基因组学课件

绪 论
一、基因组和基因组学的定义
二、本门课程的发展和演变
三、基因组学发展的路程
四、基因组学的研究内容
五、基因组计划简介
六、基因组学的参考资料
七、本门课程的安排
§0 Introduction
§0.1 基因组和基因组学的定义
基因组(genomes): 一种生物所有染色体上的遗传物质，称为基因组， 包括所有的基因和基因间区域。基因组的大小常常采 用碱基对的数目来表示。 基因组学(genomics)： 是遗传学研究进入分子水平后发展起来的一个分 支，主要研究生物体全基因组(genome)的分子特征。 ◆特点：是以基因组为研究单位，而不是以单个基因。 ◆目标： 是认识基因组的结构、功能及进化，弄清基因组 包含的全部遗传信息及相互关系，为最终充分合理利 用各种有效资源，提供科学依据。
Genomics vs molecular biology

பைடு நூலகம்

Genomics attempts to bring a fresh approach to the teaching of undergraduate molecular biology. The book is centered on genomes, not genes, in recognition of the fact that today's molecular biology is driven less by research into the activities of individual genes and more by genome sequencing and functional analysis. Reduce the overlapping with other courses, like molecular biology.
式运行；欧洲分子生物学实验室的EMBL数据库也于1982 年开始服务；日本于1984年开始建立国家级的核酸数据库
DDBJ，并于1987年正式服务。从那个时候以来，DNA序
列的数据已经从80年代初期的百把条序列，几十万碱基上 升至2000年的110亿碱基！这就是说，在短短的约18年间， 数据量增长了近十万倍。
§0 Introduction §0.2 本门课程的发展和演变
1984-1992 细胞遗传学
1996-2000 植物基因组作图的原理和方法
2001-
基因组学
§0 Introduction
§0.3 基因组学发展的路程
1900 奥地利科学家孟德尔根据豌豆杂交实验提出遗传因子概念，并 总结出孟德尔遗传定律; 1909 丹麦植物学家和遗传学家约翰逊首次提出“基因”这一名词， 用以表达孟德尔的遗传因子概念; 1910 摩尔根发现连锁遗传学，确立基因与染色体之间的关系； 1944 3位美国科学家分离出细菌的DNA（脱氧核糖核酸），并发现 DNA是携带生命遗传物质的分子; 1953 美国人沃森（ Watson）和英国人克里克（Crick ）通过实验提 出了DNA分子的双螺旋模型; 1969 科学家成功分离了第一个基因; 1973 Cohen等第一次实现重组DNA，开始了遗传工程时代； 1977 大肠杆菌噬菌体ФХ174基因组测序完成；
本门课程的安排 总学时： 学分： 34学时 2
课堂授课： 16学时+2 学时 学生自学： 16 学时
考试方式： 卷面考试或论文的方式
总评成绩：
70 %考试成绩+30 % 平时成绩
On the examination





Most of you will have a high score. A high score in this course is not very important for you. What is important? All what you learned in this course, which, in most cases, are not reflected accurately in the score. Our aim is a preparation for your research. Research is the first of all in next three years for you.
基因组学 Genomics
发表基因组学论文的主要期刊： Science Nature Proc. Natl. Acad. Sci. USA The Plant Journal Plant Molecular Biology Nucleic Acids Research Genetics Genome Genomics Genome Research Theor Appl Genet (TAG) Mol Gen Genet (MGG) DNA Research Molecular Breeding
1983 Mullis发明了PCR技术，实现了DNA体外大量扩增；
1988 被誉为生命科学“阿波罗登月计划”的国际人类基因组计划启动 (20世纪人类科技发展史上的三大创举) ； 1995 第一个原核生物（细菌）基因组测序完成； 1996 第一个真核生物（酵母）的基因组测序完成； 1998 第一个多细胞生物（线虫）的基因组测序完成； 1999 中国获准加入人类基因组计划，负责测定人类基因组全部序 列 的1%。中国是继美、英、日、德、法之后第6个国际人类基因组计 划参与过，也是参与这一计划的唯一发展中国家。 2000 果蝇和拟南芥的基因组测序完成； 人类第一张基因组草图完成； 2001 人类基因组测序完成； 2002 水稻（籼稻和粳稻）基因组草图完成。
根据2006.11.1统计,目前已经测序的基因组,包括动物, 植物, 微生物 (真菌, 细菌, 支原体, 病毒等)，已经有456个。
基因组学的飞速发展
美国的核酸数据库GenBank〖Banson,D.A. et al. (1998)
Nucleic Acids Res. 26, 1-7〗从1979年开始建设，1982年正