因间隔区(intergenic region, IG 区)基因II与基因IV之间存在一段507bp的基因间隔区,内含有复制起始位点,是实施改造、构建人工载体的重点区域。
② IG区内只有一个Bsu I 切点。
(2)加入酶切位点,在IG区内加入单一内切酶位点。
M13mp1 在IG区内插入一个大肠杆菌的LacZ’(-肽序列)。
使克隆的DNA片段以特定单链的形式输出受体细胞外,M13重组分子筛选简便,被M13噬菌体感染的受体细胞生长缓慢,形成混浊斑,易于辨认挑选。
而且重组分子越大,混浊斑的混浊度亦越大但M13-DNA载体的最大缺陷是装载量小,只有 kb
考斯质粒是一类人工构建的含有λ-DNA cos序列和质粒复制子的的特殊类型载体。
能像
-DNA那样进行体外包装,并高效转染受体细胞;能像质粒那样在受体细胞中自主复制具有较高容量的克隆能力:45kb;具有与同源性序列的质粒进行重组的能力粘粒(cosmid)是带有 cos 序列的质粒。
cos序列是噬菌体 DNA 中将DNA 包装到噬菌体颗粒中所需的 DNA 序列。
黏粒的组成包括质粒复制起点(colE1),抗性标记(amp r),cos 位点,因而能象质粒一样转化和增殖。
克隆的最大 DNA 片段可达 45kb 。
有的粘粒载体含有两个cos 位点,在某种程度上可提高使用效率。
质粒载体总结
λ噬菌体载体
表达载体。
克隆载体与表达载体介绍

(二)质粒载体的构建
天然质粒载体不易直接作为克隆载体,需要改造:
(1)选择合适的复制起始位点,松散型质粒复制起始位点; (2)加入合适的选择标记基因,主要有LacZ基因和抗生素抗性基因; (3)增加或减少酶切位点,组装多个单一的限制酶切位点即多克隆位点
(MCS); (4)缩短长度,通常重组DNA分子越小,转化效率越高。
(三)常用的质粒载体
1. pBR322质粒载体
2. pUC18和pUC19质粒载体
3. TA载体
二、噬菌体载体
(一) λ 噬菌体载体 1 λ 噬菌体的性质
λ噬菌体Βιβλιοθήκη 外壳蛋白 线性,全长48502bp
λDNA 5’端含12bp的黏性末端
2 λ 噬菌体的构建 构建λ 噬菌体的依据:
a.λ 噬菌体能够包装原λDNA长度的75%-105%的DNA片段 (36.4~51kb) b.有20kb的区域对λ噬菌体生长非必需。
该λ 噬菌体载体的最大装载容量为: 4.9+5.5+2.6+(51-48.5)=15.5kb
2.6kb
3 代表性λ 噬菌体
(1) 插入型载体
装载容量为:0-10.18kb
(2) 置换型噬菌体载体载体 克隆外源DNA片段范围为:9-23kb
(二) M13 噬菌体载体
1.M13噬菌体的增值
M13噬菌体是单链丝状噬菌体; 长6407bp, 507bp基因间隔区,含复制起始位点,同时可用于改造; M13 DNA在宿主细胞中以双链或单链形式存在,但释放到细胞外的 M13 噬菌体颗粒以单链形式存在。
2.M13噬菌体载体 1) 插入选择标记基因; 2) 组装合适的多克隆位点。
三、噬菌体-质粒杂合载体
2第二章基因克隆载体的种类和特性 (1)

检测性标记基因。有的基因是不能用作选择性标记基因(lacZ等)。
2、 标记基因的种类
1)抗性标记基因(可直接用于选择转化子)
主要是抗生素抗性基因: Ampr ,Tetr , Cmlr,Kanr,Strr 2)生化标记基因 其表达产物可催化某些易检测的生化反应, 如lacZ
• 除了酵母的杀伤质粒(Killer plasmid)是RNA质粒外,所
有的质粒都是DNA质粒。关于质粒DNA的大小,
文献中有多种说法: 小的仅有103KD,仅能编码2-3种蛋白质; 大的可达105KD,两者相差上百倍。 1Kb~200Kb (Sambrok et al.) 5Kb~400Kb (Lehninger) MD(megadaltons)=106D (兆道尔顿)
2、质粒的相容性和不相容性(又称为亲和性与不亲和性)
①:在同一时间内从一个细胞中发现多个不同类型的质粒 ,只有当 不同的质粒是相容的时才能存在于同一个细胞中; ②:质粒的不相容性是指在没有选择压力的情况下,两种亲缘关系密 切的不同质粒,不能够在同一寄主细胞中稳定共存的现象。不相容 的质粒一般都利用同一复制系统,拷贝多的复制更快,结果在细菌 繁殖几代之后,细菌的子细胞中绝大多数都含有占优势的质粒 。 ③:注意:只有当有确切的证据表明第二种B质粒已经进入含有A质 粒的寄主细胞,而且它的DNA不受寄主细胞限制体系的降解作用, 但这两种质粒却不能长期共存,只有在这种情况下,我们才能说A 和B是不亲和的质粒。 ④:不亲和群的概念: 彼此之间互不相容的质粒,属于同一不亲和群(incompatibility group)。彼此能够共存的质粒则属于不同的不亲和群。同一不亲和 群的质粒在亲缘关系上则比较接近。
严紧型复制控制的质粒(stringent plasmid):质粒的复制
基因工程中的基因克隆与表达

基因工程中的基因克隆与表达基因工程是一门涉及分子生物学、遗传学、生物化学等多个学科的综合性科学。
其中,基因克隆和基因表达是基因工程研究的两个重要方面。
本文将就基因克隆和基因表达的原理、方法及应用进行探讨。
一、基因克隆1.原理基因克隆是指将目标基因从其天然基因组或其他来源中分离出来,并将其插入到另一个载体(如质粒)中,使其能够在宿主细胞内复制和表达。
基因克隆的原理是基于DNA序列特异性杂交的方法,利用限制性内切酶切割目标DNA和载体DNA,然后将它们黏合在一起,形成重组DNA。
通过转形或感染,使重组DNA 进入宿主细胞内,并复制和表达。
2.方法基因克隆的方法主要有限制性酶切与黏合(RE-Mediated Ligation)、PCR(聚合酶链反应)、TA克隆和基因文库等。
限制性酶切与黏合是一种常用的基因克隆方法。
该方法利用限制性内切酶切割DNA,然后通过T4 DNA连接酶黏合在一起。
这种方法操作简单、效率高,但存在限制内切酶的局限性,无法应用于不同酶切位点的DNA。
PCR是用于复制DNA片段的重要方法,也可以用于基因克隆。
PCR方法可以在不使用限制酶的情况下,从任何源提取DNA片段,扩增需要的基因段,并使用酶切和连接技术插入到载体中。
TA克隆是指用于从PCR产物中克隆DNA的一种方法。
该方法利用了Taq聚合酶不完全特异性合成3'-末端斜伸的性质,使产生的末端序列与T自带的A进行互补配对,从而使PCR产物能够被直接连接到TA克隆载体上。
基因文库是一种重要的基因克隆技术,可以将许多目标基因同时克隆入同一载体中。
基因文库分为cDNA文库和基因组文库。
通过荧光筛选或选择性培养,可以从文库中筛选出感兴趣的基因。
3.应用基因克隆技术广泛应用于基因工程、疫苗制备、药物研发、作物改良、动物遗传改良、环境污染治理等领域。
例如,利用基因克隆技术可以创造出超级细菌、工业用酶、新型药物、高产优质作物等。
二、基因表达1.原理基因表达是指基因通过转录和翻译的过程,将DNA序列转化为蛋白质的过程。
克隆载体与表达载体

噬菌 粒载 体
M13-DNA 那样体外包 装,并高效转染受体细 胞 装载量比常规的 M13mp 系列要大很多
点、抗生素抗性选择标记和丝状体噬菌 体 DNA 间隔区(含有噬菌体 DNA 复制 起始、终止以及噬菌体颗粒形态发生所 必需的全部顺式作用元件)
个 ampr 基因作为选择记号,便于转化子的选择; 3. 拷贝数含量高 4. 存在着一个多克隆位点区,因 此多种不同类型的外源 DNA 片段,不经修饰便可 直接插入到载体分子上;5.多克隆位点区阻断了大
噬 黏粒 装,并高效转染受体细 位点,因而能象质粒一样转化和增殖。 DNA 可大于 40kb。重组的柯斯质粒可象噬菌体λ
菌 载体 胞;能像质粒那样在受 克隆的最大 DNA 片段可达 45kb 。 一样感染大肠杆菌,并在细菌细胞中复制。
体-
体细胞中自主复制具有 有的粘粒载体含有两个 cos 位点,在
质
M13 噬菌 体的 基 因组 为单链 DNA。噬菌体颗 粒的大小受其 DNA 端 点制约的,不存在包装 限制。只感染雄性大肠 杆菌
(1)基因组大小;去除非必需区,建立外 源 DNA 片段的克隆或替换位点(2)在 DNA 的非必需区插入选择标记:lacZ 基因;基因 cⅠ 失活(cI 基因:溶源 过程控制基因);Spi 筛选(野生型 λ 噬 菌 体 在 带 有 P2 原 噬 菌 体 的 溶 源 性 E.coli 中 的生长会受到限制的表型, 称作 Spi+ ,即对 P2 噬菌体的干扰敏 感) 基因间隔区(intergenic region, IG 区) 基因 II 与基因 IV 之间存在一段 507bp 的基因间隔区,内含有复制起始 位点,是实施改造、构建人工载体的重 点区域。② IG 区内只有一个 Bsu I 切 点。(2)加入酶切位点,在 IG 区内加 入单一内切酶位点。M13mp1 在 IG 区
克隆载体表达载体(课件)PPT课件

组成型表达载体是将基因整合到宿主细胞的染色体上,使基因在任何生长条件下都能稳定表达。这种 表达载体适用于需要持续稳定表达的基因。
组织特异性表达载体
总结词
在特定的组织或器官中,表达载体才能 启动基因的表达。
VS
详细描述
组织特异性表达载体是将基因与特定的组 织或器官相关的调控序列结合,使基因只 在特定的组织或器官中表达。这种表达载 体适用于需要组织特异性表达的基因。
05
克隆载体和表达载体的未来发展
克隆载体和表达载体的新技术和新方法
基因编辑技术
利用CRISPR-Cas9等基因编辑技术,实现对克隆载体和表达载体的精确修饰,提高基 因治疗的效率和安全性。
人工染色体技术
开发人工染色体技术,实现对大型基因组的克隆和表达,为遗传病研究和治疗提供新的 工具。
克隆载体和表达载体的新应用和新领域
04
克隆载体和表达载体的应用
克隆载体在基因工程中的应用
基因克隆
克隆载体可以将目的基因插入到质粒 或病毒载体中,实现基因的复制和扩 增,为基因工程提供大量目的基因。
基因保存
基因突变
通过将目的基因插入到克隆载体中, 进行定点突变或随机突变,研究基因 功能和蛋白质活性。
克隆载体可以保存和传递目的基因, 为基因工程提供长期稳定的基因来源。
01
02
03
基因治疗
利用克隆载体和表达载体, 开发新型基因治疗策略, 针对遗传性疾病、肿瘤等 进行有效治疗。
生物制药
通过克隆载体和表达载体, 实现高效、大规模的蛋白 质药物生产,推动生物制 药产业的发展。
农业育种
利用克隆载体和表达载体, 培育抗逆、抗病、高产的 农作物新品种,提高农业 生产效益。
基因工程载体的分类及其特性

基因工程载体的分类及其特性田文晓 1343001125按照来源和性质分类1、质粒载体①复制:通常情况下一个质粒含有一个与相应的顺式作用控制要素结合在一起的复制起始区。
在不同的质粒中,复制起始区的组成方式不同,有的可决定复制的方式,例如滚环复制和θ复制;在大肠杆菌中使用的大多数载体都带有一个来源于 pMB1 质粒或 ColE1 质粒的复制起始位点。
②拷贝数:质粒拷贝数分为严谨型与松驰型。
严谨型质粒每个细胞中拷贝数大约为1 ~几个;松驰型质粒拷贝数较多,可达几百。
③不相容性:两个质粒在同一宿主中不能共存的现象称质粒的不相容性,它是指在第二个质粒导入后,在不涉及DNA 限制系统时出现的现象。
不相容的质粒一般都利用同一复制系统,从而导致不能共存于同一宿主中。
两个不相容性质粒在同一个细胞中复制时,在分配到子细胞的过程中会竞争,随机挑选,微小的差异最终被放大,从而导致在子细胞中只含有其中一种质粒。
④转移性:指在自然条件下,很多质粒可以通过称为细菌接合的作用转移到新宿主内。
它需要移动基因 mob ,转移基因 tra ,顺式因子 bom 及其内部的转移缺口位点 nic。
2、噬菌体载体(包括λ噬菌体、M13噬菌体载体)1)λ噬菌体载体:大的外援插入片段在质粒中不稳定,转导是比转化效率更高的过程,避免出现无插入片段的空载体。
2)M13噬菌体载体:可以对任意克隆基因进行DNA进行诱变,测序方便,可以制备单链测序模板;含有噬菌体DNA的噬菌体颗粒从转化细胞中分泌出来后,可以在生长平板上收集。
①超感染免疫性:溶原性细菌在被噬菌体感染并溶原化后,不会被同种噬菌体再次感染。
②经过若干世代后,溶原性细菌会开始进入溶菌周期,即溶原性细菌的诱发。
此时,原噬菌体从宿主基因组上切离下来进行增殖。
3、粘粒载体(柯斯质粒)①具有λ噬菌体的特性。
柯斯质粒载体在克隆了合适长度的外源DNA,并在体外被包装成噬菌体颗粒之后,可以高效地转导对λ噬菌体敏感的大肠杆菌寄主细胞。
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C)Inc基因:决定两种亲缘关系相近的两种质粒不能存在于同 一宿主细胞中.
D)Tra基因:指令宿主细胞合成菌毛(Pilus)和细胞表面物, 促使宿主细胞与受体细胞表面结合,遗传物质的转移.
3.5 农杆菌Ti质粒载体的构建
设计原理: 保留T-DNA两侧的边界序列,插入选择 性标记,除去致瘤基因和无关基因.
共整合质粒载体: 将T-DNA区段编码致瘤基因和 冠瘿碱合成酶的基因由pBR322上的一段DNA片 段取代,当携带目的基因片段的pBR322衍生中 间载体进入农杆菌细胞后,两者相同的pBR322 序列之间发生同源交换,导致外源目的基因片 段整合到Ti质粒上.
病毒区基因及功能
Ti质粒T-DNA的边界序列
3 质粒载体的构建
3.1 质粒构建的基本要求
1)构建的质粒载体能转化受体细胞,并在其中进行 松弛型复制. * 选择松弛型质粒复制起始子(Ori)
2) 构建的质粒载体含有克隆外源DNA的位点(MCS) *构建的质粒载体含有选择标记基因(Apr,Tcr,Kmr) *构建的质粒载体分子量小,转化效率高,插入外 源片段较大.
pGEX-2T,pGEX-3X 真核(Eukaryotic)表达载体:pSVK3,pBPV 转录(Transcription)载体:pSL1190 普通载体(General vector):pBR322,pUC18
第二节 质粒克隆载体
1 质粒载体的一般特性
质粒是一种广泛存在于 细菌细胞中染色体以 外 的能自主复制的裸露的 环状双链DNA分子,比 病毒更简单。在霉菌、 蓝藻、酵母和一些动植 物细胞中也发现了质粒, 目前对细菌的质粒研究 得比较深入。
可转移性:质粒可通过接合作用等方式转移到新 的宿主细胞中.
复制性:质粒DNA分子只在宿主细胞内进行单向 复制,其复制受质粒本身和宿主细胞遗传系统的双 重控制,质粒提供复制的起始位点和核苷酸的序 列.
6)相关基因
A)COP因子:决定质粒的拷贝数,在质粒的复制过程中指令细 胞合成阻物,当质粒复制到一定的拷贝时,阻物的量也积 累到足以阻止质粒的复制.
3.2 pBR322质粒载体的构建
3.3 pUC18-19 质粒载体的构建
以pBR322为出发质粒,用含乳糖操纵子O、P和Z’ 的DNA片段取代pBR322上的Tcr基因,并在Z’区组 入一个多克隆位点.
pUC18-19的构建
3.4 蓝藻质粒载体的构建
蓝藻作为受体细胞的特点 a)原核生物,能进行光合作用,具有固氮能力. b)基因组简单,50%的蓝藻含有质粒.
• 质粒载体 大肠杆菌质粒载体,枯草杆菌质粒载体,酵母质 粒载体,农杆菌质粒载体,蓝细菌质粒载体
• 噬菌体质粒载体 双链DNA噬菌体载体:λ 单链DNA噬菌体载体:M13,T3,T7
• 病毒载体 植物病毒载体CaMV(花椰菜花斑病病) 动物病毒载体 SV40(猿猴空泡病毒)
质粒和噬菌体DNA兼有的载体 Phasmid 载体(含有f1 噬菌体的ori) Cosmid 载体(含有λDNA的Cos区)
1 λ噬菌体克隆载体
1.1λ噬菌体的一般特性 λ噬菌体的组成
结构:外壳蛋白 DNA
形态:头部 尾部
c)细胞大(10-10于E.coli)储藏蛋白多,单一蛋白可达
25%,而大肠杆菌仅为5%. d)蛋白更新慢,容受性比较大 e)蛋白酶的降解作用比较低,产物比较均一.
蓝藻质粒的特点 a)双向载体(需要两种Ori). b)合适的选择标记. c)分子大小合适. d)拷贝高.
蓝藻质粒载体pAQE17的构建
基因克隆载体的特 点、分类和表达
具备与外源DNA片段连接和重组的克隆位点.
进入受体细胞后能稳定存在于细胞质中或与染 色体整合在一起.
在宿主细胞或受体细胞中自我复制或随整合的 受体细胞染色体DNA一起复制.
外源基因能在受体细胞中表达.
克隆载体进入细胞后有可供选择标记.
2 克隆载体的分类 2.1 按构建克隆载体DNA的来源分类
染 色 体 和 质 粒 DNA 兼 有 的 载 体 ( Chrosmid vector)
基因整合平台系统 YAC克隆载体
其它克隆载体
2.2 按克隆载体的用途分类
cDNA克隆载体:λgt11,pT7T3 原核(Prokaryotic)表达载体:pKK223-3 原核基因融合(Prokaryotic gene fusion)载体:
外源片段共整合到Ti质粒上的过程
双向载体:由两 个以上的质粒构 建而成. 将Ti 质粒的Vir与广宿 主范围质粒的携 带目的基因 (MCS)、选择性标 记、转移和复制 功能整合在 一 起.双向载体可在 大肠杆菌和农杆 菌中进行 复制 并稳定存在下 去.
双向Ti质粒载体的构建
第三节 噬菌体衍生的克隆载体
E)抗性基因:抗菌素抗性基因,Apr,Tcr. F)产毒素基因:大肠杆菌素基因(Col-质粒). G)降解基因:降解重金属、有机物和农药等.
H) 致瘤基因:诱导某些组织形成肿瘤,如Ti质粒,Ri质粒.
2 几种常见的质粒载体
1)pBR322:含有双抗基因(Apr,Tcr)Col E1 复制起始子
2)pUC18-19:含有pBR322的Apr基因和复制的起始点,
质粒载体的一般特性
质粒的组成与构型 细胞内:超螺旋环状共价双链DNA分子
细胞外:超螺旋、开环,线形
双螺旋共价闭合 环(超螺旋)
开环双螺旋 (一个裂口)
线状双螺旋 (两个裂口)
质粒DNA分子的大小:细菌质粒的大小相差较大, 小的仅不足1kb,大的可达数百kb.
不相容性(Incompatible):两种类似的但又不 同的质粒不能存在于同一细胞中.
部分缺失的Lac操纵子片段,并在Lac Z’区组装了MCS.
pUC 18-19多克隆位点
3)pBluescript M13: 含有M13噬菌体DNA复制起点的载
体,该起点以互为相反方向插入到含有T3和T7噬菌体启动
子的一个来自pUC质粒的载体当中.
pBluescript M13多克隆位点
4)Ti质粒载体