锌指蛋白
植物中RING型锌指蛋白研究进展
植物中RING型锌指蛋白研究进展陆瑜(重庆大学生物工程学院,重庆400044)摘要:锌指蛋白家族数目庞大,功能繁多。
随着研究的不断深入,RING型锌指蛋白日渐引人关注。
RING 型锌指蛋白都含有一段保守的RING型结构域,大量研究表明,RING型锌指蛋白广泛参与植物的生长发育、胁迫与信号转导等过程。
该文主要概括了锌指蛋白的概述与分类、RING型锌指蛋白的结构,RING型锌指蛋白在植物光形态建成、侧根发育、气孔调节等生理过程、以及在干旱、盐、高温、低温、铝等非生物胁迫方面的作用。
最后就植物RING型锌指蛋白的后续工作进行了展望。
关键词:RING型锌指蛋白;生长发育;胁迫中图分类号Q943文献标识码A文章编号1007-7731(2017)08-0036-04Research Progress of RING-type Zinc Finger Protein in PlantsLu Yu(College of Bioengineering,Chongqing University,Chongqing400044,China)Abstract:The number of zinc finger protein family is huge and the function is numerous.With the deepening of re⁃search,RING-type zinc finger protein is attracting peoples'attention,RING type zinc finger proteins all contain a conserved RING domain,a large number of studies show that RING-type zinc finger protein is widely involved in plant growth and development,plant stress signal transmission process.In this paper,we mainly summarize the over⁃view and classification of zinc finger protein,the structure of RING-type zinc finger protein,the physiological pro⁃cesses of RING-type zinc finger protein in the light form,lateral root development,stomatal regulation,and we con⁃clude the functions of plant RING-type zinc finger protein in drought,salt,high temperature,low temperature,alumi⁃num and other adversity stress.Finally,the follow-up work of RING-type zinc finger protein was prospected.Key words:RING-type zinc finger protein;Development;Stress随着人们对锌指蛋白研究的逐渐深入,越来越多的证据表明锌指蛋白参与动物基因的表达调控过程[1],同样,其在植物中也发挥着重要的作用。
锌指蛋白原理
锌指蛋白原理我今天要和大家聊聊一个超级神奇的东西——锌指蛋白。
你可别小瞧了它,这东西在生命的舞台上那可是扮演着至关重要的角色呢。
先来说说啥是锌指蛋白吧。
想象一下,在我们身体这个超级复杂的大工厂里,有着无数的小零件在忙碌地工作着,锌指蛋白就像是一个个独特的小工具。
它之所以叫锌指蛋白,是因为它的结构有点像手指,而且这个“手指”里面还紧紧地握着一个锌离子,就好像这个锌离子是它力量的源泉。
我有个朋友叫小李,他呀,是个生物迷。
有一次我们聊天,他就特别兴奋地跟我说:“你知道锌指蛋白吗?那简直就是大自然创造的精密小仪器!”我当时还一头雾水呢。
他就接着给我解释,说锌指蛋白的这个“手指”结构不是随便长的,它的每一个弯曲、每一个角度都有着特殊的意义。
就好比一把特制的钥匙,只能开特定的锁。
那这个锌指蛋白到底是怎么工作的呢?这就更有趣了。
在我们的细胞里,有着数不清的DNA,这些DNA就像是一本本超级复杂的生命之书,里面记载着各种各样的信息,从我们的眼睛是什么颜色,到我们会不会容易生病,都写在这DNA里。
锌指蛋白就像是一个聪明的小读者,它的“手指”能够识别DNA上特定的序列。
这识别的过程就像是在玩一个超级精准的拼图游戏。
锌指蛋白要在那长长的DNA链里找到完全匹配自己“手指”形状的那一小段序列。
一旦找到了,那可不得了,它就开始发挥它的功能了。
我又想起我和小李的另一次对话。
我就问他:“这锌指蛋白找到那段DNA序列后能干啥呢?总不能就只是站在那儿看看吧?”小李哈哈一笑,说:“这你就不懂了吧。
它一旦找到,就可以像个小指挥官一样,指挥很多其他的生物分子呢。
它可以告诉那些分子,这里是该开始制造某种蛋白质的地方,或者是这里需要对DNA进行一些修改。
”这让我大为惊叹啊。
锌指蛋白在很多方面都有着不可替代的作用。
比如说在基因表达调控方面,它就像是一个严格的门卫。
如果把基因表达想象成一场盛大的演出,那么锌指蛋白就站在舞台入口,决定哪些演员(基因)可以上台表演(表达),哪些还得在后台等着。
大豆C2H2型锌指蛋白基因STF-2的克隆及结构分析
安徽农学通报,Anhui Agri.Sci.Bull.2016,22(03-04)大豆C2H2型锌指蛋白基因STF-2的克隆及结构分析宋冰1,2付永平1李勃2赵海涛2李丹1王丕武1*(1吉林农业大学,吉林长春130118;2吉林市农业科学院,吉林吉林132101)摘要:大豆是我国重要的粮油经济作物,是众多行业中必需的原材料。
锌指蛋白是一种重要的转录因子,其中双锌指的植物C2H2型锌指蛋白多数与植物的非生物胁迫相关,可以利用生物技术手段提高作物对非生物胁迫的耐受能力。
该文利用生物信息学和同源克隆的方法克隆得到了大豆C2H2型锌指蛋白基因STF-2,并且利用软件对其蛋白结构进行了初步分析。
关键词:大豆;锌指蛋白;STF-2;结构分析中图分类号S188文献标识码A文章编号1007-7731(2016)03-04-18-03Cloning and Structural Analysis of STF-2Encoding a C2H2-type Zinc Finger Protein from Soybean Song Bing1,2et al.(1Jilin Agricultural University,Changchun130118,China;2Jilin City Academy of Agricultural Sciences,Jilin 132101,China)Abstract:Soybean(Glycine max[L.]Merrill)is the important food and oil crops of China which is the important raw materials of many industries.The zinc protein was an important transcription factors,and most plant C2H2-type zinc finger protein with the double zinc-finger structures related with adversity stress.It will offer a favorable condition to enhance the plants tolerance to adversity stress by the biotechnology.In this paper,a C2H2-type zinc finger protein gene STF-2was isolated from soybean,and analyzed primary structure of the STF-2by software.Key words:Soybean;Zinc finger protein;STF-2;structural analysis干旱、高盐、低温是限制植物生长发育的不利环境因子[1]。
锌指蛋白核酸酶的作用原理及其应用
关键词: 锌指结构域 ; 锌指蛋白 ; 锌指蛋白核酸酶 ; 同源重组 ; 基因打靶
The mechanism and application of zinc finger nucleases
ZHONG Qiang , ZHAO Shu-Hong
Key Laboratory of Agricultural Animal Genetics, Breeding and Reproduction of Ministry of Education of China, College of Animal Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China
HEREDITAS (Beijing) 2011 年 2 月 , 33(2): 123― 130 ISSN 0253-9772
综述
DOI: 10.3724/SP.J.1005.2011.00123
锌指蛋白核酸酶的作用原理及其应用
钟强 , 赵书红
华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室 , 农业部猪遗传育种重点开放实验室 , 武汉 430070
Abstract: Due to specific recognization of DNA sequences and designability, zinc finger nucleases (ZFN) has been used in knock in and knock out genes. Because of high ratio of homologous recombination of DSB-GT induces by ZFN, ZFN technology has been considered as the most powerful tool for gene modification. It has been successfully used at cell or embryo levels in plants and animals. Under the rapid development of high affinity zinc finger protein (ZFP), this technique will be applied to genetic engineering and breeding extensively in the future. This review discussed the DNA recognization mechanism and double strand break gene targeting (DSB-GT) of zinc finger nucleases (ZFN). Some application examples of ZFN were summarized.
锌指蛋白家族在肝细胞癌发生发展中的作用
.锌指蛋白家族在肝细胞癌发生发展中的作用魏俊伟1,2,赵彩彦11河北医科大学第三医院感染科,石家庄050051;2邯郸市第一医院消化内科,河北邯郸056000摘要:肝细胞癌发生发展机制复杂,目前尚未完全阐明。
锌指蛋白家族是人类基因组中最大的转录因子家族,目前越来越多的证据显示了这种潜力锌指蛋白在肝细胞癌发生发展中发挥重要作用,并有望成为肝细胞癌新的肿瘤生物标志物和治疗靶点。
现就锌指蛋白家族的结构与生物学功能及其在肝细胞癌中的作用和相关调控机制进行综述。
关键词:癌,肝细胞;锌指蛋白;病理过程;中图分类号:R735.7 文献标志码:A 文章编号:1001-5256(2020)12-2839-04RoleofzincfingerproteinsinthedevelopmentandprogressionofhepatocellularcarcinomaWEIJunwei1,2,ZHAOCaiyan1.(1.DepartmentofInfectiousDiseases,ThirdHospitalofHebeiMedicalUniversity,Shijiazhuang050051,China;2.DepartmentofGastroenterology,TheFirstHospitalofHandan,Handan,Hebei056000,China)Abstract:Therearecomplexmechanismsinthedevelopmentandprogressionofhepatocellularcarcinoma,whichhavenotbeenfullyclari fiedatpresent.Zincfingerproteinfamilyisthelargesttranscriptionfactorfamilyinhumangenome,andmoreandmoreevidencehasshownthatzincfingerproteinsplayanimportantroleinthedevelopmentandprogressionofhepatocellularcarcinomaandareexpectedtobecomenewtumorbiomarkersandtherapeutictargetsforhepatocellularcarcinoma.Thisarticlereviewsthestructureandbiologicalfunctionsofzincfingerproteinsandtheirroleandregulatorymechanismsinhepatocellularcarcinoma.Keywords:carcinoma,hepatocellular;zincfingerprotein;pathologicprocessesDOI:10.3969/j.issn.1001-5256.2020.12.042收稿日期:2020-05-28;修回日期:2020-07-03基金项目:河北省重点研发计划项目(20377768D)作者简介:魏俊伟(1985-),女,主治医师,主要从事急慢性肝病方面的研究通信作者:赵彩彦,电子信箱:zhaocy2005@163.com 世界卫生组织最新数据显示,每年约有78.1万人死于肝细胞癌(HCC),占癌症总死亡人数的8.2%;其中有50%的HCC病例和死亡病例发生在中国,是目前我国第四位的常见恶性肿瘤及第三位的肿瘤致死病因[1]。
植物锌指蛋白与研究进展
植物锌指蛋白与研究进展目录中文摘要及关键词 (3)英文摘要及关键词 (4)引言 (5)1.锌指蛋白 (5)1.1锌指蛋白概念 (5)1.2锌指蛋白结构 (6)2.锌指蛋白分类 (6)2.1 C2H2型锌指 (7)2.2 C4型锌指 (9)2.3 C6型锌指 (9)3.锌指蛋白调控机理 (9)3.1对DNA靶序列的识别 (10)3.2与RNA相互作用 (10)3.3与DNA-RNA杂交双分子特异性结合 (10)3.4锌指之间的相互作用 (11)4.逆境相关的植物锌指蛋白 (11)4.1与盐胁迫有关的锌指蛋白 (11)4.2与冷胁迫有关的锌指蛋白 (13)4.3与干旱胁迫相关的锌指蛋白 (14)4.4与氧胁迫有关的锌指蛋白 (14)4.5强光胁迫下有关的锌指蛋白 (15)5.锌指蛋白应用前景与展望 (15)结束语 (16)参考文献 (17)致谢 (22)摘要锌指蛋白是一类对基因调控起重要作用的转录因子,具有手指状结构域,对基因调控起重要作用。
根据其结构域的不同,可将锌指蛋白主要分为C2H2型、C4型和C6型。
C2H2型是研究较多,较为明确的一种锌指蛋白。
锌指通过与靶分子DNA、RNA、DNA-RNA的序列特异性结合,以及与自身或其他锌指蛋白结合,在转录和翻译水平上调控基因表达,参与许多生理过程。
近年来国内外学者对其进行了广泛研究,利用转基因技术, 将一些与逆境胁迫相关的锌指蛋白基因在目标植物中过量表达后, 能对植物起到增强抗逆性的作用, 说明锌指蛋白在增强植物逆境抗性方面有着广阔的应用前景。
这些研究成果对日后利用基因工程技术改良作物品质,提高作物抗逆性提供了有利条件。
关键词:转录因子;锌指蛋白;逆境胁迫AbstractZinc finger protein is a transcription factor plays an important role in gene regulation, with finger-like domain, plays an important role in gene regulation. Depending on the domain, zinc finger protein is divided into C2H2, C4andC6. C2H2 type is a zinc finger protein that more research and more specific. Zinc finger protein in combination with the target molecules of DNA, RNA, DNA-RNA sequence- -specific binding, and refers to itself or other zinc on the level of transcription and translation, regulation of gene expression involved in many physiological processes. Foreign scholars in recent years on the extensive research, the use of transgenic technology, will some and adversity stress related zinc finger protein gene in target plants excessive expression, to an increase the role of plant resistance that zinc finger protein in the increase in resistance plant stress have broad application prospect. The results of this study in the future use of genetic engineering technology improve the art provides favorable conditions.Key words:Transcription factor; Zinc finger protein; Adversity stress引言真核生物基因表达是一个十分复杂而有序的过程,它是众多反式因子和顺式作用元件之间相互作用的结果。
锌指蛋白碱基序列对应表-概述说明以及解释
锌指蛋白碱基序列对应表-概述说明以及解释1.引言1.1 概述概述部分的内容可以如下所述:引言部分将从一个宏观的角度来阐述锌指蛋白碱基序列对应表的概念和意义。
首先,锌指蛋白是一类广泛存在于生物体内的蛋白质家族,它们在维持生物体正常生理功能中扮演着至关重要的角色。
锌指蛋白能够通过与DNA结合进行基因调控、修复DNA损伤以及参与细胞信号传导等重要生物过程。
而锌指蛋白的功能和特性则与其碱基序列密切相关。
锌指蛋白中的锌指结构是由特定的氨基酸排列而成的,在碱基序列间具有高度的选择性和结合亲和力。
因此,了解锌指蛋白碱基序列的定义和特点对于深入研究锌指蛋白的功能机制以及其在生物体内的作用具有重要意义。
为了更好地理解和分析锌指蛋白的碱基序列,科学家们逐渐建立起了一套针对不同类型锌指蛋白的碱基序列对应表。
这些对应表可以帮助研究人员判断特定锌指蛋白的序列特征,进而提供一种准确而快捷的方式来研究锌指蛋白的功能和作用机制。
因此,本文的目的就是通过介绍锌指蛋白碱基序列对应表的重要性和应用前景,来阐述该对应表对于促进锌指蛋白研究的重要意义。
接下来的章节将会围绕锌指蛋白的重要性以及锌指蛋白碱基序列的定义和特点展开,以期为读者提供一个全面而系统的了解锌指蛋白碱基序列对应表的视角。
1.2 文章结构:本文分为引言、正文和结论三个部分。
引言部分首先概述了锌指蛋白碱基序列对应表的重要性,并说明了本文的目的。
锌指蛋白是一类广泛存在于生物体中的蛋白质,它们在细胞中发挥着重要的生物学功能。
锌指蛋白的碱基序列对应表是一个描述锌指蛋白中每个氨基酸残基与锌离子结合的能力的表格,它对于研究锌指蛋白的结构、功能以及相关的疾病机理具有重要意义。
本文旨在系统地总结和整理已知的锌指蛋白碱基序列对应表,并探讨其应用前景。
正文部分将详细介绍锌指蛋白的重要性和碱基序列的定义和特点。
首先,将从锌指蛋白的结构与功能入手,阐述锌指蛋白在细胞中的多样化作用,包括基因调控、DNA修复、蛋白质结构稳定等。
锌指蛋白名词解释
锌指蛋白名词解释
嘿,你知道锌指蛋白吗?这玩意儿可神奇啦!就好像一把精巧的钥匙,能开启生命中各种重要的“大门”。
锌指蛋白啊,它可不是一般的蛋白哦!它有着独特的结构,就像是一个个小小的手指,上面还镶嵌着锌离子呢。
你想想看,这不就像我们手上戴着戒指一样嘛,多特别呀!
比如说,在基因表达调控中,锌指蛋白那可是发挥着大作用呢!它能精准地识别特定的 DNA 序列,然后像个熟练的指挥官一样,指挥着基因该什么时候表达,表达多少。
“嘿,这个基因,现在该你上场啦!”,它就是这么牛。
再看看细胞的分化和发育过程,锌指蛋白也在其中忙得不亦乐乎。
它就如同一个聪明的引路人,引导着细胞走向正确的道路,“这边走,这边才是对的方向哦!”。
还有啊,在生物体应对外界环境变化时,锌指蛋白也会挺身而出。
“嘿,有压力?别怕,我来啦!”,它会帮助生物体更好地适应环境,顽强地生存下去。
锌指蛋白在生命活动中扮演着如此重要的角色,难道我们不应该好好去研究它、了解它吗?它就像是一个充满神秘色彩的宝藏,等待着我们去不断挖掘。
我觉得啊,对锌指蛋白的深入研究,肯定会给我们
带来更多意想不到的惊喜和发现,让我们对生命的奥秘有更深刻的认识!这绝对是一件超级有意义的事情呀!。
锌指蛋白对肌肉发育的调节
文章编号:100021336(2001)0620497203(本文参加中华基因网第二届“生命之光”征文活动)锌指蛋白对肌肉发育的调节鹿培源 贾弘 (北京大学基础医学院生物化学与分子生物学系,北京100083) 关键词:锌指蛋白;肌肉发育;MRF中图分类号:Q51;Q71收稿日期:2001207223作者简介:鹿培源(1969-),男,博士生;贾弘 ,男,教授,博士生导师。
骨骼肌已经成为研究发育的很多基本原理的一个理想模型。
对肌肉发育机制的研究加深了我们对细胞决定、细胞分化、形态发生以及生长和分化的拮抗作用等生命现象的认识。
在骨骼肌的发育过程中,从中胚层的肌肉祖先细胞产生成肌细胞以及从成肌细胞分化成多核肌细胞的每一步骤都是由转录因子来调节的。
锌指蛋白(zinc finger protein )是80年代中期发现的一类DNA 结合蛋白,在真核生物中,锌指蛋白可能是最大的一类DNA 结合蛋白,并且由锌指蛋白调控基因表达是发育和其他过程的一个非常普遍的现象。
在最近的几年中,发现某些锌指蛋白对肌肉的发育具有重要的调节作用。
1.肌肉的发育及其调节高等真核生物发育过程中的划时代的事件之一是骨骼肌的建立。
肌细胞的祖先起源于胚胎的体节内。
体节可以产生如下结构:骨骼(生骨节)、皮下组织(生皮节)以及体壁和四肢的横纹肌(生肌节)。
最先决定的肌细胞是生肌节的成肌细胞。
随着发育的进行,成肌细胞融合并形成多核的合胞体。
在很长的一段时间内,人们对肌细胞分化的确切机制知之甚少。
肌肉特异的转录因子MyoD 家族的发现使人们对肌肉发育机制的研究取得了很大进展。
这组转录因子属于庞大的碱性螺旋2环2螺旋(basic helix 2loop 2helix ,bHL H )蛋白质家族,在脊椎动物中已经发现了以下4个成员:MyoD 、Myf 25、生肌蛋白(myogenin )和MRF4。
这4种肌源性的bHL H 蛋白又称为生肌调节因子(myogenic regulatory factor ,MRF )。
锌指蛋白A20在动脉粥样硬化中的研究进展
锌指蛋白A20在动脉粥样硬化中的研究进展卢珊;罗云;孙桂波;孙晓波【期刊名称】《中国药理学通报》【年(卷),期】2018(034)007【摘要】Atherosclerosis, as a chronic inflammatory disease, is the most common one among cardiovascular system disorders. Inflammation is crucial in the development of atherosclerosis, which participates in the entire process of atherosclerosis. NF-κB can target to most inflammatory factors, and excessive NF-κB activation aggravates atherosclerosis development. Previous stud- ies have shown that the zinc finger proteinA20 plays a key role in the anti-inflammatory and anti-apoptotic response. Research advances on A20 in protection of atherosclerosis are thus summa-rized in this review.%近年来,锌指蛋白A20具有强大的抗炎、抗凋亡功能,逐渐被人们所关注. A20与炎症性疾病密切相关,而动脉粥样硬化作为心血管系统疾病中最常见的疾病,其发病整个过程都有炎症反应的参与.因此,该文重点对A20 在动脉粥样硬化中的保护作用作一综述.【总页数】4页(P895-898)【作者】卢珊;罗云;孙桂波;孙晓波【作者单位】中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京 100193;中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京 100193;中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京 100193;中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京 100193【正文语种】中文【中图分类】R-05;R329.24;R341;R364.5;R543.5;R977.6【相关文献】1.动脉粥样硬化研究进展--炎症与感染在动脉粥样硬化形成中的作用 [J], 龙汉安;肖秀丽2.锌指蛋白A20在过敏性哮喘中的研究进展 [J], 袁为远;包凯帆;贾志荣;王晓钰;郑劼;洪敏;江国荣3.炎性细胞在动脉粥样硬化中作用的研究进展 [J], 王敏;李瑾4.固有免疫介导的炎症反应在动脉粥样硬化发病机制中的研究进展 [J], 李丹丹;梅俊;周庆兵;徐凤芹5.去泛素化酶在动脉粥样硬化中的研究进展 [J], 周孟学;王中群因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
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June 21, 2015
具有锌指构型的蛋白是一种参与许多真 核生物基因调控的转录因子。
锌指结构使激活子蛋白与增强子序列特异性结 合而调节基因的表达。
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真激活子与启动子区域转录复合体直接接触来 激活转录。 真激活子包括两个功能区域:
与强化子结合的DNA结合区域 与转录体蛋白质互作的反式调控激活区域
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二、锌指蛋白与RNA结合
锌指不仅与DNA
发生作用,也可以识别RNA, 也可以与某些基因的转录产物结合形成复合物。 螺旋主要与DNA发生相互作用,而对于RNA识 别,磷酸骨架起主导作用。
三、与DNA-RNA杂交双链结合
锌指蛋白与杂交双链DNA-RNA分子的作用是
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锌指蛋白的分类
锌指存在于动物、植物和真菌中,但不同种属
典型锌指数目和相邻锌指间连接长度有很大不 同;不同代表结构对应不同功能。 根据锌指Cys和His残基围绕锌离子所构成的空 间结构不同,Krishna等把锌指蛋白分成8个不 同的折叠群: 类C2H2型锌指、塞结状锌指、高音谱号锌指、 带状锌指、Zn2/Cys6型锌指、类TAZ2型锌指、 锌离子结合短环锌指、金属硫蛋白锌指。
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基于这种新的熟悉,科学家们测验考察了多种
办法来阻拦CCR5蛋白质的正常产生或者来改变 CCR5蛋白质的形态,从而让HIV病毒无法搭载 上去。这可是“劫机”测验考试的第一步,目 的就是破坏HIV病毒的搭载对象。此策略就如 同在进行摔跤比赛之前,先剪掉自己的头发, 不让对手有器械可抓。
当用锌离子螯合剂除去锌离子,或用Fe
Cu Mn Co Ni等金属离子臵换锌离子后,锌指蛋白与 DNA特异性结合就会被显著抑制,同时蛋白本 身的结构稳定也会被破坏,影响基因表达。 用半胱氨酸或组氨酸代替锌离子通常也会导致 锌指功能的丧失。
锌指结构的稳定性保证了锌指功能的有效性。
锌指蛋白
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TF ⅢA中的Zn
1、 TF ⅢA中的锌离子提供结构中心,指导蛋白质 的折叠,使其与DNA上特定部位定位识别并结合, 在控制5S核糖体RNA基因转录起关键作用; 2、这种含锌蛋白与DNA上约45bp序列相结合并 可抵御核酸酶的切割消化; 3、蛋白酶解研究表明,锌离子的加入使肽段被蛋 白酶裂解的敏感性大大下降。
序列特异性的,并且是链特异性的。
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四、锌指蛋白的相互作用
锌指也可以与其他蛋白发生蛋白-蛋白相互作用,
通过这种相互作用,进而影响锌指结合DNA特 性。例如激活基因的表达,调控细胞内蛋白质 正常折叠,对生物体基因的转录起重要的调控 作用等。
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大自然为什么选择锌?
1、锌在自然界的天然丰度较高; 2、锌没有氧化还原活性,而氧化还原活性会促
使DNA损伤。
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锌指结构的稳定性主要是由锌离子提供的链间
的交叉连接,锌离子起着规定蛋白质折叠及三 维框架结构的作用。
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例2:TF ⅢA在转录中的作用
TF ⅢA是锌指蛋白的一种,其含有9个不完整重复列, 每个重复域中2个Cys烃硫基及2个His的咪唑基与锌离 子配位。9个锌指协作地结合于5SRNA基因的内控区。 其作用过程为: 1)5SRNA基因的启动子序列首先与TF ⅢA结合, TF ⅢA稳定另一转录因子TF ⅢC与启动子的结合; 2)TF ⅢA与TF ⅢC共同协助TF ⅢB与启动子的结合; 2)TF ⅢB是定位因子,能促使RNA聚合酶Ⅲ与DNA序 列结合并正确定位,从15
锌指结构
由一个α-螺旋和两个反平行的β-折叠三个肽段自我折叠成 “手指”形状。锌指的N-端有一对半胱氨酸残基,C-端有 一对组氨酸残基,这四个残基在空间上形成一个洞穴,恰 好容纳一个Zn离子,组成稳定的四面体结构。通过疏水作 用来稳定。(每个重复域中2个Cys烃硫基及2个His的咪唑 基与锌离子配位)
锌指蛋白的研究与发展
打造个性化的DNA结合蛋白。 利用锌指蛋白识别出人类基因组里的任意一段
DNA序列。 商业化的人工锌指可供选择。
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改写基因使人体对艾滋病具有免疫力?
HIV病毒平日是附着在名为CCR5蛋白质潜入人体细 胞的。CCR5蛋白质主要覆盖于T细胞外面,是一种 蛋白受体。T细胞是人体两种主要的白细胞之一,对 人体的免疫力和抗感染能力等机能发挥着至关重要 的作用。
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其保守重复序列为Cys-N2-4-Cys-N12-14-His-N3-His
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June 21, 2015
锌指蛋白每个重复的“指”状结构约含23个氨
基酸残基。整个蛋白质分子可有2-9个这样的锌 指重复单位。 由于Zn离子可稳定模体中α-螺旋结构,致使每 一个单位以其指部α-螺旋伸入到DNA双螺旋的 大沟中,接触5个核苷酸。
其DNA结合区域具有特定的三维构型,包括α 螺旋-转角-α螺旋,锌指,碱性亮氨酸拉链。
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June 21, 2015
一、锌指蛋白与DNA结合
锌指蛋白能特异性得识别DNA,主要是由于其
DNA结构域具有与DNA双螺旋互补的特殊表面结 构,依靠其指型空间结构伸入到DNA双螺旋的大 沟内,通过α螺旋与DNA碱基发生特异性接触。 锌指与DNA结合时必须满足一下条件: 1.锌指蛋白α螺旋位于大沟; 2.锌指蛋白携带正电荷的区域接近磷酸骨架; 3.锌指间的接头结构相对固定
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新近开辟的“基因编辑”技巧能“改写”人体
中的任何一个基因,从而改变CCR5蛋白质的形 态和特点,以达到治疗爱滋病的效果。在此疾 病防治办法的最新版本中,美国宾西法尼亚大 学的科学家卡尔〃琼恩(Carl June)和他的同 事应用了一种高工程技巧改进的蛋白质,叫 “锌指核酸酶”,即锌指蛋白,用它来剥离T 细胞表层的CCR5基因。锌指蛋白载有一种核酸 酶,可以与基因黏附,并使基因永远开启或闭 合。所以,T细胞没有了CCR5蛋白质,HIV病 毒几乎很难入侵人体细胞。琼恩将其研究成果 发表在7月1日出版的《自然-生物工艺学》杂志 上。
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二十世纪九十年代,研究人员曾经对一组特殊
的男同性恋者进行了研究,发明他们虽然同患 有艾滋病的性伴经久保持着稳定的性关系,但 从未被感染过。于是,科学家对他们进行了研 究,发现他们体内发生了基因突变,导致他们 的人体细胞不再产生正常的CCR5蛋白质,HIV 病毒也就没有了可以进入人体细胞的载体,是 以就不能“混入”人体细胞中去。
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例1:Zif268与DNA结合形成复合物。Zif268的三个锌指模体排列成C字形的
夹子环绕形成特异性接触。每个锌指的α螺旋与DNA大沟上3个碱基对各自结合: 此时DNA大沟变宽边深,每一个锌指相对于DNA取向相同,但与DNA反平行。所有 碱基特异性接触都位于DNA双螺旋的一条链上。 锌指DNA结合区在大肠杆菌中功能性表达成功为锌指蛋白-DNA相互作用的胞 内遗传筛选模型的建立奠定了基础。
June 21, 2015
锌指蛋白
生物无机化学
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June 21, 2015
锌指(zinc finger)
锌指蛋白最初在非洲爪蟾的卵母细胞中发现,已知广
泛分布在动物、植物和微生物中,人类基因组中可能 有将近1%的序列编码的是含有锌指结构的蛋白质。目 前人们已经清楚地知道锌指结构是识别特定碱基序列 的一种普遍性的转录因子结构。 锌指蛋白是指含有通过结合Zn2 +稳定的短的可以 自我折叠形成“手指”结构的一类蛋白质。由于其自 身的结构特点 ,可以选择性的结合特异的靶结构 ,使锌 指蛋白在基因的表达调控、细胞分化、胚胎发育等生 命过程中发挥重要作用。