第7讲 医学图像配准和融合
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向右平移p为正 向左平移p为负
23
沿y轴平移:
变换公式:
x' x 其中x’与y’是平移后的结果 y' y q
x ' 1 y' 0 1 0 0 1 0 0 x 1 * x o * y 0 * 1 x q y 0 * x 1* y q *1 y q 1 1 0 * x 0 * y 1 * 1 1
0 1 0 0
0 0 1 0
p x x 0 y 0 z 1 1
先沿X轴平移2.3764个单位 再沿Y轴平移9,5579个单位 最后绕坐标原点旋转10度 对于一个给定的变换结果,可 以有许多不同的变换途径
28
② 三维刚体变换:沿x轴平移
x' x p 变换公式: y' y , z' z
其中x’,y’,z’是平移后的结果
矩阵公式:
x ' 1 y' 0 z' 0 1 0
8
实例:
9
按维数:2 D、3D 按摸态:单、多 按变换性质: 按用户交互性:自动、半自动、交互 按配准所基于图像特征:外、内 按变换参数确定的方式:公式、最优解 按主体分:同一患者、不同患者、患者与图谱
10
刚体变换:指物体内部任意两点间的距离及平行关系保持 不变(处理人脑图像,对不同方向成像的图像配 准常使用刚体变换) 仿射变换:保持平行性,但距离发生变化,直线还是直线 (校正成像设备的误差产生的畸变) 投影变换:直线映射成直线,平行性和两点间的距离变化 (二维投影图像与三维图像的配准) 弯曲变换:直线变成曲线 (解剖图谱变形拟合图像数据)
1)确定一个共同的标准。 要求有一个详细标记人体各个解剖位置的计算机化标准 图谱,如Talairach标准空间,把两幅图像分别映射到图谱, 再比较
16
不同对象的图像配准方法:
胼胝体 Talairach人脑图谱 对两个病人的PET或MR图象进行比较,首先把二者的图 像都映射到这个共同的参考空间,然后再比较
0 1 0
0 1 9 0 1 0
0 1 0
4 x 0 y 1 1
0 . 1736 0 . 9848 0
5 . 5016 x 8 . 1688 y 1 1
27
x ' 0 . 9848 y ' 0 . 1736 1 0 cos( 10 0 ) 0 sin( 10 ) 0
cos( 10 0 ) x ' 0 y ' sin( 10 ) 1 0 0 . 9848 0 . 1736 0 sin( 10 ) cos( 10 ) 0
0 0
0 1 0 0 0 1
先绕原点旋转,再沿y轴平移,最后沿x轴平移
x ' 1 y' 0 1 0 0 1 0 p 1 0 0 1 0 0 1 0 0 cos q sin 1 0 sin cos 0 0 x 0 y 11
一般情况下,图像配准都是基于几何变换的,即寻找一
幅图像空间X中的点(用列向量x表示)与另一幅图像空 间Y中的点(用列向量y表示)之间的映射。X经T变换 后得到点x΄,即: x΄=T(x)
如果y与x是对应点,则成功的配准应该使得x΄等于或近
似等于y,若两者之间的差值T(x)-y 非零,则说明存在配
准误差。根据空间变换T的形式不同,可将其分为刚体 变换和非刚体变换两种形式。
Medical Image registration and fusion
1
1. 配准融合技术概述
背景 意义
2. 医学图像配准技术
理论 方法 评估
方法 评估
3. 图像图像融合技术
医学影像设备在最近 十年中得到迅速的发 展,并广泛应用于临 床诊断和治疗中。 由于成像的原理和设 备不同,存在有多种 成像模式(解剖成像、 功能成像)。
14
多模医学图像配准:难点:由于扫描设备的原理不同,两种断层图像间并
不存 在简单的一一对应关系
人脑MR/PET图像配准 上排:轴向图; 中间:矢状图; 下排:冠壮图 左:PET图像; 中:MRI图像; 右:融合图像
15
不同对象的图像配准
典型正常图像 被试图像 对比 疾病的典型图像 难点:不同对象形状、大小、位置差异 方法: 是否属于同类 是否出现异常
25
复合变换:
先沿x轴平移,再沿y轴平移,最后绕原点旋转
x ' cos y ' sin 1 0 sin cos 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 q 0 1 0 0 1 0 px 0 y 1 1
17
不同对象的图像配准方法: 2)非线性形变法 将三维图像逐渐变形,最终较好的与另一个三维图像 匹配
用非线性变换法配准不同人脑表面沟回
18
图像与图谱配准或与物理空间配准
在手术导航系统中解决图像像素与实际物理空间的位置配准
实现方法: 图像空间 坐标变换 立体定向装置、人体实体空间
19
每一幅待配准的图像都与定义图像空间的坐标系有关。
术前病灶精确定位
放疗计划
CT图像精确计算放射剂量、MR图像描述肿瘤结构, PET对代谢、免疫及生理方面进行识别,配准融合 后图像用于改进放疗计划、立体定向活检、手术
癫痫病治疗
观察炎症、脑外伤、硬化症等变化、病灶精确定位
5
配准(image registration)的概念
• 医学图像配准是指对于一幅医学图像寻求一种(或一 系列)空间变换,使它与另一幅医学图像上的对应点
0 x cos * x sin * y 0 * 1 0 y sin * x cos * y 0 * 1 1 1 0* x 0* y 1*1
x cos y sin cos x sin cos y cos cos 1
达到空间上的一致。这种一致是指人体上的同一解剖
点在两张匹配图像上有相同的空间位置(位置一致, 角度一致、大小一致)。、 • 目的:将多种成像模式或同一种模式得到的多幅 图像综合分析,更好的了解组织情况
•
解决的问题:几幅图像的严格对齐
6
几幅图像信息综合的结果称作图像的融合(image fusion)。 利用图像融合技术,将多种图像结合起来,利用各自的信 息优势,在一幅图像上同时表达来自人体的多方面信息,
11
单模配准的典型应用: (1) 不同MR加权像间的配准 T1 加权像 T2 加权像 质子密度加权像 不同组织表现不同强度 信息互补
(2) 电镜图像序列的配准
不同时间采集的多幅图像 (时间序列图像)
研究生长现象
粒子移动,形态变化
12
单模配准的典型应用:
(3) fMRI图像序列的配准
时间序列图像,大脑活动会产生氧摄取量和血流间的不平衡 MRI图像测得信号的改变 (4) 胸腹部脏器的图像配准 不同时刻的三维脏器图像 四维图像分析
刚体变换:平移、旋转
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① 二维刚体变换:沿x轴平移:
从(x,y)变到新坐标系(x’,y’) 变换公式:
x' x p 其中x’与y’是平移后的结果 y' y
矩阵公式:
x ' 1 y' 0 1 0
0 1 0
p x 1 * x 0 * y p * 1 x p 0 y 0 * x 1* y 0 *1 y 1 1 0 * x 0 * y 1*1 1
对人脑可用多种模式成像
3
解剖图像:提供解剖形态信息,分辨率高 功能图像:提供功能代谢信息,分辨率差
二者结合:在一幅图像中同时表达来自人体多
方面的信息,使人体内部结构和功能等状况能 通过影像反映出来,直观提供人体解剖生理病 理信息。
于是出现了配准和ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ合技术,配准是融合的先
决条件
4
外科手术
解决:参考点位置确定(定位问题) 运动过程中的局部变形和噪声问题
13
多模医学图像配准: 待配准的两幅图像来源于不同的成像设备。 CT:对密度差异较大的组织效果好 解剖图像: MRI:可识别软组织 较高的空间分辨率
功能图像:SPECT/PET:能反映人体的功能和代谢信息 空间分辨率差
一般临床上的应用: CT(或MRI)和SPECT(或PET)的综合分析, 同时提供功能和解剖信息
0
sin( 10 ) cos( 10 ) 0
0
0
0 x 0 y 1 1
0 . 9848 0 . 1736 0
0 . 1736 0 . 9848 0
9 x 4 y 1 1
设刚体变换先沿x轴平移4个单位,再沿y轴平移9个单位, 然后绕坐标原点旋转10°
矩阵公式:
向上平移q为正 向下平移q为负
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绕坐标原点旋转:
变换公式:
Y'
Y
( x1, y1)
x ' x cos y sin y ' x sin y cos
( x1', y1')
y xtg x cos xtg
X' X
矩阵公式:
x ' cos y ' sin 1 0 sin cos 0
20
图像的变换模型:
• 刚体变换(二维刚体变换、三维刚体变换) • 全局尺度变换
• 仿射变换(9参数仿射变换、一般仿射变换)
• 透视变换* • 非线性空间变换*
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刚体变换
物体内部两点间的距离和角度保持不变 医学图像配准在大多数情况下是采用刚体变换模型。 人体的很多组织可以近似为刚体,如骨头、由颅骨固定 的大脑等
0 . 1736 0 . 9848 0 sin( 10 ) cos( 10 ) 0
0 0
9 x 4 y 1 1 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1 9 . 5579 0 0 1 0 0 1 0 2 . 3764 0 1 x y 1
使人体内部的结构、功能等多方面的状况通过影像反映出
来,从而更加直观地提供人体解剖、生理及病理等信息。 图像配准技术是图像融合的先决条件
7
图像配准示意图
配准实现过程:
1. 获得特征图像:不同角度,不同位置,反映某些方面的特征 2. 图像配准:通过空间变换(移动和旋转),使两幅图像对齐
3. 图像融合:得到整体特征图像
不同顺序的变换得到的结果是不同。
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举例:
设刚体变换先绕坐标原点旋转10°,再沿x轴平移4个单 位,然后沿y轴平移9个单位
x ' 1 y' 0 1 0 0 1 0 0 1 9 0 1 0 0 1 0 4 cos( 10 ) 0 0 sin( 10 ) 1 0