中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范
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2.进入数据处理（View>>Data Analysis）；
3.调入要输出的色谱文件（File>>Load Signal…）；
4.进入数据输出窗口（File>>Export File>>AIA File…），进入方式如下图所示：
在弹出窗口中指定导出路径及文件名，确定。可导出AIA格式文件。
5.若选择输出文本格式文件（File>>Export File>>CSV File…），会弹出数据输出窗口。在数据输出窗口中，选中Signal选项，在File Name输入框中输入相应的文件名及文件保存路径。点击OK。
点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他特殊需要，可以直接点击next至安装结束。
图 1
三．功能
本软件系统包括文件导入，数据库管理，谱图处理，分析检验和帮助等功能。安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。
在Use specified export method框下选建立过的输出方法名
点OK键完成数据的输出
到Windows的数据输出目的目录下可看到输出的文件，此文件格式为*.arw或*.cdf。
Shimadzu Class-VP色谱工作站
1、文件栏中Method→Advanced…
弹出窗口：
选择AIA（*.CDF）输出AIA文件；选择ASCII输出文本格式（*.acs）。
（2）导出文件（保存图谱）
本系统支持将导入的图谱数据文件以文本文件（*.txt）导出保存（图6）。
图6
（3）导出图象
将导入绘制的色谱图谱也可以图象形式存放，文件格式为*.bmp（图7）。
图7
（4）图谱删除
本系统提供谱图删除功能（图8）。可以选中某一谱图删除（删除当前图谱功能），也可将导入的谱图全部删除（清除所有图谱数据）。
图15
图16
（5）随机着色谱图：
用户可以对绘制图谱的颜色进行随机着色（图14）。
4 分析检验：
（1）相似度计算：
对照图谱生成后，用户通过“相似度计算”功能进行色谱图谱样本与对照图谱的相似度评价。评价结果以表格形式显示，并可保存（图17和18）。或将结果拷贝到剪贴板上以方便用户使用。
图17
图18
（2）打印报告：
其中大部分按钮的功能在前面已经介绍过，不再赘述。这里将重点介绍“数据恢复”，“图谱间距”，“单谱显示”和x与y轴放大功能。
（1）数据恢复
“数据恢复”功能是使当前处理结果恢复到图谱数据刚导入的状态。
（2）图谱间距
“图谱间距”可以调节绘制图谱间的距离，便于用户观察和分析。
（3Fra Baidu bibliotek单峰显示
“单峰显示”可使选中的图谱单个显示，便于用户观察和分析单个样本图谱。
下的Name框中填入输出方法名
关闭Export Method Editor界面
方法一：
回到在Project窗口，选中要输出的一个或多个数据；
在Tools菜单下选Export；
在随后出现的Background Processing and Reporting界面下确认Exporting项下的Export框打勾，
指定参照图谱：用户可以任意选择一条色谱图谱作为指定参照图谱。在图所示的对话框中输入参照图谱编号确定后即可将编号对应的图谱指定为参照图谱（图13）。该图谱变为红色，以区别于其他图谱。
图13
多点校正：系统支持“多点校正”功能。用户根据需要直接在图谱上设置匹配点（匹配点数不限）进行多点校正。若设置结果不满意，再点击设置的匹配点即可取消以前设置的匹配点。（图14）
2、关闭窗口后，再进行数据分析。
分析结束后，即可以在指定的输出路径检查输出的文件。
在Signal Export窗口下，选中Times axis及Y axis两选项，点击OK后即可。
6.重复以上操作，依次输出。
Waters M32色谱工作站
建立输出方法
登陆M32，右击Browse Data小窗口，选择相应的Project。
在Project窗口中选定Channels标签页面下要输出的某个数据（点黑）
1 样本图谱数据导入（AIA格式）
图24
图25
2 设参照图谱
图26
3 自动匹配
图27 自动匹配结果
4多点校正
图28 多点校正设定
图29 多点校正后自动匹配结果
5 对照图谱生成
图30
图31
图32
图33
图34
附常用色谱工作站AIA格式文件的导出：
Agilent色谱工作站
1.打开Agilent色谱工作站；
图2
图3
图4
系统主界面中，文件信息区显示文件的路径名称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱的图形。
1 文件打开
（1）打开文件（全谱导入）（图5）：
图5
本系统支持三种格式文件的导入：AIA(即*.cdf)文件，文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格式文件的导入（图5）。为了方便用户的使用，附录中给出了主要色谱工作站的（AGILENT，WATERS，和SHIMADZU）AIA数据格式的文件导出介绍。
图8
2数据库功能：
数据库管理包括药材信息建档（图9）、制剂信息建档（图10）和参照图谱建档功能（图11），便于用户信息管理。
图9
图10
图11
3 谱图处理：
（1）数据剪切
采用数据剪切功能用户可以选择一定时间范围内的色谱数据进行匹配（图12）。
图12
（2）色谱峰匹配
色谱峰匹配包括指定参照峰，指定基准峰和自动匹配。下面逐一介绍：
图14
自动匹配：
本系统提供自动匹配功能，可实现色谱峰的自动匹配。自动匹配时，需要用户设置时间漂移，系统默认值为0.1（图13）。用户可以调节此参数以调整色谱峰的匹配结果。
（4）生成对照图谱
对照图谱的生成需要先进行谱峰匹配然后才能生成对照图谱。其生成方法包括均值法和中位数法（图13）。用户可以根据需要选择合适的方法生成对照图谱（见图15中标识为R的图谱），并以特殊格式导出（图14和16，对照图谱不能在“文件”菜单中以“导出文件”导出，必须以图14所示菜单中“导出对照图谱导出”）。对于注射剂建议采用均值法产生对照指纹图谱；对于中药材，建议采用中位数法产生对照指纹图谱。
方法一：在File菜单下，选New Method下的Export Method…以建立输出方法模板
方法二：在Database菜单下，选Export Data…，在Export窗口下点击Edit Method按钮。
方法一：方法二：或选中需要输出的数据文件，
在随后出现的Save current Export Method窗口
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范
(版本2004A)
SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM
一．简介
1．版本介绍：
本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，不具有生成对照图谱的功能。
2．系统运行环境要求：
(1). 最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows98以上，屏幕分辨率800×600。
(2). 推荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows2000以上，屏幕分辨率1024×768
二．安装方法
用户通过“打印报告”功能将分析结果打印出来。打印报告中包括报表信息输入（图19）和分析报告两部分（图20和21）。其中分析报告包括原始指纹图谱，匹配后图谱和相似度评价结果。
图19
图20
图21
5 帮助
为方便用户使用，本系统提供简洁完整的联机帮助。
6 工具栏按钮简介：
工具栏按钮如图所示(图22)。
图22
（4）x与y轴放大功能
通过此功能可以对图谱的x和y轴进行放大和缩小，系统默认值为100％。
四 卸载
在控制面板中，采用添加/删除程序卸载本程序。
五 应用实例
为方便用户快速掌握本系统，我们以一例子加以介绍。
例：对获取的色谱指纹图谱建立对照图谱，进行相似度评价，并打印报告。
基本流程图如下（图23）：
图23
3.调入要输出的色谱文件（File>>Load Signal…）；
4.进入数据输出窗口（File>>Export File>>AIA File…），进入方式如下图所示：
在弹出窗口中指定导出路径及文件名，确定。可导出AIA格式文件。
5.若选择输出文本格式文件（File>>Export File>>CSV File…），会弹出数据输出窗口。在数据输出窗口中，选中Signal选项，在File Name输入框中输入相应的文件名及文件保存路径。点击OK。
点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他特殊需要，可以直接点击next至安装结束。
图 1
三．功能
本软件系统包括文件导入，数据库管理，谱图处理，分析检验和帮助等功能。安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。
在Use specified export method框下选建立过的输出方法名
点OK键完成数据的输出
到Windows的数据输出目的目录下可看到输出的文件，此文件格式为*.arw或*.cdf。
Shimadzu Class-VP色谱工作站
1、文件栏中Method→Advanced…
弹出窗口：
选择AIA（*.CDF）输出AIA文件；选择ASCII输出文本格式（*.acs）。
（2）导出文件（保存图谱）
本系统支持将导入的图谱数据文件以文本文件（*.txt）导出保存（图6）。
图6
（3）导出图象
将导入绘制的色谱图谱也可以图象形式存放，文件格式为*.bmp（图7）。
图7
（4）图谱删除
本系统提供谱图删除功能（图8）。可以选中某一谱图删除（删除当前图谱功能），也可将导入的谱图全部删除（清除所有图谱数据）。
图15
图16
（5）随机着色谱图：
用户可以对绘制图谱的颜色进行随机着色（图14）。
4 分析检验：
（1）相似度计算：
对照图谱生成后，用户通过“相似度计算”功能进行色谱图谱样本与对照图谱的相似度评价。评价结果以表格形式显示，并可保存（图17和18）。或将结果拷贝到剪贴板上以方便用户使用。
图17
图18
（2）打印报告：
其中大部分按钮的功能在前面已经介绍过，不再赘述。这里将重点介绍“数据恢复”，“图谱间距”，“单谱显示”和x与y轴放大功能。
（1）数据恢复
“数据恢复”功能是使当前处理结果恢复到图谱数据刚导入的状态。
（2）图谱间距
“图谱间距”可以调节绘制图谱间的距离，便于用户观察和分析。
（3Fra Baidu bibliotek单峰显示
“单峰显示”可使选中的图谱单个显示，便于用户观察和分析单个样本图谱。
下的Name框中填入输出方法名
关闭Export Method Editor界面
方法一：
回到在Project窗口，选中要输出的一个或多个数据；
在Tools菜单下选Export；
在随后出现的Background Processing and Reporting界面下确认Exporting项下的Export框打勾，
指定参照图谱：用户可以任意选择一条色谱图谱作为指定参照图谱。在图所示的对话框中输入参照图谱编号确定后即可将编号对应的图谱指定为参照图谱（图13）。该图谱变为红色，以区别于其他图谱。
图13
多点校正：系统支持“多点校正”功能。用户根据需要直接在图谱上设置匹配点（匹配点数不限）进行多点校正。若设置结果不满意，再点击设置的匹配点即可取消以前设置的匹配点。（图14）
2、关闭窗口后，再进行数据分析。
分析结束后，即可以在指定的输出路径检查输出的文件。
在Signal Export窗口下，选中Times axis及Y axis两选项，点击OK后即可。
6.重复以上操作，依次输出。
Waters M32色谱工作站
建立输出方法
登陆M32，右击Browse Data小窗口，选择相应的Project。
在Project窗口中选定Channels标签页面下要输出的某个数据（点黑）
1 样本图谱数据导入（AIA格式）
图24
图25
2 设参照图谱
图26
3 自动匹配
图27 自动匹配结果
4多点校正
图28 多点校正设定
图29 多点校正后自动匹配结果
5 对照图谱生成
图30
图31
图32
图33
图34
附常用色谱工作站AIA格式文件的导出：
Agilent色谱工作站
1.打开Agilent色谱工作站；
图2
图3
图4
系统主界面中，文件信息区显示文件的路径名称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱的图形。
1 文件打开
（1）打开文件（全谱导入）（图5）：
图5
本系统支持三种格式文件的导入：AIA(即*.cdf)文件，文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格式文件的导入（图5）。为了方便用户的使用，附录中给出了主要色谱工作站的（AGILENT，WATERS，和SHIMADZU）AIA数据格式的文件导出介绍。
图8
2数据库功能：
数据库管理包括药材信息建档（图9）、制剂信息建档（图10）和参照图谱建档功能（图11），便于用户信息管理。
图9
图10
图11
3 谱图处理：
（1）数据剪切
采用数据剪切功能用户可以选择一定时间范围内的色谱数据进行匹配（图12）。
图12
（2）色谱峰匹配
色谱峰匹配包括指定参照峰，指定基准峰和自动匹配。下面逐一介绍：
图14
自动匹配：
本系统提供自动匹配功能，可实现色谱峰的自动匹配。自动匹配时，需要用户设置时间漂移，系统默认值为0.1（图13）。用户可以调节此参数以调整色谱峰的匹配结果。
（4）生成对照图谱
对照图谱的生成需要先进行谱峰匹配然后才能生成对照图谱。其生成方法包括均值法和中位数法（图13）。用户可以根据需要选择合适的方法生成对照图谱（见图15中标识为R的图谱），并以特殊格式导出（图14和16，对照图谱不能在“文件”菜单中以“导出文件”导出，必须以图14所示菜单中“导出对照图谱导出”）。对于注射剂建议采用均值法产生对照指纹图谱；对于中药材，建议采用中位数法产生对照指纹图谱。
方法一：在File菜单下，选New Method下的Export Method…以建立输出方法模板
方法二：在Database菜单下，选Export Data…，在Export窗口下点击Edit Method按钮。
方法一：方法二：或选中需要输出的数据文件，
在随后出现的Save current Export Method窗口
中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范
(版本2004A)
SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM
一．简介
1．版本介绍：
本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。研究版主要用于科学研究工作，具有生成对照图谱功能。检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，不具有生成对照图谱的功能。
2．系统运行环境要求：
(1). 最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows98以上，屏幕分辨率800×600。
(2). 推荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows2000以上，屏幕分辨率1024×768
二．安装方法
用户通过“打印报告”功能将分析结果打印出来。打印报告中包括报表信息输入（图19）和分析报告两部分（图20和21）。其中分析报告包括原始指纹图谱，匹配后图谱和相似度评价结果。
图19
图20
图21
5 帮助
为方便用户使用，本系统提供简洁完整的联机帮助。
6 工具栏按钮简介：
工具栏按钮如图所示(图22)。
图22
（4）x与y轴放大功能
通过此功能可以对图谱的x和y轴进行放大和缩小，系统默认值为100％。
四 卸载
在控制面板中，采用添加/删除程序卸载本程序。
五 应用实例
为方便用户快速掌握本系统，我们以一例子加以介绍。
例：对获取的色谱指纹图谱建立对照图谱，进行相似度评价，并打印报告。
基本流程图如下（图23）：
图23