蛋白质的共价结构
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蛋白质的共价结构
1.了解蛋白质对生物体的重要意义。 2.了解蛋白质的分类,掌握蛋白质元素组成的
特点。 3 肽及肽键 4 蛋白质一级结构的测定
一. 蛋白质的生物学意义
(一) 蛋白质是生命活动的物质基础
生物体内的蛋白质是除水以外, 机体组织中最多的组分,占人体 干重的45%,占细菌干重的 50~70% 。
(二) 蛋白质的生物学功能
1.作为生物催化剂:在体内催化各种物质代谢反应的 酶几乎都是蛋白质。
2.调节代谢反应:一些激素是蛋白质或肽,如胰岛素、 生长素。
3.运输载体:如红细胞中运输O2、CO2要靠 Hb(Hemoglobin血红蛋白)、运输脂类物质的是载 脂蛋白、运铁蛋白等转运蛋白或叫载体蛋白。
4.参与机体的运动:如心跳、胃肠蠕动等,依靠与肌 肉收缩有关的蛋白质来实现,如肌球蛋白、肌动蛋白。
5.参与机体的防御: 机体抵抗外来侵害的防御机能,靠 抗体,抗体也称免疫球蛋白,是蛋白质。
6.接受传递信息:如口腔中的味觉蛋白、视网膜中的视 觉蛋白。
7.调节或控制细胞的生长、分化、遗传信息的表达。
8.其它:如鸡蛋清蛋白、牛奶中的酪蛋白是营养和储存 蛋白;胶原蛋白、纤维蛋白等属于结构蛋白。还有甜味 蛋白、毒素蛋白等都具有特异的生物学功能。
按反应时间和AA残基释放量作动力学曲线 蛋白质N-末端残基顺序。
❖ 最常用的氨肽酶是亮氨酸氨肽酶 —水解以Leu残基为N-末端的肽键速度最大。
2 ① 肼解法
肼化物可与苯甲醛缩合成不溶于水的物质
C
末 端
② 还原法
分
析
硼氢化锂
C末端AA
α氨基醇
③羧肽酶法
❖ 肽链外切酶:从多肽链C-端逐个水解 ❖ 根据不同反应时间释放出的AA种类和数量
❖ 可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍处理,即 可分开多肽链(亚基)。
(3) 断开二硫键
❖ 在8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍存在下,用 过量的-巯基乙醇处理,使二硫键还原为巯 基,然后用烷基化试剂保护生成的巯基,防 止重新被氧化。
(4)测定每条多肽链的AA组成,并计算出AA成 分的分子比
(二)、末端氨基酸残基测定
❖ 两类多肽链末端氨基酸残基: N-端氨基酸 C-端氨基酸
❖ 在肽链氨基酸顺序分析中,最重要的是N-端 氨基酸分析法。
二硝基氟苯(DNFB)法
1 、 末 端 分 析
丹磺酰氯(DNS)法
苯异硫氰酸酯(PITC)法
④氨肽酶法
❖ 肽链外切酶:从多肽链N-端逐个向里水解 ❖ 根据不同反应时间测出释放的AA种类和数量,
CH2
肽键 OH
CONH2
❖ 多肽链中AA残基按一定顺序排列:氨基酸顺序 ❖ 含游离-氨基的一端:氨基端或N-端
含游离-羧基的一端:羧基端或C-端 ❖ AA顺序是从N-端开始以C-端氨基酸残基为终点
如上述五肽:Ser-Val-Tyr-Asp-Gln
(一)、肽和肽键的结构
①肽键中C-N键有部分 双键性质 ——不能自由旋转
(三)、 天然存在的重要多肽
OH
CH3 CH CH2OH
CH O
O
O
HN CH C NH CH C NH CH2 C
CO
H
CH
HO N
CH2
OS N O CH2 H
OH O
NH
CH3
CH CH
C源自文库2CH3
CO
C CH2 NH C CH NH C CH2 NH O
鹅膏覃碱的化学结构
Cys Tyr ILe S Gln S Asn Cys Pro Leu Gly NH2
计算每种AA的个数 ❖ 5.测定水解液中的氨量计算酰胺的含量
(一)蛋白质测序策略
❖ (1) 测定蛋白质分子中多肽链的数目 ❖ 通过测定末端氨基酸残基的摩尔数与蛋白质分子
量之间的关系,即可确定多肽链的数目。
(2) 多肽链的拆分
❖ 几条多肽链借助非共价键连接在一起,称为 寡聚蛋白质,血红蛋白为四聚体,烯醇化酶 为二聚体。
②组成肽键原子处于 同一平面(肽平面)
③键长及键角一定 ④大多数情况以反式
结构存在
共价主链
(二)、肽的物理化学性质
•肽末端α-羧基pKa值比游离AA中的大。 肽末端α-氨基pKa值比游离AA中的小。 • 等电点(两性)。 • 酸碱性质取决于: —α-羧基、α-氨基、侧链基团的解离 • 具有双缩脲反应
(5)分析多肽链的N-末端和C-末端
(6)多肽链断裂成多个肽段 ❖ 采用两/多种不同的断裂方法将多肽
断裂成两套或多套肽段,并将其分离。
❖ (7)测定每个肽段的氨基酸顺序
❖ (8)确定肽段在多肽链中的次序 ❖ 利用两/多套肽段的AA顺序彼此间的交错重
叠,拼凑出整条多肽链的AA顺序。
(9)确定原多肽链中二硫键的位置。
蛋白质C-末端残基顺序。 ❖ 四种羧肽酶:A,B,C和Y;
牛催产素
Cys Tyr Phe S Gln S Asn Cys Pro Arg Gly NH2
牛加压素
三、蛋白质一级结构的测定
什么是Pr的一级结构?
蛋白质中氨基酸的排列顺序。
前提
❖ 1.样品必需纯(>97%以上) ❖ 2.知道蛋白质的分子量 ❖ 3.知道蛋白质由几个亚基组成 ❖ 4.测定蛋白质的AA组成并根据分子量
4.根据营养价值分:完全蛋白质、不完全蛋白质。
蛋白质——多肽—— 肽 —— AA
1*104
1000 200 -500 100
蛋白质与多肽无严格的界线
——通常将6000Dr以上的多肽称为蛋白质。
蛋白质分子量变化范围很大
二、肽(peptide)
氨基酸的α-羧基与另一氨基酸的α-氨基间 失水形成的酰胺键 称肽键,所形成的化合物称肽。
由两个AA组成的肽称为二肽。 由多个AA组成的肽则称为多肽。 组成多肽的AA单元称为氨基酸残基。
Ser
Val
Tyr
Asp
Gln
H
H
H
H
H
O
O
O
O
H3N+ C C N C C N C C N C C N C COO-
N-端 CH2
H CH
H CH2
H CH2
H CH2 C-端
OH
CH3 CH3
CO2H
所以,我们不难理解,为什么说没有蛋白质就没有生命。
(三)、蛋白质的分类
1.根据分子形状分:球状蛋白质、纤维状蛋白质
2.根据功能分:活性蛋白质、结构蛋白质。
3.根据组成分: (1)简单蛋白质:清蛋白、球蛋白、谷蛋白、 醇溶谷蛋白、组蛋白、精蛋白、硬蛋白。 (2)结合蛋白质:色素蛋白、金属蛋白、磷蛋 白、核蛋白、脂蛋白、糖蛋白。
1.了解蛋白质对生物体的重要意义。 2.了解蛋白质的分类,掌握蛋白质元素组成的
特点。 3 肽及肽键 4 蛋白质一级结构的测定
一. 蛋白质的生物学意义
(一) 蛋白质是生命活动的物质基础
生物体内的蛋白质是除水以外, 机体组织中最多的组分,占人体 干重的45%,占细菌干重的 50~70% 。
(二) 蛋白质的生物学功能
1.作为生物催化剂:在体内催化各种物质代谢反应的 酶几乎都是蛋白质。
2.调节代谢反应:一些激素是蛋白质或肽,如胰岛素、 生长素。
3.运输载体:如红细胞中运输O2、CO2要靠 Hb(Hemoglobin血红蛋白)、运输脂类物质的是载 脂蛋白、运铁蛋白等转运蛋白或叫载体蛋白。
4.参与机体的运动:如心跳、胃肠蠕动等,依靠与肌 肉收缩有关的蛋白质来实现,如肌球蛋白、肌动蛋白。
5.参与机体的防御: 机体抵抗外来侵害的防御机能,靠 抗体,抗体也称免疫球蛋白,是蛋白质。
6.接受传递信息:如口腔中的味觉蛋白、视网膜中的视 觉蛋白。
7.调节或控制细胞的生长、分化、遗传信息的表达。
8.其它:如鸡蛋清蛋白、牛奶中的酪蛋白是营养和储存 蛋白;胶原蛋白、纤维蛋白等属于结构蛋白。还有甜味 蛋白、毒素蛋白等都具有特异的生物学功能。
按反应时间和AA残基释放量作动力学曲线 蛋白质N-末端残基顺序。
❖ 最常用的氨肽酶是亮氨酸氨肽酶 —水解以Leu残基为N-末端的肽键速度最大。
2 ① 肼解法
肼化物可与苯甲醛缩合成不溶于水的物质
C
末 端
② 还原法
分
析
硼氢化锂
C末端AA
α氨基醇
③羧肽酶法
❖ 肽链外切酶:从多肽链C-端逐个水解 ❖ 根据不同反应时间释放出的AA种类和数量
❖ 可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍处理,即 可分开多肽链(亚基)。
(3) 断开二硫键
❖ 在8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍存在下,用 过量的-巯基乙醇处理,使二硫键还原为巯 基,然后用烷基化试剂保护生成的巯基,防 止重新被氧化。
(4)测定每条多肽链的AA组成,并计算出AA成 分的分子比
(二)、末端氨基酸残基测定
❖ 两类多肽链末端氨基酸残基: N-端氨基酸 C-端氨基酸
❖ 在肽链氨基酸顺序分析中,最重要的是N-端 氨基酸分析法。
二硝基氟苯(DNFB)法
1 、 末 端 分 析
丹磺酰氯(DNS)法
苯异硫氰酸酯(PITC)法
④氨肽酶法
❖ 肽链外切酶:从多肽链N-端逐个向里水解 ❖ 根据不同反应时间测出释放的AA种类和数量,
CH2
肽键 OH
CONH2
❖ 多肽链中AA残基按一定顺序排列:氨基酸顺序 ❖ 含游离-氨基的一端:氨基端或N-端
含游离-羧基的一端:羧基端或C-端 ❖ AA顺序是从N-端开始以C-端氨基酸残基为终点
如上述五肽:Ser-Val-Tyr-Asp-Gln
(一)、肽和肽键的结构
①肽键中C-N键有部分 双键性质 ——不能自由旋转
(三)、 天然存在的重要多肽
OH
CH3 CH CH2OH
CH O
O
O
HN CH C NH CH C NH CH2 C
CO
H
CH
HO N
CH2
OS N O CH2 H
OH O
NH
CH3
CH CH
C源自文库2CH3
CO
C CH2 NH C CH NH C CH2 NH O
鹅膏覃碱的化学结构
Cys Tyr ILe S Gln S Asn Cys Pro Leu Gly NH2
计算每种AA的个数 ❖ 5.测定水解液中的氨量计算酰胺的含量
(一)蛋白质测序策略
❖ (1) 测定蛋白质分子中多肽链的数目 ❖ 通过测定末端氨基酸残基的摩尔数与蛋白质分子
量之间的关系,即可确定多肽链的数目。
(2) 多肽链的拆分
❖ 几条多肽链借助非共价键连接在一起,称为 寡聚蛋白质,血红蛋白为四聚体,烯醇化酶 为二聚体。
②组成肽键原子处于 同一平面(肽平面)
③键长及键角一定 ④大多数情况以反式
结构存在
共价主链
(二)、肽的物理化学性质
•肽末端α-羧基pKa值比游离AA中的大。 肽末端α-氨基pKa值比游离AA中的小。 • 等电点(两性)。 • 酸碱性质取决于: —α-羧基、α-氨基、侧链基团的解离 • 具有双缩脲反应
(5)分析多肽链的N-末端和C-末端
(6)多肽链断裂成多个肽段 ❖ 采用两/多种不同的断裂方法将多肽
断裂成两套或多套肽段,并将其分离。
❖ (7)测定每个肽段的氨基酸顺序
❖ (8)确定肽段在多肽链中的次序 ❖ 利用两/多套肽段的AA顺序彼此间的交错重
叠,拼凑出整条多肽链的AA顺序。
(9)确定原多肽链中二硫键的位置。
蛋白质C-末端残基顺序。 ❖ 四种羧肽酶:A,B,C和Y;
牛催产素
Cys Tyr Phe S Gln S Asn Cys Pro Arg Gly NH2
牛加压素
三、蛋白质一级结构的测定
什么是Pr的一级结构?
蛋白质中氨基酸的排列顺序。
前提
❖ 1.样品必需纯(>97%以上) ❖ 2.知道蛋白质的分子量 ❖ 3.知道蛋白质由几个亚基组成 ❖ 4.测定蛋白质的AA组成并根据分子量
4.根据营养价值分:完全蛋白质、不完全蛋白质。
蛋白质——多肽—— 肽 —— AA
1*104
1000 200 -500 100
蛋白质与多肽无严格的界线
——通常将6000Dr以上的多肽称为蛋白质。
蛋白质分子量变化范围很大
二、肽(peptide)
氨基酸的α-羧基与另一氨基酸的α-氨基间 失水形成的酰胺键 称肽键,所形成的化合物称肽。
由两个AA组成的肽称为二肽。 由多个AA组成的肽则称为多肽。 组成多肽的AA单元称为氨基酸残基。
Ser
Val
Tyr
Asp
Gln
H
H
H
H
H
O
O
O
O
H3N+ C C N C C N C C N C C N C COO-
N-端 CH2
H CH
H CH2
H CH2
H CH2 C-端
OH
CH3 CH3
CO2H
所以,我们不难理解,为什么说没有蛋白质就没有生命。
(三)、蛋白质的分类
1.根据分子形状分:球状蛋白质、纤维状蛋白质
2.根据功能分:活性蛋白质、结构蛋白质。
3.根据组成分: (1)简单蛋白质:清蛋白、球蛋白、谷蛋白、 醇溶谷蛋白、组蛋白、精蛋白、硬蛋白。 (2)结合蛋白质:色素蛋白、金属蛋白、磷蛋 白、核蛋白、脂蛋白、糖蛋白。