国内分子病理检测现状及进展
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乳腺癌、胃癌 FISH SISH
ALK
肺癌
FISH
PCR
ROS1
肺癌
FISH
PCR
基因突变
基因
肿瘤
DNA
RNA
EGFR
肺癌
PCR
KRAS
结直肠癌
PCR
BRAF
黑色素瘤
PCR
蛋白质 IHC IHC IHC
蛋白质 IHC
IHC
FISH/PCR vs IHC
乳腺癌HER2 胃癌HER2 肺癌ALK 结直肠癌/甲状腺癌/黑色素瘤BRAF
分子病理检测进展
检测平台的进展:DNA-RNA-蛋白-多分子 检测标本类型:组织标本-细胞学标本-血液/体液 检测项目:单基因到多基因 检测标准化:检测指南/共识-室间质评
基于肿瘤原位检测技术用于分子靶 向治疗敏感人群筛选
基因扩增或染色体易位引起的蛋白质过表达
基因
肿瘤
DNA
RNA
HER2
14.9%
247
247
100%
1274
2069
应建明等,中华病理学杂志,2012,5
胃癌HER2检测:FISH VS IHC
Shan L, Diag pathol, 2013,9
肺癌ALK检测:FISH VS IHC
敏感性:100% 特异性:98%
Ying J, et al. Ann Oncol, 2013,24:2589; Shan L, et al. Diag Pathol, 2014,9:3
* CACA = China Anti-Cancer Association
中国EGFR突变院内检测现状
中国院内EGFR基因突变检测中心
2013年院内检测中心 2014年新建的院内检测中心
检测率
2011 2012 2013 2014 6% 14% 20% 38%
阳性率
30% 32% 33% 33%
FISH/RT-PCR/IHC
DNA
RNA
蛋白质
荧光原位杂交 FISH
荧光定量 PCR RT-PCR
免疫组化 IHC
乳腺癌HER2检测:FISH VS IHC
HER2信号 3+ 2+ 1+/0 总计
扩增
>10
<10
568
50
80
97
0
0
648
147
无扩增
小计
符合率
14
632
98%
1013
1190
BRAF突变检测:PCR VS IHC
敏感性:100% 特异性:99%
ALK易位检测方法的优缺点
方法 IHC
FISH RT-PCR
优势
常用方法 不受易位位点限制 快速 可检测存档组织 可检测有限的组织标本 便宜
不受易位位点限制 临床研究所用方法(金标准) 可检测存档蜡块
潜在快速检测方法 非常敏感 相对准确
6
Ventana平台
4
2
0
分子病理检测平台分布特点
全国总体分布不均,北上广分子病理检测 平台建设较全面
随着全国性室间质评项目的开展,检测质 量显著提高
精准医学浪潮到来
肺腺癌人群
经驱动基因 筛选分类
检测结果 指导用药
单个病人 耐药机制变化
分子病理检测进展
检测平台的进展:DNA-RNA-蛋白-多分子 检测标本类型:组织标本-细胞学标本-血液/体液 检测项目:单基因到多基因 检测标准化:检测指南/共识-室间质评
EGFR检测平台的科室分布和方法占比
检测平台科室分布
检测平台方法占比
院内检测平台主要分布在病理科,采用的大多为ARMS检测方法
Data form AstraZeneca China internal
ALK基因检测平台各省分布图
16
14
12
共107家医院
其中双平台48家
10
8
Both
非Ventana诊断平台
组织检测是国际认可的金标准
金标准 • 外科手术标本 组织学 • 活检标本
有效补充
• 胸水
细胞学
检测平台
免疫组化(IHC) 原位杂交(ISH) 荧光定量PCR(RT-PCR) 数字PCR(dPCR) DNA测序 二代测序/NGS 新技术……
均适用于细胞学标本
细胞学标本检测EGFR突变 的价值
Positive Rate (IHC 3+)
Lab Code
Annual data of PQCC registration , 2013: - n=71 (Labs that passed 2 successive runs) - Overall positive rate: 20.2% - Range of positive rate: 14~31%
检测中心数 39 50 70 130
平均检测 时间(天)
10
7
6
6
截至2014年10月,全国共有130家医院建立了院内EGFR基因突变检测平台
Data form AstraZeneca China internal
院内EGFR检测平台的城市分布
自13年新建
平
原有平台
台
数
院内EGFR基因突变检测平台分布具有地域性差异
国内分子病理检测现状及进展
目录
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ 国内分子病理检测平台分布现状 分子病理检测进展 中国医学科学院肿瘤医院分子病理发展历程
国内分子病理检测平台现状
乳腺癌HER2检测(免疫组化、FISH) 肺癌EGFR突变检测(PCR) 肺癌ALK易位检测(免疫组化、FISH、RT-PCR)
通过以上病种及基因检测可以体现国内 分子病理检测平台现状。
是EGFR突变检测的重要材料,可作为TKI治疗的重 要依据
穿刺细胞和胸水:较理想 印片、涂片、痰液不建议采用:细胞量太少。
可能出现部分假阴性,其原因:
肿瘤细胞含量少; 肿瘤细胞的比例小; EGFR突变的异质性; 检测方法的敏感性。
推荐:制作细胞蜡块
对于细胞穿刺或胸水标本, 应保存细胞蜡块
病理评估; 免疫组化,协助组织学分
2011年和2013年全国乳腺HER2检测阳性率比较
Positive Rate (IHC 3+)
Annual data of CACA* registration , 2011:
- n=74 - Overall positive rate: 18.8% - Range of positive rate: 0~50%
缺点
不能直接明确易位基因 对抗体和二抗检测系统要求高 对组织前处理要求高 判读标准不统一 组织异质性 背景
贵 敏感性相对低 检测周期长
需高质量RNA 不能检测未知易位 不能定位
分子病理检测进展
检测平台的进展:DNA-RNA-蛋白-多分子 检测标本类型:组织标本-细胞学标本-血液/体液 检测项目:单基因到多基因 检测标准化:检测指南/共识-室间质评