CCCH型锌指蛋白研究进展
植物CCCH型锌指蛋白研究进展
植物CCCH型锌指蛋白研究进展郗冬梅;朱东方【期刊名称】《山东农业科学》【年(卷),期】2012(44)5【摘要】锌指蛋白是具有典型锌指结构特征的超蛋白家族,几乎参与了生物体生长发育的各个阶段,其中CCCH型锌指蛋白包含一个或多个由三个半胱氨酸和一个组氨酸组成的基序.本文综述了植物CCCH锌指蛋白的结构、作用方式、功能等方面的研究进展,并对其应用前景进行了展望.%Zinc finger proteins are defined as a superfamily with typical zinc finger domain and are involved in many aspects of plant growth and development. In which, the CCCH zinc finger proteins contain the motif with three cysteines and one histidine residues. In this paper, the research progress in structure, action pattern and function of plant CCCH - type zinc finger proteins were summarized, and their application prospect was also presented.【总页数】3页(P20-22)【作者】郗冬梅;朱东方【作者单位】临沂大学实验中心,山东临沂276000;临沂市林业局,山东临沂276000【正文语种】中文【中图分类】Q513【相关文献】1.水稻 CCCH 型锌指蛋白亚家族Ⅰ基因的表达分析 [J], 刘小艳;孙艳侠;王亚男;刘晓楠;刘坤;郗冬梅CH型锌指蛋白在白血病中的研究进展 [J], 陈伟娟;吴飒CH型锌指蛋白研究进展 [J], 秦智慧;杨青川;晁跃辉;康俊梅4.绵羊CCCH型锌指蛋白基因ZC3H10的mRNA表达研究 [J], 李宝钧; 刘少贞; 任有蛇; 乔利英; 刘建华; 王伟伟; 刘文忠5.二穗短柄草CCCH型锌指蛋白基因家族成员的鉴定和分析 [J], 蒋明;余沁欣;李金枝;柯世省;陈珂珺因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
玉米ZmC3H18基因的序列及表达分析
玉米ZmC3H18基因的序列及表达分析李文兰;李文才;孙琦;于彦丽;赵勐;李艳娇;孟昭东【摘要】CCCH型锌指蛋白是锌指蛋白超家族的一个亚家族,一般包含1～6个由三个半胱氨酸和一个组氨酸组成的基序,在植物的生长发育和非生物胁迫过程中均发挥重要的调控作用.本研究中,我们对CCCH型锌指蛋白基因ZmC3H18的序列及表达进行了分析.ZmC3H18蛋白包含2个CCCH结构域,系统进化树分析表明ZmC3H18与单子叶植物中同源基因的进化关系更近.ZmC3H18基因在组织器官中呈组成型表达,但是在生殖器官中的表达量高于在营养器官中的表达量.ZmC3H18基因在气生根中的表达模式显示该基因在气生根原基起始过程中表达量最高.此外,顺式作用元件分析显示ZmC3H18基因的启动子区含有响应冷、热和干旱胁迫的顺式作用元件.实时定量PCR分析显示ZmC3 H18基因的表达受非生物胁迫(冷、热、盐和干旱)调控.这些表达结果显示ZmC3H18基因在生殖生长和非生物胁迫过程中均发挥重要作用.本试验结果将为玉米ZmC3H18基因的功能研究提供重要信息.【期刊名称】《山东农业科学》【年(卷),期】2018(050)008【总页数】5页(P7-11)【关键词】玉米;ZmC3H18;CCCH结构域;表达分析【作者】李文兰;李文才;孙琦;于彦丽;赵勐;李艳娇;孟昭东【作者单位】山东省农业科学院玉米研究所/小麦玉米国家工程实验室/农业部黄淮海北部玉米生物学与遗传育种重点实验室,山东济南250100;山东省农业科学院玉米研究所/小麦玉米国家工程实验室/农业部黄淮海北部玉米生物学与遗传育种重点实验室,山东济南250100;山东省农业科学院玉米研究所/小麦玉米国家工程实验室/农业部黄淮海北部玉米生物学与遗传育种重点实验室,山东济南250100;山东省农业科学院玉米研究所/小麦玉米国家工程实验室/农业部黄淮海北部玉米生物学与遗传育种重点实验室,山东济南250100;山东省农业科学院玉米研究所/小麦玉米国家工程实验室/农业部黄淮海北部玉米生物学与遗传育种重点实验室,山东济南250100;山东省农业科学院玉米研究所/小麦玉米国家工程实验室/农业部黄淮海北部玉米生物学与遗传育种重点实验室,山东济南250100;山东省农业科学院玉米研究所/小麦玉米国家工程实验室/农业部黄淮海北部玉米生物学与遗传育种重点实验室,山东济南250100【正文语种】中文【中图分类】S513;Q78锌指蛋白超家族包含ERF、WRKY、DOF和RING-finger等多个亚家族[1-4]，CCCH型锌指蛋白是其中一个亚家族。
锌指蛋白在胃癌中作用的研究进展
（ Ｃ ３ ＨＣ ４ ） 、 Ｃ ２ ＨＣ 型 、 Ｃ ３ Ｈ 型及 Ｃ 广泛分 布 在 动植 物 和 微 生 物 中 ， 负 责 调 控 基 因 的 表达 。锌指 蛋 白的 共 同 特 征 是 通 过结 合 Ｚ ｎ 来
稳 定一种 很 短 的 可 自我 折 叠 成 “ 手 指” 的 多 肽 空 间 构 型［ ＝ ＝ １ ］ 。近年来 研 究 发 现 ， 锌 指蛋 白家 族 成 员 在 恶 性 肿瘤 发生 、 发展 和转 移 的分 子 调 控 过 程 中发 挥 了 重要 的作 用 。 胃癌 是 世 界 范 围 内最 常 见 的 恶 性 肿
瘤 之一 ， 在肿 瘤病死 率 中排第 ２位 ］ ， 目前对 于 胃癌 发 病 的分 子 机制 尚不 清 楚 。 已有 大量 研 究 证 明 ， 在
胃癌 中存 在 多种锌 指 蛋 白的 异 常表 达 ， 与 胃癌 的发 生、 侵 袭 和转 移 关 系 密 切 ， 揭 示 锌 指 蛋 白在 胃癌 发
结 合 以及与 自身 或其 他锌 指 蛋 白结 合 ， 在 转 录 和 翻
译 水平 上 调 控 基 因表 达 。作 为 真 核 生 物 中重 要 的
生 发展 中 的作 用 机 制 将 有 助 于 寻 找 胃癌 新 的治 疗
靶 点 。本 文 就 近 年 来 锌 指 蛋 白与 胃癌 相 关 性 的研 究 进展作 一综 述 。
顾 慧媛 张 国新
摘要 ： 胃癌 是世 界 范 围内最 常见的 恶 性肿 瘤之 一 ， 其 分 子 机 制 尚未 阐 明 。锌 指蛋 白是 一 类 具 有 手 指 状
结构 域 的转 录 因子 ， 对基 因调 控起 着重要 的作 用。有研 究表 明 ， 锌 指 蛋 白广泛 参 与 胃癌 的发 生发 展 过程 ， 以 类似 癌基 因或 抑癌 基 因的功 能发挥 作 用 ， 并 有望 作 为 胃癌 基 因治疗 的 新靶 点 。此 文就 锌 指 蛋 白与 胃癌 的 相
锌指蛋白结构及功能研究进展
锌指蛋白结构及功能研究进展
赵楠;赵飞;李玉花
【期刊名称】《生物技术通讯》
【年(卷),期】2009(020)001
【摘要】锌指蛋白是一类具有手指状结构域的转录因子,对基因调控起重要的作用.根据其保守结构域的不同,可将锌指蛋自主要分为C2H2型、C4型和C6型.锌指通过与靶分子DNA、RNA、DNA-RNA的序列特异性结合,以及与自身或其他锌指蛋白的结合,在转录和翻译水平上调控基因的表达.我们简要综述了近年来锌指蛋白结构、分类及其与核酸及蛋白质相互作用等方面的研究进展.
【总页数】4页(P131-134)
【作者】赵楠;赵飞;李玉花
【作者单位】东北林业大学,生命科学学院,黑龙江,哈尔滨,150040;山东农业大学,园艺科学与工程学院,山东,泰安,271018;东北林业大学,生命科学学院,黑龙江,哈尔滨,150040
【正文语种】中文
【中图分类】Q513
【相关文献】
1.锌指蛋白结构域MIZ-1型包含蛋白基因研究进展 [J], 李璐璐;孙勇虎;刘红
2.锌指蛋白结构和功能研究进展 [J], 余晓丹;沈晓明;颜崇淮
3.Zn(Ⅱ)2Cys6锌指转录因子的结构和功能研究进展 [J], 梁甜甜; 王亦婧; 程晓婕;
曾斌; 贺斌
4.Zn(Ⅱ)2Cys6锌指转录因子的结构和功能研究进展 [J], 梁甜甜; 王亦婧; 程晓婕; 曾斌; 贺斌
5.tRNA修饰酶TiaS蛋白结构与功能研究及其锌指的潜在应用 [J], 董建树
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MCPIP 1蛋白质结构、功能的研究探究进展新
MCPIP 1蛋白质结构、功能的研究进展摘要ZC3H12A是免疫系统中的一个重要基因，其编码的蛋白质ZC3H12A/MCPIP 1在免疫相关疾病，尤其是自身免疫病和炎症反应中发挥重要的抑制效应。
ZC3H12A的表达能够被多种炎症相关细胞因子所诱导。
近来的研究报道，MCPIP 1具有转录因子、RNA酶、去泛素化酶等作用，其在调控基因转录、mRNA降解、多聚泛素链的去除、细胞凋亡、细胞自噬、炎症抑制、细胞分化、血管生成等方面都有重要作用。
基因敲除小鼠患有严重的高免疫球蛋白血症、淋巴结肿大、浆细胞和记忆细胞的积聚及自身抗体的大量产生等免疫功能紊乱疾病。
本文较为系统地阐述了ZC3H12A基因的克隆、MCPIP 1蛋白的结构及功能，从时间的维度观其主要研究历程，以及对免疫系统的重要影响。
大体上浅析了MCPIP 1从其发现至今的探索情况。
【关键词】ZC3H12A Zc3h12a MCPIP 1 RNA酶凋亡去泛素化酶1 简介ZC3H12A/MCPIP是一种锌指蛋白。
它的全名是具有CCCH锌指结构域的蛋白质12A（Zinc finger CCCH domain-containing protein 12A），简称ZC3H12A[1]，又称MCP-1诱导蛋白（MCP1-induced protein，MCPIP 1）[2]。
MPCIP的编码基因是ZC3H12A，它属于ZC3H12基因家族，该家族中共有4个成员，分别编号为ZC3H12A、ZC3H12B、ZC3H12C、ZC3H12D[1]。
此家族保守性很强，在很多物种（包括果蝇、秀丽线虫、小鼠和大鼠等）中都有发现其同源序列[1]。
MCPIP 1最初被发现于经MCP-1处理的人外周血单核细胞中[2]，而后又在经IL-1β刺激的人单核细胞来源的巨噬细胞中被发现[3]。
在TNF、MCP-1、IL-1β或LPS等细胞因子的作用下，该基因的转录水平被显著激活[1, 2, 3, 4, 5, 6]。
大豆C_(2)H_(2)型锌指蛋白转录因子家族全基因组鉴定及表达分析
大豆C_(2)H_(2)型锌指蛋白转录因子家族全基因组鉴定及表达分析郭智滨;张亚坤;贺紫航;周强华;蔡占东;马启彬;年海【期刊名称】《大豆科学》【年(卷),期】2024(43)2【摘要】为进一步寻找与大豆产量相关的潜在候选基因,利用生物信息学与转录组学技术,通过拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)C_(2)H_(2)型锌指蛋白(C_(2)H_(2)zinc finger protein)序列BLAST映射,将从大豆(Glycine max)的基因组数据库中筛选出的44个C_(2)H_(2)锌指蛋白家族成员分成11个亚家族,并对其进行系统进化、保守结构域、顺式作用元件、测序数据和转录组数据等相关分析。
结果表明:C_(2)H_(2)锌指蛋白家族成员分布于17条大豆染色体中,且每个亚家族的基因结构域较为相近,呈高度保守性。
成员启动子部分含有抗逆境胁迫以及激素相关的调控元件。
RNA-seq结果显示,有8个基因在不同植物组织内表达差异显著。
荧光定量PCR分析表明,3个基因的分析结果为SUPERMAN的转录调节因子,GmC1-1iZFP42为Ln位点的相应基因,参与大豆叶形和籽粒的调控,GmC1-1iZFP12、GmC1-1iZFP30为SUPERMAN基因的转录调节因子,GmC1-1iZFP21可能参与大豆籽粒形成和发育的过程,为调控相关过程的候选基因。
本研究为进一步寻找和挖掘大豆高产基因提供方向,也为C_(2)H_(2)型锌指蛋白和生物信息学在植物中的利用提供参考和启示。
【总页数】12页(P139-150)【作者】郭智滨;张亚坤;贺紫航;周强华;蔡占东;马启彬;年海【作者单位】华南农业大学农学院/国家大豆改良中心广东分中心;岭南现代农业科学与技术广东省实验室【正文语种】中文【中图分类】R73【相关文献】1.烟草C2H2锌指蛋白转录因子家族成员的鉴定与表达分析2.甘蓝型油菜全基因组DELLA蛋白基因家族的鉴定和表达分析3.核桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族全基因组鉴定及表达分析4.普通烟草CCCH类锌指蛋白家族的全基因组鉴定和表达分析5.玉米TGA转录因子家族全基因组鉴定及盐胁迫相关表达分析因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
CCCH型锌指蛋白在白血病中的研究意义
CCCH型锌指蛋白在白血病中的研究意义【摘要】CCCH型锌指蛋白包含1到6个拷贝的CCCH类型的锌指基序，折叠成特殊的指状结构，通过与富含腺嘌呤和尿苷(AU)的mRNA3'端结合，参与调节mRNA代谢。
作为转录因子，免疫调节因子和肿瘤抑制蛋白，临床上与多种疾病密切相关。
研究证实，CCCH型锌指蛋白可通过调节血细胞的增殖、分化、凋亡参与白血病发生发展的进程。
靶向干预CCCH型锌指蛋白或基因可能是一种治疗白血病的有效方法，可为白血病的防治提供新的策略。
【关键词】CCCH型锌指蛋白；ZFP36；ZC3H12a；白血病1CCCH型锌指蛋白的特点1、1CCCH型锌指蛋白的结构与特点CCCH型锌指蛋白质包含1到6个拷贝的CCCH型的锌指基序，基序由三个半胱氨酸(C)和一个组氨酸(H)通过zn+结合形成稳定的手指结构，并且在进化中高度保[7]。
Berg等研究定义CCCH锌指基序的特征为C-4-15-C-4-6-C-3-H[8]。
CCCH锌指蛋白选择性地表达在各种动植物中，通过调节各种基因的表达和蛋白质的修饰，执行特殊的功能。
通过与富含腺嘌呤和尿苷(AU)的mRNA3'端结合，参与调节mRNA的代谢。
此外，还可以通过与DNA、蛋白质和脂质的相互作用参与基因表达的调控[3]。
目前，已发现大量结构和功能各异的CCCH型锌指蛋白广泛分布在动植物上。
基因组分析鉴定发现，在拟南芥和水稻上分别有68和67个CCCH锌指蛋白基因，玉米有68个ZmC3H(玉米半胱氨酸3组氨酸)基因，藜苜蓿有34个MtC3H基因和白杨中有91个PtC3H基因[9]。
目前，哺育动物中已发现多种CCCH型锌指蛋白，如ZFP36家族、Zc3h12a家族、Roquin-1家族、P58TFL和P36TFL蛋白、Zc3h13等。
这些锌指蛋白可通过调控信号转导，表观遗传和转录后修饰，参与机体的正常生长或多种疾病的发生[10]。
研究发现，CH型锌指蛋白与血液系统疾病[3，11]、免疫性疾病[13]和多种实体肿瘤[11]密切相关。
烟草C3HC4型锌指蛋白的原核表达及转基因植株功能研究
烟草C3HC4型锌指蛋白的原核表达及转基因植株功能研究伍文宪;杨秀芬;刘勇;邱德文【摘要】植物中C3HC4型RING锌指蛋白在泛素化、光形态建成、抗逆及生长发育等过程中均起到非常重要的作用。
首次从本生烟中扩增获得一个锌指蛋白基因的完整阅读框，编码203个氨基酸，含有C3HC4型锌指结构域，命名为NbZFP1。
将NbZFP1基因分别克隆到原核表达系统载体pGEX-6P-2以及pMAL-C2X中，成功构建了重组表达载体pGEX-6P-2-NbZFP1与pMAL-C2X-NbZFP1，经IPTG获得了大量可溶性表达的NbZFP1融合蛋白。
将NbZFP1基因克隆于植物表达载体pBI121中，通过农杆菌介导法获得转基因烟草，PCR检测及Southern blot分析表明NbZFP1基因已整合到烟草基因组中，转NbZFP1基因烟草表现出株型紧凑，节间缩短，茎干粗壮和对TMV抗性增强。
%C3HC4-type RING finger genes comprise a large family in the plant kingdom and play important roles in various physiologic processes of plant life. In this study, a zinc finger gene was isolated from Nicotiana benthamiana. Sequence analysis indicated that the gene encodes a 24 kD protein with 203 amino acids and contains one typical C3HC4 zinc finger domain and named NbZFP1. The entire coding region of NbZFP1 gene was then cloned into the bacterial expression vectors pGEX-6P-2 and pMAL-C2X. After IPTG induction, the recombinant protein was analyzed by SDS-PAGE, which showed that the expected protein was expressed at a high level in bacterial cells. NbZFP1 gene was cloned into the over-expression vector pBI121, and then transfered into Nicotiana benthamiana through Agrobacterium tumefacien-mediated transformation. According to PCR and Southern blotdetection, NbZFP1 gene was successfully integrated into Nicotiana benthamiana genome. Regeneration plants showed type compactness, internode shorten and stem sturdy, also enhanced disease resistance against tobacco mosaic virus (TMV).【期刊名称】《生物技术通报》【年(卷),期】2014(000)007【总页数】6页(P100-105)【关键词】锌指蛋白;重组表达;转基因烟草;抗病性【作者】伍文宪;杨秀芬;刘勇;邱德文【作者单位】中国农业科学院植物保护研究所，北京 100081; 四川省农业科学院植物保护研究所，成都 610066;中国农业科学院植物保护研究所，北京 100081;四川省农业科学院植物保护研究所，成都 610066;中国农业科学院植物保护研究所，北京 100081【正文语种】中文锌指蛋白是真核生物基因组中最丰富的一类转录因子，最初于1983年被发现存在于非洲爪蟾卵母细胞的转录因子TFIIIA中［1] ，锌指结构由多个半胱氨酸或（和）组氨酸组成，通过锌离子来维持结构的稳定性。
水稻CCCH型锌指蛋白亚家族Ⅰ基因的表达分析_
水稻CCCH型锌指蛋白亚家族Ⅰ基因的表达分析作者：刘小艳等来源：《山东农业科学》2015年第02期摘要：CCCH型锌指蛋白是一类生物体中广泛存在的转录因子，与植物的抗逆性密切相关。
水稻CCCH锌指蛋白家族包括67个成员，分为8个亚家族。
本研究采用实时定量PCR技术分析水稻CCCH亚家族Ⅰ基因的组织表达模式以及盐、干旱、低温、高温等多种非生物胁迫和脱落酸（ABA）对CCCH基因表达水平的调节。
结果表明，多数CCCH基因都不同程度地受到这些非生物胁迫及ABA的诱导或抑制，其中C3H10、C3H24、C3H33、C3H37和C3H67的表达量在不同胁迫处理后表现出不同程度的升高，C3H35、C3H50和C3H52在盐、干旱、ABA、低温和高温处理后表达水平呈下降趋势，表明这些CCCH锌指蛋白可能参与水稻的非生物胁迫响应。
关键词：CCCH锌指蛋白；非生物胁迫；基因表达分析中图分类号：S511.01文献标识号：A文章编号：1001-4942（2015）02-0007-05AbstractCCCH-type zinc finger proteins， a kind of widely distributed transcription factors，are closely related to plant tolerance to stress. CCCH-type zinc finger protein family in rice contains 67 members， which are devided into 8 subfamilies. The tissue-specific expression patterns of CCCH-zinc finger protein subfamily Ⅰ genes and the adjustment of ABA and abiotic stresses such as salt， drought， low and hight temperature to CCCH genes expression level were analyzed by real time PCR. The results showed that most of CCCH genes were induced or restrained by the abiotic stresses and ABA at varying degrees. The expression quantities of C3H10， C3H24， C3H33，C3H37 and C3H67 genes were up-regulated， while those of C3H35， C3H50 and C3H52 genes were declining. It indicated that CCCH subfamily Ⅰ genes might be involved in response to abiotic stress.Key wordsCCCH-type zinc finger protein； Abiotic stress； Gene expression analysis锌指蛋白是一类具有锌指结构域的转录因子1，2。
二穗短柄草CCCH型锌指蛋白基因家族成员的鉴定和分析
二穗短柄草CCCH型锌指蛋白基因家族成员的鉴定和分析的报告，600字本报告主要讨论二穗短柄草CCCH型锌指蛋白基因家族成员的鉴定和分析。
二穗短柄草是一种野生牧草，也称为双穗朱雀稗，在我国的草甸中很常见。
其植株对寒、干旱等环境适应性坚强，含有丰富的抗性基因资源，可提供大量的水稻和小麦的抗病基因。
这些抗病基因与植物的生长发育有关，促进植物生长发育的过程叫做信号传导，锌指蛋白是其中重要的调节因子，因此，鉴定和分析CCCH型锌指蛋白基因家族成员更加重要。
本报告首先使用BLAST来检索二穗短柄草中的CCCH型锌指蛋白基因家族成员，在数据库中检索出了7个基因的序列，然后利用MEGA7软件的序列比对分析进行基因多态性研究，结果显示这7个基因序列之间有一部分相似性，基因序列编号分别为AB00012-AB00020。
接下来利用GeneMarkS软件预测这7个基因序列的结构，结果表明，这7个基因序列为多重转录调控因子，其中AB00012-AB00015和AB00017-AB00020是CCCH型锌指蛋白基因家族成员。
随后，进行电泳分析，结果表明，这七个基因的基因表达存在差异。
其中，AB00020的表达水平最低，AB00014的表达水平最高。
最后，对7个CCCH型锌指蛋白基因家族成员进行分子进化分析。
结果显示，这7个基因具有相当的进化距离，而AB00012-AB00015和AB00017-AB00020则有更大的进化距离。
综上所述，本报告鉴定和分析了二穗短柄草CCCH型锌指蛋白基因家族成员，使用BLAST检索出7个基因序列，结构分析表明其中包括4对CCCH型锌指蛋白基因家族成员，电泳分析表明AB00020表达最低，AB00014表达最高，另外，进行分子进化分析，检测出AB00012-AB00015和AB00017-AB00020的更大的进化距离。
本研究为进一步研究二穗短柄草CCCH型锌指蛋白基因家族提供了基础。
普通白菜C3H_类锌指蛋白基因家族鉴定及表达分析
Identification and Expression Analysis of C3H Zinc Finger Protein Gene Family in Brassica campestris ssp .chinensisTIAN Wen-jie 1，2，HOU Rui-ze 2，DU Ze-guang 2，LI Gai-zhen 2，HOU Lei-ping 2，LI Mei-lan 2*（1.Quwo Wisdom Vegetable Valley Development and Service Center of Shanxi Province ，Quwo 043400，China ；2.Shanxi Agricultural University ，Taigu 030801，China ）Abstract ：CCCH （C3H ）zinc finger protein is a protein that can recognize and bind RNA ，playing an impor-tant role in plant growth ，development ，and stress response.In order to understand the characteristics of the C3H zinc finger protein family in Brassica campestris ssp.chinensis ，by comparing the database of the C3H zinc finger protein members of Arabidopsis thaliana with B.campestris ssp.chinensis ，the members of the C3H zinc finger protein family in B.campestris ssp.chinensis were identified ，and their protein physicochemical properties ，phylogenetic evolution ，chromosome distribution ，and expression patterns at different stages of flower bud differentiation were analyzed.The results showed that a total of 84members of the C3H zinc finger protein family in B.campestris ssp.chinensis were identified ，named BrcC3H1-84according to their chromosomal order.These members were unevenly distributed on 10chromosomes ，with the highest distribution on chromosome 3，with15members.The analysis of protein physicochemical properties showed that the number of amino acids encoded by this family member was 156-1542，with a theoretical isoelectric point of 4.96-10.84.By constructing a phylo-genetic tree ，these family members could be divided into three subgroups ，with significant differences in genestructure and conserved motifs among each subgroup.Different C3H models may be important factors leadingto differences.The gene structure analysis showed thatmost BrcC3H members contain 1or 7CDS.By analyz-ing the expression patterns of BrcC3H members at dif ferent stages of flower bud differentiation of B.campestris ssp.chinensis through transcriptome data ，it was found that 21BrcC3H genes highly expressed during the摘要：植物CCCH （C3H ）锌指蛋白是一种可识别并结合RNA 的蛋白，在植物生长发育、胁迫响应中发挥重要作用。
植物CCCH型锌指蛋白研究进展
Ｓ ａｄ ｎ ｇ ｃ ｌ ｒｌ ｃｅｃ ｓ ｈ ｎ ｏ ｇＡ ｒ ｕ ｕａ Ｓ ｉ ｅ ｉ ｔ ｎ
植物 Ｃ Ｃ Ｃ Ｈ型锌指蛋 白研究进 展
郗冬梅 朱东方 ，
（ ．临沂大学实验中心 ， １ 山东 临沂 ２ ６０ ；．临沂市林业局 ， ７００２ 山东 临沂 ２６０ ） ７０ ０
ｗａ ｌｏ ｐｒ ｓ ｎ ｅ ｓａ ｓ ｅ ｅ ｔ ｄ． Ｋｅ ｒ ＣＣＣＨ —ｔｐｅ ｚｎ ｎ ｅ ｏｅ ｎ；Ａｃｉ ｎ ｐ ｔ ｒ ｙ ｗｏ ｄｓ ｙ ｉ ｃ ｆ ｇ ｒｐｒｔ ｉ ｉ ｔｏ ａ ｔ ｎ；Ｇｒ ｗｔ ｎ ｅ ｅｏ ｍｅ ｔ ｔｅ ｓ ｒ ｓｓ— ｅ ｏ ｈ ａ ｄ ｄ ｖ ｌ ｐ ｎ ；Ｓ ｒ ｓ ｅ ｉｔ
包 括人类 在 内 的 哺 乳 动 物 ’ 植 物 、 蝇 、 、 果 ］
， 该基 序 由三个 半 胱 氨酸 和 一 个 一Ｃ—
组 氨 酸残基 组 成 ， 初 被 定 义 为 Ｃ—ｘ 最
一
ｃ—ｘ 一Ｈ（ ｃ代 表半 胱 氨 酸 ， 代 表 组 氨 Ｈ
酵母 ］病 毒 ｌ体 内鉴 定 出大量 含 有 锌 指结 构 的 、 ７ 蛋 白质 ， 称 为 锌 指蛋 白 。根 据 锌 指 结构 序 列 和 统 功 能 的不 同 ， 将 锌 指 蛋 白分 为 ９大 类 ： ： ： 可 ＣＨ ，
中图分类号 ： ５ ３ Ｑ １ 文献标识号 ： Ａ 文章编号 ：０ １ ４ ４ （０ ２ ０ ０２ ０ １０ — ９ ２ ２ １ ）５— ００－ ３
Ａｄ ａ ｃ ｓｉ ｓ ａ ｃ ｆＰｌ ｎ ｖ ｎ ｅ ｎ Ｒｅ ｅ ｒ ｈ ｏ ａ ｔＣＣＣＨ —Ｔｙ ｎ ｎ ｅ ｏ ｅｎ — ｐｅ Ｚｉ ｃ Ｆｉ ｇ ｒ Ｐｒ ｔ ｉ
植物锌指蛋白与研究进展
植物锌指蛋⽩与研究进展植物锌指蛋⽩与研究进展⽬录中⽂摘要及关键词 (3)英⽂摘要及关键词 (4)引⾔ (5)1.锌指蛋⽩ (5)1.1锌指蛋⽩概念 (5)1.2锌指蛋⽩结构 (6)2.锌指蛋⽩分类 (6)2.1 C2H2型锌指 (7)2.2 C4型锌指 (9)2.3 C6型锌指 (9)3.锌指蛋⽩调控机理 (9)3.1对DNA靶序列的识别 (10)3.2与RNA相互作⽤ (10)3.3与DNA-RNA杂交双分⼦特异性结合 (10)3.4锌指之间的相互作⽤ (11)4.逆境相关的植物锌指蛋⽩ (11)4.1与盐胁迫有关的锌指蛋⽩ (11)4.2与冷胁迫有关的锌指蛋⽩ (13)4.3与⼲旱胁迫相关的锌指蛋⽩ (14)4.4与氧胁迫有关的锌指蛋⽩ (14)4.5强光胁迫下有关的锌指蛋⽩ (15)5.锌指蛋⽩应⽤前景与展望 (15)结束语 (16)参考⽂献 (17)致谢 (22)摘要锌指蛋⽩是⼀类对基因调控起重要作⽤的转录因⼦，具有⼿指状结构域，对基因调控起重要作⽤。
根据其结构域的不同，可将锌指蛋⽩主要分为C2H2型、C4型和C6型。
C2H2型是研究较多，较为明确的⼀种锌指蛋⽩。
锌指通过与靶分⼦DNA、RNA、DNA-RNA的序列特异性结合，以及与⾃⾝或其他锌指蛋⽩结合，在转录和翻译⽔平上调控基因表达，参与许多⽣理过程。
近年来国内外学者对其进⾏了⼴泛研究，利⽤转基因技术, 将⼀些与逆境胁迫相关的锌指蛋⽩基因在⽬标植物中过量表达后, 能对植物起到增强抗逆性的作⽤, 说明锌指蛋⽩在增强植物逆境抗性⽅⾯有着⼴阔的应⽤前景。
这些研究成果对⽇后利⽤基因⼯程技术改良作物品质，提⾼作物抗逆性提供了有利条件。
关键词：转录因⼦；锌指蛋⽩；逆境胁迫AbstractZinc finger protein is a transcription factor plays an important role in gene regulation, with finger-like domain, plays an important role in gene regulation. Depending on the domain, zinc finger protein is divided into C2H2, C4andC6. C2H2 type is a zinc finger protein that more research and more specific. Zinc finger protein in combination with the target molecules of DNA, RNA, DNA-RNA sequence- -specific binding, and refers to itself or other zinc on the level of transcription and translation, regulation of gene expression involved in many physiological processes. Foreign scholars in recent years on the extensive research, the use of transgenic technology, will some and adversity stress related zinc finger protein gene in target plants excessive expression, to an increase the role of plant resistance that zinc finger protein in the increase in resistance plant stress have broad application prospect. The results of this study in the future use of genetic engineering technology improve the art provides favorable conditions.Key words：Transcription factor; Zinc finger protein; Adversity stress引⾔真核⽣物基因表达是⼀个⼗分复杂⽽有序的过程，它是众多反式因⼦和顺式作⽤元件之间相互作⽤的结果。
锌指蛋白对肿瘤干细胞调控作用的研究进展
锌指蛋白对肿瘤干细胞调控作用的研究进展
李涛;伍海;杨梅;袁胜涛
【期刊名称】《中国现代医生》
【年(卷),期】2024(62)16
【摘要】肿瘤干细胞是一种具有自我更新潜能的肿瘤细胞,发现于多种类型肿瘤中,其与肿瘤的发生、发展、复发及耐药等密切相关。
多项研究证实,锌指蛋白可在转录和翻译层面对肿瘤干细胞进行调控。
本文主要探讨锌指蛋白在肿瘤干细胞中的研究进展,旨在进一步阐明肿瘤干性的发生和维持机制,为肿瘤的临床治疗提供依据。
【总页数】4页(P130-132)
【作者】李涛;伍海;杨梅;袁胜涛
【作者单位】中国药科大学多靶标天然药物全国重点实验室
【正文语种】中文
【中图分类】R730
【相关文献】
1.C2H2型锌指蛋白在肿瘤基因调控中的研究进展
2.锌指蛋白在基因转录翻译及肿瘤发生发展中的调控作用机制研究进展
3.miR-375靶向锌指蛋白470对人牙周膜干细胞成软骨分化的调控作用
4.锌指蛋白调控肿瘤免疫原性的作用及其机制的研究进展
5.C2H2型锌指蛋白对成体干细胞分化的调控作用
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冷胁迫下普通油茶CCCH型锌指蛋白基因家族的鉴定和分析
冷胁迫下普通油茶CCCH型锌指蛋白基因家族的鉴定和分析邢凯峰;姚杏子;周军;谢昊星;陈容平;赵耀;戎俊;张剑【期刊名称】《经济林研究》【年(卷),期】2024(42)1【摘要】【目的】为挖掘和利用耐寒普通油茶Camellia oleifera遗传资源提供参考。
【方法】基于普通油茶的冷胁迫转录组数据,对其CCCH型锌指蛋白基因进行鉴定,并对CCCH型锌指蛋白进行理化性质分析、系统发育分析、保守结构域预测、二级结构预测等相关生物信息学分析,并以庐山高海拔油茶(LSG)和栽培油茶品种赣无1(GW1)为材料,对CCCH型锌指蛋白基因在冷胁迫下的表达情况进行分析。
【结果】在普通油茶的冷胁迫转录组数据中共鉴定到24个CCCH型锌指蛋白基因,参考水稻分类方法,将24个CCCH型锌指蛋白聚类到2个亚家族中。
保守基序分析结果表明,在24个基因中仅有3种CCCH型锌指蛋白基序类型,即C-X8-C-X5-C-X3-H、C-X7-C-X5-C-X3-H和C-X5-C-X4-C-X3-H,数目分别为92、4和4。
转录组表达谱分析结果表明:在野外冷胁迫试验中CoC3H17基因在D4、D5和D6时期的表达量高于D1、D2和D3时期,在室内冷胁迫试验中庐山高海拔油茶和赣无1的CoC3H17基因一直表现为更高的转录本丰度;CoC3H14和CoC3H24基因在野外试验的D4、D5和D6时期均表现为表达量明显上升,且在室内冷胁迫试验中庐山高海拔油茶的这2个基因的表达量高于赣无1。
【结论】CoC3H17、CoC3H14和CoC3H24基因可能是普通油茶应对冷胁迫的关键基因。
【总页数】9页(P11-19)【作者】邢凯峰;姚杏子;周军;谢昊星;陈容平;赵耀;戎俊;张剑【作者单位】南昌大学生命科学学院【正文语种】中文【中图分类】S602.4【相关文献】1.二穗短柄草CCCH型锌指蛋白基因家族成员的鉴定和分析2.基于转录组的油茶DHHC型锌指蛋白基因家族的鉴定及分析3.普通烟草CCCH类锌指蛋白家族的全基因组鉴定和表达分析4.桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族的鉴定及其在低温胁迫下的表达分析5.冷胁迫下甘蓝型冬油菜表达蛋白及BnGSTs基因家族的鉴定与分析因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
苎麻CCCH基因家族生物信息学及表达谱分析
苎麻CCCH基因家族生物信息学及表达谱分析
张晓洋;何思;瞿宏悦;韩昕冉;张嘉敏;赵倾城;邢虎成
【期刊名称】《草地学报》
【年(卷),期】2024(32)3
【摘要】CCCH锌指蛋白作为各种生物体中广泛存在的调节因子,在植物生长发育,胁迫应答等多种生物过程中发挥重要的调控作用。
本研究采用生物信息学方法,从苎麻基因组中鉴定出59个CCCH基因家族成员,并进行了理化性质、系统进化、基因结构、共线性及表达模式的分析。
结果表明CCCH基因不均匀分布在苎麻的14条染色体上;顺式作用元件预测分析发现启动子区有大量非生物胁迫和激素响应元件;表达谱分析表明,差异基因BniC3H48、BniC3H53和BniC3H57在乙烯利和磷酸二氢钾两者混合喷施后表达呈上调趋势,这三个基因可能在乙烯利和磷酸二氢钾互作调控苎麻富集镉中发挥重要作用。
本研究为进一步解析苎麻响应重金属镉胁迫的分子机制提供新的线索和理论依据。
【总页数】11页(P703-713)
【作者】张晓洋;何思;瞿宏悦;韩昕冉;张嘉敏;赵倾城;邢虎成
【作者单位】湖南农业大学苎麻研究所;湖南省草类作物种质创新与利用工程技术研究中心;湖南省长沙市长沙县植保植检站
【正文语种】中文
【中图分类】S330.25
【相关文献】
1.苎麻纤维不同发育时期差异表达miRNAs的表达谱分析
2.苎麻kinesin基因家族全基因组鉴定与表达分析
3.苎麻CCRs基因家族3类成员的生化特性与表达差异
4.豌豆CBF基因家族的生物信息学及低温胁迫下的表达分析
5.牦牛GPX基因家族生物信息学及表达分析
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２生物技术通报ＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙＢｕｌｌｅｔｉｎ２０１０年第８期
包含１到６个ＣＣＣＨ类型的锌指基序，其基序的特
征是富含甘氨酸和苯丙氨酸残基的Ｃ—Ｘ。
川一Ｃ—Ｘ。
一。
一
Ｃ—Ｘ，一Ｈ。
分析的结果表明含有Ｃ—Ｘ，一。
－Ｃ・Ｘ，一Ｃ—Ｘ，－Ｈ
基序的ＣＣＣＨ蛋白是最大的一个类，约占７５％，
并认为该基序很可能是其它ＣＣＣＨ基序的一个
起源。
２结构研究
目前，关于ＣＣＣＨ结构的研究主要是ＣＣＣＨ与
ＲＮＡ复合体的结构。
Ｈｕｄｓｏｎ等＂１已经利用核磁共
振技术得到了ＴＩＳｌｌＤ的ＣＣＣＨ结构域与富含ＡＵ
图３Ａｔｃ３Ｈ“的ＲＮＡ复合物的三维结构
的ＲＮＡ单体结合的三维结构（图１，图２）。
由于
ＴＩＳｌｌＤ与拟南芥中ＡｔＣ３Ｈ１４都含有两个连续的Ｃ－
Ｘ８．ｃ．ｘ５．ｃ．ｘ３．Ｈ基序，并且两个基序之间的氨基酸
残基的间隔都是１８个，其它的残基的保守性也很
高。
Ｗａｎｇ依据前者模拟了ＡｔＣ３Ｈ１４与ＲＮＡ结合
的三维构象（图３，图４）。
圈１ＴＩＳｌｌＤ与ＲＮＡ单体结合的三维结构图２ＴＩＳｌｌＤ与ＲＮＡ单体结合的拓扑结构
圈４ＡｔＣ３Ｈ１４结构的分子接触表面拓扑结构
ＷａｎｇＨｌ根据图ｌ一图４分析，每个ＣＣＣＨ锌指的Ｎ端都有一段ＫＴＥＬ（Ｖ）的残基，这段残基形成与ＲＮＡ结合的关键接触面，每个锌指都形成一个容纳ＲＮＡ的口袋，分别容纳ＲＮＡ的ｕ６和Ｕ２两个核苷酸残基。
Ｕ２一Ｐｈｅ２９３－Ａ３，Ｕ４－Ｔｙｒ２８７一Ｕ５，Ｕ６一Ｐｈｅ２５５．Ａ７和Ｕ８一Ｔｙｒ２４９．Ｕ９相互之间形成的芳香族的堆积力在ＣＣＣＨ锌指结构与ＲＮＡ结合中起着关键作用，这些相应的氨基酸的缺失可能会导致二者的结合丧失紧密性。
３ＣＣＣＨ锌指蛋白表达模式
３．１组织表达
在植物中，Ｗａｎｇ等在拟南芥和水稻中分别鉴定到６８个和６７个ＣＣＣＨ基因，这些ＣＣＣＨ在不同的组织中都有表达，但ＣＣＣＨ基因的组织表达模式不同。
根据表达模式的差异可以将ＣＣＣＨ基因分为３类。
第一类的基因在所有４种检测的组织
都有表达，这类基因在拟南芥中有３３个，在水稻。