曙光集群用户使用手册
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1.登录和文件传输
登录方式为ssh，与telnet功能类似，推荐的登录工具为putty或者Secure Shell （，绿色版无需安装）
在地址栏输入本集群的登录地址(node1对应的局域网IP)，点击“打开”，就会出现登录窗口，输入用户名、密码即可。
文件传输为sftp，与传统ftp类似，但其协议更安全可靠，推荐工具为filezilla。
（，绿色版无需安装）
输入登录地址，输入用户名和密码，端口填22（本软件支持ftp，端口为21），点击快速连接，即可使用，操作办法与常用ftp工具类似。
2.图形窗口支持
Linux推荐使用vnc。vnc可以将用户的操作状态保持在服务器端，即使断开连接也不会影响到正在进行的操作、计算等。
登录到linux服务器中，在命令行运行vncserver。第一次运行时需要输入VNC登陆用的密码：
根据提示输入新的vnc密码。此密码与用户登录密码无关，将在登录vnc时需要。
此处提示的node1:2即为vnc成功打开的端口。
运行vncclient，输入登录服务器地址和端口号，点确定，输入前面设置的密码，即进入了图形窗口。
注意：
1、在第一次启动了vncserver之后，vnc的连接一直可用，全部图形窗口保持在Linux 服务器上。因此，只在每次服务器重新启动后运行一次vncserver即可，由于用户较多，请勿启动多个。
2、如果需要使用node2的图形界面，可执行ssh -X node2。
3.作业提交
3.1.Fluent
3.1.1.图形方式运行
首先通过VNC登陆到图形界面，如果没有Terminal的话在桌面点击左键选择Xterm，输入以下命令即可运行：
此处myhosts为用户指定的host文件，内容如下所示：
node1
node1
node1
node1
node2
node2
node2
node2
-t8即指定8个核心参与计算，分别为node1上的4个核心和node2上的4个核心。
在图形界面下导入cas和data文件，修改和设置边界条件等并计算 (和在windows下操作单机版Fluent相同，略)：
注：通过VNC使用图形界面方式运行fluent时，无需保持PC机与服务器的连接，只要vncserver没有重新启动，即可随时连接到原有的窗口。
3.1.2.命令行方式运行
建立script1文件：
script1内容如下：
（注：其中为cas文件名，根据实际进行修改；solve/iterate 25 表示迭代25步，也可根据需要修改步数。）
用命令行进行fluent计算：
此处myhosts为用户指定的host文件，内容如下所示：
node1
node1
node1
node1
node2
node2
node2
node2
-t8即指定8个核心参与计算，分别为node1上的4个核心和node2上的4个核心。
3.1.3.作业调度方式运行
注：PBS只持Fluent命令行运行方式的作业提交
1．编译脚本script1，内容如下（与上面脚本运行方式相同）：
file/rcd 25
/file/wcd
parallel/timer/usage
exit
yes
2．编辑pbs脚本，内容如下：
#!/bin/bash
#PBS -N job1-8cpu
#PBS -l nodes=1:ppn=8
#PBS -j oe
INPUTFILE=script1
OUTPUTFILE=
cd $PBS_O_WORKDIR
#
# indicate using ib protocal and the udapl way. t8 indicates using
# 8 processors
#
NP=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l`
date
fluent 3d -t$NP -cnf=$PBS_NODEFILE -g -i $INPUT >& $OUTPUT
date
exit 0
提交作业：qsub
用qstat -a和pbsnodes -a以及top命令查看作业是否正常排队运行。
注：红色字体部分需要根据实际情况改动，黑色字体为固定格式的内容。
3.1.
4.获取计算结果
1．如果用图形界面的方式运行fluent，可以在菜单中选择选择保存dat文件到当前工作目录或其他某个目录下，然后用ftp软件将dat文件下载到终端pc机上，即可进行后处理。
2．如果用命令行的方式运行fluent， dat文件自动保存到当前目录，文件名由script1文件的内容决定（例如“file/wcd ”则表示dat文件为），用软件将dat文件下载到终端pc机上，即可进行后处理。
3.2.Ansys作业
3.2.1.图形方式运行
通过vnc登录以后，运行launcher121，即可进入ansys界面，选择相关的模块点击run 即可。
3.2.2.命令行方式运行
在命令行方式下，不能进行交互的图形操作，所有的命令需要通过命令流来实现。
假设写好的命令流文件为，运行方式如下：
单节点：
ansys121 -np 16 -i >& &
多节点运行：
ansys121 -dis -machines node1:16:node2:16 -i >& &
3.2.3.作业调度方式运行
编写一个pbs脚本如下所示：