丝氨酸蛋白酶水解机制(教学课件)
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14、 抱 最 大 的 希望 ,作最 大的努 力。2020年 10月 18日 星期日 下午2时 21分58秒 14:21:5820.10.18
15、 一 个 人 炫 耀什 么,说 明他内 心缺少 什么。 。2020年 10月 下午2时 21分20.10.1814:21October 18, 2020
(3)丝氨酸蛋白水解酶的空间结构:
X射线衍射法:通常,都是将表达蛋白的基因PCR之后克隆到一种
表达载体中,然后在大肠杆菌中诱导表达,提纯之后摸索结晶条件。 结晶后,将晶体进行x射线衍射,收集衍射图谱,通过一系列的计算, 很快就能得到蛋白质的原子结构。
牛的胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶以及住的弹性蛋白酶在结构上很相似, 这三种酶大约由240个氨基酸残基组成,三者的一级结构大约有 40% 是相同的,且活性中心的必需氨基酸也大致相同(Ser、His、Asp)
4.4.5 丝氨酸蛋白酶水解机制
什么是丝氨酸蛋白酶?
丝氨酸蛋白酶是一个蛋白 酶家族,其激活是通过活 性中心一组氨基酸残基变 化实现的,它们之中一定 有一个是丝氨酸(Ser, serine)。在哺乳类动物 里面,丝氨酸蛋白酶扮演 着很重要的角色,特别是 在消化,凝血和补体系统 方面。
Fra Baidu bibliotek
最典型的三种丝氨酸蛋白酶:
乙酰胆碱是一种生物体内常见的神经传导物质,自身具有 很高的毒性,而负责水解完成传递信息任务后的乙酰胆碱 的乙酰胆碱酯酶(乙酰胆碱酯酶可将乙酰胆碱分解成无毒 性的乙酸和胆碱)失活之后就会导致乙酰胆碱在生物体内 不断地积累,最终导致生物中毒死亡。
(2)活性His(组氨酸)基团:
N-对甲苯磺酰苯丙氨酸氯甲基酮(TPCK)其中氯甲基酮基是 一个很强的烷基化剂,它能够与反应中心His-57的咪唑基发 生烷基化反应,并最终引起酶的失活。
Step 1:Ser-195作用于底物的肽键酰基,发起亲核进 攻,形成一个包括Ser-195的羟基、底物酰基和氨基在内 的共价四联体中间物。
Step 2:四面体中间物分解,即生成酰基-酶中间物并伴随着C-N 键的断裂。
R1NH2
H2O
肽键断裂之后,R‘-NH2基团作为离去基团从反应体系中 离去,此时水分子进入,其氧原子攻击羰基上的碳原子,从而 又形成了一个水分子参与的四联体中间物。
胰蛋白酶 胰凝乳蛋白酶 弹性蛋白酶
同属消化酶系,在胰腺 泡内合成并分泌到十二 指肠中。均可催化肽键 的水解反应,但对肽键 的选择性则有所不同
1.水解作用的动力学模型
胰凝乳蛋白酶不仅可以水解肽键,同时也可以水解一般 的酯键。以对硝基苯酚乙酸酯为例:
胰凝乳蛋白酶
对硝基苯酚乙酸酯
乙酸 对硝基苯酚
这一反应过程具有两相特征:
11、 人 总 是 珍 惜为 得到。 20.10.1814:21:5814:21Oct-2018-Oct-20
12、 人 乱 于 心 ,不 宽余请 。14:21:5814:21:5814:21Sunday, October 18, 2020
13、 生 气 是 拿 别人 做错的 事来惩 罚自己 。20.10.1820.10.1814:21:5814:21:58October 18, 2020
2.酶活化中心必需基团的测定
(1)活性Ser基团:
二异丙基磷酰氯(DIPF)能特异性与 Ser基团的-OH反应,其结果导致作 为酶活性中心的Ser的残基发生不可 逆失活,此方法可有效确定胰凝乳蛋 白酶中的Ser-195是酶活性中心必需 氨基酸残基。
DIPF作用于动物上时,即可显示出很高的神经毒性,动 物体内的乙酰胆碱酯酶(丝氨酸蛋白水解酶的一种)能够 与DIPF反应,使其自身失活,失去对乙酰胆碱的水解作 用。
快速反应相:对硝基苯酚离子快速形成,与酶的浓度 成正比。 恒态反应相:对硝基苯酚离子形成较缓慢,形成速率 恒定。(决定反应速率的关键步骤)
快速反应相过程中酶和底物结合释放出对硝基苯酚离 子,同时形成乙酰基-酶中间体;而恒态反应相过程则 是乙酰基-酶中间体缓慢水解,放出酶,使之与底物相 结合继续释放出对硝基苯酚离子。由于乙酰基-酶的水 解很慢,使体系中酶浓度下降,进而导致对硝基苯酚 释放速率变慢。
16、 业 余 生 活 要有 意义, 不要越 轨。2020年 10月 18日 星期日 2时21分 58秒14:21:5818 October 2020
17、 一 个 人 即 使已 登上顶 峰,也 仍要自 强不息 。下午 2时21分 58秒下 午2时 21分14:21:5820.10.18
谢谢大家
3.催化作用机制
(1)结构特性
以胰凝乳蛋白酶举例,其活性中心有三个必需氨基酸残基: Ser-195,His-57和Asp-102,这三部分通过氢键结合,整体呈 三角形,即所谓的“催化三元区”。“催化三元区”的最显著特 征是Ser-195的羟基高度极化,具有很高的亲核进攻能力。
(2)亲核共价催化作用——易形成四联体结构的中间物
Step 3:酰基-酶中间物的解离,这时His-57作为广义酸起催化作用。
9、 人 的 价 值 ,在 招收诱 惑的一 瞬间被 决定。 20.10.1820.10.18Sunday, October 18, 2020
10、 低 头 要 有 勇气 ,抬头 要有低 气。14:21:5814:21:5814:2110/18/2020 2:21:58 PM