植物病毒的分类 - qcp的日志 - 网易博客

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植物病毒的分类 - qcp的日志 - 网易博客

植物病毒的分类工作由国际病毒分类委员会(Interrnational Committee on Taxonomy ofviruses,ICTV)植物病毒分会负责。随着病毒学研究水平的提高,有关病毒基本性质的知识不断更新和丰富,病毒学家们对病毒分类研究也不断深入,新的病毒属(组)不断增加,尤其是病毒分类标准、指标内容越来越明确,且接近病毒的本质。经过20多年的不断修改、充实,到2000年,已报到的植物病毒977种,有关它们的分类系统ICTV先后发表《病毒分类与命名》报告七次,在第六次报告中,植物病毒与动物病毒和细菌病毒一样实现了按科、属、种分类。近代病毒分类体系趋于将病毒这类非细胞结构的分子寄生物列为独立的“病毒界”,下分为RNA病毒和DNA病毒两大类。但为方便及习惯,仍按寄主种类分为动物病毒、植物病毒、微生物病毒等实用系统分类。

一、植物病毒的分类

(一)分类依据植物病毒分类依据的是病毒最基本、最重要的性质:①构成病毒基因组的核酸类型(DNA或RNA);②核酸是单链(single strand, ss)还是双链(double strand,ds);③病毒粒体是否存在脂蛋白包膜;④病毒形态;⑤核酸分段状况(即多分体现象)等。

根据上述主要特性,将977种植物病毒分在15个科73个属中(包括24个未定科的悬浮属),各科(属)名称见表4—3,各科(属)形态及核酸类型见图4—11。

表4-3植物病毒的科、属学名

根据ICTV病毒分类第七次报告(2000年)加以整理。

在上述73个属的977种植物病毒中,DNA病毒只有2个科,11个属;RNA 病毒有13个科,62个属,834种,占病毒总数的85.36%。根据核酸的类型和链数,可将植物病毒分为六大类群:第一类群是双链DNA病毒,有6个病毒属;第二类群为单链DNA病毒,5个属;第三类群为双链RNA病毒,2个科,6个病毒属;第四类群为负单链RNA病毒,包括2个科,5个病毒属;第五类群为正单链RNA病毒,涉达7个科,49个病毒属。新增加反转录ssRNA类群,包括2个科2个属。

(二)分类方法在植物病毒的分类系统中,多数学者认为病毒“种”的概念还不够完善,采用门、纲、目、科、属、种的等级分类方案还不成熟,所以近代植物病毒分类上的基本单位不称为“种(species)”而称为成员(member),近似于属的分类单位称为组(group)。2000年第七次报告,则进一步明确了科、属、种关系,科下属,属(genus)下为典型种(type species)、种(species)和暂定种(tentative species)。有些属下还保留有亚组(subgroup)的分类地位。在一个属内的病毒成员有共同特性,可用于鉴别,如马铃营Y病毒属病毒有风轮状内含体等。

随着研究的进展,新病毒种的发现、病毒分子核酸序列的同源性、病毒生物学特性的揭示,会影响植物病毒的分类系统。如在第七次分类报告中,考虑到原马铃薯Y病毒组成员很多(196个种),传播方式各异,故将其上升为马铃薯Y病毒科(Potyviridae),按照传播介体的不同分为6个属。

另外,在病毒的研究过程中,还相继发现了一些与病毒相似、但个体更小、特性稍有差别的病毒类似物。其中一些要依赖其它病毒才能存在的小病毒或核酸,称为卫星(satellite),它们依赖的病毒称为辅助病毒(heIper virus)。它们的核酸与辅助病毒很少有同源性,且影响辅助病毒的增殖;其中自身能编码衣壳蛋白的称为卫星病毒,不能编码衣壳蛋白的称为卫星核酸。由于植物病毒的卫星核酸都是RNA,故称为卫星RNA(satellite RNA,sRNA)。另外一些有衣壳蛋白、RNA部分具有双链结构的称为类病毒(viroid);含有线状和环状两种RNA的称为拟病毒(virusoid);无核酸只有蛋白质的侵染因子称为阮病毒(prion)。为了分类上的方便,将这些病毒都归入亚病毒(subviruses),而由核蛋白体构成的病毒则称为真病毒(euviruses)。

(三)病毒的株系株系(strain)是病毒种下的变种,具有生产上的重要性。当分离到一种病毒,但还未完全了解其特征、不能确定分类地位时,常称其为“分离物”或“分离株”(isolate)。

二、植物病毒的命名

植物病毒中的标准名称,仍以寄主英文俗名加上症状来命名。的一个词的首写字母要大写,后面的词除专用词汇(如地名等)外首写字母一般不大写,如烟草花叶病毒为Tobacco mosaic virus,缩写为TMV;黄瓜花叶病毒为Cucumber mosaic virus,缩写为CMV。属名为专用国际名称,常由典型的寄主名称(英文或拉丁文)缩写十主要特点描述(英文或拉丁文)缩写十virus拼组而成。如:黄瓜花叶病毒属的学名为Cucu—mo—virus;烟草花叶病毒属为Toba—mo—virus。即植物病毒属的结尾是一virus,科、属名书写时应用斜体,凡是经ICTV批准的确定种(definitive species)的名称均应用斜体书写或打印,而暂定种(tentative species)或属名未定的病毒名称暂用正体。

类病毒(viroid)在命名时遵循相似于病毒的规则,因缩写名易与病毒混淆,新命名规则规定类病毒的缩写为Vd,如马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viroid)缩写为PSTVd。

工作由国际病毒分类委员会(Interrnational Committee on Taxonomy ofviruses,ICTV)植物病毒分会负责。随着病毒学研究水平的提高,有关病毒基本性质的知识不断更新和丰富,病毒学家们对病毒分类研究也不断深入,新的病毒属(组)不断增加,尤其是病毒分类标准、指标内容越来越明确,且接近病毒的本质。经过20多年的不断修改、充实,到2000年,已报到的植物病毒977种,有关它们的分类系统ICTV先后发表《病毒分类与命名》报告七次,在第六次报告中,植物病毒与动物病毒和细菌病毒一样实现了按科、属、种分类。近代病毒分类体系趋于将病毒这类非细胞结构的分子寄生物列为独立的“病毒界”,下分为RNA病毒和DNA病毒两大类。但为方便及习惯,仍按寄主种类分为动物病毒、植物病毒、微生物病毒等实用系统分类。

一、植物病毒的分类

(一)分类依据植物病毒分类依据的是病毒最基本、最重要的性质:①构成病毒基因组的核酸类型(DNA或RNA);②核酸是单链(single strand, ss)还是双链(double strand,ds);③病毒粒体是否存在脂蛋白包膜;④病毒形态;⑤核酸分段状况(即多分体现象)等。

根据上述主要特性,将977种植物病毒分在15个科73个属中(包括24个未定科的悬浮属),各科(属)名称见表4—3,各科(属)形态及核酸类型见图4—11。

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