清华大学微生物学ppt课件

第三节 微生物的分类系统纲要
• 美国微生物学会《伯杰氏细菌鉴定手 册》
• 苏联 克拉西里尼科夫 《细菌和放线 菌的鉴定》
• 法国 普雷沃 《细菌分类学》
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二、 菌物分类系统纲要
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第四节 微生物分类和鉴定的方法 通常把微生物的分类鉴定方法分成5个不
同水平： ①细胞的形态和习性 ②细胞组分 ③蛋白质水平 ④核酸水平 ⑤计算生物学
BacBiblioteka Baidullus spp.
若干芽孢杆菌
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第一节 通用分类单元
三、亚种以下分类名词 提出和使用不受国际命名规则的限制
（一）亚种 进一步细分种时所用的单元，一般指除某 一明显而稳定的特征外，其余鉴定特征与 模式种相同的种。 命名按照三名法
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第一节 通用分类单元
三、亚种以下分类名词
（四）菌株 菌株又称品系（在病毒中称为毒株或株）， 他表示任何由一个独立分离的单细胞（或 单个病毒粒）反制而成的纯遗传型群体及 其一切后代。 菌株的名字可以随意确定。 一般用字母加编号。 如：Escherichia coli K12
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动物界 植物界
原生生物界
三界 （1860年）
1860年，德国动物学家E.H.Haeckel建议
在动物界和植物界之外，增加一个由低等生物
构成的第三界---原生生物界。
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动物界 植物界
原生生物界 菌类 四界
（1956年）
1956年，Copeland分为动物 界、植物界、原生生物界 （原生动物、真菌、部分藻 类）和菌类（细菌和蓝细菌）
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(一)经典的鉴定指标
• 形态 • 生理生化反应 • 生长特性 • 生活史，有性生殖情况 • 血清学反应 • 对噬菌体的敏感性 • 其他
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(二)自动化鉴定技术
1.API细菌数值鉴定系统 法国 2.“Biolog”全自动和手动细菌鉴定系统 美国
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二、微生物分类鉴定中的现代方法
• G+C碱基比例的测定 G+C碱基比例相差多少，可以认为是不同的种 G+C碱基比例相差多少，可以认为是不同的属 • 核酸杂交 G+C碱基比相差多少，鉴定需要做核酸杂交？ • 16SrRNA碱基测序
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掌握以下名词 菌株 菌落 菌苔 斜面 菌种 克隆 分离物
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第二节 微生物在生物界的地位 一、生物的界级分类学说
二界
三界
四界
（1753年） （1860年） （1956年）
五界
六界
三域
（1969年） （1977年） （1978年）
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动物界 植物界
二界 （1753年） 1753年瑞典学者林奈，在其名著 《植物种志》中首次提出了动物界和 植物界。
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第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 （一）7级分类单元
界 Kingdom 门 Phylum 纲 Class 目 Order 科 Family 属 Genus 种 Species
微生物种下单位-------------------------------亚种 subspecies，subsp. 变种 variety，var. 致病变种 pathovar，pv.
第十章 微生物分类和鉴定
基本概念： 分类 （classification），根据各种
细菌的相似性和进化关系将其分为类群， 排放在适当的分类单元中。
鉴定（identification），是分类的 操作过程，经过一系列测定来确定所研 究的菌株属于哪个类群。
命名（nomenclature），根据命 名的国际法则对所鉴定的菌株给以科学 名称（学名）。
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第一节 通用分类单元
二、学名
（一）双名法
依照国际命名法则，采用瑞典科学家林奈（Carl von Linne） 在1753年提出的双名法： 学名=属名+种加词+（首次定名人）+现名定名人+现名定名年份
斜体字
正体字（一般省略）
例1.大肠埃希氏菌（简称“大肠杆菌）
Escherichia coli （Migula） Castellani et Chalmers
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(三)细菌数值分类
又称统计分类法，就是用数理统计的方 法来处理细菌的各种特征，借助现代计算机 对拟分类的微生物对象按大量表型性状的相 似性程度进行统计、归类的方法。
特点:
• 采用较多的分类特征 • 根据“等重原则”各个特征不分主次,同等
1949年，Jahn等提
出六界系统：动物
界、后生植物界、
原生生物界、真菌
界、原核生物界和
病毒界。
1977年，我国学者
王大耜提出：动物
界、植物界、原生
生物界、真菌界、
原核生物界和病毒
界。
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古生菌域
细菌域
真核生物域
1978年，美国C.R.Woese等对大量微生物和其他
生物进行16S和18SrRNA的寡核苷酸测序，并比较 其同源性，提出三域学说Three Domains Theor16y
例2. 丁香假单胞烟草致病变种 Pseudomonas syringae pv. tabaci
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第一节 通用分类单元
二、学名
（三）有关学名的其他知识
1.属名
表示该微生物主要特征，单数，第一个字
母大写
属名什么时候可以缩写？
2.种名加词
代表一个物种的次要特征，字首一律小写
Bacillus sp.
一种芽孢杆菌
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第一节 通用分类单元
一、种以上的系统分类单元 （二）种的概念 种(species):是一个基本分类单元，它 是一大群表性特征高度相似、亲缘关系 及其接近、与同属内其他物种有明显差 异的一大群菌株的总称。
新种（species nova）：指权威性的分 类、鉴定手册中从未记载过的一种新分 离并鉴定的微生物。
例2.枯草芽孢杆菌
Bacillu subtilis（Ehrenberg） Cohn 1872
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第一节 通用分类单元
二、学名 （二）三名法
学名=属名+种加词+符号subsp.或var.+亚种或变种加词
斜体字
正体字（一般省略）
斜体字
例1.苏云金芽孢杆菌腊螟亚种
Bacillus thuringiensis subsp. galleria
1959年，Whittaker：动物界、 植物界、原生生物界和菌物界
1974年，Leedale等：动物界、 植物界、真菌和原核生物界
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动物界 植物界
原生生物界 真菌界
原核生物界
1969年， R. H. Whittaker： 动物界、植物界、原生 生物界、真菌界和原核 生物界
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植物界 菌物界 动物界 原生生物界 原核生物界 病毒界