荧光定量PCR检测技术
荧光定量PCR检测技术

如果检测到荧光信号超过域值被认为是 真正的信号,它可用于定义样本的域值 循环数(Ct)。 Ct值的含义是: 每个反应管内的荧光信号达到设定的域
值时所经历的循环数。
什么是C(t)值
C(t)
Threshold(域值)
为什么要引入C(t)值
Endpoin
96 replicates of B7 gene molecular beacon
1 、采用闭管检测,不需 PCR 后处理, 并采用dUTP-UNG酶的防污染系统,扩 增和检测一次同时完成。不需开盖,不
产生污染,避免了假阳性。
FQ-PCR与普通PCR的区别
2 、探针与被检 DNA 序列特异杂交, 增强了特异性。
A、上下游引物和探针三道关卡控制其 特异性; B、引物和探针都比较长,退火温度较 高,非特异性扩增几率减少。
FQ-PCR与普通PCR的区别
5、可以多重检测。
如果检测两种以上的基因片断,可以对各个 基因分别设计探针和引物,在不同的反应管 中进行TaqMan检测,或者将各自的探针分 别标记不同的荧光信号,在同一个反应体系 中检测多个基因片断。
二、SYBR荧光染料原理
在PCR反应体系中,加入过量SYBR荧 光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入 DNA双链后,发射荧光信号,而不掺入 链中的SYBR染料分子不会发射任何荧 光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR产物的增加完全同步。
FQ-PCR与普通PCR的区别
3、可定量结果,准确灵敏地反应了 病原体的感染和治疗恢复情况。
FQ-PCR与普通PCR的区别
4、光谱分析仪直读结果,自动分析, 增强了 灵敏性和客观性。能够实时检测,即一边PCR, 一边检测PCR的结果,而不需要在PCR结束之 后进行核酸电泳来显示PCR反应的结果,(因 此实时荧光PCR检测技术操作更简单;也避免 了核酸电泳非常难以回避的化学污染和核酸污 染等严重问题);
荧光定量PCR技术

03
结果重复性差
可能原因包括实验操作不规范、仪器 故障等。解决方案包括规范实验操作 、定期维护和校准仪器等。
05
荧光定量PCR技术在生物医学 研究中的应用
基因表达水平检测
绝对定量
通过标准曲线对未知模板进行定量分析,确 定基因的表达量。
相对定量
比较不同样本间基因表达的差异,常用于研究基因 在不同组织、不同发育阶段或不同处理条件下的表 达模式。
光信号的特性,实现对PCR产物的实时监测。
02
第二代荧光定量PCR技术
引入了特异性更高的荧光探针(如TaqMan探针),提高了检测的准确
性和特异性。
03
第三代荧光定量PCR技术
在第二代技术的基础上,进一步改进了荧光探针的设计,引入了多种荧
光基团和猝灭基团,实现了多重荧光定量PCR检测。
应用领域及意义
研究微生物与环境因素的相互作用
荧光定量PCR技术可用于研究微生物与环境因素(如温度、pH值、营养物质等)的相互 作用,揭示微生物在环境中的适应机制和生态功能。
食品安全领域应用
检测食品中的病原微生物
荧光定量PCR技术可用于快速、灵敏地检测食品中的病原微生物,如沙门氏菌、大肠杆菌等,保 障食品安全。
评估食品中的转基因成分
重复性原则
设计合理的实验重复和对照,以验证结果的 稳定性和可靠性。
定量准确性原则
选择合适的荧光定量方法和标准曲线,确保 目标序列的准确定量。
样品准备与DNA提取方法
样品准备
收集待测样品,如组织、细 胞、血液等,并进行适当的 处理,如研磨、裂解等,以
释放DNA。
DNA提取方法
根据样品类型和实验需求选 择合适的DNA提取方法,如 酚氯仿抽提法、试剂盒法等 ,以获得高质量的DNA模板
1、试述荧光定量pcr技术的原理、方法、注意事项及其在临床与科研中的应用

1、试述荧光定量pcr技术的原理、方法、注意事项及其在临床与科研中的应用
荧光定量PCR是一种在PCR反应过程中,通过荧光信号的检测来对PCR产物进行实时定量分析的技术。
1. 原理:
荧光定量PCR利用荧光染料或者荧光探针,标记扩增过程中的每一个循环的产物,这些荧光标记的产物在激发光的作用下会发出荧光。
随着反应的进行,PCR产物不断累积,荧光信号也随之增强。
通过对荧光信号的实时监测,可以推断出样本中起始模板的数量。
2. 方法:
主要方法包括探针法、SYBR Green I染料法和分子信标法等。
探针法使用与目标序列特异性结合的荧光探针来标记PCR产物。
SYBR Green I染料法则是利用染料与双链DNA的结合特性,将染料添加到反应体系中,随着PCR产物的增加,染料的荧光信号也增强。
3. 注意事项:
荧光定量PCR对样品纯度要求较高,应避免杂质的干扰。
反应体系中的成分和浓度需要精确控制,以确保实验结果的准确性。
荧光定量PCR的结果解读需要参考标准曲线,以确定未知样本中的目标序列数量。
4. 在临床与科研中的应用:
在临床应用中,荧光定量PCR被广泛用于病原体检测、基因突变分析、遗传病诊断以及癌症研究等。
例如,用于检测病毒如HIV、HBV等的载量,或者检测癌症相关基因的表达水平。
在科研领域,荧光定量PCR可用于基因表达分析、基因组学和表观遗传学研究中。
例如,比较不同组织或细胞类型的基因表达差异,或者研究表观遗传修饰对基因表达的影响。
总的来说,荧光定量PCR技术是一种高灵敏度、高特异性的核酸定量分析方法,对于临床诊断和科学研究具有重要意义。
荧光定量PCR技术原理与结果分析

荧光定量PCR技术原理与结果分析一、荧光定量PCR技术原理1.基本原理荧光定量PCR技术基于传统的PCR技术,其中关键的步骤是DNA的扩增。
PCR过程中,DNA模板会通过聚合酶链式反应在多个循环中进行指数级扩增。
在扩增过程中,每一个循环都包括三个主要步骤:变性,引物结合和扩增。
2.荧光标记3.荧光信号检测与分析在PCR反应的扩增过程中,荧光强度会随着PCR产物的扩增而增加。
荧光信号的强度与扩增目标DNA的数量成正比。
因此,通过测量PCR反应中发出的荧光信号的强度,可以确定目标DNA的起始数量。
二、荧光定量PCR技术结果分析1.标准曲线2.反应效率反应效率是PCR扩增的关键因素之一、反应效率是通过标准曲线的斜率来表示的,斜率越接近1,表示反应效率越高。
较低的PCR反应效率可能是由于试剂的浓度不足、PCR条件不合适或者目标DNA的起始浓度低。
3.CT值CT值是PCR反应过程中,荧光信号由背景噪声中分离出来的阈值周期数。
在荧光定量PCR实验中,CT值用于计算目标DNA的起始浓度。
CT值越小,表示目标DNA的起始数量越多。
4.荧光指数荧光指数是指测量PCR反应中特定周期(一般为指定阈值之后的周期)的荧光信号的增加量。
荧光指数也可以用来评估PCR的效果和目标DNA的起始数量。
荧光指数越高,表示目标DNA的起始数量越多。
5.目标基因的相对表达量总结起来就是,荧光定量PCR技术通过引入荧光标记的引物和探针,在PCR反应中实时监测荧光信号的强度变化来定量分析目标DNA的起始数量。
通过制备标准曲线、测量CT值和荧光指数,可以对PCR反应的效果和目标DNA的表达量进行定量分析。
此外,荧光定量PCR还可以用于研究目标基因的相对表达量。
荧光定量pcr技术

荧光定量pcr技术
荧光定量PCR技术是一种可以快速准确定量分析基因表达水平的高灵敏度技术,是分子生物学实验中最常用的定量技术。
荧光定量PCR技术结合了荧光技术和PCR技术,通过定量PCR技术可以获得特定基因在某一样本中的表达水平,广泛应用于基因表达谱的分析、基因芯片的芯片定量、基因功能的研究、抗性蛋白的检测、表观遗传学的分析等。
荧光定量PCR技术的原理是利用特定的核酸引物对目标基因进行扩增,在扩增过程中,会加入能够发出荧光信号的探针,探针会与基因片段结合,在特定条件下会发出荧光,用荧光检测仪检测荧光信号,根据荧光强度来推测基因表达水平。
荧光定量PCR技术具有检测灵敏度高、结果可靠、操作简便、快速、成本低等优势,在生物学研究中有着重要的作用。
荧光定量PCR技术的实施,需要准备特定的核酸引物及荧光探针,确定PCR 探针的配对关系,以及设置正确的反应参数,实施反应,将PCR反应产物分析荧光检测仪,结果准确可靠。
总之,荧光定量PCR技术是一种快速准确定量分析基因表达水平的高灵敏度技术,在生物学研究中起着重要的作用,具有很好的应用前景。
荧光定量PCR技术在基因检测中的应用

荧光定量PCR技术在基因检测中的应用引言PCR技术是分子生物学中的重要工具,是一种基于DNA模板进行体外扩增的技术。
PCR技术的发展促进了基因检测的发展,而荧光定量PCR技术作为PCR技术的升级版,在基因检测中有着广泛的应用。
本文主要介绍荧光定量PCR技术的原理、特点、优势及在基因检测中的应用。
一、荧光定量PCR技术的原理荧光定量PCR技术是PCR技术发展的一种变化,它通过测量PCR扩增反应体系中所含荧光染料的荧光强度,来确定扩增产物的数量。
荧光定量PCR技术的基本原理如下:1、往PCR反应体系中添加荧光染料在PCR扩增反应体系中加入荧光染料,如SYBR Green。
SYBR Green是一种具有振动激发的荧光染料,它可以与DNA双链结合并发出荧光信号。
2、采用实时荧光检测技术实时荧光检测技术可以实时测量PCR反应体系中SYBR Green 的荧光强度,并将其转换为扩增产物的相对数量信息。
每个PCR扩增周期结束后,都会利用荧光探针检测扩增产物的浓度,然后显示在计算机上。
3、荧光定量PCR技术的成本较高荧光定量PCR技术的成本较高,因为它需要使用专门的仪器和荧光染料。
二、荧光定量PCR技术的特点荧光定量PCR技术有以下特点:1、高灵敏度荧光定量PCR技术可以检测非常少量的DNA分子,甚至可以检测单个分子。
2、高精度荧光定量PCR技术具有高精度,可以检测极少数的基因。
3、高通量荧光定量PCR技术可以进行高通量分析,可以同时检测多个基因。
4、多重分析荧光定量PCR技术可以进行多重分析,可以同时检测不同基因的表达情况。
5、简单操作荧光定量PCR技术的操作简单,无需非常复杂的实验技能,实验人员可以很快地掌握技术。
三、荧光定量PCR技术的优势荧光定量PCR技术在基因检测中有以下优势:1、快速高效荧光定量PCR技术只需要很少的时间就可以完成分析,可以大大缩短实验周期。
2、高精度高灵敏度荧光定量PCR技术具有高精度和高灵敏度,并且可以进行多重分析。
荧光定量pcr实验原理与应用

荧光定量pcr实验原理与应用荧光定量PCR(qPCR)是一种高灵敏度、高特异性的DNA扩增技术,通过检测PCR反应体系中的荧光信号实时监测DNA的合成量。
这种技术结合了传统PCR的高效性和荧光探针的高度特异性,广泛应用于基因表达分析、病原体检测、基因定量、基因型鉴定等领域。
一、原理荧光定量PCR利用荧光信号与PCR产物数量呈正比的原理,通过实时监测PCR反应过程中荧光信号的强度变化来确定反应体系中模板DNA的初始量。
在PCR反应中,荧光探针与特定的DNA序列结合,并发出荧光信号。
随着PCR反应的进行,产物数量逐渐增加,荧光信号也随之增加。
通过检测荧光信号的增长曲线,可以确定初始模板DNA的数量。
二、应用1.基因表达分析:荧光定量PCR可用于实时监测基因的表达水平,通过检测靶基因的mRNA量来研究基因在不同条件下的表达情况。
2.病原体检测:荧光定量PCR可用于快速准确地检测病原体的存在,如病毒、细菌等,对临床诊断和疾病监测具有重要意义。
3.基因定量:荧光定量PCR可用于定量分析基因拷贝数、基因表达水平等,对基因功能研究和疾病诊断有重要作用。
4.基因型鉴定:荧光定量PCR可用于检测基因型多态性,如单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失等,用于遗传学研究和个体鉴定。
三、优势与传统PCR技术相比,荧光定量PCR具有以下优势:1.高灵敏度:荧光信号与PCR产物数量呈正比,可实现低拷贝数DNA的检测。
2.高特异性:荧光探针设计精准,可准确识别靶基因序列,避免非特异性扩增。
3.实时监测:可实时监测PCR反应过程中的荧光信号,得到实时、准确的反应动态信息。
4.高准确性:荧光定量PCR结果稳定可靠,可用于定量分析和比较研究。
荧光定量PCR作为一种高效、高灵敏的DNA定量技术,在生命科学研究、临床诊断、食品安全监测等领域具有广泛应用前景。
随着技术的不断发展和完善,荧光定量PCR将在更多领域发挥重要作用,为科学研究和临床实践提供强有力的支持。
荧光定量PCR技术

荧光定量PCR技术荧光定量PCR技术(Fluorescent Quantitative PCR,简称qPCR)是一种基于聚合酶链式反应(PCR)的多样性分析方法,它能够对DNA 分子进行定量分析。
本文将介绍荧光定量PCR技术的原理、优势以及应用领域。
一、原理荧光定量PCR技术是在常规PCR技术的基础上发展起来的,它通过添加与PCR产物相关联的荧光探针,利用荧光信号的定量变化来确定PCR反应中目标DNA的含量。
具体原理如下:1. 引物设计:根据目标DNA序列,设计一对特异性引物。
这两个引物分别作为PCR反应中的前向引物和反向引物,可以在PCR扩增的过程中特异性地结合到目标DNA序列的两端。
2. 荧光探针选择:为了检测PCR扩增产物的数量,需要选择一个荧光探针来标记目标DNA。
常用的荧光探针包括TaqMan探针、Molecular Beacons以及SYBR Green等。
3. 扩增过程:在PCR扩增过程中,前向和反向引物将目标DNA序列作为模板进行扩增。
同时,荧光探针与PCR扩增产物结合,并通过荧光信号被激发发出荧光。
4. 荧光检测:荧光定量PCR装置能够检测到荧光强度的变化,并根据标准曲线进行定量计算。
荧光信号的强度与PCR扩增产物的数量成正比。
二、优势荧光定量PCR技术相比于传统PCR技术具有以下优势:1. 高灵敏度:荧光定量PCR技术可以检测到极低浓度的目标DNA,其灵敏度通常可达到单拷贝水平。
2. 高特异性:由于设计特异性引物和荧光探针,荧光定量PCR技术对目标DNA的选择性很高,几乎不会产生假阳性结果。
3. 定量精确:通过荧光信号强度的定量变化,荧光定量PCR技术能够准确测定PCR扩增产物的数量,从而实现对目标DNA的定量分析。
4. 速度快:相比于传统的定量分析方法,荧光定量PCR技术的反应时间更短,结果可以在几个小时内得到。
三、应用领域荧光定量PCR技术在生物医学研究、疾病诊断和基因表达分析等领域得到了广泛的应用:1. 基因表达分析:荧光定量PCR技术可以定量检测不同基因在细胞或组织中的表达水平,为基因功能研究提供有力支持。
荧光定量pcr技术

荧光定量pcr技术1荧光定量PCR技术荧光定量PCR技术是一项临床检测技术,可以用于电子细胞学、遗传学分析和生物学研究的诊断和治疗,是现代分子生物学研究的重要技术和工具。
它可以用来快速准确测定微量的基因突变物,是一种重要的分子生物学技术。
2基本原理荧光定量PCR的基本原理是利用特定的核酸引物与靶序列结合能够将二碱基添加物体(TAMRA)附着到反应碱基处,当DNA聚合酶催化DNA模板反应完成后,产生大量逐渐增多(cumulative)的双链DNA分子,每一个Tama DNA分子会发出特定波长的荧光,可以以气运及成像仪检测曲线。
由此可以研究基因表达量或检测基因突变。
3结构图荧光定量PCR是由PCR反应体系、荧光检测系统和生物计算机软件三部分组成的。
PCR反应体系主要由PCR反应管,DNA聚合酶,引物,核酸模板,dNTP,反应矿物液等构成,而荧光检测系统由荧光检测仪、光学模块、滤波器和细节探查器等组成,生物计算机软件则含有数据处理和分析工具等。
4操作步骤(1)准备试剂=将相应的引物、模板酶、模板、等试剂准备完毕(2)反应杯=将试剂放入反应杯中(3)添加活性=加入活性DNA复制酶并完成反应(4)添加TAMRA探针=添加探针的复制物(5)样品吸附=将样品放入荧光PCR仪,待样品被荧光PCR仪件计数(6)数据处理=将获取的数据处理为连续变化线,并进行准确定量5应用荧光定量PCR技术最早用于病毒感染或突变的检测,后来也被广泛用于人类基因组学研究和生物分子临床检测。
荧光定量PCR技术可用于检测癌症的基因突变,诊断免疫过敏症状,检测病毒杂交异体,以及测定各种人体疾病的基因感染活性等多方面应用。
此外,还可用于分离基因扩增及基因电泳,核酸转录检测,组织学,血清学等技术领域。
6优势荧光定量PCR是一种灵敏而稳定的数据测定方法,能快速、准确地检测极微量的样品,具有视觉化简易性、灵活多变,还可同时检测多个基因样品。
此外,选用的引物和探针也极为可靠,重复性强,可以有效控制背景噪声,为分子诊断技术的发展做出巨大贡献。
荧光定量pcr原理

荧光定量pcr原理
荧光定量PCR是一种用于定量检测DNA分子数量的技术。
其原理基于传统PCR技术,通过引入荧光探针和荧光素标记的引物来实现DNA数量的检测与测量。
在PCR反应中,首先将要检测的DNA样本与一对特定序列的引物进行反应。
这两个引物分别与待检测的DNA片段的两端序列互补。
当PCR反应进行到特定的温度时,引物会与DNA 片段结合,作为复合物存在。
在引物和DNA结合的阶段,引物会被荧光素标记的探针所识别。
探针与引物结合后,荧光素的荧光信号就会产生。
这个信号的强度与DNA片段的数量成正比。
荧光信号会在每一个PCR循环中累积,从而对DNA数量进行定量。
在PCR反应过程结束后,通过荧光仪来测量PCR管中的荧光信号强度。
这些信号会被转化为数字数据,然后使用计算机软件进行分析和定量。
根据控制组的荧光信号强度,可以建立标准曲线,以确定未知样本中DNA的数量。
荧光定量PCR具有高灵敏度、高选择性和高准确性的特点。
它广泛应用于基因表达研究、病原体检测、遗传疾病诊断等领域。
荧光定量PCRPPT课件

仪器设备
确保PCR仪、荧光检测器 等设备正常运行,并按照 实验要求进行参数设置。
实验设计
根据研究目的和样本特性, 设计合理的荧光定量PCR 实验方案。
样本处理
样本收集
采集具有代表性的样本, 并妥善保存以备后续实验。
样本处理
将样本进行适当的处理, 如细胞分离、DNA/RNA 提取等,以获得足够的核 酸模板。
荧光信号检测
在PCR循环过程中,实时监测荧光 信号的变化,收集数据以供后续分 析。
结果分析
数据处理
结果应用
对荧光定量PCR实验数据进行处理, 如阈值设定、循环阈值(Ct值)计算 等。
将荧光定量PCR实验结果应用于后续 的研究或实际应用中,如基因表达分 析、病原体检测等。
结果解读
根据实验目的和预期结果,对荧光定 量PCR实验结果进行解读,并评估其 可靠性。
02
该技术利用荧光染料或荧光探针 标记特异性检测目标,通过荧光 信号的累积和检测,实现对目标 序列的实时定量分析。
荧光定量PCR技术的原理
在PCR反应过程中,随着DNA 的合成,荧光染料或荧光探针与
DNA结合,产生荧光信号。
随着DNA的扩增,荧光信号也 相应增强,通过实时监测荧光信 号的变化,可以计算出目标序列
基因突变检测
总结词
荧光定量PCR技术可用于检测基因突变,通过对基因序列的变异进行分析,有助于遗传性疾病的诊断、药物疗效 评估和个性化治疗。
详细描述
荧光定量PCR能够高特异性地检测基因序列的变异,包括点突变、插入和缺失等。通过比较正常组织和病变组织 的基因突变差异,有助于了解疾病的发生和发展机制,为遗传性疾病的诊断和治疗提供依据。同时,基因突变检 测还可用于药物疗效评估和个性化治疗方案的制定。
荧光定量PCR技术及临床应用

03
疗效评估与预后判 断
荧光定量PCR技术可以实时监测 肿瘤治疗效果,评估患者预后病检测
01
荧光定量PCR技术可以对单基因遗传病进行检测,如地中海贫
血、血友病等。
染色体异常检测
02
通过荧光定量PCR技术,可以检测染色体数目和结构异常,如
唐氏综合征、威廉姆斯综合征等。
自动化程度高
现代荧光定量PCR仪具有高度的自动化特点,能够快速、准确地完成 大量样本的检测和分析,提高工作效率。
局限性
成本较高
荧光定量PCR技术所需的仪 器、试剂和耗材成本较高, 限制了其在资源有限地区的 广泛应用。
操作复杂
样本处理要求高
荧光定量PCR技术操作较为 复杂,需要专业人员操作和 解读结果,增加了技术门槛。
技术改进与创新
提高检测灵敏度和特异性
通过改进PCR反应体系和荧光检测方法,提高荧光定量PCR技术 的灵敏度和特异性,降低检测下限。
自动化与智能化
通过自动化和智能化的技术手段,简化荧光定量PCR的操作流程, 提高检测效率,降低人为误差。
标准化与质量控制
建立荧光定量PCR技术的标准化操作和质量控制体系,确保检测结 果的准确性和可靠性,促进技术的广泛应用和推广。
病原体检测
荧光定量PCR技术在病原体检测 方面具有高灵敏度和特异性,可 应用于各种感染性疾病的诊断和
监测。
肿瘤诊断与治疗
荧光定量PCR技术可应用于肿瘤相 关基因的突变检测、肿瘤细胞耐药 性分析等方面,为肿瘤的诊断和治 疗提供有力支持。
遗传性疾病诊断
荧光定量PCR技术可应用于基因突 变检测、单基因遗传病和染色体异 常疾病的诊断,有助于遗传性疾病 的早期发现和干预。
荧光定量PCR实验及数据分析

荧光定量PCR实验及数据分析一、概述荧光定量PCR(Quantitative Realtime PCR,简称qPCR)是一种结合了PCR技术的高灵敏度和荧光探针技术的实时定量特性的分子生物学分析方法。
该方法通过实时监测PCR反应过程中荧光信号的变化,对模板DNA或RNA的初始浓度进行定量分析。
荧光定量PCR技术在基因表达研究、病原体检测、基因突变分析以及药物疗效评估等领域具有广泛的应用价值。
在荧光定量PCR实验中,通常使用特异性引物和荧光探针来识别并扩增目标序列。
荧光探针的设计是关键步骤之一,它必须能够与目标序列特异性结合并在PCR过程中产生可检测的荧光信号。
实验过程中还需严格控制反应条件,包括温度、时间、引物和探针的浓度等,以确保实验的准确性和可重复性。
数据分析是荧光定量PCR实验不可或缺的一部分。
通过对实验数据的收集、整理和分析,可以获取目标序列的初始浓度信息,进而对实验结果进行解读和评估。
数据分析方法包括相对定量和绝对定量两种,前者通过比较不同样本间目标序列的相对表达量来评估差异,后者则通过标准曲线法或质粒拷贝数法等方法来确定目标序列的绝对浓度。
荧光定量PCR技术是一种高效、灵敏且特异的分子生物学分析方法,对于研究基因表达、病原体检测等领域具有重要意义。
通过不断优化实验操作和数据分析方法,可以进一步提高荧光定量PCR实验的准确性和可靠性,为科学研究和临床实践提供有力支持。
1. 荧光定量PCR技术的概述荧光定量PCR技术,是一种基于DNA聚合酶链式反应的分子生物学技术,它通过引入荧光标记,实时监测PCR过程中目标DNA片段的扩增情况,从而实现对特定基因拷贝数的精确量化。
该技术结合了PCR的高效扩增能力与荧光信号的灵敏检测,使得微量DNA分子的检测成为可能,并在遗传学、分子生物学、医学诊断等领域中发挥着重要作用。
荧光定量PCR技术主要依赖于特异性引物和探针的设计,使得PCR扩增过程具有高度的特异性。
实时荧光定量pcr的原理和方法

实时荧光定量pcr的原理和方法实时荧光定量PCR(qPCR)是一种分子生物学技术,用于检测和定量特定DNA或RNA序列的存在和相对丰度。
它可以在短时间内快速、准确地测量目标序列的数量,并在许多领域中被广泛应用,包括基因表达分析、病原体检测和基因突变分析等。
实时荧光定量PCR的主要原理是通过放大DNA模板,并使用荧光探针或染料进行实时监测。
这些荧光探针通常是DNA寡核苷酸序列,带有一个共振能量转移对(RET pair),由一个荧光引物(donor)和另一个荧光引物(acceptor)组成。
在初始的PCR循环中,通过在高温下使DNA变性,使两个引物和DNA分离。
在下一个低温的退火步骤中,这两个引物会与DNA互补结合。
当两个引物结合到DNA模板上时,它们的荧光引物也会接近彼此,从而使共振能量转移发生,导致荧光信号减弱或消失。
这种现象被称为荧光淬灭。
当PCR循环继续进行时,每个复制周期会以指数级增加DNA模板的数量。
由于引物的结合会导致荧光淬灭,因此在每个PCR循环的末尾,荧光信号将与DNA模板的数量成正比。
实时荧光定量PCR中常用的荧光探针有探针PCR和SYBR Green。
探针PCR使用两个引物和一个荧光探针,该探针带有一个荧光团和一个辅助荧光团。
在荧光探针与DNA模板结合时,两个荧光团之间的共振能量转移会发生,导致荧光信号的减弱。
SYBR Green则是一种将DNA结合的染料,在PCR循环中,SYBR Green会与所有DNA结合,并发出荧光信号。
使用探针PCR时,可以通过测量荧光信号的减弱来确定目标DNA的存在量。
而使用SYBR Green时,可以通过测量荧光信号的增加来判断目标DNA的数量。
实时荧光定量PCR的操作过程如下:1. DNA提取和纯化:从样品中提取所需的DNA或RNA,并经过纯化处理,以去除可能干扰PCR反应的杂质。
2. 引物设计:设计适合的引物和荧光探针,以在PCR反应中特异性地扩增目标序列。
荧光定量PCR技术原理与结果分析

荧光定量PCR技术原理与结果分析荧光定量PCR(qPCR)是一种广泛应用于分子生物学的实验技术,可以对DNA或RNA目标序列进行定量分析。
本文将介绍荧光定量PCR的原理和结果分析,包括实验步骤、PCR曲线的解读以及测定目标序列的相对表达水平等。
一、荧光定量PCR的原理荧光定量PCR技术主要基于PCR的原理,即通过模板DNA的逐渐扩增,来定量分析起始模板DNA或RNA的数量。
在实验中,荧光定量PCR通常使用DNA合成酶来合成目标序列的拷贝,通过在每个扩增周期后测量荧光信号的变化,来定量反应的进程。
1.准备试剂和反应体系:包括引物、合成的目标序列等。
2.PCR反应:在热循环PCR仪中,通过一系列不同温度的循环,使模板DNA的扩增合成逐渐发生。
3.荧光信号检测:通过在每个循环后侦测荧光信号的变化,来定量PCR反应的进程和模板DNA的数量。
4.数据分析:通过荧光信号的变化来计算模板DNA或RNA的相对表达水平。
二、荧光定量PCR结果分析1.PCR曲线的解读在荧光定量PCR反应中,通常会绘制荧光信号与PCR循环数的关系图即PCR曲线。
根据PCR曲线的形状,可以得到以下几个关键结果:(1)阈值循环数(Ct):阈值循环数是PCR曲线上荧光信号超过背景信号的循环数。
Ct值越小,目标序列的初始模板数量越多。
(2) 扩增效率(Efficiency):扩增效率可以通过计算PCR曲线斜率的反向值得到,通常表达为百分比。
扩增效率越高,说明PCR反应的有效性越好。
(3)Ct值偏移:Ct值偏移是指实验组与对照组(如阴性对照或基准组)之间的Ct值差异。
Ct值偏移的大小可以用于计算相对表达水平。
2.相对表达水平的测定相对表达水平是指在不同实验条件下,目标序列在不同组织或细胞中的表达量相对比较和定量分析。
常用的计算方法有:(1)∆∆Ct法:通过计算实验组与对照组的相对Ct值差异来获得相对表达水平。
∆∆Ct值越大,目标序列的表达水平差异越明显。
荧光定量PCR

荧光定量PCR(Quantitative Real-Time PCR,简称qPCR)是一种分子生物学技术,用于精确测定样本中特定核酸序列的数量。
其基本原理基于PCR(聚合酶链式反应)技术和实时荧光检测,能够在PCR扩增过程中连续监测荧光信号的变化,从而实现对起始模板量的定量分析。
荧光定量PCR原理简述:1.PCR扩增:qPCR采用传统的PCR方法,包括变性(DNA双链解开成单链)、退火(引物与靶序列配对)和延伸(DNA聚合酶合成新链)这三个基本步骤,反复进行使得目标序列指数级扩增。
2.荧光标记与检测:SYBR Green法:SYBR Green是一种非特异性的双链DNA结合染料,在游离状态下几乎不发出荧光,但一旦与双链DNA结合后,荧光强度显著增强。
因此,随着PCR过程中的产物增加,荧光信号也相应增加,荧光强度与PCR产物的数量成正比。
TaqMan探针法:此方法更为特异,使用一种特殊的寡核苷酸探针,其两端分别标记了荧光报告基团和淬灭基团。
在PCR反应中,当探针与靶序列配对时,位于中间的探针被Taq 酶水解,导致荧光报告基团与淬灭基团分离,从而产生荧光信号。
只有当特定的扩增产物生成时才会释放荧光。
荧光定量PCR实验步骤概览:1.样品制备:RNA提取:从组织、细胞或其他生物样本中提取总RNA,常用TRIZOL或类似试剂进行裂解、离心分相和乙醇沉淀来纯化RNA。
cDNA合成:对于mRNA的定量,需要先将RNA逆转录为cDNA。
2.设计与合成引物:针对目标基因设计一对特异性的PCR引物,用于扩增目的片段。
3.PCR反应体系构建:将纯化的cDNA或DNA模板、特异性引物、Taq聚合酶、缓冲液、dNTPs和其他必要成分如SYBR Green染料或TaqMan探针等加入至PCR管中,配置成最终的PCR反应体系。
4.实时荧光PCR扩增与检测:在荧光定量PCR仪上进行PCR反应,仪器在每次循环的适当阶段收集荧光信号,并记录下来。
荧光定量pcr技术

荧光定量pcr技术
荧光定量PCR(Polymerase Chn Reaction)技术是一种
基于PCR原理的分子生物学技术,通过在PCR反应体系中加入荧光探针,利用荧光信号的量化来测定靶标DNA的数量。
荧光定量PCR技术相比传统的定量PCR技术具有更高的灵敏度和准确性。
它可以实现对低浓度目标DNA的定量检测,并且可以同时检测多个靶标DNA。
荧光定量PCR技术的基本原理是,将待测样品中的DNA
模板与引物和荧光探针一起加入PCR反应体系中,然后通
过PCR反应,在每一个PCR循环中,荧光探针与靶标DNA结合并发生剪切反应,荧光信号释放出来并被检测仪器检测到。
荧光定量PCR技术常用的荧光探针有TaqMan探针、Molecular Beacon探针和Scorpion探针等。
这些探针一般由专门设计的两个引物和一个含有荧光染料和荧光抑制
剂的short oligo组成。
通过检测荧光信号的增强程度,荧光定量PCR技术可定量反映靶标DNA的初始量。
通常采用标准曲线法或计算相对表达法来进行定量结果的分析。
荧光定量PCR技术在医学诊断、基础生物学研究和遗传学分析等领域得到了广泛应用,有助于快速、准确地检测和定量目标DNA。
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PCR扩增前
荧 光
完好探针
荧 光 淬
物
上游引物
质
灭 物
质
模板负链
PCR扩增时
DNA合成
探针水解,释放荧光
TaqMan® 探针
Donor dye (Reporter)
Acceptor dye (Quencher)
未结合的探针
Light Taq Light
Energy transfer
光发射或者以热量形式散失
前或向后)的序列,或重新选择一个探针, 再寻找合适的引物。
荧光定量PCR检测技术
(FQ-PCR, Fluorescence quantitative PCR)
实时荧光定量PCR技术
所谓real-time FQ-PCR技术,是指 在PCR反应体系中加入荧光基因,利 用荧光信号累积实时监测整个PCR进 程,最后通过标准曲线对未知模板进 行定量分析的方法。
是一种完全闭管式的PCR和荧光探针杂 交技术相结合的定量PCR方法。
探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭 基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切 酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬 灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到 荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧 光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产 物形成完全同步。
TaqMan检测技术
探针、引物与目的片段结合,FRET
Light Emission
Taq
Taq 水解探针,报告荧光素与淬灭荧光素分离
TaqMan检测技术的设计
与普通PCR的设计基本相同,区别 在于引物与探针的设计一般需要特 定的软件,如美国ABI公司开发的 Primer Express软件。
(一)选择靶基因
TaqMan技术主要用于检测,所以其扩增 的基因必须是特异的,如:
实时荧光定量PCR原理
在PCR反应早期,产生荧光的水平不能 与背景明显地区别,而后荧光的产生进 入指数期、线性期和最终的平台期,因 此可以在PCR反应处于指数期的某一点 上来检测PCR产物的量,并且由此来推 断模板最初的含量。
实时荧光定量PCR原理
为了便于对所检测样本进行比较,在real-time QPCR反应的指数期,首先需设定一定荧光信号的域值 (threshold)。
Ct值的含义是: 每个反应管内的荧光信号达到设定的域
值时所经历的循Βιβλιοθήκη 数。什么是C(t)值C(t)
Threshold(域值)
为什么要引入C(t)值
96 replicates of B7 gene molecular beacon
Ct
Endpoin
实时荧光定量PCR原理
研究表明,每个模板的Ct值与该模 板的起始拷贝数的对数存在线性关 系,起始拷贝数越多,Ct值越小。
PCR的高效扩增特性 核酸探针的高特异性 光谱技术的高灵敏性和可计量性
实时荧光定量PCR
定义
利用荧光信号对PCR反应的过程进行实时监控
目的
对起始模板进行定量
优点
灵敏,重复性,动态范围宽,高通量
原理
Ct 值与起始模板浓度的对数成比例
实时荧光定量PCR原理
PCR反应过程中产生的DNA拷贝数是呈指数 方式增加的,随着反应循环数的增加,最终 PCR反应不再以指数方式生成模板,从而进入 平台期。
实时荧光定量
Ct 18 and Ct 22, 2^(4 Ct shift) = 16 fold difference
实时荧光定量PCR原理
利用已知起始拷贝数的标准品可作出 标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝 数的对数,纵坐标代Ct值。因此只要 获得未知样品的Ct值,即可从标准曲 线上计算出该样品的起始拷贝数。
以PCR反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底 信号 (baseline),荧光域值的缺省设置是3~15 个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。
threshold = 10 ´ SDcycle 6-15
实时荧光定量PCR原理
如果检测到荧光信号超过域值被认为是 真正的信号,它可用于定义样本的域值 循环数(Ct)。
(三)选择引物
3、与靶基因其他区域配对较少; 4、G+C含量在40%以上; 5、相同碱基连续不超过4个;
6、Tm值比探针Tm值低10±1℃;
(三)选择引物
7、探针与两条引物之间的各种组合形成 的二聚体都较少,特别是引物3’端与探针 配对很少;
8、PCR扩增片断在70—250个碱基之间。 如果找不到合适的引物,可调整探针(向
标准曲线
如何定量
未知样品的C(t) 值
定量
荧光化学
荧光定量PCR所使用的荧光化学可分 为两种:荧光探针和荧光染料。
荧光探针:TaqMan荧光探针 荧光染料:SYBR荧光染料
一、TaqMan检测技术原理
PCR扩增时在加入一对引物的同时加入 一个特异性的荧光探针,该探针为一寡 核苷酸,与扩增片断内部某一段系列相 同或互补,两端分别标记一个报告荧光 基团和一个淬灭荧光基团。
某种病原微生物所共有的保守基因 (检测某种病原微生物);
某个血清型所特有的基因序列 (区分检测某个血清型);
选择决定毒力强弱的基因 (区分强毒和弱毒)等。
(二)选择探针
选择探针需要同时满足以下条件: 1、在靶基因的保守区域 2、G+C含量在40%以上; 3、相同碱基连续不超过4个;
4、Tm值在71±2℃;
(二)选择探针
5、内部自身配对较少; 6、5’端不为G; 7、G数目比C数目少;
如果6和7难以满足的时候,就要考 虑用互补序列作探针。
(三)选择引物
探针选好之后,在探针的上下游分别选 择合适的引物序列,引物应满足如下的 条件:
1、在靶基因保守和无二级结构的区域; 2、与探针所在区域不重叠;
在传统的PCR 中,常用凝胶电泳分离并用荧 光染色来检测PCR反应的最终扩增产物,因此 用此终点法对PCR产物定量存在不可靠之处。
利用电泳定量
11,500 counts / 5200 counts = 2.2 fold difference
实时荧光定量PCR原理
在real-time Q-PCR中,对整个PCR反 应扩增过程进行了实时的监测和连续地 分析扩增相关的荧光信号,随着反应时 间的进行,监测到的荧光信号的变化可 以绘制成一条曲线。