不平衡巢式设计遗传模型分析

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第４９卷第３期
２０１３年３月ｄｏｉ：１０．１１７０７／ｊ．１００１ — ７４８８．来自０１３０３０１
林
业
科
学
Ｖｏ１．４９．ＮＯ．３
Ｍａｒ．，２０１３
关键词：巢式设计；一般配合力；方差分量；遗传力
中图分类号：￥７２２．３；Ｑ３４８文献标识码：Ａ文章编号：１００１— ７４８８（２０１３）０３— ０００１ —０８
ＡｎａｌｙｓｅｓｏｆＧｅｎｅｔｉｃＭｏｄｅｌｓｆｏｒＵｎｂａｌａｎｃｅｄＮｅｓｔｅｄＤｅｓｉｇｎ
ＳＣＩＥＮＴＩＡ
ＳＩＬＶＡＥ
ＳＩＮＩＣＡＥ
不平衡巢式设计遗传模型分析术
童春发杨立伟蒋安纳施季森
（１．南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京２１００３７；２．南京林业大学信息科学技术学院南京２１００３７）
ＴｏｎｇＣｈｕｎ￣ＹａｎｇＬｉｗｅｉＪｉａｎｇＡｎｎａＳｈｉＪｉｓｅｎ
（１．ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＦｏｒｅｓｔＧｅｎｅｔｉｃｓ＆ＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙｆｏＭｉｎｉｓｔｒｙｆｏＥｄｕｃａｔｉｏｎ，ＮａｎｊｉｎｇＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＮａｎｊｉｎｇ２１００３７；
ｃａｌｃｕｌａｔｉｎｇｔｈｅｅｓｔｉｍａｔｅｓｏｆｇｅｎｅｔｉｃｐａｒａｍｅｔｅｒｓａｎｄｔｈｅｓｔａｔｉｓｔｉｃｓｏｆｓｏｍｅｈｙｐｏｔｈｅｓｉｓｔｅｓｔｓｗｉｔｈｕｎｂａｌａｎｃｅｄｄａｔａ．Ｉｎｔｈｉｓｐａｐｅｒ，ｂｏｔｈｆｉｘｅｄａｎｄｒａｎｄｏｍｌｉｎｅａｒｍｏｄｅｌｓｗｅｒｅａｐｐｌｉｅｄｔｏｅｓｔｉｍａｔｅｔｈｅｇｅｎｅｔｉｃｐａｒａｍｅｔｅｒｓａｎｄｔｏｐｅｒｆｏｒｍｔｅｓｔｓｏｆｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇｈｙｐｏｔｈｅｓｅｓｗｉｔｈｕｎｂａｌａｎｃｅｄｄａｔａｆｒｏｍｔｈｅｎｅｓｔｅｄｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔｄｅｓｉｇｎ．Ｆｏｒｔｈｅｆｉｘｅｄ — ｅｆｆｅｃｔｍｏｄｅｌ，ｗｅａｐｐｌｉｅｄｔｈｅｍｅｔｈｏｄｓｏｆｒｅｓｔｒｉｃｔｅｄｌｉｎｅａｒｍｏｄｅｌｔｏｅｓｔｉｍａｔｅｔｈｅｇｅｎｅｒａｌｃｏｍｂｉｎｉｎｇａｂｉｌｉｔｉｅｓｏｆｐａｒｅｎｔｓａｎｄｔｏｃａｌｃｕｌａｔｅｔｈｅｓｔａｔｉｓｔｉｃｓｆｏｒｔｅｓｔｉｎｇｗｈｅｔｈｅｒｏｒｎｏｔｔｈｅｇｅｎｅｒａｌｃｏｍｂｉｎｉｎｇａｂｉｌｉｔｉｅｓｏｆａｎｙｔｗｏｐａｒｅｎｔｓａｒｅｄｉｆｆｅｒｅｎｔ．Ｆｏｒｔｈｅｒａｎｄｏｍｅｆｆｅｃｔｍｏｄｅｌ，ｗｅｕｓｅｄｔｈｅｔｈｅｏｒｙｏｆｖａｒｉａｎｃｅｃｏｍｐｏｎｅｎｔｍｏｄｅｌｔｏｄｅｒｉｖｅｔｈｅｆｏｒｍｕｌａｅｆｏｒｃｏｍｐｕｔｉｎｇｔｈｅｖａｒｉａｎｃｅｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓ，ｔｈｅｉｒｓｔａｎｄａｒｄｅｒｒｏｒｓ，ａｎｄｔｈｅｓｔａｔｉｓｔｉｃｓｏｒｆｈｙｐｏｔｈｅｓｉｓｔｅｓｔｓ．Ｆｕｒｔｈｅｒｍｏｒｅ，ｆｏｍｕｒｌａｅｆｏｒｃｌｃａｕｌａｔｉｎｇｔｈｅｈｅｒｉｔａｂｉｌｉｔｉｅｓａｎｄｅｓｔｉｍａｔｉｎｇｔｈｅｉｒｓｔａｎｄａｒｄｅｒｏｒｓｗｅｒｅａｌｓｏｇｉｖｅｎ．Ｂａｓｅｄｏｎｔｈｅｓｅｒｅｓｕｌｔｓ，ａＷｉｎｄｏｗｓ — ｂａｓｅｄｓｏｆｔｗａｒｅｗａｓｄｅｖｅｌｏｐｅｄｔｏｉｍｐｌｅｍｅｎｔｔｈｅｃａｌｃｕｌａｔｉｏｎｓｏｆａｌｌｔｈｅｇｅｎｅｔｉｃｐａｒａｍｅｔｅｒｅｓｔｉｍａｔｅｓａｎｄｔｈｅｓｔａｔｉｓｔｉｃｓｏｒｆｖａｒｉｏｕｓｈｙｐｏｔｈｅｓｅｓ，ａｎｄｉｔｗｏｕｌｄｂｅａｕｓｅｆｕｌｔｏｏｌｏｒｆｆｏｒｅｓｔｂｒｅｅｄｅｒｓ．Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ｎｅｓｔｅｄｄｅｓｉｇｎ；ｇｅｎｅｒａｌｃｏｍｂｉｎｉｎｇａｂｉｌｉｔｙ；ｖａｒｉａｎｃｅｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓ；ｈｅｒｉｔａｂｉｌｉｔｙ
２．ＣｏｌｌｅｇｅｆＩｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎＳｃｉｅｎｃｅ＆Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ＮａｎｊｉｎｇＦｏｒｅｓｔｙｒＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＮａｎｊｉｎｇ２１００３７）Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｎｅｓｔｅｄｄｅｓｉｇｎｈａｓｂｅｅｎｗｉｄｅｌｙｕｓｅｄｉｎａｎｉｍａｌａｎｄｐｌａｎｔｂｒｅｅｄｉｎｇ，ｂｕｔｔｈｅｒｅｓｔｉｌｌｅｘｉｓｔｓｏｍｅｐｒｏｂｌｅｍｓｉｎ
应模型估计相关的遗传参数并进行相应的统计假设检验。对于固定效应模型，使用约束线性模型方法推导出亲本配合力估计及亲本间配合力假设检验统计量的计算公式。对于随机效应模型，采用混合线性模型中的方差分析
摘要：虽然巢式试验设计在动植物育种中得到广泛应用，但是在不平衡数据条件下有关遗传参数估计和假设检验统计量的计算还存在着很多问题。文中针对不平衡数据条件下的巢式试验设计，使用固定效应模型和随机效
法，推导出方差分量估计的计算公式，并给出方差分量估计标准误以及方差分量假设检验统计量的计算方法，进而给出遗传力计算公式及其标准误的近似计算方法。最后，用ＶＣ＋＋编写多种形式巢式设计遗传模型的各种遗传参数估计和假设检验统计量计算的Ｗｉｎｄｏｗｓ应用软件，供林木遗传育种工作者使用。