基于医疗大数据的临床科研平台应用设计
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基于医疗大数据的临床科研平台应用设计
目的该院的信息平台具有大量的临床数据以及管理数据,与这些数据有关的科研记过有待进一步的分析,因此构建一个科研分析平台可以为今后的医疗科研提供重要的辅助支持。方法基于临床数据中心构建具有该院医疗结果特色的数据集市。结果实现该院各类科研数据系统的医疗信息共享,建立一个科研病例检索、科研数据管理以及随访系统的完整数据管理模式,解决医疗科研人员处理数据困难的问题。结论提高了数据的利用率、分析的准确性、降低了科研难度、促进了医疗科研成果的发表。
标签:医疗大数据;科研平台;统计分析
[Abstract] Objective The information platform of our institute has a lot of clinical data and management data. The scientific research related to these data needs to be further analyzed. Therefore,the construction of a scientific research platform can provide important support for future medical research. Methods A data mart was constructed based on clinical data centers with medical results. Results To realize the medical information sharing of all kinds of scientific research data system in our hospital,establish a complete data management mode of scientific research case retrieval,scientific data management and follow-up system,and solve the problem that medical researchers are dealing with data difficulties. Conclusion It improves the utilization rate of data,the accuracy of analysis,reduces the difficulty of scientific research,and promotes the publication of medical research results.
[Key words] Medical large data;Scientific research platform;Statistical analysis
一般的科学研究都是建立在系统的试验设计上进行的,尤其是医疗领域,更是需要精确的试验方法设计,不断调整试验条件及手段,记录所得数据进而分析数据得到结果,随着信息技术得发展,医疗领域更是积累了大量的数据[1]。尤其是在临床方面,以患者为核心的大数据正在进一步扩大[2]。随着大数据概念在各行各业,包括电子商务、社交网络、咨询服务等行业的逐渐风靡,应用大数据技术对临床上越来越庞大的医疗数据进行分析也成为了目前研究的热点。大数据的应用具有4个特点:①数据量大(V olume);②数据种类多(Variety);③价值高(Value);④产生快、处理快(Velocity)[3]。而临床上大量的研究数据正以GB到TB再到PB的趋势进行发展[4],所以,只有在大数据处理技术的帮助下才能更有效地分析、利用这些数据,挖掘出“小数据”无法提供的信息,为经济社会的发展提供优良的服务,为患者、医疗工作者、科研者及管理者提供优质的服务与积极的协助[5]。然而,我国对医疗大数据的研究与应用还处于起步阶段,但发展十分迅速,医疗大数据分析正逐渐成为医疗模式转型的应用需求。因此,该文从实际出发,基于该院的临床数据,搭建医疗大数据平台,希望为该院临床研究提供新的分析手段及方法。
1 科研需求
该院是省属疗养单位,虽然与其他治疗医院有区别,但经过多年的发展已经具备比较完善的临床体系,实现了患者治疗过程的信息化管理、院内信息业务的全面覆盖以及信息共享等。为了使医疗大数据分析技术得到更好的应用,需要建立集成平台、临床数据中心及运营管理数据中心。通过医疗大数据分析技术将那些分散的数据信息收集、整合,使其更有利于分析。相较于之前的手工方式对数据的整理,这样的分析技术更具有应用价值,同时避免了数据的丢失,又提高了工作效率。然而,目前许多医疗单位都缺少统一的科研数据管理工具。对于医疗数据的获取依然处于Excel数据导出阶段,再将所得数据进行统一整合后对比分析。这一方法不仅效率低而且还容易丢失数据以及造成许多失误。因此,目前的数据整合手段已经不能够满足科研的管理需求。
2 设计思路
该院目前还缺乏统一规划的科研平台,且院内数据信息系统是相对独立的、数据复杂、信息复制比高,面对这些问题首先应该建立信息平台及临床数据中心。临床数据中心的建立是基于HL7 V3 RIM/RMIM模型和电子病例相关标准组织的[6]。在规范数据格式的基础上将数据与SPSS、SAS、R语言等软件连接,保证医疗人员科研工作的便利性。根据该院数据特点及分布将该院科研平台分为应用层、数据集市层、指标库层、临床數据中心层和业务系统层。
数据内容主要是一些有关于患者的入院診断、临床、病史、检查、护理以及相关用药等信息。这些数据经过一系列的采集、筛选、转化后可以存入临床数据中心(CDR)。而CDR中的数据则用于处理、保存、管理各个平台数据,实现临床数据的整合与集中,为今后的科研工作提供便利及有效的数据信息。除这些普遍性疾病的大数据库之外,根据该院的特点还可以建立专病指标库,主要是由各种单病种数据库构成的[7]。目前该院还没有纳入各种单病种数据的统计分析。在专病指标库中,可预设专病指标,主要包括临床表现、并发症、感染指标、护理出入量、检测结果、护理指标以及药敏结果等相关内容。然而,专病数据集市层其实也属于临床数控集市层的一部分,在需要的情况下从临床数据中提取出来进行统计分析并加以应用。因此,应用层是专病数据集市层实现应用的一个表现,包括病例检索系统、科研患者数据分组及科研随访等应用。3 建设成果
3.1 科研病例检索系统
与以往的病例检索系统不同,科研病例检索系统在基于临床数据中心的条件下,可以以单个或多个组合的方式从专病数据集中检索到符合目标的患者病例。搜索到的结果包括该患者或相似病例患者的门诊信息、住院诊断信息、检查结果、明細等其他有利用价值的信息。
3.2 科研数据管理系统
科研数据管理系统是以维护医疗单位专病指标库为目的的医疗科研平台管