日本囊对虾apo-14基因的全克隆及序列分析

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日本对虾Rab基因的克隆、结构分析与重组表达

日本对虾Rab基因的克隆、结构分析与重组表达
mo o o ) 凡 纳 对 虾 ( ea u a n me ) 中 国 对 虾 ( ea u h n ni)和 日本 对 虾 ( ea u nd n 、 P n esv n a i、 P n e s c ie ss P nes
j p nc s 等 .对虾 养殖 业 发展快 速 , 由此造 成 了养殖环 境恶 化 、 质 资 源破坏 和种 质退 化 、 a o iu ) 但 种 非传 染性 疾病 和传染 性疾 病滋 生 等一 系列 问题 , 严重 地 制 约着 对 虾 养殖 业 的进 一 步发 展 . 别是 对 虾 病 毒 病 , 特 已
世 界对虾 养殖 业兴 起 于 2 O世 纪 7 O年代 , 并在 8 O年代 得 到飞速 发展 . 在对 虾 养殖业 已成 为一个 重 现 要 产业 , 成为 我 国 沿 海 农 民 主 要 的 收 人 来 源. 前 我 国 的对 虾 养 殖 品 种 主 要 有 斑 节 对 虾 ( ea u 当 P n es

种 新 的 R b 白 , 是 首 次 在海 洋 无 脊 椎 动 物 体 内克 隆 到 该 基 因 . 该 基 因 进 行 了 原 核 表 达 , 得 到 了 有 活 a蛋 这 对 并
性 的表 达 产 物 .
关 键 词 : 虾 I a ; 构 ; 达 对 R b结 表 中图 分 类 号 : 7 . 2 Q5 5 1 文献标识码 : A 文章 编 号 :0 9 2 4 2 0 ) 2 1 2 O 1 0 —8 2 ( 0 7 0 一O O 一 6
中在 抗菌方 面 , 而有关 抗病 毒作 用 的研 究 较 少 , 于对 虾 免 疫 信 号 转 导 的机 制 研 究 尚未 见 报 道. a 至 P n等 ( 0 5 在对 虾抗病 毒 的研究 中发现 , 20 ) 一个 预 测 的 R b基 因片 段在 抗病 日本 对 虾 中表 达量 有 所上 升 , a 暗示 R b蛋 白可能参 与 了对 虾 的免疫 过程 L . a 3 j Ra b蛋 白是 小分 子 GT P结 合 蛋 白家族 ( R s R o R c C c 2 Ra 、 a / fR b等亚 家族组 成 ) 由 a 、 h / a / d 4 、 n S rAr、 a 中最 大的亚 家族 . 早 由 No i 最 vc k等 [ 在 芽殖 酵 母 ( ac a o cscrvs e 4 S ch rmy e ee ii )中发 现. a a R b蛋 白是一 种 单 体形 式 的 GT P结 合 蛋 白 , 2 0个 左 右 的 氨基 酸 组成 . b蛋 白家 族 成 员 的 氨基 酸序 列 的相 似性 在 由 0 Ra

不同形态变异类型日本囊对虾的遗传多样性及形态差异分析的开题报告

不同形态变异类型日本囊对虾的遗传多样性及形态差异分析的开题报告

不同形态变异类型日本囊对虾的遗传多样性及形态差异分析的开题报告题目:不同形态变异类型日本囊对虾的遗传多样性及形态差异分析摘要:日本囊对虾(Metapenaeus joyneri)是中国近海重要渔业资源之一,其不同形态变异类型的遗传多样性及形态差异需要深入研究。

本研究旨在利用分子标记和形态学分析方法,探究日本囊对虾不同形态变异类型的遗传多样性及形态差异,并为日本囊对虾资源保护和合理利用提供科学依据。

研究内容:本研究将采用PCR-RFLP和微卫星标记技术,对不同形态变异类型的日本囊对虾群体进行遗传多样性分析,探究其种群遗传结构和遗传多样性水平。

同时,利用形态学测量方法,对不同形态变异类型的日本囊对虾进行形态差异分析,探究其形态多样性及其与遗传多样性之间的关系。

研究意义:日本囊对虾是中国海洋渔业的重要资源之一,其种群遗传结构和遗传多样性水平的分析可以为其资源保护和合理利用提供科学依据。

同时,对不同形态变异类型的日本囊对虾进行形态差异分析,可以深入了解其形态多样性及其与遗传多样性之间的关系,为其分类和演化研究提供重要数据支持。

研究方法:本研究将采集不同形态变异类型的日本囊对虾样本,利用PCR-RFLP和微卫星标记技术对其进行遗传多样性分析,计算遗传多样性参数,如遗传多样性指数、遗传分化指数等,并进行群体遗传结构分析。

同时,采用形态学测量方法对样本进行测量,如体长、体重、鳃弓长度等,探究不同形态变异类型之间的形态差异情况,并进行多元统计分析。

预期结果:本研究可望为不同形态变异类型的日本囊对虾提供遗传多样性和形态差异的详细分析结果,填补了该领域的研究空白。

预计能够为日本囊对虾资源保护和合理利用提供科学依据,为其分类和演化研究提供重要数据支持。

利用引物退火控制技术克隆日本囊对虾性腺差异表达基因

利用引物退火控制技术克隆日本囊对虾性腺差异表达基因

引物退 火控 制技 术 克 隆到 了共 8个精 巢 、 巢的 差异 表 达基 因. 中 4个 为 已知 基 因, 别 为凝 血 卵 其 分 酶敏 感 蛋 白基 因 、 质棒 蛋 白基 因 、 殖 细胞核 抗 原基 因和 泛 素缀合 酶 基 因; 为 未知基 因 , 别 皮 增 4个 分
命名为 M A P . 、 iC 4T MA P 5T和 M A P jC 3 M A P . 、 jC I一 T jC 4O基 因. 用实时定量 P R方法分析 了4个 采 C 未 知基 因在 性腺 发 育过程 的表 达谱 , 结果表 明 : A P 一、 A P 一 MjC 3T jC 4T和 jC 1一 因在 日本 囊 A P 5T基
示 技术 ( D TP R) D R —C 的基 础上 发展 起来 的一 种 克 隆 差 异表 达基 因的新 技 术 . 技 术 可 较 好 地 消 除 初 始 该
收 稿 日期 :0 0 I-5 2 1 一Jl
基础 上 , 本研 究 选 择 2 0对 改 良 的 AC P随 机 引物 分
别对 日本囊对虾( as eau j oi s 精巢和卵 M r pnesa n u ) u p c
贾锡伟 ,沈冰玲 , 张子平 , 艺磊 ,谢芳靖 王
( 美大学水产学院 、 美大 学福建省高校水产科学技术 与食品安全重点实验室 ,福建 厦门 3 12 ) 集 集 60 1
摘要: 了解 日本 囊对 虾 ( r pn es a o i s 性 腺 发 育 及 分 化 的 分 子机 制 , 为 Mas ea u jp nc ) u u 本研 究采 用 改 良的
基金项 目: 幽家 f然科学 金资助 口(0 7 5ห้องสมุดไป่ตู้7 ; 1 3 0 0 9 ) 集荚大学创新闭 队 金 资助项 F(0 8 0 1 j 20 A 0 )

香鱼Apo-14基因的克隆、序列分析及其mRNA表达与盐度适应性的关系

香鱼Apo-14基因的克隆、序列分析及其mRNA表达与盐度适应性的关系

香鱼Apo-14基因的克隆、序列分析及其mRNA表达与盐度适应性的关系曹霄;陈炯;史雨红;陆新江【期刊名称】《应用海洋学学报》【年(卷),期】2011(030)002【摘要】14 kDa载脂蛋白(Apo-14)是鱼类一种特有的载脂蛋白,是鱼类高密度脂蛋白(HDLs)的重要成分,其生物学功能目前还不明确.本研究采用简并引物,从香鱼(Plecoglossus altivelis)肝脏cDNA文库中筛选香鱼Apo-14基因,该基因cDNA 序列全长905个核苷酸,开放阅读框编码一个有144个氨基酸,分子量约为15.9 kDa的蛋白.香鱼Apo-14基因mRNA主要在香鱼肝脏中表达,在肠、肾和鳃中也有少量表达.同源性分析揭示,香鱼Apo-14与已知鱼类中虹鳟(Oncorhynchus mykiss)Apo-14最相似,氨基酸序列同源性为70%.qRT-PCR表明,咸淡水处理组(盐度为10)的肝、肠、肾、鳃中,该基因mRNA均比淡水处理组(盐度为0)明显下调(P<0.05),揭示载脂蛋白Apo-14可能与盐度适应相关.%Apolipoproteins are important structural components of plasma lipoproteins and have been shown to participate in lipoprotein assembly, secretion, processing, and catabolism. 14 kDa apolipoprotein (Apo-14), a specific apolipoprotein in fish, is an important component of high-density lipoproteins, but its biological functions remain unclear. Apo-14 was amplified by a degenerate primer and then sequenced and analyzed using BLASTX, SignalP 3.0, NetNGlye 1.0, YinOYang 1.2, NetPho 2.0, ClustalW, and MEGA 4.1 software. Sixty specimens of healthy ayu were acclimatized to laboratory conditionsfor two weeks before experiments. The fish were then subjected to a progressive salinity change to 10 (BW) in four tanks or to zero (FW) in another four tanks over a period of 3 weeks. RT-PCR was employed to analyze the mRNA expressions in different tissues, and qRT-PCR was employed to analyze the effects of salinity change on the mRNA expression. In this study, a full-length eDNA clone of the Apo-14 gene, 905 bp in size, encoding a protein of 144 amino acids with a molecular weight of 15.9 kDa, was isolated from the fish ayu eDNA library. The ayu Apo-14 amino acid sequence includes a signal peptide of 18 amino acids, a 33-eodon block and 22 amino acid repeats, which is predicted to form amphipathic or-helical and be able to transport lipids and other hydrophobie molecules. RT-PCR analysis showed that Apo-14 was only transcribed in the liver,intestine, kidney and gill and not in the muscle, spleen, and brain. The mRNA level of ayu Apo-14 was highest in the liver. Sequence comparison and phylogenetic analysis showed that ayu Apo-14 was most similar to that of rainbow trout ( Oncorhynchus mykiss); about 70% amino acid sequence identity, qRT-PCR analysis demonstrated that the expressions of Apo-14 mRNA were significantly decreased in ayu liver, intestine, kidney and gill tissues when the fish were transferred from fresh water to brackish water. It is suggested that apo-14 transcription might be down-regulated when subjected to salinity change and related to osmoregulation in salinity adaptation.【总页数】7页(P203-209)【作者】曹霄;陈炯;史雨红;陆新江【作者单位】宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江,宁波,315211;宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江,宁波,315211;宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江,宁波,315211;宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江,宁波,315211【正文语种】中文【中图分类】P735【相关文献】1.日本囊对虾apo-14基因的全克隆及序列分析 [J], 乔莹;王军;钟声平;刘洪涛;毛勇2.香鱼补体成分C9基因的克隆、序列分析及表达 [J], 孔铖将;黄左安;陈炯;史雨红;陆新江3.香鱼巨噬细胞炎性蛋白-2基因的克隆、序列分析及表达 [J], 王世会;史雨红;陈炯4.香鱼RBP基因的克隆、组织表达特征及其与盐度应激相关的表达分析 [J], 陈强;赵桐;史雨红;陈炯5.香鱼抗凝血酶基因(AT)cDNA的克隆、序列分析及组织表达特征 [J], 李长红;陈炯;史雨红;陆新江因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

用微卫星标记分析不同形态变异类型日本囊对虾的遗传多样性

用微卫星标记分析不同形态变异类型日本囊对虾的遗传多样性

用微卫星标记分析不同形态变异类型日本囊对虾的遗传多样性何永琴;苏永全;毛勇;王军【摘要】Marsupenaneus japonicus is one of the important species in shrimp fisheries and aquaculture in China. Two morphologically similar varieties ( I and II )with distinct color banding patterns on the carapace are recognized from the South China Sea. In the present study,9 pairs of microsatellite markers were used to detect the genetic diversities from two varieties of 6 wild stocks of M. japonicus ,i. e. Zhoushan(ZS) stock in Zhejiang province, Xiamen ( XM ) stock in Fujian province, Huilai ( HLQ and HLB ) stock in Guangdong province,Lingshui(LS) stock in Hainan province and Beihai(BH) stock in Guangxi province. The results indicated:a total of 235 alleles were obtained from 9 markers in the 6 stocks. Polymorphic information content(PIC) value per locus was more than 0. 5 indicating the 9 loci seemed highly polymorphic. Basic data statistics showed that the mean observed alleles in each stock were 13. 2 - 17. 7. The mean observed heterozygosity (Ho) ranged from 0. 729 6 to 0. 788 9 and the mean expected heterozygosity (He) ranged from 0.880 5 to 0. 925 1. Average polymorphism information content (PIC) was 0. 851 2 - 0. 903 5, which explained high level of genetic diversity in 6 wild stocks. 42. 6% of stock loci showed significant deviation from the Hardy-Weinbery balance, and there was heterozygosity deficiency in all stocks. The pair-wise genetic differentiation( Fst)in 6 M. japonicus stocks ranged from 0.011 8 to 0. 091 1 .indicating significant genetic differentiation among the 6 stocks.Analysis of molecular variance ( AMOVA) revealed that the variation within stocks was 93.06% .whereas the variation among stocks accounted for 6.94% of the total variation. The genetic distance among stocks ranged from 0. 178 5 to 0. 621 8. Cluster analysis based on DA indicated that HLB ,BH and LS stocks were clustered as one group while ZS ,XM and HLQ were gathered in another group.%选用9个多态性微卫星分子标记,分析我国近海浙江舟山(ZS)、福建厦门(XM)、广东惠来(HLQ及HLB)、海南陵水(LS)及广西北海(BH)日本囊对虾6个群体2种形态变异类型群体间的遗传变异,探讨了日本囊对虾的种质资源状况.结果显示,9个位点在6个日本囊对虾群体中均为高度多态(PIC >0.5),共检测出235个等位基因;6个群体平均等位基因数在13.2~17.7;PIC平均值在0.851 2~0.903 5;平均观测杂合度(Ho)在0.729 6~0.788 9,平均期望杂合度(He)在0.880 5~0.925 1;表明群体遗传多样性水平较高.Hardy-Weinberg平衡检测显示,6个群体普遍存在杂合子缺失现象.分子变异方差分析( AMOVA)结果表明,遗传变异6.94%来自群体间,93.06%来自群体内.由ZS、XM和HLQ群体组成的形态变异类型I与由HLB、LS和BH群体组成的形态变异类型Ⅱ之间的Fst 均大于0.05,发生了中等程度的遗传分化;相同形态变异类型各群体间的Fst均小于0.05,遗传分化不明显.日本囊对虾群体间的遗传距离(DA)为0.178 5~0.6218;UPGMA聚类分析表明,聚类关系符合距离隔离模式,BH群体和LS群体遗传距离最小,亲缘关系最近,它们首先聚在一起,然后与HLB群体聚为一支;XM群体和HLQ群体先聚在一起,再与ZS群体聚为另一支.【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2012(036)010【总页数】9页(P1520-1528)【关键词】日本囊对虾;不同形态变异类型;微卫星标记;遗传多样性【作者】何永琴;苏永全;毛勇;王军【作者单位】厦门大学海洋与地球学院,福建厦门361005;厦门大学海洋与地球学院,福建厦门361005;厦门大学海洋与地球学院,福建厦门361005;厦门大学海洋与地球学院,福建厦门361005【正文语种】中文【中图分类】Q785;S917.4日本囊对虾(Marsupenaneus japonicus)是我国重要的经济养殖虾类。

日本沼虾卵巢表达序列标签分析及生殖相关基因的克隆与表达

日本沼虾卵巢表达序列标签分析及生殖相关基因的克隆与表达

日本沼虾卵巢表达序列标签分析及生殖相关基因的克隆与表达【摘要】:生殖细胞的发生是发育生物学研究的主要内容之一,卵子在卵巢中的形成更是个体发育中极其重要的时期,也是历来备受关注的生殖生物学课题。

与其它模式生物相比,十足类中关于生殖的分子机制方面的研究相对薄弱,淡水虾类尤其突出,迄今对淡水虾类遗传资源的了解极为有限,NCBI数据库中收录的信息量与对虾类相比颇为匮乏。

因此,大量挖掘、获取淡水虾类生殖相关的基因资源,无疑具有重要的意义和潜在的应用价值。

同时,一些功能保守基因的发现,也为遗传背景薄弱的经济物种生殖细胞的研究带来了契机。

本文以日本沼虾为研究对象,通过构建卵巢cDNA文库及表达序列标签分析,鉴别了29个与生殖、发育相关的基因;随后以日本沼虾卵巢发育过程为主线,以获得的表达序列标签为基础,结合同源克隆策略,分离获得了7个与卵母细胞形成、成熟有关的基因,并对其序列特征和时空表达进行了系统地分析。

研究主要包括如下四个部分:1、日本沼虾卵巢cDNA文库的构建及生殖相关基因的鉴别为了研究日本沼虾卵巢发育过程中储存的遗传信息,以卵巢为材料构建了cDNA文库,文库重组率为82.93%,库容量为2.9×10~6,插入片段大小为0.5-3kb。

随机挑取文库中3294个克隆进行5’-3’端测序,获得了3256条高质量的表达序列标签(ESTs),拼接后得到了1514条单基因簇,其中可推测功能的序列占47.5%。

据序列相似性分析,发现了组织蛋白酶B和L、细胞周期蛋白B、周期蛋白依赖性激酶、DEAD-box家族蛋白等29个与生殖、发育相关的基因。

此外,在构建的文库中还发现了与皮质棒形成密切相关的围食膜因子,预测在成熟卵缺少皮质棒结构的沼虾属种类中,这种基因同样存在。

通过卵巢cDNA文库的构建及ESTs分析,初步明晰了与日本沼虾卵巢发育相关的基因,为进一步研究日本沼虾乃至十足类的功能基因组提供了重要的基础资料。

日本囊对虾群体遗传多样性的线粒体序列分析

日本囊对虾群体遗传多样性的线粒体序列分析

日本囊对虾群体遗传多样性的线粒体序列分析孟繁星;徐田军;王日昕【期刊名称】《浙江海洋学院学报(自然科学版)》【年(卷),期】2010(029)004【摘要】对日本囊对虾的3个养殖群体即浙江舟山群体(ZJ)、福建群体(FJ)和台湾群体(TW)的线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅲ基因进行PCR扩增,得到577 bp的核苷酸分析序列,AT含量高于GC含量,发现51个变异位点,其中包括18个简约信息位点,共有31种单倍型.福建群体的核苷酸多样性最高.用MEGA软件中的NJ法构建日本囊对虾3群体与另外5种对虾的系统进化关系,日本囊对虾的3个群体首先聚在一起,再与亲缘关系较近的中国明对虾聚在一起.【总页数】5页(P331-335)【作者】孟繁星;徐田军;王日昕【作者单位】浙江海洋学院海洋科学学院,海洋生物资源与分子工程实验室,浙江舟山,316004;浙江海洋学院海洋科学学院,海洋生物资源与分子工程实验室,浙江舟山,316004;浙江海洋学院海洋科学学院,海洋生物资源与分子工程实验室,浙江舟山,316004【正文语种】中文【中图分类】Q953【相关文献】1.利用线粒体DNA控制区部分序列分析不同地理群体大泷六线鱼遗传多样性 [J], 李莹;王伟;孟凡平;李占东2.基于线粒体COⅠ基因序列分析5个\r巨群体的遗传多样性 [J], 牛宝珍;李娜;刘艳红;王兴龙;陈春丽;文天仙;周亚;杜民3.中国近海条石鲷(Oplegnathus fasciatus)群体遗传多样性线粒体DNA序列分析 [J], 肖永双; 程起群; 任桂静; 李军; 马道远; 徐世宏; 刘清华; 肖志忠; 韩志强4.中国近海条石鲷(Oplegnathus fasciatus)群体遗传多样性线粒体DNA序列分析 [J], 肖永双; 程起群; 任桂静; 李军; 马道远; 徐世宏; 刘清华; 肖志忠; 韩志强5.基于线粒体和核基因DNA序列分析的大河乌猪群体结构和遗传多样性研究 [J], Tang L;晋大鹏因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

日本囊对虾Ran基因的克隆表达与蛋白质GTP结合活性分析

日本囊对虾Ran基因的克隆表达与蛋白质GTP结合活性分析

具 有所有 的小 G蛋 白都具 有 的 I一Ⅳ 4个 保 守 的结 构域 ,这 4个 结构 域 的共有 序列 从 I Ⅳ分别 为 到
G X XG S T 、D X X X K ( ) X G、N( ) X T K D和 E S X .但是 ,有关 对虾 乃 至 海洋无 脊 椎 动物 中 R n基 因 XA a
日本 囊 对 虾 R n基 因的克 隆表 达 与 a
蛋 白质 G P结 合 活 性 分 析 T
韩 芳 ,王 志 勇 ,
( .集美大学水产学院,福建 厦 门 3 12 ;2 1 60 1 .福建省高校水产科学技术 与食品安全重点实验室,福建 厦 门3 12 ) 60 1
[ 要 ]在 日本 囊 对 虾 抑 制 性 差 减 杂 交 ( upes nsbr t ehbii tn S 摘 sp rs o ut ci yr z i ,S H) 研 究 过 程 中 ,首 次 i a v d ao
发现一段经 同源 比较为 R n基因的部分序列 ,在抗病 日本囊对虾 中上调表达.为 了进 一步探索 日本囊对虾 a R n基 因的功能 ,通过 R C a A E—P R的方法克隆得到了 日本 囊对虾 R n基因全长共 1 4 C a 1个碱基,其 中开放 4 阅读框 为 6 5 4 个碱基 ,共编码 25个氨基酸 ,这是首次在海洋无脊椎 动物体 内克 隆到该基 因.还将该基 因 1
饰) 、核 质转运 、有丝 分裂 和减数分 裂 的开始 和结 束 的控制 、纺 锤体 的组 装 、染 色 体 的正确 分 配 、核 膜破裂和 重组 ,起重 要的作用 。 .李 常健 等 细胞 吞噬 活性 ,参与 动物免疫 过程 . 发现 R n在淡 水鱼生 殖细胞 的发 生和发 育 、精 核解 a
凝 中发挥 作用 .除此 以外 ,近年来 有研 究报 道 与 R n同家族 的小 G蛋 白—— R b和 R o蛋 白调控 血 a a h

日本囊对虾过氧化氢酶cDNA全长克隆及表达分析

日本囊对虾过氧化氢酶cDNA全长克隆及表达分析

结 合 1个 血 红 素 辅 基 和 还 原 型 辅 酶 Ⅱ( r e d u c e d f o r m o f
n i c o t i n a mi d e - a d e n i ne di n u c l e o t i d e p h o s p h a t e。 NADPH ) .
e n d s , R AC E ) 技术 , 在 日本 囊 对 虾 ( Ma r s u p e n a e u s j a p o n i c u s ) 肝胰 腺组 织克 隆到过 氧化氢 酶 ( c a t a l a s e , C A T) 基因 c D NA 全序列 . 日本 囊 对 虾 C AT基 因 ( Mj C A丁 ) c D NA 全 长 1 8 0 2 b p , 开 放 阅读框 ( o p e n r e a d i n g f r a me , OR F ) 长1 5 6 3 b p , 编 码 5 2 0个 氨 基 酸 , 理 论 等 电点 为 7 . 2 6 , 分 子质量为 5 8 . 9 k u . 同源建模分 析表 明, Mj C AT蛋 白 分 子 结 构 高 度 保 守 . 同 源 性 比 对后 发现, Mj C AT基 因 氨 基 酸 序 列 与 中 国 明 对 虾 ( F g r 0 p 口 P s c h i n e n s i s ) 相似性最 高 ( 9 4 . 2 ) , 其 次 是 凡 纳 滨 对 虾 ( Li t o p e n a e u s v a n n a me i ) ( 9 0 . 9 ) . 随 后 的 聚类 分 析 表 明 , 其 与 中国明对虾 和凡纳滨 对虾 聚为一支. 荧光 定量结果 显示 , Mj C AT基 因在 检 测 的多 种 组 织 中 均有 表 达 , 其 中 以肝 胰 腺 中表 达 量 最 高 , 其次为眼柄 、 肠、 鳃、 胃、 心脏和血细胞 , 在肌 肉 中 的表 达 水 平 最低 . 白斑 综 合 征 病 毒 ( w h i t e s p o t s y n d r o me v i r u s , WS S V) 感染 1 2 h后 , 肝 胰 腺 Mj C AT 基 因 的 表 达 量 逐 渐升高 , 4 8 h上 调 至 最 高 的表 达 水 平 . 研 究表明 , Mj C AT 基 因在 维 持 机 体 稳 态 及 抗 氧 化 防 御 反 应 过 程 中 发 挥 着 重 要 的

日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus基因组微卫星特征分析

日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus基因组微卫星特征分析
st a 和小 麦 ( i im a siu 等 植 物 基 因组 以 ai ) v Tr cu etห้องสมุดไป่ตู้m) t v
微 卫 星 ,又 称 作 简 单 序 列 重 复 ( i l rp a s mpe e e t
sq e c ,S R) 者 短 串联 重 复 ( h r a d m e e une S 或 s o ttn e r— p a ,S R) e t T ,一 般 是 指 以 1 6个 核 苷 酸 为 重 复 单 ~
复单位 拷 贝数 的变 异能力 分析 表 明 ,变异 系数最 大 的前 3种 重复 类 型 ,均为 4 6核苷 酸 ,较 长 重 — 复单位 类 型有着 较 强的 变异 能力. 微 卫 星 重复 单 位 长度 与其 拷 贝 数的 相 关分 析 表 明 , 二者 呈 负相
关( 一一0 4 8 , 即随 着重 复单 位 长度 的增 加 ,其 拷 贝数 在 减少 . 两 核 苷 酸 重 复 4种 类 型和 三 核 r .2 )
中 国水 产 科 学 研 究 院 黄 海 水 产 研 究 所 , 业 部 海 洋 渔 业 资 源 可 持 续 利 用 重 点 开 放 实 验 室 ,青 岛 2 6 7 农 60 1
摘 要
通过建 立 随机基 因组文 库 和序 列测 序 ,对 日本 囊 对 虾基 因组 进 行 了较 大 规模 的微 卫 星分
6 . 2 ,三核 苷酸 重 复次之 ,约 占 1 . 5 . 两 核 苷酸 重 复 中以 AT 重复 最 为 丰 富 ,约 占两核 苷 9 8 2 3
酸重 复序 列 总数 的 2 . 4 . 微 卫 星在低 拷 贝 区间( 4 ) 量 相对 较 大 ,约 占比例 为 7 . 1 . 重 94 ≤ 2数 2 3

基因组分析的贡献:日本食物标识世界领先

基因组分析的贡献:日本食物标识世界领先

基因组分析的贡献:日本食物标识世界领先
河田孝雄
【期刊名称】《生物产业技术》
【年(卷),期】2009(000)006
【摘要】@@ "本商品使用的虾执行蟹混渔法".谁都熟知的Calbee点心"河童虾煎"的包装标识突然改变了.该公司在2009年4月23日那一周交货的商品都换成了新包装.
【总页数】4页(P16-19)
【作者】河田孝雄
【作者单位】
【正文语种】中文
【相关文献】
1.日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)基因组微卫星特征分析 [J], 栾生;孔杰;王清印;高焕;王伟继;张庆文
2.日本鼓虾与鲜明鼓虾线粒体基因组全序列的分析比较 [J], 申欣;李晓;徐启华
3.基因组分析证实日本人祖先与东南亚古人相关 [J], ;
4.工业互联网OID标识解析国际标准化中国贡献分析 [J], 韩红强;吴东亚;宋林健
5.生态标识对粮食价格的影响及增值贡献分析!——以大米、挂面的特征价格调查为例 [J], 李海燕;蔡银莺
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日本囊对虾原肌球蛋白的原核表达、抗体制备以及组织表达分析

日本囊对虾原肌球蛋白的原核表达、抗体制备以及组织表达分析

日本囊对虾原肌球蛋白的原核表达、抗体制备以及组织表达分析韩芳;王志勇;王晓清【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2012(036)006【摘要】食物过敏是人类常见的一种过敏性疾病,主要由食物中的蛋白质引起.原肌球蛋白(tropomyosin,TPM)是食用虾蟹等甲壳动物引起过敏反应的主要致敏物质.研究从日本囊对虾肌肉组织中克隆了TPM基因,进行了原核表达和蛋白质纯化,并进一步制备了相应的抗体.Western-blotting分析表明原肌球蛋白在日本囊对虾组织中普遍表达,并且肌肉组织中表达量最高而鳃和皮肤组织中表达量最低.研究结果为对虾过敏性疾病的诊断和治疗以及脱敏食品开发等奠定了理论基础.%Food allergy is a representative human allergic disease, which is mainly caused by the protein in food. Up to date, however, there is only a few reports on aquatic food allergy. Tropomyosin(TPM) is the major allergen of eating seafood like shimp and crab to cause hypersensitivity. In this investigation, a TPM gene was cloned from the muscle tissue of shrimp, Marsupenaeus japonicus. Then the TPM was expressed in Escherichia coli and purified. Subsequently the specific antibody was raised using the purified fusion protein (GST-TPM). As revealed by Western-blotting, the TPM was ubiquitously expressed in shrimp tissues and with the highest expression in the muscle and the lowest in gill and skin. These results have laid thefoundation for the specific diagnosis and immunotherapy in shrimp hypersensititivity disease as well as the study on food desensitization.【总页数】5页(P879-883)【作者】韩芳;王志勇;王晓清【作者单位】湖南农业大学动物科技学院,湖南长沙410128;集美大学水产学院,福建厦门361021;湖南农业大学动物科技学院,湖南长沙410128;集美大学水产学院,福建厦门361021;湖南农业大学动物科技学院,湖南长沙410128【正文语种】中文【中图分类】Q785;Q786;S917【相关文献】1.灰飞虱原肌球蛋白的基因克隆、原核表达及多克隆抗体制备 [J], 徐秋芳;陈晴晴;倪海平;李硕;张金凤;周益军2.普通烟草铁氧还蛋白Ⅰ的原核表达、抗体制备及在ToMV侵染烟草体内表达分析 [J], 孙现超;李勇;周常勇;青玲3.日本囊对虾Na-K-2Cl共同转运蛋白基因的克隆与组织表达分析 [J], 刘洪涛;王军;毛勇;乔莹;钟声平;苏永全4.日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)组织蛋白酶D基因克隆及表达分析[J], 张曼;程光平;苏永全;徐伊桦;冯文荣;王军;宋晓红;毛勇5.日本囊对虾组织蛋白酶B基因的原核表达及纯化 [J], 黄媛;王艺磊;张子平;岳亮;冯建军;郭松林;林鹏因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

中国明对虾和日本囊对虾遗传多样性及对虾科系统学初步研究

中国明对虾和日本囊对虾遗传多样性及对虾科系统学初步研究

中国明对虾和日本囊对虾遗传多样性及对虾科系统学初步研究本文以中国沿海两种对虾类中国明对虾和日本囊对虾为研究对象,采用线粒体COI基因片段和控制区序列等标记技术开展了这两种虾类的群体遗传多样性研究,系统研究了这两种虾类的遗传多样性和群体遗传结构并探讨了其群体历史动态。

另外,利用核基因ITS1序列和线粒体全长以及nd5假基因对对虾科虾类进行了系统分析,主要研究结果如下:1、为了检测中国明对虾的群体遗传结构合群体历史动态,我们对中国明对虾分布区内5个群体共93个个体的线粒体细胞色素氧化酶I亚基基因(COI)序列和控制区序列(CR)进行了测定和分析。

在COI序列中,共检测到20个多态性核苷酸位点,定义了20种单倍型,其核苷酸多态度和单倍型多态度都很低(H=0.4816±0.0639,π=0.0846±0.0711%)。

长993bp的CR序列中,共检测到84个多态性核苷酸位点,定义了68种单倍型,其单倍型多态度较高(0.95±0.03-0.99±0.02),而核苷酸多态度中等或较低(0.66±0.36%-0.84±0.46%)。

群体分化指数FST值(FST=-0.02343-0.02112)和分子变异分析(AMOVA)都表明不同群体间的中国明对虾还没有出现明显的遗传分化。

IM的结果显示中国明对虾朝鲜半岛西海岸群和黄渤海沿岸群出现分化,用IM所估算的分化时间约为12,800(7,400-18,600)前。

因此,中国明对虾不同地理群体间分化很小或不存在遗传分化的原因是由于分化的时间尚短,不足以在不同群体间形成明显的遗传结构。

中性检验和核苷酸不配对分布都表明中国明对虾经历了群体扩张事件。

中国明对虾较低的遗传多样性水平、简单的基因谱系结构、星状结构的单倍型网络关系图和检验显著的负的Tajima’D值都提示分布于黄渤海的中国明对虾群体可能经历过近期的瓶颈效应或奠基者效应。

日本囊对虾的遗传育种研究进展

日本囊对虾的遗传育种研究进展

日本囊对虾的遗传育种研究进展袁瑞鹏;郑静静;刘建勇;蒋湘【期刊名称】《广东海洋大学学报》【年(卷),期】2016(036)001【摘要】日本囊对虾是我国优质对虾资源。

综述日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)的种质资源、选择育种、多倍体诱导育种、分子标记辅助育种等方面的研究进展,总结虾类杂交育种、转基因育种研究现状,对日本囊对虾相关研究进行展望;针对当前日本囊对虾遗传育种研究落后、数量遗传学应用不够、育种工艺不足的现状,认为在日本囊对虾遗传改良时,应用高新分子标记辅助育种技术与传统选择育种相结合的综合育种技术是良种培育的有效途径。

%The kuruma prawn, Marsupenaeus japonicus, is an outstanding framed shrimp species with a high economic value. This paper reviews the researches carried out for breedingofM.japonicus, with variety resources, selection breeding, multi-chromosome breeding and molecular marker-assisted selection breeding. Through making a conclusion of researches on hybrid breeding and genetic engineering breeding of shrimp, breeding techniquesinM.japonicusis predicted.At present, many problems have found in breeding improved ofM.japonicus, such as theunderdevelopment of genetic breeding researches, the lack of breeding technology, not enough application of quantitative genetics. Therefore, it has been suggested that the combination of both conventional breeding methods and advanced marker-assisted selection is an effective way of breedingM. japonicus.【总页数】5页(P98-102)【作者】袁瑞鹏;郑静静;刘建勇;蒋湘【作者单位】广东海洋大学水产学院,广东湛江524025;广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025;广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025;湛江国联水产开发股份有限公司,广东湛江 524022【正文语种】中文【中图分类】S66.12+5.2【相关文献】1."十三五"我国茄子遗传育种研究进展 [J], 刘富中;舒金帅;张映;陈钰辉;连勇;田时炳2.鲍的遗传育种研究进展 [J], 游伟伟;骆轩;柯才焕3.DNA分子标记技术在菠菜遗传育种中的应用研究进展 [J], 彭枫;张莹;陈珂;戴雨柔;李亚兵;蔡晓锋4.北京油鸡遗传育种与品质研究进展 [J], 赵灵改;吕学泽;刘毅;王梁;杨卫芳;秦琛强;李兴民5.2020年国内外家兔遗传育种与繁殖研究进展 [J], 王源朗;丁海生;赵辉玲;黄冬维因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

香鱼Apo-14基因的克隆、序列分析及其mRNA表达与盐度适应性的关系

香鱼Apo-14基因的克隆、序列分析及其mRNA表达与盐度适应性的关系
DOI 1 . 9 9 J I S 1 0 — 1 0. 0l . 2 0 8 : 0 3 6 / , S N. 0 0 8 6 2 0 . 0 1
中 图分 类 号 :7 5 I 3 "
文 献标 识 码 : A
文章 编 号 :0086 (0 10 -2 3 7 10 —10 2 1 ) 2 0 - 0 0
( aas sa rt i l ) 、 鳟 ( n o y cu C rs u tau gb i ¨ 虹 i t s eo O cr nh s h
高时 , 体 主要 通 过 调 节脂 质代 谢 , 鱼 以满 足渗 透 压
调 节所 需 的 能 量 . 浆 脂 蛋 自 在 脂 类 运 输 和 代 血 谢 中起 重要 作 用 , 中 高 密 度脂 蛋 白 ( D s 含 量 其 H L) 最 高 , 鱼类 血浆 中 H [ 而 D S的含 量 又 明 显 高 于其 他 脊椎 动 物 中 的含量 . 载脂 蛋 白 ( p ) A o 是脂 蛋 白 的 重要 组 成 成 分 , 与脂 类 摄 人 、 泌 和 转 运 . 参 分 此 外, 载脂 蛋 白 还 拥 有 抗 氧 化 和 抗 炎 症 等 功 能 . 目前研 究 的 鱼类 H ) s I 的载 脂 蛋 白主 要有 2类 , L 一 类 是 与 哺乳 类 的 A oA I 脂 蛋 白具 有 较 高 同 源 p — 载 性 的分 子 量约 为 2 D 8 k a的 载 脂 蛋 白 , 一 类 是 与 另 哺乳 类 的 A o A I 有 远 源 关 系 的 分 子 量 约 为 l p — 1 4 k a的载 脂 蛋 白 ( p 一4) . p 一4 目前 仅 在 鱼 D A o1 A o1 类 中有发 现 一 , 且 其 含 量 仅 次 于 A oA IA o 并 p —, p 一 1 4最早 在欧 洲鳗 鲡 ( n ul jp nc ) A g ia ao i 血浆 HD s中 l a L 分离 得 到 . 后 , 用 同源 克 隆 和 E T等 分 子 生 此 采 S 物学技 术 , 们 已经 克 隆 了斜 带石 斑 鱼 ( pnp e s 人 E iehl u

日本囊对虾胸腺肽基因及其日本囊对虾胸腺肽的制备方法与应用[发明专利]

日本囊对虾胸腺肽基因及其日本囊对虾胸腺肽的制备方法与应用[发明专利]

专利名称:日本囊对虾胸腺肽基因及其日本囊对虾胸腺肽的制备方法与应用
专利类型:发明专利
发明人:阮灵伟,施泓,徐洵,马金友
申请号:CN201310339573.2
申请日:20130806
公开号:CN103361356A
公开日:
20131023
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:日本囊对虾胸腺肽基因及其日本囊对虾胸腺肽的制备方法与应用,涉及日本囊对虾胸腺肽基因的核苷酸序列以及其所编码的氨基酸序列。

日本囊对虾胸腺肽基因包括日本囊对虾胸腺肽mjthm4基因、日本囊对虾胸腺肽mjthm3基因和日本囊对虾胸腺肽mjthm2基因。

一个日本囊对虾总RNA的提取的步骤;一个日本囊对虾cDNA反转录的步骤;一个日本囊对虾胸腺肽基因的PCR扩增和序列分析的步骤;一个日本囊对虾胸腺肽的重组表达的步骤。

所述日本囊对虾胸腺肽可用于制备抗对虾病毒药物。

通过同源重组表达三种胸腺肽,可克服分离纯化过程复杂繁琐、产量低等不足,为该蛋白在生物、食品、医药、农业等研究领域的广泛应用奠定基础。

申请人:国家海洋局第三海洋研究所
地址:361005 福建省厦门市思明区大学路178号
国籍:CN
代理机构:厦门南强之路专利事务所(普通合伙)
代理人:马应森
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பைடு நூலகம்
1 材 料 与 方 法
1 . 1 材料 以鲜活 的 日本 囊对 虾肝胰 脏组织 为 实验材 料 , 提取 总 R N A。反 应 中用 的 d N T P、 P C R缓 冲液 、
T a q酶 、 限制性 内切 酶 、 G e n e R u l e r D N A M i x t u r e l a d d e r 、 T r i z o l 试 剂 和琼 脂 糖均 购 自 MB I F e r m e n t a s公 司 ; 反
的发育 、 增 强应激 性 - 7 ] 以及幼 虾的 生长 和 蜕 皮过 程 均 有 显 著 的影 响 J 。因此 , 清 楚 了解对 虾 脂 质 代谢 和运输 过程 , 对于 E t 本囊 对 虾 育种 、 品种 改 良以及 养 殖 过 程 中饲养 成本 的控 制 均 具 有 重 要 的 指 导 意义 。
鳗鲡( A n g u i l l aj a p o n i c a ) 中鉴定 获得 的 。随后 , 在鲤 ( C y p r i n u s c a r p i o ) 、 河豚 ( T a k f i u g u r u b r i p ) 、 橙 点石 斑
鱼( E p i n e p h e l u s b l e e k e r i ) 、 草鱼 ( C t e n o p h a r y n g o d o n i d e l l a ) 以及 黑头 呆鱼 ( P i m e p h a l e s p r o m e l a s ) 等1 1 种 硬骨鱼 中都 有发 现 J 。其 主要 作用 是参 与鱼类 各个 组织 的代谢 , 特 别是 参 与鱼 的消化 器 官 内脂质 运输 与 代谢 作
用, 维持脂 质代谢 的稳 态与 平衡 。 日本囊 对虾 ( Ma r s u p e n a e u s j a p o n i c u s ) 广泛 分布 于印度 、 澳 大利 亚 、 红海、 坦桑 尼 亚 、 菲律 宾 及 日本 的东 南沿海 海域 , 是我 国重要 的经济养 殖虾类 。已有研 究表 明 , 富含 脂类 的食 物 对 虾类 的 体质 量增 长 J 、 性 腺
目前 , 对 于虾 类养 殖过程 中的脂类 营养 代 谢 以及 脂 类运 输 途 径 的研 究 较 少 。笔 者 通 过基 因克 隆 , 首 次在
虾类体内得到了载脂蛋 白a p o l i p o p r o t e i n - 1 4 ( a p o . 1 4 ) 基因的全长序列 , 并与其他物种的蛋 白序列进行了比 对 分析 , 旨在 为深入 研究该 基 因 的具 体功 能奠定 基础 。
中图 分 类 号 : Q 7 8 1 文献标志码 : A
载脂蛋 白( a p o l i p o p r o t e i n ) 是 动物 体 内脂质 的主要 载体 , 除 了在血 脂 的运输 中起重 要 作用 外 , 还 可 以作
为 某些 生物 酶 的辅 助 因子 、 配 体结合 受 体 蛋 白和 脂 质转 运 载 体 , 以调 节 生 物体 组 织 内脂 蛋 白的代 谢 和 吸 收l l 。载脂 蛋 白基 因编码 的 1 4 k D a载脂蛋 白作 为高 密度 脂 蛋 白 H D L的重 要组 成 成 分 , 最早 是 在 日本
日本 囊 对 虾 a p o 一 1 4基 因 的 全 克 隆 及 序 列 分 析
乔 莹, 王 军 , 钟声平 , 刘 洪涛 , 毛 勇
( 厦 门大学 海洋与地球学 院 , 福建 厦门 3 6 1 0 0 5 )
摘 要 : 以 日本 囊 对 虾 ( Ma r s u p e n a e u s j a p o n i c u s ) 肝胰腺组 织为实 验材料 , 提取 总 R N A, 通过 3 以及 5 一 R A C E
转 录试 剂 盒 , 胶 回收试 剂盒 购 自 T a K a R a公 司。
1 . 2 RN A提取
取0 . 5 g对虾 肝胰 脏置 于预冷 的玻璃 匀浆 器 中 , 加入 3 0 0 L的 T i f z o l 进行组 织 匀浆 ; 再
加入 3 0 0 t x L的氯 仿均 匀混合 , 4℃ 3 2 0 0 0 r・ m i n 离心 1 5 m i n ; 小心 吸取 上 清液 , 移 人 离心 管 中 , 再 加入 相 同体 积预 冷 的异丙醇 , 4℃ 3 2 0 0 r ・ m i n 离心 1 5 m i n ; 移去 上清 液 , 用1 mL = 7 0 % 的乙醇 冲洗沉 淀 2 次, 加入 适量 经 D E P C ( 焦碳 酸 二 乙酯 ) 处理 过 的蒸 馏水 溶解 , 一 8 0℃保存 。
第 4卷 第 1 期
2 0 1 3年 3月
热 带 生 物 学 报
J oURNAL oF TRoPI CAL BI oLoGY
Vo l J 4 No .1 Ma t . 2 0 1 3
文章编号 : 1 6 7 4— 7 0 5 4 ( 2 0 1 3 ) 0 1 — 0 0 1 7— 0 8
基 因克隆技术 , 首次在 日本囊对虾 中克隆到载脂蛋 白 a p o l i p o p r o t e i n 一 1 4 ( a p o 一 1 4 ) 基 因的全长序列 , 包含完 整的 O R F以及 3 一 U T R和 5 U T R。 日本囊 对虾 a p o . 1 4 e D N A序列 全长 为 7 8 4 b p , 其中 O R F长 度为 4 2 0 b p , 编码 1 3 9个氨基酸。对虾 a p o 一 1 4氨基酸序列与其他鱼类 a p o 一 1 4氨基酸序列有较 高的相似性 。 关键词 :日本囊对虾 ; 载脂蛋 白 ; a p o 一 1 4 ; 克 隆; 序列 分析
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