分离自土壤Paraboeremia属真菌一新记录种

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山 地 农 业 生 物wk.baidu.com学 报 38(1) :006 ~ 009ꎬ2019 Journal of Mountain Agriculture and Biology
分离自土壤 Paraboeremia 属真菌一新记录种
王坤英ꎬ姜于兰∗
( 贵州大学 农学院ꎬ贵州 贵阳 550025)
摘 要:采集贵州贵阳花溪湿地公园山林土壤ꎬ分离得到 Paraboeremia 属真菌一新记录种ꎬ对该种结合形态特征及 分子系统学分析基于 ITSꎬLSUꎬrpb2 和 tub 四个基因片段ꎬ在系统进化树上ꎬ该标本 HGUP1801 与采自荷兰卷柏叶 片上的 Paraboeremia selaginellae 聚集在一起ꎬ并且形成很高的支持率ꎬ将该种定名为 Paraboeremia selaginellaeꎮ 研 究标本保存在贵州大学植物病理学实验室( HGUP) ꎮ 关键词:亚隔孢壳科ꎻ形态学ꎻ分子系统学ꎻ分类 中图分类号:S432������ 1 文献标识码:A 文章编号:1008-0457(2019)01-0006-04 国际 DOI 编码:10.15958 / j.cnki.sdnyswxb.2019.01.002
A New Record of Paraboeremia sp. Isolated from Soil
WANG Kun-YingꎬJIANG Yu-Lan∗ ( College of Agricultureꎬ Guizhou Universityꎬ Guiyangꎬ Guizhou 550025ꎬ China)
Abstract:A newly recorded strain of the genus Paraboeremia was isolated from the soil of the woodland of Huaxi Wetland Park in Guiyangꎬ Guizhou.This species was identified by combining morphological characters and phylogenetic analysis based on sequences of Internal Transcribed Spacer ( ITS) ꎬRibosomal Large Subunit (LSU) ꎬRNA polymeraseⅡ largest subunit 2 ( rpb2) andβ-tubulin( tub) . The phylogenetic analysis revealed that the strain HGUP1801was clustered with Paraboeremia selaginellae isolated from the leaves of Selaginellaat Netherland. The strain was strongly supported to be identified as Paraboeremia selaginellae. The holotype and ex - type cultures are preserved in the Plant Pathology Laboratory of Guizhou University. ( HGUP) . Key words:Didymellaceaeꎻmorphologyꎻmolecular phylogenyꎻ taxonomy
Paraboeremia Q������ Chen & L������ Cai 属于 Ascomycota 子囊菌门ꎬ座囊菌纲 Dothideomycetesꎬ格孢腔菌目 Pleosporalesꎬ亚 隔 孢 壳 科 Didymellaceaeꎮ 截 止 目 前ꎬ该属已报道 6 种ꎬ包括 3 个新组合种ꎬ新组合种 是由茎点霉属 Phoma Fr������ 和茎点霉属的有性属亚 隔孢壳属 Didymella Sacc������ 移入该属[1] ꎮ Chen 等[1] 以 Paraboeremia selaginellae 为模式种建立该属ꎬ其 中包括 Paraboeremia adianticola 和 Paraboeremia pu ̄ taminum 两个 结 合 新 种ꎮ Jiang 等[2] 报 道 了 Para ̄ boeremia 属 的 三 个 新 种ꎬ Paraboeremia camelliae、

记录有 3000 多个茎点霉属的物种名称ꎮ 究 其 原 因ꎬ除了形态特征在物种区分的局限性外ꎬ使用传 统的寄主相关命名法也是产生如此大量名称的重 要原因ꎮ
近些 年 来ꎬ 分 子 系 统 学 技 术 融 入 茎 点 霉 属 Phoma、种以及近似属、种的分类鉴定中[1ꎬ3-5] ꎮ De Gruyter 等[6] 根据对茎点霉属和相关无性属分子系 统学的研究结果ꎬ对茎点霉属复合群进行了重新划 分ꎬ根据模 式 属 Didymella 建 立 亚 隔 孢 壳 科 Didy ̄ mellaceaeꎬ包 括 了 广 义 茎 点 霉 和 其 他 相 关 属ꎮ Aveskamp 等[3] 研究同样发现ꎬ茎点霉属是一个多 系类群ꎬ传统分类上归于该属的物种在系统发育研 究中分散在至少 6 个科中ꎬ他们通过进一步研究建 议ꎬ以茎点霉属模式种 草 茎 点 霉 Phoma herbarum Westend������ 所在的单系分支作为狭义茎点霉属ꎬ 归 属于 亚 隔 孢 壳 科ꎬ 包 含 茎 点 霉 属、 壳 二 孢 属 Ascochyta Libert、亚隔孢壳属 Didymella 等重要病原 真菌类群ꎮ De Gruyter 等 和 Aveskamp 等[7-8] 通 过 系统学分析对茎点霉属内物种的分类地位做了部 分修订ꎬ在澄清亚隔孢壳科内属间关系上已有重要 进展ꎬ但仍有较多物种的分类情况尚未解决ꎮ Chen 等根据形态特征的观察以及基于 LSUꎬITSꎬtub2 和 rpb2 四个序列位点的系统发育学分析ꎬ将亚隔孢壳 科划分为 17 个有较高支持率的单系属ꎬ包括 Para ̄ boeremia 等 9 个新属ꎮ Paraboeremia 属真菌分布广 泛ꎬ可生存于腐生的叶片、土壤、岩石块、发病叶片、 果树的根际周围等[2ꎬ9] ꎮ 该属的形态特征是产 孢 细胞球形或翁形ꎬ分生孢子无隔ꎬ具油滴ꎬ椭球形ꎬ 直或弯曲ꎬ无色透明至浅绿ꎮ 作者在土壤真菌调查 中ꎬ分离获得一株疑似茎点霉属真菌ꎬ依据其他研 究者对于该属及相似属研究中采用的基因条形 码[10] ꎬ选择 ITS、LSU、tub、rpb2 四个基因片段ꎬ利用 多基因系统发育分析结合形态分类方法对该菌株 进行系统分类研究ꎮ
P������ litseae 和 P������ oligotrophicaꎮ 茎点霉属由 Fries( 1821) 建立ꎬ该属真菌是一
类重要的植物病原菌ꎬ分布广泛且具有丰富的多样 性ꎬ主要引起植物叶片及茎杆上的病斑ꎬ可导致作 物产量严重损失ꎬ其中一些物种还被列为检疫性真 菌ꎬ对该属真菌进行准确的分类鉴定非常重要[3] ꎮ 但传统上区分该属的形态特征相当有限ꎬ主要包括 分生孢子器、产孢细胞和分生孢子的形状和大小ꎬ 而这些相对简单的无性形态特征不足以对相似的 不同物种进行辨别ꎮ 至 2004 年ꎬ在 MycoBank 中已
收稿日期:2018 - 09 - 30ꎻ修回日期:2018 - 10 - 22 基金项目:国家自然科学基金(31660006) ꎮ ∗通讯作者:姜于兰(1974-) ꎬ女ꎬ博士ꎬ教授ꎬ主要从事真菌分类学研究ꎻE-mail:yljchsd@ 163������ comꎮ
第 1 期
王坤英ꎬ等:分离自土壤 Paraboeremia 属真菌一新记录种
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