八章真核生物基因表达调控
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I 型 基因内启动子
起始位点
基因内启动子
boxA
boxC
基因外启动子
II 型
OCT
PSE
TATA
boxA
boxB
图 12-23 真核 RNA Pol Ⅲ 的基因内启动子和基因外启动子
III型
1.2 增强子 Enhancer 又称远端上游序列(far upstream sequence)。 最早SV40病毒中发现,可使旁侧基因转录提高
胸苷激酶
组蛋白H2B
-140 -120 -100 -80 -60 -40 -20 +1
Oct
CAAT
GC
TATA
•Ⅰ型启动子
-170 -160 -150 -140 -130 -120 -110………..-60 -50 -40 -30 -20 -10 +1 +10 +20
上游控制区
核心启动子
• Ⅲ型启动子
~10bp TBP
27,000 ?
普遍
CAAT box GGCCAATCT ~22bp CTF/NF1 60,000 300,000 普遍
GC box Octamer Octamer
GGGCGG ATTTGCAT ATTTGCAT
~20bp ~20bp 23bp
SP1 Oct-1 Oct-2
165,000 76,000 52,000
-10
3’
16-19 bp TATAAT5-9 bp
T80A95T45A60A50T96 转录起始点
II型启动子组成
(1) 核心启动子成分,如TATA框;
(2) 上游启动子成分(UPE),如CAAT框, GC框,八聚体(octamer)等;
(3) 转录起始子(Inr)
真核启动子含有不同的序列,不同序列的位置、种类、 距离和方向都不完全相同; SV40 早期启动子
➢ 包括:转录因子、RNA聚合酶、调控蛋白等。
2.1 反式作用因子的分类
2.2 反式作用因子的调控作用
2.1 反式作用因子的分类:
(1) 通用因子,在一般细胞中普遍存在,
表 哺乳动物RNA PolⅡ启动子上游转录因子结合的序列元件
组件
保守顺序
DNA长 转录因子 大小(Da)丰度(/细 分布
度
胞)
TATA box TATAAAA
因子 HSTF
GRE TGGTACAAATGTTCT 20bp
受体
TRE TGACTCA
22bp
AP1
SRE CCATATTAGG
20bp
SRF
大小(Da)
93,000 94,000 39,000 52,000
效应元件的特点:
有短的保守顺序;
是启动子或增强子的上游元件。
在不同基因中,拷贝相似,有时有多个拷 贝;
2.2 反式作用因子的调控作用
1.3 沉默子 silencer
负性调控元件, 转录因子结合抑制转录。 作用特点: ➢ 不受序列方向的影响, ➢ 能远距离发挥作用, ➢ 并可对异源基因的表达起作用。
1.4 转座子
转座子---跳跃基因的移动,有时候能够 激活或抑制某些结构基因的表达。
1.5 效应元件(Response element):
60,000 ? ?
普遍 普遍 淋巴细胞
KB
GGGACTTTCC ~10bp NFKB
44,000 ?
淋巴细胞
(2) 特异作用因子:特殊组织与细胞中的,如淋巴细胞中的 Oct-2
还包括:转录激活因子(结合增强子)和转录抑制因子(结 合沉默子)。
(3) 诱导型因子:和效应元件(特异调控序列)
结合的蛋白因子。
❖一 组 受 到 共 同 调 控 的 基 因 , 都 有 一 个 相 同 的 元 件 ( 序 列),此元件能与某一个(类)专一蛋白因子结合,使基因 对其作出反应。
调节剂
热激 糖皮质激素 弗波酯 血清
表 真核生物的效应元件和相应的蛋白因子
效应 元件
HSE
保守序列 CNNGAANNTCCNNG
DNA长度 27bp
第二节 真核基因转录水平的调控
1 顺式作用元件 2 反式作用因子
1 基因转录的顺式作用元件(cis-acting elements)
顺式作用元件:对基因表达有调节活性的DNA 序列,其活性只影响与其自身同处在一个DNA 分子上的基因;
➢ 通常不编码蛋白质,多位于基因旁侧或内含子 中。
➢ 包括: 启动子、终止子、增强子、沉默子、静息 子、转座子、效应元件等。
第八章 真核生物基因 表达调控
第一节 概述
原核与真核生物基因表达的差异 回顾
真核生物
原核生物
• DNA + 组蛋白
→核小体 • 重复序列
• 割裂基因
• 单顺反子 • RNA转录后加工
裸露的 DNA 重叠基因 无内含子 多顺反子(操纵子) 转录和翻译同步进行
wenku.baidu.com 染色质结构 DNA的甲基化
第一节 概述 第二节 转录水平的调控 第三节 转录后加工水平的调控 第四节 翻译的调控
与转录起点距离不固定。
类固醇激素信号
增强子 接受金属刺激
肿瘤诱导剂 应答佛波酯
应答元件
第二节 真核基因转录水平的调控
1 顺式作用元件 2 反式作用因子
2 反式作用因子(trans-acting factors)
➢ 反式作用因子:通过扩散自身表达产物(酶、 调节蛋白)控制其他基因的表达,其编码基因 与其识别或结合的靶序列不在同一个DNA分子 上。
100倍。 组成:100-200bp,单拷贝或多拷贝串连形式
存在。 正性调控元件,转录因子结合,促进转录。
增强子的作用特点: 促进基因的转录效率远距离发挥作用
(100~500bp,10Kb) 促进转录,不具有启动子专一性 功能与方向、位置无关 具有组织或细胞特异性
对同源或异源基因均有功能。
1.1 启动子
启动子(promoter):是一段提供RNA聚合酶识别和结合 的DNA序列,它位于基因的上游。 RNA聚合酶正是通过与它的结合而启动基因的转录。
序列特异性 *启动子的特征 方向性
位置特性 种属特异性
原核生物的Promoter
5’
-35
TTGACA
T82T84G78A65C54A45
调节剂
表 真核生物的效应元件
元件 保守顺序
DNA长度 作用因子 大小(Da)
热激
HSE
糖皮质激素 GRE
弗波酯
TRE
血清
SRE
CNNGAANNTCCNNG
TGGTACAAATGTTCT
TGACTCA CCATATTAGG
27bp 20bp 22bp 20bp
HSTF 受体 AP1 SRF
93,000 94,000 39,000 52,000