崔仕超比较基因组学和原核生物的进化生物化学与分子生物学PPT课件
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Comparative genomics and the
evolution of prokaryotes
崔仕超（10708040）
1
整体概述
概述一
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概述二
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相关文本内容
概述三
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2
主要内容：
• 基因组学：分子进化的新纪元 • 原核生物基因组 • 基因谱系的进化 • HGT和基因系统的进化 • 系统发育和HGT所面临的问题 • 结语和展望
8
结论和展望
基因工程
比较基因组学 代谢基因组学
HGT
组织形成
9
10
11
12
• 开放阅读框：如果一个阅读框在起始密 码子后有50个以上的连续密码子无终止 密码子，那么称这段顺序为开放阅读框。
• 长的开放阅读框是为某个蛋白编码的基 因。
• 一个相对分子质量为60000的蛋白质编 码不间断的基因需要有一个含有500或 更多的密码子的开放阅读框
3
基因组学：分子进化的新 纪元
• 原核生物的在进化研究中的优势 • 基因组学为微观进化和宏观进化中所
研究的遗传物质提供了非常丰富的信 息 • 利用比较基因组学的方法将这些信息 进行整合总结
4
原核生物基因组
• 原核生物基因复制和进化 前导链和滞后链 起始位点和终止位点（图）
• 原核生物基因组的多样性 开放宏基因组 封闭宏基因组 HGT（水平基因转移）（图）
• 当前观点：原核生物的基因通过HGT 将周围的功能基因的加入来进行进化， 而周围的功能则直接和与其相互作用 的周围的环境有关。
• 功能基因对细胞内复杂的系统的适应： TFs比基因又相对低的保守性
7
系统发育和HGT的问题
• 基因进化树 • 物种进化树 • 基因进化树与物种进化树的不一
致 • HGT
13
14
Q&A
人人思考，大声说出
15
结束语
感谢参与本课程，也感激大家对我们工作的支持与积极 的参与。课程后会发放课程满意度评估表，如果对我们
课程或者工作有什么建议和意见，也请写在上边
16
最后、感谢您的到来
· 讲师： XXXX
· 时间：202X.XX.XX
17
5
基因谱系的进化
• 基因谱系多样性 基因的获得和缺矢
• 假基因 移码和置换 （图）
• 新基因的进化:HGT对基因谱系中突 变的贡献：15~20％
• ORF（开放阅读框）富集HGT 变形菌门和硬壁菌门的ORF与噬菌 体中的序列有更高的同源性
6
HGT和基因系统的进化
• Teichmann 和 Ma百度文库an Babu的进化模 型 ：在调控的基因中有的45％的进 化是由于复制和相互作用的遗传所导 致的
evolution of prokaryotes
崔仕超（10708040）
1
整体概述
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概述三
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2
主要内容：
• 基因组学：分子进化的新纪元 • 原核生物基因组 • 基因谱系的进化 • HGT和基因系统的进化 • 系统发育和HGT所面临的问题 • 结语和展望
8
结论和展望
基因工程
比较基因组学 代谢基因组学
HGT
组织形成
9
10
11
12
• 开放阅读框：如果一个阅读框在起始密 码子后有50个以上的连续密码子无终止 密码子，那么称这段顺序为开放阅读框。
• 长的开放阅读框是为某个蛋白编码的基 因。
• 一个相对分子质量为60000的蛋白质编 码不间断的基因需要有一个含有500或 更多的密码子的开放阅读框
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基因组学：分子进化的新 纪元
• 原核生物的在进化研究中的优势 • 基因组学为微观进化和宏观进化中所
研究的遗传物质提供了非常丰富的信 息 • 利用比较基因组学的方法将这些信息 进行整合总结
4
原核生物基因组
• 原核生物基因复制和进化 前导链和滞后链 起始位点和终止位点（图）
• 原核生物基因组的多样性 开放宏基因组 封闭宏基因组 HGT（水平基因转移）（图）
• 当前观点：原核生物的基因通过HGT 将周围的功能基因的加入来进行进化， 而周围的功能则直接和与其相互作用 的周围的环境有关。
• 功能基因对细胞内复杂的系统的适应： TFs比基因又相对低的保守性
7
系统发育和HGT的问题
• 基因进化树 • 物种进化树 • 基因进化树与物种进化树的不一
致 • HGT
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Q&A
人人思考，大声说出
15
结束语
感谢参与本课程，也感激大家对我们工作的支持与积极 的参与。课程后会发放课程满意度评估表，如果对我们
课程或者工作有什么建议和意见，也请写在上边
16
最后、感谢您的到来
· 讲师： XXXX
· 时间：202X.XX.XX
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基因谱系的进化
• 基因谱系多样性 基因的获得和缺矢
• 假基因 移码和置换 （图）
• 新基因的进化:HGT对基因谱系中突 变的贡献：15~20％
• ORF（开放阅读框）富集HGT 变形菌门和硬壁菌门的ORF与噬菌 体中的序列有更高的同源性
6
HGT和基因系统的进化
• Teichmann 和 Ma百度文库an Babu的进化模 型 ：在调控的基因中有的45％的进 化是由于复制和相互作用的遗传所导 致的