华大基因BGI
华大建库流程
华大建库流程详解华大基因(BGI)是全球领先的基因组学研究机构之一,拥有先进的高通量测序平台和丰富的经验,能够为科研机构、医疗机构、农业企业等客户提供高质量的基因组学数据。
华大建库流程是指将样本中的DNA或RNA提取、文库构建、测序和数据分析等步骤串联起来的一系列工作流程。
本文将详细介绍华大建库流程的步骤和流程。
1. 样本提取和质量检测华大建库流程的第一步是从样本中提取DNA或RNA,并进行质量检测。
样本可以是血液、组织、细胞、土壤、水体等。
提取DNA或RNA的方法根据样本的不同而有所区别,常用的方法有酚氯仿法、磁珠法、柱子法等。
提取的DNA或RNA样本需要进行质量检测,包括浓度检测和完整性检测。
常用的测量方法有紫外分光光度法和凝胶电泳法。
2. 文库构建文库构建是华大建库流程的核心步骤,它将提取的DNA或RNA样本转化为可以进行高通量测序的文库。
文库构建的具体步骤如下:2.1 DNA或RNA片段剪切首先,将提取的DNA或RNA样本通过酶切等方法剪切成适当的片段。
DNA片段的长度通常为200-800碱基对,而RNA片段的长度则根据实验的需要而定。
2.2 末端修复和连接将片段的末端进行修复,以使其适合连接测序引物。
修复的方法包括使用聚合酶填充末端和连接适配体。
适配体是一种含有特定序列的DNA片段,它可以与测序引物结合,并提供测序反应所需的序列。
2.3 PCR扩增通过PCR扩增来增加文库的数量。
PCR扩增的条件需要根据实验的要求进行优化,以保证文库的质量和数量。
2.4 文库纯化通过凝胶电泳或磁珠法等方法,将PCR产物中的目标文库分离出来,并去除杂质。
2.5 文库质检对纯化后的文库进行浓度检测和完整性检测,确保文库的质量符合要求。
3. 测序文库构建完成后,下一步是进行测序。
华大基因拥有世界领先的高通量测序平台,可以进行全基因组测序、转录组测序、外显子测序、甲基化测序等多种测序服务。
3.1 测序准备在进行测序之前,需要对文库进行一系列的处理,包括文库放大、文库纯化和文库浓度调整等。
单细胞送样建议-BGI-华大基因
单细胞送样建议文件编号:SOP-SMM-016 版本号:A1生效日期:2016-10-31目录第一章动物单细胞/微量细胞自行分选建议 (2)1单细胞重测序 (2)1.1 样品要求 (2)1.2 样品准备 (2)2单细胞全基因组甲基化 (2)3单细胞转录组/RNA-SEQ (SMART-SEQⅡ) (3)3.1 样品要求 (3)3.2 样品准备 (4)4样品打包及寄送 (4)5细胞分选的环境及操作要求 (4)第二章口吸管法分离单细胞的送样建议 (6)1细胞系样品 (6)2血液细胞样品 (6)3组织样品 (7)4样品处理其他说明 (7)第一章动物单细胞/微量细胞自行分选建议1单细胞重测序1.1样品要求主要针对人和小鼠样品。
若为其他物种,需要提供对应物种看家基因检测引物。
1.2样品准备1.2.1将细胞分选至装有3~5μL PBS缓冲液的200μL PCR管中,每管细胞数目不得超过1000个。
不建议另外加入其他细胞保护剂,如有特殊情况,加入其他试剂或者经过其他处理,请在样品信息单中备注。
1.2.2细胞分离完成后,请于10分钟内放入-80℃冰箱或者干冰保存。
可暂存于-20℃,但保存时间不得超过3小时。
1.2.3每个细胞样品建议送3管重复,以保证后续实验成功率。
例如:需测序某一细胞样品数为5个,则建议送样细胞样品数为15。
1.2.4除提供细胞样品外,建议每批次提供一个阴性对照,即在PBS缓冲液中加入0.1~0.5μL 的1% PBS-BSA溶液(分选细胞时,细胞保存溶液)。
表1. 单细胞重测序送样要求注:X为细胞数目2单细胞全基因组甲基化2.1样品准备2.1.1单细胞甲基化裂解液由华大配制并提供,请联系当地销售人员获取。
2.1.211μL裂解液存于200μL PCR管中,收到后请-80℃保存。
2.1.3取出裂解液,置于冰上融化。
2.1.4挑取单细胞至裂解液中,立即置于冰上。
2.1.5样本置于PCR仪中37℃反应1小时。
基因测序龙头:华大基因持续加大研发投入,授权专利多达282项
基因测序龙头:华大基因持续加大研发投入,授权专
利多达282项
2017年7月份,华大基因正式挂牌,成为深交所第2001家上市公司,是实至名归的基因测序龙头企业,也是具有全球品牌影响力的中国生命科学企业代表。
在关乎大众生命健康的基因测序领域,华大基因拥有先进的技术平台、丰富的临床经验以及庞大基因数据库等多项核心优势。
技术平台方面,作为国内少有的掌握核心测序技术的企业,对于研发投入的重视是华大基因主旋律之一。
近日,华大基因相关高层表示,公司2018年度计划研发投入将大幅增长,2018年度研发预算将较2017年实际投入增长48%-53%左右。
科研成果相继诞生授权专利多达282项
在华大基因持续研发投入下,一个个科研成果相继诞生,公司及其全资、控股子公司获得授权专利多达282项。
华大医学科普文章之——无创产前检测(NIPT)从最近的一篇学术论文说起
无创产前检测(NIPT),从最近的一篇学术论文说起作为一项应用于临床检测的基因组新技术,无创产前DNA检测,主要是通过孕期母体的外周血,对其中的游离DNA(含有胎儿来源的DNA)进行测序,来判断胎儿是否患有某些遗传病,如21-三体综合征、18三体综合征以及13-三体综合征。
无创产前检测的英文是Non-invasive Prenatal Testing,取几个英文单词的首字母,简称NIPT。
严格来讲,无创产前检测,除了无创的DNA检测外,还包括传统的母体血液生化指标以及超声检测。
由于近两年基于DNA的无创检测有了快速发展,所以很多场合下,提到NIPT,主要说的还是基于DNA的检测。
2013年12月13日,Ultrasound in Obstetrics & Gynecology 杂志上在线发表了香港的一家胎儿医学中心的NIPT实践数据。
该论文系统回顾了在其中心过去的18月中1982例孕妇进行NIPT检测的情况。
其中,NIPT检测由BGI 临检中心完成。
在这里,NIPT检测作为一项筛查手段应用,而不是诊断。
也就是说,对于NIPT结果为阳性孕妇,还需要进行诊断(目前的诊断方法,主要包括绒毛穿刺或者羊水穿刺,直接在显微镜下检测胎儿细胞染色体核型),并根据最终的诊断结果来进行临床指导。
只有诊断结果也是阳性的情况,才可以决定选择引产还是继续妊娠。
如果仅仅是NIPT-阳性,是不能作为引产依据的。
这项在工作中,所有NIPT都是从12孕周(含)之后开展,其中12-13孕周占到了56.23%,97.14%的受检者都是在20孕周(含)之前接受的NIPT检测。
对于最为常见的三种常染色体三体综合征,即21-三体综合征、18三体综合征以及13-三体综合征,NIPT一共检测出29例阳性,包括23例 21-三体,4例18-三体以及2例13-三体。
这29例NIPT-阳性孕妇,经过咨询都进行了穿刺核型分析,诊断的结果证明NIPT结果全部正确。
华大基因BGI Online的云计算实践
华大基因BGI Online的云计算实践本文章来自于阿里云云栖社区摘要:华大基因是全球最大的基因测序服务公司之一,随着基因产业的迅猛发展,加之基因大数据的爆炸性增长,催生了云计算的应用。
华大基因与阿里云强强联手,打造出一款强大的基因云平台——BGI Online,希望通过利用云计算、大数据分析等技术对基因数据进行深度挖掘,从而不断加速精准医疗的发展。
基因测序为生命科学领域带来机遇,随着测序技术的发展和测序成本的降低,基因测序在生物信息与医疗健康等领域得到广泛应用。
但同时,基因测序行业也面临着处理及分析海量数据的全新挑战。
传统的硬盘已无法满足大数据的存储,而大数据处理和分析解读工作存在复杂性和不可预测性,因此需要极强的计算能力。
我们的产品生物信息分析云平台BGI Online正是为了解决这个难题而诞生。
BGI Online是由华大基因开发的一款基于“云”的生物信息数据云平台。
2014年,BGI Online项目启动;2015年,我们在评估了数据存储与计算的需求后,决定与阿里云合作,选择其作为我们产品的主要计算资源供应商。
通过在云计算、大数据领域的长期技术积累,阿里云具备支撑这个世界最大基因中心核心业务系统的能力,满足我们在数据处理、隐私安全保护以及传输方面极为严苛的要求。
1. 架构解析/优化任何系统架构的搭建和新技术的应用都是由业务需求催生的。
生物信息分析面对的基因数据动则数十G乃至上百G,大文件的传输、存储、计算对平台的IO吞吐、扩展性、伸缩性都有很高的要求。
生物信息分析是对大文件的精细分析,同时属于数据密集型、计算密集型、IO密集型应用。
大量基因数据的持久化和流动,要求文件管理系统的大容量、高伸缩、高通量;大量的计算需求要求计算资源的高性能、高时效、经济性。
为了满足用户基因数据的存、管、算、传,BGI Online系统设计了多个架构组件,分别为前端、后端、任务管理引擎、存储管理、文件传输五大部分。
华大基因发展现状及未来趋势分析
华大基因发展现状及未来趋势分析华大基因(BGI)是中国生物技术公司,成立于1999年,总部位于深圳。
作为全球领先的基因测序和生物信息学解决方案提供商之一,华大基因已经发展成为一家规模庞大且领先的公司,在生物技术领域有着广泛的影响力。
本文将对华大基因的发展现状及未来趋势进行分析。
首先,华大基因在过去的二十余年中取得了显著的成就。
该公司在基因测序技术方面取得了重大突破,成为全球最大的测序中心之一。
华大基因的高通量测序技术为科学研究、医疗诊断和农业领域等提供了强有力的支持。
此外,华大基因还致力于基因组学研究,通过构建大规模的人类基因组数据资源库,有助于深入理解人类基因组的变异和功能。
随着技术的不断发展,华大基因已经越过领域的边界,拓宽了其业务范围,并在生物医药、农业和环境等领域展开了深入研究。
华大基因的智能化产品和解决方案能够满足不同行业的需求,为客户提供个性化的服务。
例如,华大基因的基因检测产品通过分析个体基因信息,为客户提供个性化的健康管理方案,为疾病预防和健康促进提供了新的途径。
未来,华大基因将继续致力于创新和技术进步。
随着精准医学的不断发展,华大基因将进一步推动个体化医疗的实现。
通过深入研究基因组学和遗传学,华大基因将开发出更多的诊断和治疗工具,为个体提供更好的医疗服务。
同时,华大基因还将加强与全球科学界和产业界的合作,共同推动生物技术领域的创新和发展。
此外,华大基因还将积极参与全球生态环境保护和可持续发展。
该公司将继续投入资源和精力,加强在农业和环境领域的研究,推动生物技术在农业生产和环境保护中的应用。
华大基因的创新和技术将有助于提高农业生产效率,减少对化学农药的依赖,保护环境并提供更多健康食品。
尽管华大基因在生物技术领域有着广泛的影响力,但该公司也面临着一些挑战。
首先,生物技术行业竞争激烈,许多公司都在进行类似的研究和开发。
华大基因需要不断提高自己的技术水平,以保持竞争优势。
其次,生物技术的应用领域涉及许多敏感和道德问题,如基因编辑和个体隐私。
mgi测序原理
mgi测序原理MGI测序:从原理到应用的全面解析1. 什么是MGI测序?MGI测序是一种基因组测序技术,由BGI(华大基因)旗下的MGI 公司开发和推广。
它采用第三代测序技术,结合了纳米孔技术和人工智能,具有高通量、高准确性和低成本的特点。
MGI测序在疾病研究、农业科学、基因组学等领域有着广泛的应用。
2. MGI测序的原理MGI测序原理基于纳米孔测序技术,简单来说,就是将待测DNA 片段通过纳米孔导入到电导性纳米结构中,利用电信号的变化来识别每个碱基,从而获取DNA的序列信息。
具体步骤如下:DNA样本准备首先需要从样本中提取DNA,并按照特定的方法制备DNA文库,使其适合于纳米孔测序。
DNA片段引导将DNA文库中的DNA片段连接到引导线上,引导线上的特殊结构有助于片段的导入和定向测序。
纳米孔测序将连接了引导线的DNA文库通过纳米孔导入到测序设备中。
测序设备会自动控制纳米孔的电子流,当DNA片段通过纳米孔时,电流会产生波动。
这些波动通过高速的数据采集和分析,可以得到DNA的碱基顺序。
数据分析通过人工智能算法和大数据分析,将测序得到的原始数据转化为DNA序列信息。
这个过程包括碱基识别、纠错和序列组装等步骤。
3. MGI测序的优势和应用优势•高通量:MGI测序设备可同时进行数百个纳米孔的测序,大大提高了测序效率和产量。
•高准确性:MGI测序在碱基识别和纠错方面具有较高的准确性,能够提供高质量的测序数据。
•低成本:相比传统的基因组测序技术,MGI测序具有较低的运行成本,更加经济高效。
应用•疾病研究:MGI测序可以帮助科学家快速准确地识别疾病相关基因,加快疾病的诊断和治疗进程。
•农业科学:MGI测序可以用于植物基因组的测序和分析,帮助改良农作物品种,提高产量和抗病能力。
•基因组学研究:MGI测序可以用于人类和其他物种基因组的测序和比较分析,深入探索生命的奥秘。
4. 结论MGI测序是一项领先的基因组测序技术,其高通量、高准确性和低成本的特点使其在科学研究和应用领域具有广泛的应用前景。
中国的人才战略:深圳的“孔雀计划”能落户吗?
去年,中国在全球研发投入中的份额达到了12.3%,自政府于2006年推行“自主创新”的发展政策以来,中国在全球研发投入中的比例一直在稳定增长。在其他方面,这个国家也正在赶上来——专利申请总数一直在持续增长,尽管其中的大部分依然还是低质量的专利。此外,本土大学授予的科学和技术博士学位也越来越多。然而,中国目前的创新主要还是“利用设计方案,更便宜而且更快地生产一种产品。”西格尔谈到,“现在,大部分动机都旨在复制其他市场的创新、尽快推出产品以及将产品在中国的市场本地化。”具有突破性意义的创新之所以在中国不会很快出现,是因为“这里的研究环境不倾向奖励原创,以及不鼓励挑战权威。”他补充谈到。
从实验室到市场
然而,有专家认为,孔雀计划能否成功,取决于政府能否认识清楚打造创造性企业所必须的能力。美国对外关系委员会(the Council on Foreign Relations)研究员亚当。西格尔(Adam Segal)认为,第一步就是识别创新的“硬件”部分(比如,投资建设基础设施)与“软件”部分(比如,构建和激励愿意承担风险的企业文化)的差异。在谈到“硬件”投资时,他认为,中国在这一方面做得很好,但是,“将创想从实验室引向市场的社会认知、政治认知和文化认知”方面,与其他国家相比,中国在这一方面的落后“非常显著”。
与其他国家比起来,在中国,大学的研究机构与企业之间的断层也更大,北京中国科学院研究生院管理学院副院长、创新研究教授柳卸林谈到。“政府的很多钱都投到了大学和研究机构的研发上面,但是,它们完成的研究成果与企业的实际需求却相距甚远。”
华大基因:关于为全资子公司香港医学提供履约担保的公告
证券代码:300676 证券简称:华大基因公告编号:2020-112深圳华大基因股份有限公司关于为全资子公司香港医学提供履约担保的公告深圳华大基因股份有限公司(以下简称公司)于2020年8月25日召开第二届董事会第二十三次会议、第二届监事会第二十二次会议审议通过了《关于为全资子公司香港医学提供履约担保的议案》,本议案尚需提交公司2020年第五次临时股东大会审议。
具体情况如下:一、担保情况概述(一)担保情况概述为满足全资子公司华大基因健康科技(香港)有限公司(以下简称香港医学)投标项目需求,公司拟为香港医学向荷兰卫生部竞标核酸检测项目提供连带责任保证,预计担保金额不超过3,600万欧元(按1欧元兑人民币8.2083元的汇率,3,600万欧元换算为人民币29,550万元)。
本次提供履约担保的项目为投标项目,目前处于资质审查阶段,香港医学最终是否能够中标、签署合同具有不确定性。
(二)审议程序公司于2020年8月25日召开第二届董事会第二十三次会议、第二届监事会第二十二次会议审议通过了《关于为全资子公司香港医学提供履约担保的议案》,且已经出席董事会会议的三分之二以上董事审议同意,公司独立董事对本议案发表了同意的独立意见。
本次担保事项生效后,公司连续十二个月内担保金额超过公司最近一期经审计总资产的30%,根据《深圳证券交易所创业板股票上市规则》《公司章程》等相关规定,本次担保事项经公司董事会审议通过之后,尚需提交公司股东大会审议,并经出席会议的股东所持表决权的三分之二以上通过。
二、对香港医学提供担保额度情况单位:人民币万元注:上表最近一期是指截至2020年6月30日。
公司于2019年3月7日召开第二届董事会第七次会议,审议通过了公司为香港医学引进Natera公司生育健康产品相关技术和肿瘤基因检测技术使用权的合作事项提供履约担保的事项,该履约担保总金额为5,000万美元(按1美元兑人民币6.7220元的汇率,5,000万美元担保金额换算为人民币33,610万元)。
华大基因:国内基因检测行业的龙头企业
产品内容
主要应用
通过采集孕妇外周血,提取游离 检测 21-三体综合征(唐氏综合
DNA,采用新一代高通量测序 征),18-三体综合征(爱德华氏
技术,并结合生物信息分析,计 综合征)和 13-三体综合征(帕
算胎儿发生染色体非整倍体的 陶氏综合征)及其他染色体异常
风险值。
疾病。
采用单细胞全基因组扩增技术
和全基因组低覆盖度高通量测 PGS-染色体异常检测用于挑选
魏赟[Table_MainInfo]
日期:2017 年 07 月 04 日 行业:医药制造业
华大基因(300676)
证券研究报告/公司研究/新股定价
国内基因检测行业的龙头企业
[分Ta析ble师_Author]魏赟
TEL
021-53686159
E-Mail weiyun@ 执业证书编号:S0870513090001
公司主要服务于国内外的科研院校、研究所、独立实验室、制 药公司等机构,以及国内外的各级医院、体检机构等医疗卫生机构、 公司客户和大众客户。目前,公司已经覆盖了全球 100 多个国家和 地区,包括国内 31 个省市自治区的 2,000 多家科研机构和 2,300 多 家医疗机构,其中三甲医院 300 多家;欧洲、美洲、大洋洲等地区 合作的海外医疗和科研机构超过 3,000 家。
基因组相关产业已形成了包含科学发现、技术发明、产业发展 的完整产业链条。基因芯片的代表企业是美国的 Affymetrix 公司(已 于 2016 年被 Thermo Fisher Scientific 收购)。新一代基因测序的代 表企业是美国 Illumina, Inc.、Life Technologies(已于 2013 年被 Thermo Fisher Scientific 收购)、Pacific Biosciences 以及瑞士的罗氏 公司。Illumina, Inc.并购 Solexa 公司的测序技术并在此基础上开发 出全系列的新一代基因测序仪,2013 年取得全球新一代测序仪市场 约 71%的市场份额。Life Technologies 公司并购 SOLiD 和 Ion Torrent 公司的测序技术并在此技术上开发出新一代基因测序平台,2013 年 取得全球约 16%的市场份额。Pacific Biosciences 陆续更新 PacBio RS II 以及 PacBio Sequel 等一系列单分子测序仪,也在市场占据一定市
详解美国国家微生物组计划,这五大行业或将迎来新一轮变革
详解美国国家微生物组计划,这五大行业或将迎来新一轮变革1 天前 贝壳社/秦楠分享:导读 5月13日,美国白宫宣布启动“国家微生物组计划”(National Microbiome Initiative, NMI ),旨在推动微生物科学的发展,使个体、社区乃至全人类在卫生保健、食品生产和环境恢复等领域受益。
作者:秦楠两年投入1.21亿美金,美国国家微生物组计划希望实现三大宏伟目标5月13日,美国白宫宣布启动“国家微生物组计划”(National Microbiome Initiative, NMI ),旨在推动微生物科学的发展,使个体、社区乃至全人类在卫生保健、食品生产和环境恢复等领域受益。
微生物存在于人体、植物、土壤、海洋等各种环境中,这些微生物群落的集合被称为微生物组。
微生物影响人类健康、气候改变、食品安全等多个领域。
研究表明,环境微生物失衡可引发人类慢性疾病如肥胖、糖尿病、哮喘等,还可引发农业生态失衡、气候破坏等。
人们逐渐认识到,从肥胖、糖尿病、哮喘等人类健康问题到海洋“死区”等环境问题,从农业生产到气候变化,或多或少都与微生物组相关联。
尽管人类在微生物科学已取得了令人兴奋的进步,但直接控制微生物的知识和工具还非常缺乏。
NMI主要是对不同生态系统的微生物进行比较研究以寻求微生物的塑造方式。
了解这些原则为我们改变微生物朝着对人类有益的方向发展提供可靠必要的途径。
当今这个时代人类面临的挑战,包括养活众多的人口、生产可持续的能源、保护环境或减缓对环境的破坏,以及人类健康,都与生物学相关,可以从微生物世界中找到解决方案。
总体上,“国家微生物组计划”有三大目标:首先,支持跨学科研究,以回答多样化生态系统中微生物组的基本问题,如什么是健康的微生物组;其次,开发检测、分析微生物组的工具,了解分享多样化生态系统中微生物知识,增加微生物数据,如实时检测空气、土壤、水或人体微生物的手持传感器;第三,通过全民科学和教育机会培训更多的微生物组相关工作人员。
如何理解测序蜂图
测序峰图测序方法现代DNA序列测序可分为一二三代。
一代测序第一代测序技术包括链终止法和化学降解法,其主要特点是以待测DNA为模板,根据碱基互补规则采用DNA聚合酶体外合成新链。
由于新链中渗入了带有标记的碱基类似物,可用于制备末端带有标记的DNA单链。
这些末端带有标记的DNA单链是一个群体,在凝胶电泳时可以形成彼此仅差一个碱基的梯形条带。
根据末端碱基的特有标记可以读取待测DNA的序列组成。
链终止法(Sanger法)反应分别在4个试管中进行,每一试管中都含有:待测的DNA单链片段,作为模板; 1.DNA聚合酶;2.序列已知且与模板3'端互补的引物;3.四种脱氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、4.dCTP和dTTP) ;四种双脱氧核苷酸中的一种,作为DNA5.链合成的末端终止剂。
在适当条件下进行互补链的合成,由于新掺入的核苷酸只能同新生链3'端的-OH连接,而2', 3' -双脱氧核苷三磷酸核糖基的2', 3'位-OH的氧已脱掉,失去了和后来的核苷酸连接的可能性,这时碱基的掺入就有两种可能性:1.dNTP掺入新生链,使链继续延伸。
2.2', 3' -ddNTP掺入,使新生链的合成终止。
由于两者掺入的几率不同,就形成一套长度不一的DNA片段。
最后通过A、T、G和C四组反应的凝胶电泳放射自显影图谱,即可读出所测样品互补链的核苷酸序列。
iii要求测序时使用的DNA聚合酶不能有5'-3'外切酶活性(可将新合成DNA链的5'-末端除去核苷酸而改变链的长度)、3'-5'外切酶活性(可将错配的碱基除去,再补上正确配对的核苷酸)。
这两种活性会产生干扰条带。
.iii荧光染料标记物在Sanger法中的应用目前已发现具有不同荧光色彩的标记化合物,可将其分别与指定的ddNTP结合,如ddATP标记绿色荧光,ddCTP蓝色荧光,ddTTP红色荧光,ddGTP黑色荧光。
华大建库流程
华大建库流程华大建库流程介绍华大建库(BGI Genomics)是全球最大的基因测序和解读中心之一,提供各种基因组学和生物信息学解决方案。
该公司提供的华大建库流程是一个先进的基因测序流程,以高质量、高效率和高通量的特点而闻名。
流程概述华大建库流程主要包括样品准备、文库构建、测序、数据分析和结果解读等关键步骤。
1.样品准备•收集和标记样品。
•提取样品中的核酸。
•评估样品DNA/RNA的质量和纯度。
•根据实验设计决定建库方法和测序策略。
2.文库构建•根据样品的特性和研究目标选择适当的建库方法。
•根据建库方法制备DNA文库或RNA文库。
•文库构建过程包括DNA/RNA片段加工、连接适配体、富集PCR等步骤。
•合成所构建文库的DNA片段。
3.测序•选择合适的测序平台和测序模式。
•根据文库的特征进行测序运行。
•解读生成的测序数据。
4.数据分析•对原始测序数据进行过滤、清洗和校正,删除低质量的序列。
•将测序数据与参考基因组进行比对。
•识别和注释变异位点。
•进行生物信息学分析,如基因表达分析、功能富集分析等。
5.结果解读•根据数据分析结果解读样品的遗传变异。
•结合相关文献和数据库进行注释和解释。
•给出研究结果和建议。
总结华大建库流程是一个高度系统化和标准化的基因测序流程,能够有效地为基因组学研究提供支持。
通过严格的样品准备、精确的文库构建、可靠的测序和深入的数据分析,华大建库流程确保了高质量的测序数据和可靠的结果解读,为基因研究和生物信息分析提供有力的支持。
流程细节下面将详细介绍华大建库流程的各个步骤。
1.样品准备在这一步骤中,需要收集并标记样品以确保其完整性和可追溯性。
然后对样品进行核酸提取,常见的方法包括酚-氯仿提取、磁珠提取等。
提取的核酸样品需要经过质量和纯度评估,通常使用比色法、毛细管电泳等技术进行检测。
最后,根据实验设计的需要选择合适的建库方法和测序策略。
2.文库构建在文库构建过程中,根据样品特性和研究目标选择适当的建库方法。
北京基因组研究所
北京基因组研究所北京基因组研究所(Beijing Genomics Institute, BGI)是中国领先的生物科技研究机构,总部位于北京。
它是世界上最大的基因组研究机构之一,涵盖了基因组学、生物信息学和生物技术等多个领域。
北京基因组研究所成立于1999年,由中国科学院遗传与发育生物学研究所和华大基因公司共同发起组建。
早期的研究重点主要集中在基因组测序和分析上。
2001年,该研究所完成了中国第一个人类基因组的测序工作,填补了中国在这一领域的研究空白。
随着技术的进步和发展,研究所逐渐扩大了研究方向,包括新型生物技术、生物大数据的分析和应用等。
作为基因组研究领域的领军者,北京基因组研究所在国内外拥有丰富的研究资源和实验设施。
研究所的测序能力已经达到全球领先水平,每年能够完成数以百万计的基因组测序任务。
同时,研究所还拥有大型的生物信息数据库和分析平台,可以为科研人员提供全方位的数据支持和分析工具。
北京基因组研究所的研究成果在生命科学领域具有重要的影响力。
通过对生物物种基因组的深入研究,研究所的科学家们发现了许多重要的基因和功能,为解析生物的遗传机制和疾病的发生机制提供了重要的线索。
同时,研究所与世界各地的科研机构合作,开展了许多有意义的合作项目,为基因组学领域的国际交流与合作做出了贡献。
此外,北京基因组研究所还积极参与生态环境保护和社会发展等方面的研究,提供科学支撑和技术解决方案。
例如,研究所与相关单位合作,对我国珍稀濒危动植物进行基因组测序和保护。
研究所还开展了丰富多样的科普活动,提高公众对基因组学的认知和理解。
总之,北京基因组研究所是中国乃至世界生物科技研究的重要力量之一。
其在基因组测序、生物信息学和生物技术等领域的研究成果和贡献,为生命科学研究和生物技术应用提供了坚实的支撑,对推动科学发展和社会进步具有重要意义。
与院士的科普交流
围绕中国科学院院士杨焕明身上诸多闪亮的光环,让我们稍作解读吧:杨院士曾任国家自然基金委员会“中国人类基因组计划”秘书长,“中国人类基因组计划”人类基因组多样性委员会秘书长,“中国人类基因组计划”伦理、立法、社会问题委员会秘书长,以及联合国教科文组织国际生命伦理委员会委员,世界卫生组织人类遗传学与ELSI专家组成员,联合国人权委员会遗传学与伦理问题顾问组成员,联合国人权委员会遗传学与伦理问题顾问组成员,国际“人类基因组计划”与国际“单体型图(HapMap)计划”中国协调人。
杨院士现任北京华大基因研究中心(BGI)主任、中国遗传资源管理办公室专家委员会成员、UNESCO政府生命伦理委员会(IGBC)中国政府代表、欧洲全球生命科学促进会(EAGLES)副主席。
杨院士所获得过的奖项就包括国家杰出青年科学基金、国务院特殊津贴、国家自然科学奖、香港“求是”奖、香港何梁何利奖、日本科技新闻奖、《科学美国人》年度“科学领头人”、第三世界科学院生物奖等。
可以看出,杨院士的专业领域主要是基因研究,同时他也非常关注基因及其相关学科所产生的伦理问题。
大概也正因为如此,他花费大量精力写作了《天生与人生:生殖与克隆》这样一本独特的科普著作。
其独特之处在于,它既向公众普及生殖知识与克隆技术,同时又把克隆技术所带来的伦理问题,以及所引发的社会反响告诉世人。
全书通俗易懂,读着杨院士的这部科普作品,常常会有一种读小说的感觉。
书中文字优美干净,并不时流露出一种人文的关怀。
在世人的眼中,这种充满人性的温情本来是不属于科学的;而这种充满人文关怀的科普书也本不可能出自一位取得卓越成就的院士之手。
然而,事实的确如此,杨院士写了一本非常精彩的科普著作。
虽然从事科普工作,作为一位科普研究人员,但是同普通公众一样,我依然对科学及科学家充满了敬畏,始终觉得跟他们有距离,很难接近。
然而,经过这次跟杨院士接触才发现,院士其实是很平易近人的,并没有我们所想象的那么高高在上。
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