原核生物真核生物基因表达比较
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DNA ? RNA-聚合酶 I II III 转录因子
RNA-聚合酶
模板:
原核生物的基因由于没有外显子和内含子,转录产生的信使 RNA不需要剪切、拼接等加工过程。而真核生物有内含子、外 显子,因此转录产生的RNA需要加工修饰!
酶:
原核生 物RNA聚合酶
真核生 物RNA聚合酶
原核生物每一转录区段可视为一个转录单位,
蛋白质翻译后修饰:
真核生物中新生(未成熟)分泌蛋白的N端有可被细胞转 运系统识别的特征性、保守的氨基酸序列(约13-36AA, 含疏水AA较多),称信号肽. 原核表达是边转录边表达的,没有区域间隔。信号肽 大多是疏水性的,溶解性较差,所以在原核中的表达 会有些困难。 另外原核生物本身的基因中是不存在什么信号肽片段 的,信号肽序列中的密码子对原核生物来说可能是稀 有密码子。
称为操纵子(operon)。操纵子包括若干个结构基因 及其上游(upstream)的调控序列。
原核生物上游调控序列:中的启动子是RNA聚合酶结合
模板DNA的部位,也是控制转录的关键部位。 转录起始区:A-T配对比较多,A-T多是有利于解链的 -10区的“一致性序列”为TATAAT -35区最大一致性序列是TTGACA
原核生物终止阶段需要释放因子RF-1、 RF-2和 RF-3参与
释放因子功能:I 识别终止密码子 II诱导转肽酶转变为酯酶活性
IIIRF-3有GTP酶活性,能介导RF-1、RF-2与核蛋白体的相互作用
真核生物翻译终止过程与原核生物相似,但只有1个释放因子
eRF,可识别所有终止密码子,完成原核生物各类RF的功能。
(启动子)
真核生物转录起始前的上游区段调控序列:
不同物种、不同细胞或不同的基因,转录起始点上游可以有不同的 DNA序列,但这些序列都可统称为顺式作用元件(cis-acting element)。 顺式作用元件包括启动子、启动子上游元件(upstream promoter elements) 等近端调控元件和增强子(enhancer)等远隔序列。 起始点上游多数有共同的TATA序列,称为Hognest盒或TATA盒 (TATA box)。通常认为这就是启动子的核心序列。TATA盒虽然没有原
原核生物起始氨基酰-tRNA:
真核生物起始氨基酰-tRNA:
fMet-tRNAfMet
tRNAfMet与甲硫氨酸结合后,
甲硫氨酸很快被甲酰化为N甲酰甲硫氨酸,于是形成N甲酰甲硫氨酰-tRNA (fMettRNAfMet)。
Met-tRNAiMet
tRNAiMet与甲硫氨酸结合 后形成Met-tRNAiMet 。
真核生物转录延长过程与原核生物大致相似,但因有核膜相隔,没
有转录与翻译同步的现象。
转录终止:
RNA聚合酶在DNA模板上停顿下来不再前进,转 录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。
依赖ρ因子的转录终止
原核生物的转录终止分类:
非依赖ρ因子的转录终止
Ρ因子:
识别富含C的RNA链 ATPase活性 解螺旋酶(helicase)活性
真核mRNA只编码一种蛋白质,为单顺反子(single cistron)
许多真核生物基因转录后有一个对mRNA外显子加工的过程,使 mRNA序列中出现移码、错义、无义突变,导致同一前体mRNA 翻译出序列、功能不同的蛋白质。这种基因表达的调节方式称为 mRNA编辑(mRNA editing)。
核蛋白体是蛋白质生物合成的场所:
核的-10区、-35区那么典型,没有原核那样的相对较高较精确的丰度、区段; 除TATA盒;还有一些叫“盒”或不叫的调控序列。
启动子上游元件是位于TATA盒上游的DNA序列,多在转录起始点约 -40~-100nt的位置,比较常见的是GC盒和CAAT盒。
转录起始:
原核生物:RNA聚合酶和DNA
的特殊序列——启动子 (promoter)结合后,就能启动 RNA合成。 RNA聚合酶全酶( 2 )与模 板结合,形成闭合转录复合体。
真核生物翻译起始
原核生物肽链合成的延长:
1. 进位: 氨基酰-tRNA按照mRNA模板的指令进入并结合到核蛋白体A位
2. 成肽:转肽酶催化,核蛋白体P位上起始氨基酰-tRNA转移到A位,与A位
上氨基酰-tRNA的α-氨基结合形成肽键
3. 转位转位酶催化,核蛋白体向3´-端移动一个密码子的距离,使mRNA
参与肽链延长的甲硫氨酰-tRNA:Met-tRNAMet
肽链合成起始:
原核生物:
起始tRNA是fMet-tRNA(fMet上角标)
真核生物:
起始tRNA是 Met-tRNA(Met上角标)
30s小亚基首先与mRNA模板相结合
40s小亚基首先与Met-tRNA(Met上角标) 相结合
再与fMet-tRNA(fMet上角标)结合
真核生物:转录起始需要启动
子 、RNA聚合酶和转录因子的 参与。 少数几个反式作用因子的搭配启 动特定基因的转录 真核生物RNA-pol不与DNA分子 直接结合,而需依靠众多的转录 因子,形成转录起始复合物。
DNA双链局部解开,形成开放转 录复合体。
在RNA聚合酶作用下发生第一次 聚合反应,形成转录起始复合物。
Ρ因子
真核生物的转录终止:在超出千百个核苷酸后停顿,
转录后修饰有多聚腺苷酸(poly A)尾巴结构加进去 。 在读码框架下游常有一组公共序列AATAAA 及 GTGTGT序列,这些序列称为转录终止修饰点。
原核生物真核生物转录对比:
翻译:
mRNA是蛋白质生物合成的直接模板:
遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为顺反子(cistron)。 原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的 mRNA可编码几种功能相关的蛋白质,为多顺反子(polycistron) 。
核蛋白体是细胞质和线粒体中无膜包裹的颗粒状细 胞器,具蛋白质合成功能。 核蛋白体包括 rRNA(核糖体RNA) 和蛋白质,直径 为 20-25nm,真核细胞的核蛋白体比原核细胞的大。
wenku.baidu.com
蛋白质生物合成需要酶类、蛋白质因子:
氨基酸的活化:
氨基酸与特异的tRNA结合形成氨基酰-tRNA的过程称为 氨基酸的活化,氨基酸活化形成氨基酰-tRNA。 原核、真核生物----都有两种Met-tRNA:
再与模板mRNA结合
最后与50s大亚基结合
最后与60s大亚基结合生成起始复合物
原核生物位于AUG上游8-13个核苷酸处的一个短片段(4-6个 核苷酸)叫做SD序列。这段序列正好与tRNA 30S小亚基中的 16s rRNA3’端一部分序列互补,因此SD序列也叫做核糖体结 合序列。其中有三种IF参加起始复合物的形成。 真核生物mRNA中的帽子结构和帽子结合蛋白复合物结合。至 少有十种eIF参与起始复合物的形成。
真核生物RNA聚合酶Ⅱ-DNA-RNA复合物
转录延长:
原核生物转录过程中有羽毛状现象: 启动子清除,α亚基脱落, RNA–pol聚合酶核心酶变构, 与模板结合松弛,沿着DNA模 板前移,在核心酶作用下NTP 不断聚合,RNA链不断延长。
原核生物在同一DNA模板上,有多个转录同时在进行,转录尚未完
成,翻译已在进行。
原核生物与真核生物 基因表达方面的主要差异
基因表达: 基因表达(gene expression)是指细胞在生命过 程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻 译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。
122210101436熊雪薇
转录:
原料: 模板: 酶:
其他因子:
原核生物 NTP
真核生物 (ATP UTP CTP GTP)
上下一个密码子进入核蛋白体A位、而占据A位的肽酰-tRNA移入P位
延长因子: EF-Tu EF-Ts EF-G
真核延长过程与原核基本相似
但有不同的反应体系和延长因子:eEF-1α eEF-1βγ eEF-2 真核细胞核蛋白体没有E位,转位时卸载的tRNA直接从P位脱落
肽链合成终止:
核蛋白体A位出现mRNA的终止密码子后,多肽链合成停止,肽 链从肽酰-tRNA中释出,mRNA、核蛋白体大、小亚基等分离。
RNA-聚合酶
模板:
原核生物的基因由于没有外显子和内含子,转录产生的信使 RNA不需要剪切、拼接等加工过程。而真核生物有内含子、外 显子,因此转录产生的RNA需要加工修饰!
酶:
原核生 物RNA聚合酶
真核生 物RNA聚合酶
原核生物每一转录区段可视为一个转录单位,
蛋白质翻译后修饰:
真核生物中新生(未成熟)分泌蛋白的N端有可被细胞转 运系统识别的特征性、保守的氨基酸序列(约13-36AA, 含疏水AA较多),称信号肽. 原核表达是边转录边表达的,没有区域间隔。信号肽 大多是疏水性的,溶解性较差,所以在原核中的表达 会有些困难。 另外原核生物本身的基因中是不存在什么信号肽片段 的,信号肽序列中的密码子对原核生物来说可能是稀 有密码子。
称为操纵子(operon)。操纵子包括若干个结构基因 及其上游(upstream)的调控序列。
原核生物上游调控序列:中的启动子是RNA聚合酶结合
模板DNA的部位,也是控制转录的关键部位。 转录起始区:A-T配对比较多,A-T多是有利于解链的 -10区的“一致性序列”为TATAAT -35区最大一致性序列是TTGACA
原核生物终止阶段需要释放因子RF-1、 RF-2和 RF-3参与
释放因子功能:I 识别终止密码子 II诱导转肽酶转变为酯酶活性
IIIRF-3有GTP酶活性,能介导RF-1、RF-2与核蛋白体的相互作用
真核生物翻译终止过程与原核生物相似,但只有1个释放因子
eRF,可识别所有终止密码子,完成原核生物各类RF的功能。
(启动子)
真核生物转录起始前的上游区段调控序列:
不同物种、不同细胞或不同的基因,转录起始点上游可以有不同的 DNA序列,但这些序列都可统称为顺式作用元件(cis-acting element)。 顺式作用元件包括启动子、启动子上游元件(upstream promoter elements) 等近端调控元件和增强子(enhancer)等远隔序列。 起始点上游多数有共同的TATA序列,称为Hognest盒或TATA盒 (TATA box)。通常认为这就是启动子的核心序列。TATA盒虽然没有原
原核生物起始氨基酰-tRNA:
真核生物起始氨基酰-tRNA:
fMet-tRNAfMet
tRNAfMet与甲硫氨酸结合后,
甲硫氨酸很快被甲酰化为N甲酰甲硫氨酸,于是形成N甲酰甲硫氨酰-tRNA (fMettRNAfMet)。
Met-tRNAiMet
tRNAiMet与甲硫氨酸结合 后形成Met-tRNAiMet 。
真核生物转录延长过程与原核生物大致相似,但因有核膜相隔,没
有转录与翻译同步的现象。
转录终止:
RNA聚合酶在DNA模板上停顿下来不再前进,转 录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。
依赖ρ因子的转录终止
原核生物的转录终止分类:
非依赖ρ因子的转录终止
Ρ因子:
识别富含C的RNA链 ATPase活性 解螺旋酶(helicase)活性
真核mRNA只编码一种蛋白质,为单顺反子(single cistron)
许多真核生物基因转录后有一个对mRNA外显子加工的过程,使 mRNA序列中出现移码、错义、无义突变,导致同一前体mRNA 翻译出序列、功能不同的蛋白质。这种基因表达的调节方式称为 mRNA编辑(mRNA editing)。
核蛋白体是蛋白质生物合成的场所:
核的-10区、-35区那么典型,没有原核那样的相对较高较精确的丰度、区段; 除TATA盒;还有一些叫“盒”或不叫的调控序列。
启动子上游元件是位于TATA盒上游的DNA序列,多在转录起始点约 -40~-100nt的位置,比较常见的是GC盒和CAAT盒。
转录起始:
原核生物:RNA聚合酶和DNA
的特殊序列——启动子 (promoter)结合后,就能启动 RNA合成。 RNA聚合酶全酶( 2 )与模 板结合,形成闭合转录复合体。
真核生物翻译起始
原核生物肽链合成的延长:
1. 进位: 氨基酰-tRNA按照mRNA模板的指令进入并结合到核蛋白体A位
2. 成肽:转肽酶催化,核蛋白体P位上起始氨基酰-tRNA转移到A位,与A位
上氨基酰-tRNA的α-氨基结合形成肽键
3. 转位转位酶催化,核蛋白体向3´-端移动一个密码子的距离,使mRNA
参与肽链延长的甲硫氨酰-tRNA:Met-tRNAMet
肽链合成起始:
原核生物:
起始tRNA是fMet-tRNA(fMet上角标)
真核生物:
起始tRNA是 Met-tRNA(Met上角标)
30s小亚基首先与mRNA模板相结合
40s小亚基首先与Met-tRNA(Met上角标) 相结合
再与fMet-tRNA(fMet上角标)结合
真核生物:转录起始需要启动
子 、RNA聚合酶和转录因子的 参与。 少数几个反式作用因子的搭配启 动特定基因的转录 真核生物RNA-pol不与DNA分子 直接结合,而需依靠众多的转录 因子,形成转录起始复合物。
DNA双链局部解开,形成开放转 录复合体。
在RNA聚合酶作用下发生第一次 聚合反应,形成转录起始复合物。
Ρ因子
真核生物的转录终止:在超出千百个核苷酸后停顿,
转录后修饰有多聚腺苷酸(poly A)尾巴结构加进去 。 在读码框架下游常有一组公共序列AATAAA 及 GTGTGT序列,这些序列称为转录终止修饰点。
原核生物真核生物转录对比:
翻译:
mRNA是蛋白质生物合成的直接模板:
遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为顺反子(cistron)。 原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的 mRNA可编码几种功能相关的蛋白质,为多顺反子(polycistron) 。
核蛋白体是细胞质和线粒体中无膜包裹的颗粒状细 胞器,具蛋白质合成功能。 核蛋白体包括 rRNA(核糖体RNA) 和蛋白质,直径 为 20-25nm,真核细胞的核蛋白体比原核细胞的大。
wenku.baidu.com
蛋白质生物合成需要酶类、蛋白质因子:
氨基酸的活化:
氨基酸与特异的tRNA结合形成氨基酰-tRNA的过程称为 氨基酸的活化,氨基酸活化形成氨基酰-tRNA。 原核、真核生物----都有两种Met-tRNA:
再与模板mRNA结合
最后与50s大亚基结合
最后与60s大亚基结合生成起始复合物
原核生物位于AUG上游8-13个核苷酸处的一个短片段(4-6个 核苷酸)叫做SD序列。这段序列正好与tRNA 30S小亚基中的 16s rRNA3’端一部分序列互补,因此SD序列也叫做核糖体结 合序列。其中有三种IF参加起始复合物的形成。 真核生物mRNA中的帽子结构和帽子结合蛋白复合物结合。至 少有十种eIF参与起始复合物的形成。
真核生物RNA聚合酶Ⅱ-DNA-RNA复合物
转录延长:
原核生物转录过程中有羽毛状现象: 启动子清除,α亚基脱落, RNA–pol聚合酶核心酶变构, 与模板结合松弛,沿着DNA模 板前移,在核心酶作用下NTP 不断聚合,RNA链不断延长。
原核生物在同一DNA模板上,有多个转录同时在进行,转录尚未完
成,翻译已在进行。
原核生物与真核生物 基因表达方面的主要差异
基因表达: 基因表达(gene expression)是指细胞在生命过 程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻 译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。
122210101436熊雪薇
转录:
原料: 模板: 酶:
其他因子:
原核生物 NTP
真核生物 (ATP UTP CTP GTP)
上下一个密码子进入核蛋白体A位、而占据A位的肽酰-tRNA移入P位
延长因子: EF-Tu EF-Ts EF-G
真核延长过程与原核基本相似
但有不同的反应体系和延长因子:eEF-1α eEF-1βγ eEF-2 真核细胞核蛋白体没有E位,转位时卸载的tRNA直接从P位脱落
肽链合成终止:
核蛋白体A位出现mRNA的终止密码子后,多肽链合成停止,肽 链从肽酰-tRNA中释出,mRNA、核蛋白体大、小亚基等分离。