定量PCR基本原理及方法

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荧光定量 pcr 的基本原理和步骤

荧光定量 pcr 的基本原理和步骤

荧光定量PCR的基本原理和步骤
荧光定量PCR(quantitative polymerase chain reaction,qPCR)是一种常用的分子生物学技术,可以用于检测和定量DNA或RNA分子。

其基本原理是在PCR过程中加入荧光探针,通过监测荧光信号的强度来定量PCR产物的数量。

下面是荧光定量PCR的基本步骤:
1. 样品处理:首先需要从待检测样品中提取DNA或RNA,并进行适当的处理,例如反转录、扩增等。

2. 设计引物:根据待检测的目标序列设计特异性引物。

3. PCR反应体系的制备:将引物、荧光探针、dNTPs、PCR缓冲液等混合,制备PCR反应体系。

4. PCR反应:将样品DNA或RNA与PCR反应体系混合,进行PCR反应。

5. 荧光定量:在PCR反应过程中,荧光探针会结合到目标序列上,并通过荧光信号的产生来检测PCR产物的数量。

在荧光定量PCR中,通常采用SYBR Green或TaqMan探针来检测PCR产物的数量。

6. 数据分析:通过对荧光信号的强度进行分析,计算出样品中目标序列的数量,并进行比较和分析。

需要注意的是,在荧光定量PCR中,需要选择合适的荧光探针和荧光信号检测系统,以确保准确和可靠的结果。


外,为了避免PCR过程中的污染和误差,需要严格控制PCR 反应条件和操作流程。

定量pcr的方法

定量pcr的方法

定量pcr的方法定量聚合酶链反应(Quantitative Polymerase Chain Reaction,qPCR)是一种在实验室中常用的分子生物学技术,旨在定量测定DNA或RNA分子的相对丰度。

本文将详细介绍定量PCR的原理、操作步骤以及应用领域。

一、定量PCR的原理定量PCR的原理基于聚合酶链反应(PCR)技术,该技术通过复制模板DNA 或RNA分子的特定片段来实现特异性扩增,从而产生大量复制产物。

在定量PCR 中,引入一种特定的荧光探针,该荧光探针与扩增产物结合,并在每个扩增周期的末端释放荧光信号。

荧光信号的数量与初始模板分子量成正比,因此可以通过测量荧光信号的强度来定量PCR产物中的特定DNA或RNA分子序列的相对丰度。

二、定量PCR的操作步骤1. 制备PCR反应体系:将反应缓冲液、模板DNA或RNA、引物、荧光探针、聚合酶、核苷酸和水混合制备反应体系。

反应体系中的核苷酸是用来提供DNA 或RNA的基本成分。

2. 热循环条件设置:选择合适的PCR仪,并设置合适的热循环条件。

热循环的三个步骤包括变性、退火和扩增。

3. 变性步骤:将反应体系加热至高温,通常为94-98,使DNA或RNA解性,即DNA双链分离,RNA变性为单链,使模板分子可供扩增。

4. 退火步骤:降低温度到引物特异性结合的温度,引物会与模板分子特异性结合,这通常在50-65之间进行。

5. 扩增步骤:将退火的反应体系加热至合适的温度,通常为72,此时聚合酶开始合成新的DNA链,延伸引物。

该步骤重复多次,每次扩增会产生两倍数量的DNA或RNA分子。

6. 荧光检测:在PCR反应进行过程中,荧光探针会与扩增产物结合,并在每个扩增周期的末端释放荧光信号。

荧光信号的强度与扩增产品的数量成正比。

7. 数据分析:使用特定的软件来分析荧光信号数据,将其转化为反应物的初始模板浓度。

可以通过比较不同样本的荧光信号强度来定量比较DNA或RNA的相对丰度。

概述荧光定量PCR技术的基本原理

概述荧光定量PCR技术的基本原理

概述荧光定量PCR技术的基本原理
荧光定量PCR技术是一种用于定量测量目标DNA序列数量的技术。

它基于普通PCR技术,但在PCR反应中引入了一种荧光探针,以实现对产物扩增过程的实时监测和定量测量。

实现荧光定量PCR的基本原理如下:
1. 选择适当的引物和荧光探针:引物用于特异性扩增目标DNA序列,而荧光探针用于标记并检测PCR产物的存在。

2. 引物和荧光探针的设计:引物的设计要确保特异性扩增目标DNA序列,而荧光探针通常由一个荧光染料和一个荧光淬灭器组成,荧光染料在引物与目标DNA序列结合时发荧光信号,而荧光淬灭器则抑制荧光信号。

3. PCR反应条件的设置:包括扩增温度、循环数等参数的设置,以确保高效的PCR扩增反应。

4. 实时监测PCR反应:在PCR反应过程中,荧光探针与目标DNA序列结合并发荧光信号,荧光信号的增加与PCR产物的扩增过程成正相关。

通过荧光信号的强度可以定量测量目标DNA序列的数量。

5. 分析数据:根据荧光信号的强度和扩增循环数,可以绘制荧光增幅曲线,并通过内部标准物质或标准曲线来计算目标DNA序列的浓度。

荧光定量PCR技术具有高灵敏度、高特异性和高准确性的优点,可以用于基因表达分析、突变检测、病原体检测等领域。

定量PCR基本原理及方法

定量PCR基本原理及方法
Molecular Beacon 定量分析,熔解曲线分析,基因型分析
FRET 定量分析,熔解曲线分析,基因型分析
Ampliflour Probe,LUX 定量分析
➢ 基因型分析
利用扩增信号的种类来分型 —— Taqman 根据熔解曲线的不同来分型 —— FRET, Molecular Beacon
➢ 荧光定量PCR的定量原理
RePaCl-Rti的m理e论C方he程m:isYt=rxie×s(1+ Ev)n
Y:扩增物数量; X :起始模板数量;Ev:扩增效率;n:扩增循环数
1. 终点法定量原理 前提:在最佳实验、循环次数n一定、Ev相同 原理:根据扩增产物的量计数反应物中原始分子数,即: lnx=lnY-n×ln(1+Ev)=lnY - b (b为常数)
R
3’
3’
3’
5’
QQQ
Q
5’
分子信标(Molecular Beacon Probe)
R ExcitatEiomnission Q
Excitation
荧光共振能量传递(FRET Probe)
Oligo 1: Fluorescein Excitation
Transfer
Oligo 2: LC Red 640 Emission
2. 实时检测法定量原理 前提:在最佳实验、相同Ev以、扩增产物量相同 原理:反应物中原始分子数(X)与其所需要的扩增循环次数(n)成反比, 由此计算出标本中靶分子的准确含量,即: LgX=LgY–n×Lg(1+Ev)=b - n×a (a、b为常数)
✓ n: 扩增循环数的确定
PCR efficiency =[10(-1/slope)]-1 Where slope=1/m

实时荧光定量PCR原理

实时荧光定量PCR原理

实时荧光定量PCR原理1.PCR基本原理PCR通过在不断循环的体系中复制和放大特定DNA片段,从而实现DNA的快速扩增。

PCR反应通常包括三个步骤:变性、退火和延伸。

在变性步骤中,DNA的双链结构被解开,形成两条单链DNA。

在退火步骤中,引物与目标DNA的互补序列结合,形成引物-目标DNA结合复合物。

在延伸步骤中,DNA聚合酶通过追加互补碱基,并使用引物作为起始点,在目标DNA的基础上合成新的DNA链。

实时荧光PCR是对传统PCR技术的改进,它通过添加荧光探针(也称为探针引物)来实时监测PCR反应的进程。

荧光探针通常由两部分组成:一个荧光标记物和一个定向增效子。

在PCR反应的延伸步骤中,荧光探针与目标DNA的互补序列结合,并被PCR酶切割,导致荧光信号被释放。

3.原理图解实时荧光PCR通常需要使用一个双喷嘴热循环仪(Thermal Cycler),其中一个喷嘴用于控制样品的温度,另一个喷嘴用于实时监测PCR反应的进程。

具体的PCR反应流程如下:-备制PCR试剂:将PCR反应所需的试剂混合均匀,包括DNA模板、引物、荧光探针和内参物。

-生成PCR产物:通过一系列的循环反应,将DNA模板放大成大量的PCR产物。

-荧光信号监测:PCR反应过程中,荧光探针与PCR产物的结合会释放荧光信号。

实时荧光PCR系统通过探测和记录PCR反应体系中的荧光信号,并在每个循环结束时测定信号强度。

4.数据解读和PCR效率计算实时荧光PCR的结果通常以荧光信号的周期阈值(Ct值)表示,Ct值是荧光信号强度超过背景噪音的循环数。

Ct值越低,表示PCR产物浓度越高,反之亦然。

根据Ct值,可以计算PCR的效率。

效率(E)的计算公式为:E =10^(-1/slope) - 1,其中slope为荧光曲线的斜率。

效率越接近1,表示PCR反应越有效。

5.RT-qPCR的应用RT-qPCR可应用于多个领域,包括基因表达分析、病原体检测和药物开发等。

定量PCR 简介

定量PCR 简介

定量PCR简介聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)是微量核酸扩增的有效工具,由于其灵敏、特异、快速等优点,在医学上已广泛应用与病毒、细菌病原体及遗传病、肿瘤的早期诊断。

随着PCR技术的发展,特别是病毒或肿瘤的治疗监测、疾病的诊断、机体基因表达调控方面,不仅需要检测其存在是否;而且还需要得知扩增前标本中的模板的数量,因而必须对PCR进行定量检测,即定量PCR技术,本文将对定量PCR的定量原理、技术类型以及相关进展方面综述如下:一、定量PCR的基本原理:在PCR实验条件下(Mg++、缓冲液、Taq酶、dNTP、引物、模板),经变性→退火→延伸的一个循环,引物在退火阶段与相应的模板结合,在延伸阶段进行复制,此时产物为:Yn=Yn-1×(1+Ev) ,Yn:n个PCR循环后PCR产物的分子数;Yn-1:为n-1个热循环后PCR产物的分子数;Ev:为扩增效率,0≤Ev≤1;若n个热循环中其Ev是一致的话,经n个循环后的扩增产物的分子数(Y)和反应物中原始分子数(X)之间关系,可描述为:Y=x×(1+ Ev)n。

1. 终点法定量原理:在最佳实验、循环次数n一定、Ev相同的前提下,根据扩增产物的量可以计数出反应物中原始分子数,若核酸提取效率相同(与标准品),进而计算出标本中靶分子的准确含量,即:lnx=lnY-n×ln(1+Ev)=lnY - b (b为常数)2. 实时检测法定量原理:在最佳实验、相同Ev以及相同扩增产物的情况下,反应物中原始分子数(X)与其所需要的扩增循环次数(n)成反比,若核酸提取效率相同(与标准品),进而计算出标本中靶分子的准确含量,即:LgX=LgY–n×Lg(1+Ev)=b - n×a (a、b为常数)3. 扩增效率(Ev)的影响因素:以上所述的定量原理均假定反应体系中扩增效率是不变,但是,实际上,Ev在不同的扩增管之间和同一扩增管的不同循环次数之间是不同,如何控制及解决Ev的变异以及标本制备的可靠性是PCR定量的可靠性所在,也是定量PCR的发展方向,那么,Ev的影响因素有:a. 引物和靶序列的结合能力(G+C%及突变),扩增产物的长度,G+C含量。

定量PCR基本原理及方法-PPT精品文档

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原理:根据扩增产物的量计数反应物中原始分子数,即: lnx=lnY-n×ln(1+Ev)=lnY - b (b为常数) 2. 实时检测法定量原理 前提:在最佳实验、相同Ev以、扩增产物量相同 原理:反应物中原始分子数(X)与其所需要的扩增循环次数(n)
成反比,由此计算出标本中靶分子的准确含量,即:
LgX=LgY–n×Lg(1+Ev)=b - n×a (a、b为常数)
Ampliflour Probe,LUX
定量分析
基因型分析
利用扩增信号的种类来分型 —— Taqman
根据熔解曲线的不同来分型 —— FRET, Molecular Beacon LC Green
利用扩增信号的种类来分型 双Taqman探针法检测野生型和突变型
在基因型分析中,可采用两种不同的Taqman探针(分别针对野生型和突变型),即一个突 变型探针以一种荧光素(Flr)标记,而野生型探针则用不同的荧光物(Tet)标记。如果只有 一种信号被扩增出来,则样本为对应的基因型(野生型或突变型)的纯合子;如二者都被有效 地扩增出来,则样本为杂合型。
后来用与双链DNA有更强结合力的SYBR Green I取代EB
荧光定量PCR的定量原理
PCR的理论方程: Y=x×(1+ Ev)n Real-time Chemistries
Y:扩增物数量; X :起始模板数量;Ev:扩增效率;n:扩增循环数
1. 终点法定量原理
前提:在最佳实验、循环次数n一定、Ev相同
定量PCR基本原理及方法
基因有限公司 黄妤
内 容
一. 荧光定量PCR基本原理 二. 荧光定量PCR标记方法 三. 荧光定量PCR不同方法学的应用
一.荧光定量PCR基本原理

定量PCR基本原理及方法

定量PCR基本原理及方法

✓ Ct值与起始模板的关系
logN=log N0 +nlogE n=Ct 每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系。利用已知起始拷贝数 的标准品作出标准曲线,根据未知样品的Ct值,即可计算出该样品的起始拷贝数。
Y轴—Ct值
6
X—起始拷贝数的对数
✓ 绝对定量——未知浓度的样品与标准曲线相比较
Excitation
R
3’
11
3’
3’
5’
QQQ
Q
5’
分子信标(Molecular Beacon Probe)
R ExcitatEiomnission Q
Excitation
12
荧光共振能量传递(FRET Probe)
Oligo 1: Fluorescein Excitation
Transfer
野生型 突变型 杂合型
21
利用熔解曲线检测基因突变 FRET探针进行熔解曲线分析确定基因型
FRET探针与模板结合时,因共振能量的传递而信号增强,而当在Tm 值时, FRET探针与PCR产物分开,荧光信号减弱。通过实时捕捉到的PCR产物在熔解过程 中荧光信号的变化,得到PCR产物的熔解曲线。因为发生基因突变的PCR产物有特定 的Tm 值,通过测定探针与PCR产物分开时的熔解温度Tm值,就能确定样品的基因型。
8
内掺式染料 SYBR-Green I
Excitation
5’
3’
SG
Emission
SG
SG
3’
SG
5’
SG
9
内掺式染料 SYBR-Green I
Excitation
SG
5’
3’

定量PCR基本原理

定量PCR基本原理

定量PCR基本原理定量PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种用于测定DNA样品中特定序列的数量的技术。

它是通过扩增目标DNA序列并将其与已知浓度的标准样品进行比较来实现的。

以下是定量PCR的基本原理。

1.反应组分准备:在定量PCR中,需要准备一系列的反应组分,包括DNA模板、引物、酶和缓冲液。

引物是专门设计用于扩增目标序列的短片段DNA,它们会在PCR反应中与DNA模板结合并使其扩增。

酶是一种聚合酶,用于将单链DNA合成为双链DNA。

缓冲液用于提供适当的pH和离子浓度,以维持PCR反应的稳定性。

2.PCR反应步骤:定量PCR通常包括三个主要的温度周期:变性、退火和扩增。

-变性:在初始变性步骤中,PCR反应体系中的DNA双链会被加热至95-98°C,使其解离为两条单链DNA。

这个步骤一般持续数秒至数分钟。

-退火:在退火步骤中,PCR反应体系中的温度会降低至45-68°C,这样引物就可以与DNA模板结合起来。

引物将寻找目标DNA序列中的互补序列,并结合在其上。

这个步骤一般持续数秒至数分钟。

-扩增:在扩增步骤中,PCR反应体系中的温度会升高至64-72°C。

聚合酶会结合到DNA模板上,并在引物指导下合成新的DNA链。

这个步骤一般持续数分钟至数小时。

3. 反应过程监测:定量PCR通常通过监测反应过程中累积的产物数量来确定目标序列的浓度。

有多种检测方法可供选择,包括荧光探针、SYBR Green染料和分子质量测定。

-荧光探针:荧光探针是由一个荧光染料和一个荧光猝灭器构成的DNA探针。

当荧光探针与目标序列结合时,它会在PCR反应中被降解并释放出荧光信号。

通过监测荧光信号的强度,可以确定目标序列的浓度。

- SYBR Green染料:SYBR Green是一种荧光染料,它可以结合到所有双链DNA上。

当SYBR Green与扩增产物结合时,它会发出荧光信号。

定量PCR原理及PCR仪光学原理

定量PCR原理及PCR仪光学原理

定量PCR原理及PCR仪光学原理1.荧光染料法:在PCR反应混合液中添加荧光染料,该染料只与双链PCR产物结合并产生荧光信号,因此只有在扩增过程中产生双链PCR产物时才会有荧光发光。

PCR反应过程中,荧光信号会随着扩增产物的积累而增加。

可以通过荧光强度与PCR循环数的关系来计算出初始模板的初始数量。

2.探针法:在PCR反应中加入探针,该探针通常包含两个部分:荧光染料基团和辅助基团。

辅助基团可以竞争性结合PCR产物,从而导致荧光信号减弱或熄灭。

当PCR过程中产生PCR产物时,探针会被酶水解并释放出荧光染料基团,从而导致荧光信号增强。

通过测量荧光信号的变化,可以测量PCR 产物的数量。

PCR仪光学原理:PCR仪是用于定量PCR实验的专用仪器,它具有特殊的光学系统来测量荧光信号的强度。

PCR仪的光学原理通常基于光衰减原理。

PCR仪中使用的荧光染料或探针一般会发出荧光信号,该信号在PCR过程中会通过光学系统进行收集和测量。

PCR仪的光学系统一般包括以下几个组件:1.光源:PCR仪通常使用特定波长的光源来激发荧光信号的发生。

常见的光源有LED或氙气灯。

2.滤光片:滤光片用于选择特定波长的荧光信号传递到探测器,并阻挡其他波长。

滤光片通常由凹凸面组成,以控制特定光线的传播方向和传播方式。

3.检测器:检测器用于测量荧光信号的强度。

常见的检测器有光电二极管(photodiodes)或光电倍增管(photomultiplier tubes),它们可以将荧光信号转化为电信号。

4.放大器和转换器:放大器用于增强电信号的强度,并将其转换为数字信号。

5.软件和分析系统:PCR仪通常配备专门的软件和分析系统,用于处理和分析测量的数据。

这些软件可以计算出初始模板的初始数量,并生成相应的曲线和图表。

总结:定量PCR是一种用于测量DNA或RNA在样本中的定量浓度的技术,依赖于PCR过程中的荧光信号的监测。

荧光染料法和探针法是常用的定量PCR方法。

定量pcr原理

定量pcr原理

定量pcr原理定量PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种利用DNA聚合酶链式反应技术量化检测目标DNA数量的方法。

该方法基于DNA的反链合成原理,通过多次反复复制目标DNA序列,将其扩增到可检测范围。

定量PCR主要包括准备试剂、反应体系的构建、PCR扩增条件的优化和PCR产物的检测四个步骤。

首先,准备试剂包括模板DNA、引物(前向引物和反向引物)、DNA聚合酶、dNTP(即四种脱氧核苷酸)、缓冲液和MgCl2等。

其次,构建反应体系。

通过将模板DNA、引物、DNA聚合酶、dNTP、缓冲液和MgCl2混合,得到PCR反应液。

引物是特异性序列,可与目标DNA的两个端点互补结合,成为PCR反应的开始和结束点。

然后,优化PCR扩增条件。

这涉及到温度条件和PCR循环数的调整。

PCR反应通常包括三个步骤:变性、退火和延伸。

在变性步骤中,PCR反应液在高温下使目标DNA双链解离为两条单链;在退火步骤中,引物与目标DNA的单链以互补碱基配对的方式结合;在延伸步骤中,DNA聚合酶将dNTP加入到引物的5'端扩增产物的3'端,从而合成一个新的DNA链。

最后,检测PCR产物。

这可以通过凝胶电泳、荧光定量PCR或实时定量PCR等方法进行。

实时定量PCR是一种通过荧光信号实时监测PCR反应进程的方法,可以准确地测量PCR产物的数量。

根据荧光信号的增加,可以定量计算出起始DNA 模板的数量。

总的来说,定量PCR是一种可靠且高敏感的方法,可以准确地测量目标DNA的数量。

它在医学诊断、基因表达研究、遗传学分析等领域具有广泛的应用价值。

定量PCR基本原理

定量PCR基本原理

定量PCR基本原理基本原理:定量PCR通过引入一种用于测量PCR反应进程的探针或染料来获取结果。

这些探针或染料具有与目标序列相互作用的特性。

当目标序列被放大并到达一定浓度时,探针或染料与之结合,产生荧光信号。

这个荧光信号的强度与目标序列的数量成正比。

下面是定量PCR的主要步骤:1.反应物准备:反应物主要包括样本DNA或RNA、引物和探针(如果使用)等。

引物是位于目标序列两侧的短DNA寡核苷酸片段,用于定向放大DNA。

探针是一种染料与荧光标记分子结合的DNA片段,用于鉴别和定量检测目标序列。

2.反应体系的配置:根据反应物的需求,将引物、探针、双链DNA模板、dNTPs、酶和缓冲液等组合在一起,形成反应混合物。

3.PCR反应:将反应混合物置于PCR仪中,进行多轮的反应循环。

每一个反应循环包括三个步骤:变性、退火和延伸。

-变性:在高温条件下,双链DNA被解开成两条单链DNA。

-退火:在较低温度下,引物与目标序列的互补部分结合。

-延伸:在适当酶的作用下,引物延伸成为与目标序列相互补的DNA 链。

4.目标序列的定量测量:反应循环完成后,可以通过测量荧光信号的强度来定量PCR反应中的目标序列。

对于使用探针的定量PCR,荧光信号强度与目标序列的拷贝数呈正相关。

探针通常在引物的5'端带有一种荧光染料,并在3'端带有另一种荧光染料。

当探针与目标序列结合时,这两种染料距离变近,导致荧光共振能量转移(FRET)。

这种能量转移的效应会导致双荧光染料之间的荧光信号发生变化,从而提供了目标序列的相对丰度的定量信息。

需要注意的是,为了准确测量目标序列的拷贝数,还需要使用内参基因或标准曲线。

内参基因是一个稳定的基因,它在样本中的拷贝数相对稳定,可以作为PCR反应的参考。

标准曲线是一系列含有已知拷贝数的DNA 标准品,它们在PCR反应中被共同放大,用来建立目标序列拷贝数和荧光信号强度之间的关系。

综上所述,定量PCR是一种基于PCR技术的分子生物学方法,通过测量荧光信号的强度来定量PCR反应中的目标序列。

定量pcr的原理和应用

定量pcr的原理和应用

定量PCR的原理和应用一、定量PCR的概述定量PCR(Quantitative PCR,简称qPCR)是一种用于精确测定DNA或RNA 在样本中的相对或绝对数量的技术。

相比传统的定性PCR,定量PCR能提供更加准确和可靠的分子生物学定量分析结果。

本文将介绍定量PCR的原理、方法和应用。

二、定量PCR的原理定量PCR基于传统PCR技术,通过测量PCR产物的实时累积情况来确定起始模板的数量。

其主要原理包括:1.设计引物和探针:定量PCR需要使用特异性引物和荧光探针来扩增和检测目标序列,引物的设计应考虑碱基配对的特异性和温度互补性。

2.实时检测:在PCR反应过程中,荧光探针与目标序列发生特异性结合,形成荧光信号。

通过实时监测PCR产物的荧光信号强度,可以确定目标序列的起始数量。

3.标准曲线法:定量PCR通常需要构建标准曲线来确定目标序列的起始数量。

标准曲线是由一系列已知起始数量的标准品制备而成,根据标准曲线上的荧光信号强度和已知起始数量的关系,可以推断出未知样本中目标序列的起始数量。

三、定量PCR的步骤定量PCR通常包括以下步骤:1.样本处理:将待测样本中的DNA或RNA提取和纯化,以获得高质量的核酸模板。

2.引物和探针设计:根据目标序列的特异性和相关基因信息,设计引物和荧光探针。

3.PCR反应体系的配置:根据实验需求和PCR仪器要求,配置PCR反应混合液,包括引物、荧光探针、DNA模板和PCR反应缓冲液等。

4.PCR反应条件的设置:确定PCR反应的温度和时间参数,包括退火温度、延伸时间和扩增周期数等。

5.实时荧光监测:将PCR反应体系加载到实时荧光PCR仪中,监测PCR反应过程中荧光信号的强度变化。

6.数据分析:利用实时荧光PCR仪软件对荧光信号数据进行分析,绘制标准曲线和计算目标序列的起始数量。

四、定量PCR的应用定量PCR在生物学研究和临床诊断中具有广泛的应用。

以下是定量PCR的主要应用领域:1.基因表达分析:通过定量PCR可以测定不同组织或细胞中特定基因的表达水平,揭示基因在生物学过程中的功能和调控机制。

实时定量PCR技术的基本原理

实时定量PCR技术的基本原理

实时定量PCR技术的基本原理引言实时定量PCR(Real-time quantitative polymerase chain reaction)是一种用于测量DNA或RNA的数量的分子生物学技术。

它被广泛应用于基因表达分析、病原体检测、体外诊断和分子遗传学研究等领域。

本文将介绍实时定量PCR技术的基本原理,包括反应原理和应用。

反应原理实时定量PCR是基于聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)的原理,但与传统PCR有所不同。

传统PCR只能在反应结束后测量PCR产物的数量,而实时定量PCR则可以在PCR反应过程中实时测量产物数量的变化。

实时定量PCR一般使用荧光探针标记PCR产物。

荧光探针通常由两部分组成:靶向序列与荧光染料。

靶向序列与待测分子特异性结合,荧光染料则可以发光。

在PCR反应过程中,靶向序列与目标DNA(或RNA)结合并被聚合酶扩增。

当PCR产物与荧光探针结合时,染料释放出荧光信号,通过荧光仪器可以实时检测到荧光信号的强度。

实时定量PCR的关键在于荧光信号的监测与数据分析。

荧光信号的强度与PCR产物的数量成正比,通过监测荧光信号的强度变化可以了解PCR反应的进程和产物的数量。

数据分析可以根据荧光信号的强度变化绘制标准曲线,进而推断待测样品中特定分子的初始数量。

应用实时定量PCR技术在生命科学研究和临床诊断中具有广泛的应用价值。

基因表达分析实时定量PCR可用于定量测量基因表达水平的变化。

通过检测靶向基因的mRNA在不同生理条件或疾病状态下的表达量,可以揭示基因表达调控的机制和生物学功能。

病原体检测实时定量PCR可以快速、准确地检测病原体的存在和数量。

它被广泛应用于临床微生物学、传染病监测和食品安全等领域。

通过选择特定的引物和探针,可以实现对不同病原体的特异性检测。

体外诊断实时定量PCR在临床诊断中发挥着重要的作用。

例如,它可以用于早期癌症的检测和监测,通过检测肿瘤标志物的数量变化来评估治疗效果和预测预后。

简述实时荧光定量pcr技术基本原理

简述实时荧光定量pcr技术基本原理

简述实时荧光定量pcr技术基本原理实时荧光定量PCR(Polymerase Chain Reaction)技术是一种用于检测和定量DNA分子的方法。

其基本原理可以分为以下几个步骤:1. DNA模板准备:从样品中提取目标DNA并纯化。

2. 反应混合物制备:将目标DNA模板与一对引物(Primer)和一种DNA聚合酶(如Taq聚合酶)一同混合。

引物是特异性的DNA片段,用于引导DNA合成的起始。

3. PCR反应:反应开始时,立即开始DNA聚合酶的活性。

DNA聚合酶会从引物的3'端开始合成新的DNA链,直到另一条模板DNA链的末端。

该过程包括三个步骤:变性、扩增和延伸。

- 变性:将DNA模板的双链解链,得到两条单链DNA。

- 扩增:引物结合到模板DNA上,并通过DNA聚合酶的活性引导新的DNA链的合成。

- 延伸:DNA聚合酶在模板链的5'到3'方向上合成新的DNA 链。

4. 荧光探针监测:实时PCR使用一种带有荧光染料的DNA探针,例如SYBR Green或TaqMan探针。

这些探针能够与新合成的DNA片段结合,并发出荧光信号。

- SYBR Green:该荧光染料会与双链DNA结合并发出荧光。

当PCR反应进行时,DNA的数量增加,SYBR Green的荧光信号也增加。

通过检测荧光信号的强度,可以确定PCR反应的进程和目标物质的数量。

- TaqMan探针:TaqMan探针包含一个与目标DNA片段互补的序列,并在其一端有一个荧光染料,如荧光素(FAM)和荧光素内部荧光质体(TAMRA)。

当TaqMan探针与目标DNA结合时,聚合酶开始进行DNA合成,并在过程中释放探针分子。

聚合酶的活动断开荧光染料和荧光质体之间的特定连接,导致发出另一种荧光信号。

通过监测这两种荧光信号,可以确定PCR反应的进程和目标物质的数量。

5. 数据分析:荧光信号的强度与反应温度和时间关联,通过计算PCR循环的阈值周期(CT值),可以确定目标DNA的起始数量。

pcr技术的原理和步骤

pcr技术的原理和步骤

pcr技术的原理和步骤PCR技术的原理和步骤PCR技术是一种基于DNA复制的技术,可以在短时间内扩增DNA 序列,从而使得微量的DNA样本也能够被检测到。

PCR技术的原理和步骤如下:一、PCR技术的原理PCR技术的原理是利用DNA聚合酶(DNA polymerase)在一定条件下,对DNA进行连续的复制,从而扩增DNA序列。

PCR技术的核心是DNA的复制,而DNA的复制需要三个基本元素:DNA模板、DNA聚合酶和引物(primers)。

DNA模板是PCR反应中的原始DNA序列,DNA聚合酶是一种酶类,能够在一定条件下将DNA模板复制成新的DNA序列,引物是一种短的DNA序列,能够在DNA模板上定位并启动DNA聚合酶的复制作用。

PCR技术的步骤二、PCR技术的步骤PCR技术的步骤主要包括:DNA模板的制备、引物的设计、PCR 反应体系的构建、PCR反应的条件和PCR产物的检测等。

1. DNA模板的制备DNA模板的制备是PCR反应的第一步,DNA模板可以来源于各种生物样本,如血液、组织、唾液等。

DNA模板的制备需要先将生物样本进行裂解,使得DNA能够被释放出来,然后通过离心等方法将DNA分离出来。

2. 引物的设计引物是PCR反应中的关键因素之一,引物的设计需要根据所需扩增的DNA序列进行设计。

引物的长度一般在20-30个碱基对之间,引物的GC含量应该在40%-60%之间,引物的两端应该含有一定的碱基序列,以便于引物与DNA模板的结合。

3. PCR反应体系的构建PCR反应体系的构建需要将DNA模板、引物、DNA聚合酶、缓冲液、dNTPs等反应物混合在一起,构建出PCR反应的体系。

PCR 反应体系的构建需要注意反应物的浓度、pH值、离子强度等因素,以保证PCR反应的稳定性和可靠性。

4. PCR反应的条件PCR反应的条件包括PCR反应的温度、时间和循环次数等。

PCR 反应的温度一般分为三个阶段:变性、退火和延伸。

[学习]定量PCR基本原理及方法

[学习]定量PCR基本原理及方法

HouseKeeper Gene
Gene of Interest
熔解曲线分析
利用溶解曲线进行实验条件的优化(RG3000)
dF/dT dF/dT
.35 1.2
1.1
Bin A
.3
Bin A
1
.9
Bin B
.25
.8
.7 .2
.6
.15 .5
.4 .1 .3
.2 .05
.1
0 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100
R
3’
3’
3’
5’
QQQ
Q
5’
分子信标(Molecular Beacon Probe)
R ExcitatEiomnission Q
Excitation
荧光共振能量传递(FRET Probe)
Oligo 1: Fluorescein Excitation
Transfer
Oligo 2: LC Red 640 Emission
2. 实时检测法定量原理 前提:在最佳实验、相同Ev以、扩增产物量相同 原理:反应物中原始分子数(X)与其所需要的扩增循环次数(n) 成反比,由此计算出标本中靶分子的准确含量,即: LgX=LgY–n×Lg(1+Ev)=b - n×a (a、b为常数)
✓ n: 扩增循环数的确定
PCR efficiency =[10(-1/slope)]-1 Where slope=1/m
✓ Ct值与起始模板的关系
logN=log N0 +nlogE n=Ct 每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系。利用已知起始拷贝数 的标准品作出标准曲线,根据未知样品的Ct值,即可计算出该样品的起始拷贝数。

定量pcr技术的原理

定量pcr技术的原理

定量pcr技术的原理
定量PCR技术是一种用于确定DNA数量的方法。

其原理基于聚合酶链反应(PCR),同时结合了荧光探针技术。

定量PCR的关键步骤包括:DNA模板的反应体系制备、荧光
探针设计、扩增曲线分析等。

首先,DNA模板的反应体系制备是定量PCR的基础。

该反应
体系通常包括目标DNA序列、DNA引物、聚合酶、反应缓冲液以及二苯基酚等反应成分。

其中,DNA引物是专门设计的,能够与所需检测的DNA序列互补结合并进行扩增。

聚合酶则
在PCR反应中起到催化DNA模板扩增的作用。

其次,荧光探针设计是定量PCR的关键步骤之一。

荧光探针
通常包括一个荧光染料和一个荧光猝灭剂。

在PCR反应过程中,如果目标DNA序列存在,荧光探针会与目标序列互补结合,并被引物延伸酶切割,导致荧光染料与猝灭剂分离而产生荧光信号。

荧光信号的强度与目标DNA序列的数量成正比。

最后,扩增曲线分析是定量PCR的关键步骤之一。

在PCR过
程中,荧光信号的强度会随着每个PCR循环的进行而增加。

通过测量特定循环数后的荧光信号强度,可以建立标准曲线来确定目标DNA序列的初始数量。

标准曲线中会设置一系列已
知浓度的目标DNA样品作为参照,通过比对测试样品的荧光
信号,可以推算出测试样品中目标DNA序列的初始数量。

综上所述,定量PCR技术利用聚合酶链反应和荧光探针技术,
通过测量PCR反应产生的荧光信号强度,能够准确测定目标DNA序列的数量。

这种技术在生物学研究、分子诊断和环境监测等领域具有广泛的应用。

1定量PCR基本原理

1定量PCR基本原理

1定量PCR基本原理定量PCR(Quantitative Polymerase Chain Reaction)是一种用于检测和测量DNA或RNA分子数量的分子生物学技术。

它是常用的基因表达和检测技术。

以下是定量PCR的基本原理。

定量PCR的基本原理可以分为三个主要步骤:扩增反应、检测荧光信号和标准曲线计算。

第一步是扩增反应。

PCR反应通常在一个热循环中进行,每个循环包括三个步骤:变性、退火和延伸。

变性步骤通过高温将DNA双链分离成两条单链。

然后,在退火步骤中,引物通过与目标DNA序列特异性碱基配对,使其结合到模板DNA上。

最后,在延伸步骤中,DNA聚合酶将新的DNA链合成为与模板DNA相匹配的互补链。

这个循环过程被重复多次,每个循环使得目标序列的数量翻倍,从而进一步扩增目标DNA序列。

第二步是检测荧光信号。

PCR反应中通常会引入一个特定的探针或染料,其结构包括与目标DNA序列特异性结合的引物,并带有一个发光染料和一个参考染料。

扩增反应进行时,DNA聚合酶会催化探针与模板DNA结合,并释放出发光信号。

发光信号的强度与目标DNA序列的数量成正比。

参考染料发出的信号用于校正可能因扩增反应条件变化而引起的信号差异。

第三步是用标准曲线计算目标序列的数量。

标准曲线是通过基于已知浓度的一系列标准样品构建的。

这些标准样品包含与待测样品相同的目标序列,但其浓度已知。

将标准曲线上的荧光信号强度与标准样品的浓度进行比较,可以建立一个线性关系模型。

然后,通过将待测样品的荧光信号强度与标准曲线进行比较,可以计算出待测样品中目标序列的初始浓度。

定量PCR的结果可以用于不同的应用,如基因表达研究、病原体检测、遗传病诊断等。

通过定量PCR,可以准确测量目标序列的数量,并比较不同样品之间的差异。

总结一下,定量PCR通过扩增反应、检测荧光信号和标准曲线计算三个主要步骤来定量测量DNA或RNA分子的数量。

这种技术在许多生物学研究和医学诊断中发挥着重要作用。

1定量PCR基本原理

1定量PCR基本原理

1定量PCR基本原理定量PCR(Quantitative Polymerase Chain Reaction)是一种利用DNA复制技术进行定量测定DNA数量的方法。

它是PCR技术的一种改进,在遗传学、疾病诊断、药物研发等领域有广泛应用。

以下是定量PCR的基本原理的详细介绍:1.反应体系组成:定量PCR所需的反应体系包括DNA模板、引物、荧光探针、聚合酶、缓冲液、dNTPs和MgCl2等组分。

DNA模板是待测DNA的起始材料,引物是用于扩增特定DNA片段的寡核苷酸引物,荧光探针则会结合到PCR产物上生成荧光信号用于检测和计量。

2.PCR扩增步骤:定量PCR扩增过程包括三个主要步骤:变性、退火和延伸。

首先,将反应体系加热至95°C,使DNA双链解开变性为两条单链。

然后,将温度降低至特定的温度,使引物能够与DNA靶序列结合。

引物结合后,聚合酶开始在两条单链DNA上合成新的DNA链。

这一过程称为延伸。

随着循环的进行,PCR产物的数量呈指数增加。

3.荧光信号检测:定量PCR中使用特定的荧光探针来检测扩增产物的数量。

这些荧光探针一般由两个部分组成:探针序列和荧光染料。

探针序列与待测DNA的靶序列互补配对,而荧光染料则位于探针的末端。

在PCR过程中,引物扩增到接近探针的位置时,3'末端荧光染料会与5'末端的荧光信号发生共振能量转移(FRET),从而发出荧光信号。

通过测量这些信号的强度,可以推断PCR产物的数量。

4.标准曲线和计量:为了进行定量测定,标准曲线是必不可少的。

标准曲线是一系列已知浓度的标准品所构建的,通过对标准品进行PCR扩增并测量荧光信号的强度,可以建立起PCR产物浓度与荧光强度之间的关系。

通过测量待测样品的荧光强度,并根据标准曲线进行插值计算,可以得出待测样品中特定DNA序列的浓度。

5.分析和解释结果:定量PCR的结果可以通过多种途径进行分析。

一种常见的方法是计算待测样品和标准样品之间的CT值差,通过该差值来比较两者的浓度。

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标准曲线 • 由系列稀释的已知浓度的样品做标准曲线 • 计算待测样品的初始模板浓度
log N0 =-Ct logE+logN
二.荧光定量 PCR 标记方法
内掺式染料 序列特异性探针
引物特异性探针
SYBR Green I, LC Green Taqman Molecular Beacons FRET Amplifluor (Intergen) LUX
Slope -3.322
100%efficienc y
阈值(threshold)的设定
阈值:PCR扩增信号进入相对稳 定的对数增长期时的荧光值。
Ct值——n:扩增循环数
PCR循环在到达Ct值所在的循环数 时,刚刚进入真正的指数扩增期( 对数期),此时微小误差尚未放大 ,因此Ct值的重现性极好,即同一 模板不同时间扩增或同一时间不同 管内扩增,得到的Ct值是恒定的。
R
3’
3’
3’
5’
QQQ
Q
5’
分子信标(Molecular Beacon Probe)
R ExcitatEiomnission Q
Excitation
荧光共振能量传递(FRET Probe)
Oligo 1: Fluorescein Excitation
Transfer
Oligo 2: LC Red 640 Emission
Molecular Beacon 定量分析,熔解曲线分析,基因型分析
FRET 定量分析,熔解曲线分析,基因型分析
Ampliflour Probe,LUX 定量分析
基因型分析
利用扩增信号的种类来分型 —— Taqman 根据熔解曲线的不同来分型 —— FRET, Molecular Beacon
73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 8d7eg. 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 deg.
AnAnnenaelainligngata6t 06℃3℃
标记方法
Taqman 定量分析,基因型分析
Sybr-Green 定量分析,熔解曲线分析,基因型分析 (LC Green)
内掺式染料 SYBR-Green I
Excitation
5’
3’
SG
Emission
SG
SG
3’
SG
5’
SG
内掺式染料 SYBR-Green I
Excitation
SG
5’
3’
SG SG SG
Emission
3’ 5’
SG
双标记探针(Taqman Probe)
5’
5’
3’
Excitation
Excitation
三.荧光定量PCR不同方法学的应用
研究目的 标记方法
研究目的
Hale Waihona Puke 定量分析(基因拷贝数的绝对定量,基因表达调控的相对定量) Sybr-Green (LC Green), Taqman, Molecular Beacon, etc
熔解曲线分析 Sybr-Green, LC Green, Molecular Beacon, FRET
2. 实时检测法定量原理 前提:在最佳实验、相同Ev以、扩增产物量相同 原理:反应物中原始分子数(X)与其所需要的扩增循环次数(n) 成反比,由此计算出标本中靶分子的准确含量,即: LgX=LgY–n×Lg(1+Ev)=b - n×a (a、b为常数)
n: 扩增循环数的确定
PCR efficiency =[10(-1/slope)]-1 Where slope=1/m
定量PCR基本原理及方法
基因有限公司 黄妤
内容
一. 荧光定量PCR基本原理 二. 荧光定量PCR标记方法 三. 荧光定量PCR不同方法学的应用
一.荧光定量PCR基本原理
定量PCR技术的产生 1992年由Higuchi等人第一次报告:使用EB加入PCR反应体系,
经改装的带有冷CCD的PCR仪检测样品的荧光强度 核酸 ↔ 染料荧光 后来用与双链DNA有更强结合力的SYBR Green I取代EB
基因型分析(SNP、突变型分析) Taqman, Molecular Beacon, FRET, LC Green
绝对定量
某 科 研 用 户 使 用 Rotor-Gene 3000 进 行 基 因 表 达 检 测 结 果
(自备标准品,检测样品做复管)
相对定量
某科研用户使用Rotor-Gene 3000进行基因表达相对定量分析,下图为用 ∆∆Ct法得出的分析结果 。(自备标准品,检测样品做3次重复复管)
野生型 突变型 杂合型
利用熔解曲线检测基因突变
FRET探针进行熔解曲线分析确定基因型
FRET探针与模板结合时,因共振能量的传递而信号增强,而当在Tm 值时, FRET探针与PCR产物分开,荧光信号减弱。通过实时捕捉到的PCR产物在熔解过程 中荧光信号的变化,得到PCR产物的熔解曲线。因为发生基因突变的PCR产物有特定 的Tm 值,通过测定探针与PCR产物分开时的熔解温度Tm值,就能确定样品的基因型。
LC Green
利用扩增信号的种类来分型
双Taqman探针法检测野生型和突变型
在基因型分析中,可采用两种不同的Taqman探针(分别针对野生型和突变型),即一个突 变型探针以一种荧光素(Flr)标记,而野生型探针则用不同的荧光物(Tet)标记。如果只有 一种信号被扩增出来,则样本为对应的基因型(野生型或突变型)的纯合子;如二者都被有效 地扩增出来,则样本为杂合型。
Ct值与起始模板的关系
logN=log N0 +nlogE n=Ct 每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系。利用已知起始拷贝数 的标准品作出标准曲线,根据未知样品的Ct值,即可计算出该样品的起始拷贝数。
Y轴—Ct值
X—起始拷贝数的对数
绝对定量——未知浓度的样品与标准曲线相比较
荧光定量PCR的定量原理
RePaCl-Rti的m理e论C方he程m:isYt=rxie×s(1+ Ev)n
Y:扩增物数量; X :起始模板数量;Ev:扩增效率;n:扩增循环数
1. 终点法定量原理 前提:在最佳实验、循环次数n一定、Ev相同 原理:根据扩增产物的量计数反应物中原始分子数,即: lnx=lnY-n×ln(1+Ev)=lnY - b (b为常数)
HouseKeeper Gene
Gene of Interest
熔解曲线分析
利用溶解曲线进行实验条件的优化(RG3000)
dF/dT dF/dT
.35 1.2
1.1
Bin A
.3
Bin A
1
.9
Bin B
.25
.8
.7 .2
.6
.15 .5
.4 .1 .3
.2 .05
.1
0 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100
谢谢!
专才服务专家
突变型 杂合型 野生型
利用熔解曲线检测基因突变
利用内掺式染料进行高分辨率熔解曲线(HRM)分析基因型 HRM根据序列长度、GC含量和互补性分析样品,可精确到单碱基差异。 相比其它方法节约了探针和标记的费用。
上图:用内掺式染料(无探针)区分ACTIN3(R577X)SNP基因型(C到T替代)。 同源野生型、突变型及杂合样品如图所示(10次重复),由随机软件自动分型。片 段预先进行40个循环的快速扩增(<40分钟)。
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