明胶酶谱实验方法
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明胶酶谱实验
72kD(MMP-2)和92kD(MMP-9)
抽提缓冲液:
10 mmol/L Tris-HCl pH 7.5,
150 mmol/L NaCl,
20 mmol/L CaCl2,
1μmol/L ZnSO4,
0.01% (v/v) Triton X-100,
(0.5% PMSF)。
10mmol/LPMSF 溶液:取PMSF 粉末17.4mg, 加异丙醇溶解, 定容至100ml,置-20℃备用。
注意:PMSF在临提取组织时再加入,使终浓度为0.5%,配制时不加,不然易失效。
先用新鲜肾组织,蛋白量尽量加至最大。如果按这个还做不出来,那就是你的实验技术问题了
明胶酶是锌依赖的蛋白酶. EDTA是金属离子络合剂.加了就把明胶酶的锌离子络合了,完全抑制MMP的活性。你加了这个我保证你一辈子也做不出来。
蛋白浓度一般是先摸索一个量。就是分别上10,20,30,40,50,60,70,80,90,100ug
跑一下电泳,先看结果。条带看不见的,或者太透明的,都不能选。就是要半明半暗的那种。看是哪个道分解的,我们就选其中几个量上样。
(1)、5%浓缩胶(现配现用):
d3H2O 2.1ml
30%丙烯酰胺溶液0.5ml
1mol/L Tris-HCL( PH=6.8) 0.38ml
10% SDS 30μl
10%过硫酸铵(AP) 30μl
TEMED 3μl
3ml (2)、10%分离胶(现配现用):
d3H2O 2.1ml
30%丙烯酰胺溶液 2.31ml
1.5mol/l Tris-HCL(PH=8.8) 1.75ml
10% SDS 70μl
10%过硫酸铵(AP) 70μl
TEMED 5.6μl
1%明胶0.7ml
7ml (3)、4×上样缓冲液(4o C保存):
0.32% Tris-HCL 6.4ml
4%SDS 8ml
50%甘油 3.2 ml
溴酚蓝0.024g
d3H2O 2.4ml
20ml
①wash buffer Ⅰ500ml
50mM Tris-HCl pH 7.6 3.0286g→400ml (调pH )
5 mM CaCl2 (110.99)0.2776g
1μM ZnCl2 (136.30)0.068mg
2.5% Triton X-100 12.5ml
②wash buffer Ⅱ500ml
50mM Tris-HCl pH 7.6 3.0286g→400ml (调pH )
5 mM CaCl2 (110.99)0.2776g
1μM ZnCl2 (136.30)0.068mg
③incubate buffer 500ml
50mM Tris-HCl pH 7.6 3.0286g→400ml (调pH ) 50mM CaCl2 (110.99)0.2776g
1μM ZnCl2 (136.30)0.068mg
1% Triton X-100 5.0ml
(五)注意事项
1)孵育时间可以根据情况而定,可以延长。
2)明胶应该现用现配。
3)用血清上样作为阳性对照。
明胶酶谱相关溶液及试剂的配制
(4)、5%浓缩胶(现配现用):
d3H2O 2.1ml
30%丙烯酰胺溶液0.5ml
1mol/L Tris-HCL( PH=6.8) 0.38ml
10% SDS 30μl
10%过硫酸铵(AP) 30μl
TEMED 3μl
3ml
(5)、10%分离胶(现配现用):
d3H2O 2.1ml
30%丙烯酰胺溶液 2.31ml
1.5mol/l Tris-HCL(PH=8.8) 1.75ml
10% SDS 70μl
10%过硫酸铵(AP) 70μl
TEMED 5.6μl
1%明胶0.7ml
7ml
(6)、4×上样缓冲液(4o C保存):
0.32% Tris-HCL 6.4ml
4%SDS 8ml
50%甘油 3.2 ml
溴酚蓝0.024g
d3H2O 2.4ml
20ml
(7)、5×Tris-甘氨酸电极缓冲液:三蒸水配制,其中含0.125mol/LTris-HCL、
1.25mol/L甘氨酸和0.5%SDS,完全溶解后调pH至8.3,室温保存,用时
稀释5倍。
(8)、洗脱液:三蒸水配制,其中含2.5% Triton X–100、50mmol/L Tris-HCL、
5mmol/L CaCl2和1μmol/L ZnCl2,完全溶解后调pH至7.6,室温保存。(9)、漂洗液:三蒸水配制,其中含50mmol/L Tris-HCL、5mmol/L CaCl2和
1μmol/L ZnCl2,完全溶解后调pH至7.6,室温保存。
(10)、孵育液:三蒸水配制,其中含50mmol/L Tris-HCL、5mmol/ CaCl2、1μmol/L
ZnCl2和0. 02% Brij-35,完全溶解后调pH至7.6,室温保存。
(11)、染色液:三蒸水配制,其中0.05% 考马斯亮兰R-250、30%甲醇和10%乙
酸,混匀后室温保存。
(12)、脱色液A、B、C:三蒸水配制,三种脱色液中甲醇浓度分别为30%、20%、
10 %,乙酸浓度分别为10 %、10 %、5%,混匀后室温保存。
明胶酶谱法实验步骤
(1)、取6孔板中对数生长期的肿瘤细胞,用无血清RPMI1640培养基冲洗3次,
每孔中加入1ml无血清RPMI1640培养基,实验分组,加入干预因素,37o C、5%CO2恒温培养箱中培养24h。
(2)、将细胞培养上清液移入离心管中,4°C、2000rpm离心10min,取上清分装
后–80°C保存备用。
(3)、BCA法测定各样品蛋白浓度,根据不同浓度确定样品的上样体积,保证
各样品上样的蛋白质量相同,与4×上样缓冲液5ul混合,总体积不足20ul 用三蒸水补足(可以根据制胶时孔的大小决定上样总体积)。
(4)、配制分离胶和浓缩胶,制胶,等胶干之后,加入电泳缓冲液,使其溢满上
样孔。
(5)、20ul/孔上样,4°C、100V进行SDS-PAGE 电泳(我放在一个盆子里面,
周围覆冰),直至溴粉蓝跑至分离胶的底部。
(6)、电泳结束后,切取包括72KD和92KD合适大小的凝胶放置于洗脱液中振
荡洗脱4次(当然需要蛋白分子marker了啊),每次15min。
(7)、漂洗液中震荡漂洗2次,每次20min。
(8)、孵育液中,37°C水浴锅中孵育48h。
(9)、染色液中摇床上震荡染色3h。
(10)、将凝胶依次置于脱色液A、B、C中,在摇床上分别震荡脱色0.5 h、1 h、