日本囊对虾apo-14基因的全克隆及序列分析

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日本 囊 对 虾 a p o 一 1 4基 因 的 全 克 隆 及 序 列 分 析
乔 莹, 王 军 , 钟声平 , 刘 洪涛 , 毛 勇
( 厦 门大学 海洋与地球学 院 , 福建 厦门 3 6 1 0 0 5 )
摘 要 : 以 日本 囊 对 虾 ( Ma r s u p e n a e u s j a p o n i c u s ) 肝胰腺组 织为实 验材料 , 提取 总 R N A, 通过 3 以及 5 一 R A C E
1 材 料 与 方 法
1 . 1 材料 以鲜活 的 日本 囊对 虾肝胰 脏组织 为 实验材 料 , 提取 总 R N A。反 应 中用 的 d N T P、 P C R缓 冲液 、
T a q酶 、 限制性 内切 酶 、 G e n e R u l e r D N A M i x t u r e l a d d e r 、 T r i z o l 试 剂 和琼 脂 糖均 购 自 MB I F e r m e n t a s公 司 ; 反
中图 分 类 号 : Q 7 8 1 文献标志码 : A
载脂蛋 白( a p o l i p o p r o t e i n ) 是 动物 体 内脂质 的主要 载体 , 除 了在血 脂 的运输 中起重 要 作用 外 , 还 可 以作
为 某些 生物 酶 的辅 助 因子 、 配 体结合 受 体 蛋 白和 脂 质转 运 载 体 , 以调 节 生 物体 组 织 内脂 蛋 白的代 谢 和 吸 收l l 。载脂 蛋 白基 因编码 的 1 4 k D a载脂蛋 白作 为高 密度 脂 蛋 白 H D L的重 要组 成 成 分 , 最早 是 在 日本
鳗鲡( A n g u i l l aj a p o n i c a ) 中鉴定 获得 的 。随后 , 在鲤 ( C y p r i n u s c a r p i o ) 、 河豚 ( T a k f i u g u r u b r i p ) 、 橙 点石 斑
鱼( E p i n e p h e l u s b l e e k e r i ) 、 草鱼 ( C t e n o p h a r y n g o d o n i d e l l a ) 以及 黑头 呆鱼 ( P i m e p h a l e s p r o m e l a s ) 等1 1 种 硬骨鱼 中都 有发 现 J 。其 主要 作用 是参 与鱼类 各个 组织 的代谢 , 特 别是 参 与鱼 的消化 器 官 内脂质 运输 与 代谢 作
的发育 、 增 强应激 性 - 7 ] 以及幼 虾的 生长 和 蜕 皮过 程 均 有 显 著 的影 响 J 。因此 , 清 楚 了解对 虾 脂 质 代谢 和运输 过程 , 对于 E t 本囊 对 虾 育种 、 品种 改 良以及 养 殖 过 程 中饲养 成本 的控 制 均 具 有 重 要 的 指 导 意义 。
Baidu Nhomakorabea
转 录试 剂 盒 , 胶 回收试 剂盒 购 自 T a K a R a公 司。
1 . 2 RN A提取
取0 . 5 g对虾 肝胰 脏置 于预冷 的玻璃 匀浆 器 中 , 加入 3 0 0 L的 T i f z o l 进行组 织 匀浆 ; 再
加入 3 0 0 t x L的氯 仿均 匀混合 , 4℃ 3 2 0 0 0 r・ m i n 离心 1 5 m i n ; 小心 吸取 上 清液 , 移 人 离心 管 中 , 再 加入 相 同体 积预 冷 的异丙醇 , 4℃ 3 2 0 0 r ・ m i n 离心 1 5 m i n ; 移去 上清 液 , 用1 mL = 7 0 % 的乙醇 冲洗沉 淀 2 次, 加入 适量 经 D E P C ( 焦碳 酸 二 乙酯 ) 处理 过 的蒸 馏水 溶解 , 一 8 0℃保存 。
用, 维持脂 质代谢 的稳 态与 平衡 。 日本囊 对虾 ( Ma r s u p e n a e u s j a p o n i c u s ) 广泛 分布 于印度 、 澳 大利 亚 、 红海、 坦桑 尼 亚 、 菲律 宾 及 日本 的东 南沿海 海域 , 是我 国重要 的经济养 殖虾类 。已有研 究表 明 , 富含 脂类 的食 物 对 虾类 的 体质 量增 长 J 、 性 腺
基 因克隆技术 , 首次在 日本囊对虾 中克隆到载脂蛋 白 a p o l i p o p r o t e i n 一 1 4 ( a p o 一 1 4 ) 基 因的全长序列 , 包含完 整的 O R F以及 3 一 U T R和 5 U T R。 日本囊 对虾 a p o . 1 4 e D N A序列 全长 为 7 8 4 b p , 其中 O R F长 度为 4 2 0 b p , 编码 1 3 9个氨基酸。对虾 a p o 一 1 4氨基酸序列与其他鱼类 a p o 一 1 4氨基酸序列有较 高的相似性 。 关键词 :日本囊对虾 ; 载脂蛋 白 ; a p o 一 1 4 ; 克 隆; 序列 分析
目前 , 对 于虾 类养 殖过程 中的脂类 营养 代 谢 以及 脂 类运 输 途 径 的研 究 较 少 。笔 者 通 过基 因克 隆 , 首 次在
虾类体内得到了载脂蛋 白a p o l i p o p r o t e i n - 1 4 ( a p o . 1 4 ) 基因的全长序列 , 并与其他物种的蛋 白序列进行了比 对 分析 , 旨在 为深入 研究该 基 因 的具 体功 能奠定 基础 。
第 4卷 第 1 期
2 0 1 3年 3月
热 带 生 物 学 报
J oURNAL oF TRoPI CAL BI oLoGY
Vo l J 4 No .1 Ma t . 2 0 1 3
文章编号 : 1 6 7 4— 7 0 5 4 ( 2 0 1 3 ) 0 1 — 0 0 1 7— 0 8
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