第九章 酶动力学
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
样
别构酶的动力学
一、别构酶的性质 • 速率/底物浓度曲线为S型 • 具有别构效应物 • 对竞争性抑制的作用表现双相反应 • 温和变性可导致别构效应的丧失 • 通常是寡聚酶 • 与非别构酶相比,别构酶占少数 二、S型作图和Hill方程
典型的别构酶催化的反应速 率与底物浓度的S 型曲线
激活剂或抑制剂对别构酶活性的影响
4.自杀型抑制剂
这类抑制剂受酶本身的激活,在与酶结合以后,受到酶的催化发生几步 反应,但并不形成产物,而是变成高度反应性的化合物后,转而修饰酶 的必需基团导致酶活性的丧失。
乙酰胆碱酯酶的基团特异性抑制剂
副交感神经末梢兴奋所致的平滑肌痉挛和腺体分泌增加
(恶心、呕吐、腹痛、多汗、尚有流泪、流涕、流涎、腹泻、尿频 、大小便失禁)
2. 解读Vmax
Vmax也是酶的特征常数,但随着酶浓度的变化而变化。
3. 解读kcat
kcat称为酶的催化常数或转换数或周转数,具体是指在单位时间内,一个 酶分子将底物转变成产物的分子总数。kcat的单位是s-1。如果一个酶遵守 米氏方程,则kcat=k2=Vmax/Et。
4. 解读kcat/Km
几种常见的酶抑制剂药物 磺胺类
可逆性抑制剂
可分为竞争性、非竞争性和反竞争性抑制剂。
1. 竞争性抑制剂 (1)性质:有两类,一类与底物在结构和化学上具有很强的相似
性;第二类与底物无结构和化学性质的相似性。 (2)动力学: Km值提高,但Vmax不变。 2. 非竞争性抑制剂 (1)性质:既能与ES结合,又能与游离的酶结合。一旦它们与E结
kcat/Km通常被用来衡量酶的催化效率,可以表示一个酶的催化效率或者完美 程度。大的kcat和(或)小的Km将给出大的kcat/Km值。
几种酶的动力学参数
米氏方程的双重性
当方程底可物转浓变度为很:低的情况下,即[S]<<Km,米氏
这时反应速率与底物浓度成正比,符合一级动 力学; 当方程底可物转浓变度为很:高的情况下,即[S]>>Km,米氏 v=Vmax 这时酶反应速率接近最大值,如果继续增加底 物的浓度,v不可能继续增加,反应速率与底 物浓度的关系符合零级动力学。
的合成和转化
竞争性抑制剂
ES
I
KI
EI
k1 ES
k2
K-1
v
vmax[S ]
[S]
பைடு நூலகம்
Km
(1
[I] KI
)
EP
Km 升高 vmax 不变
v
vmax
Km(1+[I]/KI) Km
[S]
+抑制剂 1/v
斜率=Km/vmax
斜率= Km(1+[I]/KI)/vmax
-1/Km 1/vmax
1/[S]
-1/(Km(1+[I]/KI))
非竞争性抑制剂
v
vmax
Km
ES
I
KI
EI S
k1 ES k2 E P
k-1
I v [S] vmax
KI’
[S ] K m (1 [I ] ) KI
EIS Km 不变
vmax 降低
+抑制剂
1/v
Vmax/(1+[I]/KI)
米氏方程的线性转换
直接使用米氏方程中的v对[S]作图得到的是一条曲 线,从图中虽然也能得到Km 值和Vmax值,然而, 由于实验误差的客观存在,只要出现任何可见的 误差使数据点偏离真实的位置,那么就很难画出 一个很完美的曲线,但在同样的条件下,画直线 更容易。因此,将米氏方程进行线性化处理就显 得十分必要。
影响酶促反应的因素
酶促反应速率和反应类型 酶反应速率与非酶促反应一样,一般都是以单位时间 内,底物或产物浓度的变化值来表示。
影响酶促反应速率的因素 影响酶促反应速率的主要因素包括:酶浓度、底物浓 度、反应温度、反应介质的pH和离子强度以及有无抑 制剂的存在等。
★ 酶的速度与初速度。
酶与底物复合物形成
Hill常数能够反映底物协同性的程度:如果h=1,这时的Hill方程实际 上与米氏方程一模一样,这意味着酶不是别构酶,无底物协同性,速 率对底物作图应该为双曲线,K0.5=Km;如果h >1,则速率对底物浓度 作图呈S型曲线,酶具有正底物协同性;如果h <1,则意味着酶具负底 物协同性。
Hill常数不同的酶反应速率与底物浓度的关系曲线
[S]
(1+
/(1+[I]/KI)/Vmax斜率=
斜率=Km/vmax
Km/vmax
-1/Km
1/vmax
1/[S]
- (1+ /(1+[I]/KI) /Km
不可逆性抑制剂
1. 基团特异性抑制剂
这类抑制剂在结构上与底物无相似之处,但能共价修饰酶活性中心上的 必需侧链基团而导致酶活性不可逆的失活。由于许多氨基酸残基含有亲 核侧链基团,所以充当基团特异性抑制剂的一般是亲电试剂。
2. 底物类似物抑制剂
这类抑制剂在结构上相似于底物,因此在活性中心与酶结合,然后不可 逆地修饰酶活性中心上的必需基团,导致酶活性的丧失。
3.过渡态类似物抑制剂
这类抑制剂与酶促反应的过渡态极为相似,它们在化学结构和分子形状 上与酶的活性中心十分般配,能够以极高的亲和力与活性中心结合,从 而导致底物无法进入而使得酶活性受到不可逆性抑制。
S型曲线和Hill方程
既然米氏方程给出的是双曲线(v对[S]作图),所以它不适合具有底物 协同性的呈S型曲线的别构酶,但Hill方程却能够很好地说明别构酶的 动力学,Hill方程是:
Hill方程与米氏方程实际上十分相似,它们的主要差别首先是Hill方程 中的底物浓度[S]被提高到h数量级,h被称为Hill系数;其次,方程底 部的常数不是Km,而是K0.5,该常数也被提高了h数量级。K0.5与Km十 分相似,因为它也是指速率为最大速率一半时候的底物浓度。
酶浓度对反应速率的影响( 底物浓度无限大)
最适温度 温度对反应速率的影响
最适pH pH对反应速率的影响
底物浓度对酶反应速率的影响
米氏反应动力学
酶反应动力学最简单的模型由Lenor Michaelis和 Maude Menten于1913年提出,因此又名为 Michaelis-Menten模型或M-M模型。
乙酰胆碱在横纹肌神经肌肉接头处过度蓄积和刺激 (面、眼睑、舌、四肢和全身横纹肌发生肌纤维颤动,甚至全身肌
肉强直性痉挛)
中枢神经系统受乙酰胆碱刺激
(头晕、头痛、疲乏、共济失调、烦躁不安、诡妄、抽搐和昏迷)
激活剂
• 激活剂:提高酶活性 • 类型:无机离子(金属离子、无机阴离子)、有机小分子 • 特点:选择性、拮抗作用、相互替代、与浓度有关、机制多
在稳态时,ES形成的速率与ES解离的速率相等,因此νd=νf
,即 k1[E][S]=(k-1+k2)[ES]
①
假定[Et]表示酶的总浓度,[E]表示游离的酶浓度,[ES]为与 底物结合的酶浓度,则[Et]=[E]+[ES]。于是,①式可变为 :
米氏方程的推导(续)
由于酶促反应的初速率即是产物形成的速率,ν= k2[ES],于是, 当[S]→∞,酶被底物饱和,这时的反应速率为最大反应 速率Vmax,即
Hill作图
最后,米氏方程可重写成:
解读米氏方程
1. 解读米氏常数Km
Km是酶反应初速率为Vmax一半时底物的浓度。在一定条件下,可以使用 它来表示酶与底物的亲和力。一个酶的Km越大,意味着该酶与底物的亲 和力越低;反之,Km越小,该酶与底物的亲和力越高。 Km可以帮助判断体内一个可逆反应进行的方向。如果酶对底物的Km值小 于对产物的Km值,则反应有利于正反应。否则,有利于逆反应。
合,将导致酶活性受到抑制。 (2)动力学:Km不变,Vmax降低。 3. 反竞争性抑制剂 (1)性质:只能与ES结合,但不能与游离的酶结合。一旦它们与
ES结合,将导致与活性中心结合的底物不再能够转变为产物。 (2)动力学: Km降低,Vmax降低。
琥珀酸脱氢酶的竞争性抑制
在体内叶酸以四氢叶 酸的形式起作用,四 氢叶酸在体内参与嘌 呤核酸和嘧啶核苷酸
米氏方程推导设定的3个条件: 反应速率为初速率,因为此时反应速率与酶浓度呈
正比关系,避免了反应产物以及其它因素的干扰 酶底物复合物处于稳态即ES浓度不发生变化 符合质量作用定律;化学反应速率与反应物的有效
质量(浓度)成正比
米氏方程的推导
对于一个单底物-单产物反应:
假定νf表示ES形成的速率,νd为ES解离的速率,那么νf= k1[E][S], 即νd=k-1[ES]+k2[ES]=(k-1+k2)[ES]
米氏酶的双倒数作图
酶抑制剂作用的动力学
酶抑制剂的类型 ① 可逆性抑制剂。以次级键与酶可逆结合,使用透析
或超滤就可去除它们,让酶恢复活性; ② 不可逆性抑制剂。也被称为酶灭活剂,以强的化学
键(通常是共价键)与酶不可逆结合,可导致酶有 效浓度的降低,因此一旦失活就不可逆转。如果想 恢复酶的活性,唯一的手段只能是补充新酶。 酶抑制剂对米氏酶动力学性质的影响
[S]
(1+[I]/KI)/Vmax
-1/Km
斜率=Km/vmax
斜率= Km(1+[I]/KI)/vmax
1/vmax
1/[S]
反竞争性抑制剂
ES
Km 降低 vmax 降低
k1 ES
k-1
I
KI’
EIS
k2 E P
v
+抑制剂 1/v
vmax
Km/(1+
[I]/KI)
Vmax/(1+[I]/KI) Km
提纲
一、影响酶促反应的因素 二、米氏反应动力学
• 米氏方程成立的前提 • 米氏方程的推导 • 米氏方程的解读和延伸 • 米氏方程的双重性 • 米氏方程的线性转换
三、 酶抑制剂作用的动力学
• 可逆性抑制剂 • 不可逆性抑制剂
四、别构酶的动力学
• 别构酶的性质 • S 形曲线和Hill 方程 • Hill 作图 • 协同性的优点
别构酶的动力学
一、别构酶的性质 • 速率/底物浓度曲线为S型 • 具有别构效应物 • 对竞争性抑制的作用表现双相反应 • 温和变性可导致别构效应的丧失 • 通常是寡聚酶 • 与非别构酶相比,别构酶占少数 二、S型作图和Hill方程
典型的别构酶催化的反应速 率与底物浓度的S 型曲线
激活剂或抑制剂对别构酶活性的影响
4.自杀型抑制剂
这类抑制剂受酶本身的激活,在与酶结合以后,受到酶的催化发生几步 反应,但并不形成产物,而是变成高度反应性的化合物后,转而修饰酶 的必需基团导致酶活性的丧失。
乙酰胆碱酯酶的基团特异性抑制剂
副交感神经末梢兴奋所致的平滑肌痉挛和腺体分泌增加
(恶心、呕吐、腹痛、多汗、尚有流泪、流涕、流涎、腹泻、尿频 、大小便失禁)
2. 解读Vmax
Vmax也是酶的特征常数,但随着酶浓度的变化而变化。
3. 解读kcat
kcat称为酶的催化常数或转换数或周转数,具体是指在单位时间内,一个 酶分子将底物转变成产物的分子总数。kcat的单位是s-1。如果一个酶遵守 米氏方程,则kcat=k2=Vmax/Et。
4. 解读kcat/Km
几种常见的酶抑制剂药物 磺胺类
可逆性抑制剂
可分为竞争性、非竞争性和反竞争性抑制剂。
1. 竞争性抑制剂 (1)性质:有两类,一类与底物在结构和化学上具有很强的相似
性;第二类与底物无结构和化学性质的相似性。 (2)动力学: Km值提高,但Vmax不变。 2. 非竞争性抑制剂 (1)性质:既能与ES结合,又能与游离的酶结合。一旦它们与E结
kcat/Km通常被用来衡量酶的催化效率,可以表示一个酶的催化效率或者完美 程度。大的kcat和(或)小的Km将给出大的kcat/Km值。
几种酶的动力学参数
米氏方程的双重性
当方程底可物转浓变度为很:低的情况下,即[S]<<Km,米氏
这时反应速率与底物浓度成正比,符合一级动 力学; 当方程底可物转浓变度为很:高的情况下,即[S]>>Km,米氏 v=Vmax 这时酶反应速率接近最大值,如果继续增加底 物的浓度,v不可能继续增加,反应速率与底 物浓度的关系符合零级动力学。
的合成和转化
竞争性抑制剂
ES
I
KI
EI
k1 ES
k2
K-1
v
vmax[S ]
[S]
பைடு நூலகம்
Km
(1
[I] KI
)
EP
Km 升高 vmax 不变
v
vmax
Km(1+[I]/KI) Km
[S]
+抑制剂 1/v
斜率=Km/vmax
斜率= Km(1+[I]/KI)/vmax
-1/Km 1/vmax
1/[S]
-1/(Km(1+[I]/KI))
非竞争性抑制剂
v
vmax
Km
ES
I
KI
EI S
k1 ES k2 E P
k-1
I v [S] vmax
KI’
[S ] K m (1 [I ] ) KI
EIS Km 不变
vmax 降低
+抑制剂
1/v
Vmax/(1+[I]/KI)
米氏方程的线性转换
直接使用米氏方程中的v对[S]作图得到的是一条曲 线,从图中虽然也能得到Km 值和Vmax值,然而, 由于实验误差的客观存在,只要出现任何可见的 误差使数据点偏离真实的位置,那么就很难画出 一个很完美的曲线,但在同样的条件下,画直线 更容易。因此,将米氏方程进行线性化处理就显 得十分必要。
影响酶促反应的因素
酶促反应速率和反应类型 酶反应速率与非酶促反应一样,一般都是以单位时间 内,底物或产物浓度的变化值来表示。
影响酶促反应速率的因素 影响酶促反应速率的主要因素包括:酶浓度、底物浓 度、反应温度、反应介质的pH和离子强度以及有无抑 制剂的存在等。
★ 酶的速度与初速度。
酶与底物复合物形成
Hill常数能够反映底物协同性的程度:如果h=1,这时的Hill方程实际 上与米氏方程一模一样,这意味着酶不是别构酶,无底物协同性,速 率对底物作图应该为双曲线,K0.5=Km;如果h >1,则速率对底物浓度 作图呈S型曲线,酶具有正底物协同性;如果h <1,则意味着酶具负底 物协同性。
Hill常数不同的酶反应速率与底物浓度的关系曲线
[S]
(1+
/(1+[I]/KI)/Vmax斜率=
斜率=Km/vmax
Km/vmax
-1/Km
1/vmax
1/[S]
- (1+ /(1+[I]/KI) /Km
不可逆性抑制剂
1. 基团特异性抑制剂
这类抑制剂在结构上与底物无相似之处,但能共价修饰酶活性中心上的 必需侧链基团而导致酶活性不可逆的失活。由于许多氨基酸残基含有亲 核侧链基团,所以充当基团特异性抑制剂的一般是亲电试剂。
2. 底物类似物抑制剂
这类抑制剂在结构上相似于底物,因此在活性中心与酶结合,然后不可 逆地修饰酶活性中心上的必需基团,导致酶活性的丧失。
3.过渡态类似物抑制剂
这类抑制剂与酶促反应的过渡态极为相似,它们在化学结构和分子形状 上与酶的活性中心十分般配,能够以极高的亲和力与活性中心结合,从 而导致底物无法进入而使得酶活性受到不可逆性抑制。
S型曲线和Hill方程
既然米氏方程给出的是双曲线(v对[S]作图),所以它不适合具有底物 协同性的呈S型曲线的别构酶,但Hill方程却能够很好地说明别构酶的 动力学,Hill方程是:
Hill方程与米氏方程实际上十分相似,它们的主要差别首先是Hill方程 中的底物浓度[S]被提高到h数量级,h被称为Hill系数;其次,方程底 部的常数不是Km,而是K0.5,该常数也被提高了h数量级。K0.5与Km十 分相似,因为它也是指速率为最大速率一半时候的底物浓度。
酶浓度对反应速率的影响( 底物浓度无限大)
最适温度 温度对反应速率的影响
最适pH pH对反应速率的影响
底物浓度对酶反应速率的影响
米氏反应动力学
酶反应动力学最简单的模型由Lenor Michaelis和 Maude Menten于1913年提出,因此又名为 Michaelis-Menten模型或M-M模型。
乙酰胆碱在横纹肌神经肌肉接头处过度蓄积和刺激 (面、眼睑、舌、四肢和全身横纹肌发生肌纤维颤动,甚至全身肌
肉强直性痉挛)
中枢神经系统受乙酰胆碱刺激
(头晕、头痛、疲乏、共济失调、烦躁不安、诡妄、抽搐和昏迷)
激活剂
• 激活剂:提高酶活性 • 类型:无机离子(金属离子、无机阴离子)、有机小分子 • 特点:选择性、拮抗作用、相互替代、与浓度有关、机制多
在稳态时,ES形成的速率与ES解离的速率相等,因此νd=νf
,即 k1[E][S]=(k-1+k2)[ES]
①
假定[Et]表示酶的总浓度,[E]表示游离的酶浓度,[ES]为与 底物结合的酶浓度,则[Et]=[E]+[ES]。于是,①式可变为 :
米氏方程的推导(续)
由于酶促反应的初速率即是产物形成的速率,ν= k2[ES],于是, 当[S]→∞,酶被底物饱和,这时的反应速率为最大反应 速率Vmax,即
Hill作图
最后,米氏方程可重写成:
解读米氏方程
1. 解读米氏常数Km
Km是酶反应初速率为Vmax一半时底物的浓度。在一定条件下,可以使用 它来表示酶与底物的亲和力。一个酶的Km越大,意味着该酶与底物的亲 和力越低;反之,Km越小,该酶与底物的亲和力越高。 Km可以帮助判断体内一个可逆反应进行的方向。如果酶对底物的Km值小 于对产物的Km值,则反应有利于正反应。否则,有利于逆反应。
合,将导致酶活性受到抑制。 (2)动力学:Km不变,Vmax降低。 3. 反竞争性抑制剂 (1)性质:只能与ES结合,但不能与游离的酶结合。一旦它们与
ES结合,将导致与活性中心结合的底物不再能够转变为产物。 (2)动力学: Km降低,Vmax降低。
琥珀酸脱氢酶的竞争性抑制
在体内叶酸以四氢叶 酸的形式起作用,四 氢叶酸在体内参与嘌 呤核酸和嘧啶核苷酸
米氏方程推导设定的3个条件: 反应速率为初速率,因为此时反应速率与酶浓度呈
正比关系,避免了反应产物以及其它因素的干扰 酶底物复合物处于稳态即ES浓度不发生变化 符合质量作用定律;化学反应速率与反应物的有效
质量(浓度)成正比
米氏方程的推导
对于一个单底物-单产物反应:
假定νf表示ES形成的速率,νd为ES解离的速率,那么νf= k1[E][S], 即νd=k-1[ES]+k2[ES]=(k-1+k2)[ES]
米氏酶的双倒数作图
酶抑制剂作用的动力学
酶抑制剂的类型 ① 可逆性抑制剂。以次级键与酶可逆结合,使用透析
或超滤就可去除它们,让酶恢复活性; ② 不可逆性抑制剂。也被称为酶灭活剂,以强的化学
键(通常是共价键)与酶不可逆结合,可导致酶有 效浓度的降低,因此一旦失活就不可逆转。如果想 恢复酶的活性,唯一的手段只能是补充新酶。 酶抑制剂对米氏酶动力学性质的影响
[S]
(1+[I]/KI)/Vmax
-1/Km
斜率=Km/vmax
斜率= Km(1+[I]/KI)/vmax
1/vmax
1/[S]
反竞争性抑制剂
ES
Km 降低 vmax 降低
k1 ES
k-1
I
KI’
EIS
k2 E P
v
+抑制剂 1/v
vmax
Km/(1+
[I]/KI)
Vmax/(1+[I]/KI) Km
提纲
一、影响酶促反应的因素 二、米氏反应动力学
• 米氏方程成立的前提 • 米氏方程的推导 • 米氏方程的解读和延伸 • 米氏方程的双重性 • 米氏方程的线性转换
三、 酶抑制剂作用的动力学
• 可逆性抑制剂 • 不可逆性抑制剂
四、别构酶的动力学
• 别构酶的性质 • S 形曲线和Hill 方程 • Hill 作图 • 协同性的优点