DNA电泳实验报告 杨家庆
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浙江农林大学
实验室开放项目
DNA和蛋白质的电泳技术
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班级:测绘工程151班
学号:************
指导老师:***
完成时间:2016 年11月23日
一、实验名称:DNA的电泳技术
二、实验目的:琼脂糖凝胶电泳是常用的检测核酸的方法,学习DNA 琼脂糖凝胶电泳的使用技术,掌握有关的技术和识读电泳图谱的方法。
三、实验原理:琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA、RNA 分子混合物的方法,这种电泳方法以琼脂凝胶作为支持物,利用DNA分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的。DNA分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动。在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即分子本身的大小和构型是主要的影响因素。DNA分子的迁移速度与其相对分子量成反比。不同构型的DNA分子的迁移速度不同。
四、实验器材:
仪器:制胶模具、电泳槽、电泳仪、烧杯、锥形瓶、移液枪、手套、微波炉、凝胶成像仪、分析天平、钥匙、离心机、紫外线透射仪、干式恒温器等。
试剂:琼脂糖(白色粉末)、TAE缓冲液、EB(溴化乙锭-致癌剂,操作中要严格戴手套);
五、实验步骤:
(一)DNA电泳实验
1.模板胶的制作:
①.称取1g琼脂糖加入盛有100mL的1*TAE溶液中,混合均匀后用微波炉加热至沸腾,加热2-3次,每次沸腾之后取出摇匀,直至混合均匀;
②.待溶液冷却至40-50℃时,倒入制胶模具内(注意要快速倒入,以防倒入的过程中溶液凝胶),凝固后,上DNA样品;
③.上样后,将模具移入电泳槽,将样品端上到负极,通电,恒压120V,25-30min;
④.将胶移入凝胶成像仪,用紫外光观察,拍照存档,保存图片;
⑤.清理实验相关物品,整理实验器材,实验结束。
2.DNA凝胶回收:
①.称量凝胶重量,按质量:体积=1:1换算,再按凝胶:Buffer G=1:3加入3倍的Buffer G溶液放入干湿恒温机中加热融化;
②.将溶液转入2ml离心管中,离心30s(13200rmp/min);
③.在离心管中再加入500微升的Buffer WS溶液,离心30s;
④.加入700微升的WG溶液,离心30s;
⑤.离心结束后,倒掉废液,将空的离心管放入离心机空转30s或1min,将DNA中的残留液体甩干净;
⑥.离心结束后,将含有DNA的薄片快速取出(为防止剩余的酒精再次挥发进入);
⑦.在放置DNA薄片的离心管中加入20微升的水(水要从中间加入,打在DNA薄片上,待DNA溶于水),静置1min,离心;
⑧.清理实验相关物品,整理实验器材,实验结束。
3.凝胶回收后DNA片段的电泳:
①.将胶从凝胶成像仪中取出,在相对黑暗的条件下用紫外光照射,看到清晰地六条条带之后,将相应的条带逐条切下(切的时候尽可能
薄,每个条带的重量不要超过0.3g),做凝胶回收,得到相应的DNA 分子;
②.重复制胶过程,在得到的模具中重复上样过程,在第一个孔内上标准DNA样品,其余孔内加入相应波长DNA样品;
③.上样后,将模具移入电泳槽,将样品端上到负极,通电,恒压120V,25-30min;
④.将胶移入凝胶成像仪,用紫外光观察,拍照存档,保存图片;
⑤.清理实验相关物品,整理实验器材,实验结束。
(二)PCR(Polymerase chain reaction,聚合酶链式反应)实验:1、配置反应所需试剂:反应体系为20微升,首先加入14微升水,然后依次加入2微升10*B(buffer)、0.8微升DNTPs(四种脱氧核苷酸混合物)、1微升cDNA(模板DNA)、1微升引物1、1微升引物2(引物1、2方向相反)、以及0.2微升Taq(DNA聚合酶);
2、溶液配置好之后,对溶液溶液进行预变性处理,条件95℃,时间2-5min;
3、预处理过后,进行变性操作,条件94℃,时间30s,之后,进行退活,条件58℃时间30s,然后延长反应,72℃、30s;
4、重复步骤3,共循环35次;
5、循环过程结束,在72℃下保存8min;
6、制作琼脂糖凝胶,将样品与5微升loading buffer溶液混合,上样,进行电泳;
7、将胶移入凝胶成像仪,用紫外光观察,拍照存档,保存图片;
8、清理实验相关物品,整理实验器材,实验结束。
六、实验结果:
标准DNA上样后成像为(如下左图):从上到下六条分带分别代表不同大小的DNA分子片段,带的粗细表现该片段的含量的多少,如图,从上到下每个条带一次对应的DNA分子片段的大小为:2000bp、
1000bp、750bp、500bp、250bp、100bp。凝胶回收后,各个不同片段的条带与MARKER带的对比成像为(如下右图),其中,最亮的条带对应的DNA量是150ng,其余的均为50ng
PCR实验结果成图为
七、结果讨论:
影响实验结果的因素有:
1.实验过程中仪器操作不当;
2.实验过程中液体漏加或加错;
3.电泳时电场强度以及电泳液的导电性能的影响;
4.实验中所需溶液不同浓度所带来的影响;
5.上样时在注入样品的过程中没有成功注入;
6.凝胶成像仪使用不当等。
八、实验感想和建议:
1.通过一学期的实验,我越发的明白实验操作对于结果的重要性。实验操作可以说是实验成功与否的关键部分,可是马虎不得。对于需要团队合作的实验,个人认为要有强势的人员搭档,不说是精通实验操作规程,最少也得知道实验的基本操作,掌握要做实验的操作方法,这对于后续的实验无疑是与决定性作用的。对于个人的实验能力,关键还是要看平时的积累,有些实验操作繁琐复杂,需要极大的耐心,这些都应该是逐渐培养起来的。
2.通过这次实验的学习,使我学到了不少实用的知识,更重要的是,做实验的过程,思考问题的方法,这与做其他的实验是通用的,加强了我的动手能力,并且培养了我的独立思考能力,使我受益匪浅.
3.通过这次实验的学习,我学到了很多,得到了很多,有些是书本上学不到的,只有自己参与了,操作了,才会知道。也要感谢老师对我们的照顾。