斑马鱼胚胎发育过程中Mef2c的表达
斑马鱼胚胎发育阶段相关基因的挖掘与分析
斑马鱼胚胎发育阶段相关基因的挖掘与分析近年来,斑马鱼成为一种常用的实验室模式生物,其胚胎发育过程十分规律和可控,是研究发育生物学和基因调控机制的重要模型。
随着基因挖掘技术的不断发展,越来越多的基因与斑马鱼胚胎发育阶段相关性得到了发现。
因此,分析斑马鱼胚胎发育阶段相关基因的功能和调控机制对于揭示生命活动的本质有着至关重要的意义。
一、斑马鱼胚胎发育阶段及其分子机制斑马鱼是一种小型热带鱼类,其胚胎发育阶段可分为十几个时期,分别对应着不同的形态和生理特征。
这些不同的发育阶段均是由基因表达的时空调控所驱动的,特定的基因激活和抑制导致了不同的胚胎形态和器官功能的发生。
在斑马鱼的早期发育过程中,主要涉及到卵母细胞的受精和初胚形成。
此阶段的发育主要由母源性基因调控,如 nop5、dead end、Vasa等。
随着器官的逐渐形成,受精卵将发展成为由脑、眼、肌肉等不同组织构成的多细胞胚胎。
这个过程中涉及到神经、视觉、肌肉等多种发育生物学特征,同时也是多个信号通路的交错调节,如 BMP、Wnt、Notch、Hedgehog等。
在胚胎发育的晚期,涉及到器官的成熟和功能细化等生理特征。
这个过程也是多种生化信号和调节因子交错作用下的结果,其主要涉及到细胞增殖、周期、分化等方面的调控,如 Cyclin D1、Nodal、Sox9等。
以上所述只是基础的胚胎发育阶段及其分子机制,实际上与胚胎发育相关的基因非常多且复杂。
因此,对斑马鱼胚胎发育相关基因的挖掘与分析显得尤为重要。
二、斑马鱼胚胎发育相关基因的挖掘通常,对基因的挖掘可以通过多种方式进行。
例如,可以通过对小分子化学物质的筛选和识别来验证潜在的胚胎发育相关基因,或者采用基于全反式PCR和转录组测序技术的方法进行基因调控因子的预测和鉴定。
另外,通过胚胎发育过程中的突变模式和形态,可获得一些具有生物学意义的候选基因,对其功能的研究也是非常重要的。
目前,已经有大量的胚胎发育相关基因在斑马鱼中被发现并得到了鉴定。
斑马鱼Dapper2的表达、调控及其对中胚层发育的作用机理
作者姓名:张丽霞论文题目:斑马鱼Dapper2的表达、调控及其对中胚层发育的作用机理作者简介:张丽霞,女, 1974年10月出生,2001年9月师从于清华大学孟安明教授,于2005年1月获博士学位。
中文摘要发育生物学是当今生命科学的一个重要学科,其目的在于探索生物个体在发育过程中基因的表达、调控、功能及基因间的相互作用网络。
脊椎动物由单细胞受精卵发育到由多细胞组成的中期囊胚阶段时,通过细胞分化产生内胚层、中胚层和外胚层,不同胚层主要沿背-腹轴线、前-后轴线以及左-右轴线生成不同的组织、器官。
这些胚层的形成和分化涉及细胞与细胞之间的信号交流和相互作用,转化生长因子(TGF )、Wnt、成纤维生长因子(FGF)等信号通路在胚层的形成和分化中起至关重要的作用,胚胎的正常发育必需对这些信号的强度进行精确的时空调控。
Nodal是TGFβ超家族成员,已知其是脊椎动物中、内胚层诱导的关键因子,也参与了胚胎的背部发育。
此外,Nodal信号还在胚胎的左右不对称发育及神经外胚层的前后轴线分化中起重要的作用。
然而,在胚胎发育中Nodal信号的强度是如何受到精确调控的,目前尚知道的不多。
斑马鱼因其高繁殖力、胚胎体外发育、胚胎透明、较完善的遗传操作技术等优点,已成为发育生物学研究的一种重要模式脊椎动物。
Nodal信号在斑马鱼和其它脊椎动物胚胎发育中的作用相当保守的,因此在斑马鱼上的研究结果也可以帮助理解其它物种上胚胎发育的相关机理。
本研究通过胚胎原位杂交的方法,从斑马鱼早期胚胎的cDNA文库中筛选到组织特异性表达基因dapper2(dpr2)。
一些证据表明,它是人的DAPPER2的同源基因,而其功能未见报导。
斑马鱼dpr2的表达开始于晚囊胚的背部胚盘边缘;至原肠作用开始时,其表达逐渐扩展到整个胚盘边缘,在背部组织中心(胚盾)中的表达最强,这些表达dpr2的细胞具有发育为中胚层组织的命运;在体节形成期,dpr2在神经管背部、侧板中胚层和尾芽中表达;胚胎发育到24小时时,其表达局限在血液前体细胞和尾芽中。
利用斑马鱼胚胎快速鉴定真核质粒中目的基因表达的研究
利用斑马鱼胚胎快速鉴定真核质粒中目的基因表达的研究范建超;赵成建;王晓飞;任斌;杨寒朔【期刊名称】《四川动物》【年(卷),期】2011(30)6【摘要】目的建立利用斑马鱼胚胎快速鉴定真核质粒中目的基因表达的实验体系.方法选20枚斑马鱼受精卵,在显微镜下每隔1h记录胚胎的发育情况.另选250枚单细胞期斑马鱼胚胎,平均分成5组,一组胚胎作为对照,剩余4组分别向胚胎的单细胞内注射pEGFP-N1(真核表达质粒)、pCMV-DsRed-Express2(真核表达质粒)、pET28-GFP(原核表达质粒)、pET28-RFP(原核表达质粒)质粒,在不同时间点连续观察绿色荧光及红色荧光的表达情况.另选600枚单细胞期斑马鱼胚胎,平均分成3组,一组胚胎作为对照,一组向胚胎单细胞内注射pEGFP-N1质粒,另外一组向胚胎单细胞内注射pEGFP-N1-MUC1外源基因融合重组质粒,注射4h后在荧光显微镜下观察绿色荧光的表达情况,并用RT-PCR的方法检测目的基因MUC1 mRNA的转录情况.结果注射pEGFP-N1、pCMV-DsRed-Express2真核表达质粒的胚胎,注射4 h后分别观察到很强的绿色荧光及红色荧光;注射pET28-GFP、pET28.RFP原核表达质粒的胚胎,10 h内都未观察到绿色荧光及红色荧光;注射pEGFP-N1-MUC1外源基因融合质粒,注射4h后同样观察到很强的绿色荧光,且用RT-PCR方法检测到目的基因MUC1很强的表达.结论利用斑马鱼胚胎鉴定真核重组质粒中目的基因的表达情况是一种快速、有效的实验体系.【总页数】5页(P871-875)【作者】范建超;赵成建;王晓飞;任斌;杨寒朔【作者单位】四川大学纳米生物医学技术与膜生物学研究所,成都,610041;四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室,成都,610041;四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室,成都,610041;四川大学纳米生物医学技术与膜生物学研究所,成都,610041;四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室,成都,610041【正文语种】中文【中图分类】Q959.4;Q343.1【相关文献】1.shRNA真核表达质粒介导的RNA干扰对人结肠癌LoVo细胞mTOR基因表达的抑制作用 [J], 彭秋平;刘红梅;冯青青;柯传庆;梁后杰2.新型真核表达质粒pcDNA6/myc-his-EGFP B的构建及其在重组基因表达中的应用(英文) [J], 李新建;曹以诚;杜正平;杨化强;张珍武;卓敏3.人突变型CDK4真核荧光表达质粒的构建及对人肝细胞SMMC-7702中POLD1基因表达的调控 [J], 李永继;黄怡;阮细玲;廖柳凤;吴琼;黄文涛;徐恒4.含弓形虫ROP1基因真核表达重组质粒DNA免疫小鼠的研究Ⅴ.IFN-γ基因真核表达重组质粒的构建及其在DNA免疫中基因佐剂的作用 [J], 郭虹;陈观今;郑焕钦5.弓形虫ROP1基因真核表达重组质粒DNA免疫小鼠的研究Ⅰ.pcDNA3-ROP1真核表达重组质粒的构建 [J], 郭虹;陈观今;周永安;郑焕钦;刘彦文因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
斑马鱼TNFR2基因克隆及表达分析
斑马鱼TNFR2基因克隆及表达分析摘要:利用巢式PCR方法克隆斑马鱼(Danio rerio)肿瘤坏死因子受体2(TNFR2)基因,该基因全长1 242 bp,编码413个氨基酸,分子质量44.68 ku,等电点5.90。
实时荧光定量PCR结果表明,TNFR2基因在斑马鱼胚胎发育时期的表达量呈现下降后趋于稳定,在斑马鱼不同组织中均能检测到,并且表达丰度差别不大,在肌肉中表达量最高,在肠道中表达量最低。
关键词:斑马鱼(Danio rerio);肿瘤坏死因子受体2;实时荧光定量PCRAbstract:Tumor necrosis factor receptor2(TNFR2)of zebrafish was isolated using nest PCR method. The gene was 1 242 bp,encoding 413 amino acids. The deduced molocular mass and pI was 44.68 ku and 5.90 respectively. The realtime qPCR results showed that TNFR2 g ene was in“descent-stabilization” pattern during the development period. TNFR2 gene was expressed in different tissues of zebrafish,and highly expressed in muscle,lowly expressed in gut.Key words:zebrafish(Danio rerio);TNFR2;realtime qPCR肿瘤坏死因子超家族(Tumor necrosis factor super family,TNFSF)是机体免疫反应的重要调节因子,调控炎症反应、细胞凋亡等诸多细胞应答进程[1]。
斑马鱼4个小maf时空表达分析及在调控胰外分泌酶原基因表达中的作用研究
是v . Ma f ( A v i a n mu s c u l o a p o n e u r o t i c i f b r o s a r c o ma v i r u s )
Hale Waihona Puke 但是 没 有 找 到 斑 马 鱼 4个 小 ma r时空表 达分 析及在 调控胰 外 分泌 酶原 基 因表 达 中的作 用研 究
曾俏 慧 吴 纯 卢 飞 赵 浩斌 钟雪萍 周 青春
( 华 中师 范 大 学 生命 科 学 学 院,湖 北 省 遗 传 调 控 与 整 合生 物学 重 点 实 验 室 ,武 汉 4 3 0 0 7 9 )
关键 词 :斑 马鱼 ; m 原 位杂 交 ;胰外 分泌 酶原基 因 中图分 类号 : Q3 4 4 + . 1 文献标 识码 : A 文章编 号 : 1 0 0 0 . 3 2 0 7 ( 2 0 1 5 ) 0 3 . 0 4 4 9 - 1 0
Ma f ( Mu s c u l o a p o n e u r o t i c i f b r o s a r c o ma o n c o g e n e )
明,在斑 马鱼 中也存 在 z J , m q 因,包括 m a J k 的一个
同源 基 因和ma f g 的两个 同源基 因, ̄ma f g l 和m a f g 2 ,
蛋 白家族作 为b Z I P ( B a s i c a n d l e u c i n e z i p p e r , b Z I P ) 蛋
Ma 瞪 白家 族 包 括 大 Ma 瞪 白( 大 于2 0 0 个 氨 基
酸) 和小Ma f 蛋 白( 小 于2 0 O 个 氨基 酸) p ' 4 ] 。大Ma f 蛋白
斑马鱼多能性因子的研究进展
Abstract: The mammalian pluripotency factors, including transcription factors such as Pou5f1/Oct4, Sox2, Klf4 and Nanog, play critical roles in maintaining pluripotency of embryonic stem cells and inducing reprogramming of differentiated cells. However, the functions of vertebrate pluripotency factors in vivo have not been elucidated. Zebrafish(Danio rerio H.) is an excellent model for studying vertebrates’ early embryo development. It allows functional studies of pluripotency factors to be conducted in an in vivo environment and therefore provides more accurate information on their roles. Nowadays, several homologs of mammalian pluripotency factors including oct4, nanog etc. have been identified in zebrafish. This review aimed at introducing the progress of the functional study on zebrafish pluripotency factors and comparing to those of other vertebrates.
甲炔诺酮对斑马鱼胚胎下丘脑-垂体-生长轴基因表达的影响
甲炔诺酮对斑马鱼胚胎下丘脑-垂体-生长轴基因表达的影响作者:梁燕秋岑美祈李进来源:《安徽农业科学》2019年第10期摘要 [目的] 研究甲炔诺酮对水生生物的生态毒理效应。
[方法] 将受精后的斑马鱼胚胎分别暴露在含0、6、45和87 ng/L的甲炔诺酮水环境中144 h,研究甲炔诺酮对斑马鱼胚胎下丘脑-垂体-生长轴相关基因转录表达的影响。
[结果] 甲炔诺酮在不同暴露时间点可以调节生长激素释放激素(ghrh)、胰岛素生长因子1(igf1)和胰岛素生长因子2b(igf2b)基因的转录表达,可以诱导生长激素(gh)基因的转录表达,但会抑制胰岛素生长因子1受体b(igf1rb)基因的转录表达。
此外,甲炔诺酮暴露对生长激素受体(ghra、ghrb)、胰岛素生长因子2a(igf2a)和胰岛素生长因子1受体a(igf1ra)基因的转录表达没有显著影响。
[结论] 甲炔诺酮能够改变斑马鱼早期胚胎发育阶段下丘脑-垂体-生长轴相关基因的转录表达水平,进而对斑马鱼的生长发育具有潜在的危险。
关键词孕激素;甲炔诺酮;下丘脑-垂体-生长轴;基因表达中图分类号 S912文献标识码 A文章编号 0517-6611(2019)10-0094-03Abstract [Objective]To study the ecotoxicological effect of norgestrel on aquaticorganisms.[Method]Zebrafish embryos were exposed to 0,6,45 and 87 ng/L norgestrel for 144 h,and the effects of norgestrel on the transcriptional expression of the related genes with the hypothalamicpituitarygrowth axis in zebrafish embryos were studied.[Result]Norgestrel could mediate the transcriptional expression of growth hormonereleasing hormone (ghrh),insulinlike growthfactor 1 (igf1) and insulinlike growth factor 2b (igf2b) genes at different exposure timepoints.Norgestrel exposure could induce the transcriptional expression of growth hormone (gh)gene,but it inhibited the transcriptional expression of insulinlike growth factor 1 receptor,beta (igf1rb) gene.In addition,norgestrel exposure had no significant effect on the transcriptional; expression of target genes associated with growth hormone receptor (ghra,ghrb), insulinlike growth factor 2a (igf2a) and insulinlike growth factor 1 receptor,alpha (igf1ra)genes.[Conclusion]Norgestrel could; affect the transcriptional expression levels of the related genes with hypothalamicpituitarygrowth axis,so it had potential risks on the growth of zebrafish.Key words Progestin;Norgestrel;Hypothalamicpituitarygrowth axis;Gene expression近年来,已有研究报道孕激素在水环境的污染分布特征,发现它们广泛存在于污水处理厂、养殖场和地表水等环境介質中,浓度范围从几纳克每升到几万纳克每升不等[1-2]。
斑马鱼nrf基因时空表达分析及其在调控胰外分泌酶原基因表达中的作用研究
含 抗 氧 化反 应 元件 ( AR E ) 序 列 基 因f 如: NQ01 抗氧
以上 研 究表 明 , 厂 同源 基 因均 可参 与 氧 化应 激
化 损 伤 及 对 抗 外 来 化 合 物 毒性 方 面 是 最 重 要 的 核 转 录 因子 , 参 与 调控 许 多抗 氧 化酶 和 I I 相 解毒 酶 的
Nr f 3 ( Nf e 2 1 3 ) 。
条件 下 出现 急 性肺 损伤 , 这 说 明 r f 3 可 能在 氧 化 应 激 反应 中起 保护 作用 。Nf e 2 与/ J , Ma f :  ̄白( s Ma f )
形成 异 二 聚 体 作 为 转 录 因子 调 节 珠 蛋 白基 因 的表 达, 并且 可 调节成 熟红 细胞 中的氧 化应 激反 应 ” 。 有 研 究 表 明 化 酶等 ) 的表达 系 同源基 因编 码 的 蛋 白可 以调节 。
研究6 个月 桩 物种之间的关系, 实验对6 个N r 瞪 白进行系统发育树分析, 结果显示6 个N r f 蛋 白的分子进化趋势
基 因各产 生 了两 个拷 贝, 但N r f 蛋 白仍然 是 比较保 守 的 。此外 , 实 验选 取 斑马 鱼胚 胎 发 育十个 不 同时期( 1 c e l l 、2 c e l l 、3 . 5 h p f 、6 h p f 、1 2 h p f 、
川 在 哺 乳 动物 的许 多 组织 中都 表达 , 它 在 调 节 肝 脏 中 氧化 还 原 平衡 、涉 及 发 育 的调 控基 因 、 氧 化 应 激 反应 ’ 、 细胞 骨 架 组 织 和 蛋 白酶 体 等 方 面 起 着重 要 作用 。Nr f 2 被 认 为在 细胞 内抑 制 氧
( Ca p ‘ n ’ Co l l a r b a s i c l e u c i n e z i p p e r , C 胞 保 护作 用 … 。 , 一 , 2 基 因敲 除
UBE2C基因在斑马鱼胚胎发育中的时空表达规律开题报告
UBE2C基因在斑马鱼胚胎发育中的时空表达规律开题报告一、选题背景与研究现状UBE2C (Ubiquitin-conjugating enzyme E2C)是编码酶类蛋白质的一个基因,参与蛋白质的泛素化修饰,是一种泛素连接酶。
该基因的错义突变与许多类型的癌症有关。
在人类胚胎发育中,UBE2C基因起到重要作用,是一个关键的调节因子。
目前,已经证实UBE2C基因在许多不同类型的小鼠和人类组织和细胞系中表达,但是对于其在斑马鱼胚胎发育中的时空表达规律还知之甚少。
二、研究目的本研究旨在探究UBE2C基因在斑马鱼胚胎发育过程中的时空表达规律及其与发育相关生理过程的关系,为进一步研究鱼类发育机制提供理论依据。
三、研究内容与方法1. 选择适当的实验材料:选择斑马鱼胚胎作为实验材料。
通过观察胚胎发育的外部表现,确定胚胎发育的不同阶段。
2. 提取RNA:采用Trizol方法提取斑马鱼胚胎中的总RNA。
3. 构建cDNA文库:使用反转录转录酶(RT)反转录RNA样品,并应用PCR扩增。
4. 克隆并序列化:将PCR扩增产品纯化,并克隆到载体中,经由DNA测序进行序列鉴定。
5. 实时荧光定量PCR :利用实时荧光定量PCR技术验证UBE2C基因的表达水平。
针对UBE2C基因的全长序列设计引物,同时还设计内部标准引物和荧光探针以确保精确度。
通过荧光信号记录分析相应基因在斑马鱼胚胎的时空表达模式。
6. 统计学分析:采用SPSS软件进行统计学分析,评估不同发育阶段分子表达的变化趋势。
四、研究意义本研究可以揭示UBE2C基因在斑马鱼胚胎发育中的时空表达规律及其调控的发育生理过程,为进一步揭示斑马鱼发育机制和相关疾病的研究提供了理论基础。
斑马鱼4个小maf时空表达分析及在调控胰外分泌酶原基因表达中的作用研究
斑马鱼4个小maf时空表达分析及在调控胰外分泌酶原基因表达中的作用研究曾俏慧;吴纯;卢飞;赵浩斌;钟雪萍;周青春【期刊名称】《水生生物学报》【年(卷),期】2015(039)003【摘要】The members of musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene (Maf) family are important transcription factors that are involved in many cascades of cell biology. They are classified into large and small Maf proteins. The small Maf proteins of zebrafish include Mafk, Mafg1, Mafg2 and Maff (Maft).Mafg1 andmafg2 are paraloges ofmafg that only exist in fish genomes. The phylogenetic tree indicated that the evolution of the small Mafs was conservative. The systemic analyses of different smallmafs also showed thatmafk andmaff were more conservative thanmafg. In the present study we analyzed the spatial-temporal expression of these fourmafsin the early development of zebrafish em-bryos using semiquantitative PCR and whole mountin situ hybridization. The expression of all four genes started at the one cell stage, suggesting that these genes were maternal and the expression were ubiquitous in early zebrafish embryos. Mafg2 showed the highest expression level among the four genes, and was specifically expressed in blood circulation after 48 hpf, together withmaff. The results of dual-luciferase system also showed that the over expression of the four small Mafs led to down-regulation of thetranscription of zymogens in a dose-dependent manner. Our study should con-tribute to better understanding of the functional superposition and complementarities of small Mafs.%Maf蛋白家族作为重要的转录调控因子, 参与细胞众多生命进程.它分为大Maf蛋白和小Maf蛋白, 小Maf蛋白需要与其他B-Zip家族蛋白结合形成异二聚体才能发挥作用.在斑马鱼(Danio rerio)中,小Maf 包括Mafk、Mafg1、Mafg2和Maft, Mafg1和Mafg2是Mafg在鱼类中特有的分化出的两个旁系同源基因.为了研究这4个小maf在物种之间的进化关系及表达模式, 实验对4个小maf进行进化树、染色体线性关系分析, 结果显示4个小maf的分子进化方向与物种进化方向一致, mafk和maff在物种间的更趋于保守, mafg比前两者要相对活跃.同时,实验选取斑马鱼胚胎发育十个不同时期(1 cell、2 cells、3.5 hpf、6 hpf、12 hpf、24 hpf、36 hpf、48 hpf、72 hpf、96 hpf),对其表达模式进行了详细的研究,结果显示4个小maf中,mafg2的表达量最高,maft 和mafk的表达量次之,mafg1的表达量最低.在胚胎发育的后期(48 hpf),除了mafg2在躯干的血液循环处有明显的表达, maft在躯干的血液循环处有较弱的表达, 而除mafk和mafg1在血液循环处没有检测到表达之外, 4个基因的表达部位基本重叠,都在全身广泛表达,这可能也与它们之间存在功能叠加和替换有关.利用双荧光素酶检测系统检测了4个小Maf参与调控胰外分泌酶原基因转录的不同功能, 结果显示 4个小 maf的过表达都能使胰外分泌酶原基因的表达下调.研究结果将为深入研究 4个小 maf基因的功能叠加和互补作用奠定基础.【总页数】10页(P449-458)【作者】曾俏慧;吴纯;卢飞;赵浩斌;钟雪萍;周青春【作者单位】华中师范大学生命科学学院,湖北省遗传调控与整合生物学重点实验室,武汉 430079;华中师范大学生命科学学院,湖北省遗传调控与整合生物学重点实验室,武汉 430079;华中师范大学生命科学学院,湖北省遗传调控与整合生物学重点实验室,武汉 430079;华中师范大学生命科学学院,湖北省遗传调控与整合生物学重点实验室,武汉 430079;华中师范大学生命科学学院,湖北省遗传调控与整合生物学重点实验室,武汉 430079;华中师范大学生命科学学院,湖北省遗传调控与整合生物学重点实验室,武汉 430079【正文语种】中文【中图分类】Q344+.1【相关文献】1.RNA 结合因子 AUF1调控基因表达及其在肿瘤发生中的双重调控作用的研究进展 [J], 杨颖卓;康鹏;高杰;徐春林;王诗美(综述);吴霞(审校)2.斑马鱼nrf基因时空表达分析及其在调控胰外分泌酶原基因表达中的作用研究[J], 孙素杰;谢琳琳;于翠霞;王雨薇;钟雪萍;赵浩斌;陈新华;周青春3.I型纤溶酶原激活物抑制剂基因表达的调控及作用机制 [J], 巩伯梁;郎春鹏4.人顶体蛋白酶原基因表达调控和蛋白分选的转基因小鼠研究 [J], 盛毅;李建秀;等5.三唑磷对斑马鱼H19和Sox2OT基因表达调控的影响 [J], 乔嘉凯;杜羽亭;贾龙略;张丹燕;黄涵年;郭江峰因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
斑马鱼胚胎发育中的基因表达和动态调节机制
斑马鱼胚胎发育中的基因表达和动态调节机制斑马鱼是一种非常常见的观赏鱼类,它具有非常高的观赏价值。
不过除了这种独特的外貌,斑马鱼在科学研究中也扮演着非常重要的角色。
因为斑马鱼的胚胎发育过程非常短,只需要几天时间就能在卵黄中进行整个体系的发育,这使得研究人员可以非常方便地对斑马鱼的胚胎发育过程进行研究和观测。
通过对斑马鱼胚胎发育中基因的表达和动态调节机制的研究,我们能够更好地理解动物胚胎发育过程中的机制,同时也能够为后来的生物医学研究奠定基础。
在斑马鱼的胚胎发育过程中,基因表达和动态调节机制起着非常重要的作用。
在胚胎发育的过程中,基因编码的信息会被转录成RNA分子,RNA分子再被翻译成蛋白质。
这些蛋白质随后会参与到各种生物化学反应以及细胞信号传递中,最终构建出斑马鱼的体系。
因此,研究人员可以利用斑马鱼胚胎发育中基因的表达和调节机制来推导它所合成的蛋白质,以及它所参与的反应和细胞信号传递。
在斑马鱼的胚胎发育过程中,基因表达和动态调节机制发挥着非常复杂的作用。
斑马鱼的卵子中充满了各种各样的RNA分子,这些RNA分子可以参与到胚胎发育的过程中。
同时,斑马鱼的胚胎细胞中也充满了各种各样的转录因子和调控蛋白质。
这些转录因子和调控蛋白质都可以对基因的表达和调节产生影响。
通过对这些基因表达和调节机制的研究,研究人员可以逐步地揭示出斑马鱼在胚胎发育过程中所使用的机制。
例如,在斑马鱼的胚胎发育过程中,存在着一类非常关键的基因,它们被称为是胚胎轴形成基因。
这些基因可以控制胚胎发育过程中的体轴向形成。
研究人员发现,这些基因的表达和调节机制是非常精密的。
在斑马鱼的胚胎发育初期,这些基因会被不同的信号通路所调控,使它们能够被精确地表达在体轴向形成需要的位置。
在后来的发育过程中,这些基因的表达和调节机制还会发生相应的变化,以应对斑马鱼在不同发育阶段所需要的不同的身体结构。
除了基因表达和调节机制外,斑马鱼胚胎发育过程中的其他机制也是非常关键的。
FoxO转录因子在骨骼肌稳态中的作用及运动训练调控
FoxO转录因子在骨骼肌稳态中的作用及运动训练调控张庆;丁树哲【摘要】进化上高度保守的FoxO转录因子家族对维持细胞稳态起到重要的作用,该家族包括FoxO1、FoxO3、FoxO4和FOXO6.综述了FoxO转录因子在骨骼肌稳态中的关键作用.FoxO1和FoxO3通过控制糖脂分解及线粒体代谢,起到肌肉能量代谢的核心调控因子的作用.它们同时也调控蛋白质合成、降解,影响肌纤维类型、肌肉量.根据它们的激活水平,FoxO蛋白展示出不同的功能.FoxO蛋白也是机体运动适应所必需的,不同的运动训练方式对其产生不同的影响.FoxO过度激活可能会导致许多疾病,如代谢紊乱、肌肉萎缩等.更好地理解FoxO转录因子的功能,将会对促进防控许多病理条件下(如肌肉制动、去神经支配状态、神经肌肉疾病、衰老、糖尿病、艾滋病、癌症等)肌肉耗费治疗手段的发展起到重要作用.【期刊名称】《沈阳体育学院学报》【年(卷),期】2015(034)001【总页数】7页(P91-97)【关键词】FoxO;骨骼肌稳态;肌肉萎缩;代谢;运动【作者】张庆;丁树哲【作者单位】华东师范大学青少年健康评价与运动干预教育部重点实验室,上海200241;华东师范大学体育与健康学院,上海200241;里昂高师分子细胞生物学实验室,法国里昂69364;华东师范大学青少年健康评价与运动干预教育部重点实验室,上海200241【正文语种】中文【中图分类】G804.62骨骼肌占人体体重的40% ~50%,是人体最大的器官。
骨骼肌稳态对于机体完整性的维持起重要作用,肌肉稳态受损与许多疾病密切相关。
骨骼肌对机体内外刺激具备强大的适应性,如环境因子(低氧)、营养干预、机体物理负荷、收缩活动。
所有这些刺激诱导肌肉的能量代谢和肌肉量发生改变,特别是改变肌纤维组成或者肌肉蛋白合成和降解的平衡[1-2]。
FoxO家族在进化上是高度保守的,并在许多细胞过程中发挥重要作用,如调节细胞周期相关基因表达[3]、DNA 损伤的修复[4]、抵抗氧化压力[5]、能量代谢,以及细胞凋亡[6]。
(优)优选斑马鱼的发育历程pptppt文档
层期 在( 其 一 侧) ;背 : 侧观
, 外包期( 箭头示轴中 ),在一些胚胎中可见尾芽 胚层与中线边界,近轴中胚
5.7h
H I 80%-
8h
; 外: 包 期( 外包 ), 期( 箭 头示腹 ), 侧: 薄 的 排外 泄包 区期 ;腹 : 侧观
正因为囊胚期没有囊胚腔,原肠期既没有消化道(archenteron),也没有胚 孔(blastopore)。DEL细胞在胚层边缘进行内卷,因而发挥了胚孔的作用。 内卷通过将胚层向后折叠形成胚环。因此,胚环内由两个胚层:位于上方的 称上胚层(epiblast),在整个原肠期继续给位于下方的下胚层(hypoblast )提供细胞。注意到上、下胚层这些术语可同样描述鸟类胚层结构,但所命 名的胚层在这两种脊椎动物中似乎完全不同。
此期用“实囊胚”( “stereoblastula”)称之可能更准确,因为这一
术语意味着胚胎还没有形成囊胚腔(blastocoele),而事实正是如此 (图8),仅在胚盘深层细胞之间存在不规则的间隙。卵裂取向不确 定,比卵裂期亦更不规则。此后卵裂产生的子细胞从整齐的细胞面伸 出,不论从侧面还是从顶面观都是如此,因而确定此期分期用细胞大 小判断比用细胞位置判断更为有效。从动物极观,胚盘呈轻度椭球形 (尤在早期)。
内卷运动的开始意味着原肠期的开始,目前可以说是发生于50%-外包时(图 11A)。结果在达到50%-外包后的数分钟内出现了一个增厚的外围区域,称作 胚环(germ ring),几乎与此同时完全包围了囊胚边缘(图11B,及C箭头所 指)。随后集合运动几乎同样快速地沿胚环产生一个局部的堆积,称胚盾( embryonic shield , 图11D,及E箭头所指)。在发生这些事件期间,外包暂 时中止,但胚盾形成后外包又继续。胚层边缘沿卵黄细胞延伸直至将其完全 包绕(图11F-L)。其延伸近乎恒定速度进行,约每小时包绕卵黄细胞的15% ,这也提供了大部分原肠期分期的有用指标(图12)。
丙烯酰胺对斑马鱼胚胎发育过程中microRNA表达的影响
丙烯酰胺对斑马鱼胚胎发育过程中microRNA表达的影响王菊;赵建军;马旭【期刊名称】《毒理学杂志》【年(卷),期】2007(21)3【摘要】目的研究丙烯酰胺(ACR)对斑马鱼胚胎发育过程中小分子RNA(miRNA microRNA)表达的影响,探讨丙烯酰胺发育毒性机制。
方法将斑马鱼胚胎分为10mmol/LACR染毒组,二甲亚砜(DMSO)组和空白对照组,分别处理受精后6 h的斑马鱼胚胎(6 hpf hours past fertilization);采用核苷酸锁定(LNA locked nucleic acid)修饰的microRNA探针进行胚胎整体原位杂交。
结果10 mmol/L ACR可导致斑马鱼胚胎表现出多系统的畸形,胚胎表现出心率减慢,心包水肿,体轴缩短;胚胎整体原位杂交显示ACR诱导miRNA表达增加。
结论ACR对斑马鱼胚胎发育过程中microRNA的表达有影响。
【总页数】4页(P169-171)【关键词】丙烯酰胺;斑马鱼;微小RNA【作者】王菊;赵建军;马旭【作者单位】中国医学科学院中国协和医科大学【正文语种】中文【中图分类】R114【相关文献】1.斑马鱼胚胎发育过程中内源性多肽的表达及与眼发育的相关研究 [J], 李楠;张昕;史春梅;张青宇;郭锡熔;池霞;童梅玲2.肌间刺缺失突变对斑马鱼胚胎发育过程中肌肉发育的影响 [J], 杨建;佟广香;郑先虎;孙志鹏;吕伟华;孙效文;匡友谊3.cdh5-mRNA在野生型斑马鱼胚胎发育过程中的表达模式 [J], 吴西军; 姚冬静; 刘庆; 杨小燕; 王念雪; 王一慧; 舒莉萍; 何志旭4.cdh5-mRNA在野生型斑马鱼胚胎发育过程中的表达模式 [J], 吴西军; 姚冬静; 刘庆; 杨小燕; 王念雪; 王一慧; 舒莉萍; 何志旭5.干扰素调节因子2结合蛋白2在斑马鱼胚胎早期发育过程中的表达谱分析 [J], 王海红;高硕;朱军;周隽因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
肌间刺缺失突变对斑马鱼胚胎发育过程中肌肉发育的影响
中国水产科学 2019年3月, 26(2): 296-303 Journal of Fishery Sciences of China研究论文收稿日期: 2018-04-09; 修订日期: 2018-07-22.基金项目: 中国水产科学研究院基本科研业务费项目(2016HY-ZD0301).作者简介: 杨建(1987‒), 男, 博士研究生, 主要从事鱼类遗传育种的研究. E-mail: last0templar@ 通信作者: 匡友谊, 副研究员, 主要从事鱼类基因组与分子育种研究. E-mail: kuangyouyi@DOI: 10.3724/SP.J.1118.2019.18119肌间刺缺失突变对斑马鱼胚胎发育过程中肌肉发育的影响杨建1, 2, 佟广香2, 郑先虎2, 孙志鹏2, 吕伟华2, 孙效文2, 匡友谊21. 上海海洋大学, 水产科学国家级实验教学示范中心, 上海 201306;2. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所, 黑龙江 哈尔滨 150070摘要: 为阐明肌间刺缺失对斑马鱼(Danio rerio )胚胎发育时期肌肉发育的影响, 采用qRT-PCR 的方法, 检测分析了斑马鱼不同肌间刺表型间5个肌肉特异性基因(mef2、myf5、myod 、myog 和sox6)在囊胚期(3 hpf, hours post fertilization)、原肠胚期 (6 hpf)、体节期(12 hpf)、咽囊期(24 hpf)和孵化期(72 hpf)5个发育时期的表达情况, 对比分析了肌间刺缺失对斑马鱼胚胎发育过程中肌肉发育特异性基因的时序表达差异和肌肉发育的影响, 以及对受精率、孵化率和畸形率的影响。
结果显示, 5个特异性基因在肌间刺缺失突变型与野生型斑马鱼各发育时期的表达量无显著性差异(P >0.05)。
其中, myf5、myod 基因在原肠胚期表达量升高, 在体节期和咽囊期开始逐步下降; mef2、myog 和sox6基因在囊胚期和原肠胚期表达量很低, 在体节期和咽囊期表达量迅速升高, 并在孵化期开始下降。
超氧化物歧化酶在斑马鱼早期胚胎中的表达特点
陕 西 理 工 学 院 学 报( 自然科 学版 )
Junl f hax U iesyo eh o g" N trl cec d i ) or a o an/ nvrt f cn l y( a a SineE io S i T o u tn
Sp.0 8 e t2 0
第2 4卷第 3 期
Vo . 4 N . 12 0 3
[ 文章编号]63- 94 20 )3 0 9 一 4 17 24 (0 8 0 — 0 1 o
超氧化物 歧化酶在斑 马鱼早期胚 胎 中的表达特点
黄 勇。 廖 施
( 安康学 院 化学 与生命 科学系 , 陕西 安康 750 ) 200
[ 中图分类号 】 Q 5 .6 8 994
[ 文献标识码 】 A
早期胚胎发育是生命现象 中复杂而又重要 的阶段 , 受精卵通过分裂分化产生机体全部细胞表型, 同
时也是多种理化因子参与调控的复杂过程¨ J 工。氧是重要的环境因子, 没有氧的参与胚胎不能正常地
生长发育 。无论是机体细胞还是胚胎细胞 , 生命代谢过程 中都会产生活性 氧(ec v ye ei 。 r teo gns c s ai x p e as, o ) 自由基生物学方面的研究大多表明 R S O 对机体细胞有毒害作用 。胚胎学方面的研究证据也 】
[ 摘
要 ] 以斑 马鱼 早期 胚 胎 为研 究对 象 , 过免 疫 组 织化 学的 方 法研 究 了超 氧化 物歧 化 酶 通
(O ) S D 在斑马鱼体节分化 时期 的表达特 点。结果发现 : 在体 节分化的不 同时期 ,O S D在脊 索 细胞的胞质部位有不 同强度的表达 ;O S D在脑组织中表 达较 强, 到孵化期 , 大脑 区域的表达 在
Mecp2在斑马鱼胚胎神经发育中对NOTCH信号通路的调控
Mecp2在斑马鱼胚胎神经发育中对NOTCH信号通路的调控何丽番;高海【摘要】This study aims to explore the regulation role and mechanism of Mecp2 during early neural development of zebrafish embryos. By the techniques of confocal laser scanning microscopy and in situ hybridization,and using Notch transgenic fish,it was found that Mecp2 widely expressed in the early embryonic development,then gradually expressed in the brain. In the embryos with Mcep2 knockdown,the expression of Notch signal decreased,and both the injection of Mcep2-RNA and intracellular INCD-RNA restored the phenotype. The expressionof neural factors of Ngn1,Pax2,Pax3,Eno2,and Map labelling for neural maturation as well as HUC binding with RNA were downregulated. After Mecp2 knocked down,the expression of transcriptional repressor Hey2 downregulated because the knockdown hindered the differentiation and maturation of neural cells. Our study showed that Mecp2 regulated the differentiation of nerve cells of zebrafish through Notch-Hey2 signaling pathways.%旨在探讨Mecp2在斑马鱼胚胎神经发育过程中的调控及机制。
大斑马鱼5种同工酶表达的初步分析
大斑马鱼5种同工酶表达的初步分析
刘伟成;李明云;应中富;叶帅东
【期刊名称】《水利渔业》
【年(卷),期】2006(26)5
【摘要】采用垂直聚丙烯酰胺平板电泳技术对大斑马鱼的眼、肌肉、鳃、尾鳍、卵巢5种组织器官的5种同功酶进行了研究分析.结果表明脂酶(EST)、苹果酸脱氢酶(MDH)、苹果酸酶(MEP)在眼、肌肉、鳃、尾鳍、卵巢都有表达;过氧化物酶(POX)仅在眼睛和鳃中表达;三磷酸腺苷酶(ATP)除眼睛外其它4种组织器官中均有表达.
【总页数】3页(P14-16)
【作者】刘伟成;李明云;应中富;叶帅东
【作者单位】宁波大学生命科学与生物工程学院,浙江,宁波,315211;宁波大学生命科学与生物工程学院,浙江,宁波,315211;宁波大学生命科学与生物工程学院,浙江,宁波,315211;宁波大学生命科学与生物工程学院,浙江,宁波,315211
【正文语种】中文
【中图分类】Q917
【相关文献】
1.斑马鱼胚胎及成年斑马鱼端脑中神经胶质成熟因子β的表达观察 [J], 杜明君;殷果
2.可口革囊星虫三种同工酶表达初步分析 [J], 黄福勇;李明云;竺俊全
3.5种海水鱼同工酶表达的组织特性及其电泳的初步分析 [J], 王可玲
4.Hg^(2+)在斑马鱼3种组织器官中对乳酸脱氢酶同工酶的影响 [J], 赵俊丽;任春梅;周梅仙
5.杂交贻贝同工酶表达的初步分析 [J], 刘慧慧;常抗美
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万方数据复旦学报(医学版)2006年1月,33(1)脏的发生与发育过程中的作用提供依据。
材料和方法斑马鱼胚胎固定收集不同发育时期的AB野生型斑马鱼(购自俄勒冈大学,斑马鱼养殖系统从美国AquaticHabitats公司引进)胚胎:6hpf(hourspost—fertilization,受精后6h)、7、8、9、10、11、12、13、15、17、20、24、36、48hpf,用4%多聚甲醛溶液固定过夜(至少固定12h),保存于甲醇溶液中,置一20℃备用。
引物设计与合成首先根据Genbank数据库查得斑马鱼Mef2ccDNA序列(Genbank:30575),以包含密码子1319~2385位的基因序列为RNA探针序列,探针序列总长1066bp。
RNA探针的引物序列(由上海赛百盛生物有限公司合成)为:For—ward:5'-CTCAAATACGGAAAAGCTAC一3Reverse:5'-CGCCCGTGGGACTGATGAGAG一3PCR扩增以斑马鱼基因组总DNA为模板,用以上两条引物特异扩增RNA探针序列。
扩增条件为:95℃预变性2min,95℃变性45S,57℃复性45S,72℃延伸2min,重复30个循环,最后72℃延伸7min。
1%琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物。
合成反义RNA探针将纯化的扩增产物连接到pGEM—T载体(Promega)中,然后转化到DH5a感受态菌株(博大泰克)中进行克隆。
根据Harland的方法[43抽提转染后的连接载体质粒(测序验证质粒中插入序列是否正确),NotI内切酶(NEB)酶切完全,以其为模板转录合成反义RNA探针。
整体原位杂交取不同发育时期的胚胎,用1×PBST溶液洗去多余的甲醇溶液,将胚胎置于65℃水浴进行预杂交3h,然后加入所合成的反义RNA探针65℃水浴杂交过夜。
多余的探针用0.2×SSC溶液洗去,加入anti—Dig—AP(Roche)与反义RNA探针结合过夜。
未结合的抗体用1XPBST溶液洗去,再加入BCIP/NBT/NTMT溶液显色30min,迅速用1XPBST溶液洗去多余的显色液,在显微镜下观察并记录结果。
结果探针合成效果琼脂糖凝胶电泳检测结果表明,本实验中设计的引物能够特异性地扩增目标基因片段。
图1A为特异扩增的RNA探针序列电泳检测结果,扩增的RNA探针序列大小约1066bp。
图1B为酶切后电泳迁移率的改变,2、3泳道是未被酶切的质粒序列,4、5泳道是酶切后的质粒序列。
酶切后质粒电泳速率要比未酶切质粒的速率要快。
同时,我们将该序列测序后进一步验证(由上海赛百盛生物有限公司测序),连接至pGEM—T载体中的RNA探针的序列是正确的。
图l凝胶分析PCR结果(A)和质粒酶切结果(B)Fig1GelanalysisPCR(A)andplasmid(B)A:1:marker;2-5;RNAprobe.B:1:marker;2-3:Mef2cRNA—pGEMT;4-5:Mef2cRNA-pGEMTbyNot-1斑马鱼整体原位杂交在斑马鱼胚胎发育早期,Mef2c在胚体中没有自身的转录产物,仅少许从母体自带的Mef2cmRNA存在,胚体染色呈现为弥散均染状态(图2:a,b见封二)。
当胚胎逐步发育到13hpf,Mef2c在体节中开始表达,此时约已形成8个体节,表现为在背侧出现两条条带状的深染部位;同时,在心脏中的表达也开始出现,在靠近头侧部出现有深染的片状区域,代表早期的生心区的细胞中有Mef2c表达(图2:cl,c2见封二)。
当胚胎发育至15hpf时,体节以及心脏中Mef2c的表达更加明显,Mef2c在体节的表达表现为各个体节之间能清晰区分,并表现为典型的V型结构;同时,心脏中的表达表现为生心区细胞开始集中,逐步靠近体轴开始形成心管结构,体现出染色更为集中,由片状染色转变成为线状(图2:dl,d2见封二)。
随着胚胎进一步发育,体节逐步完善,心管逐步形成,Mef2c仍然保持较高的转录水平,体节中表现为随着体节的增多,V型染色的体节也随之增多;在心脏的表达呈现出明显的线管状结构(图2:e,f见封--)。
斑马鱼的胚胎发育随着时间的进展而逐步完 万方数据 万方数据图1Fig1图2Fig2图3Fig3图4Fig4斑马鱼胚胎发育过程Mef2c表达(正文见第89页)图2Mef2c基因在斑马鱼胚胎中的表达Fig2TheexpressionofMef2cintheembryosofzebrafisha:6hpf;b:12hpf;C1,c2:13hpf;dl,d2:15hpf;e:20hpf;f24hpf;91.92:48hpfBlackarrow:embryo;Redarrow:heart;Yellowafrow:somite玫瑰糠疹皮损中朗格汉斯细胞的超微结构LC在PR表皮中的表达ExpressionofLCinPRepidermis(DABstaining×400)LC在PR真皮中的表达ExpressionofLCinPRdermis(DABstainingx400)PR皮损中LC的Birbeck颗粒BirbeckgranulesinLCofPR(TEM×20000)PR皮损中LC的线粒体和粗面内质网(正文见第110页)ChangesofroughendoplasmicreticulumandmitochondriainLCofPR(TEM×30000) 万方数据斑马鱼胚胎发育过程中Mef2c的表达作者:刘学飞, 王跃祥, 蒋璆, 钱林溪, 高广文, 董永新, 钟涛, 宋后燕, LIU Xue-fei , WANG Yue-xiang, JIANG Qiu, QIAN Lin-xi, GAO Guang-wen, DONG Yong-xin,ZHONG Tao, SONG Hou-yan作者单位:刘学飞,王跃祥,蒋璆,钱林溪,高广文,董永新,宋后燕,LIU Xue-fei,WANG Yue-xiang,JIANG Qiu,QIAN Lin-xi,GAO Guang-wen,DONG Yong-xin,SONG Hou-yan(复旦大学上海医学院生物化学与分子生物学系-分子医学教育部重点实验室,上海,200032), 钟涛,ZHONG Tao(美国Vanderbilt大学医学院心血管研究室,TN 37027)刊名:复旦学报(医学版)英文刊名:FUDAN UNIVERSITY JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES年,卷(期):2006,33(1)1.Lin Q;Schwarz J;Bucana C Control of mouse cardiac morphogenesis and myogenesis by transcription factor Mef2c[外文期刊] 19972.Srivastava D;Olson EN A genetic blueprint for cardiac development[外文期刊] 20003.Black BL;Olsen EN Transcriptional control of muscle by myocyte enhancer factor-2 (MEF-2) protein [外文期刊] 19984.Harland RM;Kay BK;Peng HB In situ hybrization:an improved whole-mount method for Xenopus embryos [外文期刊] 19915.Warren KS;Fishman MC"Physiological genomics":mutant screens in zebrafish[外文期刊] 19986.徐振华;赵慕军;李载平斑马鱼与人类疾病模型的研究[期刊论文]-生命的化学 2002(04)7.Skerjanc IS;Ptropoulos H;Ridgeway AG Myocyte Enhancer Factor 2C and Nkx2-5 Up-regulate EachOther's Expression and Initiate Cardiomyogenesis in P19 Cells[外文期刊] 1998(52)8.Wang DZ;Valdez1 MR;McAnally R The Mef2cgene is a direct transcriptional target of myogenic bHLH and MEF2 proteins during skeletal muscle development 20019.Liu ZP;Nakagawa O;Nakagawa M CHAMP,A Novel Cardiac-Specific Helicase Regulated by Mef2c 200110.Razeghi P;Young ME;Cockrill TC Downregulation of myocardial myocyte enhancer factor 2c and myocyte enhancer factor 2c-regulated gene expression in diabetic patients with nonischemic heart failure[外文期刊] 200211.Baruch ST;Didier YRS;Mark CF Three zebrafish MEF2 genes delineate somatic and cardiac muscle development in wild-type and mutant embryos 19961.周云.何晓宇.ZHOU Yun.HE Xiao-yu转录因子GATA-4在人胎心发育中的表达[期刊论文]-医学研究生学报2008,21(4)2.周文.冯湘玲.杨旭宇.王磊.姚开泰DIG标记DNA探针检测noggin在爪蟾胚胎中的表达[期刊论文]-生命科学研究2002,6(3)3.张立凤.桂永浩.钟涛.王跃祥.蒋球.崇梅.孙淑娜.宋后燕.ZHANG Li-feng.GUI Yong-hao.ZHONG Tao.WANG Yue-xiang.JIANG Qiu.CHONG Mei.SUN Shu-na.SONG Hou-yan视黄酸影响斑马鱼胚胎心脏房室分化[期刊论文]-复旦学报(医学版)2007,34(1)4.李艳欢.吴新荣斑马鱼整体原位杂交法研究MMP15a的发育相关表达的初步观察[期刊论文]-生物学杂志2009,26(6)本文链接:/Periodical_shykdxxb200601021.aspx。